小寺正明 Kotera Masaaki

研究者番号	90643669
その他のID
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2018年度 – 2020年度: 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 准教授 2017年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 講師 2015年度: 東京工業大学, 大学院生命理工学研究科, 講師 2013年度 – 2015年度: 東京工業大学, 生命理工学研究科, 講師
審査区分/研究分野	研究代表者システムゲノム科学 / ゲノム生物学 / 理工系研究代表者以外小区分45020:進化生物学関連
キーワード	研究代表者化合物 / 生合成 / 代謝経路 / 大規模データ / 遺伝的アルゴリズム / Fingerprint / NetworkX / 予測 / 生合成単位 / 複雑骨格分子 … もっと見る / 天然物 / 二次代謝 / 複雑骨格機能分子 / KEGG / 誘導体 / 中間体 / 出発物質 / 逆合成 / 化学構造 / 合成生物学 / 生合成経路 / 代謝化合物 / 次世代シークエンサー / オーソログ / 鱗翅目 / 情報学的基盤 / 遺伝子 / オミックス / 植物 / 生物間相互作用 / 化学生態学 / データベース / ゲノム / 昆虫 / 昆虫ゲノム / ケモインフォマティクス / 機械学習 / バイオインフォマティクス / 構造比較 / 酵素反応 / 代謝ネットワーク … もっと見る研究代表者以外化学感覚 / 生物間相互作用 / 次世代型シークエンサー / RNA-seq / 味覚受容体遺伝子 / RNAi / 産卵刺激物質 / 電気生理実験 / ゲノム解読 / 進化 / 種分化 / 食草選択 / 産卵行動 / 味覚受容体 / ミヤマカラスアゲハ / クロアゲハ / アゲハチョウ隠す

植食性昆虫が進化に至る、最初の変化は何か
- 研究代表者
  
  尾崎克久
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分45020:進化生物学関連
- 研究機関
  株式会社生命誌研究館
大規模計測データからの汎用的な天然物生合成経路予測研究代表者
- 研究代表者
  
  小寺正明
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
   東京工業大学
アブイニシオ代謝経路再構築へ向けた反応ネットワーク予測研究代表者
- 研究代表者
  
  小寺正明
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2014
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  東京工業大学
多様な昆虫ゲノム比較へ向けた情報学的基盤形成研究代表者
- 研究代表者
  
  小寺正明
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  東京工業大学

すべて 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Metabolic disassembler for understanding and predicting the biosynthetic units of natural products2019
- 著者名/発表者名
  Amano Kohei、Matsumoto Tsubasa、Tanaka Kenichi、Funatsu Kimito、Kotera Masaaki
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 20 号: 1 ページ: 728-728
- DOI
  10.1186/s12859-019-3183-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[雑誌論文] De novo design of anticancer peptides by ensemble artificial neural networks2019
- 著者名/発表者名
  Grisoni Francesca、Neuhaus Claudia S.、Hishinuma Miyabi、Gabernet Gisela、Hiss Jan A.、Kotera Masaaki、Schneider Gisbert
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Modeling
  
  巻: 25 号: 5 ページ: 112-112
- DOI
  10.1007/s00894-019-4007-6
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[雑誌論文] 無機材料の組成式を元にした物性予測のための記述子開発2018
- 著者名/発表者名
  Sakata Fusako、Kotera Masaaki、Tanaka Kenichi、Nakano Hiroshi、Ukita Masakazu、Shirasawa Raku、Tomiya Shigetaka、Funatsu Kimito
- 雑誌名
  
  Journal of Computer Aided Chemistry
  
  巻: 19 号: 0 ページ: 7-18
- DOI
  10.2751/jcac.19.7
- NAID
  130007492788
- ISSN
  1345-8647
- 言語
  日本語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[雑誌論文] WURCS: the Web3 unique representation of carbohydrate structures.2014
- 著者名/発表者名
  Tanaka K, Aoki-Kinoshita KF, Kotera M, Sawaki H, Tsuchiya S, Fujita N, Shikanai T, Kato M, Kawano S, Yamada I, Narimatsu H.
- 雑誌名
  
  J Chem Inf Model.
  
  巻: 54(6) 号: 6 ページ: 1558-66
- DOI
  10.1021/ci400571e
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24241073, KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[雑誌論文] Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multi-step metabolic pathways with a recursive supervised approach2014
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera, Yasuo Tabei, Yoshihiro Yamanishi, Ai Muto, Yuki Moriya, Toshiaki Tokimatsu, Susumu Goto
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 30 号: 12 ページ: i165-i174
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btu265
- NAID
  130005072035
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[雑誌論文] DINIES: drug-target interaction network inference engine based on supervised analysis2014
- 著者名/発表者名
  Yoshihiro Yamanishi, Masaaki Kotera, Yuki Moriya, Ryusuke Sawada, Minoru Kanehisa, Susumu Goto
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 42 号: W1 ページ: W39-W45
- DOI
  10.1093/nar/gku337
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714, KAKENHI-PROJECT-25700029
[雑誌論文] Predictive genomic and metabolomic analysis for the standardization of enzyme data2014
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera, Susumu Goto and Minoru Kanehisa
- 雑誌名
  
  Perspectives in Science
  
  巻: 1 号: 1-6 ページ: 24-32
- DOI
  10.1016/j.pisc.2014.02.003
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[雑誌論文] Benchmarking a wide range of chemical descriptors for drug-target interaction prediction using a chemogenomic approach2014
- 著者名/発表者名
  Ryusuke Sawada, Masaaki Kotera, and Yoshihiro Yamanishi
- 雑誌名
  
  Molecular Informatics
  
  巻: 33 号: 11-12 ページ: 719-731
- DOI
  10.1002/minf.201400066
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714, KAKENHI-PROJECT-25700029
[雑誌論文] PIERO ontology for analysis of biochemical transformations: Effective implementation of reaction information in the IUBMB Enzyme List2014
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera, Yosuke Nishimura, Zen-ichi Nakagawa, Ai Muto, Yuki Moriya, Shinobu Okamoto, Shuichi Kawashima, Toshiaki Katayama, Toshiaki Tokimatsu, Minoru Kanehisa, and Susumu Goto
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 21 号: 06 ページ: 1-17
- DOI
  10.1142/s0219720014420013
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[雑誌論文] Supervised de novo reconstruction of metabolic pathways from metabolome-scale compound sets2013
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera, Yasuo Tabei, Yoshihiro Yamanishi, Toshiaki Tokimatsu and Susumu Goto.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 29
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[雑誌論文] KCF-S: KEGG Chemical Function and Substructure for improved interpretability and prediction in chemical bioinformatics2013
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera, Yasuo Tabei, Yoshihiro Yamanishi, Yuki Moriya, Toshiaki Tokimatsu, Minoru Kanehisa and Susumu Goto.
- 雑誌名
  
  BMC Systems Biology
  
  巻: 7 号: S6
- DOI
  10.1186/1752-0509-7-s6-s2
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714, KAKENHI-PROJECT-25700029
[雑誌論文] 代謝反応予測のケミカルバイオインフォマティクス2013
- 著者名/発表者名
  小寺正明
- 雑誌名
  
  日本化学会情報化学部会誌
  
  巻: 31 ページ: 30-33
- NAID
  130003362387
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[学会発表] 構造推定の精度向上を目指した化合物データセットの選択2018
- 著者名/発表者名
  山本博之、小寺正明
- 学会等名
  第27回　環境化学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[学会発表] Pathway prediction of natural products by reverse synthetic analysis2018
- 著者名/発表者名
  Tsubasa Matsumoto, Kohei Amano, Miyabi Hishinuma, Kimito Funatsu, Masaaki Kotera
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[学会発表] Prediction of biosynthetic building blocks in complicated natural products2018
- 著者名/発表者名
  Kohei Amano, Tsubasa Matsumoto, Miyabi Hishinuma, Kimito Funatsu, Masaaki Kotera
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[学会発表] Designing Angi-Cancer Peptides by Counterpropagation Artificial Neural Network2018
- 著者名/発表者名
  Miyabi Hishinuma, Francesca Grisoni, Slaudia S. Neuhaus, Gisela Gabernet Garrida, Jan A. Hiss, Masaaki Kotera, Gisbert Schneider
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[学会発表] 機械学習を利用した.CYP 代謝部位検出法の開発2018
- 著者名/発表者名
  海東和麻、小寺正明、船津公人
- 学会等名
  第６２回日本薬学会関東支部大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[学会発表] アゲハチョウ食草転換による種分化の最初の一歩は何か？2018
- 著者名/発表者名
  尾崎克久, 宇賀神篤, 小寺正明, 吉川寛
- 学会等名
  第40回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06374
[学会発表] Prediction of natural biosynthetic pathway by reverse synthetic analysis2017
- 著者名/発表者名
  Tsubasa Matsumoto, Kohei Amano, Miyabi Hishinuma, Masaaki Kotera
- 学会等名
  Chem-Bio Informatics Society Annual Meeting 2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[学会発表] Prediction of Biosynthetic Basic Parts of Compounds with Complicated Structures2017
- 著者名/発表者名
  Kohei Amano, Tsubasa Matsumoto, Miyabi Hishinuma, Masaaki Kotera
- 学会等名
  Chem-Bio Informatics Society Annual Meeting 2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07260
[学会発表] アゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚受容体遺伝子の種間比較2016
- 著者名/発表者名
  ○尾崎克久、小寺正明、武藤愛、吉川寛
- 学会等名
  日本昆虫学会第76回大会・第60回日本応用動物昆虫学会大会合同大会
- 発表場所
  大阪府立大学
- 年月日
  2016-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] データ統合とオミックス解析による昆虫・植物間相互作用解析と昆虫代謝予測2016
- 著者名/発表者名
  小寺正明、武藤愛、尾崎克久
- 学会等名
  日本昆虫学会第76回大会・第60回日本応用動物昆虫学会大会合同大会
- 発表場所
  大阪府立大学
- 年月日
  2016-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] 化学情報学と生命情報学の融合による群集生態学2015
- 著者名/発表者名
  小寺正明
- 学会等名
  第38回ケモインフォマティクス討論会
- 発表場所
  東京大学山上会館
- 年月日
  2015-10-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] 化学生態学ネットワークの理解のための昆虫ゲノム・植物メタボローム解析2015
- 著者名/発表者名
  小寺正明、武藤愛、尾崎克久
- 学会等名
  NGS現場の会第四回研究会
- 発表場所
  つくば国際会議場
- 年月日
  2015-07-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Sequence Read Archiveからの昆虫の植物化合物代謝遺伝子の探索2015
- 著者名/発表者名
  武藤愛、尾崎克久、小寺正明
- 学会等名
  NGS現場の会第四回研究会
- 発表場所
  つくば国際会議場
- 年月日
  2015-07-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] NGSを用いたアゲハチョウの食草認識に関わる遺伝子群の網羅的探索と比較2015
- 著者名/発表者名
  尾崎克久、小寺正明、武藤愛、吉川寛
- 学会等名
  第38回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2015-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] 昆虫化学受容体遺伝子を見つけるためのNGS利用とTrinityアセンブルの工夫2015
- 著者名/発表者名
  尾崎克久、武藤愛、小寺正明
- 学会等名
  NGS現場の会第四回研究会
- 発表場所
  つくば国際会議場
- 年月日
  2015-07-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] アゲハチョウ食性進化の仕組み2014
- 著者名/発表者名
  尾崎克久、龍田勝輔、武藤愛、小寺正明、吉澤靖貴、吉川寛
- 学会等名
  第58回応用動物昆虫学会大会
- 発表場所
  高知大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Development of a Cross-species Search Database for Insect Genes.2014
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera, Katsuhisa Ozaki, Ai Muto, Susumu Goto.
- 学会等名
  第58回応用動物昆虫学会大会
- 発表場所
  高知大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] アゲハチョウ科昆虫ドラフトゲノムの解読2014
- 著者名/発表者名
  武藤愛、尾崎克久、守屋勇樹、五斗進、小寺正明
- 学会等名
  第58回応用動物昆虫学会大会
- 発表場所
  高知大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] KCF-S: KEGG Chemical Function and Substructure for improved interpretability and prediction in chemical bioinformatics2013
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera
- 学会等名
  The 24th International Conference on Genome Informatics(GIW2013)
- 発表場所
  Singapore
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[学会発表] Supervised learning of enzymatic reaction likeness for de novo reconstruction of metabolic pathways2013
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera
- 学会等名
  13th Annual International Workshop on Bioinformatics and Systems Biology
- 発表場所
  Kyoto
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[学会発表] Construction of an ortholog database of lepidopteran insects.2013
- 著者名/発表者名
  Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
- 学会等名
  第36回に本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Development of a Cross-species Search Database for Insect Genes.2013
- 著者名/発表者名
  Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
- 学会等名
  2013年日本バイオインフォマティクス学会年会
- 発表場所
  タワーホール船堀
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Metabolome-scale prediction of enzyme reaction network based on chemical structures2013
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera
- 学会等名
  The 8th Metabolome Symposium
- 発表場所
  Fukuoka
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[学会発表] チョウ目昆虫オーソログデータベースの構築2013
- 著者名/発表者名
  小寺正明、武藤愛
- 学会等名
  NGS現場の会第３回研究会
- 発表場所
  神戸国際会議場
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Supervised de novo reconstruction of metabolic pathways from metabolome-scale compound sets2013
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera
- 学会等名
  ISMB ECCB 2013
- 発表場所
  Berlin, Germany
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[学会発表] Development of lepidopteran insect ortholog database.2013
- 著者名/発表者名
  Ai Muto, Katsuhisa Ozaki, Susumu Goto and Masaaki Kotera.
- 学会等名
  The 24th International Conference on Genome Informatics
- 発表場所
  National University of Singapore
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Genome informatics platform of lepidopteran insects
- 著者名/発表者名
  小寺正明、武藤愛、尾崎克久
- 学会等名
  ISMB 2014
- 発表場所
  ボストン
- 年月日
  2014-07-11 – 2014-07-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Development of insect orthologue search database
- 著者名/発表者名
  尾崎克久、武藤愛、小寺正明
- 学会等名
  GIW ISCB-ASIA 2014
- 発表場所
  東京国際交流館（東京・お台場）
- 年月日
  2014-12-15 – 2014-12-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] PIERO ontology for analysis of biochemical transformations: Effective implementation of reaction information in the IUBMB Enzyme List
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera
- 学会等名
  GIW / ISCB-Asia 2014
- 発表場所
  等強国際交流館（東京・お台場）
- 年月日
  2014-12-15 – 2014-12-17
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[学会発表] Evolution of gustatory sensing mechanism for host recognition in swallowtail butterflies
- 著者名/発表者名
  尾崎克久、龍田勝輔、小寺正明、武藤愛、吉川寛
- 学会等名
  日本進化学会第16回大阪大会
- 発表場所
  高槻現代劇場（大阪府高槻市）
- 年月日
  2014-08-21 – 2014-08-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] ゲノム解読とRNA-seqによるアゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚遺伝子候補の探索
- 著者名/発表者名
  尾崎克久、小寺正明、武藤愛
- 学会等名
  第37回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（横浜市）
- 年月日
  2014-11-25 – 2014-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multi-step metabolic pathways with a recursive supervised approach
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera
- 学会等名
  ISMB 2014
- 発表場所
  ボストン
- 年月日
  2014-07-11 – 2014-07-15
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714
[学会発表] NGSを使ったアゲハチョウの食草選択に関わる化学感覚受容体遺伝子の探索
- 著者名/発表者名
  尾崎克久、武藤愛、小寺正明、吉川寛
- 学会等名
  第５９回日本応用動物昆虫学会大会
- 発表場所
  山形大学（山形市）
- 年月日
  2015-03-26 – 2015-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870379
[学会発表] Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multi-step metabolic pathways with a recursive supervised approach
- 著者名/発表者名
  Masaaki Kotera
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  仙台国際センター（仙台市）
- 年月日
  2014-10-02 – 2014-10-04
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-25108714

1. 尾崎克久 (60396223)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
2. 成松久

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

小寺 正明 Kotera Masaaki

研究課題

研究成果

共同研究者

植食性昆虫が進化に至る、最初の変化は何か

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

大規模計測データからの汎用的な天然物生合成経路予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

アブイニシオ代謝経路再構築へ向けた反応ネットワーク予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

多様な昆虫ゲノム比較へ向けた情報学的基盤形成研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Metabolic disassembler for understanding and predicting the biosynthetic units of natural products2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] De novo design of anticancer peptides by ensemble artificial neural networks2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 無機材料の組成式を元にした物性予測のための記述子開発2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

言語

データソース

[雑誌論文] WURCS: the Web3 unique representation of carbohydrate structures.2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Metabolome-scale prediction of intermediate compounds in multi-step metabolic pathways with a recursive supervised approach2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] DINIES: drug-target interaction network inference engine based on supervised analysis2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Predictive genomic and metabolomic analysis for the standardization of enzyme data2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Benchmarking a wide range of chemical descriptors for drug-target interaction prediction using a chemogenomic approach2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] PIERO ontology for analysis of biochemical transformations: Effective implementation of reaction information in the IUBMB Enzyme List2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Supervised de novo reconstruction of metabolic pathways from metabolome-scale compound sets2013

著者名/発表者名

雑誌名

小寺正明 Kotera Masaaki