瓜生耕一郎 Uriu Koichiro

研究者番号	90726241
その他のID
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所属 (現在)	2025年度: 東京科学大学, 生命理工学院, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 東京科学大学, 生命理工学院, 准教授 2024年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 2018年度 – 2023年度: 金沢大学, 生命理工学系, 助教 2015年度 – 2017年度: 金沢大学, 自然システム学系, 助教 2014年度: 独立行政法人理化学研究所, 階層縦断型理論生物学研究チーム, 研究員
審査区分/研究分野	研究代表者生物系 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 小区分44020:発生生物学関連 / 複合領域 / 発生生物学研究代表者以外合同審査対象区分:小区分45010:遺伝学関連、小区分45020:進化生物学関連 / 小区分45020:進化生物学関連 / 小区分45010:遺伝学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ)
キーワード	研究代表者数理モデル / 同期 / 体節形成 / ゼブラフィッシュ / 分節時計 / 遺伝子発現リズム / 位相振動子 / 細胞移動 / sharp-wave/ripples / 記憶 … もっと見る / シナプス恒常性 / 海馬 / 数理生物学 / 非線型システム / 哺乳類概日時計 / 光応答 / Period / リミットサイクル / 位相応答 / 概日時計 / 発生・分化 / 発生 / ロンドン / ブエノスアイレス / 国際情報交換 / 数値シミュレーション / cell mixing / トラッキング / シミュレーション / 時間スケール / 画像解析 … もっと見る研究代表者以外位相前進作用 / 概日リズム / 内的脱同調 / 時計遺伝子 / 数理モデル / 大規模電気生理 / 多光子イメージング / 睡眠行動解析 / 眠気隠す

眠気の生成・解消機構の解明のための総括研究
- 研究代表者
  
  丹羽康貴
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(B)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  弘前大学
細胞状態遷移と神経回路遷移をつなぐ数理モデル: 眠気の生成・解消機構の理論研究代表者
- 研究代表者
  
  瓜生耕一郎
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(B)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  東京科学大学
Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築
- 研究代表者
  
  程肇
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分45010:遺伝学関連
   小区分45020:進化生物学関連
   合同審査対象区分:小区分45010:遺伝学関連、小区分45020:進化生物学関連
- 研究機関
  金沢大学
動く細胞集団における遺伝子発現リズム動態の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  瓜生耕一郎
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分44020:発生生物学関連
- 研究機関
  金沢大学
組織変形のもとでの発生時計の同期過程研究代表者
- 研究代表者
  
  瓜生耕一郎
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  金沢大学
シグナルに対する概日時計の位相応答理論とその実験検証研究代表者
- 研究代表者
  
  瓜生耕一郎
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  金沢大学
発生組織における時計の時空間動態:分節時計再同期の数理モデリング研究代表者
- 研究代表者
  
  瓜生耕一郎
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2018
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  金沢大学
細胞集団の協調移動現象の数理モデリング研究代表者
- 研究代表者
  
  瓜生耕一郎
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  発生生物学
- 研究機関
  金沢大学
   独立行政法人理化学研究所

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Ripply suppresses Tbx6 to induce dynamic-to-static conversion in somite segmentation2023
- 著者名/発表者名
  Yabe Taijiro、Uriu Koichiro、Takada Shinji
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 14 号: 1 ページ: 2115-2115
- DOI
  10.1038/s41467-023-37745-w
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21H02498, KAKENHI-PROJECT-20K06653, KAKENHI-PUBLICLY-22H05642
[雑誌論文] Orchestration of tissue shape changes and gene expression patterns in development.2023
- 著者名/発表者名
  Uriu K, Morelli LG.
- 雑誌名
  
  Semin. Cell Dev. Biol.
  
  巻: 147 ページ: 24-33
- DOI
  10.1016/j.semcdb.2022.12.009
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06653
[雑誌論文] Cell size homeostasis under the circadian regulation of cell division in cyanobacteria.2022
- 著者名/発表者名
  Kitaguchi Y, Tei H, Uriu K.
- 雑誌名
  
  J. Theor. Biol.
  
  巻: 553 ページ: 111260-111260
- DOI
  10.1016/j.jtbi.2022.111260
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06653
[雑誌論文] From local resynchronization to global pattern recovery in the zebrafish segmentation clock2021
- 著者名/発表者名
  Uriu K., Liao B-K., Oates A.C., Morelli L.G.
- 雑誌名
  
  Elife
  
  巻: 10
- DOI
  10.7554/elife.61358
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04772
[雑誌論文] Complementary phase responses via functional differentiation of dual negative feedback loops2021
- 著者名/発表者名
  Uriu K. and Tei H.
- 雑誌名
  
  PLOS Computational Biology
  
  巻: 17 号: 3 ページ: e1008774-e1008774
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1008774
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04955
[雑誌論文] Synchronization dynamics of mobile oscillators in the presence of coupling delays2019
- 著者名/発表者名
  Petrungaro G., Uriu K., Morelli L.G.
- 雑誌名
  
  Physical Review E
  
  巻: 99 号: 6
- DOI
  10.1103/physreve.99.062207
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04772
[雑誌論文] A saturated reaction in repressor synthesis creates a daytime dead zone in circadian clocks2019
- 著者名/発表者名
  Uriu K., Tei H.
- 雑誌名
  
  PLoS Comput Biol.
  
  巻: 15 号: 2 ページ: e1006787-e1006787
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1006787
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[雑誌論文] Information flow in the presence of cell mixing and signaling delays during embryonic development2018
- 著者名/発表者名
  Petrungaro G., Morelli L.G., Uriu K.
- 雑誌名
  
  Semin Cell Dev Biol.
  
  巻: - ページ: 26-35
- DOI
  10.1016/j.semcdb.2018.09.008
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[雑誌論文] Assessment of instructions on protection against food contaminated with radiocesium in Japan in 20112018
- 著者名/発表者名
  Seto M., Uriu K., Kawaguchi I., Yokomizo H.
- 雑誌名
  
  Risk Anal.
  
  巻: 印刷中号: 6 ページ: 1154-1168
- DOI
  10.1111/risa.12893
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[雑誌論文] A framework for quantification and physical modeling of cell mixing applied to oscillator synchronization in vertebrate somitogenesis2017
- 著者名/発表者名
  Uriu K., Bhavna R. Oates A.C., Morelli L.G.
- 雑誌名
  
  Biol. Open
  
  巻: 6 ページ: 1235-1244
- DOI
  10.1242/bio.025148
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[雑誌論文] Feedback loops interlocked at competitive binding sites amplify and facilitate genetic oscillations2017
- 著者名/発表者名
  Uriu K., Tei H.
- 雑誌名
  
  J. Theor. Biol.
  
  巻: 428 ページ: 56-64
- DOI
  10.1016/j.jtbi.2017.06.005
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[雑誌論文] Determining the impact of cell mixing on signaling during development2017
- 著者名/発表者名
  Uriu K., Morelli L.G.
- 雑誌名
  
  Dev. Growth Differ.
  
  巻: 59 号: 5 ページ: 351-368
- DOI
  10.1111/dgd.12366
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[雑誌論文] Mobility-induced persistent chimera states2017
- 著者名/発表者名
  Petrungaro G., Uriu K., Morelli L.G.
- 雑誌名
  
  Phys. Rev. E
  
  巻: 96 号: 6 ページ: 062210-062210
- DOI
  10.1103/physreve.96.062210
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[雑誌論文] Object segmentation and ground truth in 3D embryonic imaging2016
- 著者名/発表者名
  Bhavna Rajasekaran, Koichiro Uriu, Guillaume Valentin, Jean-Yves Tinevez, Andrew C. Oates
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 11 号: 6 ページ: e0150853-e0150853
- DOI
  10.1371/journal.pone.0150853
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[雑誌論文] Genetic oscillators in development2016
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 雑誌名
  
  Development, Growth & Differentiation
  
  巻: 58 号: 1 ページ: 16-30
- DOI
  10.1111/dgd.12262
- NAID
  120005741598
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[雑誌論文] Interplay between intercellular signaling and cell movement in development2014
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu, Luis G. Morelli and Andrew C. Oates
- 雑誌名
  
  Seminars in Cell and Developmental Biology
  
  巻: 35 ページ: 66-72
- DOI
  10.1016/j.semcdb.2014.05.011
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[雑誌論文] Collective cell movement promotes synchronization of coupled genetic oscillators2014
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu and Luis G. Morelli
- 雑誌名
  
  Biophysical Journal
  
  巻: 107 号: 2 ページ: 514-526
- DOI
  10.1016/j.bpj.2014.06.011
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Bifurcation for determining somite boundary in zebrafish2022
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu, Taijiro Yabe, Shinji Takada
- 学会等名
  日本数理生物学会2022年年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06653
[学会発表] Regularity of gene expression waves under cell mobility gradient in somitogenesis2022
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu, Luis Morelli
- 学会等名
  第55回日本発生生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06653
[学会発表] Synchronization dynamics of the zebrafish segmentation clock: effect of delayed coupling and period gradient.2021
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  第54回日本発生生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06653
[学会発表] From local synchronization by Delta-Notch signaling to global pattern formation2021
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06653
[学会発表] Continuum limit of mobile genetic oscillators in vertebrate segment formation2021
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  第31回日本数理生物学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K06653
[学会発表] 二重ネガティブフィードバックループの機能分化がもたらす概日時計の相補的位相応答2020
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  2020年日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04955
[学会発表] 概日時計システムにおけるネガティブフィードバックループの機能分化2020
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  第43回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04955
[学会発表] 哺乳類Period遺伝子の機能分化による相補的な位相応答2020
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  第27回日本時間生物学会学術大会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04955
[学会発表] Resynchronization dynamics of the vertebrate segmentation clock2019
- 著者名/発表者名
  Uriu K.
- 学会等名
  日本数理生物学会2019年度年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04772
[学会発表] Period after effectの数理モデリング2019
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎, 程肇
- 学会等名
  第26回日本時間生物学会学術大会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04955
[学会発表] Resynchronization of the zebrafish segmentation clock in Delta-Notch mutants2019
- 著者名/発表者名
  Uriu K., Liao B-K., Morelli L.G., Oates A.C
- 学会等名
  第52回日本発生生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H04772
[学会発表] Synchrony recovery of the zebrafish segmentation clock2018
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  International young scientists workshop on neural development & stem cells 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[学会発表] Interplay between cell movement and intercellular signaling in development2018
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  The JSDB-GfE young scientist exchange meeting 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[学会発表] Dead zone formation by negative feedback loops in the circadian clocks2018
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  2018 Annual Meeting of the Society for Mathematical Biology & the Japanese Society for Mathematical Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[学会発表] Dead zone formation by saturated reactions in circadian clocks2018
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  第25回日本時間生物学会学術大会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[学会発表] Resynchronization dynamics of the zebrafish segmentation clock2018
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  第70回日本細胞生物学会第51回日本発生生物学会合同大会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[学会発表] Physical modeling of oscillator resynchronization after perturbation of Delta-Notch signaling in zebrafish presomitic mesoderm2017
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  第50回日本発生生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05762
[学会発表] 細胞移動が分節時計の同期に与える影響をイメージングデータと数理モデルで明らかにする2016
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  日本発生生物学会秋季シンポジウム2016
- 発表場所
  静岡県三島市三島市民文化会館
- 年月日
  2016-10-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Quantification and mathematical modeling of the effect of cellular movement on oscillator synchronization in vertebrate somitogenesis2015
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu, Bhavna Rajasekaran, Luis G. Morelli, Andrew C. Oates
- 学会等名
  The 26th CDB meeting
- 発表場所
  理化学研究所多細胞システム形成研究センター、兵庫
- 年月日
  2015-09-08
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Relative cellular motion in vertebrate somitogenesis2015
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  日本発生生物学会年会
- 発表場所
  つくば国際会議場、茨城
- 年月日
  2015-06-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Modeling cellular motion in vertebrate somitogenesis based on embryonic imaging data2015
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  2015年日本数理生物学会年会/日中韓数理生物学コロキウム合同大会
- 発表場所
  同志社大学、京都
- 年月日
  2015-08-26
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Quantification of relative cellular movement and mathematical modeling in vertebrate somitogenesis2015
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  第38回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド、兵庫
- 年月日
  2015-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Collective cell movement promotes synchronization of coupled genetic oscillators
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  The Joint Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology 2014
- 発表場所
  Osaka, Japan
- 年月日
  2014-07-28 – 2014-08-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Collective cell movement promotes synchronization of coupled genetic oscillators
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  The 9th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology
- 発表場所
  Gothenburg, Sweden
- 年月日
  2014-06-15 – 2014-06-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Synchronization of coupled genetic oscillators promoted by collective cell movement
- 著者名/発表者名
  Koichiro Uriu
- 学会等名
  CDB Symposium 2015 Time in Development
- 発表場所
  Kobe, Japan
- 年月日
  2015-03-23 – 2015-03-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085
[学会発表] Collective cell movement promotes synchronization of the segmentation clock
- 著者名/発表者名
  瓜生耕一郎
- 学会等名
  第47回日本発生生物学会年会
- 発表場所
  愛知
- 年月日
  2014-05-27 – 2014-05-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26840085

1. 丹羽康貴 (40590071)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
2. 坂本雅行 (00777865)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 宮脇寛行 (40785979)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 阪東勇輝 (70826809)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 真仁田聡 (80584135)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 程肇 (00242115)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 高田慎治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

瓜生 耕一郎 Uriu Koichiro

研究課題

研究成果

共同研究者

眠気の生成・解消機構の解明のための総括研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

細胞状態遷移と神経回路遷移をつなぐ数理モデル: 眠気の生成・解消機構の理論研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

Period1誘導化合物の位相前進作用の解明とそれを用いた内的脱同調モデルの構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

動く細胞集団における遺伝子発現リズム動態の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

組織変形のもとでの発生時計の同期過程研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

シグナルに対する概日時計の位相応答理論とその実験検証研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

発生組織における時計の時空間動態:分節時計再同期の数理モデリング研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

細胞集団の協調移動現象の数理モデリング研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Ripply suppresses Tbx6 to induce dynamic-to-static conversion in somite segmentation2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Orchestration of tissue shape changes and gene expression patterns in development.2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Cell size homeostasis under the circadian regulation of cell division in cyanobacteria.2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] From local resynchronization to global pattern recovery in the zebrafish segmentation clock2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Complementary phase responses via functional differentiation of dual negative feedback loops2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Synchronization dynamics of mobile oscillators in the presence of coupling delays2019

著者名/発表者名

雑誌名

瓜生耕一郎 Uriu Koichiro