関真秀 Seki Masahide

研究者番号	90749326
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2024年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任准教授 2019年度 – 2021年度: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分43060:システムゲノム科学関連研究代表者以外学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 小区分59040:栄養学および健康科学関連 / 中区分57:口腔科学およびその関連分野 / 小区分38060:応用分子細胞生物学関連
キーワード	研究代表者ナノポアシークエンサー / エピジェネティクス / DNAメチル化 / ナノポアシークエンス / 乳がん / エピゲノム / トランスクリプトーム研究代表者以外環境応答 / 植物 / 生活習慣病 … もっと見る / ダイレクトリプログラミング / 線維芽細胞 / 心筋再生 / 一細胞CRISPRスクリーニング / SNP / 一細胞解析 / CRISPRスクリーニング / GWAS / CRISPR / １細胞解析 / エンハンサー / 神経細胞死制御 / 神経細胞死 / 不均一光環境 / 転写開始点制御 / レジリエンス / 不均一環境隠す

生活習慣病による心不全発症機構の解明と直接リプログラミングによる革新的治療法開発
- 研究代表者
  
  貞廣威太郎
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分59040:栄養学および健康科学関連
- 研究機関
  慶應義塾大学
ターゲット特異的な長鎖DNAメチル化解析法の開発と乳がんでの応用解析研究代表者
- 研究代表者
  
  関真秀
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東京大学
神経細胞の生存を支えるレトログレードシグナルの解明に関する細胞工学研究
- 研究代表者
  
  久恒辰博
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分38060:応用分子細胞生物学関連
- 研究機関
  東京大学
一細胞CRISPRスクリーニング法を駆使した機能的GWAS-SNP検出法の確立
- 研究代表者
  
  北條宏徳
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分57:口腔科学およびその関連分野
- 研究機関
  東京大学
微量サンプルからの長鎖全ゲノムメチル化解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  関真秀
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東京大学
不均一環境変動に対する植物のレジリエンスを支える多層的情報統御の分子機構
- 研究代表者
  
  松下智直
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  京都大学
植物の不均一環境変動へのレジリエンスを支える転写開始点制御機構
- 研究代表者
  
  松下智直
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  京都大学
ナノポアシークエンサーを用いたRNA合成及び分解の新規解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  関真秀
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2019

すべて雑誌論文学会発表図書

[図書] 実験医学別冊実験デザインからわかる　シングルセル研究実践テキスト (担当:分担執筆, 範囲:シングルセル解析実施前の予備検討：バルクRNA-Seq)2024
- 著者名/発表者名
  関真秀、鈴木穣
- 総ページ数
  11
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758122702
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K27160
[図書] がんゲノムデータ解析 (担当:分担執筆, 範囲:がんのゲノム解析のロングリード解析)2022
- 著者名/発表者名
  三宅修平、岡美穂、坂本祥駿、関真秀、鈴木絢子、鈴木穣
- 総ページ数
  34
- 出版者
  メディカル・サイエンス・インターナショナル
- ISBN
  9784815730529
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15074
[雑誌論文] Stem cell-based modeling and single-cell multiomics reveal gene-regulatory mechanisms underlying human skeletal development2023
- 著者名/発表者名
  Tani Shoichiro, Okada Hiroyuki, Onodera Shoko, Chijimatsu Ryota, Seki Masahide, Suzuki Yutaka, Xin Xiaonan, Rowe David W., Saito Taku, Tanaka Sakae, Chung Ung-il, Ohba Shinsuke, Hojo Hironori
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 42 号: 4 ページ: 112276-112276
- DOI
  10.1016/j.celrep.2023.112276
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K05318, KAKENHI-PROJECT-22K08773, KAKENHI-PROJECT-22K10212, KAKENHI-PROJECT-21J12970, KAKENHI-PROJECT-20K18053, KAKENHI-PROJECT-21K19552, KAKENHI-PROJECT-21K19589, KAKENHI-PROJECT-21H04952, KAKENHI-PROJECT-20H03885, KAKENHI-PROJECT-23K21494, KAKENHI-PROJECT-23K27718
[雑誌論文] Whole-genome Methylation Analysis of APOBEC Enzyme-converted DNA (~5 kb) by Nanopore Sequencing2022
- 著者名/発表者名
  Suzuko Zaha、Sakamoto Yoshitaka、Nagasawa Satoi、Sugano Sumio、Suzuki Ayako、Suzuki Yutaka、Seki Masahide
- 雑誌名
  
  BIO-PROTOCOL
  
  巻: 12 号: 3
- DOI
  10.21769/bioprotoc.4345
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15074, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Runx2 regulates chromatin accessibility to direct the osteoblast program at neonatal stages2022
- 著者名/発表者名
  Hojo Hironori, Saito Taku, He Xinjun, Guo Qiuyu, Onodera Shoko, Azuma Toshifumi, Koebis Michinori, Nakao Kazuki, Aiba Atsu, Seki Masahide, Suzuki Yutaka, Okada Hiroyuki, Tanaka Sakae, Chung Ung-il, McMahon Andrew P., Ohba Shinsuke
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: 40 号: 10 ページ: 111315-111315
- DOI
  10.1016/j.celrep.2022.111315
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K05318, KAKENHI-PROJECT-22K10212, KAKENHI-PROJECT-22K10261, KAKENHI-PROJECT-21K19552, KAKENHI-PROJECT-21K19589, KAKENHI-PROJECT-22KK0272, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-21H04952, KAKENHI-PROJECT-20H03885, KAKENHI-PROJECT-17K11932, KAKENHI-PROJECT-21K19883, KAKENHI-PROJECT-23K21494, KAKENHI-PROJECT-21H03146
[雑誌論文] Single-cell RNA sequencing unravels heterogeneity of skeletal progenitors and cell-cell interactions underlying the bone repair process2022
- 著者名/発表者名
  Nakayama Mika、Okada Hiroyuki、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Chung Ung-il、Ohba Shinsuke、Hojo Hironori
- 雑誌名
  
  Regenerative Therapy
  
  巻: 21 ページ: 9-18
- DOI
  10.1016/j.reth.2022.05.001
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10212, KAKENHI-PROJECT-22K10261, KAKENHI-PROJECT-21K19589, KAKENHI-PROJECT-22KK0272, KAKENHI-PROJECT-21H04952, KAKENHI-PROJECT-20H03885, KAKENHI-PROJECT-17K11932, KAKENHI-PROJECT-21K19883, KAKENHI-PROJECT-23K21494
[雑誌論文] Aberrant splicing isoforms detected by full-length transcriptome sequencing as transcripts of potential neoantigens in non-small cell lung cancer.2021
- 著者名/発表者名
  Oka M, Xu L, Suzuki T, Yoshikawa T, Sakamoto H, Uemura H, Yoshizawa AC, Suzuki Y, Nakatsura T, Ishihama Y, Suzuki A, Seki M
- 雑誌名
  
  Genome Biol.
  
  巻: 22(1):9 号: 1 ページ: 1-9
- DOI
  10.1186/s13059-020-02240-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K09297, KAKENHI-PLANNED-17H06306, KAKENHI-PROJECT-19K16108, KAKENHI-PROJECT-19K16792, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-18K08637, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299
[雑誌論文] ナノポアシークエンサーによるDNAメチル化解析2021
- 著者名/発表者名
  関　真秀、坂本　祥駿、座波　紗子、鈴木　穣
- 雑誌名
  
  月刊「細胞」
  
  巻: 53 ページ: 818-820
- NAID
  40022757051
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15074
[雑誌論文] Long-read whole-genome methylation patterning using enzymatic base conversion and nanopore sequencing2021
- 著者名/発表者名
  Sakamoto Yoshitaka、Zaha Suzuko、Nagasawa Satoi、Miyake Shuhei、Kojima Yasuyuki、Suzuki Ayako、Suzuki Yutaka、Seki Masahide
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Research
  
  巻: 49 号: 14 ページ: e81-e81
- DOI
  10.1093/nar/gkab397
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16108, KAKENHI-PROJECT-21J13203, KAKENHI-PROJECT-21K15074, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Transcript Identification Through Long-Read Sequencing2021
- 著者名/発表者名
  Seki Masahide、Oka Miho、Xu Liu、Suzuki Ayako、Suzuki Yutaka
- 雑誌名
  
  Methods in Molecular Biology
  
  巻: 2284 ページ: 531-541
- DOI
  10.1007/978-1-0716-1307-8_29
- ISBN
  9781071613061, 9781071613078
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16108, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Recent advances in the detection of base modifications using the Nanopore sequencer2019
- 著者名/発表者名
  Xu Liu、Seki Masahide
- 雑誌名
  
  Journal of Human Genetics
  
  巻: 65 号: 1 ページ: 25-33
- DOI
  10.1038/s10038-019-0679-0
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16108, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 微量DNAから実施可能なターゲット特異的な長鎖DNAメチル解析法の開発2023
- 著者名/発表者名
  関真秀、鈴木穣
- 学会等名
  第46回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K27160
[学会発表] Targeted long-read methylation sequencing using nanopore sequencing with hybridization capture2023
- 著者名/発表者名
  Masahide Seki, Yutaka Suzuki
- 学会等名
  The 14th International Workshop on Advanced Genomics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K27160
[学会発表] Targeted long-read methylation sequencing using nanopore sequencing with hybridization capture.2023
- 著者名/発表者名
  Masahide Seki, Yutaka Suzuki
- 学会等名
  The General Meeting, AGBT 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15074
[学会発表] 次世代シークエンス技術の現状と展望2022
- 著者名/発表者名
  関真秀、鈴木穣
- 学会等名
  第8回日本HTLV-1学会学術集会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15074
[学会発表] 微量DNAからの長鎖DNAメチル化解析手法の開発2022
- 著者名/発表者名
  関真秀
- 学会等名
  第15回　日本エピジェネティックス研究会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15074
[学会発表] 微量DNAからの長鎖DNAのメチル化解析手法の開発2021
- 著者名/発表者名
  関　真秀、坂本　祥駿、座波　紗子、永澤　慧、鈴木　絢子、鈴木　穣
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K15074

1. 松下智直 (20464399)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 多田安臣 (40552740)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
3. 花田耕介 (50462718)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
4. 鈴木孝征 (50535797)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
5. 久恒辰博 (10238298)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 北條宏徳 (80788422)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
7. 松林嘉克 (00313974)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 児玉豊 (00455213)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 稲垣宗一 (00597883)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 吉田聡子 (20450421)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 杉本慶子 (30455349)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 打田直行 (40467692)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 壽崎拓哉 (40575825)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 木下俊則 (50271101)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 佐瀬英俊 (70510006)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 芦苅基行 (80324383)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 望田啓子 (70624352)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 関根俊一 (50321774)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 鈴木邦律 (20373194)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 岡田寛之 (10883481)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
21. 大庭伸介 (20466733)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 貞廣威太郎 (60571130)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 永澤慧 (20773039)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 吉川聡明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

関 真秀 Seki Masahide

研究課題

研究成果

共同研究者

生活習慣病による心不全発症機構の解明と直接リプログラミングによる革新的治療法開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ターゲット特異的な長鎖DNAメチル化解析法の開発と乳がんでの応用解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

神経細胞の生存を支えるレトログレードシグナルの解明に関する細胞工学研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

一細胞CRISPRスクリーニング法を駆使した機能的GWAS-SNP検出法の確立

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

微量サンプルからの長鎖全ゲノムメチル化解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

不均一環境変動に対する植物のレジリエンスを支える多層的情報統御の分子機構

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

植物の不均一環境変動へのレジリエンスを支える転写開始点制御機構

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ナノポアシークエンサーを用いたRNA合成及び分解の新規解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 実験医学別冊 実験デザインからわかる シングルセル研究実践テキスト (担当:分担執筆, 範囲:シングルセル解析実施前の予備検討：バルクRNA-Seq)2024

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] がんゲノムデータ解析 (担当:分担執筆, 範囲:がんのゲノム解析のロングリード解析)2022

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[雑誌論文] Stem cell-based modeling and single-cell multiomics reveal gene-regulatory mechanisms underlying human skeletal development2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Whole-genome Methylation Analysis of APOBEC Enzyme-converted DNA (~5 kb) by Nanopore Sequencing2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Runx2 regulates chromatin accessibility to direct the osteoblast program at neonatal stages2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Single-cell RNA sequencing unravels heterogeneity of skeletal progenitors and cell-cell interactions underlying the bone repair process2022

関真秀 Seki Masahide

[図書] 実験医学別冊実験デザインからわかる　シングルセル研究実践テキスト (担当:分担執筆, 範囲:シングルセル解析実施前の予備検討：バルクRNA-Seq)2024