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氷見山 幹基  Himiyama Tomoki

研究者番号 90828310
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0001-5252-1834
所属 (現在) 2025年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2024年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員
2018年度 – 2022年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 研究員
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分37010:生体関連化学 / 0501:物理化学、機能物性化学、有機化学、高分子、有機材料、生体分子化学およびその関連分野
研究代表者以外
小区分37020:生物分子化学関連
キーワード
研究代表者
ペルオキシレドキシン / 化学修飾 / タンパク質集合体 / タンパク質 / 分子修飾 / エックス線結晶構造解析 / 四次構造 / 金属錯体 / 人工金属酵素
研究代表者以外
ペルオキシレドキシン … もっと見る / 超分子複合体 / 分子会合 / 四次構造 / Peroxiredoxin 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (38件)
  • 共同研究者

    (5人)
  •  ペルオキシレドキシンを基盤とした光応答性タンパク質ケージの設計と構築研究代表者

    • 研究代表者
      氷見山 幹基
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分37010:生体関連化学
    • 研究機関
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
  •  環状タンパク質の四次構造制御による機能スイッチング研究代表者

    • 研究代表者
      氷見山 幹基
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分37010:生体関連化学
    • 研究機関
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
  •  ペルオキシレドキシンの新規な超分子複合体

    • 研究代表者
      中村 努
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分37020:生物分子化学関連
    • 研究機関
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
  •  超好熱性古細菌由来ペルオキシレドキシンを基盤とする新規人工金属酵素の開発研究代表者

    • 研究代表者
      氷見山 幹基
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2019
    • 研究種目
      研究活動スタート支援
    • 審査区分
      0501:物理化学、機能物性化学、有機化学、高分子、有機材料、生体分子化学およびその関連分野
    • 研究機関
      国立研究開発法人産業技術総合研究所

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 雑誌論文 学会発表 産業財産権

  • [雑誌論文] Unnaturally Distorted Hexagonal Protein Ring Alternatingly Reorganized from Two Distinct Chemically Modified Proteins2023

    • 著者名/発表者名
      Himiyama Tomoki、Hamaguchi Tasuku、Yonekura Koji、Nakamura Tsutomu
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 34 ページ: 764-771

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.3c00057

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [雑誌論文] Functional analysis of the N‐terminal region of acetylxylan esterase from Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis2022

    • 著者名/発表者名
      Sasamoto Kohei、Himiyama Tomoki、Moriyoshi Kunihiko、Ohmoto Takashi、Uegaki Koichi、Nakamura Tsutomu、Nishiya Yoshiaki
    • 雑誌名

      FEBS Open Bio

      巻: 12 号: 10 ページ: 1875-1885

    • DOI

      10.1002/2211-5463.13476

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [雑誌論文] Reducing substrate inhibition of malate dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus by C-terminal truncation2022

    • 著者名/発表者名
      Shimozawa Yuya、Matsuhisa Hinano、Nakamura Tsutomu、Himiyama Tomoki、Nishiya Yoshiaki
    • 雑誌名

      Protein Engineering, Design and Selection

      巻: 35

    • DOI

      10.1093/protein/gzac008

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [雑誌論文] Structural analysis and reaction mechanism of malate dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus2021

    • 著者名/発表者名
      Shimozawa Yuya、Himiyama Tomoki、Nakamura Tsutomu、Nishiya Yoshiaki
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 1 ページ: 97-105

    • DOI

      10.1093/jb/mvab027

    • NAID

      40022723378

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403, KAKENHI-PROJECT-18K06616, KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [雑誌論文] Increasing loop flexibility affords low-temperature adaptation of a moderate thermophilic malate dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus.2021

    • 著者名/発表者名
      Yuya Shimozawa, Tomoki Himiyama, Tsutomu Nakamura, Yoshiaki Nishiya
    • 雑誌名

      Protein Engineering Design and Selection

      巻: 34

    • DOI

      10.1093/protein/gzab026

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06616, KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [雑誌論文] Crystal structure of acetylxylan esterase from Caldanaerobacter subterraneus subsp. tengcongensis.2021

    • 著者名/発表者名
      Kohei Sasamoto, Tomoki Himiyama, Kunihiko Moriyoshi, Takashi Ohmoto, Koichi Uegaki, Yoshiaki Nishiya, Tsutomu Nakamura
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica

      巻: F77 号: 11 ページ: 399-406

    • DOI

      10.1107/s2053230x21009675

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06616, KAKENHI-PROJECT-20K15403, KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [雑誌論文] Increasing loop flexibility affords low-temperature adaptation of a moderate thermophilic malate dehydrogenase from Geobacillus stearothermophilus2021

    • 著者名/発表者名
      Yuya Shimozawa, Tomoki Himiyama, Tsutomu Nakamura, Yoshiaki Nishiya
    • 雑誌名

      Protein Engineering Design & Selection

      巻: 34 ページ: 1-6

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [雑誌論文] Artificial Metalloenzymes: From Selective Chemical Transformations to Biochemical Applications2020

    • 著者名/発表者名
      Himiyama Tomoki、Okamoto Yasunori
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 25 号: 13 ページ: 2989-2989

    • DOI

      10.3390/molecules25132989

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [雑誌論文] Disassembly of the ring‐type decameric structure of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 by amino acid mutation2020

    • 著者名/発表者名
      Himiyama Tomoki、Nakamura Tsutomu
    • 雑誌名

      Protein Science

      巻: 29 号: 5 ページ: 1138-1147

    • DOI

      10.1002/pro.3837

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K21133, KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [雑誌論文] Rebuilding Ring-Type Assembly of Peroxiredoxin by Chemical Modification2020

    • 著者名/発表者名
      Himiyama Tomoki、Tsuchiya Yuko、Yonezawa Yasushige、Nakamura Tsutomu
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chemistry

      巻: 32 号: 1 ページ: 153-160

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.0c00587

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K05620, KAKENHI-PROJECT-20K05740, KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [雑誌論文] Distinct molecular assembly of homologous peroxiredoxins from Pyrococcus horikoshii and Thermococcus kodakaraensis2019

    • 著者名/発表者名
      Himiyama Tomoki、Oshima Maki、Uegaki Koichi、Nakamura Tsutomu
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: 未定 号: 1 ページ: 89-95

    • DOI

      10.1093/jb/mvz013

    • NAID

      40021952200

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K01815, KAKENHI-PROJECT-19K21133
  • [産業財産権] ペルオキシレドキシンに基づく人工ヘテロオリゴマータンパク質2021

    • 発明者名
      氷見山 幹基、中村 努
    • 権利者名
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2021-137971
    • 出願年月日
      2021
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [産業財産権] ペルオキシレドキシンに基づく人工ヘテロオリゴマータンパク質2021

    • 発明者名
      氷見山 幹基、中村努
    • 権利者名
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
    • 産業財産権種類
      特許
    • 産業財産権番号
      2021-137971
    • 出願年月日
      2021
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [学会発表] 精製工程の違いによる金属依存性糖脱アセチル化酵素の活性と立体構造への影響2023

    • 著者名/発表者名
      佐々本 康平、氷見山 幹基、武田 悠杜、張 宇琪、森芳 邦彦、大本貴士、上垣浩一、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 好熱菌由来糖脱アセチル化酵素の基質結合部位改変と構造解析2023

    • 著者名/発表者名
      武田 悠杜、佐々本 康平、氷見山 幹基、張 宇琪、森芳 邦彦、大本貴士、上垣浩一、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      日本農芸化学会2023年度大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] サルコシンオキシダーゼのL-プロリンに対する反応機構の解析2023

    • 著者名/発表者名
      張 宇琪、中嶋義隆、佐々本 康平、武田 悠杜、氷見山 幹基、中村 努、西矢芳昭
    • 学会等名
      第33回生物試料分析科学会合同年次学術集会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 糖脱アセチル化酵素TTE0866が有する天然変性N末端領域の役割2022

    • 著者名/発表者名
      佐々本 康平、氷見山 幹基、森芳 邦彦、大本貴士、上垣浩一、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      第20回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 化学修飾によるペルオキシレドキシン環状交互ヘテロ集合の構築2022

    • 著者名/発表者名
      氷見山 幹基、 濵口 祐、 米倉 功治、 中村 努
    • 学会等名
      令和4年度日本結晶学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] Caldanaerobacterポリサッカライドデアセチラーゼの反応機構解析2022

    • 著者名/発表者名
      武田 悠杜、佐々本 康平、氷見山 幹基、森芳 邦彦、大本貴士、上垣浩一、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 溶解性と凝集抑制に必要な好熱菌由来アセチルキシランエステラーゼの天然変性領域2022

    • 著者名/発表者名
      佐々本 康平、下澤 勇弥、氷見山 幹基、森芳 邦彦、大本貴士、上垣浩一、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      第22回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] サルコシンオキシダーゼのL-プロリンに対する反応機構の解析2022

    • 著者名/発表者名
      張 宇琪、中嶋義隆、下澤 勇弥、佐々本 康平、氷見山 幹基、中村 努、西矢芳昭
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] Rebuilding and altering ring-type assembly of peroxiredoxin by chemical modification2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [学会発表] Rebuilding ring-type decameric assembly of peroxiredoxin by chemical modification2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [学会発表] Rebuilding and altering ring-type assembly of peroxiredoxin by chemical modification2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山 幹基、中村 努
    • 学会等名
      第21回日本蛋白質科学年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 複雑で巨大な環状タンパク質の構造制御2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      産業技術支援フェアin KANSAI 2021
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [学会発表] 環状タンパク質多量体の構造制御2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山 幹基、中村 努
    • 学会等名
      第19回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 環状タンパク質多量体の構造制御2021

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第19回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [学会発表] Controlling ring-type assembly of peroxiredoxin by chemical modification2020

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      日本化学会第100春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K21133
  • [学会発表] 活性部位の進化により分岐したリンゴ酸脱水素酵素の基質認識2020

    • 著者名/発表者名
      下澤 勇弥、佐々本 康平、氷見山 幹基、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] The Structural Change Mechanism In The Catalytic Cycle Of Malate Dehydrogenase2020

    • 著者名/発表者名
      下澤 勇弥、西矢芳昭、佐々本 康平、氷見山 幹基、中村 努
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] Disassembly and reassembly of ring-type structure of peroxiredoxin by manipulating hydrophobic interaction2020

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第20回蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15403
  • [学会発表] X-ray crystallographic analysis of acetylxylan esterase from Caldanaerobacter subterraneus2020

    • 著者名/発表者名
      佐々本 康平、下澤 勇弥、氷見山 幹基、森芳 邦彦、大本 貴士、上垣浩一、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 天然変性タンパク質としてのアセチルキシランエステラーゼの構造・機能解析2020

    • 著者名/発表者名
      佐々本 康平、下澤 勇弥、氷見山 幹基、森芳 邦彦、大本 貴士、上垣浩一、西矢芳昭、中村 努
    • 学会等名
      第43回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] Disassembly and Reassembly of Ring-type Structure of Peroxiredoxin by Manipulating Hydrophobic Interaction2020

    • 著者名/発表者名
      氷見山 幹基、中村 努
    • 学会等名
      第20回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K05740
  • [学会発表] 環状十量体タンパク質Aeropyrum pernix K1由来ペルオキシレドキシンの集合挙動制御2019

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第13回バイオ関連化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K21133
  • [学会発表] Aeropyrum pernix K1由来ペルオキシレドキシンの環状四次構造を解離する変異導入2019

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第19回日本蛋白質科学会年会・第71回日本細胞生物学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K21133
  • [学会発表] Controlling ring-type decameric assembly of peroxiredoxin from Aeropyrum pernix K1 by combining amino acid mutation and chemical modification2019

    • 著者名/発表者名
      Tomoki Himiyama, Tsutomu Nakamura
    • 学会等名
      16th Conference on the Asian Crystallographic Association
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K21133
  • [学会発表] 変異導入によるペルオキシレドキシンの環状四次構造解離2019

    • 著者名/発表者名
      氷見山幹基、中村努
    • 学会等名
      第18回 産総研・産技連LS-BT合同研究発表会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K21133
  • 1.  中村 努 (10357668)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 20件
  • 2.  秋山 健太郎 (41001366)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  上垣 浩一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 4.  西矢 芳昭
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 5.  米澤 康滋
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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