林智彦 Hayashi Tomohiko

研究者番号	90838070
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 新潟大学, 自然科学系, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 新潟大学, 自然科学系, 准教授 2022年度 – 2023年度: 新潟大学, 自然科学系, 准教授 2019年度 – 2021年度: 新潟大学, 自然科学系, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
キーワード	研究代表者形態計測学的アプローチ / 積分方程式理論 / 自由エネルギー計算 / 天然変性ペプチド / ペプチド薬 / 自由エネルギー関数 / 水和自由エネルギー / ペプチド抗癌剤

次世代バイオ医薬品の物理理論に基づく高速設計法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  林智彦
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
- 研究機関
  新潟大学
次世代ペプチド薬の物理理論に基づく高速デザイン法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  林智彦
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
- 研究機関
  新潟大学
ペプチド抗癌剤の物理理論に基づく高速探索法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  林智彦
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分13040:生物物理、化学物理およびソフトマターの物理関連
- 研究機関
  新潟大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019

すべて雑誌論文学会発表産業財産権

[雑誌論文] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023
- 著者名/発表者名
  Yasuda Satoshi、Hayashi Tomohiko、Murata Takeshi、Kinoshita Masahiro
- 雑誌名
  
  Frontiers in Molecular Biosciences
  
  巻: 10 ページ: 1-23
- DOI
  10.3389/fmolb.2023.1159603
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03547, KAKENHI-PROJECT-21K06108, KAKENHI-PROJECT-21H02409
[雑誌論文] Nonadditivities of the Particle Sizes Hidden in Model Pair Potentials and Their Effects on Physical Adsorptions2023
- 著者名/発表者名
  Amano Ken-ichi、Furukawa Satoshi、Kubo Yuto、Nakamura Yuka、Ishii Rina、Tanase Ayane、Maebayashi Masahiro、Hayashi Tomohiko、Nishi Naoya、Sakka Tetsuo
- 雑誌名
  
  Langmuir
  
  巻: 39 号: 37 ページ: 12999-13007
- DOI
  10.1021/acs.langmuir.3c00968
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03547, KAKENHI-PROJECT-21K18935, KAKENHI-PLANNED-23H03829, KAKENHI-PROJECT-21H02046
[雑誌論文] A methodology for creating mutants of G‐protein coupled receptors stabilized in active state by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering2022
- 著者名/発表者名
  Yamamoto Taisei、Yasuda Satoshi、Kasai Rinshi S.、Nakano Ryosuke、Hikiri Simon、Sugaya Kanna、Hayashi Tomohiko、Ogasawara Satoshi、Shiroishi Mitsunori、Fujiwara Takahiro K.、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
- 雑誌名
  
  Protein Science
  
  巻: 31 号: 10
- DOI
  10.1002/pro.4425
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06108, KAKENHI-PROJECT-22K03547, KAKENHI-PLANNED-21H05252, KAKENHI-PROJECT-20H03225, KAKENHI-PLANNED-18H05424, KAKENHI-PLANNED-18H05425
[雑誌論文] Development of an Outward Proton Pumping Rhodopsin with a New Record in Thermostability by Means of Amino Acid Mutations2022
- 著者名/発表者名
  Yasuda Satoshi、Akiyama Tomoki、Kojima Keiichi、Ueta Tetsuya、Hayashi Tomohiko、Ogasawara Satoshi、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei、Kunishima Naoki、Sudo Yuki、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 126 号: 5 ページ: 1004-1015
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.1c08684
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PLANNED-18H05425, KAKENHI-PUBLICLY-21H00404, KAKENHI-PROJECT-21H02446, KAKENHI-PROJECT-20K21482, KAKENHI-PROJECT-21K15054, KAKENHI-PROJECT-20H02531
[雑誌論文] Controlling the Rigidity of Kinesin-Propelled Microtubules in an In Vitro Gliding Assay Using the Deep-Sea Osmolyte Trimethylamine N-Oxide2022
- 著者名/発表者名
  Kabir Arif Md. Rashedul、Munmun Tasrina、Hayashi Tomohiko、Yasuda Satoshi、Kimura Atsushi P.、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi、Sada Kazuki、Kakugo Akira
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 7 号: 4 ページ: 3796-3803
- DOI
  10.1021/acsomega.1c06699
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PLANNED-18H05425, KAKENHI-PROJECT-21K04846, KAKENHI-PLANNED-20H05972, KAKENHI-PROJECT-21H04434
[雑誌論文] A methodology for creating thermostabilized mutants of G‐protein coupled receptors by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering2022
- 著者名/発表者名
  Sugaya Kanna、Yasuda Satoshi、Sato Shingo、Sisi Chen、Yamamoto Taisei、Umeno Daisuke、Matsuura Tomoaki、Hayashi Tomohiko、Ogasawara Satoshi、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
- 雑誌名
  
  Protein Science
  
  巻: 31 号: 9
- DOI
  10.1002/pro.4404
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06108, KAKENHI-PROJECT-22K03547, KAKENHI-PLANNED-18H05425, KAKENHI-PLANNED-21H05228
[雑誌論文] Hydration properties of a protein at low and high pressures: Physics of pressure denaturation2020
- 著者名/発表者名
  Inoue Masao、Hayashi Tomohiko、Hikiri Simon、Ikeguchi Mitsunori、Kinoshita Masahiro
- 雑誌名
  
  The Journal of Chemical Physics
  
  巻: 152 号: 6 ページ: 065103-065103
- DOI
  10.1063/1.5140499
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PLANNED-18H05426, KAKENHI-PROJECT-17H03663
[雑誌論文] Accurate and rapid calculation of hydration free energy and its physical implication for biomolecular functions2020
- 著者名/発表者名
  Kinosita Masahiro、Hayashi Tomohiko
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: 12 号: 2 ページ: 469-480
- DOI
  10.1007/s12551-020-00686-5
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PROJECT-17H03663
[雑誌論文] Theoretical identification of thermostabilizing amino acid mutations for G-protein-coupled receptors2020
- 著者名/発表者名
  Takeshi Murata、Satoshi Yasuda、Tomohiko Hayashi、Masahiro Kinoshita
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: －号: 2 ページ: 323-332
- DOI
  10.1007/s12551-020-00678-5
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15099, KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PROJECT-17H03663, KAKENHI-PLANNED-18H05425
[雑誌論文] Comparison based on statistical thermodynamics between globule-to-coil transition of poly(N-isopropylacrylamide) and cold denaturation of a protein2020
- 著者名/発表者名
  Inoue Masao、Hayashi Tomohiko、Hikiri Simon、Ikeguchi Mitsunori、Kinoshita Masahiro
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Liquids
  
  巻: 317 ページ: 114129-114129
- DOI
  10.1016/j.molliq.2020.114129
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674
[雑誌論文] Development and structural determination of an anti-PrPC aptamer that blocks pathological conformational conversion of prion protein2020
- 著者名/発表者名
  Mashima Tsukasa、Lee Joon-Hwa、Kamatari Yuji O.、Hayashi Tomohiko、Nagata Takashi、Nishikawa Fumiko、Nishikawa Satoshi、Kinoshita Masahiro、Kuwata Kazuo、Katahira Masato
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 4934-4934
- DOI
  10.1038/s41598-020-61966-4
- NAID
  120006813315
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PUBLICLY-18H04550, KAKENHI-PROJECT-17H03663, KAKENHI-PROJECT-16K07269, KAKENHI-PUBLICLY-17H05878, KAKENHI-PROJECT-20H04285, KAKENHI-PROJECT-17K07307, KAKENHI-PROJECT-20K21477, KAKENHI-PROJECT-18K19397
[雑誌論文] Methodology for Further Thermostabilization of an Intrinsically Thermostable Membrane Protein Using Amino Acid Mutations with Its Original Function Being Retained2020
- 著者名/発表者名
  Yasuda Satoshi、Akiyama Tomoki、Nemoto Sayaka、Hayashi Tomohiko、Ueta Tetsuya、Kojima Keiichi、Tsukamoto Takashi、Nagatoishi Satoru、Tsumoto Kouhei、Sudo Yuki、Kinoshita Masahiro、Murata Takeshi
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  巻: 60 号: 3 ページ: 1709-1716
- DOI
  10.1021/acs.jcim.0c00063
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15099, KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PROJECT-19K16090, KAKENHI-PLANNED-18H05425, KAKENHI-PUBLICLY-19H04727, KAKENHI-PUBLICLY-19H05396, KAKENHI-PROJECT-17H03663, KAKENHI-PROJECT-18H02082, KAKENHI-PROJECT-18H02411
[雑誌論文] How Does a Microbial Rhodopsin RxR Realize Its Exceptionally High Thermostability with the Proton-Pumping Function Being Retained?2020
- 著者名/発表者名
  Hayashi Tomohiko、Yasuda Satoshi、Suzuki Kano、Akiyama Tomoki、Kanehara Kanae、Kojima Keiichi、Tanabe Mikio、Kato Ryuichi、Senda Toshiya、Sudo Yuki、Murata Takeshi、Kinoshita Masahiro
- 雑誌名
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  巻: 124 号: 6 ページ: 990-1000
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.9b10700
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K15099, KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PROJECT-19K16090, KAKENHI-PLANNED-18H05425, KAKENHI-PUBLICLY-19H04727, KAKENHI-PUBLICLY-19H05396, KAKENHI-PROJECT-17H03663, KAKENHI-PROJECT-18H02411, KAKENHI-PROJECT-17H06264
[雑誌論文] How Does the Recently Discovered Peptide MIP Exhibit Much Higher Binding Affinity than an Anticancer Protein p53 for an Oncoprotein MDM22019
- 著者名/発表者名
  Yamada Tatsuya、Hayashi Tomohiko、Hikiri Simon、Kobayashi Naohiro、Yanagawa Hiroshi、Ikeguchi Mitsunori、Katahira Masato、Nagata Takashi、Kinoshita Masahiro
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  巻: 59 号: 8 ページ: 3533-3544
- DOI
  10.1021/acs.jcim.9b00226
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06152, KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PLANNED-18H05426, KAKENHI-PROJECT-17H03663, KAKENHI-PUBLICLY-17H05878, KAKENHI-PROJECT-17K07307
[雑誌論文] An Accurate and Rapid Method for Calculating Solvation Free Energies of a Variety of Solutes Including Proteins2019
- 著者名/発表者名
  S. Hikiri, T. Hayashi, M. Inoue, T. Ekimoto, M. Ikeguchi, M. Kinoshita
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Physics
  
  巻: 150 号: 17 ページ: 175101-175101
- DOI
  10.1063/1.5093110
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03663, KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PLANNED-18H05426
[雑誌論文] Mechanism of globule-to-coil transition of poly(N-isopropylacrylamide) in water: Relevance to cold denaturation of a protein2019
- 著者名/発表者名
  Inoue Masao、Hayashi Tomohiko、Hikiri Simon、Ikeguchi Mitsunori、Kinoshita Masahiro
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Liquids
  
  巻: 292 ページ: 111374-111374
- DOI
  10.1016/j.molliq.2019.111374
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674, KAKENHI-PROJECT-17H03663
[産業財産権] 自由エネルギーの計算方法2023
- 発明者名
  村田武士、安田賢司、木下正弘、林智彦
- 権利者名
  村田武士、安田賢司、木下正弘、林智彦
- 産業財産権種類
  特許
- 産業財産権番号
  2023-221583
- 出願年月日
  2023
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03547
[学会発表] 膜輸送タンパク質-グルコース複合体の水和および揺らぎダイナミクス2023
- 著者名/発表者名
  Tatsuki Kawauchi, Tomohiko Hayashi
- 学会等名
  日本物理学会第78回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03547
[学会発表] A methodology for designing peptide drugs by combining structure prediction methods and statistical thermodynamics2023
- 著者名/発表者名
  Shunsuke Miyamoto, Tomohiko Hayashi
- 学会等名
  第61回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03547
[学会発表] Computational study for designing peptide drugs based on statistical thermodynamics2022
- 著者名/発表者名
  Shunsuke Miyamoto, Tomohiko Hayashi
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K03547
[学会発表] Theoretical study based on statistical mechanics for predicting native-like poses of a protein-peptide complex2021
- 著者名/発表者名
  Shunsuke Miyamoto, Masato Kawamura, Tomohiko Hayashi
- 学会等名
  The 59th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674
[学会発表] Structural and physical basis for anti-prion activity and destruction of the Alzheimer’s disease-related complex of an RNA-aptamer2021
- 著者名/発表者名
  Takashi Nagata, Tsukasa Mashima, Joon-Hwa Lee, Yuji O. Kamatari, Tomohiko Hayashi, Masahiro Kinoshita, Kazuo Kuwata, Masato Katahira
- 学会等名
  Pacifichem 2021
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674
[学会発表] Calculation of hydration free energy of a protein with sufficient accuracy and remarkably high speed2021
- 著者名/発表者名
  Masato Kawamura, Shunsuke Miyamoto, Tomohiko Hayashi, Masahiro Kinoshita
- 学会等名
  The 59th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674
[学会発表] Statistical thermodynamics on the weakening of binding affinity of myosin for actin at low temperatures2021
- 著者名/発表者名
  Tomohiko Hayashi, Masahiro Kinoshita
- 学会等名
  Pacifichem 2021
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674
[学会発表] Statistical thermodynamics on the weakening of binding affinity of myosin for actin at low temperatures2019
- 著者名/発表者名
  Tomohiko Hayashi, Masahiro Kinoshita
- 学会等名
  The 57th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674
[学会発表] Structural and Physical Basis for the Higher Affinity to Oncoprotein MDM2 of a Peptide Selected with MRNA Display Over Tumor Suppressor p532019
- 著者名/発表者名
  Takashi Nagata, Tatsuya Yamada, Tomohiko Hayashi, Simon Hikiri, Naohiro Kobayashi, Mitsunori Ikeguchi, Masato Katahira, Masahiro Kinoshita, Hiroshi Yanagawa
- 学会等名
  Biophysical Society 64th Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674
[学会発表] Physics of drastic decrease in water solubility upon coil-to-globule transition of poly(N-isopropylacrylamide)2019
- 著者名/発表者名
  Masao INOUE, Tomohiko Hayashi, Simon Hikiri, Masahiro Kinoshita
- 学会等名
  The 57th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K14674

1. 小林直宏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
2. 木下正弘

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
3. 安田賢司

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 5件

林 智彦 Hayashi Tomohiko

研究課題

研究成果

共同研究者

次世代バイオ医薬品の物理理論に基づく高速設計法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

次世代ペプチド薬の物理理論に基づく高速デザイン法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ペプチド抗癌剤の物理理論に基づく高速探索法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Physical pictures of rotation mechanisms of F1- and V1-ATPases: Leading roles of translational, configurational entropy of water2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Nonadditivities of the Particle Sizes Hidden in Model Pair Potentials and Their Effects on Physical Adsorptions2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A methodology for creating mutants of G‐protein coupled receptors stabilized in active state by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Development of an Outward Proton Pumping Rhodopsin with a New Record in Thermostability by Means of Amino Acid Mutations2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Controlling the Rigidity of Kinesin-Propelled Microtubules in an In Vitro Gliding Assay Using the Deep-Sea Osmolyte Trimethylamine N-Oxide2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A methodology for creating thermostabilized mutants of G‐protein coupled receptors by combining statistical thermodynamics and evolutionary molecular engineering2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Hydration properties of a protein at low and high pressures: Physics of pressure denaturation2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Accurate and rapid calculation of hydration free energy and its physical implication for biomolecular functions2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Theoretical identification of thermostabilizing amino acid mutations for G-protein-coupled receptors2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Comparison based on statistical thermodynamics between globule-to-coil transition of poly(N-isopropylacrylamide) and cold denaturation of a protein2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Development and structural determination of an anti-PrPC aptamer that blocks pathological conformational conversion of prion protein2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] Methodology for Further Thermostabilization of an Intrinsically Thermostable Membrane Protein Using Amino Acid Mutations with Its Original Function Being Retained2020

著者名/発表者名

林智彦 Hayashi Tomohiko