KUMA Kei-ichi 隈啓一

… Alternative Names

KUMA Keiichi 隈啓一

Less

Researcher Number	10221938
Other IDs
External Links
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2007 – 2009: 国立情報学研究所, 戦略研究プロジェクト創成センター, 教授 2007 – 2008: 国立情報学研究所, 戦略研究プロジェクト創成センター, 特任教授 2006: Kyoto University, Institute for Chemical Research, Researcher, 化学研究所, 研究員 2006: 京都大学, 化学研究所, 研究員(客員助教授) 2005 – 2006: 京都大学, 化学研究所, 研究員(科学技術振興) … More 2005 – 2006: 京都大学, 化学研究所, 科学技術振興研究員(常勤形態) 1995 – 1999: 京都大学, 大学院・理学研究科, 助手 1994 – 1996: 京都大学, 理学部, 助手 Less
Review Section/Research Field	Principal Investigator Evolutionary biology / 遺伝 Except Principal Investigator Biological Sciences / 遺伝
Keywords	Principal Investigator Morphological evolution / 形態進化 / Maximum likelihood method / Phylogenetic tree / Multiple alignment / Homology search / Comparative genome / Genome database / Mammals / 最尤法 … More / 分子系統樹 / マルチプルアライメント / 相同性検索 / ゲノム比較 / ゲノムデータベース / 哺乳類 / The neutral theory of molecular evolution / Functional constraint / Evolutionary rate / Gene duplication / Molecular evolution / Super gene family / Tissue specific gene / 中立説 / 機能的制約 / 進化速度 / 遺伝子重複 / 分子進化 / 超遺伝子族 / 組織特異的遺伝子 … More Except Principal Investigator 分子系統樹 / 進化 / 真核生物 / tRNA / 古細菌 / 立体構造 / アミノ酸配列 / シグナル伝達系 / 生物多様性 / 分子進化 / Organismal diversity / Phylogenetic tree / Gene duplication / Gene family / Cyclostomes / Sponge / 多細胞効物 / 多様性 / 形態形成遺伝子 / 遺伝子重複 / 遺伝子族 / ナメクジウオ / 円口類 / カイメン / bacteria / eukaryotes / archaea / tRNA identity / aminoacyl-tRNA synthetase / ribosome / RNA World / RNaseP / 逆転写 / プライマー / リジンtRNA / RNA世界 / 微量塩基成分 / アイデンティティ / アミノアシル合成酵素 / レトロポゾン / 真正細菌 / tRNAアイデンティティー / アミノアシルtRNA合成酵素 / リボザイム / RNAワールド / ΔΔG / 腦型PGD合成酵素 / グルタチオンSトランスフエラーゼ / チオレキシン様ドメイン / プロスタグランジン / アラキドン酸カスケード / 保存度 / 空間統計学 / プロファイル比較 / 遺伝子順序 / phosphatidylethanolamine / phosphatidylserine / 極性脂質 / 射影演算子 / 共進化 / 正の選択圧 / ミラーツリー法 / GPCR / データベース / ゲノム / 立襟鞭毛虫 / 多細胞化 / 大量情報 / 病原性ウイルスの進化 / 画面インターフェイス / DDBJ / 塩基配列データ / ソフトウェア / 遺伝情報解析 / 分子進化学 / 枯草菌デノムデータベース / 生物分類データベース / 塩基配列 / DNAデータベース / 解析ソフトウェア / 遺伝情報 Less

情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発
- Principal Investigator
  
  藤博幸
- Project Period (FY)
  2007 – 2008
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Kyushu University
A study on the origin and evolution of multicellular animals
- Principal Investigator
  
  IWABE Naoyuki
- Project Period (FY)
  2005 – 2009
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Kyoto University
情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発
- Principal Investigator
  
  藤博幸
- Project Period (FY)
  2005 – 2006
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Kyushu University
A Study of Relationship between Mammalian Specific Features and Gene Diversification on the Basis of Genome Comparisons.Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  KUMA Keiichi
- Project Period (FY)
  2005 – 2006
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Evolutionary biology
- Research Institution
  Kyoto University
Relationships between gene diversity and organismal evolution
- Principal Investigator
  
  MIYATA Takashi
- Project Period (FY)
  1997 – 1999
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
- Research Field
  
  遺伝
- Research Institution
  KYOTO UNIVERSITY
Tissue dependent molecular evolution : the attempt to link between molecular evolution and morphological evolution.Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  KUMA Kei-ichi
- Project Period (FY)
  1995 – 1997
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  遺伝
- Research Institution
  KYOTO UNIVERSITY
分子進化学における総合的遺伝情報解析ソフトウェアの開発研究
- Principal Investigator
  
  五條堀孝
- Project Period (FY)
  1993 – 1994
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B)
- Research Field
  
  遺伝
- Research Institution
  National Institute of Genetics
Origin and Evolution of RNA
- Principal Investigator
  
  OKADA Norihiro
- Project Period (FY)
  1992 – 1995
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- Research Institution
  Tokyo Institute of Technology

All 2009 2008 2007 2006 2005

All Journal Article Presentation Book

[Book] prostaglandin D_2 synthase- A Multitude of Biological Functions2008
- Author(s)
  Ichihara, H.・Kuma, K.・Urade, Y.・Toh, H
- Publisher
  Research Signpost
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19036021
[Book] 細胞工学別冊比較ゲノム学から読み解く生命システム:基本概念から最新ゲノム情報まで(分子進化と比較ゲノム-立襟鞭毛虫の遺伝子から探る動物の多細胞化)2007
- Author(s)
  岩部直之、菅裕、廣瀬希、隈啓一、藤博幸、岡田雅人
- Publisher
  秀潤社
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Journal Article] Ancient divergence of animal protein tyrosine kinase genes demonstrated by a gene family tree including choanoflagellate genes.2008
- Author(s)
  Suga, H., Sasaki, G., Kuma, K., Nishiyori, H., Hirose, N., Su, Z.H., Iwabe, N., Miyata, T.
- Journal Title
  
  FEBS Lett. 582(5)
  
  Pages: 815-818
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Journal Article] 実践的系統樹推定法:原理と特徴、樹形の信頼性評価、およびソフトウェア2006
- Author(s)
  隈啓一
- Journal Title
  
  化学と生物 44(3)
  
  Pages: 185-191
- NAID
  10017248242
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17570188
[Journal Article] Positive selection in the ComC-ComD system of streptococcal species2006
- Author(s)
  H.Ichihara, K.Kuma, H.Toh
- Journal Title
  
  J. Bacteriol 188巻・17号
  
  Pages: 6249-6434
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17048011
[Journal Article] Identification of rDNA-specific non-LTR retrotransposons in Cnidaria.2006
- Author(s)
  Kojima, K.K., Kuma, K., Toh, H., Fujiwara, H.
- Journal Title
  
  Mol. Biol. Evol. 23(10)
  
  Pages: 1984-1993
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Journal Article] A study on archaeal enzymes involved in polar lipids synthesis by an approach linking the informationabout amino acid sequences, genomic contexts and lipid composition2005
- Author(s)
  Daiyasu, H., Kuma, K., Yokoi, T., Morii, H., Koga, Y., Toh, H.
- Journal Title
  
  Archaea 1・6
  
  Pages: 399-410
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17048011
[Journal Article] Improvement in the accuracy of multiple sequence alignment program MAFFT.2005
- Author(s)
  Katoh, K., Kuma, K., Miyata, T., Toh, H.
- Journal Title
  
  Genome Inform. Ser. Workshop Genome Inform. 16(1)
  
  Pages: 22-33
- NAID
  130003997390
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Journal Article] MAFFT version 5: improvement in accuracy of multiple sequence alignment.2005
- Author(s)
  Katoh, K., Kuma, K., Toh, H., Miyata, T.
- Journal Title
  
  Nucleic Acids Res. 33(2)
  
  Pages: 511-518
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノム計画:II. 動物初期進化における遺伝子の多様化2009
- Author(s)
  岩部直之、隈啓一、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、村田友輔、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- Organizer
  日本遺伝学会第81回大会
- Place of Presentation
  信州大学理学部(松本市)(一般講演(口頭発表:3B-13))
- Year and Date
  2009-09-18
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノム計画:I. ゲノム概観2009
- Author(s)
  隈啓一、岩部直之、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- Organizer
  日本遺伝学会第81回大会
- Place of Presentation
  信州大学理学部(松本市)(一般講演(口頭発表:3B-12))
- Year and Date
  2009-09-18
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノムプロジェクト:I. ゲノムの概観2008
- Author(s)
  隈啓一、岩部直之、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- Organizer
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド(神戸市)(一般講演(ポスター発表:1P-0692))
- Year and Date
  2008-12-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛Monosiga ovataゲノムプロジェクト : I.ゲノムの概観2008
- Author(s)
  隈啓一他
- Organizer
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会.合同大会(BMB2008)
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド
- Year and Date
  2008-12-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] Genome sequencing project of a unicellular choanoflagellate, Monosiga ovata: Extensive molecular phylogenetic analysis with choanoflagellate genes reveals divergence patterns of gene family members in the early evolution of metazoans.2008
- Author(s)
  Iwabe, N., Kuma, K., Katoh, K., Suga, H., Hirose, N., Toh, H., Miyata, T., Suzuki, Y., Kasahara, M., Narita, T., Shin-i, T., Kuroki, Y., Toyoda, A., Sugano, S., Morishita, S., Kohara, Y., Fujiyama, A.
- Organizer
  XX International Congress of Genetics
- Place of Presentation
  Berlin, Germany(一般講演(ポスター発表:P121/18/B))
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫Monosiga ovataゲノムプロジェクト:II. 動物初期進化における遺伝子の多様化2008
- Author(s)
  岩部直之、隈啓一、加藤和貴、藤博幸、廣瀬希、佐々木剛、菅裕、宮田隆、鈴木穣、笠原雅弘、新井理、大石加寿子、鹿児島浩、豊田敦、黒木陽子、菅野純夫、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫
- Organizer
  第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド(神戸市)(一般講演(ポスター発表:1P-0693))
- Year and Date
  2008-12-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫遺伝子から探る動物初期進化における遺伝子多様化:(2)細胞接着、アポトーシス、転写関連遺伝子の進化2007
- Author(s)
  隈啓一, 他
- Organizer
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜
- Year and Date
  2007-12-14
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫遺伝子から探る動物初期進化における遺伝子多様化:(2)細胞接着、アポトーシス、転写調節関連遺伝子の進化2007
- Author(s)
  隈啓一、岩部直之、廣瀬希、菅裕、加藤和貴、藤博幸、宮田隆
- Organizer
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜(横浜市)(一般講演(ポスター発表:4P-1240))
- Year and Date
  2007-12-14
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 細胞外カドヘリンドメインを持つタンパク質の進化2007
- Author(s)
  隈啓一, 他
- Organizer
  日本進化学会第9回京都大会
- Place of Presentation
  京都大学吉田キャンパス
- Year and Date
  2007-08-31
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫遺伝子から探る動物初期進化における遺伝子多様化:(1)シグナル伝達系関連遺伝子の進化2007
- Author(s)
  岩部直之、隈啓一、廣瀬希、菅裕、加藤和貴、藤博幸、宮田隆
- Organizer
  第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
- Place of Presentation
  パシフィコ横浜(横浜市)(一般講演(ポスター発表:4P-1239))
- Year and Date
  2007-12-14
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 細胞外カドヘリンドメインを持つタンパク質の進化2007
- Author(s)
  隈啓一、加藤和貴、藤博幸、宮田隆、岩部直之
- Organizer
  日本進化学会第9回京都大会
- Place of Presentation
  京都大学理学部(京都市)(一般講演(口頭発表:A11))
- Year and Date
  2007-08-31
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] 立襟鞭毛虫・ゲノムと多細胞体制の進化, シンポジウムS4「動物進化のゲノム基盤」2007
- Author(s)
  岩部直之、隈啓一、加藤和貴、菅裕、廣瀬希、藤博幸、岡田雅人、笠原雅弘、森下真一、小原雄治、藤山秋佐夫、宮田隆
- Organizer
  日本進化学会第9回京都大会
- Place of Presentation
  京都大学理学部(京都市)(口頭発表:S4-1)
- Year and Date
  2007-09-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019
[Presentation] シグナル伝達系遺伝子についての系統樹データベースの作成2005
- Author(s)
  隈啓一、廣瀬希、藤博幸、岩部直之
- Organizer
  日本分子生物学会第28回年会
- Place of Presentation
  福岡ドーム(福岡市)(一般講演(ポスター発表:1P-0208))
- Year and Date
  2005-12-07
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17018019

1. MIYATA Takashi (20022692)

# of Collaborated Projects: 4 results

# of Collaborated Products: 12 results
2. TOH Hiroyuki (70192656)

# of Collaborated Projects: 3 results

# of Collaborated Products: 17 results
3. IWABE Naoyuki (80263060)

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 12 results
4. 市原寿子 (50362398)

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 2 results
5. 大安裕美 (40362397)

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 1 results
6. KATOH Kazutaka (70378868)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 11 results
7. OKADA Masato (10177058)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 2 results
8. OKADA Norihiro (60132982)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
9. TANAKA Yoshimasa (80091908)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
10. OHSAWA Shozo (10034620)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
11. KIKUCHI You (40273320)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
12. 五條堀孝 (50162136)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
13. 石和貞男 (20017205)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
14. 斉藤成也 (30192587)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
15. 舘野義男 (00202424)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
16. 長谷川政美 (60011657)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
17. 鵜川義弘 (20232803)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
18. 坂本健作 (50240685)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
19. MURATA Shigenori

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
20. 村田成範

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results

KUMA Kei-ichi 隈 啓一

KUMA Keiichi 隈 啓一

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

A study on the origin and evolution of multicellular animals

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

情報科学的アプローチによるタンパク質間のソフトな相互作用の解析法及び予測法の開発

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

A Study of Relationship between Mammalian Specific Features and Gene Diversification on the Basis of Genome Comparisons.Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Relationships between gene diversity and organismal evolution

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Tissue dependent molecular evolution : the attempt to link between molecular evolution and morphological evolution.Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

分子進化学における総合的遺伝情報解析ソフトウェアの開発研究

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Origin and Evolution of RNA

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Institution

[Book] prostaglandin D_2 synthase- A Multitude of Biological Functions2008

Author(s)

Publisher

Data Source

[Book] 細胞工学別冊比較ゲノム学から読み解く生命システム:基本概念から最新ゲノム情報まで(分子進化と比較ゲノム-立襟鞭毛虫の遺伝子から探る動物の多細胞化)2007

Author(s)

Publisher

Data Source

[Journal Article] Ancient divergence of animal protein tyrosine kinase genes demonstrated by a gene family tree including choanoflagellate genes.2008

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] 実践的系統樹推定法:原理と特徴、樹形の信頼性評価、およびソフトウェア2006

Author(s)

Journal Title

NAID

Data Source

[Journal Article] Positive selection in the ComC-ComD system of streptococcal species2006

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Identification of rDNA-specific non-LTR retrotransposons in Cnidaria.2006

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] A study on archaeal enzymes involved in polar lipids synthesis by an approach linking the informationabout amino acid sequences, genomic contexts and lipid composition2005

Author(s)

Journal Title

KUMA Kei-ichi 隈啓一

KUMA Keiichi 隈啓一