Nakamura Takenobu 中村壮伸

Researcher Number	10642324
Other IDs
Affiliation (Current)	2025: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 材料・化学領域, 主任研究員
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2017 – 2024: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 材料・化学領域, 主任研究員 2014 – 2017: 東北大学, 原子分子材料科学高等研究機構, 助教
Review Section/Research Field	Principal Investigator Mathematical physics/Fundamental condensed matter physics Except Principal Investigator Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related / Basic Section 32010:Fundamental physical chemistry-related / Mathematical Sciences in Search of New Cooperation
Keywords	Principal Investigator ランダム系 / ガラス / アモルファス構造 / 反応座標 / ガラス転移 / 自由エネルギー地形 / 自由エネルギー / 確率過程 / トポロジカルデータ解析 / パーシステントホモロジー / 統計物理学 … More Except Principal Investigator … More 同種核置換反転異性体 / グラフ解析 / ポテンシャルエネルギー曲面 / パーシステント・ホモロジー / 計算化学 / 生物物理 / 非平衡統計力学 / 非平衡熱力学 / 分子モーター / 分子シミュレーション / スローダイナミクス / 構造緩和 / 過冷却液体 / 分子動力学シミュレーション / ストークス-アインシュタイン則 / ケージジャンプモデル / ボゾンピーク / フラジリティ / 高分子ガラス / 過冷却水 / ガラス転移 / ソフトセラミクス / アモルフォス / 計算ホモロジ- / ミクロ相分離 / ナノ微粒子 / ソフトセラミックス / アモルファス / 自己組織化 / マルチスケール / 計算ホモロジー Less

Feature extraction of reaction route map by topological data analysis and its application to reactivity comparison, classification, and prediction
- Principal Investigator
  
  小林正人
- Project Period (FY)
  2023 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Review Section
  
  Basic Section 32010:Fundamental physical chemistry-related
- Research Institution
  Hokkaido University
Development of energetics of biomolecular motor F1-ATPase from the perspective of physical plausibility
- Principal Investigator
  
  Nakayama Yohei
- Project Period (FY)
  2019 – 2023
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Review Section
  
  Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
- Research Institution
  Tohoku University
Molecular mechanism of slow dynamics in glass-forming liquids: Transition states and transport phenomena
- Principal Investigator
  
  Kim Kang
- Project Period (FY)
  2018 – 2021
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Review Section
  
  Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
- Research Institution
  Osaka University
stochastic physics of disordered systems by persistent homologyPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Nakamura Takenobu
- Project Period (FY)
  2015 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- Research Field
  
  Mathematical physics/Fundamental condensed matter physics
- Research Institution
  National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
  Tohoku University
Mathematics of amorphous structures and soft ceramics
- Principal Investigator
  
  Nishiura Yasumasa
- Project Period (FY)
  2014 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Mathematical Sciences in Search of New Cooperation
- Research Institution
  Tohoku University

All 2024 2023 2018 2017 2016 2015 2014

All Journal Article Presentation

[Journal Article] Derivation of the Invariant Free-Energy Landscape Based on Langevin Dynamics2024
- Author(s)
  Nakamura Takenobu
- Journal Title
  
  Physical Review Letters
  
  Volume: 132 Issue: 13 Pages: 137101-137101
- DOI
  10.1103/physrevlett.132.137101
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H01864
[Journal Article] ポテンシャルエネルギー曲面の新記述子：反応経路地図のパーシステント・ホモロジー2024
- Author(s)
  村山武来, 小林正人, 青木雅允, 石橋卓, 齋藤琢弥, 中村壮伸, 寺本央, 武次徹也
- Journal Title
  
  Journal of Computer Chemistry, Japan
  
  Volume: -
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Journal Article] Characterizing Reaction Route Map of Realistic Molecular Reactions Based on Weight Rank Clique Filtration of Persistent Homology2023
- Author(s)
  Murayama Burai、Kobayashi Masato、Aoki Masamitsu、Ishibashi Suguru、Saito Takuya、Nakamura Takenobu、Teramoto Hiroshi、Taketsugu Tetsuya
- Journal Title
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  Volume: 19 Issue: 15 Pages: 5007-5023
- DOI
  10.1021/acs.jctc.2c01204
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04093, KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Journal Article] Reproducing the Reaction Route Map on the Shape Space from Its Quotient by the Complete Nuclear Permutation-Inversion Group2023
- Author(s)
  Teramoto Hiroshi、Saito Takuya、Aoki Masamitsu、Murayama Burai、Kobayashi Masato、Nakamura Takenobu、Taketsugu Tetsuya
- Journal Title
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  Volume: 19 Issue: 17 Pages: 5886-5896
- DOI
  10.1021/acs.jctc.3c00500
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-23H04093, KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Journal Article] Hierarchical structures of amorphous solids characterized by persistent homology2016
- Author(s)
  Yasuaki Hiraoka, Takenobu Nakamura, Akihiko Hirata, Emerson G. Escolar, Kaname Matsue, and Yasumasa Nishiura
- Journal Title
  
  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
  
  Volume: 113 Issue: 26 Pages: 7035-7040
- DOI
  10.1073/pnas.1520877113
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205, KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Journal Article] Persistent homology and many-body atomic structure for medium-range order in the glass2015
- Author(s)
  Takenobu Nakamura, Yasuaki Hiraoka, Akihiko Hirata,Emerson G Escolar, Yasumasa Nishiura
- Journal Title
  
  Nanotechnology
  
  Volume: 26 Issue: 30 Pages: 304001-304001
- DOI
  10.1088/0957-4484/26/30/304001
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530, KAKENHI-PROJECT-26610042, KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] Characterizing Reaction Route Map of Realistic Molecular Reactions based on Weight Rank Clique Filtration of Persistent Homology2023
- Author(s)
  B. Murayama, M. Kobayashi, M. Aoki, S. Ishibashi, T. Saito, T. Nakamura, H. Teramoto, and T. Taketsugu
- Organizer
  5th Conference of Theory and Applications of Computational Chemistry (TACC2023)
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Presentation] Reproducing Reaction Route Map on the Shape Space from Its Quotient by Complete Nuclear Permutation-Inversion Group2023
- Author(s)
  H. Teramoto, T. Saito, M. Aoki, B. Murayama, M. Kobayashi, T. Nakamura, and T. Taketsugu
- Organizer
  5th Conference of Theory and Applications of Computational Chemistry (TACC2023)
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Presentation] パーシステント・ホモロジーを用いた反応経路地図からの記述子の創出2023
- Author(s)
  村山武来・小林正人・青木雅允・石橋卓・齋藤琢弥・寺本央・中村壮伸・武次徹也
- Organizer
  第25回理論化学討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Presentation] PESの新たな記述子の創出：反応経路地図とパーシステント・ホモロジーを利用したアプローチ2023
- Author(s)
  村山武来・小林正人・青木雅允・石橋卓・齋藤琢弥・中村壮伸・寺本央・武次徹也
- Organizer
  日本コンピュータ化学会2023秋季年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Presentation] 反応経路地図とパーシステントホモロジーの融合によるエネルギー地形の記述子の開拓2023
- Author(s)
  村山武来・小林正人・青木雅允・石橋卓・齋藤琢弥・寺本央・中村壮伸・武次徹也
- Organizer
  シンポジウム「化学反応経路探索のニューフロンティア2023」
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Presentation] 反応経路地図とパーシステント・ホモロジーを利用したポテンシャルエネルギー曲面についての記述子の創出2023
- Author(s)
  村山武来・小林正人・青木雅允・石橋卓・齋藤琢弥・中村壮伸・寺本央・武次徹也
- Organizer
  分子科学討論会2023大阪
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K26608
[Presentation] 深層学習を用いたガラスの特徴的構造抽出2018
- Author(s)
  大山倫弘　中村壮伸
- Organizer
  日本物理学会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] 分子シミュレーションのための位相的データ解析Topological Data Analysis for the Molecular Dynamics Simulation2017
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  日本MRS年次大会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーによる単成分系の構造の記述2017
- Author(s)
  中村壮伸、白井達彦
- Organizer
  日本物理学会第72回年次大会
- Place of Presentation
  大阪大学
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] トポロジカルデータ解析超入門2017
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  レア・イベントの計算科学
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] 超基礎からのトポロジカルデータ解析 -典型例を通じたデータの読み方と材料科学への展開-2017
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  MI2Iチュートリアルセミナー
- Place of Presentation
  全日通労働組合
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] 自由エネルギー地形を適切に与える反応座標の構成方法2017
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  分子シミュレーション討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーによるガラスの微視的構造の記述2017
- Author(s)
  中村　壮伸
- Organizer
  ソフトマターを中心とした材料科学の基礎と応用
- Place of Presentation
  京都工芸繊維大学(京都)
- Year and Date
  2017-03-21
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] 自由エネルギー地形を適切に与える反応座標の構成方法2017
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  日本物理学会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] Persistent homology and medium range order in the glassy structure2017
- Author(s)
  Takenobu Nakamura, Yasuaki Hiraoka, Akihiko Hirata Emerson G. Escolar, and Yasumasa Nishiura
- Organizer
  The AIMR International Symposium 2017
- Place of Presentation
  仙台国際センター
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーによる単成分系の構造の記述2017
- Author(s)
  中村壮伸、白井達彦
- Organizer
  日本物理学会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] 乱れた系で起こるシアバンドのミクロな構造から見た解析2017
- Author(s)
  白井達彦、中村壮伸
- Organizer
  日本物理学会第72回年次大会
- Place of Presentation
  大阪大学
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーによるガラスの微視的構造の記述2017
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  ソフトマターを中心とした材料科学の基礎と応用
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] 自由エネルギー地形を適切に与える反応座標の構成方法2017
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  計算統計物理学研究会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーによるアモルファス構造の記述2016
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  統計物理学懇談会
- Place of Presentation
  学習院大学（東京）
- Year and Date
  2016-03-07
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いたアモルファス構造の記述2016
- Author(s)
  中村　壮伸
- Organizer
  The 10th Mini-Symposium on Liquids (MSL2016)
- Place of Presentation
  Okayama University, Okayama, Japan
- Year and Date
  2016-10-15
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いたアモルファス構造の記述2016
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  The 10th Mini-Symposium on Liquids (MSL2016)
- Place of Presentation
  岡山大学
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] 対象点除去法とパーシステントホモロジーを用いた局所構造の抽出2016
- Author(s)
  中村壮伸、白井達彦
- Organizer
  日本物理学会秋季大会
- Place of Presentation
  金沢大学
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いたアモルファス構造の記述2016
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  第21回高分子計算機科学研究会講座
- Place of Presentation
  東京工業大学
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] Medium range order in the amorphous material by persistent homology2016
- Author(s)
  Takenobu Nakamura
- Organizer
  Symposium: "Molecular dynamics of materials from assembly to fracture"
- Place of Presentation
  Temple University
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーによるアモルファス構造の記述2016
- Author(s)
  中村壮伸
- Organizer
  統計物理学懇談会
- Place of Presentation
  学習院大学　(東京都)
- Year and Date
  2016-03-07
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いた乱れた系の構造－物性相関の探索2016
- Author(s)
  白井達彦　中村壮伸
- Organizer
  日本物理学会秋季大会
- Place of Presentation
  金沢大学
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いたアモルファス構造の記述2016
- Author(s)
  中村　壮伸
- Organizer
  第21回高分子計算機科学研究会講座
- Place of Presentation
  東京工業大学蔵前会館ロイアルブルーホール（東京）
- Year and Date
  2016-06-21
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いた様々なアモルファス構造の記述2015
- Author(s)
  中村壮伸, 平岡裕章, 平田秋彦
- Organizer
  日本物理学会 2015年秋季大会
- Place of Presentation
  関西大学 (大阪府・大阪市)
- Year and Date
  2015-09-18
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いた様々なアモルファス構造の記述2015
- Author(s)
  中村壮伸, 平岡裕章, 平田秋彦
- Organizer
  日本物理学会 2015年秋季大会
- Place of Presentation
  関西大学 (大阪府・大阪市）
- Year and Date
  2015-09-18
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] パーシステントホモロジーによるアモルファス構造の記述2015
- Author(s)
  中村壮伸平岡裕章, 平田秋彦, Emerson Escolar, 西浦廉政
- Organizer
  計算統計物理学研究会
- Place of Presentation
  名古屋大学　(愛知県・名古屋市)
- Year and Date
  2015-11-21
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] Persistent Homology and Many-Body Atomic Structure for Medium-Range Order in the Glass2015
- Author(s)
  NAKAMURA, TAKENOBU, Hiraoka, Yasuaki, Escolar, Emerson and Nishiura, Yasumasa
- Organizer
  ICIAM2015
- Place of Presentation
  Beijing (China)
- Year and Date
  2015-08-14
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K13530
[Presentation] Persistent Homology and Many-Body Atomic Structure for Medium-Range Order in the Glass2015
- Author(s)
  NAKAMURA, TAKENOBU, Hiraoka, Yasuaki, Escolar, Emerson and Nishiura, Yasumasa
- Organizer
  8th International Congress on Industrial and Applied Mathematics(ICIAM2015)
- Place of Presentation
  Beijing （China)
- Year and Date
  2015-08-14
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] パーシステントホモロジーによる中距離秩序構造の記述2015
- Author(s)
  中村壮伸, 平岡裕章, 平田秋彦, Emerson Escolar, 松江要, 西浦廉政
- Organizer
  物理学会第70回年次大会
- Place of Presentation
  早稲田大学早稲田キャンパス (東京都新宿区）
- Year and Date
  2015-03-22
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] パーシステントホモロジーによるアモルファス構造の記述2015
- Author(s)
  中村壮伸平岡裕章, 平田秋彦, Emerson Escolar, 西浦廉政
- Organizer
  計算統計物理学研究会
- Place of Presentation
  名古屋大学（愛知県・名古屋市）
- Year and Date
  2015-11-21
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] パーシステントホモロジーを用いたアモルファスシリカ構造の表現II2014
- Author(s)
  中村壮伸*, 平岡裕章, 平田秋彦, 松江要, Emerson Escolar, 西浦廉政
- Organizer
  日本物理学会2014年秋季大会
- Place of Presentation
  中部大学春日井キャンパス (愛知県)
- Year and Date
  2014-09-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205
[Presentation] A characterization of the amorphous silica structure by persistent homology2014
- Author(s)
  Takenobu Nakamura*, Yasuaki Hiraoka, Akihiko Hirata, Emerson Escolor, Kaname Matsue and Yasumasa Nishiura
- Organizer
  International Symposium on Extended Molecular Dynamics and Enhanced Sampling: Nosé Dynamics 30 Years (NOSE30)
- Place of Presentation
  慶應義塾大学三田キャンパス (東京都港区)
- Year and Date
  2014-11-10
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26310205

1. Nishiura Yasumasa (00131277)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 6 results
2. Kim Kang (20442527)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
3. Nakayama Yohei (20757728)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
4. 平岡裕章 (10432709)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 7 results
5. 平田秋彦 (90350488)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 6 results
6. 齊藤国靖 (10775753)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
7. 阿尻雅文 (60182995)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
8. 小布施祈織 (90633967)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
9. 川崎猛史 (10760978)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
10. 芝隼人 (20549563)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
11. 小林正人 (40514469)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 9 results
12. 寺本央 (90463728)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 7 results

Nakamura Takenobu 中村 壮伸

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

Feature extraction of reaction route map by topological data analysis and its application to reactivity comparison, classification, and prediction

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Development of energetics of biomolecular motor F1-ATPase from the perspective of physical plausibility

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Molecular mechanism of slow dynamics in glass-forming liquids: Transition states and transport phenomena

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

stochastic physics of disordered systems by persistent homologyPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Mathematics of amorphous structures and soft ceramics

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

[Journal Article] Derivation of the Invariant Free-Energy Landscape Based on Langevin Dynamics2024

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] ポテンシャルエネルギー曲面の新記述子：反応経路地図のパーシステント・ホモロジー2024

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Characterizing Reaction Route Map of Realistic Molecular Reactions Based on Weight Rank Clique Filtration of Persistent Homology2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Reproducing the Reaction Route Map on the Shape Space from Its Quotient by the Complete Nuclear Permutation-Inversion Group2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Hierarchical structures of amorphous solids characterized by persistent homology2016

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Persistent homology and many-body atomic structure for medium-range order in the glass2015

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Presentation] Characterizing Reaction Route Map of Realistic Molecular Reactions based on Weight Rank Clique Filtration of Persistent Homology2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Reproducing Reaction Route Map on the Shape Space from Its Quotient by Complete Nuclear Permutation-Inversion Group2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] パーシステント・ホモロジーを用いた反応経路地図からの記述子の創出2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] PESの新たな記述子の創出：反応経路地図とパーシステント・ホモロジーを利用したアプローチ2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 反応経路地図とパーシステントホモロジーの融合によるエネルギー地形の記述子の開拓2023

Nakamura Takenobu 中村壮伸