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FUKAMI Kaoru  深海 薫

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KOBAYASHI Kaoru  小林 薫

小林 薫(深海)  コバヤシ カオル(フカミ)

小林 薫(深海 薫)  コバヤシ カオル(フカミ カオル)

KOBAYASHI  深海 薫

小林 薫  コバヤシ カオル

深海 薫

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Researcher Number 20225494
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2004: RIKEN, Bio Resource centre, head of room, バイオリソースセンター, 室長
2004: 理化学研究所, バイオリソースセンター・情報技術室, 室長
2003 – 2004: 独立行政法人理化学研究所, 情報解析技術室, 室長(副主任研究員待遇)
2003: 理科学研究所, バイオリソースセンター・情報解析室, 室長
2001 – 2002: 国立遺伝学研究所, 生命情報・DDBJ研究センター, 助手 … More
1998 – 2000: 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 助手
1996: 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 助手
1995: 名古屋大学, 理学・, 助手
1994: 名古屋大学, 理学部, 助手
1990 – 1991: 名古屋大学, 理学部, 助手 Less
Review Section/Research Field
Principal Investigator
遺伝 / Anthropology
Except Principal Investigator
Biological Sciences / 生物物性学 / 人類学(含生理人類学) / Biophysics / 自然史科学 / 遺伝
Keywords
Principal Investigator
分子進化 / MIC / MHC / タンパク質ドメイン / rhesus monkey / chimpanzee / molecular evolution / immunology / genome / primate … More / アカゲザル / チンパンジー / 免疫学 / ゲノム / 霊長類 / 系統樹 / RNA結合ドメイン / グロビンタンパク質 / タンパク質サブユニット … More
Except Principal Investigator
分子進化 / モジュ-ル / タンパク質 / FAMSBASE / GTOP / FAMS / CAFASP / CASP / molecular evolution / プロテオーム / LINE / ゲノム断片重複 / ゲノム / HLA / protein / GenBank / DDBJ / DNA / Molecular evolution / 立体構造 / 水素結合ネットワ-ク / prediction / structure / 機能進化解析 / タンパク質立体構造予測 / タンパク質データベ-ス / 遺伝子 / バイオインフォマティックス / FAMS、FAMSBASE / アライメント / コンピュータ解析 / ホモロジーモデリング / 予測 / primate evolution / divergence time / neutral evolution / genome fragment duplication / genome analysis / MHC class genomic region / HLAクラスI遺伝子領域 / 霊長類進化 / 分岐時間 / 中立進化 / LINE配列 / ゲノム解析 / MHCクラスIゲノム領域 / protein three-dimensional structure / assembly PCR method / chimera protein / folding pattern / evolutionary protein engineering / design of artificial protein / periplasmic binding protein / アセンフーリーPCR法 / タンパク質立体構造 / アセンブリーPCR法 / キメラタンパク質 / 折れたたみパターン / 進化工学 / 人工タンパク質デザイン / ペリプラズム結合タンパク質 / Periplasmic binding protein / Mitochondria / Operon / Genome / Structural evolution / Natural history / ミトコンドリア進化 / 分子系統 / 高次構造進化 / periplasmicタンパク / SINE / ゲノム進化 / ゲノム比較 / 色素遺伝子 / エポキシダーゼ / MIC / ペリプラズミック結合タンパク質 / ミトコンドリア / オペロン / 構造進化 / 自然史 / EBI / bioinformatics / database / Gen Bank / EMBL / 生命情報学 / データベース / Exon-shuffling / Barnase / Conformation / Function of module / Protein design / Module / コンピュ-タ・グラフィックス / モジュ-ルのデ-タベ-ス / エクソン混成 / バルナーゼ / タンパク質高次構造 / モジュールの酵素活性 / タンパク質設計 / モジュール / タンパク質分類 / モデリング / 機能予測 / 偽遺伝子 / 立体構造予測 / データベース構築 / ホモロジー検索 / 局所構造 / ドメイン / 選択的スプライシング / ゲノム情報解析 / 疎水相互作用 / 蛋白質立体構造 / 分子系統樹 / スプライシング / イントロン / RNPモチ-フ / RNA結合タンパク質 / エネルギ-極小化 / 位置指定突然変異 / ヘム蛋白 / Pー450cam Less
  • Research Projects

    (13 results)
  • Research Products

    (4 results)
  • Co-Researchers

    (22 People)
  •  Genome wide protein structure and function prediction database using homology modelling

    • Principal Investigator
      UMEYAMA Hideaki
    • Project Period (FY)
      2003 – 2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Kitasato University
  •  Genomic analysis of MHC class I and MIC gene family region in primatesPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      FUKAMI Kaoru
    • Project Period (FY)
      2003 – 2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Anthropology
    • Research Institution
      RIKEN
  •  ゲノム情報からのタンパク質構造の分類と予測

    • Principal Investigator
      NISHIKAWA Ken
    • Project Period (FY)
      2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      National Institute of Genetics
  •  Origin and evolution of MHC class I and MIC genes in primates

    • Principal Investigator
      TATENO Yoshio
    • Project Period (FY)
      2001 – 2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      人類学(含生理人類学)
    • Research Institution
      National Institute of Genetics
  •  Experimental study to verify structural changes of proteins taken place in the evolutionary process

    • Principal Investigator
      NISHIKAWA Ken
    • Project Period (FY)
      2000 – 2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      National Institute of Genetics
  •  Natural historical study of genes in genomes in view of the notion that a gene is segmented

    • Principal Investigator
      TATENO Yoshio
    • Project Period (FY)
      1998 – 1999
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      自然史科学
    • Research Institution
      National Institute of Genetics
  •  RNA結合ドメインの3回繰り返し構造を持つタンパク質におけるドメイン構造の進化Principal Investigator

    • Principal Investigator
      小林 薫
    • Project Period (FY)
      1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      遺伝
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  Study on DNA and related bioinformatics databases

    • Principal Investigator
      GOJOBORI Takashi
    • Project Period (FY)
      1995 – 1997
    • Research Category
      Grant-in-Aid for international Scientific Research
    • Research Field
      遺伝
    • Research Institution
      National Institute of Genetics
  •  ドメインの繰り返し構造の進化とタンパク質機能との関係Principal Investigator

    • Principal Investigator
      小林 薫
    • Project Period (FY)
      1994
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      遺伝
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  蛋白質のモジュ-ル内及びモジュ-ル間相互作用と立体構造

    • Principal Investigator
      野口 俊之
    • Project Period (FY)
      1991
    • Research Category
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
    • Research Field
      生物物性学
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  チトクロ-ムPー450の水素結合ネットワ-クと機能発現

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      1990
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  RNAの酵素活性とイントロンの起源

    • Principal Investigator
      郷 通千
    • Project Period (FY)
      1990
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  Structural and Functional Roles of Modules in Protein Architecture

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      1990 – 1991
    • Research Category
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (A)
    • Research Field
      生物物性学
    • Research Institution
      Nagoya University

All 2003 Other

All Journal Article

  • [Journal Article] Parallel Evolution of Ligand Specificity Between LacI/GalR Family Repressors and Periplasmic Sugar-Binding Proteins.2003

    • Author(s)
      Fukami-Kobayashi K., Tateno, Y., Nishikawa K.
    • Journal Title

      Mol.Biol.Evol. 20

      Pages: 267-277

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15013251
  • [Journal Article] Parallel Evolution of Ligand Specificity Between LacI/GalR Family Repressors and Periplasmic Sugar-Binding Proteins.2003

    • Author(s)
      Fukami-Kobayashi K., Tateno, Y., Nishikawa, K.
    • Journal Title

      Mol. Biol. Evol. 20

      Pages: 267-277

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15013251
  • [Journal Article] Genomic Evolution of MHC Class I Region in Primates

    • Author(s)
      Fukami-Kobayashi K
    • Journal Title

      Proc Nat Acad Sci in press

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15570199
  • [Journal Article] Genomic Evolution of MHC Class I Region in Primates.

    • Author(s)
      Fukami-Kobayashi K
    • Journal Title

      Proc Nat Acad Sci (in press)

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15570199
  • 1.  NISHIKAWA Ken (10093288)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 2 results
  • 2.  GO Mitiko (70037290)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 3.  NOGUTI Toshiyuki (90172775)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 4.  TATENO Yoshio (00202424)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 5.  UMEYAMA Hideaki (20050619)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 6.  GOJOBORI Takashi (50162136)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 7.  INOKO Hidetoshi (10101932)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 8.  IMANISHI Tadashi (80270461)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 9.  SAITOU Naruya (30192587)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 10.  SUGAWARA Hideaki (80231372)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 11.  SHIBA Kiyotaka (40196415)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 12.  IWADATE Mitsuo (10327447)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 13.  IWASE Shigeru (10391872)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 14.  輪湖 博 (60158607)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 15.  太田 元規 (40290895)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 16.  北上 始 (50234240)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 17.  磯野 克己 (70011640)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 18.  池尾 一穂 (20249949)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 19.  KAWANISHI Yuichi
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 20.  YAMAZAKI Masa-aki
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 21.  BRYANT Steve
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 22.  SIMON Eastea
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results

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