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Shinoda Natsuki  篠田 夏樹

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Researcher Number 30838397
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Affiliation (Current) 2026: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 主任研究員
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2019 – 2026: 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 助教
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Basic Section 44010:Cell biology-related / Transformative Research Areas, Section (III) / Basic Section 44020:Developmental biology-related
Except Principal Investigator
Medium-sized Section 44:Biology at cellular to organismal levels, and related fields
Keywords
Principal Investigator
近接依存性標識法 / TurboID / 非細胞死性の機能 / カスパーゼ / ショウジョウバエ / FRETイメージング / 死細胞貪食 / ホスファチジルセリン / 形質膜 / Caspase-7 … More / Dual FRETイメージング / アポトーシス / カスパーゼ基質 / MASCaT / 老化 / APEX2 / 組織サイズ / 細胞死非依存的機能 … More
Except Principal Investigator
ショウジョウバエ / 発生頑強性 / カスパーゼ / 表現度 / 個体差 Less
  • Research Projects

    (6 results)
  • Research Products

    (52 results)
  • Co-Researchers

    (6 People)
  •  網羅的カスパーゼ基質の同定と評価によるアポトーシスの再定義Principal Investigator

    • Principal Investigator
      篠田 夏樹
    • Project Period (FY)
      2026 – 2029
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 44010:Cell biology-related
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Elucidating the molecular basis of expressivity that produces individual differences

    • Principal Investigator
      三浦 正幸
    • Project Period (FY)
      2024 – 2026
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • Review Section
      Medium-sized Section 44:Biology at cellular to organismal levels, and related fields
    • Research Institution
      National Institute for Basic Biology
      The University of Tokyo
  •  カスパーゼ反応場に選択的な非細胞死性の基質の包括的探索Principal Investigator

    • Principal Investigator
      篠田 夏樹
    • Project Period (FY)
      2023 – 2025
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Review Section
      Basic Section 44010:Cell biology-related
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  非ドメイン領域が組み替えるカスパーゼ反応場と, その非細胞死性の機能Principal Investigator

    • Principal Investigator
      篠田 夏樹
    • Project Period (FY)
      2022 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
    • Review Section
      Transformative Research Areas, Section (III)
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  The functional analysis of non-lethal caspase activity by deciphering caspase microenvironmentPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Shinoda Natsuki
    • Project Period (FY)
      2021 – 2022
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • Review Section
      Basic Section 44010:Cell biology-related
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  The analysis of non-apoptotic caspase activity by TurboID-mediated proximal labelingPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Shinoda Natsuki
    • Project Period (FY)
      2019 – 2020
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • Review Section
      Basic Section 44020:Developmental biology-related
    • Research Institution
      The University of Tokyo

All 2025 2024 2023 2022 2021 2020 2019

All Journal Article Presentation

  • [Journal Article] Nonapoptotic caspase-3 guides C1q-dependent synaptic phagocytosis by microglia2025

    • Author(s)
      Andoh Megumi、Shinoda Natsuki、Taira Yusuke、Araki Tasuku、Kasahara Yuka、Takeuchi Haruki、Miura Masayuki、Ikegaya Yuji、Koyama Ryuta
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 16 Issue: 1 Pages: 918-918

    • DOI

      10.1038/s41467-025-56342-7

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-20H05897, KAKENHI-PUBLICLY-23H04766, KAKENHI-PROJECT-24H00567, KAKENHI-PROJECT-23K05747, KAKENHI-PROJECT-22K21353
  • [Journal Article] A nonsecretory antimicrobial peptide mediates inflammatory organ damage in Drosophila renal tubules2025

    • Author(s)
      Oi Ayano、Shinoda Natsuki、Nagashima Shun、Miura Masayuki、Obata Fumiaki
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 44 Issue: 1 Pages: 115082-115082

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2024.115082

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K24032, KAKENHI-PROJECT-23KJ1182, KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Journal Article] Exploring caspase-dependent non-lethal cellular processes using Drosophila2024

    • Author(s)
      Shinoda Natsuki、Miura Masayuki
    • Journal Title

      Frontiers in Cell Death

      Volume: 3 Pages: 1472108-1472108

    • DOI

      10.3389/fceld.2024.1472108

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Journal Article] Executioner caspase is proximal to Fasciclin 3 which facilitates non-lethal activation in Drosophila olfactory receptor neurons2024

    • Author(s)
      Muramoto Masaya、Hanawa Nozomi、Okumura Misako、Chihara Takahiro、Miura Masayuki、Shinoda Natsuki
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 13

    • DOI

      10.7554/elife.99650.1

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Journal Article] Caspase cleaves<i>Drosophila</i><scp>BubR1</scp>to modulate spindle assembly checkpoint function and lifespan of the organism2023

    • Author(s)
      Shinoda Natsuki、Horikoshi Misuzu、Taira Yusuke、Muramoto Masaya、Hirayama Shoshiro、Murata Shigeo、Miura Masayuki
    • Journal Title

      The FEBS Journal

      Volume: 290 Issue: 17 Pages: 4200-4223

    • DOI

      10.1111/febs.16811

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K18107, KAKENHI-PROJECT-23K05747, KAKENHI-PUBLICLY-22H05586, KAKENHI-PLANNED-23H04918, KAKENHI-PROJECT-21H04774, KAKENHI-PROJECT-22H00402
  • [Journal Article] ROS Regulate Caspase-Dependent Cell Delamination without Apoptosis in the Drosophila Pupal Notum2020

    • Author(s)
      Fujisawa Yuya、Shinoda Natsuki、Chihara Takahiro、Miura Masayuki
    • Journal Title

      iScience

      Volume: 23 Issue: 8 Pages: 101413-101413

    • DOI

      10.1016/j.isci.2020.101413

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H06385, KAKENHI-PROJECT-19K16137
  • [Journal Article] Dronc-independent basal executioner caspase activity sustains Drosophila imaginal tissue growth2019

    • Author(s)
      Shinoda N, Hanawa N, Chihara T, Koto A, Miura M
    • Journal Title

      PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA

      Volume: 116 Issue: 41 Pages: 20539-20544

    • DOI

      10.1073/pnas.1904647116

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K14761, KAKENHI-PROJECT-19K16137, KAKENHI-PROJECT-16H06385, KAKENHI-PROJECT-20K20378
  • [Presentation] Caspase activation peaks earlier at the plasma membrane that facilitates rapid "eat-me" signal exposure in apoptotic cell2025

    • Author(s)
      篠田夏樹
    • Organizer
      第4回細胞死コロキウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] Illuminating spatiotemporal caspase activation at subcellular resolution during apoptosis by Dual FRET imaging2024

    • Author(s)
      Yusuke Taira, Yugo Miyata, Katsumori Segawa, Masayuki Miura, Natsuki Shinoda
    • Organizer
      第97回日本生化学会大会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] 静電相互作用を介した形質膜局所的なカスパーゼ活性化制御機構2024

    • Author(s)
      平雄介, 宮田佑吾, 瀬川勝盛, 三浦正幸, 篠田夏樹
    • Organizer
      第47回日本分子生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] Illuminating subcellularly regulated caspase activation during apoptosis by Dual FRET imaging2024

    • Author(s)
      Yusuke Taira, Yugo Miyata, Katsumori Segawa, Masayuki Miura, Natsuki Shinoda
    • Organizer
      The 3rd International Conference of Non-Lethal Roles of Cell Death Proteins
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] Discovery of programmed caspase activation without cell death in growing wing imaginal discs2024

    • Author(s)
      山本晃平, 村本雅哉, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第16回日本ショウジョウバエ学会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] 実行カスパーゼに近接する膜タンパク質Fasciclin 3はショウジョウバエ嗅覚受容体神経において非細胞死性のカスパーゼの活性化を促進する2024

    • Author(s)
      篠田夏樹, 村本雅哉, 花輪望未, 奥村美紗子, 千原崇裕, 三浦正幸
    • Organizer
      第76回日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] カスパーゼは形質膜で先立って活性化し、アポトーシス細胞の貪食を促進する2024

    • Author(s)
      平雄介, 宮田佑吾, 瀬川勝盛, 三浦正幸, 篠田夏樹
    • Organizer
      第76回日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] プログラムされた、細胞死を伴わないカスパーゼ活性化による組織サイズ制御の解析2024

    • Author(s)
      山本晃平, 村本雅哉, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第57回日本発生生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] 実行カスパーゼ近接タンパク質による非細胞死性の活性化の制御とショウジョウバエ嗅覚神経におけるその生理機能の解析2024

    • Author(s)
      篠田夏樹, 村本雅哉, 花輪望未, 奥村美紗子, 千原崇裕, 三浦正幸
    • Organizer
      第32回日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] 近接依存性標識法TurboIDをショウジョウバエ個体に適用し, 細胞死実行因子カスパーゼの多機能性を支える近接タンパク質環境とその変動を明らかにする2024

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 辻本葵, 奥村美紗子, 千原崇裕, 三浦正幸, 篠田夏樹
    • Organizer
      第47回日本分子生物学会年会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] カスパーゼは紡錘体チェックポイント構成因子BubR1を切断し, ショウジョウバエ個体の寿命を制限する2023

    • Author(s)
      篠田夏樹, 堀越水涼, 平雄介, 村本雅哉, 平山尚志郎, 村田茂穂, 三浦正幸
    • Organizer
      第31回日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] カスパーゼは紡錘体チェックポイント構成因子BubR1を切断し, ショウジョウバエ個体の寿命を制限する2023

    • Author(s)
      篠田夏樹, 堀越水涼, 平雄介, 村本雅哉, 平山尚志郎, 村田茂穂, 三浦正幸
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] カスパーゼは紡錘体チェックポイント構成因子BubR1を切断し, ショウジョウバエ個体の寿命を制限する2023

    • Author(s)
      篠田夏樹, 堀越水涼, 平雄介, 村本雅哉, 平山尚志郎, 村田茂穂, 三浦正幸
    • Organizer
      第31回日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] カスパーゼ7が担う細胞膜局所的活性の制御2023

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第31回日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] カスパーゼ7が担う細胞膜局所的活性の制御2023

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第31回日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] カスパーゼ活性を伴うプログラム「非」細胞死とその組織サイズ制御における機能の解析2023

    • Author(s)
      山本晃平, 村本雅哉, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第31回日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] Dual FRETシステムを基盤とした細胞内局所的カスパーゼ活性の解析2023

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] カスパーゼは紡錘体チェックポイント構成因子BubR1を切断し, ショウジョウバエ個体の寿命を制限する2023

    • Author(s)
      篠田夏樹, 堀越水涼, 平雄介, 村本雅哉, 平山尚志郎, 村田茂穂, 三浦正幸
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] プログラムされた非細胞死性カスパーゼ活性化及びその組織サイズ制御における機能の解析2023

    • Author(s)
      山本晃平, 村本雅哉, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第56回日本発生生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] Dual FRETシステムを基盤とした細胞内局所的カスパーゼ活性の解析2023

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] カスパーゼ活性を伴うプログラム「非」細胞死とその組織サイズ制御における機能の解析2023

    • Author(s)
      山本晃平, 村本雅哉, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第31回日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23K05747
  • [Presentation] プログラムされた非細胞死性カスパーゼ活性化及びその組織サイズ制御における機能の解析2023

    • Author(s)
      山本晃平, 村本雅哉, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第56回日本発生生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] 非細胞死性の機能の発揮を可能とするカスパーゼ反応場の解析2022

    • Author(s)
      篠田夏樹
    • Organizer
      第3回 細胞死コロキウム
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] アポトーシスにおける細胞内局所的カスパーゼ活性の解析2022

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第74回 日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] 生体膜に限局した非細胞死性カスパーゼ反応場の発見とその機能解析2022

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第30回 日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] 非細胞死性の機能の発揮を可能とするカスパーゼ反応場の解析2022

    • Author(s)
      篠田夏樹
    • Organizer
      第3回 細胞死コロキウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] Proximal proteins define the caspase activation platform for non-apoptotic functions2022

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第15回 日本ショウジョウバエ学会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] Caspase and its proximal proteins define local activating platforms for non-lethal functions2022

    • Author(s)
      Natsuki Shinoda
    • Organizer
      The 2nd International Conference of Non-Lethal Roles of Cell Death Proteins
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] アポトーシスにおける細胞内局所的カスパーゼ活性の解析2022

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第74回 日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] Proximal proteins define the caspase activation platform for non-apoptotic functions2022

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第15回 日本ショウジョウバエ学会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] Caspase and its proximal proteins define local activating platforms for non-lethal functions2022

    • Author(s)
      Natsuki Shinoda
    • Organizer
      The 2nd International Conference of Non-Lethal Roles of Cell Death Proteins
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] 細胞内局所的カスパーゼ活性解析に向けたDual FRETシステムの構築2022

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第30回 日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] 生体膜に限局した非細胞死性カスパーゼ反応場の発見とその機能解析2022

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第30回 日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] ミトコンドリアマトリックスに存在するカスパーゼ活性の解析2022

    • Author(s)
      篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第74回 日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] ミトコンドリアマトリックスに存在するカスパーゼ活性の解析2022

    • Author(s)
      篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第74回 日本細胞生物学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] 細胞内局所的カスパーゼ活性解析に向けたDual FRETシステムの構築2022

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第30回 日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22H05586
  • [Presentation] Proximity labeling by TurboID identified a novel caspase activator causing neuronal apoptosis during aging2021

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第14回 日本ショウジョウバエ学会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] ショウジョウバエにおける老化依存的なカスパーゼ活性を制御するカスパーゼ近傍タンパク質の解析2021

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第29回 日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] 近接依存性標識法APEX2によるショウジョウバエアポトーシス実行カスパーゼ近傍タンパク質の解析2021

    • Author(s)
      小木曽和志, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第29回 日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] ミトコンドリアマトリックスに存在するカスパーゼ活性の解析2021

    • Author(s)
      篠田夏樹
    • Organizer
      第2回 細胞死コロキウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] 局在型mSCAT3を用いた細胞内局所的カスパーゼ活性の解析2021

    • Author(s)
      平雄介, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第29回 日本Cell Death学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] Analysis of proximal proteins of caspases that are responsible for age-dependent activation in Drosophila2021

    • Author(s)
      村本雅哉, 花輪望未, 篠田夏樹, 三浦正幸
    • Organizer
      第64回 日本神経化学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K15080
  • [Presentation] 細胞死実行カスパーゼの非細胞死性機能に関わる, カスパーゼ周辺微小環境の解析2020

    • Author(s)
      篠田夏樹, 花輪望未, 三浦正幸
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19K16137
  • [Presentation] Dronc-independent basal executioner caspase activity sustains Drosophila imaginal tissue growth2019

    • Author(s)
      Shinoda, N., Hanawa N., Chihara T., Koto A., Miura, M.
    • Organizer
      Non-Apoptotic Roles of Apoptotic Proteins
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19K16137
  • [Presentation] 基礎的な実行カスパーゼ活性はショウジョウバエの翅の成長を促進する2019

    • Author(s)
      篠田夏樹, 花輪望未, 千原崇裕, 古藤日子, 三浦正幸
    • Organizer
      第28回日本CellDeath学会学術集会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19K16137
  • 1.  三浦 正幸 (50202338)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 2.  樫尾 宗志朗 (40823307)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 3.  古藤 日子
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 4.  小山 隆太
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 5.  小幡 史明
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 6.  村田 茂穂
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results

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