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Ooka Koji  大岡 紘治

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Researcher Number 40968260
Other IDs
Affiliation (Current) 2026: 東京大学, 教養学部, 特任助教
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2024 – 2025: 東京大学, 教養学部, 特任助教
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Basic Section 43040:Biophysics-related
Except Principal Investigator
Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related / Transformative Research Areas, Section (II)
Keywords
Principal Investigator
フォールディング反応 / 深層学習 / 統計物理学モデル / 自由エネルギー地形 / フォールディング / タンパク質
Except Principal Investigator
タンパク質 / 合理的設計 / タンパク質デザイン / 理論的設計 … More / タンパク質工学 / 酵素デザイン / グリーン・トランスフォーメーション / バイオ燃料 / 酵素 / データ科学 / 精密高分子 Less
  • Research Projects

    (3 results)
  • Research Products

    (26 results)
  • Co-Researchers

    (2 People)
  •  Rational design of precision polymer pharmaceuticals based on protein data science

    • Principal Investigator
      新井 宗仁
    • Project Period (FY)
      2025 – 2029
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
    • Review Section
      Transformative Research Areas, Section (II)
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  軽油相当のバイオ燃料を大量生産可能なGX用酵素の合理的創出

    • Principal Investigator
      新井 宗仁
    • Project Period (FY)
      2024 – 2026
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 27040:Biofunction and bioprocess engineering-related
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  タンパク質のダイナミクス予測のための統計力学モデルと深層学習モデルの開発Principal Investigator

    • Principal Investigator
      大岡 紘治
    • Project Period (FY)
      2024 – 2026
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
    • Review Section
      Basic Section 43040:Biophysics-related
    • Research Institution
      The University of Tokyo

All 2025 2024

All Journal Article Presentation

  • [Journal Article] タンパク質のフォールディング反応過程を予測する物理学理論2025

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Journal Title

      生体の科学

      Volume: 76 Pages: 109-114

    • Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Journal Article] タンパク質のフォールディング反応過程を予測する物理学理論2025

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Journal Title

      生体の科学

      Volume: 76 Pages: 109-114

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Journal Article] タンパク質のフォールディング過程を正確に予測する方法2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 82 Pages: 306-307

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Journal Article] タンパク質のフォールディング過程を正確に予測する方法2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 82 Pages: 306-307

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] Prediction of protein folding mechanisms by simple structure-based statistical mechanical models2025

    • Author(s)
      Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      Biophysical Society 2025 Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] Accurate prediction of symmetry breaking in the folding process of a symmetric protein2025

    • Author(s)
      Liu, R., Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      Biophysical Society 2025 Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] Accurate prediction of symmetry breaking in the folding process of a symmetric protein2025

    • Author(s)
      Liu, R., Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      Biophysical Society 2025 Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] Prediction of protein folding mechanisms by simple structure-based statistical mechanical models2025

    • Author(s)
      Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      Biophysical Society 2025 Annual Meeting
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] Prediction of detailed structures over the entire free energy landscape of protein folding using extended statistical mechanical models and restrained simulations2024

    • Author(s)
      Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      IUPAB 2024 ポスター発表
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] あらゆるタンパク質のフォールディング機構を予測可能な構造ベースの統計力学モデルの開発2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      第24回日本蛋白質科学会年会 ポスター発表
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] 統計物理学モデルによるタンパク質のフォールディング反応機構の予測とその応用2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      ラン藻ゲノム交流会2024
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] Prediction of detailed structures over the entire free energy landscape of protein folding using extended statistical mechanical models and restrained simulations2024

    • Author(s)
      Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      IUPAB 2024 ポスター発表
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] In vitroとin vivoにおけるタンパク質フォールディングの理論的予測2024

    • Author(s)
      新井宗仁、大岡紘治、季高駿士、吉村匡隆
    • Organizer
      第24回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「多面的視点から捉える蛋白質の世界」
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] 統計物理学モデルによるタンパク質のフォールディング反応機構の予測とその応用2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      ラン藻ゲノム交流会2024
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] In vitroとin vivoにおけるタンパク質フォールディングの理論的予測2024

    • Author(s)
      新井宗仁、大岡紘治、季高駿士、吉村匡隆
    • Organizer
      第24回日本蛋白質科学会年会ワークショップ「多面的視点から捉える蛋白質の世界」
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] Prediction of detailed structures over the entire free energy landscape of protein folding using extended statistical mechanical models and restrained simulations2024

    • Author(s)
      Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      IUPAB 2024 若手奨励賞シンポジウム
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] 対称構造を持つタンパク質の非対称的フォールディング反応の高精度予測2024

    • Author(s)
      劉潤晶、大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      第76回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] 統計力学モデルによるタンパク質フォールディング経路の理論的デザイン2024

    • Author(s)
      加藤沙愛、大岡紘治、劉潤晶、新井宗仁
    • Organizer
      第76回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] 統計力学モデルによるタンパク質フォールディング経路の理論的デザイン2024

    • Author(s)
      加藤沙愛、大岡紘治、劉潤晶、新井宗仁
    • Organizer
      第76回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] 対称構造を持つタンパク質の非対称的フォールディング反応の高精度予測2024

    • Author(s)
      劉潤晶、大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      第76回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] 統計物理学モデルによるタンパク質のフォールディング反応の予知とその応用2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      学術変革領域(A)予知生合成科学第3回若手シンポジウム
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] 統計力学モデルによる対称なタンパク質のフォールディング経路と酵素反応の予測2024

    • Author(s)
      劉潤晶、大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      学術変革領域(A)予知生合成科学第3回若手シンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] あらゆるタンパク質のフォールディング機構を予測可能な構造ベースの統計力学モデルの開発2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      第24回日本蛋白質科学会年会・若手奨励賞シンポジウム
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] あらゆるタンパク質のフォールディング機構を予測可能な構造ベースの統計力学モデルの開発2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      第24回日本蛋白質科学会年会・若手奨励賞シンポジウム
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • [Presentation] あらゆるタンパク質のフォールディング機構を予測可能な構造ベースの統計力学モデルの開発2024

    • Author(s)
      大岡紘治、新井宗仁
    • Organizer
      第24回日本蛋白質科学会年会 ポスター発表
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K18078
  • [Presentation] Prediction of detailed structures over the entire free energy landscape of protein folding using extended statistical mechanical models and restrained simulations2024

    • Author(s)
      Ooka, K., Arai, M.
    • Organizer
      IUPAB 2024 若手奨励賞シンポジウム
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24K01262
  • 1.  新井 宗仁 (90302801)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 12 results
  • 2.  季高 駿士 (50968138)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results

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