Yui Toshifumi 湯井敏文

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YUI Toshifumi 湯井敏文

湯井敏文ユイトシフミ

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Researcher Number	50230610
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Affiliation (Current)	2025: 宮崎大学, 工学部, 教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2021 – 2023: 宮崎大学, 工学部, 教授 2017 – 2019: 宮崎大学, 工学部, 教授 2007: University of Miyazaki, Department of Applied Chemistry, Associate Professor 2006: 宮崎大学, 工学部, 助教授 1994: 宮崎大学, 工学部, 助教授
Review Section/Research Field	Principal Investigator Basic Section 35020:Polymer materials-related / Life / Health / Medical informatics / Applied molecular and cellular biology Except Principal Investigator Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields / Applied microbiology
Keywords	Principal Investigator 操舵分子動力学法 / 分子シミュレーション / 操舵分子動力学報 / 分子力学パラメータ / 操舵分子動力学計算法 / 多糖誘導体 / キラル分離 / 糖結合モジュールタンパク質 / 糖鎖基質認識 / 糖結合モジュール … More / 糖結合モジュール（CBM） / ドッキングシミュレーション / キチナーゼ / セルラーゼ / キチン / セルロース / 立体配座解析 / エネルギーマップ / MM3分子力場 / 血液型特異性糖鎖 … More Except Principal Investigator 分子シミュレーション / 力場パラメータ / 相互作用 / 立体構造 / 糖鎖 / biphenyl dioxygenase / molecular dynamics method / chimeric enzyme / DNA shuffling / combinatorial chemistry / aromatic-ring dioxygenase / オキシゲナーゼ / ビフェニルジオキシゲナーゼ / 分子動力学的計算 / キメラ酵素 / DNAシャフリング / コンビナトリアルケミストリー / 芳香環二酸素添加酵素 / 芳香環ジオキシゲナーゼ Less

Development of carbohydrate force field to elucidate the mechanism of sugar chain interactions
- Principal Investigator
  
  宇都卓也
- Project Period (FY)
  2023 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
- Review Section
  
  Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
- Research Institution
  University of Miyazaki
Study of chiral recognition on polysaccharide derivatives using molecular simulation combined with data analysis methodPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Yui Toshifumi
- Project Period (FY)
  2021 – 2023
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 35020:Polymer materials-related
- Research Institution
  University of Miyazaki
Exhaustive analysis for substrate recognition mechanisms of the carbohydrate binding module proteinsPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Yui Toshifumi
- Project Period (FY)
  2017 – 2019
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Life / Health / Medical informatics
- Research Institution
  University of Miyazaki
Engineering of aromatic ring dioxygenase and application to combinatorial chemistry
- Principal Investigator
  
  HIROSE Jun
- Project Period (FY)
  2006 – 2007
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  University of Miyazaki
血液型特異性糖鎖分子の立体配座解析Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  湯井敏文
- Project Period (FY)
  1994
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- Research Field
  
  Applied molecular and cellular biology
- Research Institution
  University of Miyazaki

All 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2008

All Journal Article Presentation

[Journal Article] Extended ensemble simulation study of structural polysaccharide crystal structures2024
- Author(s)
  Yui Toshifumi, Uto Takuya
- Journal Title
  
  Cellulose Communications
  
  Volume: 31 Pages: 18-21
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Journal Article] The Detailed Crystal Structures of Chitin and Chitosan2024
- Author(s)
  Yui Toshifumi
- Journal Title
  
  Chitin and Chitosan Research
  
  Volume: 30 Pages: 2-8
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Journal Article] Molecular Dynamics Simulation Study of Chitosan−Zinc Chloride Complex Model2023
- Author(s)
  Noda Kotaro、Uto Takuya、Yui Toshifumi
- Journal Title
  
  Journal of Fiber Science and Technology
  
  Volume: 79 Issue: 2 Pages: 24-31
- DOI
  10.2115/fiberst.2023-0004
- ISSN
  2189-7654
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Journal Article] Extended Ensemble Molecular Dynamics Study of Ammonia?Cellulose I Complex Crystal Models: Free-Energy Landscape and Atomistic Pictures of Ammonia Diffusion in the Crystalline Phase2023
- Author(s)
  Yui Toshifumi、Uto Takuya、Noda Kotaro
- Journal Title
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  Volume: 63 Issue: 13 Pages: 4088-4099
- DOI
  10.1021/acs.jcim.3c00106
- Peer Reviewed / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Journal Article] Docking and Molecular Dynamics Study of the Carbohydrate Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A on the Surfaces of the Cellulose III1 Crystal2020
- Author(s)
  Toshifumi Yui, Takuya Uto
- Journal Title
  
  Journal of Renewable Materials
  
  Volume: - Issue: 8 Pages: 863-878
- DOI
  10.32604/jrm.2020.010830
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] 密度汎関数理論計算による糖質分子の立体化学研究2023
- Author(s)
  藤川大雅、湯井敏文、宇都卓也
- Organizer
  第60回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] Pyrococcus furiosus由来耐熱性キチナーゼのキチン結合性モジュールによるキチン分子鎖認識2023
- Author(s)
  末永ひな乃，宇都卓也，湯井敏文
- Organizer
  第37回日本キチン・キトサン学会大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] イオン液体の細胞毒性に関する分子シミュレーション研究2023
- Author(s)
  長浦翔、湯井敏文、宇都卓也
- Organizer
  第60回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] セルロース結晶面上を移動するTrichoderma reesei由来セロビオヒドロラーゼ糖結合性モジュールタンパク質の基質認識2023
- Author(s)
  長嶺一毅、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  第60回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 分子鎖剥離より評価する天然セルロース結晶の安定性2023
- Author(s)
  米倉健太、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  第60回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 種々の溶媒環境におけるカードラン三重らせん構造の膨潤に伴う自由エネルギー変化量2023
- Author(s)
  長谷部智大、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  第60回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 天然セルロース結晶表面からの分子鎖剥離に関する分子シミュレーション研究2023
- Author(s)
  米倉健太、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  令和 5 年度九州地区高分子若手研究会・冬の講演会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 分子シミュレーションが提案するキチン・キトサン結晶構造の新たな理解2023
- Author(s)
  湯井敏文
- Organizer
  第37回日本キチン・キトサン学会大会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] アルコール誘起αヘリックス形成の分子シミュレーション研究2023
- Author(s)
  末永ひな乃、湯井敏文、宇都卓也
- Organizer
  第60回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] βキチン結晶表面からの分子鎖剥離に関する分子シミュレーション研究2023
- Author(s)
  米倉健太，宇都卓也，湯井敏文
- Organizer
  第37回日本キチン・キトサン学会大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 溶液中におけるαヘリックスポリペプチド鎖の立体構造安定性2023
- Author(s)
  末永ひな乃、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  2023年繊維学会年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] セルロース結晶モデル表面からの単分子鎖剥離に関する分子シミュレーション研究2023
- Author(s)
  米倉健太、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  2023年繊維学会年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 各種溶媒に対する天然セルロース結晶の熱力学的評価2023
- Author(s)
  米倉健太，宇都卓也，湯井敏文
- Organizer
  セルロース学会第 30回年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] セルロース結晶面上を移動するTrichoderma reesei由来セロビオヒドロラーゼ糖結合性モジュールタンパク質の基質認識2023
- Author(s)
  末永ひな乃，宇都卓也，湯井敏文
- Organizer
  セルロース学会第 30回年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 量子化学計算による糖質分子の立体化学研究2023
- Author(s)
  藤川大雅、湯井敏文、宇都卓也
- Organizer
  令和 5 年度九州地区高分子若手研究会・冬の講演会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 拡張アンサンブル分子動力学計算法による多糖類分子鎖形成する高次構造の解析2023
- Author(s)
  湯井敏文、宇都卓也
- Organizer
  第72回高分子討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 温度レプリカ交換法による多糖分子鎖の多重らせん構造形成シミュレーション2023
- Author(s)
  田大翔、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  第60回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] セルロース誘導体によるキラル認識2022
- Author(s)
  武元佑樹, 宇都卓也, 湯井敏文
- Organizer
  化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] セルロース誘導体キラルセレクターにおけるキラル認識2022
- Author(s)
  米倉健太、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  セルロース学会第29回年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] アミロース誘導体によるキラル認識に関する分子シミュレーション研究2022
- Author(s)
  米倉健太、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] セルロース誘導体におけるキラル分離のシミュレーション研究2022
- Author(s)
  武元佑樹, 宇都卓也, 湯井敏文
- Organizer
  2022年繊維学会年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] フェニルカルバメート多糖誘導体におけるキラル認識2021
- Author(s)
  岩本成瑠, 宇都卓也, 湯井敏文
- Organizer
  セルロース学会第 28 回年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 多糖誘導体によるキラル分離のシミュレーション研究2021
- Author(s)
  武元佑樹、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  2021年繊維学会年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 多糖誘導体キラルセレクターにおけるキラル認識に関する研究2021
- Author(s)
  武元佑樹、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  第58回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] 多糖誘導体によるキラル分離のシミュレーション研究2021
- Author(s)
  武元佑樹, 宇都卓也, 湯井敏文
- Organizer
  セルロース学会第 28 回年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K05187
[Presentation] ニワトリ卵白リゾチームの糖加水分解反応シミュレーション2019
- Author(s)
  三谷亮樹、宇都卓也、湯井敏文
- Organizer
  第56回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] キチン結合性タンパク質ヘベインによる糖鎖認識2019
- Author(s)
  岡田　美沙希、高橋さくら、宇都卓也、湯井　敏文
- Organizer
  セルロース学会第26回年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] キチン結合性タンパク質ヘベインによる糖鎖認識2019
- Author(s)
  岡田　美沙希、高橋　さくら、宇都卓也、湯井　敏文
- Organizer
  第56回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] Carbohydrate recognition by chitin binding proteins: a molecular dynamics study2018
- Author(s)
  T. Yui, R. Otoshi, T. Uto
- Organizer
  14th International Chitin and Chitosan Conference
- Invited / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] 細菌由来キチナーゼのキチン結合モジュール表面における糖鎖ドッキング解析2017
- Author(s)
  落亮太、湯井敏文
- Organizer
  第54回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] 細菌由来キチナーゼのキチン結合モジュール表面における糖鎖吸着2017
- Author(s)
  落亮太、湯井敏文
- Organizer
  セルロース学会第24回年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] 微生物由来エクスパンシンによる基質認識2017
- Author(s)
  大西孝尚、湯井敏文
- Organizer
  第54回化学関連支部合同九州大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17K00409
[Presentation] キメラビフェニルジオキシゲナーゼによる1-フェニルピラゾールの位置選択的水酸化2008
- Author(s)
  廣瀬遵、西村恵、横井春比古、菅本和寛、湯井敏文、藤原秀彦、古川謙介
- Organizer
  日本農芸化学会2008年度大会
- Place of Presentation
  名古屋
- Year and Date
  2008-03-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18580080
[Presentation] キメラビフェニルジオキシゲナーゼによる1-フェニルピラゾールの位置選択的水酸化2008
- Author(s)
  広瀬遵、西村恵、横井春比古、菅本和寛、湯井敏文、藤原秀彦、古川謙介
- Organizer
  日本農芸化学会2008年度大会
- Place of Presentation
  名城大学(名古屋)
- Year and Date
  2008-03-28
- Description
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18580080
[Presentation] Regiospecific hydroxylation of 1-phenylpyrazole by chimeric biphenyl dioxygenase2008
- Author(s)
  Jun, Hirose, Megumi, Nishimura, Haruhiko, Yokoi, Kazuhiro, Sugamoto, Toshifumi, Yui, Hidehiko, Fujiwara, Kensuke, Furukawa
- Organizer
  Annual Meeting of Japan Society for Bioscience, Biotechnology, and Agrochemistry
- Place of Presentation
  Meijo University(Nagoya)
- Year and Date
  2008-03-28
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18580080

1. 宇都卓也 (60749084)

# of Collaborated Projects: 3 results

# of Collaborated Products: 31 results
2. HIROSE Jun (60264363)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 2 results
3. FURUKAWA Kensuke (90221556)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 3 results
4. SUGAMOTO Kazuhiro (10274771)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 3 results
5. YOKOI Haruhiko (00253815)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 3 results

Yui Toshifumi 湯井 敏文

YUI Toshifumi 湯井 敏文

湯井 敏文 ユイ トシフミ

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

Development of carbohydrate force field to elucidate the mechanism of sugar chain interactions

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Study of chiral recognition on polysaccharide derivatives using molecular simulation combined with data analysis methodPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Exhaustive analysis for substrate recognition mechanisms of the carbohydrate binding module proteinsPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Engineering of aromatic ring dioxygenase and application to combinatorial chemistry

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

血液型特異性糖鎖分子の立体配座解析Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

[Journal Article] Extended ensemble simulation study of structural polysaccharide crystal structures2024

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] The Detailed Crystal Structures of Chitin and Chitosan2024

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Molecular Dynamics Simulation Study of Chitosan−Zinc Chloride Complex Model2023

Author(s)

Journal Title

DOI

ISSN

Language

Data Source

[Journal Article] Extended Ensemble Molecular Dynamics Study of Ammonia?Cellulose I Complex Crystal Models: Free-Energy Landscape and Atomistic Pictures of Ammonia Diffusion in the Crystalline Phase2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Docking and Molecular Dynamics Study of the Carbohydrate Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A on the Surfaces of the Cellulose III1 Crystal2020

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Presentation] 密度汎関数理論計算による糖質分子の立体化学研究2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Pyrococcus furiosus由来耐熱性キチナーゼのキチン結合性モジュール によるキチン分子鎖認識2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] イオン液体の細胞毒性に関する分子シミュレーション研究2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] セルロース結晶面上を移動するTrichoderma reesei由来セロビオヒドロラーゼ糖結合性モジュールタンパク質の基質認識2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 分子鎖剥離より評価する天然セルロース結晶の安定性2023

Author(s)

Organizer

Yui Toshifumi 湯井敏文

YUI Toshifumi 湯井敏文

湯井敏文ユイトシフミ

[Presentation] Pyrococcus furiosus由来耐熱性キチナーゼのキチン結合性モジュールによるキチン分子鎖認識2023

[Presentation] セルロース結晶モデル表面からの単分子鎖剥離に関する分子シミュレーション研究2023

[Presentation] セルロース結晶面上を移動するTrichoderma reesei由来セロビオヒドロラーゼ糖結合性モジュールタンパク質の基質認識2023

[Presentation] フェニルカルバメート多糖誘導体におけるキラル認識2021