Tsukamoto Daisuke 塚本大輔

Researcher Number	50598836
Other IDs
Affiliation (Current)	2026: 北里大学, 理学部, 助教
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2020 – 2026: 北里大学, 理学部, 助教
Review Section/Research Field	Principal Investigator Transformative Research Areas, Section (III) / Basic Section 44050:Animal physiological chemistry, physiology and behavioral biology-related / Basic Section 42030:Animal life science-related Except Principal Investigator Medium-sized Section 90:Biomedical engineering and related fields
Keywords	Principal Investigator 体温変動 / 遺伝子発現制御 / 肝臓 / シマリス / 冬眠 / リズム / 概年リズム / トランスクリプトーム / 非モデル生物 / RNA結合タンパク質 … More Except Principal Investigator … More 虚血再灌流障害 / 低酸素・酸化ストレス / 心筋細胞 / シマリス / 冬眠 Less

シマリス肝臓の冬眠適応を支える、非冬眠期からの再調整による分子基盤の解明Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  塚本大輔
- Project Period (FY)
  2026 – 2027
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
- Review Section
  
  Transformative Research Areas, Section (III)
- Research Institution
  Kitasato University
Engineering 3D tissues with enhanced oxidative stress resistance inspired by hibernation mechanisms
- Principal Investigator
  
  関根秀一
- Project Period (FY)
  2025 – 2027
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
- Review Section
  
  Medium-sized Section 90:Biomedical engineering and related fields
- Research Institution
  Tokyo Women's Medical University
シマリスの冬眠に適応する肝臓の遺伝子発現再調整メカニズムの解明Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  塚本大輔
- Project Period (FY)
  2024 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
- Review Section
  
  Transformative Research Areas, Section (III)
- Research Institution
  Kitasato University
Analysis of gene expression with hibernation-specific periodicity in the liver of chipmunk adapted to low metabolic rates and body temperaturesPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  塚本大輔
- Project Period (FY)
  2023 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 44050:Animal physiological chemistry, physiology and behavioral biology-related
- Research Institution
  Kitasato University
Gene expression regulation in hibernating chipmunks for elucidating cold tolerance mechanisms in peripheral tissuesPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Tsukamoto Daisuke
- Project Period (FY)
  2020 – 2023
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 42030:Animal life science-related
- Research Institution
  Kitasato University

All 2025 2024 2023 2022 2021 2020

All Journal Article Presentation

[Journal Article] Periodic expression of Per1 gene is restored in chipmunk liver during interbout arousal in mammalian hibernation2025
- Author(s)
  Nakamaru Erina、Seki Kota、Shirahata Yuiho、Adachi Megumi、Sakabe Nene、Matsuo Takuya、Tsukamoto Daisuke、Takamatsu Nobuhiko
- Journal Title
  
  Scientific Reports
  
  Volume: 15 Issue: 1 Pages: 4403-4403
- DOI
  10.1038/s41598-025-87299-8
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018, KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Journal Article] シマリスの冬眠 : 遺伝子発現制御の解析から紐(ひも)を解く2024
- Author(s)
  塚本大輔
- Journal Title
  
  Milsil : 自然と科学の情報誌
  
  Volume: 17 Pages: 12-14
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Journal Article] Correlation Between Subgenome-biased DNA Loss and DNA Transposon Activation Following Hybridization in the Allotetraploid Xenopus Frogs2024
- Author(s)
  Suda Kosuke、Suzuki Takahiro、Hayashi Shun、Okuyama Honoka、Tsukamoto Daisuke、Matsuo Takuya、Tamura Kei、Ito Michihiko
- Journal Title
  
  Genome Biology and Evolution
  
  Volume: 16 Issue: 9 Pages: 179-179
- DOI
  10.1093/gbe/evae179
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018, KAKENHI-PROJECT-22K06376, KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Journal Article] シマリスの冬眠 : 遺伝子発現制御の解析から紐(ひも)を解く2024
- Author(s)
  塚本大輔
- Journal Title
  
  Milsil : 自然と科学の情報誌
  
  Volume: 17 Pages: 12-14
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Journal Article] Diversity of transactivation regions of DMRT1 in vertebrates2024
- Author(s)
  Ishikawa Naoki、Fujitani Kazuko、Okano Norihito、Hayashi Shun、Sakabe Nene、Inazumi Shiori、Okuyama Honoka、Seki Kota、Suda Kosuke、Tsukamoto Daisuke、Matsuo Takuya、Tamura Kei、Ito Michihiko
- Journal Title
  
  Molecular Biology Reports
  
  Volume: 51 Issue: 1 Pages: 1077-1077
- DOI
  10.1007/s11033-024-10006-9
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018, KAKENHI-PROJECT-22K06376, KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Journal Article] Heat shock factor 1 induces a short burst of transcription of the clock gene Per2 during interbout arousal in mammalian hibernation2023
- Author(s)
  Takamatsu Nobuhiko、Shirahata Yuiho、Seki Kota、Nakamaru Erina、Ito Michihiko、Tsukamoto Daisuke
- Journal Title
  
  Journal of Biological Chemistry
  
  Volume: 299 Issue: 4 Pages: 104576-104576
- DOI
  10.1016/j.jbc.2023.104576
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447, KAKENHI-PROJECT-20K06746
[Journal Article] Promoter generation for the chimeric sex-determining gene dm-W in Xenopus frogs2023
- Author(s)
 Hayashi Shun、Tamura Kei、Tsukamoto Daisuke、Ogita Yusaku、Takamatsu Nobuhiko、Ito Michihiko
- Journal Title
 
 Genes Genet. Syst.
 
 Volume: 98 Issue: 2 Pages: 53-60
- DOI
 10.1266/ggs.22-00137
- ISSN
 1341-7568, 1880-5779
- Year and Date
 2023-04-01
- Language
 English
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
 KAKENHI-PROJECT-22K06376, KAKENHI-PROJECT-23K05857, KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Journal Article] Molecular biological studies on hibernation in chipmunks (Tamias asiaticus), a mammalian hibernator2023
- Author(s)
  塚本　大輔、高松　信彦
- Journal Title
  
  低温科学
  
  Volume: 81 Pages: 119-129
- DOI
  10.14943/lowtemsci.81.119
- ISSN
  1880-7593
- Year and Date
  2023-03-20
- Language
  Japanese
- Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Journal Article] Neofunctionalization of a Noncoding Portion of a DNA Transposon in the Coding Region of the Chimerical Sex-Determining Gene dm-W in Xenopus Frogs2022
- Author(s)
 Hayashi Shun、Suda Kosuke、Fujimura Fuga、Fujikawa Makoto、Tamura Kei、Tsukamoto Daisuke、Evans Ben J、Takamatsu Nobuhiko、Ito Michihiko
- Journal Title
 
 Molecular Biology and Evolution
 
 Volume: 39 Issue: 7
- DOI
 10.1093/molbev/msac138
- Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
 KAKENHI-PROJECT-20K06447, KAKENHI-PROJECT-22K06376
[Journal Article] Gene expression regulation during hibernation using body temperature fluctuations in the mammalian hibernator chipmunk2021
- Author(s)
  塚本大輔、高松信彦
- Journal Title
  
  生化学
  
  Volume: 93 Issue: 6 Pages: 830-834
- DOI
  10.14952/SEIKAGAKU.2021.930830
- NAID
  40022783954
- ISSN
  0037-1017
- Year and Date
  2021-12-25
- Language
  Japanese
- Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447, KAKENHI-PROJECT-20K06746
[Presentation] 冬眠関連タンパク質 HP の進化とリス科 HP のマウスを用いた生理機能の解析2025
- Author(s)
  於保希咲枝、岡原学杜、坂部寧々、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、阿部幸一郎、塚本大輔
- Organizer
  学術変革領域A「冬眠生物学2.0」第2回若手領域会議
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] クラミドモナスb20変異株におけるROC15タンパク質の光誘導性分解の解析2024
- Author(s)
  白木優、水村早希、大村亜有美、Malavika Gururaj、塚本大輔、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉
- Organizer
  第31回日本時間生物学会学術大会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] 冬眠期のシマリス肝臓で発現が上昇する低温誘導性RNA結合タンパク質Rbm3の機能解析2024
- Author(s)
  坂部寧々、於保希咲枝、岡原学杜、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、塚本大輔
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] 冬眠期のシマリス肝臓で発現が上昇する低温誘導性RNA結合タンパク質Rbm3の機能解析2024
- Author(s)
  坂部寧々、於保希咲枝、岡原学杜、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、塚本大輔
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] シマリスの冬眠に適応する肝臓の遺伝子発現再調整メカニズムの解明2024
- Author(s)
  塚本大輔
- Organizer
  学術変革領域A「冬眠生物学2.0」夏の領域会議2024
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] 冬眠期のシマリス肝臓で誘導されるRNA結合タンパク質の研究進展と適応メカニズムの解明2024
- Author(s)
  坂部寧々、於保希咲枝、岡原学杜、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、高松信彦、塚本大輔
- Organizer
  学術変革領域A「冬眠生物学2.0」夏の領域会議2024
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] 獣類哺乳類の性決定遺伝子Sryにおける下剋上進化仮説の検証2024
- Author(s)
  奥山ほのか、徳永彩優花、稲積しおり、荻田悠作、井口竣友、回渕修治、林舜、須田皓介、塚本大輔、松尾拓哉、田村啓、伊藤道彦
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] 転写因子DMRT1の転写活性化と抑制化機能の2面性2024
- Author(s)
  石川直樹, 塚本大輔, 松尾拓哉, 田村啓, 伊藤道彦
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] ツメガエルの筋分化における甲状腺ホルモンの分子作用機序解明2024
- Author(s)
  山寺麻里奈、塚本大輔、松尾拓哉、伊藤道彦、田村啓
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] メダカ属の性決定遺伝子dmyの分子進化機構～性決定遺伝子の下剋上進化仮説の検証～2024
- Author(s)
  稲積しおり、奥山ほのか、山崎もも、荻田悠作、中迫啓、回渕修治、藤村楓雅、林舜、塚本大輔、松尾拓哉、田村啓、伊藤道彦
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] 転写因子DMRT1の転写活性化と抑制化機能の2面性2024
- Author(s)
  石川直樹, 塚本大輔, 松尾拓哉, 田村啓, 伊藤道彦
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] クラミドモナスb20変異株におけるROC15タンパク質の光誘導性分解の解析2024
- Author(s)
  白木優、水村早希、大村亜有美、Malavika Gururaj、塚本大輔、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉
- Organizer
  第31回日本時間生物学会学術大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] ツメガエルの筋分化における甲状腺ホルモンの分子作用機序解明2024
- Author(s)
  山寺麻里奈、塚本大輔、松尾拓哉、伊藤道彦、田村啓
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] 獣類哺乳類の性決定遺伝子Sryにおける下剋上進化仮説の検証2024
- Author(s)
  奥山ほのか、徳永彩優花、稲積しおり、荻田悠作、井口竣友、回渕修治、林舜、須田皓介、塚本大輔、松尾拓哉、田村啓、伊藤道彦
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] メダカ属の性決定遺伝子dmyの分子進化機構～性決定遺伝子の下剋上進化仮説の検証～2024
- Author(s)
  稲積しおり、奥山ほのか、山崎もも、荻田悠作、中迫啓、回渕修治、藤村楓雅、林舜、塚本大輔、松尾拓哉、田村啓、伊藤道彦
- Organizer
  第47回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-24H02018
[Presentation] シマリス肝臓における概日時計の発現解析2023
- Author(s)
  高松信彦、白畠由比穂、関皓太、中丸絵莉奈、塚本大輔
- Organizer
  第5回冬眠休眠研究会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] シマリスの冬眠に伴う低温誘導 RNA 結合タンパク質 Rbm3 遺伝子の発現増加機構の解析2023
- Author(s)
  坂部寧々、米山美羽、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、塚本大輔
- Organizer
  第46回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] 哺乳類の性決定遺伝子Sryの分子進化真獣哺乳類祖先-現存種2023
- Author(s)
  奥山ほのか、稲積しおり、荻田悠作、井口竣友、回渕修治、林舜、須田皓介、田村啓、塚本大輔、松尾拓哉、伊藤道彦
- Organizer
  第46回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] 異種交配におけるサブゲノム非対称的トランスポゾン発現の脱抑制：piRNAおよび片親ゲノム排除との連関性の検討2023
- Author(s)
  須田皓介、三浦郁夫、田村啓、塚本大輔、奥山ほのか、松尾拓哉、伊藤道彦
- Organizer
  第46回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] シマリスの冬眠に伴う低温誘導 RNA 結合タンパク質 Rbm3 遺伝子の発現増加機構の解析2023
- Author(s)
  坂部寧々、米山美羽、田村啓、伊藤道彦、松尾拓哉、塚本大輔
- Organizer
  第46回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] 冬眠期のシマリス肝臓における低温誘導タンパク質 Rbm3 の発現増加機構2023
- Author(s)
  坂部寧々、高松信彦、塚本大輔
- Organizer
  第5回冬眠休眠研究会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] 転写因子DMRT1の転写活性化領域における分子進化2023
- Author(s)
  石川直樹、藤谷和子、岡野則仁、林舜、須田皓介、奥山ほのか、坂部寧々、稲積しおり、塚本大輔、田村啓、松尾拓哉、伊藤道彦
- Organizer
  第46回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K05857
[Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスの肝臓の末梢時計の発現制御の解析2022
- Author(s)
  関　皓太、白畠　由比穂、中丸　絵莉奈、塚本　大輔、伊藤　道彦、高松　信彦
- Organizer
  第45回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスの肝臓における CREB1 バリアントの発現及び機能解析2022
- Author(s)
  中丸　絵莉奈、安達　めぐみ、白畠　由比穂、関　皓太、塚本　大輔、伊藤　道彦、高松　信彦
- Organizer
  第45回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] 冬眠に伴うストレス応答遺伝子 GADD45A の FOXO1 による転写活性化機構の解明2022
- Author(s)
  白畠　由比穂、関　皓太、中丸　絵莉奈、岡村　瑠美、塚本　大輔、伊藤　道彦、高松　信彦
- Organizer
  第45回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] シマリスの冬眠の低体温に伴う Rbm3 遺伝子の発現制御機構と機能の解析2022
- Author(s)
  塚本　大輔、坂部　寧々、関　皓太、白畠　由比穂、中丸　絵莉奈、伊藤　道彦、高松　信彦
- Organizer
  第45回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] 性＆種多様性ワンダーランド：遺伝子間競合（新・性決定遺伝子の下克上）＆異種ゲノム間競合2022
- Author(s)
  伊藤　道彦、林　舜、荻田　悠作、須田　皓介、奥山　ほのか、塚本　大輔、田村　啓、三浦　郁夫、高松　信彦
- Organizer
  日本動物学会第93回早稲田大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスのmiR-182-5pによる時計遺伝子CLOCKの発現制御の解析2021
- Author(s)
  関皓太、白畠由比穂、塚本大輔、伊藤道彦、高松信彦
- Organizer
  第44回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] ツメガエル生殖巣形成におけるRSPO1リガンドによる雌化機構~生殖細胞を介した雌デフォルト説~2021
- Author(s)
  佐久間恵吾、中西晋也、田村啓、林舜、荻田悠作、塚本大輔、高松信彦、伊藤道彦
- Organizer
  第45回日本皮革内分泌学会大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] 冬眠哺乳動物シマリスのmiR-182-5pによるFOXO1の発現制御とFOXO1による GADD45Aの転写制御の解析2021
- Author(s)
  白畠由比穂、関皓太、岡村瑠美、塚本大輔、伊藤道彦、高松信彦
- Organizer
  第44回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] Impact of body temperature rhythm on gene expression during hibernation in the liver of chipmunk2020
- Author(s)
  塚本大輔、伊藤道彦、高松信彦
- Organizer
  第43回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447
[Presentation] 収斂重複型性決定遺伝子ツメガエル dm-W とメダカ dmy の分子進化:下剋上進化仮説の検証に向けて2020
- Author(s)
  藤村楓雅、荻田悠作、林舜、塚本大輔、田村啓、高松信彦、伊藤道彦
- Organizer
  第22回日本進化学会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06447

1. 関根秀一 (60541737)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
2. 本間順 (50507366)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results

Tsukamoto Daisuke 塚本 大輔

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

シマリス肝臓の冬眠適応を支える、非冬眠期からの再調整による分子基盤の解明Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Engineering 3D tissues with enhanced oxidative stress resistance inspired by hibernation mechanisms

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

シマリスの冬眠に適応する肝臓の遺伝子発現再調整メカニズムの解明Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Analysis of gene expression with hibernation-specific periodicity in the liver of chipmunk adapted to low metabolic rates and body temperaturesPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Gene expression regulation in hibernating chipmunks for elucidating cold tolerance mechanisms in peripheral tissuesPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

[Journal Article] Periodic expression of Per1 gene is restored in chipmunk liver during interbout arousal in mammalian hibernation2025

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] シマリスの冬眠 : 遺伝子発現制御の解析から紐(ひも)を解く2024

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Correlation Between Subgenome-biased DNA Loss and DNA Transposon Activation Following Hybridization in the Allotetraploid Xenopus Frogs2024

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] シマリスの冬眠 : 遺伝子発現制御の解析から紐(ひも)を解く2024

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Diversity of transactivation regions of DMRT1 in vertebrates2024

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Heat shock factor 1 induces a short burst of transcription of the clock gene Per2 during interbout arousal in mammalian hibernation2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Promoter generation for the chimeric sex-determining gene <i>dm-W</i> in <i>Xenopus</i> frogs2023

Author(s)

Journal Title

DOI

ISSN

Year and Date

Language

Data Source

[Journal Article] Molecular biological studies on hibernation in chipmunks (Tamias asiaticus), a mammalian hibernator2023

Author(s)

Journal Title

DOI

ISSN

Year and Date

Language

Data Source

[Journal Article] Neofunctionalization of a Noncoding Portion of a DNA Transposon in the Coding Region of the Chimerical Sex-Determining Gene <i>dm-W</i> in <i>Xenopus</i> Frogs2022

Author(s)

Tsukamoto Daisuke 塚本大輔