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SUZUKI HIROFUMI  鈴木 博文

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鈴木 博文  スズキ ヒロフミ

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Researcher Number 60418572
Other IDs
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2023: 早稲田大学, ナノ・ライフ創新研究機構, 次席研究員(研究院講師)
2019 – 2021: 早稲田大学, ナノ・ライフ創新研究機構, 次席研究員(研究院講師)
2016: 大阪大学, 蛋白質研究所, 特任助教
Review Section/Research Field
Except Principal Investigator
Basic Section 43040:Biophysics-related / Biophysics
Keywords
Except Principal Investigator
コンピュータシミュレーション / ウミホタル / 発光メカニズム / ゲノム塩基配列 / データベース / 分子進化 / 発光タンパク質 / EMアルゴリズム / 形状比較 / 混合正規分布モデル … More / 密度マップ / 単粒子解析 / 電子顕微鏡 / 構造・機能予測 Less
  • Research Projects

    (2 results)
  • Research Products

    (13 results)
  • Co-Researchers

    (2 People)
  •  Building Inventory of Evolution and Luminescent Mechanisms of Bioluminescent Proteins

    • Principal Investigator
      YURA Kei
    • Project Period (FY)
      2019 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 43040:Biophysics-related
    • Research Institution
      Waseda University
  •  Comparison and superposition of low-resolution density maps and atomic models using Gaussian mixture model

    • Principal Investigator
      KAWABATA TAKESHI
    • Project Period (FY)
      2014 – 2016
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Osaka University

All 2019 2017 2016 2015 2014 Other

All Journal Article Presentation Book

  • [Book] 見てわかる構造生命科学 -生命科学研究へのタンパク質構造の利用-2014

    • Author(s)
      中村春木、大島勘二、緒方一博、笠原浩太、神谷成敏、川端 猛、寒川剛、椎名政昭、鈴木博文、鷹野 優
    • Total Pages
      320
    • Publisher
      化学同人
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Journal Article] Protein Data Bank Japan (PDBj): updated user interfaces, resource description framework, analysis tools for large structures2017

    • Author(s)
      Akira R. Kinjo, Gert-Jan Bekker,Hirofumi Suzuki,Yuko Tsuchiya,Takeshi Kawabata,Yasuyo Ikegawa, Haruki Nakamura
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 45(D1) Issue: D1 Pages: D282-D288

    • DOI

      10.1093/nar/gkw962

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Journal Article] Omokage search: shape similarity search service for biomolecular structures in both the PDB and EMDB.2016

    • Author(s)
      Hirofumi Suzuki, Takeshi Kawabata, Haruki Nakamura
    • Journal Title

      Bioinformatics

      Volume: 32 Issue: 4 Pages: 619-620

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btv614

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078, KAKENHI-ORGANIZER-24118001, KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [Presentation] Evolutionary Analysis of Luciferase, Photoprotein and Luciferin2019

    • Author(s)
      舟橋 実里、鈴木 博文、由良 敬
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H03200
  • [Presentation] EMDB, PDB, SASBDB中の多階層構造データを対象としたウェブサービス2016

    • Author(s)
      鈴木博文、Gert-Jan Bekker, 川端 猛、中村春木
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県、つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] Omokage search and gmfit : shape similarity search and superposition among models and maps2016

    • Author(s)
      Takeshi Kawabata, Hirofumi Suzuki, Haruki Nakamura
    • Organizer
      60-th annual meeting of Biophysical Society
    • Place of Presentation
      ロサンゼルス(アメリカ合衆国)
    • Year and Date
      2016-02-27
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] Omokage検索:PDB原子モデル・クライオ電子顕微鏡マップデータ・SAXSダミー原子モデルなどを対象とした形状類似検索2016

    • Author(s)
      鈴木博文、 川端 猛、中村春木
    • Organizer
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県、福岡市)
    • Year and Date
      2016-06-07
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] 低解像度密度マップへの複数のサブユニットのあてはめ計算 -実験情報による拘束の利用-2015

    • Author(s)
      川端 猛, 鈴木博文, 中村春木
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      金沢大学 角間キャンパス(石川県、金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] Omokage search and gmfit : global shape similarity search and 3D-superposition among atomic models and density maps2015

    • Author(s)
      川端 猛, 鈴木博文, 中村春木
    • Organizer
      生命医薬情報学連合大会2015年大会
    • Place of Presentation
      京都大学 宇治キャンパス 黄檗プラザ(京都府、宇治市)
    • Year and Date
      2015-10-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] EMDBとPDBデータの形状類似検索:Omokage検索2015

    • Author(s)
      鈴木博文,川端 猛, 中村春木
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      金沢大学 角間キャンパス(石川県、金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] Shape similarity searh of EMDB and PDB: Omokage search2015

    • Author(s)
      鈴木博文,川端 猛, 中村春木
    • Organizer
      第15回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島県、徳島市)
    • Year and Date
      2015-06-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] セグメンテーション&フィッティング ‐低解像度密度マップへの複数のサブユニットのあてはめ計算法‐

    • Author(s)
      川端 猛、鈴木博文、中村春木.
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • [Presentation] 構造データベース中の3次元電子顕微鏡データの形状比較とフィッティング

    • Author(s)
      鈴木博文、川端猛、中村春木
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26440078
  • 1.  KAWABATA TAKESHI (60343274)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 12 results
  • 2.  YURA Kei (50252226)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results

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