Mitsuta Yuki 満田祐樹

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満田祐樹ミツタユウキ

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Researcher Number	70866251
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Affiliation (Current)	2025: 大阪公立大学, 大学院理学研究科, 助教
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2023 – 2024: 大阪公立大学, 大学院理学研究科, 助教 2019 – 2020: 筑波大学, 計算科学研究センター, 特別研究員(PD)
Review Section/Research Field	Principal Investigator Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related / Basic Section 32010:Fundamental physical chemistry-related Except Principal Investigator Transformative Research Areas, Section (II)
Keywords	Principal Investigator 自由エネルギー計算 / 分子シミュレーション / Nudged Elastic Band / 薬剤設計 / 生体膜 / 反応経路ネットワーク / 生体分子シミュレーション / 分子動力学計算 / 計算化学 / 膜透過係数 / タンパク質フォールディング / 生体分子の分子動力学計算 … More Except Principal Investigator … More 機械学習 / 自由エネルギー解析 / 長距離エネルギー移動論 / 光-物質強結合 / フラグメント分子軌道法 / 量子ダイナミクス / 分子動力学計算 / 量子化学計算 Less

Theory of mesohierarchy
- Principal Investigator
  
  重田育照
- Project Period (FY)
  2023 – 2027
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
- Review Section
  
  Transformative Research Areas, Section (II)
- Research Institution
  University of Tsukuba
自由エネルギー反応経路探索法を利用した薬剤分子の膜透過シミュレーション手法の開発Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  満田祐樹
- Project Period (FY)
  2023 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- Review Section
  
  Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
- Research Institution
  Osaka Metropolitan University
自由エネルギー反応経路探索法によるタンパク質リガンド結合の計算手法開発Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  満田祐樹
- Project Period (FY)
  2019 – 2021
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- Review Section
  
  Basic Section 32010:Fundamental physical chemistry-related
- Research Institution
  University of Tsukuba

All 2024 2023 2020 2019

All Journal Article Presentation

[Journal Article] Nudged elastic stiffness band method: A method to solve kinks problems of reaction paths2023
- Author(s)
  Mitsuta Yuki、Asada Toshio
- Journal Title
  
  Journal of Computational Chemistry
  
  Volume: 44 Issue: 23 Pages: 1884-1897
- DOI
  10.1002/jcc.27169
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K13074, KAKENHI-PROJECT-22K05024, KAKENHI-PROJECT-21H04564
[Journal Article] Analytical Method Using a Scaled Hypersphere Search for High-Dimensional Metadynamics Simulations2020
- Author(s)
  Mitsuta Yuki、Shigeta Yasuteru
- Journal Title
  
  Journal of Chemical Theory and Computation
  
  Volume: 16 Issue: 6 Pages: 3869-3878
- DOI
  10.1021/acs.jctc.0c00010
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PUBLICLY-19H05047, KAKENHI-PUBLICLY-20H05497, KAKENHI-PROJECT-19J01221
[Journal Article] Calculation of Free Energy Reaction Network of Alanine Polypeptide by Using Free Energy Reaction Route Mapping Method2019
- Author(s)
  MITSUTA Yuki、SHIGETA Yasuteru
- Journal Title
  
  J. Comput. Chem. Jpn.
  
  Volume: 18 Issue: 5 Pages: 221-223
- DOI
  10.2477/jccj.2019-0045
- ISSN
  1347-1767, 1347-3824
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19J01221
[Presentation] 自由エネルギー反応経路ネットワーク計算から見た生体分子の振る舞い2024
- Author(s)
  満田祐樹
- Organizer
  研究会「凝縮系の理論化学」
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K13074
[Presentation] Nudged Elastic Band法を改良するために剛性の力を加えたNudged Elastic Stiffness Band法の開発2024
- Author(s)
  満田祐樹、麻田俊雄
- Organizer
  日本化学会第104春季年会（2024）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K13074
[Presentation] Predicting the Biomembranes Permeability of Fentanyl and Its Analogues by Free Energy Reaction Route Network2023
- Author(s)
  Yuki Mitsuta, Toshio Asada
- Organizer
  The 6th International Conference on Molecular Simulation
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K13074
[Presentation] アンブレラ積分法を利用した多次元アンブレラサンプリングのパラメーター自動最適化手法の開発2023
- Author(s)
  満田祐樹、麻田俊雄
- Organizer
  第 37 回分子シミュレーション討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K13074
[Presentation] Nudged Elastic Stiffness Band法：反応経路のkink問題を解決する手法の開発2023
- Author(s)
  満田祐樹、麻田俊雄
- Organizer
  第17回分子科学討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K13074
[Presentation] Development of the New Method to Calculate Free Energy Reaction Network of High-Dimensional Metadynamics by Using Scaled Hypersphere Search Method2020
- Author(s)
  満田祐樹, 重田育照
- Organizer
  日本化学会第100春季年会 (2020)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19J01221
[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法を利用したジペプチドの膜透過速度計算2020
- Author(s)
  満田祐樹、重田育照
- Organizer
  第34回分子シミュレーション討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19J01221
[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法を利用した水中ポリペプチドの自由エネルギーネットワーク解析2019
- Author(s)
  満田祐樹, 重田育照
- Organizer
  第13回分子科学討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19J01221
[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法を用いたアラニンペプチドの反応経路ネットワーク解析2019
- Author(s)
  満田祐樹, 重田育照
- Organizer
  第46回生体分子化学討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19J01221
[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法によるアラニンペプチドのフォールディング探索2019
- Author(s)
  満田祐樹, 重田育照
- Organizer
  第33回分子シミュレーション討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19J01221
[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法による水中アラニンペプチドの自由エネルギーネットワーク計算2019
- Author(s)
  満田祐樹, 重田育照
- Organizer
  日本コンピュータ化学会2019秋季年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19J01221

1. 重田育照 (80376483)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 1 results
2. 藤田貴敏 (70767970)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results

Mitsuta Yuki 満田 祐樹

満田 祐樹 ミツタ ユウキ

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

Theory of mesohierarchy

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

自由エネルギー反応経路探索法を利用した薬剤分子の膜透過シミュレーション手法の開発Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

自由エネルギー反応経路探索法によるタンパク質リガンド結合の計算手法開発Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

[Journal Article] Nudged elastic stiffness band method: A method to solve kinks problems of reaction paths2023

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Analytical Method Using a Scaled Hypersphere Search for High-Dimensional Metadynamics Simulations2020

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Calculation of Free Energy Reaction Network of Alanine Polypeptide by Using Free Energy Reaction Route Mapping Method2019

Author(s)

Journal Title

DOI

ISSN

Language

Data Source

[Presentation] 自由エネルギー反応経路ネットワーク計算から見た生体分子の振る舞い2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Nudged Elastic Band法を改良するために剛性の力を加えたNudged Elastic Stiffness Band法の開発2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Predicting the Biomembranes Permeability of Fentanyl and Its Analogues by Free Energy Reaction Route Network2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] アンブレラ積分法を利用した多次元アンブレラサンプリングのパラメーター自動最適化手法の開発2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Nudged Elastic Stiffness Band法：反応経路のkink問題を解決する手法の開発2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Development of the New Method to Calculate Free Energy Reaction Network of High-Dimensional Metadynamics by Using Scaled Hypersphere Search Method2020

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法を利用したジペプチドの膜透過速度計算2020

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法を利用した水中ポリペプチドの自由エネルギーネットワーク解析2019

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法を用いたアラニンペプチドの反応経路ネットワーク解析2019

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] 自由エネルギー反応経路探索法によるアラニンペプチドのフォールディング探索2019

Author(s)

Organizer

Data Source

Mitsuta Yuki 満田祐樹

満田祐樹ミツタユウキ