OHNUKI Jun 大貫隼

… Alternative Names

大貫隼オオヌキジュン

Less

Researcher Number	90777989
Other IDs
Affiliation (Current)	2026: 分子科学研究所, 理論・計算分子科学研究領域, 助教
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2023 – 2024: 分子科学研究所, 理論・計算分子科学研究領域, 助教
Review Section/Research Field	Principal Investigator Basic Section 43040:Biophysics-related
Keywords	Principal Investigator AlphaFold / 機械学習 / 遷移経路 / 分子動力学シミュレーション / 蛋白質構造変化 / 反応座標

蛋白質サイズの大規模構造遷移に適用可能な反応座標推定法の開発Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  大貫隼
- Project Period (FY)
  2023 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
- Review Section
  
  Basic Section 43040:Biophysics-related
- Research Institution
  Institute for Molecular Science

All 2025 2024 2023

All Journal Article Presentation Book

[Book] 実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ　AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド　「タンパク質の構造変化予測　AlphaFoldと分子動力学の統合」2024
- Author(s)
  岡崎圭一、大貫隼
- Total Pages
  7
- Publisher
  羊土社
- ISBN
  9784758122764
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Book] 月刊「細胞」2024年4月号ライフサイエンス分野におけるAI解析「分子シミュレーション×AlphaFold2でトランスポータータンパク質の未解明構造を明らかにする」2024
- Author(s)
  大貫隼
- Total Pages
  3
- Publisher
  ニューサイエンス社
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Journal Article] AlphaFoldによる複数の準安定状態をもつタンパク質の構造予測2025
- Author(s)
  大貫隼
- Journal Title
  
  蛋白質科学会アーカイブ
  
  Volume: 18
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Journal Article] Accelerated Molecular Dynamics and AlphaFold Uncover a Missing Conformational State of Transporter Protein OxlT2024
- Author(s)
  Ohnuki Jun、Jaunet-Lahary Titouan、Yamashita Atsuko、Okazaki Kei-ichi
- Journal Title
  
  The Journal of Physical Chemistry Letters
  
  Volume: 15 Issue: 3 Pages: 725-732
- DOI
  10.1021/acs.jpclett.3c03052
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160, KAKENHI-PROJECT-23K23858
[Journal Article] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics for Efficient Conformational Sampling of Transporter Protein NarK2024
- Author(s)
  Ohnuki Jun、Okazaki Kei-ichi
- Journal Title
  
  The Journal of Physical Chemistry B
  
  Volume: 128 Issue: 31 Pages: 7530-7537
- DOI
  10.1021/acs.jpcb.4c02726
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23858, KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] 分子動力学法とAlphaFoldの相互活用が促進するタンパク質の構造状態探索2024
- Author(s)
  大貫隼、岡崎圭一
- Organizer
  第38回分子シミュレーション討論会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics to Uncover Missing Conformational States of Transporter Proteins2024
- Author(s)
  Jun Ohnuki
- Organizer
  International Conference on Theoretical and High Performance Computational Chemistry 2024
- Invited / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics for Sampling Conformational States of Transporter Proteins2024
- Author(s)
  Jun Ohnuki、Kei-ichi Okazaki
- Organizer
  21st IUPAB Congress 2024
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics for Uncovering Conformational States of Transporter Proteins2024
- Author(s)
  Jun Ohnuki、Kei-ichi Okazaki
- Organizer
  第24回日本蛋白質科学会年会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] Resolving Unknown Conformational State of Oxalate Transporter by Combination of Molecular Dynamics Simulation and AlphaFold22023
- Author(s)
  Jun Ohnuki、Kei-ichi Okazaki
- Organizer
  第23回日本蛋白質科学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] Accelerated Molecular Dynamics and AlphaFold Discover a Conformational State of Transporter Protein OxlT2023
- Author(s)
  Jun Ohnuki、Kei-ichi Okazaki
- Organizer
  第61回日本生物物理学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] Accelerated MDとAlphaFoldによるトランスポーター蛋白質の構造状態探索2023
- Author(s)
  大貫隼
- Organizer
  計算タンパク質科学研究会 2023
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160
[Presentation] Accelerated MD法とAlphaFoldによるトランスポーターの未解明構造探索2023
- Author(s)
  大貫隼
- Organizer
  第4回生体分子シミュレーション・モデリング研究会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K14160

1. 岡崎圭一

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results

OHNUKI Jun 大貫 隼

大貫 隼 オオヌキ ジュン

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

蛋白質サイズの大規模構造遷移に適用可能な反応座標推定法の開発Principal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

[Book] 実験医学別冊 最強のステップUPシリーズ AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド 「タンパク質の構造変化予測 AlphaFoldと分子動力学の統合」2024

Author(s)

Total Pages

Publisher

ISBN

Data Source

[Book] 月刊「細胞」2024年4月号 ライフサイエンス分野におけるAI解析「分子シミュレーション×AlphaFold2でトランスポータータンパク質の未解明構造を明らかにする」2024

Author(s)

Total Pages

Publisher

Data Source

[Journal Article] AlphaFoldによる複数の準安定状態をもつタンパク質の構造予測2025

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Accelerated Molecular Dynamics and AlphaFold Uncover a Missing Conformational State of Transporter Protein OxlT2024

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics for Efficient Conformational Sampling of Transporter Protein NarK2024

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Presentation] 分子動力学法とAlphaFoldの相互活用が促進するタンパク質の構造状態探索2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics to Uncover Missing Conformational States of Transporter Proteins2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics for Sampling Conformational States of Transporter Proteins2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Integration of AlphaFold with Molecular Dynamics for Uncovering Conformational States of Transporter Proteins2024

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Resolving Unknown Conformational State of Oxalate Transporter by Combination of Molecular Dynamics Simulation and AlphaFold22023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Accelerated Molecular Dynamics and AlphaFold Discover a Conformational State of Transporter Protein OxlT2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Accelerated MDとAlphaFoldによるトランスポーター蛋白質の構造状態探索2023

Author(s)

Organizer

Data Source

[Presentation] Accelerated MD法とAlphaFoldによるトランスポーターの未解明構造探索2023

Author(s)

Organizer

Data Source

OHNUKI Jun 大貫隼

大貫隼オオヌキジュン

[Book] 実験医学別冊　最強のステップUPシリーズ　AlphaFold時代の構造バイオインフォマティクス実践ガイド　「タンパク質の構造変化予測　AlphaFoldと分子動力学の統合」2024

[Book] 月刊「細胞」2024年4月号ライフサイエンス分野におけるAI解析「分子シミュレーション×AlphaFold2でトランスポータータンパク質の未解明構造を明らかにする」2024