Murakami Katsuhiko 村上勝彦

Researcher Number	30344055
Other IDs
Affiliation (Current)	2023: 富士通株式会社(富士通研究所), その他部局等, 研究員
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2021 – 2022: 富士通株式会社(富士通研究所), その他部局等, 研究員 2018 – 2020: 株式会社富士通研究所, その他部局等, 研究員(移行) 2017: 東京大学, 医科学研究所, 特任研究員 2014 – 2016: 東京工科大学, 応用生物学部, 准教授
Review Section/Research Field	Principal Investigator Life / Health / Medical informatics / Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related Except Principal Investigator Basic Section 09050:Tertiary education-related
Keywords	Principal Investigator 遺伝子変異 / 疾患 / 遺伝子機能 / 遺伝子発現 / オミックス解析 / バイオマーカー / データ統合 / 細胞内局在 / 遺伝子 / データベース … More / 多重検定 / タンパク質間相互作用 / 立体構造 / タンパク質機能ドメイン / GSEA / 蛋白質間相互作用 / 蛋白機能ドメイン / 分散表現 / オントロジー / ナレッジグラフ / 自然言語処理 / 薬剤 / 深層学習 / 推論 / 知識表現 / セマンティックウェブ … More Except Principal Investigator 縮約 / eラーニングAIシステム / 読解力・表現力の向上 Less

新教育課程に対応した読解・記述力を高める縮約基盤型eラーニングAIシステムの構築
- Principal Investigator
  
  牛頭哲宏
- Project Period (FY)
  2022 – 2024
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 09050:Tertiary education-related
- Research Institution
  Kobe Tokiwa University
オントロジーと深層学習の融合による生命情報推論システムPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  村上勝彦
- Project Period (FY)
  2018 – 2022
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
- Research Institution
  Fujitsu Limited (Fujitsu Research)
Identification of hidden concept modules using correlation analysis of heterogenious dataPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Murakami Katsuhiko
- Project Period (FY)
  2014 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Life / Health / Medical informatics
- Research Institution
  The University of Tokyo
  Tokyo University of Technology

All 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 Other

All Journal Article Presentation Book

[Book] in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術2018
- Author(s)
  村上勝彦（他78名）
- Total Pages
  540
- Publisher
  技術情報協会
- ISBN
  9784861046889
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Journal Article] ゲノム医療を推進するAI技術 : 文献検索AI,病原性を予測するXAI(説明可能なAI)2021
- Author(s)
  村上, 勝彦森田, 一光石, 豊馬場, 謙介マルティネス, アンデルグェン, レアン多湖, 真一郎小林, 賢司阿部, 修也富士, 秀
- Journal Title
  
  オペレーションズ・リサーチ
  
  Volume: 66 Pages: 422-429
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] がんゲノム医療に向けたナレッジグラフと予後情報を活用した論文検索システム2020
- Author(s)
  村上勝彦　富士秀
- Journal Title
  
  JMAI Letter
  
  Volume: -
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] 第1 回ナレッジグラフ推論チャレンジ2018 開催報告─説明性のある人工知能システムを目指して─2019
- Author(s)
  川村隆浩江上周作田村光太郎外園康智鵜飼孝典小柳佑介西野文人岡嶋成司村上勝彦高松邦彦杉浦あおい白松俊張翔宇古崎晃司
- Journal Title
  
  人工知能学会誌
  
  Volume: 34 Pages: 396-412
- NAID
  130007658351
- Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] 思考を綴る AI がゲノム医療の新たなステージを拓く2019
- Author(s)
  岡本青史、多湖真一郎、村上勝彦
- Journal Title
  
  BIO Clinica
  
  Volume: 34 Pages: 48-54
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] Evaluation of Database Annotation to Determine Human Mitochondrial Proteins2018
- Author(s)
  Murakami K, and Sugita　M.
- Journal Title
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  Volume: 印刷中
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Journal Article] データ統合による隠れた関係の発見2018
- Author(s)
  村上勝彦
- Journal Title
  
  FARUAW
  
  Volume: 54 Issue: 9 Pages: 862-866
- DOI
  10.14894/faruawpsj.54.9_862
- NAID
  130007479843
- ISSN
  0014-8601, 2189-7026
- Language
  Japanese
- Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] Evaluation of Database Annotation to Determine Human Mitochondrial Proteins2018
- Author(s)
  Katsuhiko Murakami, Masaharu Sugita
- Journal Title
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  Volume: 8 Pages: 210-217
- DOI
  10.17706/ijbbb.2018.8.4.210-217
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] Biomarker discovery by integrated joint non-negative matrix factorization and pathway signature analyses2018
- Author(s)
  Fujita, N., Mizuarai, S., Murakami, K. & Nakai, K.
- Journal Title
  
  Scientific Reports
  
  Volume: 8 Pages: 1-10
- DOI
  10.1038/s41598-018-28066-w
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] Non-negative matrix factorization with information expansion using item class information2018
- Author(s)
  村上勝彦
- Journal Title
  
  Proc. of JSAI
  
  Volume: 3Pin1-07 Issue: 0 Pages: 1-2
- DOI
  10.11517/pjsai.JSAI2018.0_3Pin107
- NAID
  130007424342
- Language
  Japanese
- Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Journal Article] Novel visualization for curriculum in silico using syllabus by a combination of cosine similarity, multidimensional scaling methods, and scatter plot: Dynamic curriculum mapping (DCM) for syllabus.2017
- Author(s)
  Takamatsu K, Murakami K, Lim R-JW, Nakata Y.
- Journal Title
  
  Bull Kobe Tokiwa Univ.
  
  Volume: 10 Pages: 99-106
- NAID
  120006022273
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Journal Article] Tag-based knowledge network models.2017
- Author(s)
  Takamatsu K, Bannaka K, Kirimura T, Noda I, Murakami K, Mitsunari K, et al.
- Journal Title
  
  Bull Kobe Tokiwa Univ.
  
  Volume: 10 Pages: 51-61
- NAID
  120006022268
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Journal Article] On statistics education for Kobe Tokiwa University Division of Health Sciences students.2017
- Author(s)
  Takamatsu K, Murakami K, Seki M, Nakata Y.
- Journal Title
  
  Bull Kobe Tokiwa Univ.
  
  Volume: 10 Pages: 61-69
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] がんゲノム医療に向けたナレッジグラフと予後情報を活用した論文検索システム2020
- Author(s)
  村上勝彦, 富士秀
- Organizer
  日本メディカルAI学会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Presentation] 医師の負担軽減をめざす医療文献検索AIシステム2020
- Author(s)
  村上勝彦、他９名
- Organizer
  日本オペレーションズ・リサーチ学会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Presentation] ネットワーク構造を利用した知識グラフの埋込2020
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  2020年度人工知能学会全国大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Presentation] サンプル混合度を考慮した遺伝子発現量のがんバイオマーカー探索2019
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  2019年度人工知能学会全国大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Presentation] Report on the First Knowledge Graph Reasoning Challenge 2018 Toward the eXplainable AI System2019
- Author(s)
  akahiro Kawamura, Shusaku Egami, Koutarou Tamura, Yasunori Hokazono, Takanori Ugai, Yusuke Koyanagi, Fumihito Nishino, Seiji Okajima, Katsuhiko Murakami, Kunihiko Takamatsu, Aoi Sugiura, Shun Shiramatsu, Xiangyu Zhang, Kouji Kozaki
- Organizer
  Proceedings of the 9th Joint International Semantic Technology Conference (JIST2019)
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Presentation] アイテムのクラス情報を利用した非負値行列分解NMF2018
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  2018年度人工知能学会全国大会（第32回）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11522
[Presentation] Evaluation of database annotation to determine human mitochondrial proteins2018
- Author(s)
  Katsuhiko Murakami, Masaharu Sugita
- Organizer
  International Conference on Bioinformatics and Computing Technologies (ICBCT)
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] ヒトミトコンドリアタンパク質局在情報の整備と予測2017
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  2017年度生命科学系学会合同年次大会(ConBio2017)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] Prediction of human mitochondrial proteins from various resources2017
- Author(s)
  Murakami, K.
- Organizer
  Intelligent Systems for Molecular Biology
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] Clustering of gene ontology annotation by matrix factorization2016
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  Intelligent Systems for Molecular Biology
- Place of Presentation
  Orlando, Florida (USA)
- Year and Date
  2016-07-08
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] PubMed Central論文引用ネットワークの解析2016
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  第38回日本分子生物学会年会
- Place of Presentation
  横浜国際平和会議場（神奈川県横浜市西区）
- Year and Date
  2016-11-30
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] A tool and analyses of citation network2016
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  生命医薬情報学連合大会2016
- Place of Presentation
  東京国際交流館プラザ平成（東京都江東区）
- Year and Date
  2016-09-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] 遺伝子オントロジーの階層的クラスタリング2016
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  2016年度人工知能学会全国大会
- Place of Presentation
  北九州国際会議場（福岡県北九州市小倉北区浅野）
- Year and Date
  2016-06-06
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] Extraction of latent concepts from an integrated human gene database（2015 7th International Conference of Soft Computing and Pattern Recognition2015
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  SoCPaR 2015
- Place of Presentation
  九州大学大橋キャンパス（福岡県福岡市南区塩原）
- Year and Date
  2015-11-13
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] 遺伝子データベースアノテーションのクラスタリング2015
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  第38回日本分子生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市中央区港島中町）
- Year and Date
  2015-12-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] Identification of latent factors in gene databases using non-negative matrix factorization2015
- Author(s)
  村上勝彦
- Organizer
  生命医薬情報学連合大会
- Place of Presentation
  京都大学宇治おうばくプラザ（京都府宇治市五ケ庄）
- Year and Date
  2015-10-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342
[Presentation] 高度な推論にむけたヒト遺伝子データベースH-InvDBのRDF化
- Author(s)
  村上勝彦、今西規
- Organizer
  第３回生命医薬情報学連合大会
- Place of Presentation
  仙台国際センター（宮城県仙台市）
- Year and Date
  2014-10-02 – 2014-10-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26330342

1. 高松邦彦 (80392017)

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 2 results
2. 牛頭哲宏 (80709048)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
3. 伴仲謙欣 (50752119)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
4. 中田康夫 (70295773)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results

Murakami Katsuhiko 村上 勝彦

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

新教育課程に対応した読解・記述力を高める縮約基盤型eラーニングAIシステムの構築

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

オントロジーと深層学習の融合による生命情報推論システムPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Identification of hidden concept modules using correlation analysis of heterogenious dataPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

[Book] in silico創薬におけるスクリーニングの高速化・高精度化技術2018

Author(s)

Total Pages

Publisher

ISBN

Data Source

[Journal Article] ゲノム医療を推進するAI技術 : 文献検索AI,病原性を予測するXAI(説明可能なAI)2021

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] がんゲノム医療に向けたナレッジグラフと予後情報を活用した論文検索システム2020

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] 第1 回ナレッジグラフ推論チャレンジ2018 開催報告─説明性のある人工知能システムを目指して─2019

Author(s)

Journal Title

NAID

Data Source

[Journal Article] 思考を綴る AI がゲノム医療の新たなステージを拓く2019

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] Evaluation of Database Annotation to Determine Human Mitochondrial Proteins2018

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] データ統合による隠れた関係の発見2018

Author(s)

Journal Title

DOI

NAID

ISSN

Language

Data Source

[Journal Article] Evaluation of Database Annotation to Determine Human Mitochondrial Proteins2018

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Biomarker discovery by integrated joint non-negative matrix factorization and pathway signature analyses2018

Author(s)

Journal Title

DOI

Data Source

[Journal Article] Non-negative matrix factorization with information expansion using item class information2018

Author(s)

Journal Title

DOI

NAID

Language

Data Source

[Journal Article] Novel visualization for curriculum in silico using syllabus by a combination of cosine similarity, multidimensional scaling methods, and scatter plot: Dynamic curriculum mapping (DCM) for syllabus.2017

Author(s)

Journal Title

NAID

Data Source

[Journal Article] Tag-based knowledge network models.2017

Murakami Katsuhiko 村上勝彦