Yamagishi Kenji 山岸賢司

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YAMAGISHI Kenji 山岸賢司

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Researcher Number	90460021
Other IDs
Affiliation (Current)	2025: 日本大学, 工学部, 准教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2018 – 2023: 日本大学, 工学部, 准教授 2016 – 2017: 日本大学, 工学部, 講師 2015: 日本大学, 工学部, 助教
Review Section/Research Field	Principal Investigator Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related / Life / Health / Medical informatics Except Principal Investigator Respiratory organ internal medicine
Keywords	Principal Investigator 分子シミュレーション / 分子認識 / シミュレーション / 核酸 / フラグメント分子軌道計算 / 分子動力学計算 / 計算化学 / RNAアプタマー / フラグメント分子軌道法 / NMR … More / VIINEC / 分子設計 / 等温滴定型カロリメトリ / 表面プラズモン共鳴 / 分子シミュレーション解析 / 分子間相互作用 / アプタマー / ＦＭＯ / 新規アミノ酸 / バイオインフォマティクス / 軌道間相互作用 / 軌道間相互作用解析 / ハロゲン原子 / 構造安定化 / 相互作用エネルギー / 人工アミノ酸 … More Except Principal Investigator 好酸球 / 気道上皮 / microRNA / バイオマーカー / COPD / 喘息 / エクソソーム Less

Establishment of a fundamental technology for designing new aptamers using molecular simulation methodsPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  YAMAGISHI Kenji
- Project Period (FY)
  2021 – 2023
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
- Research Institution
  Nihon University
Molecular Recognition Mechanism of RNA aptamerPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  YAMAGISHI Kenji
- Project Period (FY)
  2018 – 2020
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Review Section
  
  Basic Section 62010:Life, health and medical informatics-related
- Research Institution
  Nihon University
Mechanism of structural stability of halogenated proteinPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  YAMAGISHI Kenji
- Project Period (FY)
  2016 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
- Research Field
  
  Life / Health / Medical informatics
- Research Institution
  Nihon University
Identification of biomarker for pathogenesis on asthma and COPD based on airway secreted exosome
- Principal Investigator
  
  GON yasuhiro
- Project Period (FY)
  2015 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Respiratory organ internal medicine
- Research Institution
  Nihon University

All 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015

All Journal Article Presentation Book Patent

[Book] 「mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用」-RNAの立体構造と計算化学-2023
- Author(s)
  山岸賢司，坂本泰一
- Total Pages
  411
- Publisher
  技術情報協会
- ISBN
  9784861049378
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Book] 【分担執筆】タンパク質の構造解析手法と In silicoスクリーニングへの応用事例，「第8節　生体分子シミュレーションによる核酸医薬品開発への展開タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例」2023
- Author(s)
  山岸賢司、石川岳志
- Total Pages
  530
- Publisher
  技術情報協会
- ISBN
  9784861049712
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Book] 【分担執筆】mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用，「第6節　mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用」2023
- Author(s)
  山岸賢司、坂本泰一
- Total Pages
  411
- Publisher
  技術情報協会
- ISBN
  9784861049378
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Book] in-silico創薬におけるスクリーニングの高速化・効率化技術2018
- Author(s)
  山岸賢司，坂本泰一
- Total Pages
  540
- Publisher
  技術情報協会
- ISBN
  9784861046889
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Journal Article] Thermodynamic Analysis of Nucleic Acid Aptamers Binding to Their Targets2023
- Author(s)
  山岸賢司、坂本泰一
- Journal Title
  
  Netsu Sokutei
  
  Volume: 50 Issue: 3 Pages: 96-102
- DOI
  10.11311/jscta.50.3_96
- ISSN
  0386-2615, 1884-1899
- Year and Date
  2023-07-25
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20K06529, KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Journal Article] Phylogenetic trees of closely related bacterial species and subspecies based on frequencies of short nucleotide sequences2023
- Author(s)
  Nakano Yoshio、Domon Yusaku、Yamagishi Kenji
- Journal Title
  
  PLOS ONE
  
  Volume: 18 Issue: 4 Pages: e0268847-e0268847
- DOI
  10.1371/journal.pone.0268847
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Journal Article] Computational approach for understanding the biding mechanism of RNA aptamer to human Immunogloblin G2021
- Author(s)
  Kenji Yamagishi
- Journal Title
  
  AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY
  
  Volume: 67 Pages: 998-1002
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Journal Article] 計算化学手法を用いた抗体に結合する RNA アプタマーの分子認識機構の解明2021
- Author(s)
  山岸賢司
- Journal Title
  
  月刊「細胞」
  
  Volume: 715 Pages: 926-929
- NAID
  40022799112
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Journal Article] Synthesis and evaluation of (S)-5′-C-aminopropyl and (S)-5′-C-aminopropyl-2′-arabinofluoro modified DNA oligomers for novel RNase H-dependent antisense oligonucleotides2020
- Author(s)
  Zhou Yujun、Kajino Ryohei、Ishii Seiichiro、Yamagishi Kenji、Ueno Yoshihito
- Journal Title
  
  RSC Advances
  
  Volume: 10 Issue: 68 Pages: 41901-41914
- DOI
  10.1039/d0ra08468a
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Journal Article] 計算化学を用いたRNAアプタマーの分子設計手法の確立に向けて2020
- Author(s)
  山岸賢司, 吉田尚恵
- Journal Title
  
  SAR News
  
  Volume: 38 Pages: 9-17
- Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Journal Article] Binding interaction analysis of RNA aptamer-Fc region of human immunoglobulin G using fragment molecular orbital calculation2020
- Author(s)
  Yoshida Hisae, Sato Koki, Ishikawa Takeshi, Sakamoto Taiichi, Yamagishi Kenji
- Journal Title
  
  Chemical Physics Letters
  
  Volume: 738 Pages: 136854-136854
- DOI
  10.1016/j.cplett.2019.136854
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536, KAKENHI-PROJECT-16H05840, KAKENHI-PROJECT-17J01992
[Journal Article] 計算化学によるRNAアプタマーと標的タンパク質との分子間相互作用解析2020
- Author(s)
  山岸賢司
- Journal Title
  
  アグリバイオ
  
  Volume: 48 Pages: 58-62
- NAID
  40022320668
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Journal Article] RNAアプタマーの分子認識メカニズムの解明2020
- Author(s)
  山岸賢司
- Journal Title
  
  月刊「細胞」
  
  Volume: 692 Pages: 45-47
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Journal Article] Elucidation of the Role of Ca<sup>2+</sup> in the Formation of an RNA Aptamer/Human Immunoglobulin G Complex Using Molecular Dynamics Simulation2019
- Author(s)
  Ishii Seiichiro, Sekiguchi Masahiro, Yoshida Hisae, Masukawa Keisuke, Ishikawa Takeshi, Sakamoto Taiichi, Yamagishi Kenji
- Journal Title
  
  J. Comput. Chem. Jpn.
  
  Volume: 18 Issue: 5 Pages: 208-210
- DOI
  10.2477/jccj.2019-0051
- NAID
  130007815004
- ISSN
  1347-1767, 1347-3824
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536, KAKENHI-PROJECT-17J01992
[Journal Article] Synthesis and Biophysical Characterization of RNAs Containing (R)- and (S)-5′-C-Aminopropyl-2′-O-methyluridines2019
- Author(s)
  Kajino Ryohei、Maeda Yusuke、Yoshida Hisae、Yamagishi Kenji、Ueno Yoshihito
- Journal Title
  
  The Journal of Organic Chemistry
  
  Volume: 84 Issue: 6 Pages: 3388-3404
- DOI
  10.1021/acs.joc.8b03277
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536, KAKENHI-PROJECT-17J01992
[Journal Article] Synthesis and characterization of small interfering RNAs with haloalkyl groups at their 3′-dangling ends2019
- Author(s)
  Chandela Akash, Watanabe Taeko, Yamagishi Kenji, Ueno Yoshihito
- Journal Title
  
  Bioorganic & Medicinal Chemistry
  
  Volume: 27 Issue: 7 Pages: 1341-1349
- DOI
  10.1016/j.bmc.2019.02.037
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Journal Article] Synthesis of 4′- C -aminoalkyl-2′- O -methyl modified RNA and their biological properties2018
- Author(s)
  Koizumi Kana、Maeda Yusuke、Kano Toshifumi、Yoshida Hisae、Sakamoto Taiichi、Yamagishi Kenji、Ueno Yoshihito
- Journal Title
  
  Bioorganic & Medicinal Chemistry
  
  Volume: 26 Issue: 12 Pages: 3521-3534
- DOI
  10.1016/j.bmc.2018.05.025
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536, KAKENHI-PROJECT-17J01992
[Journal Article] Selective release of miRNAs via extracellular vesicles is associated with house dust mite allergen-induced airway inflammation.2017
- Author(s)
  Gon Y, Maruoka S, Inoue T, Kuroda K, Yamagishi K, Kozu Y, Shikano S, Soda K, Lotvall J, Hashimoto S
- Journal Title
  
  Clinical & Experimental Allergy
  
  Volume: 47 Issue: 12 Pages: 1586-1598
- DOI
  10.1111/cea.13016
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196, KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Journal Article] Quantitative Determination of Glycine, Alanine, Aspartic Acid, Glutamic Acid, Phenylalanine, and Tryptophan by Raman Spectroscopy2017
- Author(s)
  Yasushi Numata, Maria Otsuka, Kenji Yamagishi, Hiroyuki Tanaka
- Journal Title
  
  Analytical Letters
  
  Volume: 50(4) Issue: 4 Pages: 651-662
- DOI
  10.1080/00032719.2016.1193189
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151, KAKENHI-PROJECT-16K07754
[Journal Article] Gene expression analysis in airway-secreting extracellular vesicles upon house dust mite exposure.2016
- Author(s)
  Gon Y, Maruoka S, Inoue T, Mizumura K, Kuroda K, Fukano Y, Yamagishi K, Tsuboi E, Hashimoto S
- Journal Title
  
  Allergol Int.
  
  Volume: Sep;65 Pages: S53-S55
- DOI
  10.1016/j.alit.2016.04.003
- NAID
  130005418886
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196, KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Journal Article] 細胞外顆粒内RNA情報の臨床応用2015
- Author(s)
  権　寧博、丸岡秀一郎、黒田和道、山岸賢司、橋本　修
- Journal Title
  
  呼吸と循環
  
  Volume: 63 Pages: 541-546
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196
[Journal Article] 気道分泌型エクソソーム2015
- Author(s)
  権　寧博、丸岡秀一郎、黒田和道、深野義人、山岸賢司、橋本　修
- Journal Title
  
  臨床免疫・アレルギー科
  
  Volume: 64 Pages: 495-500
- NAID
  40020656761
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196
[Patent] 核酸アプタマー、固相担体、ヒトＩｇＧ精製用カラム、及びヒトＩｇＧの精製方法2017
- Inventor(s)
  山岸賢司,関口真裕,吉田尚恵,坂本泰一,野村祐介,石川岳志
- Industrial Property Rights Holder
  学校法人　日本大学
- Industrial Property Rights Type
  特許
- Filing Date
  2017-02-10
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] バイオインフォマティクス手法によるライフサイエンス研究2024
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  第20回RNA工学セミナー（千葉工業大学）
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 抗体に結合するaptamerの改変体の結合能の解析2023
- Author(s)
  遠藤朱梨，関口真裕，阪本智樹，堀内正隆，石川岳志，片平正人，永田崇，山岸賢司，坂本泰一
- Organizer
  46回日本分子生物学会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] Conformational behavior, dynamics, and affinity of A18-modified aptamers toward human Immunoglobulin G2023
- Author(s)
  Ozora Kudo, Akari Endo, Masahiro Sekiguchi, Azumi ito, Takeshi Ishikawa, Taiichi Sakamoto, Kenji Yamagishi
- Organizer
  CBI学会2023年大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 抗体に結合するaptamerの改変体の結合能の解析2023
- Author(s)
  遠藤朱梨，伊藤愛純，関口真裕，阪本智樹，片平正人，永田崇，石川岳志，山岸賢司，坂本泰一
- Organizer
  2023年度日本生化学会関東支部例会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] Effect of modification on the aptamer that binds to IgG2023
- Author(s)
  Akari Endo, Azumi Ito, Masahiro Sekiguchi, Tomoki Sakamoto, Masato Katahira, Takashi Nagata, Takeshi Ishikawa, Kenji Yamagishi, Taiichi Sakamoto
- Organizer
  The 14th International Symposium of Advanced Energy Science
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] IgG1に対するRNA aptamerとChimera aptamerの構造特性の比較2023
- Author(s)
  長谷川拓矢，阪本智樹，関口真裕，石川岳志，片平正人，永田崇，山岸賢司，坂本泰一
- Organizer
  第46回日本分子生物学会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 計算化学を用いたアプタマーの革新的デザイン技術2022
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  イノベーションジャパン／JST事業採択課題展示特別枠
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] Effect of chemical modification on the aptamer that binds to IgG2022
- Author(s)
  Azumi Ito, Yuuki Yatabe, Hisae Yoshida, Masahiro Sekiguchi, Kazumasa Akita, Yoshikazu Nakamura, Yusuke Nomura, Takeshi Ishikawa, Kenji Yamagishi, Taiichi Sakamoto
- Organizer
  第６０回日本生物物理学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 生体分子シミュレーション　－核酸医薬品開発への展開－2022
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  第４回ファーマラボEXPO
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] Effect of chemical modification on the aptamer that binds to IgG，Improvement of binding activity by introducing chemical modification to the aptamer that binds to IgG2022
- Author(s)
  Azumi Ito, Yuuki Yatabe, Hisae Yoshida, Masahiro Sekiguchi, Kazumasa Akita, Yoshikazu Nakamura, Yusuke Nomura, Takeshi Ishikawa, Kenji Yamagishi, Taiichi Sakamoto
- Organizer
  The 13th International Symposium of Advanced Energy Science
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 核酸・タンパク質などの生体高分子の分子シミュレーション2022
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  福島地区・高分子学会東北支部講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] Conformational behavior and dynamics of G7A mutant IgG-aptamer2022
- Author(s)
  Seiichiro Ishii, Ryoji Yamazaki, Oozora Kudo, Taiichi Sakamoto, Takeshi Ishikawa, Kenji Yamagishi
- Organizer
  CBI学会2022年大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] RNAの立体構造および相互作用の計算化学2022
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  mRNAターゲット創薬研究機構「2021年度　第2回講演会」
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] In silico approach for identification of the thermodynamic profiles of aptamer-IgG binding2022
- Author(s)
  Ryoji Yamazaki, Azumi Ito, Tomoki Sakamoto, Masaki Komine, Takeshi Ishikawa, Masato Katahira, Takashi Nagata, Taiichi Sakamoto, Kenji Yamagishi
- Organizer
  第６０回日本生物物理学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 分子動力学計算による抗体に結合するRNAアプタマーの立体構造解析2021
- Author(s)
  山崎凌司，山岸賢司
- Organizer
  日本コンピュータ化学会2021年秋季年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 分子動力学計算を用いたIgGアプタマーの構造ダイナミクスの塩基配列・塩基修飾依存性2021
- Author(s)
  金沢拓土, 金田一樹, 山岸賢司
- Organizer
  化学系学協会東北大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] RNAアプタマーのDNA置換の物理化学的解析2021
- Author(s)
  坂本泰一，山岸賢司
- Organizer
  第44回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] デオキシリボヌクレオチドとリボヌクレオチドの違いによるIgG アプタマーの結合プロファイルの解析2021
- Author(s)
  山崎凌司, 金田一樹, 吉田尚恵, 坂本泰一, 石川岳志, 山岸賢司
- Organizer
  化学系学協会東北大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 計算化学を基盤としたアプタマーの論理的な設計指針の確立を目指して2021
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  化学系学協会東北大会　若手シンポジウム
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] 分子シミュレーションを用いたヒト抗体(IgG)に特異的に結合する新規修飾アプタマーの分子設計2021
- Author(s)
  金田一樹, 石井清一郎, 坂本泰一, 石川岳志, 山岸賢司
- Organizer
  化学系学協会東北大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-21K12129
[Presentation] Phylogenetic classifier of bacterial genomes based on nucleotide pentamer profiles2020
- Author(s)
  中野善夫，土門優作，山岸賢司，渡辺孝康
- Organizer
  第93回日本細菌学会総会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] Molecular Dynamics Simulation of the Effect that Ca2+ has on the Tertiary Structure of an RNA Aptamer2020
- Author(s)
  Kazuki Kaneda, Seiichiro Ishii, Hisae Yoshida, Takeshi Ishikawa, Taiichi Sakamoto, Kenji Yamagishi
- Organizer
  第２０回日本蛋白質科学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 分子動力学計算によるIgGアプタマーの構造特性の解析2019
- Author(s)
  石井清一郎, 吉田尚恵, 増川恵介, 矢田部優貴, 秋田一雅, 猪股恵美礼, 石川岳志, 坂本泰一, 山岸賢司
- Organizer
  日本化学会第99回春季大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 分子動力学計算を用いた修飾核酸の立体構造解析2019
- Author(s)
  山崎翔，吉田尚恵，増川恵介，石井清一郎，山岸賢司
- Organizer
  第57回日本薬学会東北支部大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] クラスター解析を用いたMDトラジェクトリー解析プロトコルの構築と応用2019
- Author(s)
  土門優作，増川恵介，金田一樹，佐藤壱成, 山岸賢司
- Organizer
  化学系学協会東北大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] AML1 アプタマーの動的構造と結合親和性との相関2019
- Author(s)
  田中淳，増川恵介，吉田尚恵，石川岳志，坂本泰一，山岸賢司
- Organizer
  第19回日本蛋白質科学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] RNA アプタマーと標的分子の結合メカニズムの解明2019
- Author(s)
  増川恵介，吉田尚恵，田中淳，石井清一郎，矢田部優貴，石川岳志，坂本泰一，山岸賢司
- Organizer
  第19回日本蛋白質科学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 分子シミュレーションによるRNAアプタマー- IgG複合体の相互作用解析および複合体形成におけるCa2+の影響2019
- Author(s)
  石井清一郎，吉田尚恵，増川恵介，石川岳志，坂本泰一，山岸賢司
- Organizer
  日本コンピュータ化学会2019秋季年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] AML1アプタマーに対する動的構造活性相関の解析2019
- Author(s)
  田中淳，山岸賢司
- Organizer
  RNAフロンティアミーティング 2019
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 抗体に結合するアプタマーと金属イオンの相互作用解析2019
- Author(s)
  古峰真樹，吉田尚恵，関口真裕，石川岳志，山岸賢司，坂本泰一
- Organizer
  第42回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 新規RNAアプタマーの設計を目指したRNAアプタマーと標的分子との結合メカニズム解析2019
- Author(s)
  増川恵介，吉田尚恵，石井清一郎，矢田部優貴，石川岳志，坂本泰一，山岸賢司
- Organizer
  RNAフロンティアミーティング 2019
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] フラバノン配糖体の消化による抗アレルギー活性の発現に関する研究2019
- Author(s)
  白土心，田中守，山岸賢司，岡本威明
- Organizer
  第23回生物機能研究会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 分子シミュレーションを用いたRNAアプタマーとヒト抗体(IgG)の結合メカニズムの解析2019
- Author(s)
  石井清一郎，山岸賢司
- Organizer
  RNAフロンティアミーティング 2019
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] バイオインフォマティクス研究における種々のライフサイエンスデータベースの高度利用2019
- Author(s)
  石井清一郎, 土門優作, 吉田尚恵, 武田伊織, 小野洋一, 中野善夫, 山岸賢司
- Organizer
  トーゴーの日　－バイオデータベース：つないで使う－
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] Combined computational and experimental study on the binding mechanism of RNA aptamer to human Immunoglobulin G2019
- Author(s)
  Masukawa Keisuke, Yoshida Hisae, Ishii Seiichiro, Yatabe Yuuki, Ishikawa Takeshi, Sakamoto Taiichi, Yamagishi Kenji
- Organizer
  CBI（情報計算化学生物）学会2019年大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 短塩基連続出現頻度あるいは隣接遺伝子出現頻度に基づくバクテリアゲノム系統解析2019
- Author(s)
  土門優作，山岸賢司，中野善夫
- Organizer
  第42回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 分子シミュレーション解析を用いた生体分子の構造と機能の解明2018
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  第1回SPERC計算化学講演会・第3回岩手量子化学計算講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] RNAアプタマーと標的タンパク質の分子間相互作用解析2018
- Author(s)
  吉田尚恵・山岸賢司・都築誠二
- Organizer
  SATテクノロジー・ショーケース2018
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 化学教育への展開を目指した分子構造AR表示システムの開発2018
- Author(s)
  武田伊織, 山岸賢司
- Organizer
  化学系学協会東北大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 抗体に結合する化学修飾アプタマーの熱力学的解析2018
- Author(s)
  矢田部優貴・吉田尚恵・関口真裕・秋田一雅・猪股恵美礼・野村祐介・石川岳志・山岸賢司・坂本泰一
- Organizer
  第41回日本分子生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] MECHANISM OF MOLECULAR RECOGNITION OF RNA APTAMER TO HUMAN IMMUNOGLOBULIN G2018
- Author(s)
  Hisae YOSHIDA, Takeshi ISHIKAWA, Taiichi SAKAMOTO, Kenji YAMAGISHI
- Organizer
  EFMC-ISMC 2018[XXV EFMC International Symposium on Medicinal Chemistry
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] ライフサイエンスデータベースを利活用したバイオインフォマティクス研究2018
- Author(s)
  渡邊妙子, 吉田尚恵, 武田伊織, 小野洋一, 中野善夫, 山岸賢司
- Organizer
  トーゴーの日　－バイオデータベース：つないで使う－
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18K11536
[Presentation] 分子動力学計算による修飾核酸オリゴマーの立体構造解析2018
- Author(s)
  山崎翔・関口真裕・山岸賢司
- Organizer
  日本化学会第98春季年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] RNA アプタマーとAML1 タンパク質の結合メカニズムに対する分子シミュレーション解析2018
- Author(s)
  増川恵介・関口真裕・山岸賢司
- Organizer
  日本化学会第98春季年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 生体分子系に対する分子シミュレーション解析2017
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  平成２９年度化学系学協会東北大会　（依頼講演）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] エクソソームの呼吸器疾患バイオマーカーへの応用2017
- Author(s)
  権　寧博、山岸賢司、井上寿男、黒田和道、坪井絵莉子、木澤靖夫、橋本　修
- Organizer
  平成28年度　日本大学学部連携研究推進シンポジウム
- Place of Presentation
  日本大学会館2階大講堂 (東京都、千代田区)
- Year and Date
  2017-02-18
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196
[Presentation] Structure and Dynamics of RNA Aptamer to Human Immunoglobulin G2017
- Author(s)
  Hisae Yoshida, Masahiro Sekiguchi, Keisuke Masukawa, Sho Yamazaki, Emire Inomata, Kazumasa Akita, Takeshi Ishikawa, Taiichi Sakamoto, Kenji Yamagishi
- Organizer
  CBI（情報計算化学生物）学会2017年大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 生体分子シミュレーション2017
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  第６０回日本大学工学部学術研究報告会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] Theoretical study on the structure and dynamics of RNA aptamer to human immunoglobulin G2017
- Author(s)
  Hisae Yoshida, Masahiro Sekiguchi, Kazumasa Akita, Emire Inomata, Takeshi Ishikawa, Taiichi Sakamoto, Kenji Yamagishi
- Organizer
  平成２９年度化学系学協会東北大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 分子シミュレーションを用いたRNA アプタマーの設計手法の開発2017
- Author(s)
  吉田尚恵・関口真裕・秋田一雅・猪股恵美礼・野村祐介・石川岳志・坂本泰一・山岸賢司
- Organizer
  第１７回日本蛋白質科学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 分子動力学シミュレーションによる修飾核酸の動的構造解析2017
- Author(s)
  関口真裕・山岸賢司
- Organizer
  第６０回日本大学工学部学術研究報告会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] ハロゲン原子の導入によるタンパク質の構造安定化メカニズムの解明2016
- Author(s)
  吉田尚恵, 石川岳志, 小橋創介, 鷹嘴潤平, 春木満, 坂本健作, 山岸賢司
- Organizer
  第16回日本蛋白質科学会年会
- Place of Presentation
  福岡国際会議場（博多）
- Year and Date
  2016-06-07
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] ビタミンD 受容体のリガンド認識メカニズムの解明2016
- Author(s)
  吉田尚恵, 春木満, 山岸賢司
- Organizer
  第16回日本蛋白質科学会年会
- Place of Presentation
  福岡国際会議場（博多）
- Year and Date
  2016-06-07
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] Molecular Simulation Analysis of RNA Aptamer to Human Immunoglobulin G2016
- Author(s)
  Hisae Yoshida, Toshiki Fukaya, Masahiro Sekiguchi, Emire Inomata, Kazumasa Akita, Takeshi Ishikawa, Taiichi Sakamoto, Kenji Yamagishi
- Organizer
  Chem-Bio Informatics Society(CBI) Annual Meeting 2016
- Place of Presentation
  Tower hall FUNABORI (Edogawa)
- Year and Date
  2016-10-25
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 修飾RNA アプタマーに対するコンフォメーション解析2016
- Author(s)
  関口真裕, 吉田尚恵, 石川岳志, 宮川伸, 坂本泰一, 山岸賢司
- Organizer
  第16回日本蛋白質科学会年会
- Place of Presentation
  福岡国際会議場（博多）
- Year and Date
  2016-06-07
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 生体分子シミュレーションによるアプタマーの最適化2016
- Author(s)
  山岸賢司
- Organizer
  CBI学会2016年大会　フォーカストセッション
- Place of Presentation
  タワーホール船堀（江戸川）
- Year and Date
  2016-10-25
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 分子動力学計算を用いた修飾RNAアプタマーの立体構造解析2016
- Author(s)
  関口真裕, 吉田尚恵, 石川岳志, 山岸賢司
- Organizer
  第５９回日本大学工学部学術研究報告会
- Place of Presentation
  日本大学工学部（郡山）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 分子動力学計算を用いた修飾RNAアプタマーの構造解析2016
- Author(s)
  関口真裕, 小野間優希, 吉田尚恵, 秋田一雅, 猪股恵美礼, 石川岳志, 坂本泰一, 山岸賢司
- Organizer
  日本核酸医薬学会第2回年会
- Place of Presentation
  東京理科大学葛飾キャンパス（葛飾）
- Year and Date
  2016-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] 急性肺障害モデルにおけるexosome由来miRNAの発現解析2016
- Author(s)
  鹿野壮太郎、井上寿男、権　寧博、丸岡秀一郎、黒田和道、山岸賢司、曽田香織、橋本　修
- Organizer
  第56回日本呼吸器学会学術講演会
- Place of Presentation
  国立京都国際会館（京都府、京都市）
- Year and Date
  2016-04-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196
[Presentation] AR 技術を用いた分子構造表示システムの開発と薬学教育への応用2016
- Author(s)
  八巻雷士・山岸賢司
- Organizer
  第５５回日本薬学会東北支部大会
- Place of Presentation
  奥羽大学（郡山）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] マウスLPS誘導性肺障害におけるエクソソームのRNA発現解析2016
- Author(s)
  井上寿男、権　寧博、丸岡秀一郎、鹿野壮太郎、黒田和道、山岸賢司、曽田香織、橋本　修
- Organizer
  第56回日本呼吸器学会学術講演会
- Place of Presentation
  国立京都国際会館（京都府、京都市）
- Year and Date
  2016-04-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196
[Presentation] 修飾RNA アプタマーに対する構造活性相関2016
- Author(s)
  関口真裕, 小野間優希, 深谷和紀, 八巻雷士, 吉田尚恵, 石川岳志, 秋田一雅, 猪股恵美礼, 坂本泰一, 山岸賢司
- Organizer
  第５５回日本薬学会東北支部大会
- Place of Presentation
  奥羽大学（郡山）
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K16151
[Presentation] マウス喘息モデルを用いた気道分泌型exosomeの解析2015
- Author(s)
  権　寧博、丸岡秀一郎、黒田和道、山岸賢司、鹿野壮太郎、曽田香織、坪井絵莉子、竹下郁子、橋本　修
- Organizer
  第64回日本アレルギー学会学術大会
- Place of Presentation
  グランドプリンスホテル新高輪国際館パミール(東京都、港区)
- Year and Date
  2015-05-26
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196
[Presentation] マウスLPS誘導性肺障害におけるBALF中エクソソームのRNA発現解析2015
- Author(s)
  井上寿男、権　寧博、丸岡秀一郎、鹿野壮太郎、黒田和道、山岸賢司、曽田香織、橋本　修
- Organizer
  第55回日本呼吸器学会学術講演会
- Place of Presentation
  東京国際フォーラム(東京都、千代田区)
- Year and Date
  2015-04-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196
[Presentation] マウス喘息モデルにおける気道分泌型細胞外小胞RNAの網羅的発現解析2015
- Author(s)
  権　寧博、井上寿男、深野義人、山岸賢司、黒田和道、鹿野壮太郎、曽田香織、水村賢司、丸岡秀一郎、橋本　修
- Organizer
  アレルギー、好酸球研究会2015
- Place of Presentation
  学術総合センター(東京都、千代田区)
- Year and Date
  2015-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15K09196

1. 坂本泰一 (40383369)

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 26 results
2. 石川岳志 (80505909)

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 23 results
3. GON yasuhiro (80339316)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 10 results
4. 黒田和道 (50215109)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 10 results
5. 木澤靖夫 (80211192)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 1 results
6. 丸岡秀一郎 (80599358)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 9 results

Yamagishi Kenji 山岸 賢司

YAMAGISHI Kenji 山岸 賢司

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

Establishment of a fundamental technology for designing new aptamers using molecular simulation methodsPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Molecular Recognition Mechanism of RNA aptamerPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Mechanism of structural stability of halogenated proteinPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Identification of biomarker for pathogenesis on asthma and COPD based on airway secreted exosome

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

[Book] 「mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用」-RNAの立体構造と計算化学-2023

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Data Source

[Book] 【分担執筆】タンパク質の構造解析手法と In silicoスクリーニングへの応用事例，「第8節 生体分子シミュレーションによる核酸医薬品開発への展開タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例」2023

Author(s)

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Publisher

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Data Source

[Book] 【分担執筆】mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用，「第6節 mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用」2023

Author(s)

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Data Source

[Book] in-silico創薬におけるスクリーニングの高速化・効率化技術2018

Author(s)

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[Journal Article] Thermodynamic Analysis of Nucleic Acid Aptamers Binding to Their Targets2023

Author(s)

Journal Title

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Data Source

[Journal Article] Phylogenetic trees of closely related bacterial species and subspecies based on frequencies of short nucleotide sequences2023

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Journal Title

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Data Source

[Journal Article] Computational approach for understanding the biding mechanism of RNA aptamer to human Immunogloblin G2021

Author(s)

Journal Title

Data Source

[Journal Article] 計算化学手法を用いた抗体に結合する RNA アプタマーの分子認識機構の解明2021

Author(s)

Journal Title

NAID

Data Source

[Journal Article] Synthesis and evaluation of (S)-5′-C-aminopropyl and (S)-5′-C-aminopropyl-2′-arabinofluoro modified DNA oligomers for novel RNase H-dependent antisense oligonucleotides2020

Author(s)

Journal Title

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Data Source

Yamagishi Kenji 山岸賢司

YAMAGISHI Kenji 山岸賢司

[Book] 【分担執筆】mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用，「第6節　mRNAの制御機構の解明と治療薬・ワクチンへの活用」2023