• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

馬見塚 拓  Mamitsuka Hiroshi

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 00346107
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 京都大学, 化学研究所, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2012年度 – 2025年度: 京都大学, 化学研究所, 教授
2003年度 – 2004年度: 京都大学, 化学研究所, 客員助教授
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分61030:知能情報学関連 / 生物系 / 中区分61:人間情報学およびその関連分野 / 小区分51030:病態神経科学関連 / 知能情報学 / 知能情報学
研究代表者以外
大区分E / 知能情報学
キーワード
研究代表者
機械学習 / プロテオーム / 生体生命情報学 / バイオインフォマティクス / 知識発見とデータマイニング / アルゴリズム / 高次元機械学習 / データマイニング / 協調行列分解 / 行列分解 / ゲノム / 人工知能 / グラフマイニング … もっと見る
研究代表者以外
… もっと見る 機能性高分子 / TERP / ポリマーリサイクル / 自己修復性材料 / 有機テルル / 多分岐ポリマー / 修復性材料 / 絡み合い / 制御ラジカル重合 / デンドリマー / 超分岐ポリマー / 頻出パターンマイニング / ゲノム情報処理 / シーケンスマイニング / 知識発見とデータマイニング 隠す
  • 研究課題

    (10件)
  • 研究成果

    (100件)
  • 共同研究者

    (20人)
  •  グラフ深層学習による超高速物理シミュレーションの実現:システム生物学への展開研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2029
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分61:人間情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      京都大学
  •  多様なデータからの包括的データ構造推定研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分61030:知能情報学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  構造が制御された超分岐高分子を基盤とする次世代高分子材料の開発

    • 研究代表者
      山子 茂
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(S)
    • 審査区分
      大区分E
    • 研究機関
      京都大学
  •  うつ症状の生物学を解明するための機械学習に基づくバイオインフォマティクスの構築研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      特別研究員奨励費
    • 審査区分
      小区分51030:病態神経科学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  複数のテンソルからの効率的なデータ構造推定研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分61030:知能情報学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  複数行列データからのデータ因子構造推定研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      知能情報学
    • 研究機関
      京都大学
  •  巨大シーケンス内の類似繰り返し構造の分析

    • 研究代表者
      中村 篤祥
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      知能情報学
    • 研究機関
      北海道大学
  •  多様な半構造化データからのデータ構造推定研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      知能情報学
    • 研究機関
      京都大学
  •  生体内化合物の効率的な比較、探索、発見アルゴリズムの開発研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      京都大学
  •  生体高分子と結合する低分子化合物の効率的な比較、探索、発見アルゴリズムの開発研究代表者

    • 研究代表者
      馬見塚 拓
    • 研究期間 (年度)
      2003
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      京都大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2004 その他

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] Machine Learning for Marketing2019

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Mamitsuka
    • 総ページ数
      237
    • 出版者
      Global Data Science Publishing
    • ISBN
      9784991044526
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [図書] Textbook of Machine Learning and Data Mining: with Bioinformatics Applications2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Mamitsuka
    • 総ページ数
      388
    • 出版者
      Global Data Science Publishing
    • ISBN
      9784991044502
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [図書] Data Mining for Systems Biology2018

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Mamitsuka
    • 総ページ数
      243
    • 出版者
      Springer
    • ISBN
      9781493985609
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [図書] Data Mining for Systems Biology: Methods and Protocols2013

    • 著者名/発表者名
      Mamitsuka, H., DeLisi, C., and Kanehisa, M.
    • 総ページ数
      279
    • 出版者
      Springer
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] CoPolDB: a copolymerization database for radical polymerization2024

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Kei-ichiro、Mamitsuka Hiroshi、Tosaka Masatoshi、Zhu Nanyi、Yamago Shigeru
    • 雑誌名

      Polymer Chemistry

      巻: 15 号: 10 ページ: 965-971

    • DOI

      10.1039/d3py01372c

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H05027
  • [雑誌論文] Graph Network-Based Simulation of Multicellular Dynamics Driven by Concentrated Polymer Brush-Modified Cellulose Nanofibers2024

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa Chiaki、Nguyen Duc Anh、Nakaji-Hirabayashi Tadashi、Takigawa Ichigaku、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      ACS Biomaterials Science and Engineering

      巻: 10 号: 4 ページ: 2165-2176

    • DOI

      10.1021/acsbiomaterials.3c01888

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19KK0368, KAKENHI-PROJECT-21K12041, KAKENHI-PROJECT-21H05027, KAKENHI-PROJECT-23K23401, KAKENHI-PROJECT-23K25205
  • [雑誌論文] Central-Smoothing Hypergraph Neural Networks for Predicting Drug?Drug Interactions2023

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Duc Anh、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems

      巻: 0 号: 8 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1109/tnnls.2023.3261860

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K12150, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] DeepMHCI: an anchor position-aware deep interaction model for accurate MHC-I peptide binding affinity prediction2023

    • 著者名/発表者名
      Qu Wei、You Ronghui、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 39 号: 9

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btad551

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K24901, KAKENHI-PROJECT-21H05027
  • [雑誌論文] Multiplicative Sparse Tensor Factorization for Multi-View Multi-Task Learning2023

    • 著者名/発表者名
      Wang Xinyi、Sun Lu、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the 26th European Conference on Artificial Intelligence (ECAI 2023)

      巻: - ページ: 2560-2567

    • DOI

      10.3233/faia230561

    • ISBN
      9781643684369, 9781643684376
    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K24901, KAKENHI-PROJECT-21H05027
  • [雑誌論文] DIVERSE: Bayesian Data IntegratiVE Learning for Precise Drug ResponSE Prediction2022

    • 著者名/発表者名
      Paltun Betul Guvenc、Kaski Samuel、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 19 号: 4 ページ: 2197-2207

    • DOI

      10.1109/tcbb.2021.3065535

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] SPARSE: a sparse hypergraph neural network for learning multiple types of latent combinations to accurately predict drug?drug interactions2022

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Duc Anh、Nguyen Canh Hao、Petschner Peter、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 号: Supplement_1 ページ: i333-i341

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac250

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K12150, KAKENHI-PROJECT-21H05027, KAKENHI-PROJECT-20F20809, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] DeepMHCII: a novel binding core-aware deep interaction model for accurate MHC-II peptide binding affinity prediction2022

    • 著者名/発表者名
      You Ronghui、Qu Wei、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 号: Supplement_1 ページ: i220-i228

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac225

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H05027, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Sc2Mol: a scaffold-based two-step molecule generator with variational autoencoder and transformer2022

    • 著者名/発表者名
      Liao Zhirui、Xie Lei、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 39 号: 1

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btac814

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169, KAKENHI-PROJECT-23K24901, KAKENHI-PROJECT-21H05027
  • [雑誌論文] Machine learning approaches for drug combination therapies2021

    • 著者名/発表者名
      G?ven??Paltun Bet?l、Kaski Samuel、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 22 号: 6

    • DOI

      10.1093/bib/bbab293

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Reshaped tensor nuclear norms for higher order tensor completion2021

    • 著者名/発表者名
      Wimalawarne Kishan、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Machine Learning

      巻: 110 号: 3 ページ: 507-531

    • DOI

      10.1007/s10994-020-05927-y

    • NAID

      120007002690

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Eukaryotic virus composition can predict the efficiency of carbon export in the global ocean2021

    • 著者名/発表者名
      Kaneko Hiroto、Blanc-Mathieu Romain、Endo Hisashi、Chaffron Samuel、Delmont Tom O.、Gaia Morgan、Henry Nicolas、Hern?ndez-Vel?zquez Rodrigo、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi、Forterre Patrick、Jaillon Olivier、de Vargas Colomban、Sullivan Matthew B.、Suttle Curtis A.、Guidi Lionel、Ogata Hiroyuki
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 24 号: 1 ページ: 102002-102002

    • DOI

      10.1016/j.isci.2020.102002

    • NAID

      120006951684

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K15895, KAKENHI-INTERNATIONAL-16K21723, KAKENHI-PLANNED-16H06437, KAKENHI-ORGANIZER-16H06429, KAKENHI-PROJECT-19H05667, KAKENHI-PROJECT-18H02279, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Crop loss identification at field parcel scale using satellite remote sensing and machine learning2021

    • 著者名/発表者名
      Hiremath Santosh、Wittke Samantha、Palosuo Taru、Kaivosoja Jere、Tao Fulu、Proll Maximilian、Puttonen Eetu、Peltonen-Sainio Pirjo、Marttinen Pekka、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 16 号: 12 ページ: e0251952-e0251952

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0251952

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] HPODNets: deep graph convolutional networks for predicting human protein?phenotype associations2021

    • 著者名/発表者名
      Liu Lizhi、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 38 号: 3 ページ: 799-808

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btab729

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H05027, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Drug3D-DTI: Improved Drug-target Interaction Prediction by Incorporating Spatial Information of Small Molecules2021

    • 著者名/発表者名
      Liao Zhirui、Huang Xiaodi、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Proceedings of the IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2021)

      巻: - ページ: 340-347

    • DOI

      10.1109/bibm52615.2021.9669707

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] XGSEA: CROSS-species gene set enrichment analysis via domain adaptation2021

    • 著者名/発表者名
      Cai Menglan、Hao Nguyen Canh、Mamitsuka Hiroshi、Li Limin
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 22 号: 5

    • DOI

      10.1093/bib/bbaa406

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] DeepGraphGO: graph neural network for large-scale, multispecies protein function prediction2021

    • 著者名/発表者名
      You Ronghui、Yao Shuwei、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 37 号: Supplement_1 ページ: i262-i271

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btab270

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Learning subtree pattern importance for Weisfeiler-Lehman based graph kernels2021

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Dai Hai、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Machine Learning

      巻: 110 号: 7 ページ: 1587-1607

    • DOI

      10.1007/s10994-021-05991-y

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K11434, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Machine Learning for Metabolic Identification2021

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Dai Hai、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Creative Complex Systems

      巻: - ページ: 329-350

    • DOI

      10.1007/978-981-16-4457-3_20

    • ISBN
      9789811644566, 9789811644573
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] HPOFiller: identifying missing protein?phenotype associations by graph convolutional network2021

    • 著者名/発表者名
      Liu Lizhi、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 37 号: 19 ページ: 3328-3336

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btab224

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Learning on Hypergraphs with Sparsity2020

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Hao Canh、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence

      巻: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1109/tpami.2020.2974746

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K11434, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Scaled Coupled Norms and Coupled Higher-Order Tensor Completion2020

    • 著者名/発表者名
      Wimalawarne Kishan、Yamada Makoto、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Neural Computation

      巻: 32 号: 2 ページ: 447-484

    • DOI

      10.1162/neco_a_01254

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Scalable Probabilistic Matrix Factorization with Graph-Based Priors2020

    • 著者名/発表者名
      Strahl Jonathan、Peltonen Jaakko、Mamitsuka Hirsohi、Kaski Samuel
    • 雑誌名

      Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence

      巻: 34 号: 04 ページ: 5851-5858

    • DOI

      10.1609/aaai.v34i04.6043

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] HPOLabeler: improving prediction of human protein?phenotype associations by learning to rank2020

    • 著者名/発表者名
      Liu Lizhi、Huang Xiaodi、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 36 号: 14 ページ: 4180-4188

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btaa284

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] BERTMeSH: deep contextual representation learning for large-scale high-performance MeSH indexing with full text2020

    • 著者名/発表者名
      You Ronghui、Liu Yuxuan、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 37 号: 5 ページ: 684-692

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btaa837

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Efficiently Enumerating Substrings with Statistically Significant Frequencies of Locally Optimal Occurrences in Gigantic String2020

    • 著者名/発表者名
      Nakamura Atsuyoshi、Takigawa Ichigaku、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the AAAI Conference on Artificial Intelligence

      巻: 34 号: 04 ページ: 5240-5247

    • DOI

      10.1609/aaai.v34i04.5969

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Scalable Probabilistic Matrix Factorization with Graph-Based Priors.2020

    • 著者名/発表者名
      Strahl, J., Peltonen, J., Mamitsuka, H. and Kaski, S.
    • 雑誌名

      Proceedings of the 34th AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI 2020)

      巻: -

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] AttentionXML: Label Tree-based Attention-Aware Deep Model for High-Performance Extreme Multi-Label Text Classification.2019

    • 著者名/発表者名
      You, R., Dai, S., Zhang, Z., Mamitsuka, H. and Zhu, S.
    • 雑誌名

      Proceedings of the 33rd Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2019)

      巻: - ページ: 5820-5830

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Modelling G×E with historical weather information improves genomic prediction in new environments2019

    • 著者名/発表者名
      Gillberg Jussi、Marttinen Pekka、Mamitsuka Hiroshi、Kaski Samuel
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 35 号: 20 ページ: 4045-4052

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btz197

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] ADAPTIVE: leArning DAta-dePendenT, concIse molecular VEctors for fast, accurate metabolite identification from tandem mass spectra2019

    • 著者名/発表者名
      Dai Hai Nguyen, Canh Hao Nguyen, Hiroshi Mamitsuka
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 35 号: 14 ページ: 164-172

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btz319

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19J14714, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] NetGO: improving large-scale protein function prediction with massive network information2019

    • 著者名/発表者名
      You Ronghui、Yao Shuwei、Xiong Yi、Huang Xiaodi、Sun Fengzhu、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 47 号: W1 ページ: W379-W387

    • DOI

      10.1093/nar/gkz388

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] A survey on adverse drug reaction studies: data, tasks and machine learning methods2019

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Duc Anh、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 1 号: 1 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1093/bib/bbz140

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K11434, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Fast and Robust Multi-View Multi-Task Learning via Group Sparsity2019

    • 著者名/発表者名
      Sun Lu、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the 28th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI 2019)

      巻: - ページ: 3499-3505

    • DOI

      10.24963/ijcai.2019/485

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] HPOAnnotator: improving large-scale prediction of HPO annotations by low-rank approximation with HPO semantic similarities and multiple PPI networks2019

    • 著者名/発表者名
      Gao Junning、Liu Lizhi、Yao Shuwei、Huang Xiaodi、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      BMC Medical Genomics

      巻: 12 号: S10 ページ: 187-187

    • DOI

      10.1186/s12920-019-0625-1

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Multiplicative Sparse Feature Decomposition for Efficient Multi-View Multi-Task Learning2019

    • 著者名/発表者名
      Sun Lu、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the 28th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI 2019)

      巻: - ページ: 3506-3512

    • DOI

      10.24963/ijcai.2019/486

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] FullMeSH: improving large-scale MeSH indexing with full text2019

    • 著者名/発表者名
      Dai Suyang、You Ronghui、Lu Zhiyong、Huang Xiaodi、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 36 号: 5 ページ: 1533-1541

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btz756

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] Improving drug response prediction by integrating multiple data sources: matrix factorization, kernel and network-based approaches2019

    • 著者名/発表者名
      Guvenq Paltun Betel、Mamitsuka Hiroshi、Kaski Samuel
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: - 号: 1 ページ: 346-359

    • DOI

      10.1093/bib/bbz153

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868, KAKENHI-PROJECT-19H04169
  • [雑誌論文] GOLabeler: improving sequence-based large-scale protein function prediction by learning to rank2018

    • 著者名/発表者名
      You Ronghui、Zhang Zihan、Xiong Yi、Sun Fengzhu、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 34 号: 14 ページ: 2465-2473

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/bty130

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] MeSHLabeler and DeepMeSH: Recent Progress in Large-Scale MeSH Indexing2018

    • 著者名/発表者名
      Peng Shengwen、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 1807 ページ: 203-209

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8561-6_15

    • NAID

      120006552926

    • ISBN
      9781493985609, 9781493985616
    • オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] SiBIC: A Tool for Generating a Network of Biclusters Captured by Maximal Frequent Itemset Mining2018

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Kei-ichiro、duVerle David A.、Yotsukura Sohiya、Takigawa Ichigaku、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 1807 ページ: 95-111

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8561-6_8

    • NAID

      120006552927

    • ISBN
      9781493985609, 9781493985616
    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] SIMPLE: Sparse Interaction Model over Peaks of moLEcules for fast, interpretable metabolite identification from tandem mass spectra2018

    • 著者名/発表者名
      Nguyen Dai Hai、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 34 号: 13 ページ: i323-i332

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/bty252

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K11434, KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms.2018

    • 著者名/発表者名
      Wimalawarme, K. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Proceedings of the Thirty-Second Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2018)

      巻: - ページ: 6902-6910

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Factor Analysis on a Graph2018

    • 著者名/発表者名
      Karasuyama, M. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Proceedings of the 21st International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS 2018) (JMLR Workshop and Conference Proceedings (PMLR))

      巻: 84 ページ: 1117-1126

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] DrugE-Rank: Predicting Drug-Target Interactions by Learning to Rank2018

    • 著者名/発表者名
      Deng Jieyao、Yuan Qingjun、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology

      巻: 1807 ページ: 195-202

    • DOI

      10.1007/978-1-4939-8561-6_14

    • NAID

      120006552925

    • ISBN
      9781493985609, 9781493985616
    • オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms2018

    • 著者名/発表者名
      Wimalawarne Kishan, Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Proceedings of the Thirty-Second Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2018)

      巻: - ページ: 6902-6910

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Factor Analysis on a Graph.2018

    • 著者名/発表者名
      Karasuyama, M. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Proceedings of the 21st International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS 2018)

      巻: - ページ: 1117-1126

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Ultra High-Dimensional Nonlinear Feature Selection for Big Biological Data2018

    • 著者名/発表者名
      Yamada Makoto、Tang Jiliang、Lugo-Martinez Jose、Hodzic Ermin、Shrestha Raunak、Ouyang Hua、Radivojac Predrag、Sahinalp Cenk、Menczer Filippo、Chang Yi、Saha Avishek、Mamitsuka Hiroshi、Yin Dawei
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering

      巻: n/a 号: 7 ページ: 1-1

    • DOI

      10.1109/tkde.2018.2789451

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K16114, KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] AiProAnnotator: Low-rank Approximation with network side information for high-performance, large-scale human Protein abnormality Annotator2018

    • 著者名/発表者名
      Gao Junning、Yao Shuwei、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 雑誌名

      Proceedings of the 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2018)

      巻: - ページ: 13-20

    • DOI

      10.1109/bibm.2018.8621517

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Convex Coupled Matrix and Tensor Completion2018

    • 著者名/発表者名
      Wimalawarne Kishan、Yamada Makoto、Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Neural Computation

      巻: 30 号: 11 ページ: 3095-3127

    • DOI

      10.1162/neco_a_01123

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Exploring Phenotype Patterns of Breast Cancer within Somatic Mutations: a Modicum in the Intrinsic Code2017

    • 著者名/発表者名
      Yotsukura Sohiya, Karasuyama Masayuki, Takigawa Ichigaku, and Mamitsuka Hiroshi
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 18 ページ: bbw040-bbw040

    • DOI

      10.1093/bib/bbw040

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-14J00381, KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Adaptive Edge Weighting for Graph-Based Learning Algorithms2017

    • 著者名/発表者名
      M. Karasuyama, and H. Mamitsuka,
    • 雑誌名

      Machine Learning

      巻: 106 号: 2 ページ: 307-335

    • DOI

      10.1007/s10994-016-5607-3

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26730120, KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Generalized sparse learning of linear models over the complete subgraph feature set2017

    • 著者名/発表者名
      Takigawa I, Mamitsuka H
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Pattern Analysis and Machine Intelligence

      巻: 36(3) 号: 3 ページ: 617-624

    • DOI

      10.1109/tpami.2016.2567399

    • NAID

      120006382284

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26330242, KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Convex Factorization Machine for Toxicogenomics Prediction2017

    • 著者名/発表者名
      Yamada Makoto、Lian Wenzhao、Goyal Amit、Chen Jianhui、Wimalawarne Kishan、Khan Suleiman A.、Kaski Samuel、Mamitsuka Hiroshi、Chang Yi
    • 雑誌名

      Proceedings of the Twenty-third ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery and Data Mining (KDD 2017)

      巻: - ページ: 1215-1224

    • DOI

      10.1145/3097983.3098103

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] Mining approximate patterns with frequent locally optimal occurrences2016

    • 著者名/発表者名
      Nakamura A, Takigawa I, Tosaka H, Kudo M, Mamitsuka H
    • 雑誌名

      Discrete Applied Mathematics

      巻: 200 ページ: 123-152

    • DOI

      10.1016/j.dam.2015.07.002

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26330242, KAKENHI-PUBLICLY-26120503, KAKENHI-PROJECT-24300054, KAKENHI-PROJECT-25280079, KAKENHI-PROJECT-15H02719
  • [雑誌論文] Current Status and Prospects of Computational Resources for Natural Product Dereplication: A Review.2016

    • 著者名/発表者名
      Mohamed, A., Nguyen, C. H. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 17 号: 2 ページ: 309-321

    • DOI

      10.1093/bib/bbv042

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Computational Recognition for Long Non-coding RNA (lncRNA): Software and Databases.2016

    • 著者名/発表者名
      Yotsukura, S., duVerle D., Hancock, T., Natsume-Kitatani, Y. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: unassigned 号: 1 ページ: 9-27

    • DOI

      10.1093/bib/bbv114

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-14J00381, KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [雑誌論文] MeSHSim: An R/Bioconductor Package for Measuring Semantic Similarity over MeSH Headings and MEDLINE Documents2015

    • 著者名/発表者名
      Zhou, J., Shui, Y., Peng, S., Li, X., Mamitsuka, H. and Zhu, S.
    • 雑誌名

      Journal of Bioinformatics and Computational Biology

      巻: 13 号: 06 ページ: 1542002-1542002

    • DOI

      10.1142/s0219720015420020

    • NAID

      120006654075

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Non-negative Matrix Factorization with Auxiliary Information on Overlapping Groups2015

    • 著者名/発表者名
      Motoki Shiga, Hiroshi Mamitsuka
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Knowledge and Data Engineering

      巻: 27 号: 6 ページ: 1615-1628

    • DOI

      10.1109/tkde.2014.2373361

    • NAID

      120005663300

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25870322, KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] BMExpert: Mining MEDLINE for Finding Experts in Biomedical Domains Based on Language Model.2015

    • 著者名/発表者名
      Wang, B., Chen, X., Mamitsuka, H. and Zhu, S.
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 12 号: 6 ページ: 1286-1294

    • DOI

      10.1109/tcbb.2015.2430338

    • NAID

      120006654074

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] MeSHLabeler: Improving the Accuracy of Large-scale MeSH indexing by Integrating Diverse Evidence.2015

    • 著者名/発表者名
      Liu, K., Peng, S., Wu, J., Zhai, C., Mamitsuka H. and Zhu S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 31 号: 12 ページ: i339-i347

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btv237

    • NAID

      120005980853

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Evaluation of Serum-based Cancer Biomarkers: A Brief Review from a Clinical and Computational Viewpoint2015

    • 著者名/発表者名
      Yotsukura, S. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Critical Reviews in Oncology/Hematology

      巻: 93 号: 2 ページ: 103-115

    • DOI

      10.1016/j.critrevonc.2014.10.002

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-14J00381, KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] NetPathMiner:R/Bioconductor Package for Network Path Mining through Gene Expression2014

    • 著者名/発表者名
      Mohamed, A., Hancock, T., Nguyen, C. H. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 30 号: 21 ページ: 3139-3141

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btu501

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Selecting Graph Cut Solutions via Global Graph Similarity2014

    • 著者名/発表者名
      Nguyen, C. H., Wicker, N. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems

      巻: 25 号: 7 ページ: 1407-1412

    • DOI

      10.1109/tnnls.2013.2292975

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Detecting Differentially Coexpressed Genes from Labeled Expression Data:A Brief Review2014

    • 著者名/発表者名
      Kayano, M., Shiga, M. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 11 号: 1 ページ: 154-167

    • DOI

      10.1109/tcbb.2013.2297921

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054, KAKENHI-PROJECT-24700290
  • [雑誌論文] SIBIC : A Web Server for Generating Gene Set Seiworks Based on Blelusters Obtained by Maximal Frequent Itemsel Mining2013

    • 著者名/発表者名
      Keiichio Takahashi. Ichigaku Takigawa and Hiroshi Mamitsuka
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 8(12) 号: 12 ページ: e82890-e82890

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0082890

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12J04552, KAKENHI-PROJECT-23710233, KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] A New Dissimilarity Measure for Comparing Labeled Graphs2013

    • 著者名/発表者名
      Wicker, N., Nguyen, C. H. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Linear Algebra and its Applications

      巻: 438 号: 5 ページ: 2331-2338

    • DOI

      10.1016/j.laa.2012.10.021

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Efficient Semi-supervised MEDLINE Document Clustering with MeSH Semantic and Global Content Constraints2013

    • 著者名/発表者名
      Gu, J., Feng, W., Zeng, J., Mamitsuka, H. and Zhu, S.
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Cybernetics

      巻: 43 号: 4 ページ: 1265-1276

    • DOI

      10.1109/tsmcb.2012.2227998

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Multiple Graph Label Propagation by Sparse Integration2013

    • 著者名/発表者名
      Karasuyama, M. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems

      巻: 24 号: 12 ページ: 1999-2012

    • DOI

      10.1109/tnnls.2013.2271327

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054, KAKENHI-PROJECT-24800036
  • [雑誌論文] An In Silico Model for Interpreting Polypharmacological Relationships in Drug-Target Networks2013

    • 著者名/発表者名
      Ichigaku Takigawa, Koji Tsuda, Hiroshi Mamitsuka
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology (In Silico Models for Drug Discovery)

      巻: 993 ページ: 67-80

    • DOI

      10.1007/978-1-62703-342-8_5

    • ISBN
      9781627033411, 9781627033428
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23710233, KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Fast Algorithms for Finding a Minimum Repetition Representation of Strings and Trees2013

    • 著者名/発表者名
      Nakamura, A., Saito, T., Takigawa, I., Kudo, M. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      Discrete Applied Mathematics

      巻: 161 号: 10-11 ページ: 1556-1575

    • DOI

      10.1016/j.dam.2012.12.013

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Graph mining: procedure, application to drug discovery and recent advances2013

    • 著者名/発表者名
      Ichigaku Takigawa, Hiroshi Mamitsuka
    • 雑誌名

      Drug Discovery Today

      巻: 18: 1-2 号: 1-2 ページ: 50-57

    • DOI

      10.1016/j.drudis.2012.07.016

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23710233, KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Identifying Pathways of Coordinated Gene Expression2013

    • 著者名/発表者名
      Timothy Hancock, Ichigaku Takigawa, Hiroshi Mamitsuka
    • 雑誌名

      Methods in Molecular Biology (Data Mining for Systems Biology)

      巻: 939 ページ: 69-85

    • DOI

      10.1007/978-1-62703-107-3_7

    • ISBN
      9781627031066, 9781627031073
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23710233, KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Similarity-based machine learning methods for predicting drug.target interactions : a brief review2013

    • 著者名/発表者名
      Ding H, Takigawa I, Mamitsuka H, Zhu S
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: (印刷中・先行オンライン出版済) 号: 5 ページ: 737-747

    • DOI

      10.1093/bib/bbt056

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23710233, KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] Latent Feature Kernels for Link Prediction on Sparse Graphs2012

    • 著者名/発表者名
      Nguhen, C. H. and Mamitsuka, H.
    • 雑誌名

      LEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems

      巻: 23 号: 11 ページ: 1793-1804

    • DOI

      10.1109/tnnls.2012.2215337

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [雑誌論文] A Hierarchical Mixture of Markov Models for Finding Biologically Active Paths using Gene Expression and Protein Classes2004

    • 著者名/発表者名
      Mamitsuka, H., Okuno, Y.
    • 雑誌名

      Proceedings of the IEEE Computational Systems Bioinforimatics Conference (CSB 2004)

      ページ: 341-352

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014211
  • [学会発表] ラジカル共重合におけるモノマー反応性比の機械学習を用いた理解と予測2022

    • 著者名/発表者名
      登阪雅聡, 朱南屹, 山子茂, 馬見塚拓
    • 学会等名
      第71回高分子年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H05027
  • [学会発表] Scalable Probabilistic Matrix Factorization with Graph-Based Priors.2020

    • 著者名/発表者名
      Strahl, J., Peltonen, J., Mamitsuka, H. and Kaski, S.
    • 学会等名
      34th AAAI Conference on Artificial Intelligence (AAAI 2020)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] Multiplicative Sparse Feature Decomposition for Efficient Multi-View Multi-Task Learning.2019

    • 著者名/発表者名
      Sun Lu、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 学会等名
      28th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI 2019)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] Fast and Robust Multi-View Multi-Task Learning via Group Sparsity2019

    • 著者名/発表者名
      Sun Lu、Nguyen Canh Hao、Mamitsuka Hiroshi
    • 学会等名
      28th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI 2019)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms.2018

    • 著者名/発表者名
      Wimalawarme, K. and Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      Thirty-Second Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2018)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] AiProAnnotator: Low-rank Approximation with network side information for high-performance, large-scale human Protein abnormality Annotator2018

    • 著者名/発表者名
      Gao Junning、Yao Shuwei、Mamitsuka Hiroshi、Zhu Shanfeng
    • 学会等名
      2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM 2018)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] Factor Analysis on a Graph.2018

    • 著者名/発表者名
      Karasuyama, M. and Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      Proceedings of the 21st International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS 2018)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] Factor Analysis on a Graph2018

    • 著者名/発表者名
      Karasuyama, M. and Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      21st International Conference on Artificial Intelligence and Statistics (AISTATS 2018)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] Efficient Convex Completion of Coupled Tensors using Coupled Nuclear Norms2018

    • 著者名/発表者名
      Wimalawarne Kishan, Mamitsuka Hiroshi
    • 学会等名
      Thirty-Second Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NeurIPS 2018)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H02868
  • [学会発表] MeSHLabeler: Improving the Accuracy of Large-scale MeSH indexing by Integrating Diverse Evidence2015

    • 著者名/発表者名
      Liu, K., Peng, S., Wu, J., Zhai, C., Mamitsuka H. and Zhu S.
    • 学会等名
      23rd International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB/ECCB 2015)
    • 発表場所
      Dublin, Ireland
    • 年月日
      2015-07-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Collaborative matrix factorization for predicting drug-target interactions2015

    • 著者名/発表者名
      Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      CIM Workshop on Machine Learning
    • 発表場所
      Uppsala, Sweden
    • 年月日
      2015-10-08
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Instance-wise Weighted Nonnegative Matrix Factorization for Aggregating Partitions with Locally Reliable Clusters.2015

    • 著者名/発表者名
      Zheng, X., Zhu, S., Gao, J. and Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      24th International Joint Conference on Artificial Intelligence (IJCAI 2015)
    • 発表場所
      Buenos Aires, Argentina
    • 年月日
      2015-07-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Collaborative Matrix Factorization for Predicting Drug-Target Interactions2014

    • 著者名/発表者名
      Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      Trends in Machine Learning
    • 発表場所
      Kyoto University, Japan
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Mining Metabolic Pathways through Gene Expression2013

    • 著者名/発表者名
      Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      Kyoto University--Koc University Symposium ``New Frontiers in Health Sciences & Technologies''
    • 発表場所
      Kyoto University, Japan
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Manifold-based Similarity Adaptation for Label Propagation2013

    • 著者名/発表者名
      Karasuyama, M. and Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      Twenty-Seventh Annual Conference on Neural Information Processing Systems (NIPS 2013)
    • 発表場所
      Lake Tahoe, NV, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Variational Bayes Co-clustering with Auxiliary Information2013

    • 著者名/発表者名
      Shiga, M. and Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      4th MultiClust Workshop on Multiple Clusterings, Multi-view Data, and Multi-source Knowledge-driven Clustering (MultiClust 2013)
    • 発表場所
      Chicago, IL, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Machine Learning for Bioinformatics2013

    • 著者名/発表者名
      Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      FASEB Science and Research Conference, The Biology of Calpains in Health and Disease
    • 発表場所
      Saxtons River, VT, USA
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Collaborative Matrix Factorization with Multiple Similarities for Predicting Drug-Target Interactions2013

    • 著者名/発表者名
      Zheng, X., Ding, H., Mamitsuka, H. and Zhu, S.
    • 学会等名
      Nineteenth ACM SIGKDD International Conference On Knowledge Discovery and Data Mining (KDD 2013)
    • 発表場所
      Chicago, IL, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Mining Significant Substructure Pairs from Drug-Target Network2013

    • 著者名/発表者名
      馬見塚 拓
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会第17回創薬インフォマティクス研究会
    • 発表場所
      産業技術総合研究所臨海副都心センター別館
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Efficiently Detecting Switching Mechanisms in Gene Expression2013

    • 著者名/発表者名
      Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      23rd International Conference on Genome Informatics (GIW 2013)
    • 発表場所
      Matrix, Biopolis, Singpore
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • [学会発表] Learning kernel-based feature representation for gene essentiality prediction

    • 著者名/発表者名
      Karasuyama, M. and Mamitsuka, H.
    • 学会等名
      DREAM Challenges and Cytoscape Workshops
    • 発表場所
      San Diego, CA, USA
    • 年月日
      2014-11-09 – 2014-11-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300054
  • 1.  瀧川 一学 (10374597)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 7件
  • 2.  山口 敦子 (10346108)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  ハンコック ティモシー (80600709)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 4.  志賀 元紀 (20437263)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 5.  津田 宏治 (90357517)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  茅野 光範 (20590095)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  グェン カン ハオ (90626889)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 10件
  • 8.  中村 篤祥 (50344487)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  工藤 峰一 (60205101)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  喜田 拓也 (70343316)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  大久保 好章 (40271639)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  山子 茂 (30222368)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 13.  遊佐 真一 (00301432)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  竹中 幹人 (30222102)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  PETSCHNER PETER
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  烏山 昌幸
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 17.  吉川 千晶
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 18.  遠藤 寿
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 19.  NGUYEN DaiーHai
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 20.  山田 誠
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

URL: 

この研究者とORCID iDの連携を行いますか?
※ この処理は、研究者本人だけが実行できます。

Are you sure that you want to link your ORCID iD to your KAKEN Researcher profile?
* This action can be performed only by the researcher himself/herself who is listed on the KAKEN Researcher’s page. Are you sure that this KAKEN Researcher’s page is your page?

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi