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庄司 光男  Shoji Mitsuo

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 00593550
その他のID
所属 (現在) 2022年度: 筑波大学, 計算科学研究センター, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2016年度 – 2021年度: 筑波大学, 計算科学研究センター, 助教
2015年度: 筑波大学, 数理物質科学研究科, 助教
2014年度 – 2015年度: 筑波大学, 数理物理科学研究科(系), 助教
2012年度 – 2015年度: 筑波大学, 数理物質系, 助教
2013年度: 筑波大学, 数理物科学研究科(系), 助教
2012年度: 筑波大学, 数理物質科学研究科(系), 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
物理化学 / 複合領域
研究代表者以外
複合領域 / 生物系 / 構造生物化学 / 遷移状態制御 / 天文学
キーワード
研究代表者
反応機構 / QM/MM / 自由エネルギー / 光化学系II / 水分解反応 / 光合成 / トレオニン合成酵素 / 反応制御 / スーパーコンピュータ / 人工光合成 … もっと見る / 反応経路 / O-O結合形成 / 水分解 / 酸素発生 / コンフォメーション / 酵素 / 亜硝酸還元酵素 / MD / UV / 生成物支援機構 / molecular dynamics / スパコン / 反応制御機構 / 副反応経路 / molecular dynamics (MD) / 量子古典混合計算 / 酵素反応 / 非ラジカル機構 / QMMM / 活性化 / 再活性化 / クラスター再構築 / 構造変化 / 反応機構解明 / 再構築 / プロトン化 / Mnクラスター / 反応経路探索 / 酸素分子放出 / 水分子挿入 / 協奏反応機構 / 量子化学 / 酸素発生機構 / 酸素酸素結合 / 協奏機構 / 酸素発生中心 / ラジカル / プロトン移動 / 一電子移動 / Ru錯体 … もっと見る
研究代表者以外
X線自由電子レーザー / 反応機構 / 反応中間体 / 補酵素 / 量子化学計算 / 光合成 / 水分解 / 膜タンパク質 / 結晶構造解析 / 理論計算 / 赤外分光法 / 酸素発生 / QM/MM / プロトン共役電子移動 / 量子力学計算 / フーリエ変換赤外分光法 / プロトン移動 / 水素結合ネットワーク / 光化学系II / フーリエ変換赤外分析法 / 量子計算 / 密度汎関数法 / 電子スピン共鳴 / 酵素反応機構 / ピリドキサールリン酸 / 反応速度論 / 遷移相速度論 / 反応特異性 / 基質支援触媒 / 生成物支援触媒 / ピリドキサール5'-リン酸 / プロトン化状態 / 副反応 / X線結晶解析 / ゆらぎ / 酵素 / 遷移状態 / 中性子構造解析 / 銅アミン酸化酵素 / 中性子結晶構造 / 銅 / アストロケミストリー / 惑星系形成 / 星間化学 / アストロバイオロジー / 第一原理計算 / 理論天文学 / 惑星起源・進化 / 計算物理 / 化学物理 / 動的構造解析 / 蛋白質結晶構造解析 / X線溶液散乱 / シリアルフェムト秒結晶構造解析 / タンパク質ダイナミクス / 溶液散乱 / 構造モデリング / 量子古典混合計算 / 化学反応解析 / シミュレーション / ハイブリッドアプローチ / タンパク質 隠す
  • 研究課題

    (11件)
  • 研究成果

    (302件)
  • 共同研究者

    (35人)
  •  自然・半導体・分子触媒で利用可能な多様な水分解反応機構の解明研究代表者

    • 研究代表者
      庄司 光男
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      筑波大学
  •  分子シミュレーションによるタンパク質化学反応ダイナミクスの解明

    • 研究代表者
      宮下 治
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  時分割実験のための多様な反応誘起システムの開発

    • 研究代表者
      南後 恵理子
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東北大学
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  光化学系II酸素発生中心における再活性化機構についての理論的解明研究代表者

    • 研究代表者
      庄司 光男
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 研究機関
      筑波大学
  •  光化学系II酸素発生中心における水分解反応の全反応経路解明研究代表者

    • 研究代表者
      庄司 光男
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2019
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      物理化学
    • 研究機関
      筑波大学
  •  酵素活性中心の構造変化とゆらぎにリンクする触媒反応遷移状態の制御機構

    • 研究代表者
      岡島 俊英
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2019
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      遷移状態制御
    • 研究機関
      大阪大学
  •  計算科学によるアストロバイオロジーへの理論的挑戦

    • 研究代表者
      相川 祐理
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      天文学
    • 研究機関
      東京大学
      筑波大学
  •  トレオニン合成酵素の全反応機構の理論的解明研究代表者

    • 研究代表者
      庄司 光男
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2016
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      物理化学
    • 研究機関
      筑波大学
  •  生体酵素における反応機構と反応制御機構解明のための理論的研究研究代表者

    • 研究代表者
      庄司 光男
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2013
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      物理化学
    • 研究機関
      筑波大学
  •  光合成系Ⅱにおける水分解反応の学理解明

    • 研究代表者
      沈 建仁
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2017
    • 研究種目
      特別推進研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      岡山大学
  •  ピリドキサール酵素の反応特異性制御機構の解明

    • 研究代表者
      林 秀行
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      構造生物化学
    • 研究機関
      大阪医科大学

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すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] フリーソフトで始める分子モデリング2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 総ページ数
      70
    • 出版者
      Amazon Kindle direct publishing (電子書籍)
    • ISBN
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [図書] フリーソフトで始める分子モデリング2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 総ページ数
      65
    • 出版者
      Amazon Kindle direct publishing (電子書籍)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [図書] フリーソフトで始める分子モデリング2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 総ページ数
      65
    • 出版者
      Amazon Kindle direct publishing (電子書籍)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [図書] Gaussian16で始める量子化学超入門2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 総ページ数
      70
    • 出版者
      Amazon Kindle direct publishing (電子書籍)
    • ISBN
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [図書] Gaussian16で始める量子化学超入門2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 総ページ数
      70
    • 出版者
      Amazon Kindle direct publishing (電子書籍)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05781
  • [図書] Gaussian16で始める量子化学超入門2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 総ページ数
      70
    • 出版者
      Amazon Kindle direct publishing (電子書籍)
    • ISBN
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [図書] フリーソフトで始める分子モデリング2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 総ページ数
      70
    • 出版者
      Amazon Kindle direct publishing (電子書籍)
    • ISBN
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [図書] Adv. Quantum. Chem (Large-Scale QM/MM Calculations of Hydrogen Bonding Networks for Proton Transfer and Water Inlet Channels for Water Oxidation―Theoretical System Models of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II)2014

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen
    • 出版者
      Elsevier
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [図書] 金属錯体の量子・計算化学”、錯体化学会選書102014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男(山口兆、榊茂好、増田秀樹編著)
    • 出版者
      三共出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [図書] 第5章1節, 錯体化学会選書10金属錯体の量子・計算化学2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 山口兆
    • 出版者
      三共出版
    • 説明
      (山口兆、榊茂好、増田秀樹編著)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [図書] “Large-Scale QM/MM Calculations of Hydrogen Bonding Networks for Proton Transfer and Water Inlet Channels for Water Oxidation-Theoretical System Models of the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II”, Adv. Quantum. Chem, 7, 325-4132014

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, T. Nakajima, K. Yamaguchi
    • 出版者
      Elsevier Inc
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Weak O2 binding and strong H2O2 binding at the non-heme diiron center of trypanosome alternative oxidase2021

    • 著者名/発表者名
      Yamasaki S, Shoji M, Kayanuma M, Sladek V, Inaoka DK, Matsuo Y, Shiba T, Young L, Moore AL, Kita K, Shigeta Y.
    • 雑誌名

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics

      巻: 1862(4) ページ: 148356-148356

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2020.148356

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07523, KAKENHI-PUBLICLY-20H05088, KAKENHI-PLANNED-20H05453, KAKENHI-PUBLICLY-20H05497
  • [雑誌論文] Unique protonation states of aspartate and topaquinone in the active site of copper amine oxidase2020

    • 著者名/発表者名
      Shoji Mitsuo、Murakawa Takeshi、Boero Mauro、Shigeta Yasuteru、Hayashi Hideyuki、Okajima Toshihide
    • 雑誌名

      RSC Advances

      巻: 10 ページ: 38631-38639

    • DOI

      10.1039/d0ra06365g

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K05694, KAKENHI-PROJECT-20K06530, KAKENHI-PUBLICLY-20H05088, KAKENHI-PUBLICLY-20H05448, KAKENHI-PLANNED-20H05453, KAKENHI-PUBLICLY-20H05497, KAKENHI-PROJECT-17K07317
  • [雑誌論文] Neutron crystallography of copper amine oxidase reveals keto/enolate interconversion of the quinone cofactor and unusual proton sharing2020

    • 著者名/発表者名
      Takeshi Murakawa, Kazuo Kurihara, Mitsuo Shoji, Chie Shibazaki, Tomoko Sunami, Taro Tamada, Naomine Yano, Taro Yamada, Katsuhiro Kusaka, Mamoru Suzuki, Yasuteru Shigeta, Ryota Kuroki, Hideyuki Hayashi, Takato Yano, Katsuyuki Tanizawa, Motoyasu Adachi, Toshihide Okajima
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 印刷中 ページ: 10818-10824

    • DOI

      10.1073/pnas.1922538117

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K05694, KAKENHI-PROJECT-16KT0055, KAKENHI-PROJECT-20K06238, KAKENHI-PUBLICLY-19H05047, KAKENHI-PUBLICLY-20H05497
  • [雑誌論文] Role of the Propionic Acid Side-Chain of C-Phycocyanin Chromophores in the Excited States for the Photosynthesis Process2020

    • 著者名/発表者名
      K.Mishima, M.Shoji, Y.Umena, M.Boero, Y.Shigeta
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      巻: 93(12) 号: 12 ページ: 1509-1519

    • DOI

      10.1246/bcsj.20200187

    • NAID

      130007955895

    • ISSN
      0009-2673, 1348-0634
    • 言語
      英語
    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088, KAKENHI-PLANNED-20H05453, KAKENHI-PROJECT-18K06158
  • [雑誌論文] Domain-based local pair natural orbital CCSD (T) calculations of strongly correlated electron systems: Examination of dynamic equilibrium models based on multiple intermediates in S1 state of photosystem II2020

    • 著者名/発表者名
      K Miyagawa, H Isobe, T Kawakami, M Shoji, S Yamanaka, M Okumura, T Nakajima, K Yamaguchi
    • 雑誌名

      Molecular Physics

      巻: - ページ: 1666171-1666171

    • DOI

      10.1080/00268976.2019.1666171

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167, KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [雑誌論文] Reaction Mechanism of Monomeric Sarcosine Oxidase with N-Cyclopropylglycine2020

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, Y.Abe, M.Boero, Y.Shigeta, Y.Nishiya
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: - ページ: 16552-16561

    • DOI

      10.1039/d0cp01679a

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PLANNED-19H05781, KAKENHI-PROJECT-17H04866, KAKENHI-PUBLICLY-19H05047, KAKENHI-PUBLICLY-20H05088, KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [雑誌論文] Possibility of the right-opened Mn-oxo intermediate (R-oxo(4444)) among all nine intermediates in the S3 state of the oxygen-evolving complex of photosystem II revealed by large-scale QM/MM calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Miyagawa Koichi、Yamaguchi Kizashi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 518 ページ: 81-90

    • DOI

      10.1016/j.chemphys.2018.11.003

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06434, KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167
  • [雑誌論文] Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of fourteen different S2 intermediates for water oxidation in the Kok cycle of OEC of PSII. Re-visit to one LS-two HS model for the S2 state2019

    • 著者名/発表者名
      Miyagawa K.、Isobe H.、Kawakami T.、Shoji M.、Yamanaka S.、Okumura M.、Nakajima T.、Yamaguchi K.
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 734 ページ: 136731-136731

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2019.136731

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06434, KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167
  • [雑誌論文] Theoretical study of the photodissociation reaction of methanol2019

    • 著者名/発表者名
      Kayanuma Megumi、Shoji Mitsuo、Furuya Kenji、Aikawa Yuri、Umemura Masayuki、Shigeta Yasuteru
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 714 ページ: 137-142

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2018.10.077

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H03638, KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [雑誌論文] Theory of chemical bonds in metalloenzymes XXII: a concerted bond-switching mechanism for the oxygenーoxygen bond formation coupled with one electron transfer for water oxidation in the oxygen-evolving complex of photosystem II2019

    • 著者名/発表者名
      K Yamaguchi, M Shoji, Hiroshi Isobe, K Miyagawa, K Nakatani
    • 雑誌名

      Molecular Physics

      巻: 2018 ページ: 2320-2354

    • DOI

      10.1080/00268976.2018.1552799

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167
  • [雑誌論文] Domain-based local pair natural orbital CCSD(T) calculations of six different S1 structures of oxygen evolving complex of photosystem II. Proposal of multi-intermediate models for the S1 state2019

    • 著者名/発表者名
      Miyagawa K.、Kawakami T.、Isobe H.、Shoji M.、Yamanaka S.、Nakatani K.、Okumura M.、Nakajima T.、Yamaguchi K.
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 732 ページ: 136660-136660

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2019.136660

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06434, KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167
  • [雑誌論文] Concerted bond switching mechanism coupled with one-electron transfer for the oxygen-oxygen bond formation in the oxygen-evolving complex of photosystem II2019

    • 著者名/発表者名
      Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Yamaguchi Kizashi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 714 ページ: 219-226

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2018.10.041

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06434, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167, KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [雑誌論文] Elucidation of the entire Kok cycle for photosynthetic water oxidation by the large-scale quantum mechanics/molecular mechanics calculations: Comparison with the experimental results by the recent serial femtosecond crystallography2019

    • 著者名/発表者名
      Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Shen Jian-Ren、Suga Michihiro、Akita Fusamichi、Miyagawa Koichi、Shigeta Yasuteru、Yamaguchi Kizashi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 730 ページ: 416-425

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2019.06.026

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06434, KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167, KAKENHI-PUBLICLY-19H05047, KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [雑誌論文] Concerted Mechanism of Water Insertion and O2 Release during the S4 to S0 Transition of the Oxygen-Evolving Complex in Photosystem II2018

    • 著者名/発表者名
      Shoji Mitsuo、Isobe Hiroshi、Shigeta Yasuteru、Nakajima Takahito、Yamaguchi Kizashi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 122 ページ: 6491-6502

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.8b03465

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06434, KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167, KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [雑誌論文] 光合成における酸素発生の反応機構2018

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 磯部寛, 重田育照, 中嶋隆人, 山口兆
    • 雑誌名

      生物物理

      巻: 58(3) ページ: 127-133

    • NAID

      130007378606

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [雑誌論文] First-principles study of the formation of glycine-producing radicals from common interstellar species2018

    • 著者名/発表者名
      Sato, A., Kitazawa, Y., Ochi, T., Shoji, M., Komatsu, Y., Kayanuma, M., Aikawa, Y., Umemura, M., Shigeta, Y.
    • 雑誌名

      Molecular Astrophysics

      巻: 10 ページ: 11-19

    • DOI

      10.1016/j.molap.2018.01.002

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782, KAKENHI-PROJECT-15H03638
  • [雑誌論文] 光化学系II酸素発生中心の反応機構2018

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 雑誌名

      アンサンブル

      巻: 40(4) ページ: 238-242

    • NAID

      130007739813

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [雑誌論文] A practical approach for searching stable molecular structures by introducing repulsive interactions among walkers2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, M.Kayanuma, Y.Shigeta
    • 雑誌名

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      巻: 191(10) 号: 10 ページ: 1465-1473

    • DOI

      10.1246/bcsj.20180122

    • NAID

      130007498133

    • ISSN
      0009-2673, 1348-0634
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866, KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [雑誌論文] Nonadiabatic one-electron transfer mechanism for the O-O bond formation in the oxygen-evolving complex of photosystem II2018

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Yasuteru Shigeta, Takahito Nakajima, Kizashi Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 698 ページ: 138-146

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2018.02.056

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154, KAKENHI-PUBLICLY-18H05167
  • [雑誌論文] Reaction mechanism of sarcosine oxidase elucidated using FMO and QM/MM methods2017

    • 著者名/発表者名
      Y. Abe, M. Shoji, Y. Nishiya, H. Aiba, T. Kishimoto, K. Kitaura
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 19 ページ: 9811-9822

    • DOI

      10.1039/c6cp08172j

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the S3 state of the oxygen evolving complex of photosystem II. Comparison between water-inserted and no water-inserted structures.2017

    • 著者名/発表者名
      Shoji M, Isobe H, Nakajima T, Shigeta Y, Suga M, Akita F, Shen JR and *Yamazaki K.
    • 雑誌名

      faraday discussions

      巻: 198 ページ: 83-106

    • DOI

      10.1039/c6fd00230g

    • 説明
      【掲載確定】 印刷中
    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-15H01642, KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-16K21181, KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-16H06162
  • [雑誌論文] A theoretical study of the formation of glycine via hydantoin intermediate in outer space environment2017

    • 著者名/発表者名
      Kayanuma, M., Kidachi, K., Shoji, M., Komatsu, Y., Sato, A., Shigeta, Y., Aikawa, Y., Umemura, M.
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 687 ページ: 178-183

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2017.09.016

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782, KAKENHI-PROJECT-15H03638
  • [雑誌論文] UNO DMRG CASCI calculations of effective exchange integrals for mphenylene-bis-methylene spin clusters2017

    • 著者名/発表者名
      T. Kawakami, S. Sano, T. Saito, S. Sharma, M. Shoji, S. Yamada, Y. Takano, S. Yamanaka, M. Okumura, T. Nakajima, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Molecular Physics

    • DOI

      10.1080/00268976.2017.1301586

    • 説明
      【掲載確定】 印刷中
    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Geometric and electronic structures of the synthetic Mn4CaO4 model compound mimicking the photosynthetic oxygen-evolving complex2016

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Physical Chemistry Chemical Physics

      巻: 18 ページ: 11330-11340

    • DOI

      10.1039/c5cp07226c

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Catalytic Mechanism of Nitrile Hydratase Subsequent to Cyclic Intermediate Formation: A QM/MM Study2016

    • 著者名/発表者名
      M. Kayanuma, M. Shoji, M. Yohda, M. Odaka, Y. Shigeta
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 123(13) ページ: 3259-3266

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b11363

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-15H03832, KAKENHI-PUBLICLY-16H00753, KAKENHI-PROJECT-16H04572, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Molecular Mechanisms of Substrate Specificities of Uridine-Cytidine Kinase2016

    • 著者名/発表者名
      W. Tanaka, M. Shoji, F. Tomoike, Y. Ujiie, K. Hanaoka, R. Harada, M. Kayanuma, K. Kamiya, T. Ishida, R. Masui, S. Kuramitsu, Y. Shigeta
    • 雑誌名

      Biophysics and Physicobiology

      巻: 13 号: 0 ページ: 77-84

    • DOI

      10.2142/biophysico.13.0_77

    • NAID

      130005156955

    • ISSN
      2189-4779
    • 言語
      英語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-15K21459, KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-16H06164
  • [雑誌論文] Chemical equilibrium models for the S3 state in the oxygen-evolving complex of photosystem Ⅱ2016

    • 著者名/発表者名
      H. Isobe, M. Shoji, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Inorg. Chem.

      巻: 55 号: 2 ページ: 502-511

    • DOI

      10.1021/acs.inorgchem.5b02471

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Theory of chemical bonds in metalloenzymes XX : magneto-structural correlations in the CaMn405 cluster in oxygen-evolving complex of photosystem II2016

    • 著者名/発表者名
      K. Yamaguchi, H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, M. Okumura
    • 雑誌名

      Molecular Physics

      巻: 114 号: 3-4 ページ: 519-546

    • DOI

      10.1080/00268976.2015.1114162

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Large-scale QM/MM calculations of the CaMn4O5 cluster in the oxygen-evolving complex of photosystem II: comparisons with EXAFS structures2016

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, T. Nakajima, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett.

      巻: 658 ページ: 354-363

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2016.06.067

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Theoretical studies of the damage-free SI structure of the CaMn405 cluster in oxygen-evolving complex of photosystem II2015

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, M. Suga, F. Akita, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 623 ページ: 1-7

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.01.030

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-26840023
  • [雑誌論文] Strong Coupling between the Hydrogen Bonding Environment and Redox Chemistry during the S2 to S3 Transition in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II2015

    • 著者名/発表者名
      H. Isobe, M. Shoji, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 119 号: 43 ページ: 13922-13933

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b05740

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Full Geometry Optimizations of the CaMn4O4 Model Cluster for the Oxygen Evolving Complex of Photosystem II2015

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, H.Isobe, T.Nakajima, K.Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 640 ページ: 23-30

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.10.006

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Light absorption and excitation energy transfer calculations in primitive photosynthetic bacteria2015

    • 著者名/発表者名
      Yu Komatsu, Megumi Kayanuma, Mitsuo Shoji, Kazuhiro Yabana, Kenji Shiraishi, Masayuki Umemura
    • 雑誌名

      Molecular Physics

      巻: 印刷中

    • DOI

      10.1080/00268976.2014.998305

    • NAID

      120007130098

    • 説明
      【掲載確定】 (accepted) (in press)
    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-14J01303, KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] QM/MM Study of the S2 to S3 Transition Reaction in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II2015

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, H.Isobe, K.Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 636 ページ: 172-179

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.07.039

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] Light absorption efficiencies of photosynthetic pigments: the dependence on spectral types of central stars2015

    • 著者名/発表者名
      Yu Komatsu, Masayuki Umemura, Mitsuo Shoji, Megumi Kayanuma, Kazuhiro Yabana and Kenji Shiraishi
    • 雑誌名

      International Journal of Astrobiology

      巻: 印刷中

    • DOI

      10.1017/s147355041400072x

    • NAID

      120007130099

    • 説明
      【掲載確定】 (accepted) (in press)
    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-14J01303, KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] Involvement of Propionate Side Chains of the Heme in Circular Dichroism of Myoglobin: Experimental and Theoretical Analyses2015

    • 著者名/発表者名
      1M.Nagai, C.Kobayashi, Y. Nagai, K.Imai, N.Mizusawa, H.Sakurai, S.Neya, M.Kayanuma, M.Shoji, S.Nagatomo
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. B

      巻: 119

    • DOI

      10.1021/jp5086203

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] Performance of the divide-and-conquer approach used as an initial guess2015

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, M.Kayanuma, H.Umeda, Y.Shigeta
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 634 ページ: 181-187

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.06.011

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] On the guiding principles for lucid understanding of the damage-free Sl Structure of the CaMn405 cluster in the oxygen evolving complex of photosystem II2015

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, M. Suga, F. Akita, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 627 ページ: 44-52

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.03.033

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-26840023, KAKENHI-PROJECT-15K05390
  • [雑誌論文] Theoretical modeling of biomolecular system I. Large-scale QM/MM calculations of hydrogen-bonding networks of the oxygen evolving complex of photosystem II2015

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, T. Nakajima, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Mol. Phys.

      巻: 113 号: 3-4 ページ: 359-384

    • DOI

      10.1080/00268976.2014.960021

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PLANNED-24107003, KAKENHI-PROJECT-24227002, KAKENHI-PROJECT-15H05588
  • [雑誌論文] A QM/MM Study of the Initial Steps of Catalytic Mechanism of Nitrile Hydratase2015

    • 著者名/発表者名
      M.Kayanuma, K.Hanaoka, M.Shoji, Y. Shigeta
    • 雑誌名

      Chem. Phys. Lett.

      巻: 623

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.01.039

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] A QM/MM study of the 5'-AMP DNA hydrolysis of aprataxin2015

    • 著者名/発表者名
      K.Hanaoka, W.Tanaka, M.Kayanuma, M.Shoji
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 631-632 ページ: 16-20

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.04.053

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] An Efficient Initial Guess Formation of Broken-Symmetry Solutions by using Localized Natural Orbitals2014

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, Y. Yoshioka, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Chemical Physics Letters

      巻: 608 ページ: 50-54

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2014.05.063

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] A QM/MM Study of the l-Threonine Formation Reaction of Threonine Synthase : Implications into the Mechanism of the Reaction Specificity2014

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, K. Hanaoka, Y. Ujiie, W. Tanaka, D. Kondo, H. Umeda, Y. Kamoshida, M. Kayanuma, K. Kamiya, K. Shiraishi, Y. Machida, T. Murakawa, H. Hayashi
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 136(12) ページ: 4525-4533

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] A QM/MM Study of the l-Threonine Formation Reaction of Threonine Synthase: Implications into the Mechanism of the Reaction Specificity.2014

    • 著者名/発表者名
      Shoji, M., Hanaoka, K., Ujiie, Y., Tanaka, W., Kondo, D., Umeda, H., Kamoshida, Y., Kayanuma, M., Kamiya, K., Shiraishi, K., Machida, Y., Murakawa, T., and Hayashi, H.
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 136 ページ: 4525-4533

    • DOI

      10.1021/ja408780c

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140, KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] Generalized approximate spin projection calculations of effective exchange integrals of the CaMn405 cluster in the S1 and S3 states of oxygen evolving complex of photosystem II2014

    • 著者名/発表者名
      H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, H. Mino, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, and K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      巻: 16 ページ: 11911-11923

    • DOI

      10.1039/c4cp00282b

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PLANNED-24107003, KAKENHI-PROJECT-24227002, KAKENHI-PROJECT-24687006
  • [雑誌論文] A QM/MM Study of the l-Threonine Formation Reaction of Threonine Synthase: Implications into the Mechanism of the Reaction Specificity2014

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, K.Hanaoka, Y.Ujiie, W.Tanaka, D.Kondo, H.Umeda, Y.Kamoshida, M.Kayanuma, K.Kamiya, K.Shiraishi,Y.Machida, T.Murakawa, H.Hayashi
    • 雑誌名

      Journal of the American Chemical Society

      巻: 136

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [雑誌論文] フラグメント分子軌道法におけるFock行列計算のGPGPU化2013

    • 著者名/発表者名
      梅田宏明, 塙敏博, 庄司光男, 朴泰祐, 稲富雄一
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌コンピューティングシステム(ACS)

      巻: 6, 4 ページ: 26-37

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] A QM/MM study of nitric oxide reductase-catalyzed N2O formation2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, K. Hanaoka, D. Kondo, A. Sato, H. Umeda, K. Kamiya, K. Shiraishi
    • 雑誌名

      Molecular Physics

      巻: 112, 3-4 ページ: 393-397

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] Theoretical insight in to hydrogen-bonding networks and proton wire for the CaMn405 cluster of photosystem II. Elongation of Mn-Mn distances with hydrogen bonds2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J. -R. Shen and K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Catal. Sci.e & Technol.

      巻: 3 ページ: 1831-1848

    • DOI

      10.1039/c3cy00051f

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-24687006
  • [雑誌論文] Substrate-mediated proton relay mechanism for the religation reaction in topoisomerase II2013

    • 著者名/発表者名
      Kyohei Hanaoka, Mitsuo Shoji, Daiki Kondo, Akimasa Sato, Moon Young Yang, Katsumasa Kamiya, and Kenji Shiraishi
    • 雑誌名

      Journal of Biomolecular Structure & Dynamics

      巻: -

    • DOI

      10.1080/07391102.2013.834848

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22740259, KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] Full Geometry Optimizations of the Mixed-Valence CaMn4O4X(H2O) 4 (X=OH or O) Cluster in OEC of PS II: Degree of Symmetry Breaking of the Labile Mn-X-Mn Bond Revealed by Several Hybrid DFT Calculations2013

    • 著者名/発表者名
      K. Yamaguchi, H. Isobe, S. Yamanaka, T. Saito, K. Kanda, M. Shoji, Y. Umena, K. Kawakami, J.-R.. Shen, N. Kamiya, M. Okumura
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry

      巻: 113 ページ: 525-541

    • DOI

      10.1002/qua.24117

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23550016, KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-24687006, KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] The Nature of chemical bonds of the CaMn4O5cluster in oxygen evolving complex of photosystem II. Jahn-Teller distortion and its suppression by Ca doping in cubane structures2013

    • 著者名/発表者名
      K. Yamaguchi, S. Yamanaka, H. Isobe, T. Saito, K. Kanda, Y. Umena, K. Kawakami, J. -R. Shen, N. Kamiya, M. Okumura, H. Nakamura, M. Shoji and Y. Yoshioka
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry

      巻: 113 ページ: 453-473

    • DOI

      10.1002/qua.24280

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22550010, KAKENHI-PROJECT-23550016, KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-24687006, KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] Theory of chemical bonds in metalloenzymes XVIII. Importance of mixed-valence configurations for Mn505, CaMn405 and Ca2Mn305 clusters revealed by UB3LYP computations. A bio-inspired strategy for artificial photosynthesis2013

    • 著者名/発表者名
      K. Yamaguchi, Y. Kitagawa, H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, M. Okumura
    • 雑誌名

      Polyhedron

      巻: 57 ページ: 138-149

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] フラグメント分子軌道法におけるFock行列計算のGPGPU化2013

    • 著者名/発表者名
      梅田 宏明, 塙 敏博, 庄司 光男, 朴 泰祐,稲富 雄一
    • 雑誌名

      情報処理学会論文誌コンピューティングシステム(ACS)

      巻: 6 ページ: 26-37

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] Calculation of the Electron Transfer Coupling Matrix Element in Diabatic Reactions2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, K. Hanaoka, A. Sato, D. Kondo, M. Yang, K. Kamiya, K. Shiraishi
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry

      巻: 113 ページ: 342-347

    • DOI

      10.1002/qua.24074

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [雑誌論文] Theory of chemical bonds in metalloenzymes XVI. Oxygen activation by high-valent transition metal ions in native and artificial systems2013

    • 著者名/発表者名
      K. Yamaguchi, M. Shoji, H. Isobe, Y. Kitagawa, S. Yamada, T. Kawakami, S. Yamanaka, M. Okumura
    • 雑誌名

      Polyhedron

      巻: 66 ページ: 228-244

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Theoretical illumination of water-inserted structures of the CaMn4O5 cluster in the S2 and S3 states of oxygen-evolving complex of photosystem II: full geometry optimizations by B3LYP hybrid density functional2012

    • 著者名/発表者名
      H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 雑誌名

      Dalton Trans.

      巻: 41 ページ: 13727-13740

    • DOI

      10.1039/c2dt31420g

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23550016, KAKENHI-PROJECT-24000018, KAKENHI-PROJECT-24227002, KAKENHI-PROJECT-24687006, KAKENHI-PLANNED-24107003
  • [雑誌論文] Possible Mechanisms of Water Splitting Reaction Based on Proton and Electron Release Pathways Revealed for CaMn_4O_5 Cluster of PSII Refined to 1.9 Å X-Ray Resolution2012

    • 著者名/発表者名
      Toru Saito
    • 雑誌名

      International Journal of Quantum Chemistry

      巻: 112 ページ: 253-276

    • DOI

      10.1002/qua.23218

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-09J01376, KAKENHI-PROJECT-10J02491, KAKENHI-PUBLICLY-23104506, KAKENHI-PROJECT-23550016, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] 化学反応における対称性の破れの理論(4)—光合成システムIIの結晶構造とCaMn4O5クラスターの理論計算—2012

    • 著者名/発表者名
      山口 兆、庄司光男、斎藤 徹、磯辺 寛、山中秀介
    • 雑誌名

      豊田研究報告

      巻: 65 ページ: 9-19

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Theory of chemical bonds in metalloenzymes-Manganese oxysides clusters in the oxygen evolving center-2012

    • 著者名/発表者名
      K. Yamaguchi, M. Shoji, T. Saito, H. Isobe, S. Yamada, S. Nishihara, T. Kawakami, Y. Kitagawa, S. Yamanaka, M. Okumura
    • 雑誌名

      AIP Conf. Proc.

      巻: 1504 ページ: 63-79

    • DOI

      10.1063/1.4771704

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [雑誌論文] Theory of Chemical Bonds in Metalloenzymes XVII. Symmetry Breaking in Manganese Cluster Structures and Chameleonic Mechanisms for the O-O Bond Formation of Water Splitting Reaction2012

    • 著者名/発表者名
      Toru Saito
    • 雑誌名

      Int. J. Quant. Chem.

      巻: 112 ページ: 121-135

    • DOI

      10.1002/qua.23255

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-09J01376, KAKENHI-PROJECT-23550016, KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 自然・半導体・分子触媒で利用可能な多様な水分解反応機構の解明2021

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      I4LEC第三回公開シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] QM/MMで見えてきた酵素反応の特徴2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      高速分子動画領域会議
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] 構造探索手法(GLAS)による酵素反応機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      SRPS2020
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] 今日から使えるガウシャン(Gaussian)2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      CSJ化学フェスタ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] 銅含有アミン酸化酵素のプロトン化状態についてのQM/MM解析2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 村川武志, 重田育照, 林秀行, 岡島俊英,
    • 学会等名
      量子生命科学会第2回大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] QM/MM 法による銅含有アミン酸化酵素のプロトン化状態についての理論解析2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] Recent Progress in the Reaction Mechanism of Water-Splitting in Photosystem II2020

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji
    • 学会等名
      70th JSCC
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] QM/MM study for the protonation states of copper amine oxidase2020

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, T.Murakawa, Y.Shigeta, H.Hayashi, T.Okajima
    • 学会等名
      The 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] 構造探索手法(GLAS)による酵素反応機構の解明2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      SRPS2020
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] サルコシンオキシダーゼにおけるシクロプロピルグリシンの反応機構についての理論的解明2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第93回日本生化学学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] Recent Progress in the Reaction Mechanism of Water-Splitting in Photosystem II2020

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji
    • 学会等名
      70th JSCC
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] 銅含有アミン酸化酵素のプロトン化状態についてのQM/MM解析2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 村川武志, 重田育照, 林秀行, 岡島俊英
    • 学会等名
      量子生命科学会第2回大会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H05088
  • [学会発表] Theoretical analyses on the protonation states of copper amine oxidase2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、村川武志、重田育照、林秀行、岡島俊英
    • 学会等名
      高速分子動画領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] サルコシンオキシダーゼにおけるシクロプロピルグリシンの反応機構についての理論的解明2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第93回日本生化学学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] QM/MM 法による銅含有アミン酸化酵素のプロトン化状態についての理論解析2020

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第34回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] QM/MM study for the protonation states of copper amine oxidase2020

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, T.Murakawa, Y.Shigeta, H.Hayashi, T.Okajima
    • 学会等名
      The 58th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-20H05453
  • [学会発表] 酵素の反応機構解明に適した構造探索手法(GLAS)の開発2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      新学術領域研究「高速分子動画」キックオフミーティング・膜タンパ ク質研究会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05781
  • [学会発表] 光化学系II酸素発生中心における水分解反応機構についての理論解析2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第46回生体分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Water-Splitting Reactions in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II Revealed by QM/MM calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      ICOPP2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] Reaction mechanism of water splitting in photosystem II revealed by QM/MM calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      11th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences, CCS International Symposium 2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] Catalytic Reaction Mechanisms Found by using the GLAS Algorithm2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji,
    • 学会等名
      ICPAC 2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] 光合成酸素発生機構の分子メカニズム2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      筑波大プレ戦略研究会「生命から学ぶ」プログラム
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] Role of Ca ion of the oxygen-evolving complex of photosytem II Revealed by QM/MM2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Yasuteru Shigeta, Takahito Nakajima, Yasuteru Shigeta, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      The 99th CSJ Annual Meeting (日本化学会 第99春季年会), Konan University (2019) (oral, 口頭B講演)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Elucidation of the Entire Kok Cycle of the Photosynthetic Water Oxidation Using QM/MM Calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      3rd International Solar Fuels Conference (ISF-3) and International Conference on Artificial Photosynthesis-2019 (ICARP2019)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] Reaction mechanism of water splitting in photosystem II revealed by QM/MM calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      11th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences, CCS International Symposium 2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05781
  • [学会発表] Water-Splitting Reactions in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II Revealed by QM/MM calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      ICOPP2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Glycine Formation Reactions via Non-Radical and Radical Processes in Interstellar Medium2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      LIFE3E’2019: SEARCH FOR LIFE, FROM EARLY EARTH TO EXOPLANETS
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] 光合成水分解反応の反応機構についての理論的探求2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      ミニシンポジウム 『生命科学と物質科学の融合による新規エネルギー・物質変換技術の創造をめざして』
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] 光合成水分解反応の反応機構についての理論的探求2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      ミニシンポジウム 『生命科学と物質科学の融合による新規エネルギー・物質変換技術の創造をめざして』
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Elucidation of the Entire Kok Cycle of the Photosynthetic Water Oxidation Using QM/MM Calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      3rd International Solar Fuels Conference (ISF-3) and International Conference on Artificial Photosynthesis-2019 (ICARP2019)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Spin States and O-O bond formation mechanisms in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      AWEST2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Reaction mechanism of water splitting in photosystem II revealed by QM/MM calculations2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      11th symposium on Discovery, Fusion, Creation of New Knowledge by Multidisciplinary Computational Sciences, CCS International Symposium 2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] 光合成酸素発生機構の分子メカニズム2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      筑波大プレ戦略研究会「生命から学ぶ」プログラム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Spin States and O-O bond formation mechanisms in the Oxygen-Evolving Complex of Photosystem II2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      AWEST2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] Catalytic Reaction Mechanisms Found by using the GLAS Algorithm2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      ICPAC 2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05781
  • [学会発表] GLAS アルゴリズムによる酵素反応機構の新規解明2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 三嶋 謙二, 堀優太, 重田育照
    • 学会等名
      第33回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-19H05781
  • [学会発表] 光化学系II酸素発生中心における水分解反応機構についての理論解析2019

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第46回生体分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] Catalytic Reaction Mechanisms Found by using the GLAS Algorithm2019

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji,
    • 学会等名
      ICPAC 2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] 分子構造探索および反応経路探索のための新手法(GLAS 法)の提唱2018

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、常盤恭樹、山崎笙太朗、栢沼愛、重田育照
    • 学会等名
      第21回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] A new approach for searching stable molecular structures by introducing repulsive interactions among walkers2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, M.Kayanuma, H.Kitoh-Nishioka, Y.Shigeta
    • 学会等名
      7thJCS, Prague, Czech Republic (Poster).
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Water insertion reactions in the oxygen-evolving complex of photosystem II revealed by QM/MM calculations2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji
    • 学会等名
      ICPAC Langkawi 2018, Langkawi Island, Malaysia
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] A new approach for searching reaction pathways applicable to quantum mechanical calculations2018

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      CCS-EPCC Joint Workshop
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] A new approach for searching reaction pathways applicable to quantum mechanical calculations2018

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      CCS-;EPCC Joint Workshop, Edinburgh Parallel Computing Centre (EPCC), University of Edinburgh (Oral)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] 分子構造探索および反応経路探索のための新手法(GLAS 法)の提唱2018

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、常盤恭樹、山崎笙太朗、栢沼愛、重田育照
    • 学会等名
      第21回理論化学討論会、岡崎カンファレンスセンター、岡崎 (口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] A new algorithm searching stable molecular structures and reaction pathways by introducing repulsive interactions among walkers2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, M.Kayanuma, Y.Shigeta
    • 学会等名
      16TH INTERNATIONAL CONGRESS OF QUANTUM CHEMISTRY
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] 銅含有アミン酸化酵素におけるセミキノン ラジカル生成機構についての理論的解明2018

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 村川武志, 重田育照, 岡島俊英
    • 学会等名
      分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16KT0055
  • [学会発表] A new algorithm searching stable molecular structures and reaction pathways by introducing repulsive interactions among walkers2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, M.Kayanuma, Y.Shigeta
    • 学会等名
      ICQC 2018, Menton, France (Poster).
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] 光化学系II酸素発生中心でのS3→S0反応機構2018

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第1回合同班会議, 伊東、静岡(口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] 分子構造および反応機構探索アルゴリズムの新展開2018

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] A new approach for searching stable molecular structures by introducing repulsive interactions among walkers2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, M.Kayanuma, H.Kitoh-Nishioka, Y.Shigeta
    • 学会等名
      7th JCS Symposium
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] QM/MM study on the S state transitions of the oxygen-evolving complex in photosystem II2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi
    • 学会等名
      the 43rd International Conference on Coordination Chemistry (ICCC2018), Sendai, Miyagi (oral invited)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] QM/MM study on the O2 formation and O2 release mechanism in the oxygen-evolving complex of photosystem II2018

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi
    • 学会等名
      the 56th Annual Meeting of The BioPhysical Society of Japan, Okayama University, Okayama (oral)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H05154
  • [学会発表] 生命起源解明のためのアミノ酸生成と分解機構についての量子化学研究2017

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      ポスト「京」 萌芽的課題・計算惑星第 1 回公開シンポジウム:惑星の起源・進化と環境変動の解明を目指して
    • 発表場所
      神戸大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] Reaction mechanisms of iron-containing proteins elucidated using QM/MM calculations2017

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, S.Yamasaki, M.Kayanuma, Y.Shigeta
    • 学会等名
      55th BSJ
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] Theoretical study on the photodissociation of methanol in the interstellar medium2017

    • 著者名/発表者名
      Kayanuma, M., Shoji, M., Aikawa, Y., Umemura, M., Shigeta, Y.
    • 学会等名
      28th International Conference on Photochemistry (ICP2017)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] A quantum chemical study of the glycine formation reactions in interstellar medium2017

    • 著者名/発表者名
      Shoji, M.
    • 学会等名
      アストロバイオロジーセンター国際ワークショップ2017
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2017-03-21
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] A quantum chemical study of the glycine formation reactions in interstellar medium2017

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji,
    • 学会等名
      ABC workshop
    • 発表場所
      Hiroshima
    • 年月日
      2017-03-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16KT0055
  • [学会発表] 星間空間におけるアミノ酸生成と光不斉化についての量子化学的探究2017

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      天体形成論 ~過去・現在・未来~
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] A quantum chemical study of the glycine formation reactions in interstellar medium2017

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji
    • 学会等名
      ABC workshop
    • 発表場所
      Hiroshima University(Higashi Hiroshima, Hiroshima)
    • 年月日
      2017-03-21
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Large-scale QM/MM study on the S1 state structures of the oxygen-evolving complex in photosystem II2017

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, J.-R.Shen, K.Yamaguchi
    • 学会等名
      JSCC67
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] QM/MM study on a S4 -> S0 reaction of the Oxygen Evolving Complex in Photosystem II2017

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, H.Isobe, Y.Shigeta, T.Nakajima, K.Yamaguchi
    • 学会等名
      CPMD2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17H04866
  • [学会発表] 銅含有アミン酸化酵素における触媒反応中のプロトン化状態についての理論的解明2017

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 村川武志, 重田育照, 岡島俊英
    • 学会等名
      第17回日本蛋白質科学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16KT0055
  • [学会発表] 星間ダスト上でのアミノ酸生成反応機構についての理論的研究2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      宇宙生命計算科学連携拠点第2回ワークショップ
    • 発表場所
      筑波大学計算科学研究センター
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] Reaction mechanisms for the S2 to S3 transition in the oxygen-evolving complex of photosystem II2016

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      AWEST 2016
    • 発表場所
      Awaji Yumebutai , Awaji island, Awaji, Hyogo
    • 年月日
      2016-06-19
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 光合成酸素発生中心のモデル錯体(Mn4Ca04)の理論解析2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      同志社大学京田辺キャンパス
    • 年月日
      2016-03-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] NTChemによる光合成酸素発生中心の電子状態解析2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第五回NTChemワークショップ
    • 発表場所
      秋葉原UDX6階カンファレンス
    • 年月日
      2016-03-09
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 分割統治法を用いた初期電子密度行列の効率的作成2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      蛋白質研セミナー(ショートトーク+ポスター)
    • 発表場所
      東大先端研
    • 年月日
      2016-03-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] Possibilities of Glycine formation in interstellar medium2016

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      Symposium on Hierarchy and Holism in Natural Sciences
    • 発表場所
      国立天文台、東京都三鷹市
    • 年月日
      2016-02-05
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Electronic structures of the synthetic model of the photosynthetic oxygen-evolving complex2016

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi, Yasuteru Shigeta, Yu Takano
    • 学会等名
      VUVX satellite workshop
    • 発表場所
      University of Zurich, Zurich, Switzerland
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Reaction mechanisms for the S2 to S3 transition in the oxygen-evolving complex of photosystem Ⅱ2016

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, K. Yamaguchi
    • 学会等名
      AWEST 2016
    • 発表場所
      Awaji island, Hyogo
    • 年月日
      2016-06-19
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] Reaction mechanisms of the S2 to S3 transition in the oxygen-evolving complex of photosytem II2016

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      the 17th International Congress on Photosynthesis Research
    • 発表場所
      MECC Maastricht, Maastricht, Netherlands
    • 年月日
      2016-08-07
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] The formation of interstellar glycine by radical-coupling reactions2016

    • 著者名/発表者名
      Akimasa Sato, Mitsuo Shoji, Yuya Kitazawa, Toshiro Ochi, Masayuki Umemura, Yasuteru Shigeta
    • 学会等名
      AWEST 2016
    • 発表場所
      淡路夢舞台国際会議場
    • 年月日
      2016-06-19
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K13782
  • [学会発表] Large-Scale QM/MM study on the oxygen-evolving complex of photosytem II2016

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      79th Harden Conference: Oxygen Evolution and Reduction - Common Principles
    • 発表場所
      Grauer Bar Hotel, Innsbruck, Austria
    • 年月日
      2016-04-16
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 光化学系II酸素発生中心(PSII-OEC)におけるS2-S3状態変化についての理論的研究2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、磯部寛、山口兆
    • 学会等名
      第89回日本生化学学会大会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県仙台市)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] NTChemによる光合成酸素発生中心の電子状態解析2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第五回NTChemワークショップ
    • 発表場所
      秋葉原UDX6階カンファレンス、東京都千代田区
    • 年月日
      2016-03-09
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 光合成酸素発生中心の電子・スピン状態の理論解析2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第55回電子スピンサイエンス学会年会(SEST2016)
    • 発表場所
      大阪市立大学
    • 年月日
      2016-11-11
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] レオニン合成酵素における生成物支援機構の理論的解明2016

    • 著者名/発表者名
      氏家謙、○庄司光男、原田隆平、村川武志、重田育照、林秀行
    • 学会等名
      第54回生物物理会年会
    • 発表場所
      つくば国際会議場(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2016-11-25
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 光合成酸素発生中心の電子・スピン状態の理論解析2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第55回電子スピンサイエンス学会年会(SEST2016)
    • 発表場所
      大阪市立大学(大阪府大阪市)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 分割統治法を用いた初期電子密度行列の効率的作成2016

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      蛋白質研セミナー
    • 発表場所
      東京大学先端科学研究所、東京都目黒区
    • 年月日
      2016-03-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] スレオニン合成酵素における生成物支援機構の理論的解明2016

    • 著者名/発表者名
      氏家謙、庄司光男、原田隆平、村川武志、重田育照、林秀行
    • 学会等名
      第54回生物物理会年会
    • 発表場所
      つくば
    • 年月日
      2016-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16KT0055
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における生成物支援触媒機構についての理論的解明2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男,氏家謙,栢沼愛,重田育照,村川武志,林秀行
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      金沢
    • 年月日
      2015-09-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] Molecular dynamics study on the key catalytic intermediates of threonine synthase2015

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Yuzuru Ujiie, Ryuhei Harada, Megumi Kayanuma, Yasuteru Shigeta, Takeshi Murakawa, Hideyuki Hayashi
    • 学会等名
      The 29th Annual Symposium of the Protein Society
    • 発表場所
      Barcelona, Spain
    • 年月日
      2015-07-22
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] 宇宙空間におけるアミノ酸生成反応についての理論的研究2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第3回キラル研究会
    • 発表場所
      京都大学、京都府京都市
    • 年月日
      2015-11-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Molecular dynamics study on the key catalytic intermediates of threonine synthase2015

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Yuzuru Ujiie, Ryuhei Harada, Megumi Kayanuma, Yasuteru Shigeta, Takeshi Murakawa, Hideyuki Hayashi
    • 学会等名
      29th Annual Symposium of the Protein Society
    • 発表場所
      Fira de Barcelona Balcelona, Balcelona , Spain
    • 年月日
      2015-07-22
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 光化学系II酸素発生中心のS2->S3状態変化についての理論的解明2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、磯部寛、山口兆,重田育照、鷹野優
    • 学会等名
      3D active site 第2回成果報告会
    • 発表場所
      筑波山京成ホテル、茨城県つくば市
    • 年月日
      2015-09-04
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] QM/MM Study on the Reaction Mechanism of Assimilatory Nitrite Reductase (aNiR)2015

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      Metals in Biology in Wako
    • 発表場所
      理化学研究所、埼玉県和光市
    • 年月日
      2015-06-16
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 光化学系ⅠⅠの酸素発生中心の電子状態2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第53回生物物理学会
    • 発表場所
      金沢大学
    • 年月日
      2015-09-14
    • 説明
      【発表確定】
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 分割統治法を用いた初期電子密度行列の構築2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 栢沼愛, 梅田宏明, 重田育照
    • 学会等名
      第18回理論化学討論会2015
    • 発表場所
      大阪大学、大阪府豊中市
    • 年月日
      2015-05-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Theoretical elucidation on the molecular mechanism of product assited catalysis of threonine synthase2015

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Tuzuru Ujiie, Megumi Kayanuma, Yasuteru Shigeta, Takeshi Murakawa, Hideyuki Hayashi
    • 学会等名
      The 53rd Annual Meeting of the BSJ
    • 発表場所
      金沢大学、石川県金沢市
    • 年月日
      2015-09-14
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 光化学系ⅠⅠ酸素発生中心のS2->S3状態変化についての理論的解明2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、磯部寛、山口兆、重田育照、鷹野優
    • 学会等名
      新学術領域研究3D 活性サイト科学, 第2回成果報告会
    • 発表場所
      筑波山京成ホテル
    • 年月日
      2015-09-04
    • 説明
      【発表確定】
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] Molecular dynamics study on the molecular mechanism of product-assisted catalysis in threonine synthase2015

    • 著者名/発表者名
      氏家謙,田中弥,庄司光男,原田隆平,栢沼愛,重田育照,村川武志,林秀行
    • 学会等名
      第43回構造活性相関シンポジウム・第10回薬物の分子設計と開発に関する日中シンポジウム
    • 発表場所
      新潟
    • 年月日
      2015-09-27
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] 光化学系IIの酸素発生中心の電子状態2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      総会シンポジウム、第53回生物物理学会
    • 発表場所
      金沢大学、石川県金沢市
    • 年月日
      2015-09-14
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] QM/MM study on the possible reactions of Photosystem II oxygen evolving complex in the S2 to S3 transition2015

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      3rd AWEST
    • 発表場所
      淡路夢舞台、兵庫県淡路市
    • 年月日
      2015-06-14
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] ヘム蛋白の特異的円二色性(Soret帯CD)についての理論的解明2015

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、栢沼愛、重田教育照、長友重紀、長井雅子
    • 学会等名
      蛋白質科学会
    • 発表場所
      あわぎんホール、徳島県徳島市
    • 年月日
      2015-06-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 宇宙空間でのアミノ酸生成についての理論的研究2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      「実験・観測・計算シナジーによる自然界における生体分子の非対称性起源の解明」
    • 発表場所
      分子科学研究所、愛知県
    • 年月日
      2014-11-29
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] A development of the computational biosciences with supercomputers2014

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      AWEST2014
    • 発表場所
      淡路夢舞台、兵庫県
    • 年月日
      2014-06-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心の電子状態と構造2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      分野融合による新材料開発のための計算科学(oral-Invited)
    • 発表場所
      AICS RIKEN
    • 年月日
      2014-03-08
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] QM/MM study of the L-threonine formation reaction of threonine synthase: mechanism of the product-assisted catalysis2014

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Y.Ujiie, W.Tanaka, M.Kayanuma, R.Harada, H.Umeda, Y.Shigeta, T.Murakawa, H.Hayashi
    • 学会等名
      computational science workshop 2014 (oral)
    • 発表場所
      筑波国際会議場、茨城県
    • 年月日
      2014-08-22
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] トレオニン合成酵素の反応機構についての理論的研究: 反応特異性決定過程の解明2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男,氏家謙,田中弥,栢沼愛,梅田宏明,町田康博,村川武志,林秀行
    • 学会等名
      日本化学会春年会 2014
    • 発表場所
      名古屋大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] ニトリルヒドラターゼの触媒機構に関する理論的研究2014

    • 著者名/発表者名
      栢沼愛, 花岡恭平, 庄司光男
    • 学会等名
      日本化学会春年会2014
    • 発表場所
      名古屋大学(ポスター)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM 法によるトレオニン合成酵素の反応制御機構の理論解明2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男,氏家謙,田中弥,栢沼愛,梅田宏明,村川武,林秀行,重田育照
    • 学会等名
      理論化学討論会
    • 発表場所
      名古屋大学、愛知県
    • 年月日
      2014-05-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心の電子状態と構造2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      異分野融合による新材料開発のための計算科学
    • 発表場所
      RIKEN AICS
    • 年月日
      2014-03-08
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical investigation on the conformation-charge relationship of the photosystem II oxygen evolving complex (PSII-OEC)2014

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 学会等名
      The 52th Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • 発表場所
      Sapporo Convention Center (Sapporo)
    • 年月日
      2014-09-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] QM/MM法による酵素反応機構の理論的解明2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      CUTE Mini-Workshop
    • 発表場所
      三重大学
    • 年月日
      2014-05-21
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] A development of the computational bioscience with supercomputers2014

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji
    • 学会等名
      2nd Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology : Biological and Materials Science Oriented Applications” (2nd AWEST2014) (Invited)
    • 発表場所
      Awaji island
    • 年月日
      2014-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 大規模QM/MM法による光合成酸素発生中心の電子状態2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男,磯辺寛,山中秀介,沈建仁,山口兆
    • 学会等名
      日本化学会春年会 2014
    • 発表場所
      名古屋大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 大規模QM/MMによる光合成酸素発生中心の電子状態2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 磯辺寛, 山中秀介, 沈建仁, 山口兆
    • 学会等名
      日本化学会春年会2014(口頭)
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2014-03-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] トレオニン合成酵素の反応機構についての理論的研究 : 反応特異性決定過程の解明2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 氏家謙, 田中弥, 栢沼愛, 梅田宏明, 町田康博, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      日本化学会春年会2014
    • 発表場所
      名古屋大学(口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素の反応機構についての理論的研究:反応特異性決定過程の解明2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男,氏家謙,田中弥,栢沼愛,梅田宏明,町田康博,村川武志,林秀行
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] QM/MM法による酵素反応機構の理論的解明2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      CUTE Mini-Workshop
    • 発表場所
      三重大学、三重県
    • 年月日
      2014-05-21
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] 大規模QM/MM法による光合成酸素発生中心の電子状態2014

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 磯辺寛, 山中秀介, 沈建仁, 山口兆
    • 学会等名
      日本化学会春年会2014
    • 発表場所
      名古屋大学(口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM study of the L-threonine formation reaction of threonine synthase : mechanism of the product-assisted catalysis2014

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji
    • 学会等名
      CSW2014 (Invited)
    • 発表場所
      Tsukuba International Congress Center (Tsukuba)
    • 年月日
      2014-08-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 太陽系外惑星バイオマーカー検出に向けた光捕集機構のエネルギー転移計算2013

    • 著者名/発表者名
      小松勇, 梅村雅之, 庄司光男, 矢花一浩, 白石賢二, 神谷克政, 栢沼愛, 田口真彦, 佐藤皓允
    • 学会等名
      Japan Geoscience Union Meeting 2013
    • 発表場所
      (口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical investigation on the electronic structures of photosystem II oxygen evolving complex at the S2 state2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 学会等名
      1st Awaji International Workshop on"Electron Spin Science & Technology : Biological and Materials Science Oriented Applications"(1st AWEST2013)
    • 発表場所
      (Oral)
    • 年月日
      2013-06-16
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法を用いたII型DNAトポイソメラーゼによるDNA再結合反応の解明2013

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 庄司光男, 近藤大生, 田口真彦, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      Supercomputer workshop 2013
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] ニトリルヒドラターゼの触媒機構に関する理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      栢沼 愛・花岡 恭平・近藤 大生・田口 真彦・庄司 光男
    • 学会等名
      第93回日本化学会春季年会
    • 発表場所
      立命館大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical illumination of the proton wire for the CaMn4O5 cluster of photosystem II and elongation of Mn-Mn distances with hydrogen bonding. The UB3LYP geometry optimizations2013

    • 著者名/発表者名
      K. Yamaguchi, H. Isobe, M. Shoji, S, Yamanaka, a, N. Kamiya, J. –R. Shen,
    • 学会等名
      The 53rd Sanibel Symposium
    • 発表場所
      Florida, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 光合成光捕集複合体IIにおける光励起状態についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      田口 真彦, 小松 勇, 佐藤 皓允, 蘇 垠成, 庄司 光男, 栢沼 愛, 神谷 克政, 梅村 雅之, 矢花 一浩, 白石 賢二
    • 学会等名
      第93回日本化学会春季年会
    • 発表場所
      立命館大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical Study on Catalytic Mechanism of Nitrile Hydratase2013

    • 著者名/発表者名
      M. Kayanuma, K.Hanaoka, M.Shoji
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都(Poster)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] ビタミンD受容体のコンフォメーションアンサンブルと細胞応答2013

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜(口頭+ポスター)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 系外惑星バイオマーカー検出を目指した光合成機構のエネルギー移動計算2013

    • 著者名/発表者名
      小松勇, 梅村雅之, 庄司光男, 矢花一浩, 白石賢二, 神谷克政, 栢沼愛, 田口真彦, 佐藤皓允, 蘇垠成、
    • 学会等名
      2013年日本天文学会春季年会
    • 発表場所
      埼玉大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 系外惑星のバイオマーカーのための光合成光吸収についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二, 矢花一浩, 梅村雅之
    • 学会等名
      Japan Geoscience Union Meeting 2013
    • 発表場所
      (口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心S1状態の電子状態解析2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第2回公開シンポジウム人工光合成特別セッション(口頭)
    • 発表場所
      立命館大学
    • 年月日
      2013-10-27
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] ウリジンシチジンキナーゼの特異的基質認識機構の理論的解明2013

    • 著者名/発表者名
      田中弥, 氏家謙, 花岡恭平, 友池史明, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 倉光成紀, 白石賢二
    • 学会等名
      蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      鳥取(ポスター)
    • 年月日
      2013-06-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical elucidation on the reaction control mechanism in Threonine Synthase2013

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, K.Hanaoka, Y.Ujiie, W.Tanaka, M.Kayanuma , H.Umeda, Y.Machida, T.Murakawa, H.Hayashi
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都(Poster)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] A QM/MM study of nitric oxide reductase-catalyzed N2O formation,2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, K. Hanaoka, D. Kondo, H. Umeda, K. Kamiya, K. Shiraishi
    • 学会等名
      Sanibel Symposium
    • 発表場所
      Florida(アメリカ合衆国)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 分子動力学法によるトレオニン合成酵素の基質結合自由エネルギー計算2013

    • 著者名/発表者名
      氏家謙, 田中弥, 花岡恭平, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二, 町田康博, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      鳥取(ポスター)
    • 年月日
      2013-06-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法によるHITスーパーファミリー酵素の触媒機構の解明2013

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      鳥取(ポスター)
    • 年月日
      2013-06-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] The energy transfer simulation for detecting photosynthetic biosignatures on extrasolar planets2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Komatsu, M. Umemura, M. Shoji, K. Yabana, K. Shiraishi, K. Kamiya, M. Kayanuma, A. Sato
    • 学会等名
      1st Awaji International Workshop on "Electron Spin Science & Technology : Biological and Materials Science Oriented Applications"(Poster)
    • 発表場所
      Awaji
    • 年月日
      2013-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] A QM/MM study on the S2 spin state of the oxygen-evolving complex2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N. Kamiya,, J. –R. Shen, K. Yamaguchi
    • 学会等名
      The 5th OCARINA Symposium and 2012 OCARINA Annual International Meeting
    • 発表場所
      Osaka City University
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] GlnやAsnを多く含むミスフォールドしたタンパク質の構造安定化機構に関する理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      近藤大生, 花岡恭平, 田口真彦, 神谷克政, 庄司光男, 河合(野間)繁子, 田口英樹, 白石賢二
    • 学会等名
      Supercomputer workshop 2013
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における反応特異性についての理論的解明2013

    • 著者名/発表者名
      庄司 光男, 氏家 謙, 田中 弥, 花岡 恭平, 梅田 梅田, 栢沼 愛, 神谷 克政, 白石 賢二, 町田 康博, 村川 武志, 林 秀行
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 分子動力学法によるトレオニン合成酵素の反応特異性についての理論的解明2013

    • 著者名/発表者名
      氏家謙,田中弥,花岡恭平,庄司光男,栢沼愛,神谷克政,白石賢二,町田康博,村川武志,林秀行
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] ニトリルヒドラターゼの触媒機構に関する理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      栢沼愛, 花岡恭平, 近藤大生, 田口真彦, 庄司光男
    • 学会等名
      第93回日本化学会春季年会
    • 発表場所
      立命館大学(ポスター)
    • 年月日
      2013-03-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 生命指標となりうる光合成の光吸収スペクトル帰属についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 蘇垠成, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 梅村雅之, 矢花一浩, 白石賢二
    • 学会等名
      2013年日本天文学会春季年会
    • 発表場所
      埼玉大学(ポスター)
    • 年月日
      2013-03-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における反応特異性決定過程の理論解明2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男,花岡恭平,氏家謙,田中弥,梅田宏明,栢沼愛,神谷克政,白石賢二,町田康博,村川武志,林秀行
    • 学会等名
      第13回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      鳥取
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] A QM/MM study on the S2 spin state of the oxygen-evolving complex2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 学会等名
      第5回 OCARINA シンポジウム
    • 発表場所
      大阪市立大学
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] A QM/MM study of nitric oxide reductase-catalyzed N2O formation2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, K. Hanaoka, D. Kondo, H. Umeda, K. Kamiya, K. Shiraishi
    • 学会等名
      Sanibel Symposium
    • 発表場所
      Florida(poster)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 生命指標となりうる光合成の光吸収スペクトル帰属についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      田口真彦、小松勇、佐藤皓允、蘇垠成、庄司光男、栢沼愛、神谷克政梅村雅之、矢花一浩、白 石賢二
    • 学会等名
      2013年日本天文学会春季年会
    • 発表場所
      埼玉大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] PSII におけるCaMn4O5クラスターの理論計算2013

    • 著者名/発表者名
      磯部 寛,庄司光男,山中 秀介,梅名泰史,川上恵典,沈建仁神谷信夫,山口兆
    • 学会等名
      第54回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] Theoretical investigation on the absorption spectrum of photosystem as a biomarker of extrasolar plants2013

    • 著者名/発表者名
      M. Taguchi, Y. Komatsu, A. Sato, M. Shoji, M. Kayanuma, K. Kamiya, K. Shiraishi, K. Yabana, and M. Umemura
    • 学会等名
      ISTCP-8
    • 発表場所
      Budapest, Hungary(poster)
    • 年月日
      2013-08-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM study on the photosystem II oxygen evolving complex at the S1 state2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N Kamiya, J.-R. Shen, and K. Yamaguchi
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis Research
    • 発表場所
      St. Louis(MO)(Poster)
    • 年月日
      2013-08-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM study on the photosystem II oxygen evolving complex at the S1 state2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N Kamiya, J.-R. Shen, and K. Yamaguchi
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis Research
    • 発表場所
      St. Louis, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM 法による光合成酸素発生中心 S 1状態の電子状態解析2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第2回公開シンポジウム人工光合成特別セッション
    • 発表場所
      立命館大学
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における反応特異性についての理論的解明2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男,氏家謙,田中弥,花岡恭平,梅田宏明,栢沼愛,神谷克政,白石賢二,町田康博,村川武志,林秀行
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] トレオニン合成酵素におけるリン酸脱離以降の反応経路についての理論的検証2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 花岡恭平, 氏家謙, 田中弥, 栢沼愛, 梅田宏明, 町田康博, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      東北大学(口頭)
    • 年月日
      2013-03-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] A QM/MM study on the S2 spin state of the oxygen-evolving complex2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi
    • 学会等名
      第5回OCARINAシンポジウム
    • 発表場所
      大阪市立大学(oral)
    • 年月日
      2013-03-05
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における反応特異性についての理論的解明2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 氏家謙, 田中弥, 花岡恭平, 梅田宏明, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二, 町田康博, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜(口頭+ポスター)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] ビタミンD受容体におけるコンフォメーションアンサンブル : 分子動力学法による解明2013

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 庄司光男, 栢沼愛, 白石賢二
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸(ポスター)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 光化学系IIアンテナ部の光捕集機構についての量子化学的研究2013

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 蘇垠成, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 梅村雅之, 矢花一浩, 白石賢二
    • 学会等名
      第93回日本化学会春季年会
    • 発表場所
      立命館大学(口頭)
    • 年月日
      2013-03-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] A QM/MM study on the reverse reaction of Threonine Synthase2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, K. Hanaoka, Y. Ujiie, W. Tanaka, M. Kayanuma, H. Umeda, Y. Machida, T. Murakawa, H. Hayashi
    • 学会等名
      BIT’s 4th Symposium on Enzymes and Biocatalysis-2013
    • 発表場所
      Nanjing(中国)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical investigation on the absorption spectrum of photosystem as a biomarker of extrasolar plants2013

    • 著者名/発表者名
      M. Taguchi, Y. Komatsu, A. Sato, M. Shoji, M. Kayanuma, K. Kamiya, K. Shiraishi, K. Yabana, and M. Umemura
    • 学会等名
      ISTCP-8 (poster)
    • 発表場所
      Budapest, Hungary
    • 年月日
      2013-08-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] QM/MM study on the photosystem II oxygen evolving complex at the S1 state2013

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都国際会議場
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] The energy transfer simulation for detecting photosynthetic biosignatures on extrasolar planets2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Komatsu, M. Umemura, M. Shoji, K. Yabana, K. Shiraishi, K. Kamiya, M. Kayanuma, A. Sato
    • 学会等名
      1st Awaji International Workshop on"Electron Spin Science & Technology : Biological and Materials Science Oriented Applications"(1st AWEST2013)
    • 発表場所
      (poster)
    • 年月日
      2013-06-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM study on the photosystem II oxygen evolving complex at the S1 state2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都(Oral)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical investigation on the absorption spectrum of photosystem as a biomarker of extrasolar plants2013

    • 著者名/発表者名
      M. Taguchi, Y. Komatsu, A. Sato, ○M. Shoji, M. Kayanuma, K. Kamiya, K. Shiraishi, K. Yabana, and M. Umemura
    • 学会等名
      ISTCP-8
    • 発表場所
      Budapest, Hungary
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical elucidation on the reaction control mechanism in Threonine Synthase2013

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Kyohei Hanaoka, Yuzuru Ujiie, Wataru Tanaka, Megumi Kayanuma , Hiroaki Umeda, Yasuhiro Machida, Takeshi Murakawa, Hideyuki Hayashi
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      京都国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical Study of Artificial and Natural Water Oxidation2013

    • 著者名/発表者名
      H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, K. Tanaka, J. -R. Shen and K. Yamaguchi
    • 学会等名
      AWEST2013 (The 1st Awaji International Workshop on Electron Spin Science & Technology : Biological and Materials Science Oriented Applications)
    • 発表場所
      Awaji, Japan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心S 1状態の電子状態解析2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      第2回公開シンポジウム人工光合成特別セッション
    • 発表場所
      立命館大学(口頭)
    • 年月日
      2013-10-28
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における反応特異性決定過程の理論解明2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 花岡恭平, 氏家謙, 田中弥, 梅田宏明, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二, 町田康博, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      鳥取(口頭(若手奨励賞候補)+ポスター)
    • 年月日
      2013-06-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Magneto-structural correlations II. Full geometry optimizations of eight spin configurations of camn4o5 cluster and calculations of magneti interaction parameters in the sl and s3 states of oxygen evolving complex of photosystem II2013

    • 著者名/発表者名
      H. Isobe, J. -R. Shen, M. Shoji, S. Yamanaka, K. Yamaguchi, Y. Umena, K. Kawakami and N. Kamiya
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis Research
    • 発表場所
      St. Louis, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] QM/MM study on the photosystem II oxygen evolving complex at the S1 state2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji
    • 学会等名
      第51回日本生物物理学会年会(Oral)
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2013-10-28
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] Theoretical Investigation on the Substrate Specificity of Uridine-cytidine Kinase2013

    • 著者名/発表者名
      W. Tanaka, Y. Ujiie, K. Hanaoka, M. Shoji, M. Kayanuma, K. Kamiya, T. Ishida, F. Tomoike, S. Kuramitsu, K. Shiraishi
    • 学会等名
      ISTCP-8
    • 発表場所
      Budapest, Hungary(poster)
    • 年月日
      2013-08-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical investigation on the electronic structures of photosystem II oxygen evolving complex at the S2 state2013

    • 著者名/発表者名
      ◯M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N. Kamiya, J. -R. Shen, K. Yamaguchi
    • 学会等名
      1st Awaji International Workshop on "Electron Spin Science & Technology : Biological and Materials Science Oriented Applications" (oral-invited)
    • 発表場所
      Awaji
    • 年月日
      2013-06-16
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 分子動力学法によるトレオニン合成酵素の反応特異性についての理論的解明2013

    • 著者名/発表者名
      氏家謙, 田中弥, 花岡恭平, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二, 町田康博, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜(ポスター)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表]2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, K. Hanaoka, Y. Ujiie, W. Tanaka, M. Kayanuma, H. Umeda,Y. Machida, T. Murakawa, H. Hayashi
    • 学会等名
      BIT's 4th Symposium on Enzymes and Biocatalysis 2013 (SEB-2013)
    • 発表場所
      Nanjing, Chaina(oral)
    • 年月日
      2013-04-26
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 一酸化窒素還元酵素におけるN2O生成機構についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 花岡恭平, 近藤大生, 梅田宏明, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      Supercomputer workshop 2013
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心のS2中間体の電子状態についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      庄司 光男・磯部 寛・山中 秀介・山口 兆・沈 建仁
    • 学会等名
      日本化学会第93春季年会
    • 発表場所
      立命館大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心のS2中間体の電子状態についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      庄司 光男・磯部 寛・山中 秀介・山口 兆・沈 建仁
    • 学会等名
      第93回日本化学会春季年会
    • 発表場所
      立命館大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素におけるリン酸脱離以降の反応経路についての理論的検証2013

    • 著者名/発表者名
      庄司 光男、花岡 恭平、氏家 謙、田中 弥、栢沼 愛、梅田 宏明、町田 康博、村川 武志、林 秀行
    • 学会等名
      日本農芸化学会
    • 発表場所
      東北大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心のS2中間体の電子状態についての理論的研究2013

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 磯部寛, 山中秀介, 山口兆, 沈建仁
    • 学会等名
      第93回日本化学会春季年会
    • 発表場所
      立命館大学(ポスター)
    • 年月日
      2013-03-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 系外惑星バイオマーカー検出を目指した光合成機構のエネルギー移動計算2013

    • 著者名/発表者名
      小松勇, 梅村雅之, 庄司光男, 矢花一浩, 白石賢二, 神谷克政, 栢沼愛, 田口真彦, 佐藤皓允, 蘇垠成
    • 学会等名
      2013年日本天文学会春季年会
    • 発表場所
      埼玉大学(口頭)
    • 年月日
      2013-03-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Molecular dynamics study on the substrate binding free energy of Threonine Synthase2013

    • 著者名/発表者名
      Y. Ujiie, W. Tanaka, K. Hanaoka, M. Shoji, M. Kayanuma, K. Kamiya, T. Ishida, K. Shiraishi, Y. Machida, T. Murakawa, H. Hayashi
    • 学会等名
      ISTCP-8
    • 発表場所
      Budapest, Hungary(poster)
    • 年月日
      2013-08-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Magneto-structural correlations 1. Magnetic interaction parameters in the S2 state of the oxygen-evolving complex in photosystem II2013

    • 著者名/発表者名
      H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J. -R. Shen, and K. Yamaguchi
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis Research
    • 発表場所
      St. Louis. USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 時間依存密度汎関数法に基づく光合成アンテナ部の吸収スペクトルの研究とそれを用いた系外惑星における生命指標検出に向けての検討2013

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 蘇垠成, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 梅村雅之, 矢花一浩, 白石賢二
    • 学会等名
      Supercomputer workshop 2013
    • 発表場所
      分子科学研究所
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM study on the photosystem II oxygen evolving complex at the S1 state2013

    • 著者名/発表者名
      M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, N. Kamiya, J. -R Shen and K. Yamaguchi
    • 学会等名
      The 16th International Congress on Photosynthesis Research
    • 発表場所
      St. Louis, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] ウリジンシチジンキナーゼ(ttCK)の基質認識機構についての分子動力学解析2013

    • 著者名/発表者名
      田中弥, 氏家謙, 花岡恭平, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 友池史明, 倉光成紀, 白石賢二
    • 学会等名
      第86回日本生化学会大会
    • 発表場所
      横浜(ポスター)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 酵母DNAトポイソメラーゼIIにおけるDNA再結合反応の理論的解明2012

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 近藤大生, 庄司光男, 梁文榮, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-06-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 酵母DNAトポイソメラーゼ II における DNA 再結合反応の理論的解明2012

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平、近藤大生、庄司光男、梁文榮、神谷克政、白石賢二
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 光合成アンテナ部の光捕集機構についての理論的研究とそれを用いた系外惑星における生命指標検出に向けての検討2012

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 蘇垠成, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 梅村雅之, 矢花一浩, 白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点(ポスター)
    • 年月日
      2012-11-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Ground spin state of the oxygen-evolving complex at the S2 state2012

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, H.Isobe, S.Yamanaka, K. Yamaguchi, J.-R.Shen
    • 学会等名
      Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems
    • 発表場所
      Okayama(poster)
    • 年月日
      2012-10-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM study on the catalytic mechanism of nitrix oxide reductase2012

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Kyohei Hanaoka, Daiki Kondo, Hiroaki Umeda, Katsumasa Kamiya, YasutakaKitagawa, Kenji Shiraishi
    • 学会等名
      International Congress of Quantum Chemistry
    • 発表場所
      Boulder, Colorado(アメリカ合衆国)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Q/Nに富んだペプチドがつくるアミロイド線維の構造安定化機構の理論的解析2012

    • 著者名/発表者名
      近藤大生, 花岡恭平, 田口真彦, 神谷克政, 庄司光男, 河合(野間)繁子, 田口英樹, 白石賢二
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-12-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] II型DNAトポイソメラーセによるDNA再結合反応に対する基質を介するプロトンリレー機構2012

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 近藤大生, 庄司光男, 梁文榮, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第6回バイオ関連化学合同シンポジウム
    • 発表場所
      北大
    • 年月日
      2012-09-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 一酸化窒素還元酵素におけるN2O生成機構についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 花岡恭平, 近藤大生, 梅田宏明, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点(ポスター)
    • 年月日
      2012-11-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Ground spin state of the oxygen-evolving complex at the S2 state2012

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Kizashi Yamaguchi, Jian-Ren Shen
    • 学会等名
      Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems
    • 発表場所
      Okayama University
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 光合成光捕集複合体IIにおける光励起状態についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 蘇垠成, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 梅村雅之, 矢花一浩, 白石賢二
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-12-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] アゴニスト結合型ビタミンD受容体の溶液中のダイナミクスと活性制御機構2012

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 庄司光男, 近藤大生, 田口真彦, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-12-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法によるII型DNAトポイソメラーゼのDNA再結合反応の解明2012

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平、庄司光男、近藤大生、ヤンムンヨン、神谷克政、白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法による同化型亜硝酸還元酵素の反応機構についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, K.Hanaoka, D.Kondo, H.Umeda, M.Kayanuma, K.Kamiya, K.Shiraishi, S.Nakano, K.Katayanagi
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名大
    • 年月日
      2012-09-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM 法による同化型亜硝酸還元酵素の反応機構についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Kyohei Hanaoka, Daiki Kondo, Hiroaki Umeda, Megumi Kayanuma, Katsumasa Kamiya, Kenji Shiraishi, Shogo Nakano, Katsuo Katayanagi
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素におけるリン酸脱離以降の反応機構についての理論的解明2012

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 花岡恭平, 近藤大生, 田口真彦, 栢沼愛, 梅田宏明, 鴨志田良和, 神谷克政, 白石賢二, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-12-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法によるII型DNAトポイソメラーゼのDNA再結合反応の解明2012

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 庄司光男, 近藤大生, ヤンムンヨン, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点(ポスター)
    • 年月日
      2012-11-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素におけるリン酸脱離以降の反応機構についての理論的解明2012

    • 著者名/発表者名
      庄司 光男,花岡 恭平,近藤 大生,田口 真彦,栢沼 愛,梅田 宏明,鴨志田 良和,神谷 克政,白石 賢二,村川 武志,林 秀行
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] QM/MM study on the catalytic mechanism of nitrix oxide reductase2012

    • 著者名/発表者名
      M.Shoji, K.Hanaoka, D.Kondo, H.Umeda, K.Kamiya, Y.Kitagawa, K.Shiraishi
    • 学会等名
      2012 ICQC - International Congress of Quantum Chemistry
    • 発表場所
      Boulder, Colorado(poster)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 系外惑星のバイオマーカー検出に向けた光合成アンテナ機構の励起状態計算2012

    • 著者名/発表者名
      小松勇, 梅村雅之, 庄司光男, 矢花一浩, 白石賢二, 神谷克政, 栢沼愛, 田口真彦, 佐藤皓允, 蘇垠成
    • 学会等名
      第5回アストロバイオロジーワークショップ
    • 発表場所
      (口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Ground spin state of the oxygen-evolving complex at the S2 state2012

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      Okayama University International Symposium“Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”
    • 発表場所
      Okayama University
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 一酸化窒素還元酵素(NOR)におけるN2O生成酵素についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 花岡恭平, 近藤大生, 梁文榮, 梅田宏明, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-06-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 一酸化窒素還元酵素におけるN2O生成機構についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、花岡恭平、近藤大生、梅田宏明、神谷克政、白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 系外惑星における生命指標としての光合成色素についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 蘇垠成, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 梅村雅之, 矢花一浩, 白石賢二
    • 学会等名
      第5回アストロバイオロジーワークショップ
    • 発表場所
      (口頭)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 光合成アンテナ部の光捕集機構についての理論的研究とそれを用いた系外惑星における生命指標検出に向けての検討2012

    • 著者名/発表者名
      田口真彦、小松勇、佐藤皓允、蘇垠成、庄司光男、栢沼愛、神谷克政、梅村雅之、矢花一浩、白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical Investigation of a Mechanism of Chirality Induction for Amino Acids in the Early Solar System2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤, 庄司, 神谷, 梅村, 矢花, 白石
    • 学会等名
      日本地球惑星科学連合大会
    • 発表場所
      (口頭)
    • 年月日
      2012-05-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 光合成光捕集複合体IIにおける光励起状態についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      田口 真彦, 小松 勇, 佐藤 皓允, 蘇 垠成, 庄司 光男, 栢沼 愛, 神谷 克政, 梅村 雅之, 矢花 一浩, 白石 賢二
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 一酸化窒素還元酵素(NOR)におけるN2O生成酵素についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、花岡恭平、近藤大生、梁 文榮、梅田宏明、神谷克政、白石賢二
    • 学会等名
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      名古屋国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] アゴニスト結合型ビタミンD受容体のマイナーコンフォメーション2012

    • 著者名/発表者名
      花岡 恭平, 庄司 光男, 近藤 大生, 田口 真彦, 栢沼 愛, 神谷 克政, 白石 賢二
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] アゴニスト結合型ビタミンD受容体のマイナーコンフォメーション2012

    • 著者名/発表者名
      花岡恭平, 庄司光男, 近藤大生, 田口真彦, 栢沼愛, 神谷克政, 白石賢二
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-12-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素の触媒性リン酸イオン結合残基の役割2012

    • 著者名/発表者名
      町田 康博,村川 武志,庄司 光男,林 秀行
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      マリンメッセ福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] Q/Nに富んだペプチドがつくるアミロイド線維の構造安定化機構の計算科学的解析2012

    • 著者名/発表者名
      近藤大生, 花岡恭平, 田口真彦, 神谷克政, 庄司光男, 河合-野間繁子, 田口英樹, 白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点(ポスター)
    • 年月日
      2012-11-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表]2012

    • 著者名/発表者名
      佐藤皓允, 田口真彦, 庄司光男
    • 学会等名
      第7回夏の学校宇宙ライフサイエンス若手の会
    • 発表場所
      (ポスター発表)
    • 年月日
      2012-08-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Q/Nに富んだペプチドがつくるアミロイド線維の構造安定化機構の計算科学的解析2012

    • 著者名/発表者名
      近藤大生、花岡恭平、田口真彦、神谷克政、庄司光男、河合-野間繁子、田口英樹、白石賢二
    • 学会等名
      第3回協定講座シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学統合研究拠点
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM simulation revealed a substrate mediated proton relay mechanism in DNA religation reaction catalyzed by Type II DNA topoisomerase2012

    • 著者名/発表者名
      K.Hanaoka, M.Shoji, D.Kondo, A.Sato, M.-Y.Yang, K.Kamiya, K.Shiraishi
    • 学会等名
      CCP2012
    • 発表場所
      Kobe(poster)
    • 年月日
      2012-10-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 光合成光化学系IIにおけるアンテナ部の光捕集機構についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      田口 真彦, 小松 勇, 佐藤 皓允, 蘇 垠成, 庄司 光男, 栢沼 愛, 神谷 克政, 梅村 雅之, 矢花 一浩, 白石 賢二
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] アゴニスト結合型ビタミンD受容体の溶液中のダイナミクスと活性制御機構2012

    • 著者名/発表者名
      花岡 恭平, 庄司 光男, 近藤 大生, 田口 真彦, 栢沼 愛, 神谷 克政, 白石 賢二
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Q/Nに富んだペプチドがつくるアミロイド線維の構造安定化機構の理論的解析2012

    • 著者名/発表者名
      近藤 大生, 花岡 恭平, 田口 真彦, 神谷 克政, 庄司 光男, 河合(野間) 繁子, 田口 英樹, 白石 賢二
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 光合成光化学系IIにおけるアンテナ部の光捕集機構についての理論的研究2012

    • 著者名/発表者名
      田口真彦, 小松勇, 佐藤皓允, 蘇垠成, 庄司光男, 栢沼愛, 神谷克政, 梅村雅之, 矢花一浩, 白石賢二
    • 学会等名
      第35回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場(ポスター)
    • 年月日
      2012-12-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素におけるリン酸脱離以降の反応機構についての理論的解明2012

    • 著者名/発表者名
      庄司 光男, 花岡 恭平, 近藤 大生, 田口 真彦, 栢沼 愛, 梅田 宏明, 鴨志田 良和, 神谷 克政, 白石 賢二, 村川 武志, 林 秀行,
    • 学会等名
      第85回日本生化学会大会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] QM/MM法による光合成酸素発生中心の電子状態と構造

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      異分野融合による新材料開発のための計算科学
    • 発表場所
      独立行政法人理化学研究所 計算科学研究機構(RIKEN AICS)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] Theoretical investigation on the electronic structures of photosystem II oxygen evolving complex at the S2 state

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      1st Awaji International Workshop on “Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications”
    • 発表場所
      awaji Yumebutai, Hyogo, Japan
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 同化型亜硝酸還元酵素における全化学反応の理論的解明

    • 著者名/発表者名
      庄司光男、田中弥、氏家譲、栢沼愛、梅田宏明、重田育照、中野祥吾、片柳克夫
    • 学会等名
      分子科学討論会(口頭発表)
    • 発表場所
      広島大学、広島県
    • 年月日
      2014-09-21 – 2014-09-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] QM/MM study on the L-threonine formation reaction of threonine synthase

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Yuzuru Ujiie, Wataru Tanaka, Megumi Kayanuma, Ryuhei Harada, Hiroaki Umeda, Yasuteru Shigeta, Takeshi Murakawa, Hideyuki Hayashi
    • 学会等名
      QSCP XIX
    • 発表場所
      Tamkang University, Taipei, Taiwan
    • 年月日
      2014-11-11 – 2014-11-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] A QM/MM study on the reverse reaction of Threonine Synthase

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji
    • 学会等名
      BIT’s 4th Symposium on Enzymes and Biocatalysis 2013
    • 発表場所
      Nanjing, Chaina
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] 同化型亜硝酸還元酵素の反応機構の理論的解明

    • 著者名/発表者名
      庄司 光男、田中 弥 、氏家 謙 、栢沼 愛 、梅田 宏明、中野 祥吾 、片柳 克夫
    • 学会等名
      第14回蛋白質科学会(ポスター)
    • 発表場所
      ワークピア横浜、神奈川県
    • 年月日
      2014-06-25 – 2014-06-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Theoretical investigation on the conformation-charge relationship of the photosystem II oxygen evolving complex (PSII-OEC)

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Jian-Ren Shen, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター、北海道
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Magneto-structural correlation on the CaMn405 cluster in the oxygen-evolving complex of photosystem II

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      CRC-SU Joint Symposium on Chemical Theory for Complex Systems" Interplay between Theory and Experiments : New Trends in Catalysis"
    • 発表場所
      Stockholm, Sweden
    • 年月日
      2014-10-30 – 2014-10-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] 光合成酸素発生中心(PSII-OEC)の立体構造と電荷状態変化についての理論的研究

    • 著者名/発表者名
      庄司光男・磯辺寛・山中秀介・沈建仁・山口兆
    • 学会等名
      第52回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      札幌
    • 年月日
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] トレオニン合成酵素の触媒過程前半部分の解析

    • 著者名/発表者名
      林秀行,村川武志,庄司光男
    • 学会等名
      日本化学会第95春季年会
    • 発表場所
      船橋
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における生成物支援触媒機構解明のための精密自由エネルギー計算

    • 著者名/発表者名
      庄司光男, 氏家謙, 田中弥, 栢沼愛, 梅田宏明, 重田育照, 村川武志, 林秀行
    • 学会等名
      日本生化学会大会(ポスター)
    • 発表場所
      京都国際会議場、京都府
    • 年月日
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-26410002
  • [学会発表] Large-Scale QM/MM study on the oxygen-evolving complex in the S1 state of photosystem II

    • 著者名/発表者名
      Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya, Kizashi Yamaguchi
    • 学会等名
      CRC-SU Joint Symposium on Chemical Theory for Complex Systems" Interplay between Theory and Experiments : New Trends in Catalysis"
    • 発表場所
      Stockholm, Sweden
    • 年月日
      2014-10-30 – 2014-10-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24000018
  • [学会発表] トレオニン合成酵素における反応特異性決定過程の理論解明

    • 著者名/発表者名
      庄司光男
    • 学会等名
      蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      とりぎん文化会館(鳥取市)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24750007
  • [学会発表] トレオニン合成酵素の触媒反応 前半部分の反応機構解析

    • 著者名/発表者名
      町田康博,村川武志,庄司光男,林秀行
    • 学会等名
      第61回日本生化学会近畿支部例会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-05-17 – 2015-05-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24570140
  • 1.  林 秀行 (00183913)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 21件
  • 2.  村川 武志 (90445990)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 17件
  • 3.  宮下 治 (10620528)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  篠田 恵子 (80646951)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  沈 建仁 (60261161)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 35件
  • 6.  野口 巧 (60241246)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  山口 兆 (80029537)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 48件
  • 8.  菅 倫寛 (60634920)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 9.  秋田 総理 (50751418)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 10.  三野 広幸 (70300902)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 11.  加藤 祐樹 (10376634)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  磯部 寛 (00379281)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 45件
  • 13.  岡島 俊英 (10247968)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 14.  相川 祐理 (40324909)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 15.  中井 忠志 (00333344)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  古家 健次 (80783711)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 17.  南後 恵理子 (90376947)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  清水 伸隆 (20450934)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  大和田 成起 (90725962)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  氏家 譲
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 11件
  • 21.  田中 弥
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 9件
  • 22.  梅名 泰史
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 4件
  • 23.  神谷 克政
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 24.  重田 育照
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 5件
  • 25.  鈴木 守
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 26.  山中 秀介
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 6件
  • 27.  神谷 信夫
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 3件
  • 28.  川上 恵典
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 6件
  • 29.  尾高 雅文
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 30.  養王田 正文
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 31.  原田 隆平
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 32.  梅村 雅之
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 3件
  • 33.  鷹野 優
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 34.  吉岡 泰規
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 35.  稲岡 健ダニエル
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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