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北村 勇吉  キタムラ ユウキチ

研究者番号 00855702
その他のID
  • ORCIDhttps://orcid.org/0000-0002-2704-2716
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2021年度 – 2024年度: 静岡大学, 工学部, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分32010:基礎物理化学関連
研究代表者以外
小区分32010:基礎物理化学関連
キーワード
研究代表者
ソルバトクロミズムシフト / 構造機能相関 / 量子化学的記述子 / アンサンブル学習器 / 分光スペクトル解析
研究代表者以外
pH依存性運搬ペプチド / データ科学 / 時系列クラスタリング / 蛋白質機能調節 / Red Moon法 … もっと見る / レッドムーン法 / アンサンブルMD法 / 配置選択定pH法 / ph, 分子夾雑状態 / pH, 分子夾雑状態 / ph / ビッグデータ解析 / 分子夾雑系 / 配置選択定pH 法 / 運動樹法 / Motion Tree method / 分子夾雑状態 / pH / 時系列クラスタリング解析 / ビックデータ解析 / Motion Tree 法 / 夾雑状態分子物性 / 定pH法 / 分子シミュレーション 隠す
  • 研究課題

    (3件)
  • 研究成果

    (29件)
  • 共同研究者

    (2人)
  •  pHや共溶質濃度の変化による蛋白質機能調節の機構解明:計算化学とデータ科学の融合

    • 研究代表者
      長岡 正隆
    • 研究期間 (年度)
      2024
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分32010:基礎物理化学関連
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  量子化学的記述子を用いたアンサンブル機械学習モデルの開発と分光スペクトル解析研究代表者

    • 研究代表者
      北村 勇吉
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分32010:基礎物理化学関連
    • 研究機関
      静岡大学
  •  pH依存環境の計算化学とデータ科学の融合-分子凝集から生体分子機能まで-

    • 研究代表者
      長岡 正隆
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分32010:基礎物理化学関連
    • 研究機関
      名古屋大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019

すべて 学会発表

  • [学会発表] 配置選択定pH(CS-CpH)法による酸性残基を含むペプチドのpH依存性予測2024

    • 著者名/発表者名
      稲垣風花, 北村勇吉, 四谷悠, 長岡正隆
    • 学会等名
      日本化学会第104春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K04678
  • [学会発表] 配置選択定pH(CS-CpH)法による酸性残基を含むペプチドのpH依存性予測2024

    • 著者名/発表者名
      稲垣風花、北村勇吉、四谷悠、長岡正隆
    • 学会等名
      日本化学会 第104春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] ヘモグロビンの構造安定性と構造間遷移に対するpH 依存性2023

    • 著者名/発表者名
      四谷悠、北村勇吉、長岡正隆
    • 学会等名
      第37回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] 配置選択定pH(CS-CpH)法による酸性残基を含むペプチドの 立体配座が持つpH依存性の解明2023

    • 著者名/発表者名
      稲垣風花、北村勇吉、四谷悠、長岡正隆
    • 学会等名
      第37回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] 金属腐食抑制性能の予想のための 機械学習モデル構築の方法2023

    • 著者名/発表者名
      高井洋子, 伊藤勝仁, 北村勇吉
    • 学会等名
      第46回ケモインフォマティクス討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K04678
  • [学会発表] ヒスチジン残基のプロトン化状態がヘモグロビンに及ぼす構造安定化効果:理論的解析2023

    • 著者名/発表者名
      四谷悠、田中美帆、北村勇吉、長岡正隆
    • 学会等名
      第17回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] 振動分光予測モデルにおける記述子の静電ポテンシャルマップに基づく構築2023

    • 著者名/発表者名
      北村勇吉, 鳥居肇
    • 学会等名
      第46回ケモインフォマティクス討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K04678
  • [学会発表] 振動分光スペクトル解析のための理論化学的手法の開発および機械学習モデルの検討2023

    • 著者名/発表者名
      北村勇吉
    • 学会等名
      第45回溶液化学シンポジウム・プレシンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K04678
  • [学会発表] ヘモグロビンの構造安定性と構造間遷移に対するpH依存性2023

    • 著者名/発表者名
      四谷悠, 北村勇吉, 長岡正隆
    • 学会等名
      第37回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K04678
  • [学会発表] 機械学習による振動分光予測モデルにおける記述子構築方法の検討2023

    • 著者名/発表者名
      北村勇吉, 鳥居肇
    • 学会等名
      第45回溶液化学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K04678
  • [学会発表] プロトン化部位を有するペプチドのpHに依存した立体配座変化:固定プロトン化状態による分子動力学計算と配置選択定pH法の比較2023

    • 著者名/発表者名
      稲垣風花、四谷悠、北村勇吉、長岡正隆
    • 学会等名
      第17回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] 配置選択定pH(CS-CpH)法による酸性残基を含むペプチドの立体配座が持つpH依存性の解明2023

    • 著者名/発表者名
      稲垣風花, 北村勇吉, 四谷悠, 長岡正隆
    • 学会等名
      第37回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K04678
  • [学会発表] GPU版配置選択pH(CS-CpH)法の開発とその応用2022

    • 著者名/発表者名
      稲垣風花、四谷悠、北村勇吉、長岡正隆
    • 学会等名
      第36回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] R状態ヒト成人ヘモグロビンに及ぼすヒスチジン残基プロトン化の構造安定化効果2022

    • 著者名/発表者名
      四谷悠、田中美帆、北村勇吉、長岡正隆
    • 学会等名
      第12回CSJ化学フェスタ2022
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] ヒスチジン残基のプロトン化状態が決定するR状態ヘモグロビンの構造安定性2022

    • 著者名/発表者名
      四谷悠、田中美帆、北村勇吉、長岡正隆
    • 学会等名
      第24回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] R状態ヘモグロビンに及ぼすサブユニット間相互作用の構造安定化効果2022

    • 著者名/発表者名
      四谷悠、田中美帆、北村勇吉、長岡正隆
    • 学会等名
      第16回分子科学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K23300
  • [学会発表] ヘモグロビンのアロステリック制御に関するデータ科学的研究 -四次構造遷移に伴うサブユニット界面構造の解析-2021

    • 著者名/発表者名
      田中美帆,高橋由芽,高見慧,四谷悠,北村勇吉,長岡正隆
    • 学会等名
      第35回分子シミュレーション討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] ヘモグロビンのアロステリック制御に関する時系列解析:T 状態安定化に対する塩素イオンの役割2021

    • 著者名/発表者名
      田中美帆,高橋由芽,高見慧,北村勇吉,長岡正隆
    • 学会等名
      第23回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] 配置選択スキームによる定 pH ハイブリッド MC 法の開発:振動・電子遷移スペクトルへの応用2021

    • 著者名/発表者名
      北村勇吉, Carlos Bistafa, 長岡正隆
    • 学会等名
      第23回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] ヘモグロビンのアロステリック制御に関する統計解析: T状態安定化に対する塩素イオンの役割2021

    • 著者名/発表者名
      田中美帆,高橋由芽,高見慧,北村勇吉,長岡正隆
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2021年春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] 時系列クラスタリング法によるヘモグロビンタンパク質内部への酸素分子進入過程の解析2021

    • 著者名/発表者名
      北村勇吉,高見慧,長岡正隆
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2021年春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] ヒトヘモグロビンのアロステリックなT-R遷移過程の多様性:主成分分析およびMotion Tree法の適用2020

    • 著者名/発表者名
      北村 勇吉,鈴木 謙太郎,長岡 正隆
    • 学会等名
      日本化学会第100春季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] ヒト成人ヘモグロビンのT-R状態間遷移における多様な立体構造変化過程:時系列クラスタリング法によるデータ解析の適用2020

    • 著者名/発表者名
      高見慧、北村勇吉、 長岡正隆
    • 学会等名
      分子科学討論会オンライン討論会2020
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] ヒト成人ヘモグロビンのT-R状態間立体構造変化に対する進入酸素分子群の役割2020

    • 著者名/発表者名
      高見慧、北村勇吉、 長岡正隆
    • 学会等名
      日本コンピュータ化学会2020年秋季年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] ヘモグロビンのアロステリック制御における塩素イオンの役割に関する理論的研究2019

    • 著者名/発表者名
      高橋由芽,栗崎以久男,鈴木謙太郎,北村勇吉,長岡正隆
    • 学会等名
      第13回分子科学討論会 名古屋 2019
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] Motion Tree法によるヒトヘモグロビンのアロステリックなT-R遷移過程の理論的研究2019

    • 著者名/発表者名
      鈴木謙太郎,北村勇吉,高橋由芽,高柳昌芳,栗崎以久男,長岡正隆
    • 学会等名
      第13回分子科学討論会 名古屋 2019
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] 自由エネルギー面探索:溶液中の自由エネルギー最適化と振動数解析2019

    • 著者名/発表者名
      北村 勇吉
    • 学会等名
      重点課題5第2回若手勉強会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] 水和アルミニウム錯体系での多段階プロトン化と水和数変化:量子力学法に基づいた定pH法の開発2019

    • 著者名/発表者名
      北村勇吉,吉田正一,長岡正隆
    • 学会等名
      第22回理論化学討論会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • [学会発表] 化学反応エルゴードグラフィに向けた自由エネルギー面探索:溶液中の構造最適化と振動解析2019

    • 著者名/発表者名
      北村勇吉
    • 学会等名
      化学反応経路探索のニューフロンティア(SRPS2019)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02673
  • 1.  長岡 正隆 (50201679)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 20件
  • 2.  小池 亮太郎 (20381577)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件

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