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仲西 功  NAKANISHI Isao

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 10362576
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 近畿大学, 薬学部, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2017年度: 近畿大学, 薬学部, 教授
2008年度 – 2012年度: 近畿大学, 薬学部, 教授
2007年度: 京都大学, 薬学研究科, 准教授
2006年度: 京都大学, 薬学研究科, 助教授
審査区分/研究分野
研究代表者
創薬化学
研究代表者以外
創薬化学 / 物理化学
キーワード
研究代表者
自由エネルギー摂動法 / CK2 / 結合自由エネルギー / 水和エネルギー / 熱力学積分法 / 計算化学 / 生物活性物質 / HIV-1 / 溶媒和カネルギー / SBDD … もっと見る / タンパク質 / HIV-1プロテアーゼ / FKBP / 構造最適化 / 溶媒和エネルギー / 結合エネルギー / フラグメント分子軌道法 / 医薬分子設計 … もっと見る
研究代表者以外
環状ペプチド / キナーゼ / 合理的分子設計 / 創薬テンプレート / ケモカイン / GPCR / 複素環 / ペプチド / 分子シミュレーション / FMO法 / 電子状態計算 / 溶媒の連続誘電体モデル / 量子・古典融合法 / フラグメント分子軌道法 / 電子状態計算法 / 生体高分子 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (41件)
  • 共同研究者

    (4人)
  •  難解析性タンパク質を標的とした創薬基盤技術の開発研究

    • 研究代表者
      藤井 信孝
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      創薬化学
    • 研究機関
      京都大学
  •  分子シミュレーションによる高活性リガンド探索法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      仲西 功
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      創薬化学
    • 研究機関
      近畿大学
  •  生体高分子のためのマルチレベル統合フラグメント分子軌道法の開発

    • 研究代表者
      北浦 和夫
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2010
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      物理化学
    • 研究機関
      京都大学
  •  SBDDにおける薬物候補分子の活性(蛋白質結合親和力)予測法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      仲西 功
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2008
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      創薬化学
    • 研究機関
      近畿大学
      京都大学

すべて 2018 2017 2016 2012 2011 2010 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 学会発表 図書

  • [図書] Detailed Electronic Structure Studies Revealing the Nature of Protein-Ligand Binding, in "The Fragment Molecular Orbital Method : Practical Applications to Large Molecular Systems",(D.G. Fedorov, K.Kitaura (Eds.))(Boca Raton)2009

    • 著者名/発表者名
      I.Nakanishi, D.G.Fedorov, K.Kitaura
    • 出版者
      CRC press
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20350004
  • [雑誌論文] Synthesis of Jaspine B Regioisomers through Palladium-Catalyzed Stereoselective Tetrahydrofuran Formation: Insight into the Ligand Recognition of Sphingosine Kinases2018

    • 著者名/発表者名
      Miyagawa, S. Inuki, M. Honda, S. Nakamura, I. Nakanishi, N. Fujii, S. Oishi, H. Ohno
    • 雑誌名

      Tetrahdron

      巻: 74 号: 15 ページ: 1802-1809

    • DOI

      10.1016/j.tet.2018.02.042

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15KT0061, KAKENHI-PROJECT-15H04654, KAKENHI-PUBLICLY-18H04408, KAKENHI-PROJECT-17H03971
  • [雑誌論文] Identification of Selective Inhibitors of Sphingosine Kinases 1 and 2 through a Structure-Activity Relationship Study of 4-epi-Jaspine B2017

    • 著者名/発表者名
      H. Ohno, M. Honda, N. Hamada, J. Miyagaki, A. Iwata, K. Otsuki, T. Maruyama, S. Nakamura, I. Nakanishi, S. Inuki, N. Fujii, S. Oishi
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 25 号: 12 ページ: 3046-3052

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2017.03.059

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24689001, KAKENHI-PROJECT-15KT0061, KAKENHI-PROJECT-15H04654, KAKENHI-PROJECT-17H03971
  • [雑誌論文] Structure-Activity Relationship Study of 4-(Thiazol-5-yl)benzoic Acid Derivatives as Potent Protein Kinase CK2 Inhibitors2016

    • 著者名/発表者名
      H. Ohno, D. Minamiguchi, S. Nakamura, K. Shu, S. Okazaki, M. Honda, R. Misu, H. Moriwaki, S. Nakanishi, S. Oishi, T. Kinoshita, I. Nakanishi, N. Fujii
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 24 号: 5 ページ: 1136-1141

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2016.01.043

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15KT0061, KAKENHI-PROJECT-24689001, KAKENHI-PROJECT-15H04654
  • [雑誌論文] An Efficient Method to Evaluate Intermolecular Interaction Energies in Large Systems Using Overlapping Multicenter ONIOM and the Fragment Molecular Orbital Method.2012

    • 著者名/発表者名
      N. Asada, D. G. Fedorov, K. Kitaura, I. Nakanishi, K. M. Merz.
    • 雑誌名

      J. Phys. Chem. Lett.

      巻: 3 号: 18 ページ: 2604-2610

    • DOI

      10.1021/jz3010688

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] Structure-based Design of Novel Potent CK2 Inhibitors with Phenyl-azole Scaffolds.2012

    • 著者名/発表者名
      Z. Hou, I. Nakanishi, T. Kinoshita, Y. Takei, M. Yasue, R. Misu, Y. Suzuki, S. Nakamura, T. Kure, H. Ohno, K. Murata, K. Kitaura, A. Hirasawa, G. Tsujimoto, S. Oishi, N. Fujii.
    • 雑誌名

      J. Med. Chem.

      巻: 55 号: 6 ページ: 2899-2903

    • DOI

      10.1021/jm2015167

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110, KAKENHI-PROJECT-23390025, KAKENHI-PROJECT-23659038
  • [雑誌論文] Subtle structural changes in tetrahydro- quinolines, a new class of nonsteroidal selective androgen receptor modulators, induce different functions.2012

    • 著者名/発表者名
      N. Nagata, K. Kawai, I. Nakanishi
    • 雑誌名

      J. Chem. Inf. Model.

      巻: 52 号: 8 ページ: 2257-2264

    • DOI

      10.1021/ci300219g

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] Structure0based Design of Novel Potent CK2 Inhibitors with Phenyl-azole Scaffolds2012

    • 著者名/発表者名
      Z.Hou, I.Nakanishi, et al
    • 雑誌名

      J.Med.Chem.

      巻: 55 ページ: 2899-2903

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] A detailed thermodynamic profile of cyclopentyl and isopropyl derivatives binding to CK2 kinase.2011

    • 著者名/発表者名
      T. Kinoshita, Y. Sekiguchi, H. Fukada, T. Nakaniwa, T. Tada, S. Nakamura, K. Kitaura, H. Ohno, Y. Suzuki, A. Hirasawa, I. Nakanishi, G. Tsujimoto.
    • 雑誌名

      Mol. Cell Biochem.

      巻: 356 号: 1-2 ページ: 97-105

    • DOI

      10.1007/s11010-011-0960-9

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] Ligand Shape Emerges in Solvent Dipole Ordering Region at Ligand Binding Site of Protein2010

    • 著者名/発表者名
      K.Murata, N.Nagata, I.Nakanishi, K.Kitaura
    • 雑誌名

      J.Comput.Chem.

      巻: 31 ページ: 791-796

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] Ligand Shape Emerges in Solvent Dipole Ordering Region at Ligand Binding Site of Protein.2010

    • 著者名/発表者名
      K. Murata, N. Nagata, I. Nakanishi, K. Kitaura
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem.

      巻: 31 号: 4 ページ: 791-796

    • DOI

      10.1002/jcc.21362

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] SDOVS: A Solvent Dipole Ordering-Based Method for Virtual Screening.2010

    • 著者名/発表者名
      K. Murata, N. Nagata, I. Nakanishi, K. Kitaura
    • 雑誌名

      J. Comput. Chem.

      巻: 31 号: 15 ページ: 2714-2722

    • DOI

      10.1002/jcc.21565

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] Docking and SAR Studies of Salacinol Derivatives as a-Glucosidase Inhibitors2010

    • 著者名/発表者名
      S.Nakamura, K.Takahira, G.Tanabe, T.Morikawa, M.Sakano, K.Ninomiya, M.Yoshikawa, O.Muraoka, I.Nakanishi
    • 雑誌名

      Bioorg.Med.Chem.

      巻: 20 ページ: 4420-4423

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] SDOVS : A Solvent Dipole Ordering-Based Method for Virtual Screening2010

    • 著者名/発表者名
      K.Murata, N.Nagata, I.Nakanishi, K.Kitaura
    • 雑誌名

      J.Comput.Chem.

      巻: 31 ページ: 2714-2722

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] Docking and SAR Studies of Salacinol Derivatives as α-Glucosidase Inhibitors.2010

    • 著者名/発表者名
      S. Nakamura, K. Takahira, G. Tanabe, T. Morikawa, M. Sakano, K. Ninomiya, M. Yoshikawa, O. Muraoka, I. Nakanishi
    • 雑誌名

      Bioorg. Med. Chem.

      巻: 20 号: 15 ページ: 4420-4423

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2010.06.059

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [雑誌論文] Binding free energy calculations of adenosine deaminase inhibitor and the effect of methyl substitution in inhibitors2009

    • 著者名/発表者名
      Takahiro Kosugi, Isao Nakanishi, Kazuo Kitaura
    • 雑誌名

      J. Chem. Inf. Model. 49

      ページ: 618-622

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [雑誌論文] Cl-π interactions in protein-ligand complexes2008

    • 著者名/発表者名
      Imai N-Y, Inoue Y, Isao Nakanishi, Kazuo Kitaura
    • 雑誌名

      Protein Science 17

      ページ: 1129-1137

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [雑誌論文] Molecular recognition mechanism of FK506 binding protein: An all-electron fragment molecular orbital study2007

    • 著者名/発表者名
      I. Nakanishi, D. G. Fedorov and K. Kitaura
    • 雑誌名

      PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics 68

      ページ: 145-158

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [雑誌論文] Molecular recognition mechanism of FK506 binding protein : An all-electron fragment molecular orbital study2007

    • 著者名/発表者名
      Isao Nakanishi, D. G. Fedorov, Kazuo Kitaura
    • 雑誌名

      Proteins 68

      ページ: 145-158

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [雑誌論文] Molecular recognition mechanism of FK506 binding protein : An all-electron fragment molecular orbital study2007

    • 著者名/発表者名
      Isao Nakanishi, Dmitri G. Fedorov, Kazuo Kitaura
    • 雑誌名

      Protein : Structure, Function, and Bioinformatics 68(in press)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [雑誌論文] Amide-π interactions between formamide and benzene

    • 著者名/発表者名
      Imai N-Y, Inoue Y, Isao Nakanishi, Kazuo Kitaura
    • 雑誌名

      J. Comp. Chem. (in press)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [学会発表] Pd触媒を用いたTHF環構築によるJaspine B 位置異性体の合成研究2018

    • 著者名/発表者名
      宮川貴吏、本田真歩、中村真也、仲西功、井貫晋輔、大石真也、大野浩章
    • 学会等名
      日本薬学会第138年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04654
  • [学会発表] 4-epi-Jaspine B位置異性体の合成と構造活性相関研究2017

    • 著者名/発表者名
      宮川貴吏、本田真歩、小林由佳、中村真也、仲西功、藤井信孝、井貫晋輔、大石真也、大野浩章
    • 学会等名
      第34回有機合成化学セミナー
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04654
  • [学会発表] 「非経験的フラグメント分子軌道法を活用した高活性Protein Kinase CK2 阻害剤の設計」2012

    • 著者名/発表者名
      呉 竜英, 侯 増〓, 木下 誉富, 武井 義則, 安江 美里, 三須 良介, 鈴木 大和, 中村 真也, 大野 浩章, 村田 克美, 北浦 和夫, 平澤 明, 大石 真也, 藤井 信孝, 仲西 功
    • 学会等名
      第40回構造活性相関シンポジウム
    • 発表場所
      愛知
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] Binding energy estimation of CK2 inhibitors by the ab initio-based fragment molecular orbital method.2012

    • 著者名/発表者名
      T. Kure, S. Nakamura, M. Kanemitsu, K. Murata, K. Kitaura, T. Kinoshita, Z. Hou, Y. Suzuki, H. Ohno, S. Oishi, N. Fujii, Y. Takei, M. Yasue, R. Misu, A. Hirasawa, G. Tsujimoto, I. Nakanishi.
    • 学会等名
      22nd International Medicinal Chemistry Symposium 2012
    • 発表場所
      Germany
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] 「溶媒中における3(5)-Amino-5(3)-arylpyrazole誘導体の互変異性体存在比率の予測」2012

    • 著者名/発表者名
      呉 竜英、櫻井 淳史、西脇 敬二、中村 真也、仲西 功
    • 学会等名
      第10回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
    • 発表場所
      京都
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] 「分子シミュレーションを用いたProtein Kinase CK2 阻害剤の活性予測」2012

    • 著者名/発表者名
      中西 伸介、森脇 寛智、中村 真也、西脇 敬二、仲西 功
    • 学会等名
      第62回日本薬学会近畿支部大会
    • 発表場所
      兵庫
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] Srcファミリーキナーゼ特異的阻害剤SU6656の選択性に関する計算化学的考察2011

    • 著者名/発表者名
      呉 竜英、中村 真也、宮野 菜央、多田 俊治、多賀 淳、仲西 功
    • 学会等名
      第9回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
    • 発表場所
      神奈川
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] 「分子力場計算におけるCl-π相互作用パラメータの作成と分子動力学計算による検証」2011

    • 著者名/発表者名
      中尾 佳人、中村 真也、仲西 功
    • 学会等名
      日本薬学会第131年会
    • 発表場所
      静岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] MM/PBSA法によるCK2阻害剤ヘマテインの結合様式の予測2011

    • 著者名/発表者名
      永松和彦、仲西功, 他
    • 学会等名
      第34回情報化学討論会
    • 発表場所
      長崎大学(長崎)
    • 年月日
      2011-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] 分子力場計算におけるCl-π相互作用パラメータの作成と分子動力学計算による検証2011

    • 著者名/発表者名
      中尾佳人、中村真也、仲西功
    • 学会等名
      日本薬学会第131年会
    • 発表場所
      ツインメッセ静岡(静岡県)
    • 年月日
      2011-03-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] FEP/TI法によるリガンド間のタンパク質結合自由エネルギー差の評価2011

    • 著者名/発表者名
      中尾佳人、仲西功, 他
    • 学会等名
      第34回情報化学討論会
    • 発表場所
      長崎大学(長崎)
    • 年月日
      2011-11-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] FEP/TI法によるリガンド間のタンパク質結合自由エネルギー差の評価2011

    • 著者名/発表者名
      中尾 佳人、中村 真也、仲西 功
    • 学会等名
      第34回情報化学討論会
    • 発表場所
      長崎
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] LynおよびLckキナーゼの阻害剤との相互作用解析2011

    • 著者名/発表者名
      宮野菜央、仲西功, 他
    • 学会等名
      日本結晶学会年会
    • 発表場所
      北海道大学(北海道)
    • 年月日
      2011-11-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] Srcファミリーキナーゼ特異的阻害剤SU6656の選択性に関する計算化学的考察2011

    • 著者名/発表者名
      呉竜英、仲西功, 他
    • 学会等名
      第9回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム
    • 発表場所
      ホテル箱根アカデミー(神奈川)
    • 年月日
      2011-09-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] MM/PBSA法によるCK2阻害剤ヘマテインの結合様式の予測2011

    • 著者名/発表者名
      永松 和彦、中村 真也、木下 誉富、平澤 明、辻本 豪三、仲西 功
    • 学会等名
      第34回情報化学討論会
    • 発表場所
      長崎
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22590110
  • [学会発表] Quantum chemical calculation of protein-ligand calculation.2008

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi Isao
    • 学会等名
      XXth Iinternational Symposium of Medicinal Chemistry
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [学会発表] Quantum chemical calculation of protein-ligand interaction2008

    • 著者名/発表者名
      Nakanishi Isao
    • 学会等名
      XXth Iinternational Symposium of Medicinal Chemistry
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [学会発表] フラグメント分子軌道法による蛋白質-リガンド複合体の分極エネルギーの解析2007

    • 著者名/発表者名
      仲西功
    • 学会等名
      日本薬学会第127年会
    • 発表場所
      富山
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [学会発表] フラグメント分子軌道法によるポリアラニン配座異性体の相対安定性の解析2007

    • 著者名/発表者名
      浅田 直也, 仲西 功, D.G. Fedorov, 北浦 和夫
    • 学会等名
      第1回分子科学討論会
    • 発表場所
      仙台
    • 年月日
      2007-09-18
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • [学会発表] フラグメント分子軌道法を用いたcase in kinase 2aと阻害剤の相互作用解析2007

    • 著者名/発表者名
      浅田 直也, 仲西 功, 北浦 和夫
    • 学会等名
      第35回構造活性相関シンポジウム
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2007-11-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18590096
  • 1.  北浦 和夫 (30132723)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 18件
  • 2.  藤井 信孝 (60109014)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 3.  大石 真也 (80381739)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 4.  大野 浩章 (30322192)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 5件

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