• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

皿井 明倫  SARAI Akinori

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 20221286
外部サイト
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2016年度: 九州工業大学, その他の研究科, 教授
2012年度: 九州工業大学, その他の研究科, 教授
2012年度: 九州工業大学, 情報工学研究院, 教授
2008年度 – 2012年度: 九州工業大学, 大学院・情報工学研究院, 教授
2003年度 – 2007年度: 九州工業大学, 情報工学部, 教授 … もっと見る
2001年度 – 2002年度: 理化学研究所, 分子遺伝学研究室, 副主任研究員
2000年度: 理化学研究所, 細胞材料室, 副主任研究員
1999年度: 理化学研究所, 細胞材料開発室, 副主任研究員
1996年度 – 1998年度: 理化学研究所, ジーンバンク室, 副主任研究員
1995年度: 理化学研究所, ジーンバンク室・遺伝情報銀行, 副主任研究員
1994年度: 理化学研究所, ジーンバンク室, 副主任研究員 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
生物系 / 機能生物化学 / 生物系 / ゲノム情報科学 / 理工系
研究代表者以外
医化学一般 / 生物系 / 細胞生物学
キーワード
研究代表者
データベース / 転写因子 / ゲノム / 蛋白質・DNA認識 / 遺伝子発現制御 / バイオインフォマティクス / 相互作用 / 蛋白質 / 協同性 / 統合化 … もっと見る / 生体分子 / 熱力学 / DNA / 安定性 / 構造・機能相関 / 特異的認識 / ターゲット予測 / カロリメトリー / 分子認識 / DNA結合蛋白質 / Antisense / Computer simulation / Thermodynamics / Triplex DNA / アンチセンス / 計算機シミュレーション / 三重鎖DNA / ネットワーク / 未構造領域 / 進化 / 天然変性蛋白質 / 構造 / 分子構造 / 分子ネットワーク / 水 / 蛋白質の安定性 / 付加価値化 / 知識抽出 / 付加価値 / ゲノム解析 / cavity / 構造安定性 … もっと見る
研究代表者以外
p300 / MAZ / Zinc finger / Histone / GC rich element / Deacetylation / Acetylation / Triplex / リン酸化反応 / c-mysプロモーター / 相互作用 / コアクチベーター / ヒストン脱アセチル化 / SP1ファミリー / クロマチン / HAT活性 / コアクチベクター / 三重鎖結合因子 / c-mycプロモーター / zinc finger / ヒストン / GCリッチエレメント / 脱アセチル化 / アセチル化 / 三重鎖 / ヌクレオソーム / ポリメラーゼ / 蛋白質 / 生体分子 / 生物物理 / 生体生命情報学 / 分子動力学計算 / 遺伝子 / 転写因子 / Cdc2 / サイクリン / タンパク質リン酸化酵素 / Weel / 細胞関期 隠す
  • 研究課題

    (23件)
  • 研究成果

    (201件)
  • 共同研究者

    (29人)
  •  計算・情報科学による転写サイクルにおける情報変換機構の解明

    • 研究代表者
      中村 春木
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2016
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  天然変性蛋白質に関する情報の統合と解析研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2011
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  相互作用情報と構造情報を統合した分子ネットワークの構築研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      ゲノム情報科学
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  ゲノムスケールでの転写制御ネットワークの解析研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  転写制御における協同性の網羅的解析研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2008 – 2009
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  ゲノムスケールの転写因子とターゲット予測研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  転写制御における協同性の構造メカニズム研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  転写因子予測に基づく遺伝子発現制御メカニズムの解析研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  協同的転写制御の構造メカニズムの解明研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  生体分子統合データベース・解析システムの構築研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2004
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  蛋白質の安定性と相互作用における水の熱力学的役割研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2004 – 2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      理工系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  生体分子統合データベースの構築とそれに基づく情報解析研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2003
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州工業大学
  •  生体分子統合データベースの構築研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2002
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      特殊法人理化学研究所
  •  蛋白質・DNA認識における構造・特異性相関の研究研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2001
    • 研究種目
      特定領域研究(C)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  転写因子のターゲット予測と認識データベース研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2000
    • 研究種目
      特定領域研究(A)
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  蛋白質、DNA認識における構造、特異性相関の研究研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      2000
    • 研究種目
      特定領域研究(C)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  転写因子のターゲット予測と認識データベース研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      1999
    • 研究種目
      特定領域研究(A)
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  三重鎖結合転写因子MAZとp300/CBPによるクロマチンリモデリング

    • 研究代表者
      横山 和尚 (横山 一成)
    • 研究期間 (年度)
      1999 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      医化学一般
    • 研究機関
      特殊法人理化学研究所
  •  DNA結合蛋白質の機能性cavityと立体構造安定性研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      1998
    • 研究種目
      特定領域研究(A)
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  三重鎖DNA形成のメカニズムとアンチセンスとしての応用研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      1997 – 2000
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      機能生物化学
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  Weelファミリータンパク質リン酸化酵素の機能ドメイン構造の解析

    • 研究代表者
      渡邉 信元
    • 研究期間 (年度)
      1996
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      細胞生物学
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  蛋白質とDNAの分子認識における構造的特性と熱力学的特性の相関研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      1995
    • 研究種目
      重点領域研究
    • 研究機関
      理化学研究所
  •  蛋白質とDNAの分子認識における構造的特性と熱力学的特性の相関研究代表者

    • 研究代表者
      皿井 明倫
    • 研究期間 (年度)
      1994
    • 研究種目
      重点領域研究
    • 研究機関
      理化学研究所

すべて 2013 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 2004 その他

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] NF-E2 p45 Activates Genes Involved in the Regulation of Platelet Function.2013

    • 著者名/発表者名
      Rie Fujita, Mariko Takayama-Tsujimoto, Hironori Satoh, Laura Gutiérrez, Hiroyuki Aburatani, Satoshi Fujii, Akinori Sarai, Emery H. Bresnick, Masayuki Yamamoto, Hozumi Motohashi
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Biology

      巻: 33 ページ: 2659-2670

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [雑誌論文] Analysis of Relationship among Evolvability, Thermodynamics and Function of Intrinsically Disordered Proteins/Regions2012

    • 著者名/発表者名
      H. He and A. Sarai
    • 雑誌名

      Compt. Biol. Chem.

      巻: 41 ページ: 51-57

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] A New Method for Evaluating the Specificity of Indirect Readout in Protein-DNA Recognition2012

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, T. Terada, H. Kono, K. Shimizu and A. Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 40 号: 17 ページ: e129-e129

    • DOI

      10.1093/nar/gks462

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131, KAKENHI-PROJECT-22700317
  • [雑誌論文] Prediction of dinucleotide-specific RNA-binding Sites in Proteins2011

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, Y. Kumagai, D. Standley, K. Mizuguchi, A. Sarai and S. Ahmad
    • 雑誌名

      BMC Bioiformatics 12(Suppl 13)

      巻: S5

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] Prediction of dinucleotide-specific RNA-binding Sites in Proteins2011

    • 著者名/発表者名
      M.Fernandez, Y.Kumagai, D.Standley, K.Mizuguchi, A.Sarai, S.Ahmad
    • 雑誌名

      BMC Bioiformatics

      巻: 12 号: S13

    • DOI

      10.1186/1471-2105-12-s13-s5

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131, KAKENHI-PROJECT-22500277
  • [雑誌論文] Analysis of electric moments of RNA-binding proteins: implications for mechanism and prediction2011

    • 著者名/発表者名
      H. Okayama, T. Kohno, Y. Ishii, Y. Shimada,S. Ahmad and A. Sarai
    • 雑誌名

      BMC Struct. Biol

      巻: 11 ページ: 8-8

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] Analysis of electric moments of RNA-binding proteins : implications for mechanism and prediction2011

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Struct.Biol.

      巻: 11 号: 1 ページ: 8-8

    • DOI

      10.1186/1472-6807-11-8

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] Thermodynamic Database for Proteins : Features and Applications2010

    • 著者名/発表者名
      M.M.Gromiha, A.Sarai
    • 雑誌名

      Methods Mol.Biol.

      巻: 609 ページ: 97-112

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22113516
  • [雑誌論文] CCR XP: Exploring clusters of conserved residues in protein structures2010

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad, O. Keskin, K. Mizuguchi, A. Sarai and R. Nussinov
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res

      巻: 38

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] CCR XP : Exploring clusters of conserved residues in protein structures2010

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, O.Keskin, K.Mizuguchi, A.Sarai, R.Nussinov
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 38

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] Prediction of mono-and dinucleotide-specific DNA-binding proteins using neural networks2009

    • 著者名/発表者名
      M.Andrabi, K.Mizuguchi, A.Sarai, S.Ahmad
    • 雑誌名

      BMC Struct.Biol. 9

      ページ: 30-30

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] MHC class II DR classification based on antigen-binding groove natural selection2009

    • 著者名/発表者名
      S.Takeshima, A.Sarai, A.Saitou, Y.Aida
    • 雑誌名

      BMC Struct.Biol. 385

      ページ: 137-142

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] PrognoScan : a new database for meta-analysis of the prognostic value of genes2009

    • 著者名/発表者名
      H.Mizuno, K.Kitada, K.Nakai, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Medical Genomics 2

      ページ: 18-18

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] A Generalized Conformational Energy Function of DNA Derived from Molecular Dyamics Simulations2009

    • 著者名/発表者名
      S.Yamasaki, T.Terada, K.Shimizu, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nuxleic Acids Res. 37

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] Evaluation of DNA intramolecular interactions for nucleosome positioning in yeast2009

    • 著者名/発表者名
      M.Fernandez, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      Genome Inform. 23

      ページ: 13-20

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] Evaluation of DNA intramolecular interactions for nucleosome positioning in yeast2009

    • 著者名/発表者名
      M.Fernandez, S.fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      Genome Inform. 23

      ページ: 13-20

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] A signature-based method for indexing cell cycle phase distribution from microarray profiles2009

    • 著者名/発表者名
      H.Mizuno, Yo Nakanishi, N.Ishii, A.Sarai, K.Kitada
    • 雑誌名

      BMC Genomics 10

      ページ: 137-137

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] PrognoScan : a new database for meta-analysis of the prognostic value of genes2009

    • 著者名/発表者名
      H.Mizuno, K.Kitada, K.Nakai, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Medical Genomics 2

      ページ: 18-18

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] MHC class II DR classification based on antigen-binding groove natural selection2009

    • 著者名/発表者名
      S.Takeshima, A.Sarai, A.Saitou, Y.Aida
    • 雑誌名

      Biochem. Biophys. Res.Comm. 385

      ページ: 137-142

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] A signature-based method for indexing cell cycle phase distribution from microarray profiles2009

    • 著者名/発表者名
      H.Mizuno, Yo Nakanishi, N.Ishii, A.Sarai, K.Kitada
    • 雑誌名

      BMC Genomics 10

      ページ: 137-137

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] A signature-based method for indexing cell cycle phase distribution from microarray profiles2009

    • 著者名/発表者名
      H.Mizuno, Yo Nakanishi, N.Ishii, A.Sarai, K.Kitada
    • 雑誌名

      BMC Genomics 10

      ページ: 137-137

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] Evaluation of DNA intramolecular interactions for nucleosome positioning in yeast2009

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, S. Fujii, H. Kono and A. Sarai
    • 雑誌名

      Genome Inform.

      巻: 23 ページ: 13-20

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] A Generalized Conformational Energy Function of DNA Derived from Molecular Dynamics Simulations2009

    • 著者名/発表者名
      S.Yamasaki, T.Terada, K.Shimizu, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 37

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] Prediction of mono- and dinucleotide-specific DNA-binding sites in proteins using neural networks2009

    • 著者名/発表者名
      M.Andrabi, K.Mizuguchi, A.Sarai, S.Ahmad
    • 雑誌名

      BMC Struct. Biol. 9

      ページ: 30-30

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] Evaluation of DNA intramolecular interactions for nucleosome positioning in yeast2009

    • 著者名/発表者名
      M.Fernandez, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      Genome Inform. 23

      ページ: 13-20

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] MHC class II DR classification based on antigen-binding groove natural selection2009

    • 著者名/発表者名
      S.Takeshima, A.Sarai, A.Saitou, Y.Aida
    • 雑誌名

      Biochem.Biophys.Res.Comm. 385

      ページ: 137-142

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] A Generalized Conformational Energy Function of DNA Derived from Molecular Dynamics Simulations2009

    • 著者名/発表者名
      S.Yamasaki, T.Terada, K.Shimizu, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 37

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] PrognoScan : a new database for meta-analysis of the prognostic value of genes2009

    • 著者名/発表者名
      H.Mizuno, K.Kitada, K.Nakai, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Medical Genomics 2

      ページ: 18-18

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] Prediction of mono-and dinucleotide-specfic DNA-binding sites in proteins using neural networks2009

    • 著者名/発表者名
      M.Andrabi, K.Mizuguchi, A.Sarai, S.Ahmad
    • 雑誌名

      BMC Struct.Biol. 9

      ページ: 30-30

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] Prediction of mono- and dinucleotide-specific DNA- binding sites in proteins using neural networks2009

    • 著者名/発表者名
      M. Andrabi, K. Mizuguchi, A. Sarai and S. Ahmad
    • 雑誌名

      BMC Struct. Biol

      巻: 9 ページ: 30-30

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [雑誌論文] uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs2008

    • 著者名/発表者名
      A.V. Kochetov, S. Ahmad, V.I. Ivanisenko, N. A. Kolchanovand A. Sarai
    • 雑誌名

      FEBS Lett 582

      ページ: 1293-1297

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] Sequence-based prediction of residue-level properties in proteins2008

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad, Y. H. Singh, M. J. Araitzo-Bravo, A. Sarai
    • 雑誌名

      Machine Learning in Bioinformatics Chap. 7

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] Protein-DNA interactions : Structural, thermodynamic and clustering patterns of conserved residues in DNA-binding proteins2008

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad, O. Keskin, A. Sarai and R. Nussino V
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 36

      ページ: 5922-5932

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] Protein-DNA interactions : Structural, thermodynamic and clustering patterns of conserved residues in DNA-binding proteins2008

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad, O. Keskin, A. Sarai and R. Nussinov
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res 36

      ページ: 5922-5932

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] uORFs, reinitiation and alternative translation start sites in human mRNAs2008

    • 著者名/発表者名
      A.V. Kochetov, S. Ahmad, V.I. Ivanisenko, N. A. Kolchanovand A. Sarai
    • 雑誌名

      FEBS Lett 582

      ページ: 1293-1297

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] △G-based prediction and experimental confirmation of SYCRP I-binding sites on Synechocystis genome2008

    • 著者名/発表者名
      K. Omagari, H. Yoshimura, T. Suzuki, M. Takano, M. Ohmori, and A. Sarai
    • 雑誌名

      FEBS J. 275

      ページ: 4786-4795

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] △G-based prediction and experimental confirmation of SYCRP1-binding sites on Synechocystis genome2008

    • 著者名/発表者名
      K. Omagari, H. Yoshimura, T. Suzuki, M. Takano, M. Ohmori, and A. Sarai
    • 雑誌名

      FEBS J. 275

      ページ: 4786-4795

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [雑誌論文] Sequence-based prediction of residue-level properties in proteins2008

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad, Y. H. Singh, M. J. Aranzo-Bravo, A. Sarai
    • 雑誌名

      Machine Learning in Bioinformatics Chap. 7

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [雑誌論文] Sequence-Dependent DNA Deformability Studied using Molecular Dynamics Simulations2007

    • 著者名/発表者名
      S. Fujii, H. Kono, S. Takenaka, N. Go and A. Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. doi:10.1093

      ページ: 1-12

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [雑誌論文] Sequence-Dependent DNA Deformability Studied using Molecular Dynamics Simulations2007

    • 著者名/発表者名
      S. Fujii, H. Kono, S. Takenaka, N. Go and A. Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. doi:10.1093

      ページ: 1-12

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [雑誌論文] DNA deformability and hydration studied by molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Yonetani, H. Kono, S. Fujii, A. Sarai, and N. Go
    • 雑誌名

      Mol. Simulation 33

      ページ: 103-107

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [雑誌論文] Role of DNA Conformational Change in the Specificity of Drug-DNA Recognition2007

    • 著者名/発表者名
      M. J. Arauzo-Bravo and A. Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. doi:10.1093/nar/gkm892

      ページ: 1-11

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [雑誌論文] DNA deformability and hydration studied by molecular dynamics simulation2007

    • 著者名/発表者名
      Y. Yonetani, H. Kono, S. Fujii, A. Sarai, and N. Go
    • 雑誌名

      Mol. Simulation 33

      ページ: 103-107

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [雑誌論文] Role of DNA Conformational Change in the Specificity of Drug-DNA Recognition2007

    • 著者名/発表者名
      M. J. Arauzo-Bravo and A. Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. doi:10.1093/nar/gkm892

      ページ: 1-11

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [雑誌論文] ReadOut : Structure-based Calculation of Direct and Indirect Readout Energies and Specificities for Protein-DNA Recognition2006

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, H.Kono, M.J.Arauzo-Bravo, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [雑誌論文] Atom-wise Statistics and Prediction of Solvent Accessibility in Proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Y.H.Singh, M.M.Gromiha, A.Sarai, S.Ahmad
    • 雑誌名

      Biophys. Chem. 124

      ページ: 145-154

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [雑誌論文] Dimensionality of amino acid space and solvent accessibility prediction with neural networks2006

    • 著者名/発表者名
      M.J.Arauzo-Bravo, S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      Compt. Biol. Chem. 30

      ページ: 160-168

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [雑誌論文] Dimensionality of amino acid space and solvent accessibility prediction with neural networks2006

    • 著者名/発表者名
      M.J.Arauzo-Bravo, S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      Compt. Biol. Chem. 30

      ページ: 160-168

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [雑誌論文] ProTherm and ProNIT : Thermodynamic Databases for Proteins and Protein-Nucleic Acid Interactions2006

    • 著者名/発表者名
      M.D.Shaji Kumar, K.A.Bava, M.M.Gromiha, P.Prabakaran, K.Kitajima, H.Uedaira, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17054031
  • [雑誌論文] ProTherm and ProNIT : Thermodynamic Databases for Proteins and Protein-Nucleic Acid Interactions2006

    • 著者名/発表者名
      M.D.Shaji Kumar, K.A.Bava, M.M.Gromiha, P.Prabakaran, K.Kitajima, H.Uedaira, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] Atom-wise Statistics and Prediction of Solvent Accessibility in Proteins2006

    • 著者名/発表者名
      Y.H.Singh, M.M.Gromiha, A.Sarai, S.Ahmad
    • 雑誌名

      Biophys. Chem. 124

      ページ: 145-154

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [雑誌論文] Classification of Protein-DNA Complexes Based on Structural Descriptors2006

    • 著者名/発表者名
      Prabakaran, J.G., Siebers, S., Ahmad, M.M., Gromiha, M.G., Singarayan, A.Sarai
    • 雑誌名

      Structure 14

      ページ: 1355-1367

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [雑誌論文] ReadOut : Structure-based Calculation of Direct and Indirect Readout Energies and Specificities for Protein-DNA Recognition2006

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, H.Kono, M.J.Arauzo-Bravo, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [雑誌論文] Classification of Protein-DNA Complexes Based on Structural Descriptors2006

    • 著者名/発表者名
      Prabakaran, J.G.Siebers, S.Ahmad, M.M.Gromiha, M.G.Singarayan, A.Sarai
    • 雑誌名

      Structure 14

      ページ: 1355-1367

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [雑誌論文] ProTherm and ProNIT : Thermodynamic Databases for Proteins and Protein-Nucleic Acid Interactions2006

    • 著者名/発表者名
      M.D.Shaji Kumar, K.A.Bava, M.M.Gromiha, P.Prabakaran, K.Kitajima, H.Uedaira, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 34

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017030
  • [雑誌論文] Sequence-Dependent Conformational Energy of DNA Derived from Molecular Dynamics Simulations : Toward Understanding the Indirect Readout Mechanism in Protein-DNA Recognition2005

    • 著者名/発表者名
      M.J.Arauzo-Bravo, S.Ahmad, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 127

      ページ: 16074-16089

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017030
  • [雑誌論文] PSSM-based prediction of DNA binding sites in proteins2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 6

      ページ: 33-33

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017030
  • [雑誌論文] Protein-DNA Recognition Patterns and Predictions2005

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai, H.Kono
    • 雑誌名

      Ann.Rev.Biophys.Biomol.Struct. 34

      ページ: 379-398

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014219
  • [雑誌論文] The role of alternative translation start sites in the generation of human protein diversity2005

    • 著者名/発表者名
      A.V.Kochetov, A.Sarai, V.K.Shumny, N.A.Kolchanov
    • 雑誌名

      Mol.Genetics and Genomics 273

      ページ: 491-496

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017030
  • [雑誌論文] Protein-DNA Recognition Patterns and Predictions2005

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai, H.Kono
    • 雑誌名

      Ann.Rev.Biophys.Biomol.Struct. 34

      ページ: 379-398

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17017030
  • [雑誌論文] Integration of Bioinformatics and Computational Biology to Understand Protein-DNA Recognition Mechanism2005

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai, J.Siebers, S.Selvaraj, M.M.Gromiha, H.Kono
    • 雑誌名

      J.Bioinf.Compt.Biol. 3

      ページ: 169-183

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] Protein-DNA Recognition Patterns and Predictions2005

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai, H.Kono
    • 雑誌名

      Ann.Rev.Biophys.Biomol.Struct. 34

      ページ: 379-398

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] PSSM-based prediction of DNA binding sites in proteins2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 6

      ページ: 33-33

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17054031
  • [雑誌論文] PSSM-based prediction of DNA binding sites in proteins2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 6

      ページ: 33-33

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] PSSM-based prediction of DNA binding sites in proteins2005

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      IBMC Bioinformatics 6

      ページ: 33-33

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014219
  • [雑誌論文] Protein-DNA Recognition Patterns and Predictions2005

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai, H.Kono
    • 雑誌名

      Ann.Rev.Biophys.Biomol.Struct. 34

      ページ: 379-398

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17054031
  • [雑誌論文] Sequence-Dependent Conformational Energy of DNA Derived from Molecular Dynamics Simulations : Toward Understanding the Indirect Readout Mechanism in Protein-DNA Recognition2005

    • 著者名/発表者名
      M.J.Arauzo-Bravo, S.Ahmad, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 127

      ページ: 16074-16089

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17054031
  • [雑誌論文] Sequence-Dependent Conformational Energy of DNA Derived from Molecular Dynamics Simulations : Toward Understanding the Indirect Readout Mechanism in Protein-DNA Recognition2005

    • 著者名/発表者名
      M.J.Arauzo-Bravo, S.Ahmad, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      J.Am.Chem.Soc. 127

      ページ: 16074-16089

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] The role of alternative translation start sites in the generation of human protein diversity2005

    • 著者名/発表者名
      A.V.Kochetov, A.Sarai, V.K.Shumny, N.A.Kolchanov
    • 雑誌名

      Mol.Genetics and Genomics 273

      ページ: 491-496

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17054031
  • [雑誌論文] ASAView : Database and tool for solvent accessibility representation in proteins2004

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, M.M.Gromiha, H.Fawareh, A.Sarai
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics 5

      ページ: 51-51

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014219
  • [雑誌論文] Thermal stability and function of Myb protein2004

    • 著者名/発表者名
      H.Uedaira, A.Sarai
    • 雑誌名

      Comprehensive Handbook of Calorimetry and Thermal Analysis

      ページ: 422-424

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] Qgrid : Clustering tool for detecting charged and hydrophobic regions in proteins2004

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 32

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014219
  • [雑誌論文] Thermodynamic database for biomolecules2004

    • 著者名/発表者名
      H.Uedaira, A.Sarai
    • 雑誌名

      Comprehensive Handbook of Calorimetry and Thermal Analysis

      ページ: 276-279

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] Thermal stability and function of Myb protein2004

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai, P Prabakaran, H.Uedaira
    • 雑誌名

      Comprehensive Handbook of Calorimetry and Thermal Analysis

      ページ: 280-284

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] Intermolecular and Intramolecular Readout Mechanisms in Protein-DNA Recognition2004

    • 著者名/発表者名
      M.M.Gromiha, J.G.Siebers, S.Selvaraj, H.Mono, A.Sarai
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 337

      ページ: 285-294

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014219
  • [雑誌論文] Intermolecular and Intramolecular Readout Mechanisms in Protein-DNA Recognition2004

    • 著者名/発表者名
      M.M.Gromiha, J.G.Siebers, S.Selvaraj, H.Kono, A.Sarai
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 337

      ページ: 285-294

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16041235
  • [雑誌論文] Moment-based Prediction of DNA-binding Proteins2004

    • 著者名/発表者名
      S.Ahmad, A.Sarai
    • 雑誌名

      J.Mol.Biol. 65-71

      ページ: 65-71

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16014219
  • [雑誌論文] Analysis of Relationship among Evolvability, Thermodynamics and Function of Intrinsically Disordered Proteins/Regions

    • 著者名/発表者名
      H.He, A.Sarai
    • 雑誌名

      Compt.Biol.Chem.

      巻: (掲載確定)

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22113516
  • [学会発表] Biophysics of molecular interaction network2013

    • 著者名/発表者名
      A. Sarai
    • 学会等名
      The First BMIRC International Symposium on Frontiers in Computational Systems Biology and Bioengineering
    • 発表場所
      飯塚
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Analysis of Domain and Non-Domain Interactions in Protein-Protein Interaction Network2012

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Komori, Satoshi Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Integration of Structural and Biochemical Information into Protein Interaction Network2012

    • 著者名/発表者名
      Yuji Kawakami, Satoshi Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Analysis of Domain and Non-Domain Interactions in Protein-Protein Interaction Network2012

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Komori, Satoshi Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] The influence of solvent condition on DNA structures studied by molecular dynamics simulations2012

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Analysis of Transcriptional Regulation Network of Yeast2012

    • 著者名/発表者名
      Kazumasa Yada, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      タワーホール船堀(東京都江戸川区)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] A New Method for Evaluating the Specificity of Indirect Readout in Protein-DNA Recognition2012

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, T. Terada, H. Kono, K. Shimizu, A. Sarai
    • 学会等名
      European Conference on Computational Biology
    • 発表場所
      Basel, Switzerland
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Ion distribution in the EcoRV(restriction enzyme)-DNA complexcalculated by using 3D-RISM2012

    • 著者名/発表者名
      J.Yasuniwa, Y. Maruyama, N. Yoshida, A. Sarai, F. Hirata, M. Irisa
    • 学会等名
      Foundations of Molecular Modeling and Simulation
    • 発表場所
      Mt. Hood, Oregon, USA
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Integration of Structural and Biochemical Information into Protein Interaction Network2012

    • 著者名/発表者名
      Yuji Kawakami, Satoshi Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] A New Method for Evaluating the Specificity of Indirect Readout in Protein-DNA Recognition2012

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, T. Terada, H. Kono, K.Shimizu, and A. Sarai
    • 学会等名
      European Conference on Computational Biology
    • 発表場所
      Basel, Switzerland
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] The influence of solvent condition on DNA structures studied by molecular dynamics simulations2012

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono and Akinori Sarai
    • 学会等名
      第50回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      名古屋
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] 3D-RISMを用いた酵素-DNA 複合体中の水和水分布計算2012

    • 著者名/発表者名
      本松良太, 安庭潤治, 丸山豊, 吉田紀生, 皿井明倫, 平田文男, 入佐正幸
    • 学会等名
      第35回溶液化学シンポジウム
    • 発表場所
      早稲田大学(東京)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • [学会発表] Intrinsically disordered proteins/regions : an important factor in protein evolvability2011

    • 著者名/発表者名
      He Huang, Akinori Sarai
    • 学会等名
      19th ISMB/10th ECCB Annual International Conference
    • 発表場所
      Wien, Austria
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22113516
  • [学会発表] Analysis of relationship among evolvability, thermodynamic characteristics and function of intrinsically disordered proteins/regions2011

    • 著者名/発表者名
      He Huang, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第49回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      姫路
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22113516
  • [学会発表] Construction and Analysis of Protein-Protein Interaction Network Based on Domain and Non-Domain Interactions2011

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Komori, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      CBI/JSBi2011合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Integration of Structural and Biochemical Information into Protein Interaction Network2011

    • 著者名/発表者名
      Yuji Kawakami, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      CBI/JSBi2011合同大会
    • 発表場所
      神戸
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Construction and Analysis of Biomolecular Network based on Domain Structures2010

    • 著者名/発表者名
      Yukari Hayashi, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      2010年日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Thermodynamic analyses of intrinsically disordered proteins2010

    • 著者名/発表者名
      黄鶴、皿井明倫
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22113516
  • [学会発表] Construction and Analysis of Biomolecular Network in Structurome2010

    • 著者名/発表者名
      Yukari Hayashi, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      仙台
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Evolutionary and thermodynamic analyses of intrinsically disordered proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Huang He, Akinori Sarai
    • 学会等名
      2010年日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22113516
  • [学会発表] Motif Analysis of Transcription Factors in Regulatory Region2009

    • 著者名/発表者名
      T.Sakai, S.Fujii, A.Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] ベイズ統計学的解釈によるタンパク質-DNA認識におけるindirect readoutの評価2009

    • 著者名/発表者名
      山崎智, 福井一彦, 河野秀俊, 清水謙多郎, 皿井明倫, 寺田透
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] ストラクチュロームにおける分子ネットワークの系統的解析2009

    • 著者名/発表者名
      Mitsuaki Ohtsuaka, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Protein-DNA Recognition Mechanism and Prediction2009

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai
    • 学会等名
      Albany 2009 : the 16th Conversation
    • 発表場所
      Albany, NY, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Protein-DNA Recognition Mechanism and Prediction2009

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai
    • 学会等名
      Albany 2009 : The 16th Conversation
    • 発表場所
      Albany, NY, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] 構造情報に基づく蛋白質・DNA認識における協同性の解析2009

    • 著者名/発表者名
      A.Tanaka, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Evaluation of DNA intramolecular interactions for nucleosome positioning in yeast2009

    • 著者名/発表者名
      M.Fernandez, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 学会等名
      GIW2009
    • 発表場所
      Yokohama
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] 未構造タンパク質の機能的進化的特性:生物種特異的解析2009

    • 著者名/発表者名
      黄鶴、皿井明倫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Stability, Dynamics and Cooperativity of Protein-DNA Interactions2009

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      Tokyo
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] 生体分子の熱力学データと構造データの統合2009

    • 著者名/発表者名
      皿井明倫、Shaji Kumar
    • 学会等名
      文科省統合データベースプロジェクトシンポジウム「データベースが拓くこれらのライフサイエンス」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-06-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Kinase Inhibition modeling by Proteometrics and docking analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Michael Fernandez, Ahmad Shandar, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Construction and Analysis of Biomolecular Network based on Domain Structures2009

    • 著者名/発表者名
      Yukari Hayashi, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] 転写因子のゲノヘスケールでのターケット予測:相互作用情報を用いた方法2009

    • 著者名/発表者名
      大庭宏明、藤井聡、皿井明倫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] The effect of environment on the conformational transition of DNA Studied by molecular dynamics simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Nobuhiro Go, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] 転写因子のゲノムスケールでのターゲット予測:相互作用情報を用いた方法2009

    • 著者名/発表者名
      大庭宏明、藤井聡、皿井明倫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Kinase Inhibition modeling by Proteometrics and docking analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Michael Fernandez, Ahmad Shandar, Akinori Sarai
    • 学会等名
      CBI-KSBSB Joint Conference
    • 発表場所
      Busan, Korea
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Construction and Analysis of Biomolecular Network based on Domain Structures2009

    • 著者名/発表者名
      Yukari Hayashi, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Kinase Inhibition modeling by Proteometrics and docking analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Michael Fernandez, Ahmad Shandar, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Kinase Inhibition modeling by Proteometrics and docking analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Michael Fernandez, Ahmad Shandar, Akinori Sarai
    • 学会等名
      CBI-KSBSB Joint Conference
    • 発表場所
      Busan, Korea
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] 生体分子の熱力学データと構造データの統合2009

    • 著者名/発表者名
      皿井明倫、Shaji Kumar
    • 学会等名
      文科省統合データベースプロジェクトシンポジウム「データベースが拓くこれからのライフサイエンス」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-06-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Recognition of protease inhibition pattern using topological interaction matrix and genetic algorithm-optimized support vector machines2009

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, S. Ahmad, and A. Sarai
    • 学会等名
      PRIB2008
    • 発表場所
      Melbourne, Australia
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Stability, Dynamics and Cooperativity of Protein-DNA Interactions2009

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      Tokyo
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] 未構造タンパク質の機能的進化的特性:生物種特異的解析2009

    • 著者名/発表者名
      黄鶴、皿井明倫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] The effect of environment on the conformational transition of DNA studied by molecular dynamics simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Nobuhiro Go, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] ベイズ統計学的解釈によるタンパク質-DNA認識におけるindirect readoutの評価2009

    • 著者名/発表者名
      山崎智, 福井一彦, 河野秀俊, 清水謙多郎, 皿井明倫, 寺田透
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] 生体分子の熱力学データと構造データの統合2009

    • 著者名/発表者名
      皿井明倫、Shaji Kumar
    • 学会等名
      文科省統合データベースプロジェクトシンポジウム「データベースが拓くこれからのライフサイエンス」
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2009-06-12
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] The effect of environment on the conformational transition of DNA studied by molecular dynamics simulations2009

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Nobuhiro Go, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] 構造情報に基づく蛋白質・DNA認識における協同性の解析2009

    • 著者名/発表者名
      A.Tanaka, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] ストラクチュロームにおける分子ネットワークの系統的解析2009

    • 著者名/発表者名
      Mitsuaki Ohtsuaka, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] ストラクチュロームにおける分子ネットワークの系統的解析2009

    • 著者名/発表者名
      Mitsuaki Ohtsuaka, Satoshi Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Electric moments of RNA-binding proteins2009

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad and A. Sarai
    • 学会等名
      ISMB2008
    • 発表場所
      Toronto, Canada
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Motif Analysis of Transcription Factors in Regulatory Region2009

    • 著者名/発表者名
      T.Sakai, S.Fujii, A.Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] 未構造タンパク質の機能的進化的特性 : 生物種特異的解析2009

    • 著者名/発表者名
      黄鶴、皿井明倫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2009

    • 著者名/発表者名
      M.Ohtsuaka, S.Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      ISMB/ECCB 2009
    • 発表場所
      Skockholm, Sweden
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Motif Analysis of Transcription Factors in Regulatory Region2009

    • 著者名/発表者名
      T.Sakai, S.Fujii, A.Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Kinase Inhibition modeling by Proteometrics and docking analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Michael Fernandez, Ahmad Shandar, Akinori Sarai
    • 学会等名
      CBI-KSBSB Joint Conference
    • 発表場所
      Busan, Korea
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2009

    • 著者名/発表者名
      M.Ohtsuaka, S.Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      ISMB/ECCB 2009
    • 発表場所
      Skockholm, Sweden
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Stability, Dynamics and Cooperativity of Protein-DNA Interactions2009

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai
    • 学会等名
      International Symposium on Multi-Scale Dynamics of Protein Complex Formation and Function
    • 発表場所
      Tokyo
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Protein-DNA Recognition Mechanism and Prediction2009

    • 著者名/発表者名
      A.Sarai
    • 学会等名
      Albany 2009 : The 16th Conversation
    • 発表場所
      Albany, NY, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Evaluation of DNA intramolecular interactions for nucleosome positioning in yeast2009

    • 著者名/発表者名
      M.Fernandez, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 学会等名
      GIW2009
    • 発表場所
      Yokohama
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Kinase Inhibition modeling by Proteometrics and docking analysis2009

    • 著者名/発表者名
      Michael Fernandez, Ahmad Shandar, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] 転写因子のゲノムスケールでのターゲット予測 : 相互作用情報を用いた方法2009

    • 著者名/発表者名
      大庭宏明、藤井聡、皿井明倫
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] 構造情報に基づく蛋白質・DNA認識における協同性の解析2009

    • 著者名/発表者名
      A.Tanaka, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] ベイズ統計学的解釈によるタンパク質-DNA認識におけるindirect readoutの評価2009

    • 著者名/発表者名
      山崎智, 福井一彦, 河野秀俊, 清水謙多郎, 皿井明倫, 寺田透
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21310131
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2009

    • 著者名/発表者名
      M.Ohtsuaka, S.Fujii, Akinori Sarai
    • 学会等名
      ISMB/ECCB 2009
    • 発表場所
      Skockholm, Sweden
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Evaluation of DNA intramolecular interactions for nucleosome positioning in yeast2009

    • 著者名/発表者名
      M.Fernandez, S.Fujii, H.Kono, A.Sarai
    • 学会等名
      GIW2009
    • 発表場所
      Yokohama
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Role of electric moments in RNA-recognition by proteins2008

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad and A. Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Analysis of environment-dependent conformational transition of DNA by molecular dynamics simulations2008

    • 著者名/発表者名
      S. Fujii, H. Kono, N. Go and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] ProNIT : Database Development and Integration2008

    • 著者名/発表者名
      M.D. Shaji Kumar, P. Prabakaran, M.M. Gromiha, H. Uedaira, K. Kitajima, and A. Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Role of electric moments in RNA-recognition by proteins2008

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad and A. Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Electric moments of RNA-binding proteins2008

    • 著者名/発表者名
      S. Ahmad and A. Sarai
    • 学会等名
      ISMB2008
    • 発表場所
      Toronto, Canada
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ohtsuka, S. Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Ligand-target data modeling using Genetic Algorithm-optimized Bayesian Regularized Neural Networks and Support Vectors Machines2008

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, A. Sarai and J. Caballero
    • 学会等名
      IASC 2008
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Recognition of protease inhibition pattern using topological interaction matrix and genetic algorithm-optimized support vector machines2008

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, S. Ahmad, and A. Sarai
    • 学会等名
      PRIB2008
    • 発表場所
      Melbourne, Australia
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Proteometric Modeling of Protein Conformational Stability using Amino Acid Sequence Autocorrelation Vectors and Sumport Vector Machines2008

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, S. Ahmad, and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Integration of Thermodynamic and Structural Data2008

    • 著者名/発表者名
      A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] A New DNA-deformation energy function taking account of the anharmonicity of the conformational distribution2008

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, T. Terada, K. Shimizu, H. Kono and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Genome-wide prediction of target of transcriptional factor with interaction data2008

    • 著者名/発表者名
      H. Ohba, A. Sarai and S. Fujii
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ohtsuka, S. Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Evaluation of dinucleotide intramolecular interactions on nucleosome positioning2008

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, S. Fujii, H. Kono, and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Analyses of Functional and Evolutionary Characteristics of Disordered Proteins2008

    • 著者名/発表者名
      H. Huang, and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ohtsuka, S. Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Genome-wide prediction of target of transcriptional factor with interaction data2008

    • 著者名/発表者名
      H. Ohba, A. Sarai and S. Fujii
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Prediction of base-specific contacts and contact-types in DNA-binding proteins2008

    • 著者名/発表者名
      M. Andrabi, K. Mizuguchi, A. Sarai and S. Ahmad
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2008

    • 著者名/発表者名
      M. Ohtsuka, S. Fujii and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Analysis of environment-dependent conformational transition of DNA by molecular dynamics simulations2008

    • 著者名/発表者名
      S. Fujii, H. Kono, N. Go and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Prediction of base-specific contacts and contact-types in DNA-binding proteins2008

    • 著者名/発表者名
      M. Andrabi, K. Mizuguchi, A. Sarai and S. Ahmad
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Sequence-dependent DNA deformability and hydtration studied by molecular dynamics simulations2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Yonetani, S. Fujii, A. Sarai, H. Kono, and N. Go
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Analyses of Functional and Evolutionary Characteristics of Disordered Proteins2008

    • 著者名/発表者名
      H. Huang, and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Evaluation of dinucleotide intramolecular interactions on nucleosome Dositioning2008

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, S. Fujii, H. Kono, and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] ProNIT : Database Development and Integration2008

    • 著者名/発表者名
      M.D. Shaji Kumar, P. Prabakaran, M.M. Gromiha, H. Uedaira, K. Kitajima, and A. Sarai
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      大阪
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Sequence-dependent DNA deformability and hydtration studied by molecular dynamics simulations2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Yonetani, S. Fujii, A. Sarai, H. Kono, and N. Go
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Integration of Thermodynamic and Structural Data2008

    • 著者名/発表者名
      A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] A New DNA-deformation energy function taking account of the anharmonicity of the conformational distribution2008

    • 著者名/発表者名
      S. Yamasaki, T. Terada, K. Shimizu, H. Kono and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20052021
  • [学会発表] Proteometric Modeling of Protein Conformational Stability using Amino Acid Seauence Autocorrelation Vectors and Support Vector Machines2008

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, S. Ahmad, and A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Ligand-target data modeling using Genetic Algorithm-optimized Bayesian Regularized Neural Networks and Support Vectors Machines2008

    • 著者名/発表者名
      M. Fernandez, A. Sarai and J. Caballero
    • 学会等名
      IASC 2008
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20016022
  • [学会発表] Networks of conserved residue in DNA-binding proteins: analogy with hotspots and implications to prediction2007

    • 著者名/発表者名
      Shandar Ahmad, Ozlem Keskin, Ruth Nussinov and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] 出芽酵母ゲノムの転写制御ネットワークの解析2007

    • 著者名/発表者名
      T. Ueno, H. Kono, A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] ストラクチュロームでの分子ネットワークの構築と解析2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsunobu Sekitou and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] DNA塩基と蛋白質アミノ酸の相互作用自由エネルギーランドスケープ2007

    • 著者名/発表者名
      Tomoki Yoshida, Hideo Doi, Misako Aida, Hidetoshi Kono, Shaji Kumar, Michael M. Gromiha, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] 蛋白質・DNA複合体構造の分類2007

    • 著者名/発表者名
      Ponraj Prabakaran, Shandar Ahmad, M. Michael Gromiha, Maria G. Singarayan, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      仙台
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsunobu Sekitou and Akinori Sarai
    • 学会等名
      第7回国際ゲノム会議
    • 発表場所
      東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] 出芽酵母ゲノムの転写制御ネットワークの解析2007

    • 著者名/発表者名
      T. Ueno, H. Kono, A. Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] Networks of conserved residue in DNA-binding proteins: analogy with hotspots and implications to prediction2007

    • 著者名/発表者名
      Shandar Ahmad, Ozlem Keskin, Ruth Nussinov and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] 蛋白質・DNA認識におけるDNAバックボーンコンフォメーションの役割2007

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Shigeori Takenaka, Nobuhiro Go, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] 蛋白質-DNA認識における配列依存的DNAリン酸骨格コンフォーメーションの役割2007

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Shigeori Takenaka, Nobuhiro Go and Akinri Sarai
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      仙台
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] 酵母ゲノムでのDNA結合蛋白質の予測2007

    • 著者名/発表者名
      Antony Ngahu, Takuya Ueno, Shandar Ahmad, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] Prediction of DNA-binding sites from sequence and structure using machine learning: Improvements and Benchmarking2007

    • 著者名/発表者名
      Munazah Andrabi, Shandar Ahmad, Kenji Mizuguchi, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] DNA Sequence-Dependent Deformability Associated With Hydration-Implication For Indirect Readout In Protein-DNA Interactions-2007

    • 著者名/発表者名
      H. Kono, Y. Yonetani, S. Fujii, A. Sarai, N. Go
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsunobu Sekitou and Akinori Sarai
    • 学会等名
      2007年日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] 蛋白質・DNA複合体構造の分類2007

    • 著者名/発表者名
      Ponraj Prabakaran, Shandar Ahmad, M. Michael Gromiha, Maria G. Singarayan, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      仙台
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsunobu Sekitou and Akinori Sarai
    • 学会等名
      2007年日本バイオインフォマティクス学会年会
    • 発表場所
      東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] Analysis of Biomolecular Network in Structurome2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsunobu Sekitou and Akinori Sarai
    • 学会等名
      第7回国際ゲノム会議
    • 発表場所
      東京
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] 酵母ゲノムでのDNA結合蛋白質の予測2007

    • 著者名/発表者名
      Antony Ngahu, Takuya Ueno, Shandar Ahmad, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] DNA塩基と蛋白質アミノ酸の相互作用自由エネルギーランドスケープ2007

    • 著者名/発表者名
      Tomoki Yoshida, Hideo Doi, Misako Aida, Hidetoshi Kono, Shaii Kumar, Michael M. Gromiha, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] DNA Sequence-Dependent Deformability Associated With Hydration-Implication For Indirect Readout In Protein-DNA Interactions-2007

    • 著者名/発表者名
      H. Kono, Y. Yonetani, S. Fujii, A. Sarai, N. Go
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] 蛋白質・DNA認識におけるDNAバックボーンコンフォメーションの役割2007

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Shigeori Takenaka, Nobuhiro Go, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] Role of sequence-dependent DNA conformation in the DNA sequence recognition by proteins and drugs2007

    • 著者名/発表者名
      Akinori Sarai, Satoshi Fujii, Marcos J. Arauzo-Bravo and Hidetoshi Kono
    • 学会等名
      15th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
    • 発表場所
      Wien, Austria
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] Role of sequence-dependent DNA conformation in the DNA sequence recognition by proteins and drugs2007

    • 著者名/発表者名
      Akinori Sarai, Satoshi Fujii, Marcos J. Arauzo-Bravo and Hidetoshi Kono
    • 学会等名
      15th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology
    • 発表場所
      Wien, Austria
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] ストラクチュロームでの分子ネットワークの構築と解析2007

    • 著者名/発表者名
      Mitsunobu Sekitou and Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] 蛋白質-DNA認識における配列依存的DNAリン酸骨格コンフォーメーションの役割2007

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Shigeori Takenaka, Nobuhiro Go and Akinri Sarai
    • 学会等名
      第7回日本蛋白質科学会
    • 発表場所
      仙台
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18055026
  • [学会発表] Prediction of DNA-binding sites from sequence and structure using machine learning: Improvements and Benchmarking2007

    • 著者名/発表者名
      Munazah Andrabi, Shandar Ahmad, Kenji Mizuguchi, Akinori Sarai
    • 学会等名
      日本生物物理学会第45回年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2007-12-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18016026
  • [学会発表] PDBnet: Integration of Structural and Biochemical Information into Protein Interaction Network.

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Fujii, Yuji Kawakami, Satoshi komori, Akinori Sarai
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸国際会議場(神戸市)
    • 年月日
      2013-12-03 – 2013-12-06
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-24118008
  • 1.  GROMIHA Michael M. (10357973)
    共同の研究課題数: 6件
    共同の研究成果数: 2件
  • 2.  鳥越 秀峰 (80227678)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  横山 一成 (80182707)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  河野 秀俊 (40291918)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 5.  藤井 聡 (40452825)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 23件
  • 6.  相田 美砂子 (90175159)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  高井 貴子 (60222840)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  中田 琴子 (10237290)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  大橋 健 (00233239)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  安 江虹
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  PRABAKARAN Ponraj
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  AHMAD Shandar
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 4件
  • 13.  中村 春木 (80134485)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  神谷 成敏 (80420462)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  笠原 浩太 (90634965)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  神藤 平三郎 (80138966)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  筒井 初美 (00301763)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  村田 武英 (50281621)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  渡邉 信元 (90221689)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  緒方 一博 (90260330)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  飯田 緑
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 22.  PICHIERRI Fabio
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  斎藤 稔
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  森井 尚之
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  GROMIHA Mich
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  SELVARAJ Samuel
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 27.  SIEBERS Joerg G.
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 28.  上平 初穂
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 29.  PICHIERRI Fa
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件

URL: 

この研究者とORCID iDの連携を行いますか?
※ この処理は、研究者本人だけが実行できます。

Are you sure that you want to link your ORCID iD to your KAKEN Researcher profile?
* This action can be performed only by the researcher himself/herself who is listed on the KAKEN Researcher’s page. Are you sure that this KAKEN Researcher’s page is your page?

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi