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宇田 新介  Uda Shinsuke

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 20599609
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 山口大学, 情報・データ科学教育センター, 准教授
2025年度: 九州大学, 生体防御医学研究所, 共同研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2024年度 – 2025年度: 山口大学, 情報・データ科学教育センター, 准教授
2023年度: 九州大学, 生体防御医学研究所, 共同研究員
2014年度 – 2022年度: 九州大学, 生体防御医学研究所, 准教授
2013年度: 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
複合領域 / 生物系 / 小区分43060:システムゲノム科学関連 / システムゲノム科学
研究代表者以外
学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 連携探索型数理科学
キーワード
研究代表者
システム生物学 / 情報理論 / トランスオミクス / 情報科学 / データ解析 / 機械学習 / シグナル伝達 / オミクス / 正負の選択 / 情報 … もっと見る / 生命科学 / 胸腺T細胞 / 統合オミクス解析 / 生体生命情報学 / 情報工学 / スパース推定 / 分子ネットワーク / スパース性 / 頑健性 / 堅牢性 … もっと見る
研究代表者以外
プロテオミクス / リピドミクス / メタボロミクス / マルチオミクス / 数理解析 / オミクス計測 / 免疫センサー / 自己成分 / 自己認識 / リン酸化プロテオミクス / インスリン情報伝達機構 隠す
  • 研究課題

    (8件)
  • 研究成果

    (54件)
  • 共同研究者

    (15人)
  •  自己分子の包括的同定と自己認識を介した免疫ネットワーク形成の理解

    • 研究代表者
      和泉 自泰
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2026
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      九州大学
  •  情報量に基づいたトランスオミクスデータ解析手法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      宇田 新介
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      九州大学
  •  データ駆動アプローチからのトランスオミクスネットワーク推定法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      宇田 新介
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 研究機関
      九州大学
  •  胸腺T細胞における正負の選択を決定する情報伝達回路の情報理論を用いた同定研究代表者

    • 研究代表者
      宇田 新介
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分43060:システムゲノム科学関連
    • 研究機関
      九州大学
  •  多階層オミクスデータのためのネットワーク推定方法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      宇田 新介
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2017
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      九州大学
  •  ネットワークダイナミクスの数理的解析によるインスリン情報伝達機構の解明

    • 研究代表者
      松崎 芙美子
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      連携探索型数理科学
    • 研究機関
      九州大学
  •  疎性を用いた多階層ネットワークの同定研究代表者

    • 研究代表者
      宇田 新介
    • 研究期間 (年度)
      2014 – 2015
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      九州大学
  •  細胞内シグナル伝達ネットワークの情報論的解析研究代表者

    • 研究代表者
      宇田 新介
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      システムゲノム科学
    • 研究機関
      九州大学
      東京大学

すべて 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Modulation of host glutamine anabolism enhances the sensitivity of small cell lung cancer to chemotherapy.2023

    • 著者名/発表者名
      Kodama M, Toyokawa G, Sugahara O, Sugiyama S, Haratake N, Yamada Y, Wada R, Takamori S, Shimokawa M, Takenaka T, Tagawa T, Kittaka H, Tsuruda T, Tanaka K, Komatsu Y, Nakata K, Imado Y, Yamazaki K, Okamoto I, Oda Y, Takahashi M, Izumi Y, Bamba T, Shimizu H, Yoshizumi T, Nakayama KI*.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 42(8) 号: 8 ページ: 112899-112899

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112899

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K18924, KAKENHI-PROJECT-23K18502, KAKENHI-PLANNED-22H05185, KAKENHI-PROJECT-23K23151
  • [雑誌論文] Lipidome and metabolome analyses reveal metabolic alterations associated with MCF-7 cell apoptosis upon 4-hydroxytamoxifen treatment.2023

    • 著者名/発表者名
      Nishimoto K, Okahashi N, Maruyama M, Izumi Y, Nakatani K, Ito Y, Iida J, Bamba T, Matsuda F*.
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13(1) 号: 1 ページ: 18549-18549

    • DOI

      10.1038/s41598-023-45764-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K18924, KAKENHI-PROJECT-22KJ0996, KAKENHI-PLANNED-22H05185, KAKENHI-PROJECT-23K23151
  • [雑誌論文] Improved 2,3-butanediol production rate of metabolically engineered Saccharomyces cerevisiae by deletion of RIM15 and activation of pyruvate consumption pathway.2023

    • 著者名/発表者名
      Sugimura M, Seike T, Okahashi N, Izumi Y, Bamba T, Ishii J, Matsuda F*.
    • 雑誌名

      International Journal of Molecular Sciences

      巻: 24(22) 号: 22 ページ: 16378-16378

    • DOI

      10.3390/ijms242216378

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K18924, KAKENHI-PLANNED-22H05185, KAKENHI-PROJECT-23K23147, KAKENHI-PROJECT-23K23151
  • [雑誌論文] TFEB-mediated lysosomal exocytosis alleviates high fat diet?induced lipotoxicity in the kidney.2023

    • 著者名/発表者名
      Nakmura J, Yamamoto T*, Takabatake Y, Namba-Hamano T, Minami S, Takahashi A, Matsuda J, Sakai S, Yonishi H, Maeda S, Matsui S, Matsui I, Hamano T, Takahashi M, Goto M, Izumi Y, Bamba T, Sasai M, Yamamoto M, Matsusaka T, Niimura F, Yanagita M, Nakamura S, Yoshimori T, Ballabio A, Isaka Y.
    • 雑誌名

      JCI Insight

      巻: 8(4) 号: 4

    • DOI

      10.1172/jci.insight.162498

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K18924, KAKENHI-PROJECT-20K17279, KAKENHI-PLANNED-22H05185, KAKENHI-PROJECT-22H04982, KAKENHI-PROJECT-18H02642, KAKENHI-PROJECT-23K21437
  • [雑誌論文] Adrenal steroid metabolites and bone status in patients with adrenal incidentalomas and hypercortisolism.2023

    • 著者名/発表者名
      Nakao H, Yokomoto-Umakoshi M*, Nakatani K, Umakoshi H, Ogata M, Fukumoto T, Kaneko H, Iwahashi N, Fujita M, Ogasawara T, Matsuda Y, Sakamoto R, Izumi Y, Bamba T, Ogawa Y*.
    • 雑誌名

      eBioMedicine

      巻: 95 ページ: 104733-104733

    • DOI

      10.1016/j.ebiom.2023.104733

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K18924, KAKENHI-PROJECT-21K14472, KAKENHI-PROJECT-23K15392, KAKENHI-PROJECT-23KJ1747, KAKENHI-PROJECT-22K08627, KAKENHI-PROJECT-22KJ2405, KAKENHI-PLANNED-22H05185, KAKENHI-PROJECT-22H04993
  • [雑誌論文] Four features of temporal patterns characterize similarity among individuals and molecules by glucose ingestion in humans2022

    • 著者名/発表者名
      Fujita Suguru、Karasawa Yasuaki、Fujii Masashi、Hironaka Ken-ichi、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Inoue Hiroshi、Sumitomo Yohei、Hirayama Akiyoshi、Soga Tomoyoshi、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      npj Systems Biology and Applications

      巻: 8 号: 1 ページ: 6-6

    • DOI

      10.1038/s41540-022-00213-0

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PUBLICLY-20H04847, KAKENHI-PUBLICLY-20H04943, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-18K16578, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-20H03237, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-17H06300
  • [雑誌論文] An extensive and dynamic trans-omic network illustrating prominent regulatory mechanisms in response to insulin in the liver2021

    • 著者名/発表者名
      Matsuzaki Fumiko、Uda Shinsuke、Yamauchi Yukiyo、Matsumoto Masaki、Soga Tomoyoshi、Maehara Kazumitsu、Ohkawa Yasuyuki、Nakayama Keiichi I.、Kuroda Shinya、Kubota Hiroyuki
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 36 号: 8 ページ: 109569-109569

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109569

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-20H04847, KAKENHI-PLANNED-20H05930, KAKENHI-PROJECT-20K21386, KAKENHI-PROJECT-18K15011, KAKENHI-PROJECT-20H03237, KAKENHI-PLANNED-17H06300
  • [雑誌論文] Transomics analysis reveals allosteric and gene regulation axes for altered hepatic glucose-responsive metabolism in obesity2020

    • 著者名/発表者名
      Kokaji Toshiya、Hatano Atsushi、Ito Yuki、et al.
    • 雑誌名

      Science Signaling

      巻: 13 号: 660 ページ: 1236-1236

    • DOI

      10.1126/scisignal.aaz1236

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21386, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PROJECT-19K20394, KAKENHI-PROJECT-20K19915, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-19H04969, KAKENHI-PUBLICLY-19H05243, KAKENHI-PUBLICLY-20H04847, KAKENHI-PUBLICLY-20H04943, KAKENHI-PROJECT-18H02431, KAKENHI-PROJECT-20H04102, KAKENHI-PROJECT-19K24361, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-PLANNED-18H05431, KAKENHI-PLANNED-20H05930, KAKENHI-PROJECT-18KT0020, KAKENHI-PROJECT-20H03237
  • [雑誌論文] Single-Cell Information Analysis Reveals That Skeletal Muscles Incorporate Cell-to-Cell Variability as Information Not Noise2020

    • 著者名/発表者名
      Wada Takumi、Hironaka Ken-ichi、Wataya Mitsutaka、Fujii Masashi、Eto Miki、Uda Shinsuke、Hoshino Daisuke、Kunida Katsuyuki、Inoue Haruki、Kubota Hiroyuki、Takizawa Tsuguto、Karasawa Yasuaki、Nakatomi Hirofumi、Saito Nobuhito、Hamaguchi Hiroki、Furuichi Yasuro、Manabe Yasuko、Fujii Nobuharu L.、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 32 号: 9 ページ: 108051-108051

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2020.108051

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K16578, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PUBLICLY-20H04847, KAKENHI-PROJECT-18H02431, KAKENHI-PROJECT-20J14059, KAKENHI-PROJECT-19K22860, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PROJECT-18H03979, KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-PROJECT-20H03237
  • [雑誌論文] Approximate Conditional Independence Test using Residuals2020

    • 著者名/発表者名
      Uda Shinsuke
    • 雑誌名

      Proceedings of the 12th International Conference on Agents and Artificial Intelligence

      巻: 2 ページ: 297-304

    • DOI

      10.5220/0008866102970304

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04801
  • [雑誌論文] Application of information theory in systems biology2020

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda
    • 雑誌名

      Biophysical Review

      巻: - 号: 2 ページ: 377-384

    • DOI

      10.1007/s12551-020-00665-w

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04801, KAKENHI-PROJECT-18H02431
  • [雑誌論文] Trans-omics impact of thymoproteasome in cortical thymic epithelial cells.2019

    • 著者名/発表者名
      Ohigashi I, Tanaka Y, Kondo K, Fujimori S, Kondo H, Palin A, Hoffmann V, Kozai M, Matsushita Y, Uda S, Motosugi R, Hamazaki J, Kubota H, Murata S, Tanaka K, Katagiri T, Kosako H, Takahama Y
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 29 号: 9 ページ: 2901-2916

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.10.079

    • NAID

      120006894616

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07062, KAKENHI-PLANNED-17H06419, KAKENHI-PUBLICLY-18H04801, KAKENHI-PLANNED-18H05500, KAKENHI-PROJECT-16H02630, KAKENHI-PROJECT-18H04022, KAKENHI-PROJECT-19H00997, KAKENHI-PROJECT-18H02431, KAKENHI-PROJECT-17K08884, KAKENHI-PROJECT-26000014, KAKENHI-PLANNED-16H06577
  • [雑誌論文] Logical design of oral glucose ingestion pattern minimizing blood glucose in humans.2019

    • 著者名/発表者名
      Fujii M, Murakami Y, Karasawa Y, Sumitomo Y, Fujita S, Koyama M, Uda S, Kubota H, Inoue H, Konishi K, Oba S, Ishii S, Kuroda S.
    • 雑誌名

      NPJ Syst Biol Appl.

      巻: 5 号: 1 ページ: 31-31

    • DOI

      10.1038/s41540-019-0108-1

    • NAID

      120006939199

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0020, KAKENHI-PROJECT-18K16578, KAKENHI-PROJECT-19K20382, KAKENHI-PUBLICLY-18H04801, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PLANNED-16H06577
  • [雑誌論文] Reconstruction of global regulatory network from signaling to cellular functions using phosphoproteomic data2018

    • 著者名/発表者名
      Kawata Kentaro、Yugi Katsuyuki、Hatano Atsushi、Kokaji Toshiya、Tomizawa Yoko、Fujii Masashi、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Matsumoto Masaki、Nakayama Keiichi I.、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      Genes to Cells

      巻: 24 号: 1 ページ: 82-93

    • DOI

      10.1111/gtc.12655

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-18H04801, KAKENHI-PROJECT-16K12508, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-18H02431, KAKENHI-PROJECT-15H05582, KAKENHI-PLANNED-16H06577, KAKENHI-PLANNED-18H05431
  • [雑誌論文] Increase in hepatic and decrease in peripheral insulin clearance characterize abnormal temporal patterns of serum insulin in diabetic subjects2018

    • 著者名/発表者名
      Ohashi Kaoru、Fujii Masashi、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Komada Hisako、Sakaguchi Kazuhiko、Ogawa Wataru、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      npj Systems Biology and Applications

      巻: 4 号: 1 ページ: 14-14

    • DOI

      10.1038/s41540-018-0051-6

    • NAID

      120006599090

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K12508, KAKENHI-PUBLICLY-16H01551, KAKENHI-PROJECT-17J02672, KAKENHI-PLANNED-16H06577
  • [雑誌論文] In?Vivo Decoding Mechanisms of the Temporal Patterns of Blood Insulin by the Insulin-AKT Pathway in the Liver2018

    • 著者名/発表者名
      Kubota Hiroyuki、Uda Shinsuke、Matsuzaki Fumiko、Yamauchi Yukiyo、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      Cell Systems

      巻: 7 号: 1 ページ: 1-11

    • DOI

      10.1016/j.cels.2018.05.013

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04801, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PLANNED-16H06577
  • [雑誌論文] Trans-omic Analysis Reveals Selective Responses to Induced and Basal Insulin across Signaling, Transcriptional, and Metabolic Networks2018

    • 著者名/発表者名
      Kawata Kentaro、Hatano Atsushi、Yugi Katsuyuki、Kubota Hiroyuki、Sano Takanori、Fujii Masashi、Tomizawa Yoko、Kokaji Toshiya、Tanaka Kaori Y.、Uda Shinsuke、Suzuki Yutaka、Matsumoto Masaki、Nakayama Keiichi I.、Saitoh Kaori、Kato Keiko、Ueno Ayano、Ohishi Maki、Hirayama Akiyoshi、Soga Tomoyoshi、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 7 ページ: 212-229

    • DOI

      10.1016/j.isci.2018.07.022

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H05215, KAKENHI-PUBLICLY-17H06011, KAKENHI-PLANNED-17H06301, KAKENHI-PUBLICLY-18H04801, KAKENHI-ORGANIZER-18H05428, KAKENHI-PROJECT-18H04000, KAKENHI-PROJECT-16H04730, KAKENHI-PROJECT-16K12508, KAKENHI-PROJECT-17K19606, KAKENHI-ORGANIZER-17H06299, KAKENHI-PLANNED-17H06300, KAKENHI-PROJECT-15H05582, KAKENHI-PLANNED-16H06577
  • [雑誌論文] Matrix rank minimization approach to signal recovery and nonlinear function estimation for nonlinear ARX model with input nonlinearity2017

    • 著者名/発表者名
      Konishi Katsumi、Fujii Masashi、Kunida Katsuyuki、Uda Shinsuke、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      Proceedings of the 2017 Asian Control Conference

      巻: - ページ: 1428-1431

    • DOI

      10.1109/ascc.2017.8287382

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551
  • [雑誌論文] Sparse Gaussian graphical model with missing values2017

    • 著者名/発表者名
      Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki
    • 雑誌名

      Proceedings of the 21st Conference of Open Innovations Association

      巻: - ページ: 336-343

    • DOI

      10.23919/fruct.2017.8250201

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551, KAKENHI-PLANNED-16H06577
  • [雑誌論文] System identification of signaling dependent gene expression with different time-scale data2017

    • 著者名/発表者名
      Tsuchiya Takaho、Fujii Masashi、Matsuda Naoki、Kunida Katsuyuki、Uda Shinsuke、Kubota Hiroyuki、Konishi Katsumi、Kuroda Shinya
    • 雑誌名

      PLoS Computational Biology

      巻: 13 号: 12 ページ: e1005913-e1005913

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1005913

    • NAID

      120006555357

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K12508, KAKENHI-PROJECT-16K19028, KAKENHI-PUBLICLY-16H01551
  • [雑誌論文] Laguerre filter analysis with partial least square regression reveals a priming effect of ERK and CREB on c-FOS induction2016

    • 著者名/発表者名
      Kudo T, *Uda S, Tsuchiya T, Wada T, Karasawa Y, Fujii M, Saito T.H, Kuroda S.
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 11(8) 号: 8 ページ: 1-20

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0160548

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551, KAKENHI-PROJECT-14J12344
  • [雑誌論文] Analysis of cellular signal transduction from an information theoretic approach2016

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda and Shinya Kuroda
    • 雑誌名

      Seminars in Cell & Developmental Biology

      巻: 51 ページ: 24-31

    • DOI

      10.1016/j.semcdb.2015.12.011

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [雑誌論文] Selective control of up-regulated and down-regulated genes by temporal patterns and doses of insulin2016

    • 著者名/発表者名
      Takanori Sano,* Kentaro Kawata, * Satoshi Ohno,* Katsuyuki Yugi, Hiroaki Kakuda, Hiroyuki Kubota, Shinsuke Uda, Masashi Fujii, Katsuyuki Kunida, Daisuke Hoshino, Atsushi Hatano, Yuki Ito,1 Miharu Sato, Yutaka Suzuki, Shinya Kuroda†
    • 雑誌名

      Science Signaling

      巻: 9 号: 455

    • DOI

      10.1126/scisignal.aaf3739

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551, KAKENHI-PROJECT-14J05223, KAKENHI-PROJECT-16K19028, KAKENHI-PROJECT-15H05582
  • [雑誌論文] Glucose Homeostatic Law: Insulin Clearance Predicts the Progression of Glucose Intolerance in Humans2015

    • 著者名/発表者名
      Kaoru Ohashi , Hisako Komada , Shinsuke Uda, Hiroyuki Kubota, Toshinao Iwaki, Hiroki Fukuzawa, Yasunori Komori, Masashi Fujii, Yu Toyoshima, Kazuhiko Sakaguchi, Wataru Ogawa, Shinya Kuroda
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 10 号: 12 ページ: e0143880-e0143880

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0143880

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [雑誌論文] Reconstruction of insulin signal flow from phosphoproteome and metabolome data2014

    • 著者名/発表者名
      Yugi, K., Kubota, H., Toyoshima, Y., Noguchi, R., Kawata, K., Komori, Y., Uda, S., Kunida, K., Tomizawa, Y., Funato, Y., Miki, H., Matsumoto, M., Nakayama, K.I., Kashikura, K., Endo, K., Ikeda, K., Soga, T., Kuroda, S.
    • 雑誌名

      Cell Rep.

      巻: 8 号: 4 ページ: 1171-1183

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2014.07.021

    • NAID

      120005537752

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134007, KAKENHI-PUBLICLY-25134714, KAKENHI-PROJECT-25290078, KAKENHI-PLANNED-26111007, KAKENHI-PUBLICLY-26112711, KAKENHI-PUBLICLY-26120507, KAKENHI-PROJECT-26291042, KAKENHI-PROJECT-26460364, KAKENHI-PROJECT-26640080, KAKENHI-PUBLICLY-26116721
  • [雑誌論文] Robustness and Compensation of Information of Signaling Pathways.2013

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda, Takeshi H Saito, Takamasa Kudo, Toshiya Kokaji, Takaho Tsuchiya, Hiroyuki Kubota, Yasunori Komori, Yu-ichi Ozaki, and Shinya Kuroda
    • 雑誌名

      Science

      巻: 341 号: 6145 ページ: 558-561

    • DOI

      10.1126/science.1234511

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24241067, KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [学会発表] Distinct Steroid Profiles and its Effect on Bone Mass and Quality in Premenopausal Women with Autonomous Cortisol Secretion2023

    • 著者名/発表者名
      〇Hiroshi Nakao, Kohta Nakatani, Maki Yokomoto-Umakoshi, Hironobu Umakoshi, Hiroki Kaneko, Norifusa Iwahashi, Masatoshi Ogata, Tazuru Fukumoto, Masamichi Fujita, Tatsuki Ogasawara, Yayoi Matsuda, Ryuichi Sakamoto, Yoshihiro Izumi, Takeshi Bamba, Yoshihiro Ogawa
    • 学会等名
      ENDO2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22H05185
  • [学会発表] Trans-omic analysis of insulin response in the liver2022

    • 著者名/発表者名
      Matsuzaki F., Uda S., Yamauchi Y., Kubota H.
    • 学会等名
      International Symposium on Evolutionary Genomics and Bioinformatics 2022 (ISEGB2022)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04847
  • [学会発表] 1型糖尿病患者における 血糖変動と自律神経活動の関連性について2021

    • 著者名/発表者名
      小谷紀子,宇田新介,目 黒周,久保田浩行,伊藤 裕
    • 学会等名
      第64回日本糖尿病学会年次学術 集会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04847
  • [学会発表] Comparison of hepatic responses to glucose perturbation between normal and obese mice using edge ontology2020

    • 著者名/発表者名
      Yuki Ito, Shinsuke Uda, Toshiya Kokaji, Akiyoshi Hirayama, Tomoyoshi Soga, Yutaka Suzuki, Shinya Kuroda and Hiroyuki Kubota
    • 学会等名
      Fusion of Mathematics and Biology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H02431
  • [学会発表] Comparison of hepatic responses to glucose perturbation between normal and obese mice using edge ontology2020

    • 著者名/発表者名
      Yuki Ito, Shinsuke Uda, Toshiya Kokaji, Akiyoshi Hirayama, Tomoyoshi Soga, Yutaka Suzuki, Shinya Kuroda and Hiroyuki Kubota
    • 学会等名
      Fusion of Mathematics and Biology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04847
  • [学会発表] Comparison of hepatic metabolome and transcriptome responses to oral glucose tolerance test between normal and obese mice by information theoretic approach2019

    • 著者名/発表者名
      Yuki Ito, Shinsuke Uda, Toshiya Kokaji, Akiyoshi Hirayama, Tomoyoshi Soga, Yutaka Suzuki, Shinya Kuroda and Hiroyuki Kubota
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04801
  • [学会発表] Comparison of hepatic metabolome and transcriptome responses to oral glucose tolerance test between normal and obese mice by information theoretic approach2019

    • 著者名/発表者名
      Yuki Ito, Shinsuke Uda, Toshiya Kokaji, Akiyoshi Hirayama, Tomoyoshi Soga, Yutaka Suzuki, Shinya Kuroda and Hiroyuki Kubota
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18H02431
  • [学会発表] Network structure inference by conditional independence2019

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04801
  • [学会発表] Sparse Gaussian Graphical Model with Missing Values2017

    • 著者名/発表者名
      S.Uda and H.Kubota
    • 学会等名
      21st FRUCT Conference
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551
  • [学会発表] Matrix rank minimization approach to signal recovery and nonlinear function estimation for nonlinear ARX model with input nonlinearity2017

    • 著者名/発表者名
      K.Konishi, M.Fujii, K.Kunida, S.Uda, S.Kuroda
    • 学会等名
      Control Conference (ASCC), 2017 11th Asian
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551
  • [学会発表] 定量的トランスオミクス解析の試み2017

    • 著者名/発表者名
      松崎芙美子, 宇田新介, 久保田浩行
    • 学会等名
      定量生物学の会 第八回年会
    • 発表場所
      岡崎
    • 年月日
      2017-01-08
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15KT0108
  • [学会発表] An estimation method of sparse partial correlation matrix for omics data analysis2017

    • 著者名/発表者名
      S.Uda and H. Kubota
    • 学会等名
      11th International Symposium of The Institute Network “Frontiers in Biomedical Sciences”
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551
  • [学会発表] 細胞内情報伝達システムの情報理論的解析2016

    • 著者名/発表者名
      宇田新介
    • 学会等名
      6.「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域・第5回数理デザイン道場
    • 発表場所
      東京
    • 年月日
      2016-02-19
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [学会発表] TBD2016

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2016-12-01
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [学会発表] Information Theoretical Analysis of Signaling Pathway2016

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda
    • 学会等名
      The 6th Annual World Congress of Molecular & Cell Biology
    • 発表場所
      Dalian, China
    • 年月日
      2016-04-26
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [学会発表] 欠損ありデータからの疎偏相関行列の推定法2016

    • 著者名/発表者名
      宇田新介
    • 学会等名
      新学術領域研究「スパースモデリングの深化と高次元駆動データ科学の創成」平成28年度公開シンポジウム
    • 発表場所
      慶應義塾大学三田キャンパス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01551
  • [学会発表] Estimation method of sparse partial correlation matrix from omics data set with missing values2015

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda
    • 学会等名
      International Meeting on “High-Dimensional Data Driven Science” (HD3-2015)
    • 発表場所
      Kyoto, Japan
    • 年月日
      2015-12-16
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] 健常及び肥満マウスの肝臓及び筋肉におけるグルコース負荷に対する代謝変動の網羅的解析2015

    • 著者名/発表者名
      小鍛冶俊也、久保田浩行、伊藤有紀、柚木克之、藤井雅史、宇田新介、国田勝行、曽我朋義、黒田真也
    • 学会等名
      BMB2015 第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] Reconstruction of global network of insulin-dependent gene expression based on phosphoproteome and transcriptome data2015

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Kawata, Katsuyuki Yugi, Atsushi Hatano, Katsuyuki Kunida, Masashi Fujii, Satoshi Ohno, Yoko Tomizawa, Takanori Sano, Hiroaki Kakuda, Shinsuke Uda, Hiroyuki Kubota, Yutaka Suzuki, Masaki Matsumoto, Keiichi Nakayama and Shinya Kuroda
    • 学会等名
      International Conference on Systems Biology(ICSB2015)
    • 発表場所
      Biopolis,Singapore
    • 年月日
      2015-11-23
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] インスリン刺激時における網羅的遺伝子発現調節ネットワークの再構築2015

    • 著者名/発表者名
      川田健太郎、柚木克之、幡野敦、国田勝行、藤井雅史、大野聡、富沢瑶子、佐野貴規、角田裕晶、宇田新介、久保田浩行、鈴木壌、松本雅記、中山敬一、黒田真也
    • 学会等名
      BMB2015 第38回日本分子生物学会年会 第91回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2015-12-01
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] 欠損ありオミクスデータのための 疎偏相関行列推定法2015

    • 著者名/発表者名
      宇田新介
    • 学会等名
      第18回情報論的学習理論ワークショップ (IBIS2015)
    • 発表場所
      つくば国際会議場
    • 年月日
      2015-11-26
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] インスリン時間パターン依存的な遺伝子発現の選択的応答2014

    • 著者名/発表者名
      佐野貴規,川田健太郎,角田裕晶,久保田浩行,宇田新介,柚木克之,藤井雅史,国田勝行,星野太佑,鈴木穣,黒田真也
    • 学会等名
      第37回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-26
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] ヒトにおける糖代謝メカニズムのシステム生物学的解析2014

    • 著者名/発表者名
      住友洋平,唐沢康暉,宇田新介,大橋郁,平山明由,曽我朋義,黒田真也
    • 学会等名
      第37回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] データドリブンモデルから解明するPC12細胞の神経分化誘導における細胞内シグナル伝達のデコーディングメカニズム2014

    • 著者名/発表者名
      土屋貴穂,宇田新介,工藤隆将,唐沢康暉,黒田真也
    • 学会等名
      第37回分子生物学会年会
    • 発表場所
      横浜
    • 年月日
      2014-11-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [学会発表] データドリブンモデルから解明するPC12細胞の神経分化誘導における細胞内シグナル伝達のデコーディングメカニズム2014

    • 著者名/発表者名
      土屋貴穂,宇田新介,工藤隆将,黒田真也
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      京都
    • 年月日
      2014-10-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [学会発表] Robustness and compensation of information transmission of signaling pathways despite perturbation2014

    • 著者名/発表者名
      Shinsuke Uda and Shinya Kuroda
    • 学会等名
      The Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology
    • 発表場所
      Osaka
    • 年月日
      2014-07-30
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • [学会発表] 疎性を用いた多階層ネットワークの同定2014

    • 著者名/発表者名
      宇田新介
    • 学会等名
      新学術領域研究「スパースモデリングの深化と高次元データ駆動科学の創成」2014年度公開シンポジウム
    • 発表場所
      東京工業大学 すずかけ台キャンパス
    • 年月日
      2014-12-16
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-26120507
  • [学会発表] Robustness and compensation of information transmission of signaling pathways despite perturbation2013

    • 著者名/発表者名
      S. Uda, and S. Kuroda
    • 学会等名
      Workshop: Gradients and Signalling: from chemotaxis to development
    • 発表場所
      沖縄科学技術大学院大学(沖縄県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25830142
  • 1.  松崎 芙美子 (10631773)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 2.  松本 雅記 (60380531)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  今井 哲郎 (10436173)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  久保田 浩行 (40376603)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 5.  幡野 敦 (30755533)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  比嘉 綱己 (60826238)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  和泉 自泰 (70622166)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 6件
  • 8.  黒田 真也
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 3件
  • 9.  唐沢 康暉
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 10.  中山 啓子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 11.  中山 敬一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 12.  藤井 雅史
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 13.  濱崎 純
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 14.  井上 啓
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 15.  曽我 朋義
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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