二井手哲平 Niide Teppei

研究者番号	20802705
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 助教
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 助教 2023年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 助教 2020年度 – 2021年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 助教 2017年度 – 2019年度: 東北大学, 工学研究科, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連研究代表者以外大区分D / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 生物機能・バイオプロセス
キーワード	研究代表者タンパク質工学 / 計算科学 / 酵素工学 / ファージ提示法 / ナノ材料 / バイオインフォマティクス / 酵素 / 進化学 / 進化 / 合理的酵素設計 … もっと見る / ドッキングシミュレーション / 構造モデリング / シミュレーション / 耐熱化 / 機械学習 / 酵素設計 / ナノ界面 / データベース / 指向性進化 / タンパク質設計 / 分子標的薬 / 低分子医薬 / ファージディスプレイ / 抗体 / 自己組織化 / タンパク質 / 大規模セレクション / 酵母表層提示法 / ペプチド移植 / 抗体工学 … もっと見る研究代表者以外バイオものづくり / 育種 / 代謝解析 / 気相反応 / 微生物 / 代謝フラックス / 光合成 / 変動光 / 代謝フラックス解析 / シミュレーション / 酵素反応 / 生物・生体工学 / ナノ材料 / ナノ粒子 / 酵素 / 生体分子隠す

進化情報と塩基エディターによる酵素大規模ライブラリーの作製と活性機能情報抽出研究代表者
- 研究代表者
  
  二井手哲平
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  国際共同研究加速基金(国際共同研究強化)
- 審査区分
  
  小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
- 研究機関
  大阪大学
気相微生物反応の学理とプロセス構築
- 研究代表者
  
  堀克敏
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2028
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 審査区分
  
  大区分D
- 研究機関
  名古屋大学
進化情報を構造シミュレーションに組み入れた合理的酵素設計とそのプロセス化研究代表者
- 研究代表者
  
  二井手哲平
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
- 研究機関
  大阪大学
微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析
- 研究代表者
  
  清水浩
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
要求駆動型合理的蛋白質設計技術が切り拓くナノ分子標的薬の創製研究代表者
- 研究代表者
  
  二井手哲平
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2021
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
- 研究機関
  大阪大学
異種ナノ材料の集積を可能とするナノ界面接合抗体のボトムアップデザイン研究代表者
- 研究代表者
  
  二井手哲平
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
- 研究機関
  大阪大学
   東北大学
ナノ集積が築くin-vitro合成生物学ツール：代謝ネットワークの生体外模倣
- 研究代表者
  
  梅津光央
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物機能・バイオプロセス
- 研究機関
  東北大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017

すべて雑誌論文学会発表産業財産権

[雑誌論文] 材料表面を認識するペプチド・タンパク質から発想するハイブリッドナノアセンブリ2022
- 著者名/発表者名
  梅津光央、中澤光、二井手哲平
- 雑誌名
  
  バイオインダストリー
  
  巻: 39 ページ: 27-34
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15096
[雑誌論文] Logistic Regression-Guided Identification of Cofactor Specificity-Contributing Residues in Enzyme with Sequence Datasets Partitioned by Catalytic Properties2022
- 著者名/発表者名
  Sugiki Sou、Niide Teppei、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
- 雑誌名
  
  ACS Synthetic Biology
  
  巻: 11 号: 12 ページ: 3973-3985
- DOI
  10.1021/acssynbio.2c00315
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841, KAKENHI-PROJECT-19H05626
[雑誌論文] Acceleration of target production in co‐culture by enhancing intermediate consumption through adaptive laboratory evolution2021
- 著者名/発表者名
  Kawai Ryutaro、Toya Yoshihiro、Miyoshi Kenta、Murakami Manami、Niide Teppei、Horinouchi Takaaki、Maeda Tomoya、Shibai Atsushi、Furusawa Chikara、Shimizu Hiroshi
- 雑誌名
  
  Biotechnology and Bioengineering
  
  巻: 119 号: 3 ページ: 936-945
- DOI
  10.1002/bit.28007
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15096, KAKENHI-PROJECT-19H05626
[雑誌論文] Association behavior and control of the quality of cancer therapeutic bispecific diabodies expressed in Escherichia coli2020
- 著者名/発表者名
  Hikaru Nakazawa, Tomoko Onodera-Sugano, Aruto Sugiyama, Yoshikazu Tanaka, Takamitsu Hattori, Teppei Niide, Hiromi Ogata, Ryutaro Asano, Izumi Kumagai, Mitsuo Umetsu
- 雑誌名
  
  Biochemical Engineering Journal
  
  巻: 160 ページ: 1-9
- DOI
  10.1016/j.bej.2020.107636
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K04842, KAKENHI-PROJECT-18K14059, KAKENHI-PROJECT-19H03511, KAKENHI-PROJECT-20H02534, KAKENHI-PROJECT-19H02831, KAKENHI-PROJECT-19H00918, KAKENHI-PROJECT-20H00315
[雑誌論文] Complementary Design for Pairing between Two Types of Nanoparticles Mediated by a Bispecific Antibody: Bottom-Up Formation of Porous Materials from Nanoparticles2019
- 著者名/発表者名
  Niide Teppei、Manabe Noriyoshi、Nakazawa Hikaru、Akagi Kazuto、Hattori Takamitsu、Kumagai Izumi、Umetsu Mitsuo
- 雑誌名
  
  Langmuir
  
  巻: 35 号: 8 ページ: 3067-3076
- DOI
  10.1021/acs.langmuir.8b03687
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K04842, KAKENHI-PROJECT-18K14059, KAKENHI-PROJECT-16K18296
[雑誌論文] Machine-Learning-Guided Mutagenesis for Directed Evolution of Fluorescent Proteins2018
- 著者名/発表者名
  Saito Yutaka、Oikawa Misaki、Nakazawa Hikaru、Niide Teppei、Kameda Tomoshi、Tsuda Koji、Umetsu Mitsuo
- 雑誌名
  
  ACS Synthetic Biology
  
  巻: 7 号: 9 ページ: 2014-2022
- DOI
  10.1021/acssynbio.8b00155
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K04842, KAKENHI-PLANNED-17H06410, KAKENHI-PROJECT-16H04570, KAKENHI-PROJECT-16K18296
[雑誌論文] Compact seahorse-shaped T cell-activating antibody for cancer therapy2018
- 著者名/発表者名
  Hiroto Fujii, Yoshikazu Tanaka, Hikaru Nakazawa, Aruto Sugiyama, Noriyoshi Manabe, Akira Shinoda, Nobutaka Shimizu, Takamitsu Hattori, Katsuhiro Hosokawa, Takuma Sujino, Tomoyuki Ito, Teppei Niide, Ryutaro Asano, Izumi Kumagai, and Mitsuo Umetsu
- 雑誌名
  
  Advanced Therapeutics
  
  巻: 1700031 号: 3 ページ: 1-10
- DOI
  10.1002/adtp.201700031
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04570, KAKENHI-PROJECT-15KK0248, KAKENHI-PUBLICLY-16H00748
[雑誌論文] Photosynthesis of colloidal Ag-AgCl nanoparticles mediated by Tilia sp. leachate, evaluation of their behaviour in liquid phase and catalytic properties2018
- 著者名/発表者名
  Zuzana Konvickova, Veronika sova, Marek Kolencik, Teppei Niide, Gabriela Kratosova, Mitsuo Umetsu, and Jana Seidlerova
- 雑誌名
  
  Colloid and Polymer Science
  
  巻: 296 号: 4 ページ: 677-687
- DOI
  10.1007/s00396-018-4290-2
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04570, KAKENHI-PROJECT-16K14483
[雑誌論文] High-throughput cytotoxicity and antigen-binding assay for screening small bispecific antibodies without purification2018
- 著者名/発表者名
  Sugiyama Aruto、Umetsu Mitsuo、Nakazawa Hikaru、Niide Teppei、Asano Ryutaro、Hattori Takamitsu、Kumagai Izumi
- 雑誌名
  
  JBB
  
  巻: - 号: 2 ページ: 31237-31239
- DOI
  10.1016/j.jbiosc.2018.02.007
- NAID
  40021645320
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K18296, KAKENHI-PROJECT-16J04866, KAKENHI-PROJECT-16H04570, KAKENHI-PROJECT-16K14483
[雑誌論文] A semi high-throughput method for screening small bispecific antibodies with high cytotoxicity2017
- 著者名/発表者名
  Sugiyama Aruto、Umetsu Mitsuo、Nakazawa Hikaru、Niide Teppei、Onodera Tomoko、Hosokawa Katsuhiro、Hattori Shuhei、Asano Ryutaro、Kumagai Izumi
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 2862-2873
- DOI
  10.1038/s41598-017-03101-4
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K18296, KAKENHI-PROJECT-16H04570, KAKENHI-PROJECT-16K14483
[雑誌論文] 親和性ペプチド分子による有機結晶の構造制御と生体分子-半導体有機結晶ハイブリッド材料作製プロセスの開発2017
- 著者名/発表者名
  二井手哲平, 中澤光, 梅津光央
- 雑誌名
  
  ケミカルエンジニヤリング
  
  巻: 62 ページ: 23-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04570
[産業財産権] 難水溶性薬物の複合体及びその製造方法2020
- 発明者名
  二井手哲平, 梅津光央, 中澤光
- 権利者名
  二井手哲平, 梅津光央, 中澤光
- 産業財産権種類
  特許
- 出願年月日
  2020
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14059
[学会発表] バイオモノづくりにおけるデータ駆動酵素工学2024
- 著者名/発表者名
  二井手哲平
- 学会等名
  応用物理学会 M&BE未来技術研究会 2024
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 進化と構造の情報を組み込んだ酵素の耐熱化デザイン2023
- 著者名/発表者名
  宮脇佳汰, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  第75回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 機械学習を活用した酵素の分子認識特性の変換2023
- 著者名/発表者名
  二井手哲平, 杉木創, 森聖也, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  化学工学会第54回秋季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] Machine learning-guided cofactor specificity conversion of a malic enzyme using sequence datasets divided by catalytic properties2023
- 著者名/発表者名
  Teppei Niide, Sou Sugiki, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
- 学会等名
  Metabolic Engineering 15
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 機械学習を用いた代謝酵素の基質特異性決定残基の推定と変換2023
- 著者名/発表者名
  森聖也, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  第75回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 酵素の基質特異性決定残基の同定におけるロジスティック回帰モデルの有用性2023
- 著者名/発表者名
  二井手哲平、杉木創、森聖也、戸谷吉博、清水浩
- 学会等名
  第75回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 異種生物由来酵素の発現量向上を目指した酵素設計プロセス開発2022
- 著者名/発表者名
  宮脇佳汰, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  第74回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] タンパク質の構造保存性と合理的機能設計2022
- 著者名/発表者名
  二井手哲平
- 学会等名
  酵素工学研究会第87回講演会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] M13ファージのライフサイクルを活用したS-Allyl-L-cysteine生合成経路の最適化2022
- 著者名/発表者名
  松本拓也, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  第74回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] リンゴ酸酵素の補酵素特異性変換を先導する機械学習手法の提案2022
- 著者名/発表者名
  杉木創, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  第74回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 補酵素特異性改変を目指した合理的酵素設計プロセスの開発2022
- 著者名/発表者名
  宮脇佳汰、二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
- 学会等名
  化学工学会第87年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15096
[学会発表] 配列保存度情報を組み入れた酵素工学2022
- 著者名/発表者名
  二井手哲平, 杉木創, 宮脇佳汰, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  第74回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 配列保存度情報と構造モデリングを活用した酵素の耐熱化戦略の提案2022
- 著者名/発表者名
  二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩
- 学会等名
  化学工学会第53回秋季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K04841
[学会発表] 機械学習を活用したリンゴ酸酵素の補酵素特異性変換2022
- 著者名/発表者名
  杉木創、二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
- 学会等名
  化学工学会第87年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15096
[学会発表] 免疫細胞の活性機能調節を目指したin silicoタンパク質設計2021
- 著者名/発表者名
  二井手哲平、スィーカーデイビッド、クールマンブライアン
- 学会等名
  化学工学会第86年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14059
[学会発表] Rationally Designing Active Ga Protein Inhibitors for Signal Transduction Regulation2020
- 著者名/発表者名
  Teppei NIide, David Thieker, Matthew Cummins, Brian Kuhlman
- 学会等名
  Winter RosettaCON
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K14059
[学会発表] Machine-learning-guided mutagenesis platform for desired evolution: in the case of Fluorescent protein?2018
- 著者名/発表者名
  Misaki Oikawa,　Yutaka Saito,　Tomoshi Kameda,　Hikaru Nakazawa,　Teppei Niide,　Koji Tsuda,　 Mitsuo Umetsu
- 学会等名
  10th Annual PEGS Summit, Protein&Antibody Engineering Summit
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04570
[学会発表] AIはタンパク質進化を導くか？：機械学習支援によるGFPのYFP化検証2018
- 著者名/発表者名
  及川未早来, 二井手哲平, 中澤光, 亀田倫史,津田宏治,斉藤裕, 梅津光央
- 学会等名
  第70回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04570
[学会発表] AIを利用したスマートホットライブラリーデザイン：AIはGFPをYFP化できるか？2018
- 著者名/発表者名
  及川未早来, 二井手哲平, 中澤光, 亀田倫史,津田宏治,斉藤裕, 梅津光央
- 学会等名
  第18回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04570
[学会発表] 機械学習へ向けた迅速な変異体群の作製と機能評価プロセスの開発2017
- 著者名/発表者名
  及川未早来、中澤光、二井手哲平、亀田倫史、斎藤裕、津田浩二、梅津光央
- 学会等名
  バイオ工学シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04570

1. 清水浩 (00226250)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 戸谷吉博 (70582162)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
3. 梅津光央 (70333846)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件
4. 高見誠一 (40311550)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
5. 中澤光 (40584991)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 11件
6. 堀克敏 (50302956)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 吉本将悟 (90806291)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 津川裕司 (30647235)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件

二井手 哲平 Niide Teppei

研究課題

研究成果

共同研究者

進化情報と塩基エディターによる酵素大規模ライブラリーの作製と活性機能情報抽出研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

気相微生物反応の学理とプロセス構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

進化情報を構造シミュレーションに組み入れた合理的酵素設計とそのプロセス化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

要求駆動型合理的蛋白質設計技術が切り拓くナノ分子標的薬の創製研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

異種ナノ材料の集積を可能とするナノ界面接合抗体のボトムアップデザイン研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ナノ集積が築くin-vitro合成生物学ツール：代謝ネットワークの生体外模倣

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] 材料表面を認識するペプチド・タンパク質から発想するハイブリッドナノアセンブリ2022

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Logistic Regression-Guided Identification of Cofactor Specificity-Contributing Residues in Enzyme with Sequence Datasets Partitioned by Catalytic Properties2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Acceleration of target production in co‐culture by enhancing intermediate consumption through adaptive laboratory evolution2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Association behavior and control of the quality of cancer therapeutic bispecific diabodies expressed in Escherichia coli2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Complementary Design for Pairing between Two Types of Nanoparticles Mediated by a Bispecific Antibody: Bottom-Up Formation of Porous Materials from Nanoparticles2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Machine-Learning-Guided Mutagenesis for Directed Evolution of Fluorescent Proteins2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Compact seahorse-shaped T cell-activating antibody for cancer therapy2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

二井手哲平 Niide Teppei