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清水 浩  SHIMIZU Hiroshi

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 00226250
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2022年度 – 2025年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授
2011年度 – 2021年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 教授
2009年度 – 2011年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授
2007年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授
2006年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授 … もっと見る
2003年度 – 2005年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授
2004年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 教授
1998年度 – 2001年度: 大阪大学, 大学院・工学研究科, 助教授
1995年度 – 1997年度: 大阪大学, 工学部, 助教授
1990年度 – 1994年度: 大阪大学, 工学部, 助手 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
生物機能・バイオプロセス / 生物・生体工学 / 小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連 / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 中区分27:化学工学およびその関連分野 / 大区分D / 化学工学およびその関連分野 / 生物機能・バイオプロセス / 生物系 / 生体生命情報学 … もっと見る
研究代表者以外
… もっと見る 生物・生体工学 / 化学工学 / 大区分D / 生物系 / 生物機能・バイオプロセス 隠す
キーワード
研究代表者
代謝フラックス / 代謝フラックス解析 / ゲノムスケールモデル / シミュレーション / 光合成 / 指向性進化 / 生物情報工学 / ゲノムスケール代謝モデル / 代謝工学 / 物質生産 … もっと見る / 進化工学 / ストレス耐性 / DNAマイクロアレイ / 代謝反応モデル / 代謝評価 / RBS / 変動光 / 有用物質生産 / マイクロリアクタ / ロボット / 代謝解析 / がん細胞 / インシリコデザイン / 反応速度論 / システムバイオロジー / システムバイオテクノロジー / システム生物学 / microbial production / Genome scale model / isotope trace experiment / metabolic flux analysis / in silica prediction / 微生物生産 / 同位体標識トレース実験 / インシリコ代謝変動予測 / Model Predictive Controller / Multivariable Controller / Block Copolymer / Random Copolymer / Mole Fraction of Monomer Units / Metabolic Engineering / Biodegradable polymer / 分解特性 / モデル予測制御 / 多変数制御 / ブロック共重合 / ランダム共重合 / モル分率 / 生分解性ポリマー / maltose / dissolved oxygen concentration / bacteriocin / cascade controller / nisin / mixed culture / yeasts / lactic acid bacteria / ラクトース / マルトース / 溶存酸素濃度 / バクテリオシン / カスケード制御 / ナイシン / 混合培養 / 酵母 / 乳酸菌 / マルチオミクス / 強光条件 / 微細藻類 / 比増殖速度 / 発現プロファイル / バイオプロダクション / 変異解析 / ゲノム / ダイナミクス解析 / フローサイトメータ / 細胞集団 / 生物ネットワーク / ダイナミクス / GFP / 連続培養系 / フローサイトメトリー / 適応 / 細胞間相互作用 / 生命体情報ネットワーク / 大腸菌 / 形態変化 / 抗生物質生産 / オートレギュレータ / 糸状菌 / 画像解析 / エラーベクトル / 代謝反応モルフラックス / ファジィメンバシップ関数 / 状態認識 / ファジィ理論 … もっと見る
研究代表者以外
Enterococcus faecium / 乳酸菌 / Lactobacillus kefiranofaciens / E.faecium / シャトルベクター / バクテリオシン / エンテロシンA / Lactic acid bacteria / 酵母 / NMR / PHB / Specific growth rate / モデル化 / PF System / 比増殖速度 / バイオものづくり / 育種 / 代謝解析 / 気相反応 / 微生物 / エネルギー / 電子伝達 / 葉緑体 / 光合成 / kefiran / mathematical modeling / co-culture / yeast / ケフィラン / 共培養 / Structure of sugar moiety / Shuttle vector / Bacteriocin / EnterocinA / 糖鎖構造 / immunity for enterocin A / E. faecium / shuttle vector / bacteriocin / enterocin A / Lactobacillus plantarum / 発酵食品 / バクテリオシン耐性遺伝子 / wavelet filter / fault diagnosis / autoassociative neural network / temperature controllable gene expression / ウェーブレット変換 / 状態認識 / ウェーブレットフィルタ / 自己想起型ニューラルネットワーク / 異常診断 / 温度感受性組換え酵母 / Antibiotic nisin / Mixed culture / Flowcytometry / Propionic acid bacteria / Synergic interaction / Yeast / フローサイトメータ / マルトオリゴ糖 / ウィスキー醸造 / 抗菌物質ナイシン / 混合培養 / フローサイトメトリー / プロピオン酸菌 / Two-stage production / Acidic phosphatase / Rice-alpha-amylase / Temperature-sensitive / Recombinant yeast / 酸性ホスファタ-ゼ / ∂ーアミラ-ゼ / 2段培養 / 酸性ホスファターゼ / α-アミラーゼ / 温度感受性 / 遺伝子組み換え酵母 / control of substrate concentration / mole fraction in copolymer / molecular weight distribution / P(HB-co-HV) / biodegradable polymer / GPC / 高分子重合度 / 残存生物量 / ポリヒドロキシ酪酸 / 生分解性ポリマ- / 一次マルコフ鎖過程 / P(HB-HV)共重合物 / 基質濃度制御 / 共重合分率 / 分子量分布 / P(HB-co-HV)共重合物 / 生分解性ポリマー / Optimal profile of mu / Maximum principle / Specific production rate of glutathione / Extended Kalman filter / Estimation and control system / Glutathione / 最適化 / PFystem / 最適バタ-ン / 拡張カルマンフイルタ- / グルタチオン比生産速度 / 最適パタ-ン / 最大原理 / 拡張カルマンフィルタ- / 推定制御系 / グルタチオン化生産速度 / グルタチオン 隠す
  • 研究課題

    (26件)
  • 研究成果

    (374件)
  • 共同研究者

    (36人)
  •  リボゾーム結合部位配列の改変による大腸菌代謝フラックスの制御と物質生産への応用研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2028
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分27040:バイオ機能応用およびバイオプロセス工学関連
    • 研究機関
      大阪大学
  •  気相微生物反応の学理とプロセス構築

    • 研究代表者
      堀 克敏
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2028
    • 研究種目
      基盤研究(S)
    • 審査区分
      大区分D
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分62:応用情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      大阪大学
  •  モデルベース設計を基盤とした指向性進化による高効率細胞プロセス創製の確立と展開研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(S)
    • 審査区分
      大区分D
    • 研究機関
      大阪大学
  •  ゲノムスケールモデルを利用した代謝経路律速点の解消による化成品生産技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2019
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分27:化学工学およびその関連分野
    • 研究機関
      大阪大学
  •  がん細胞代謝シミュレーションシステムの開発研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2018
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 研究分野
      化学工学およびその関連分野
    • 研究機関
      大阪大学
  •  プロトン駆動力による細胞内代謝制御研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2020
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      大阪大学
  •  多層階の動的代謝解析による律速点同定とフラックス最適化法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2018
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物機能・バイオプロセス
    • 研究機関
      大阪大学
  •  新光合成:光エネルギー変換システムの再最適化

    • 研究代表者
      皆川 純
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2020
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      基礎生物学研究所
  •  実験進化過程のマルチオミクス解析によるストレス耐性細胞工場の創製研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2012 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      生物機能・バイオプロセス
    • 研究機関
      大阪大学
  •  微細藻類の光阻害とストレス適応メカニズムの解析研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2011 – 2012
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      生物機能・バイオプロセス
    • 研究機関
      大阪大学
  •  全ゲノム一塩基レベル変異解析に基づくストレス耐性細胞の創製研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2009 – 2011
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物機能・バイオプロセス
    • 研究機関
      大阪大学
  •  酵母による環境調和型化学物質生産を目的とした代謝経路のインシリコデザイン研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物機能・バイオプロセス
    • 研究機関
      大阪大学
  •  大腸菌細胞間相互作用をとおしてみた生命体情報ネットワーク研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2004 – 2005
    • 研究種目
      萌芽研究
    • 研究分野
      生体生命情報学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  微生物共生システムを利用した発酵生産法の開発

    • 研究代表者
      塩谷 捨明
    • 研究期間 (年度)
      2003 – 2004
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物機能・バイオプロセス
    • 研究機関
      大阪大学
  •  乳酸菌由来抗菌ペプチドエンテロシンAの活性発現に関与する糖鎖構造の解析

    • 研究代表者
      塩谷 捨明
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  代謝多変数制御系による生分解性ポリマーの品質および分解特性の制御に関する研究研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      2000 – 2001
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  乳酸菌による新規バクテリオシンの生産とその食品保存料への展開

    • 研究代表者
      塩谷 捨明
    • 研究期間 (年度)
      1998 – 1999
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  抗菌物質ナイシン生産プロセスにおける微生物相互作用を利用した制御技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      1998 – 1999
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  温度感受性組換え酵母培養プロセスにおけるオンライン状態認識・制御システムの開発

    • 研究代表者
      塩谷 捨明
    • 研究期間 (年度)
      1996 – 1997
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  画像処理装置を用いた放線菌の形態解析と抗生物質最大生産への応用研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      1995
    • 研究種目
      奨励研究(A)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  ファジィ理論と代謝反応モデルを用いた培養状態認識法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      清水 浩
    • 研究期間 (年度)
      1994
    • 研究種目
      奨励研究(A)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  生態工学的アプローチによる発酵醸造における乳酸菌の役割の解析とその制御

    • 研究代表者
      塩谷 捨明
    • 研究期間 (年度)
      1994 – 1995
    • 研究種目
      一般研究(B)
    • 研究分野
      生物・生体工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  生分解性ポリマー生産プロセスの計算機制御

    • 研究代表者
      菅 健一
    • 研究期間 (年度)
      1991 – 1993
    • 研究種目
      一般研究(B)
    • 研究分野
      化学工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  温度感受性遺伝子組み換え酵母による有用物質生産プロセスの構築と効率化

    • 研究代表者
      塩谷 捨明
    • 研究期間 (年度)
      1991 – 1992
    • 研究種目
      一般研究(C)
    • 研究分野
      化学工学
    • 研究機関
      大阪大学
  •  酵母によるグルタチオン生産プロセスの計算機制御

    • 研究代表者
      塩谷 捨明
    • 研究期間 (年度)
      1989 – 1990
    • 研究種目
      一般研究(C)
    • 研究分野
      化学工学
    • 研究機関
      大阪大学

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すべて 雑誌論文 学会発表 図書 産業財産権

  • [図書] 微生物を活用した有用物質の製造技術 第3章化成品原料の生産、13C代謝フラックス解析を利用したイソプロピルアルコール生産大腸菌の代謝改良2023

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 総ページ数
      8
    • 出版者
      CMC出版
    • ISBN
      9784781317403
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [図書] 光合成 第Ⅳ部、3. 光合成のカギとなる段階を探せ2021

    • 著者名/発表者名
      清水浩、豊島正和
    • 総ページ数
      224
    • 出版者
      朝倉書店
    • ISBN
      9784254171761
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [図書] 代謝センシング -健康,食,美容,薬,そして脳の代謝を知る- 第25章 動物培養細胞の13C代謝フラックス解析2018

    • 著者名/発表者名
      岡橋伸幸、松田史生、清水浩
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • ISBN
      9784781313504
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [図書] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 4: Indsutrial Biotechnology Products and Processes, Chapter 11. Glutamic acid fermentation: Discovery of glutamic acid-producing microorganisms, analysis of the production mechanism, metabolic engineering and industrial production process2017

    • 著者名/発表者名
      Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • 総ページ数
      22
    • 出版者
      Wiley-VCH
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [図書] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 8, Control of Microbial Processes2017

    • 著者名/発表者名
      Kazuyuki Shimizu, Hiroshi Shimizu, Toshiomi Yoshida,
    • 総ページ数
      22
    • 出版者
      Wiley-VCH
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [図書] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 7, Omics integrations for the state analysis of microbial processes2017

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu, Chikara Fursawa, Takashi Hirasawa, KatsunoriYoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, and Fumio Matsuda
    • 総ページ数
      36
    • 出版者
      Wiley-VCH
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [図書] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 7, Omics integrations for the state analysis of microbial processes2017

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu, Chikara Fursawa, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, and Fumio Matsuda
    • 総ページ数
      36
    • 出版者
      Wiley-VCH
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [図書] Chapter 17 Glutamic Acid2014

    • 著者名/発表者名
      Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • 総ページ数
      22
    • 出版者
      Weiley
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [図書] 合成生物工学の隆起 ―有用物質の新たな生産法構築をめざして― 第3章 オミクス解析の視点2012

    • 著者名/発表者名
      清水 浩
    • 総ページ数
      10
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [図書] バイオにもコンピュータが役立つってホント?ひらく、ひらく「バイオの世界」、14歳からの生物工学入門2012

    • 著者名/発表者名
      清水 浩
    • 総ページ数
      2
    • 出版者
      化学同人
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [図書] バイオ素材から樹脂原料2012

    • 著者名/発表者名
      清水 浩
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      日経新聞
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [図書] 日経新聞2012

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 総ページ数
      14
    • 出版者
      日本経済新聞社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [図書] 高等研報告書1005生物進化の持続性と転移(研究代表者津田一郎)2011

    • 著者名/発表者名
      古澤力, 堀之内貴明, 清水浩
    • 出版者
      第2章大腸菌の長期植え継ぎ培養における表現型・遺伝子型の網羅的解析
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [図書] 高等研報告書1005,生物進化の持続性と転移,第2章大腸菌の長期植え継ぎ培養における表現型・遺伝子型の網羅的解析2011

    • 著者名/発表者名
      古澤力, 堀之内貴明, 清水浩
    • 出版者
      財団法人国際高等研究所
    • URL

      http://www-shimizu.ist.osaka-u.ac.jp/

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [図書] メタボロミクスの先端技術と応用第14章メタボロームデータを用いた代謝フラックス解析2008

    • 著者名/発表者名
      清水浩、古澤力、白井智量
    • 出版者
      シーエムシー出版
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [図書] バイオプロダクション 第4章 : メタボリックエンジニアリング2006

    • 著者名/発表者名
      清水 浩
    • 総ページ数
      195
    • 出版者
      コロナ社
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [図書] Bioproduction Chapter 4 Metabolic Engineering2006

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi, ShimizuS (H., Chtake, ed.)
    • 総ページ数
      195
    • 出版者
      Corona Inc
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Coupling and uncoupling growth and product formation for producing chemicals2024

    • 著者名/発表者名
      Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Current Opinion in Biotechnology

      巻: - ページ: 103133-103133

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2024.103133

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Multicolor optogenetics for regulating flux ratio of three glycolytic pathways using EL222 and CcaSR in <i>Escherichia coli</i>2023

    • 著者名/発表者名
      Akagi Hayato、Shimizu Hiroshi、Toya Yoshihiro
    • 雑誌名

      Biotechnology and Bioengineering

      巻: 121 号: 3 ページ: 1016-1025

    • DOI

      10.1002/bit.28628

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Effects of <i>n</i>-butanol production on metabolism and the photosystem in <i>Synechococcus elongatus</i> PCC 7942 based on metabolic flux and target proteome analyses2023

    • 著者名/発表者名
      Wada Keisuke、Uebayashi Kiyoka、Toya Yoshihiro、Putri Sastia Prama、Matsuda Fumio、Fukusaki Eiichiro、C. Liao James、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 69 号: 4 ページ: 185-195

    • DOI

      10.2323/jgam.2023.03.002

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [雑誌論文] Functional evaluation of non-oxidative glycolysis in Escherichia coli in the stationary phase under microaerobic conditions2023

    • 著者名/発表者名
      Miyoshi Kenta、Kawai Ryutaro、Niide Teppei、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 135 号: 4 ページ: 291-297

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2023.01.002

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Effect of light fluctuations on photosynthesis and metabolic flux in Synechocystis sp. PCC 68032023

    • 著者名/発表者名
      Imada Tatsumi、Yamamoto Chiaki、Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology Progress

      巻: - 号: 3

    • DOI

      10.1002/btpr.3326

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [雑誌論文] Metabolic pathway design for growth-associated phenylalanine production using synthetically designed mutualism2022

    • 著者名/発表者名
      Kawai Ryutaro、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Bioprocess and Biosystems Engineering

      巻: 45 号: 9 ページ: 1539-1546

    • DOI

      10.1007/s00449-022-02762-4

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Logistic Regression-Guided Identification of Cofactor Specificity-Contributing Residues in Enzyme with Sequence Datasets Partitioned by Catalytic Properties2022

    • 著者名/発表者名
      Sugiki Sou、Niide Teppei、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      ACS Synthetic Biology

      巻: 11 号: 12 ページ: 3973-3985

    • DOI

      10.1021/acssynbio.2c00315

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K04841, KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] バイオによるものづくりに貢献する機械学習・深層学習技術2022

    • 著者名/発表者名
      徳山健斗、清水浩
    • 雑誌名

      化学工学

      巻: 86 ページ: 161-164

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Metabolic pathway engineering for the non-growth-associated succinate production in Escherichia coli based on flux solution space2022

    • 著者名/発表者名
      Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 134 号: 1 ページ: 29-33

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2022.04.008

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] 発酵生産プロセスにおけるDX:データ駆動型のリジン発酵自律制御システムの開発2022

    • 著者名/発表者名
      徳山健斗、清水浩
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 80 ページ: 26-30

    • NAID

      40022815673

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Recent advances in metabolic engineering?integration of in silico design and experimental analysis of metabolic pathways2021

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi、Toya Yoshihiro
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 132 号: 5 ページ: 429-436

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2021.08.002

    • NAID

      40022744384

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Identification of a rate-limiting step in a metabolic pathway using the kinetic model and in?vitro experiment2021

    • 著者名/発表者名
      Kitamura Sayaka、Shimizu Hiroshi、Toya Yoshihiro
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 131 号: 3 ページ: 271-276

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.10.008

    • NAID

      40022515098

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626, KAKENHI-PROJECT-18K04850
  • [雑誌論文] Estimation of linear and cyclic electron flows in photosynthesis based on 13C-metabolic flux analysis2021

    • 著者名/発表者名
      Yamamoto Chiaki、Toyoshima Masakazu、Kitamura Sayaka、Ueno Yoshifumi、Akimoto Seiji、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 131 号: 3 ページ: 277-282

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.11.002

    • NAID

      40022515104

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Role of type I NADH dehydrogenase in Synechocystis sp. PCC 6803 under phycobilisome excited red light2021

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Yamamoto Chiaki、Ueno Yoshifumi、Toya Yoshihiro、Akimoto Seiji、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Plant Science

      巻: 304 ページ: 110798-110798

    • DOI

      10.1016/j.plantsci.2020.110798

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Acceleration of target production in co‐culture by enhancing intermediate consumption through adaptive laboratory evolution2021

    • 著者名/発表者名
      Kawai Ryutaro、Toya Yoshihiro、Miyoshi Kenta、Murakami Manami、Niide Teppei、Horinouchi Takaaki、Maeda Tomoya、Shibai Atsushi、Furusawa Chikara、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology and Bioengineering

      巻: 119 号: 3 ページ: 936-945

    • DOI

      10.1002/bit.28007

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K15096, KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Mutations in hik26 and slr1916 lead to high-light stress tolerance in Synechocystis sp. PCC68032021

    • 著者名/発表者名
      Yoshikawa Katsunori、Ogawa Kenichi、Toya Yoshihiro、Akimoto Seiji、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 4 号: 1

    • DOI

      10.1038/s42003-021-01875-y

    • NAID

      120007028956

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Reactor control system in bacterial co‐culture based on fluorescent proteins using an Arduino‐based home‐made device2021

    • 著者名/発表者名
      Kusuda Minori、Shimizu Hiroshi、Toya Yoshihiro
    • 雑誌名

      Biotechnology Journal

      巻: 16 号: 12 ページ: 2100169-2100169

    • DOI

      10.1002/biot.202100169

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Thioredoxin pathway in Anabaena sp. PCC 7120: activity of NADPH-thioredoxin reductase C2021

    • 著者名/発表者名
      Deschoenmaeker Frederic、Mihara Shoko、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Wakabayashi Ken-Ichi、Toyoshima Masakazu、Shimizu Hiroshi、Hisabori Toru
    • 雑誌名

      The Journal of Biochemistry

      巻: - 号: 6 ページ: 709-719

    • DOI

      10.1093/jb/mvab014

    • NAID

      40022687787

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PROJECT-18H03984, KAKENHI-PROJECT-20K21420, KAKENHI-PLANNED-20H05925, KAKENHI-PROJECT-19H03242, KAKENHI-PUBLICLY-21H00420
  • [雑誌論文] Transcription Factor ArcA is a Flux Sensor for the Oxygen Consumption Rate inEscherichia coli2020

    • 著者名/発表者名
      Nochino Naoya、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology Journal

      巻: 15 号: 6 ページ: 1900353-1900353

    • DOI

      10.1002/biot.201900353

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626, KAKENHI-PROJECT-18K04850
  • [雑誌論文] Flux balance analysis of cyanobacteria reveals selective use of photosynthetic electron transport components under different spectral light conditions2020

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: 143 号: 1 ページ: 31-43

    • DOI

      10.1007/s11120-019-00678-x

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Flux controlling technology for central carbon metabolism for efficient microbial bio-production2020

    • 著者名/発表者名
      Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Current Opinion in Biotechnology

      巻: 64 ページ: 169-174

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2020.04.003

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] 光照射により代謝フラックスをコントロールする技術の開発2020

    • 著者名/発表者名
      戸谷吉博、清水浩
    • 雑誌名

      バイオサイエンスとインダストリー

      巻: 78 ページ: 31-32

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [雑誌論文] Novel allosteric inhibition of phosphoribulokinase identified by ensemble kinetic modeling of Synechocystis sp. PCC 6803 metabolism2020

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Liao James、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering Communications

      巻: 11 ページ: e00153-e00153

    • DOI

      10.1016/j.mec.2020.e00153

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PLANNED-17H06303
  • [雑誌論文] Assessment of Protein Content and Phosphorylation Level in Synechocystis sp. PCC 6803 under Various Growth Conditions Using Quantitative Phosphoproteomic Analysis2020

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Tokumaru Yuma、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 25 号: 16 ページ: 3582-3582

    • DOI

      10.3390/molecules25163582

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Prediction of Rate‐Limiting Reactions for Growth‐Associated Production Using a Constraint‐Based Approach2019

    • 著者名/発表者名
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology Journal

      巻: 14 号: 9 ページ: 1800431-1800431

    • DOI

      10.1002/biot.201800431

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H00839
  • [雑誌論文] Targeted proteome analysis of microalgae under high-light conditions by optimized protein extraction of photosynthetic organisms.2019

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima, M., Sakata, M., Ohnishi, K., Tokumaru, Y., Kato, Y., Tokutsu, R., Sakamoto, W., Minagawa, J., Matsuda, F., Shimizu, H.
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: 127 号: 3 ページ: 394-402

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.09.001

    • NAID

      40021846292

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K06290, KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PLANNED-16H06553
  • [雑誌論文] High-yielding rice Takanari has superior photosynthetic response to a commercial rice Koshihikari under fluctuating light2019

    • 著者名/発表者名
      Adachi Shunsuke、Tanaka Yu、Miyagi Atsuko、Kashima Makoto、Tezuka Ayumi、Toya Yoshihiro、Kobayashi Shunzo、Ohkubo Satoshi、Shimizu Hiroshi、Kawai-Yamada Maki、Sage Rowan F、Nagano Atsushi J、Yamori Wataru
    • 雑誌名

      Journal of Experimental Botany

      巻: 70 号: 19 ページ: 5287-5297

    • DOI

      10.1093/jxb/erz304

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K19164, KAKENHI-PROJECT-18K14386, KAKENHI-PROJECT-18KK0170, KAKENHI-PLANNED-16H06556, KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PUBLICLY-19H04715, KAKENHI-PROJECT-18H02165, KAKENHI-PROJECT-18H02185
  • [雑誌論文] 計算機工学に基づく代謝設計とその有効性の実証に関する研究2019

    • 著者名/発表者名
      清水 浩
    • 雑誌名

      生物工学誌

      巻: 97 ページ: 13-20

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [雑誌論文] Time-resolved analysis of short term metabolic adaptation at dark transition in Synechocystis sp. PCC68032019

    • 著者名/発表者名
      Maruyama Masaharu、Nishiguchi Hiroki、Toyohima Masakazu、Okahashi Nobuyuki、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience Bioengineering

      巻: -

    • NAID

      40022037144

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Transomics data-driven, ensemble kinetic modeling for system-level understanding and engineering of the cyanobacteria central metabolism2019

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Hiasa Natsuki、Uebayashi Kiyoka、Liao James、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering

      巻: 52 ページ: 273-283

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2019.01.004

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PLANNED-17H06303
  • [雑誌論文] Magnesium starvation improves production of malonyl-CoA-derived metabolites in Escherichia coli2019

    • 著者名/発表者名
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio、Cress Brady F.、Koffas Mattheos A.G.、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering

      巻: 52 ページ: 215-223

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2018.12.002

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [雑誌論文] Optimal 13 C-labeling of glycerol carbon source for precise flux estimation in Escherichia coli2018

    • 著者名/発表者名
      Toya Yoshihiro、Ohashi Shugo、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 125 号: 3 ページ: 301-305

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2017.09.009

    • NAID

      210000005652

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [雑誌論文] Mass Spectrometry-Based Method to Study Inhibitor-Induced Metabolic Redirection in the Central Metabolism of Cancer Cells2018

    • 著者名/発表者名
      Araki Chie、Okahashi Nobuyuki、Maeda Kousuke、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • 雑誌名

      Mass Spectrometry

      巻: 7 号: 1 ページ: A0067-A0067

    • DOI

      10.5702/massspectrometry.A0067

    • NAID

      130007396785

    • ISSN
      2186-5116, 2187-137X
    • 年月日
      2018-06-14
    • 言語
      英語
    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 and mechanisms of photoinhibition tolerance under extreme high light conditions2018

    • 著者名/発表者名
      Ogawa Kenichi、Yoshikawa Katsunori、Matsuda Fumio、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 126 号: 5 ページ: 596-602

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.05.015

    • NAID

      40021726334

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Metabolic engineering of mevalonate-producing Escherichia coli strains based on thermodynamic analysis2018

    • 著者名/発表者名
      Nagai Hikaru、Masuda Ami、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Metabolic Engineering

      巻: 47 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2018.02.012

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06303, KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [雑誌論文] Application of adaptive laboratory evolution to overcome a flux limitation in an Escherichia coli production strain2018

    • 著者名/発表者名
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、Horinouchi Takaaki、Furusawa Chikara、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology and Bioengineering

      巻: 115 号: 6 ページ: 1542-1551

    • DOI

      10.1002/bit.26568

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15052, KAKENHI-PROJECT-16H04576, KAKENHI-PROJECT-15J06350
  • [雑誌論文] Comparative Targeted Proteomics of the Central Metabolism and Photosystems in SigE Mutant Strains of Synechocystis sp. PCC 68032018

    • 著者名/発表者名
      Tokumaru Yuma、Uebayashi Kiyoka、Toyoshima Masakazu、Osanai Takashi、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Molecules

      巻: 23 号: 5 ページ: 1051-1051

    • DOI

      10.3390/molecules23051051

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Metabolic flux of the oxidative pentose phosphate pathway under low light conditions in Synechocystis sp. PCC 68032018

    • 著者名/発表者名
      Ueda Kentaro、Nakajima Tsubasa、Yoshikawa Katsunori、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng.

      巻: - 号: 1 ページ: 38-43

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.01.020

    • NAID

      40021601004

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Identification of alcohol stress tolerance genes of Synechocystis sp. PCC 6803 using adaptive laboratory evolution2017

    • 著者名/発表者名
      Matsusako Takuya、Toya Yoshihiro、Yoshikawa Katsunori、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology for Biofuels

      巻: 10 号: 1 ページ: 307-307

    • DOI

      10.1186/s13068-017-0996-5

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Metabolic engineering of isopropyl alcohol-producing Escherichia coli strains with 13C-metabolic flux analysis2017

    • 著者名/発表者名
      Okahashi Nobuyuki、Matsuda Fumio、Yoshikawa Katsunori、Shirai Tomokazu、Matsumoto Yoshiko、Wada Mitsufumi、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnolgy and Bioengineering

      巻: 114 号: 12 ページ: 2782-2793

    • DOI

      10.1002/bit.26390

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [雑誌論文] Metabolic engineering of Synechocystis sp. PCC 6803 for enhanced ethanol production based on flux balance analysis2017

    • 著者名/発表者名
      Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Bioprocess and Biosystems Engineering

      巻: 40 号: 5 ページ: 1-6

    • DOI

      10.1007/s00449-017-1744-8

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Learning from quantitative data to understand central carbon metabolism2017

    • 著者名/発表者名
      Matsuda Fumio、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 雑誌名

      Biotechnology Advances

      巻: 35 号: 8 ページ: 971-980

    • DOI

      10.1016/j.biotechadv.2017.09.006

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-17H06303, KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [雑誌論文] 13C-metabolic flux analysis for mevalonate producing Escherichia coli2016

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Wada, Yoshihiro Toya, Satomi Banno, Katsunori Yoshikawa, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      巻: 123 号: 2 ページ: 177-182

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2016.08.001

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [雑誌論文] Recent advances in amino acid production by microbial cells2016

    • 著者名/発表者名
      Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Current Opinion in Biotechnology

      巻: 42 ページ: 133-146

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2016.04.017

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576, KAKENHI-PROJECT-16K14881
  • [雑誌論文] Combinatorial deletions of glgC and phaCE enhance ethanol production in Synechocystis sp. PCC 68032016

    • 著者名/発表者名
      Katsunori Namakoshi, Tubasa Nakajima, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology

      巻: 239 ページ: 13-19

    • DOI

      10.1016/j.jbiotec.2016.09.016

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Metabolic flux analysis of Synechocystis sp. PCC6803 ΔnrtABCD mutant reveals a mechanism for metabolic adaptation to nitrogen-limited conditions2016

    • 著者名/発表者名
      Tsubasa Nakajima, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda, and Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 58 号: 5 ページ: 537-545

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx047

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [雑誌論文] Enhancement of 1,5-diaminopentane production in a recombinant strain of <i>Corynebacterium glutamicum</i> by Tween 40 addition2016

    • 著者名/発表者名
      Yuta Matsushima, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 62 号: 1 ページ: 42-45

    • DOI

      10.2323/jgam.62.42

    • NAID

      130005127286

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 言語
      英語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Metabolomic analysis of acid stress response in Saccharomyces cerevisiae2015

    • 著者名/発表者名
      Riyanto Heru Nugroho, Katsunori Yoshikawa, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng

      巻: 120 号: 4 ページ: 396-404

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2015.02.011

    • NAID

      110010010221

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Phenotypic convergence in bacterial adaptive evolution to ethanol stress2015

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Horinouchi, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shizmiu, Chikara Furusawa
    • 雑誌名

      BMC Evo. Biol.

      巻: 15 号: 1 ページ: 180-180

    • DOI

      10.1186/s12862-015-0454-6

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05746, KAKENHI-PROJECT-24246134, KAKENHI-PROJECT-26640135, KAKENHI-PROJECT-26290071
  • [雑誌論文] 13C-based metabolic flux analysis of Saccharomyces cerevisiae with a reduced Crabtree effect2015

    • 著者名/発表者名
      Shuichi Kajihata, Fumio Matsuda, Mika Yoshimi, Kenshi Hayakawa, Chikara Furusawa, Akihisa Kanda, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      J Biosci Bioeng

      巻: 120 号: 2 ページ: 140-144

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2014.12.014

    • NAID

      210000005080

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Increased 3-hydroxypropionic acid production from glycerol, by modification of central metabolism in Escherichia coli2014

    • 著者名/発表者名
      Kento Tokuyama, Satoshi Ohno, Katsunori Yoshikawa, Takashi Hirasawa, Shotaro Tanaka, Chikara Furusawa and Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Microbial Cell Factories

      巻: 13 号: 1 ページ: 64-64

    • DOI

      10.1186/1475-2859-13-64

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23680030, KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Enhanced acetic acid and succinic acid production under microaerobic conditions by <i>Corynebacterium glutamicum</i> harboring <i>Escherichia coli</i> transhydrogenase gene <i>pntAB</i>2014

    • 著者名/発表者名
      Yuto Yamauchi, Takashi Hiraswa, Msato Nishii, Chikara Furuasawa, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      The Journal of General and Applied Microbiology

      巻: 60 号: 3 ページ: 112-118

    • DOI

      10.2323/jgam.60.112

    • NAID

      130004449385

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • 言語
      英語
    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for improving succinic acid production based on metabolic profiling2014

    • 著者名/発表者名
      Yuma Ito, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      巻: -

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] FastPros : screening of reaction knockout strategies for metabolic engineering2014

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ohno, Chikara Furusawa and Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 30(7) 号: 7 ページ: 981-7

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btt672

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23680030, KAKENHI-PROJECT-24246134, KAKENHI-PUBLICLY-25128715
  • [雑誌論文] Development of an automated culture system for laboratory evolution2014

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Horinouchi, Teruaki Minamoto, Shingo Suzuki, Hiroshi Shimizu, Chikara Furusawa
    • 雑誌名

      Journal of Laborarory Automation

      巻: -

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Addendum, Potential of a Saccharomyces cerevisiae recombinant strain lacking ethanol and glycerol biosynthesis pathways in efficient anaerobic bioproduction2014

    • 著者名/発表者名
      Takashi Hirasawa, Yoshihiro Ida, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      Bioengineered

      巻: 5

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] In silico screening of triple reaction knockout Escherichia coli strains for overproduction of useful metabolites2013

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Ohno, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      J. Biosci. Bioeng

      巻: 115 ページ: 221-228

    • NAID

      110009592575

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Integrated transcriptomic and metabolomic analysis of the central metabolism of Synechocystis sp. PCC 6803 under different trophic conditions2013

    • 著者名/発表者名
      Katsunori Yoshikawa
    • 雑誌名

      Biotechnology Journal

      巻: 印刷中 号: 5 ページ: 571-580

    • DOI

      10.1002/biot.201200235

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [雑誌論文] 代謝工学の創成と発展、-代謝解析とオミクス研究との融合2012

    • 著者名/発表者名
      清水 浩
    • 雑誌名

      生物工学会誌

      巻: 90 ページ: 619-620

    • NAID

      110009553229

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [雑誌論文] Reconstruction and verification of a genome-scale metabolic model for Synechocystis sp2011

    • 著者名/発表者名
      Katsunori Yoshikawa, Yuta Kojima, Tsubasa Nakajima, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      PCC6803, Applied Microbiology and Biotechnology

      巻: 92:2 号: 2 ページ: 347-358

    • DOI

      10.1007/s00253-011-3559-x

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2010

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Horinouchi, Hiroshi Shimizu
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: Vol.11 ページ: 579-579

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [雑誌論文] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2010

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu.
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 11 号: 1 ページ: 579-579

    • DOI

      10.1186/1471-2164-11-579

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [雑誌論文] Dynamic change in promoter activation in lysine biosynthesis of Escherichia coli cell2008

    • 著者名/発表者名
      J. Ou, H. Shimizu, ら7名
    • 雑誌名

      Molecular Bio Systems 4巻

      ページ: 128-134

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Dynamic change in promoter activation in lysine biosynthesis of Escherichia coli cell2008

    • 著者名/発表者名
      J. Ou, H. Shimizuら7名
    • 雑誌名

      Molecular BioSystems 4巻

      ページ: 128-134

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Advanced Technology of Metabolomics and its Application, Chapter 14, Metabolic flux analysis based on metabolomics data2008

    • 著者名/発表者名
      H., Shimizu, C., Furusawa, T., Shirai
    • 雑誌名

      CMC Publisher Inc

      ページ: 171-184

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Dynamic change in promoter activation in lysine biosynthesis of Escherichia coli cell2008

    • 著者名/発表者名
      J., Cu, H. Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      Molecular BioSystems 4

      ページ: 128-134

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Identification of target genes for conferring ethanol stress-tolerance to yeast Saccharomyces cerevisiae based on DNA microarray data analysis2007

    • 著者名/発表者名
      T., Hirasawa, H., Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology 131

      ページ: 33-44

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using Self Organizing Map2007

    • 著者名/発表者名
      G.Pandey, H.Shimizuら全8名
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology (In press)(印刷中)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Analysis of fluctuation in protein abundance without promoter regulation based on Eschrichia coli continuous culture2007

    • 著者名/発表者名
      T. Yamada, H. Shimizuら6名
    • 雑誌名

      BioSystems 90巻

      ページ: 614-622

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      S. Shioya, H. Shimizu, ら8名
    • 雑誌名

      Biochemical Engineering Journal 36巻

      ページ: 28-37

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • 著者名/発表者名
      T. Shirai, H. Shimizu, ら6名
    • 雑誌名

      Microbial Cell Factory 6巻

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      S. Shioya, H. Shimizuら8名
    • 雑誌名

      Biochemical Engineering Journal 36巻

      ページ: 28-37

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • 著者名/発表者名
      T. Shirai, H. Shimizuら6名
    • 雑誌名

      Microbial Cell Factory 6巻

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Identification of target genes for conferring ethanol stress-tolerance to yeast Saccharomyces cerevisiae based on DNA microarray data analysis2007

    • 著者名/発表者名
      T. Hirasawa, H. Shimizu, ら8名
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology 131巻

      ページ: 33-44

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      S., Shioya, H., Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      Biochemical Engineering Journal 36(1)

      ページ: 28-37

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using self organizing map: biosynthesis of amino acids2007

    • 著者名/発表者名
      G. Pandey, H. Shimizuら8名
    • 雑誌名

      Applied Microbiology Biotechnology 75巻

      ページ: 415-426

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using self organizing map : biosynthesis of amino acids2007

    • 著者名/発表者名
      G., Pandey, H., Shimizu
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology 75

      ページ: 415-426

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using self organizing map: biosynthesis of amino acids2007

    • 著者名/発表者名
      G. Pandey, H. Shimizu, ら8名
    • 雑誌名

      Applied Microbiology Biotechnology 75巻

      ページ: 415-426

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Identification of target genes for conferring ethanol stress-tolerance to yeast Saccharomyces cerevisiae based on DNA microarray data analysis2007

    • 著者名/発表者名
      T. Hirasawa, H. Shimizuら8名
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology 131巻

      ページ: 33-44

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Analysis of fluctuation in protein abundance without promoter regulation based on Eschrichia coli continuous culture2007

    • 著者名/発表者名
      T., Yamada, H., Shimizu
    • 雑誌名

      BioSystems 90

      ページ: 614-622

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      S.Shioya, H.Shimizuら全8名
    • 雑誌名

      Biochemical Engineering Journal (In press)(印刷中)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • 著者名/発表者名
      T., Shirai, H., Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      Microbial Cell Factory 6

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Analysis of fluctuation in protein abundance without promoter regulati on based on Eschrichia coli continuous culture2007

    • 著者名/発表者名
      T. Yamada, H. Shimizu, ら6名
    • 雑誌名

      Bio Systems 90巻

      ページ: 614-622

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Precise metabolic flux analysis of coryneform bacteria with gas spectrometry -mass spectrometry and verification of nuclear magnetic resonance2006

    • 著者名/発表者名
      T., Shirai, H., Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102(5)

      ページ: 413-424

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Comparison of transcriptional responses to osmotic stresses induced by NaCl and sorbitol additions in Saccharomyces cerevisiae using DNA microarray2006

    • 著者名/発表者名
      H.Hirasawa, H.Shimizuら全8名
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102巻6号

      ページ: 568-571

    • NAID

      110006196953

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Analysis of fluctuation in gene expression based on continuous culture system2006

    • 著者名/発表者名
      T.Yamada, H.Shimizu et al.
    • 雑誌名

      Proceedings of The 2nd International Workshop on Biologically Inspired Approaches to Advanced Information Technology LNCS 3853

      ページ: 113-127

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [雑誌論文] Comparative analysis of transcriptional responses to saline stress in the laboratory and brewing strains of Saccharomyces cerevisiae with DNA microarray2006

    • 著者名/発表者名
      H., Hirasawa, H., Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology 70(3)

      ページ: 346-357

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Comparative analysis of transcriptional responses to saline stress in the laboratory and brewing strains of Saccharomyces cerevisiae with DNA microarray2006

    • 著者名/発表者名
      H.Hirasawa, H.Shimizuら全9名
    • 雑誌名

      Applied Microbiology and Biotechnology 70巻3号

      ページ: 346-357

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Comparison of transcriptional responses to osmotic stresses induced by NaCI and sorbitol additions in Saccharomyces cerevisiae using DNAmicroarray2006

    • 著者名/発表者名
      H., Hirasawa, H., Shimizu, et. al.
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102(6)

      ページ: 568-571

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Precise metabolic flux analysis of coryneform bacteria with gas spectrometry-mass spectrometry and verification of nuclear magnetic resonance2006

    • 著者名/発表者名
      T.Shirai, H.Shimizuら全7名
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102巻5号

      ページ: 413-424

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [雑誌論文] Dynamic Behavior of Cell Distribution in Continuous Culture of Escherichia coli2005

    • 著者名/発表者名
      T.Yamdada, H.Shimizu et al.
    • 雑誌名

      ソフトウエアバイオロジー 4

      ページ: 31-36

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [雑誌論文] Dynamic Behavior of Cell Distribution in Continuous Culture of Escherichia coli2005

    • 著者名/発表者名
      T.Yamdada, H.Shimizu et al.
    • 雑誌名

      ソフトウエアバイオロジー 4巻(印刷中)

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [雑誌論文] Analysis of Cell Population Dynamics in Continuous Culture of Escherichia coli2004

    • 著者名/発表者名
      T.yamdada, H.Shimizu et al.
    • 雑誌名

      Proceedings of 10th The Asia Pacific Confederations on Chemical Engineering (APCChE04), Kitakyushu, 6 Pages, Oct 17-21(2004) (CD-ROM)

    • NAID

      130005052895

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [雑誌論文] Analysis of Cell Population Dynamics in Continuous Culture of Escherichia coli2004

    • 著者名/発表者名
      T.Yamdada, H.Shimizu et al.
    • 雑誌名

      Proceedings of 10th The Asia Pacific Confederation on Chemical Engineering (APCChE04), Kitakyushu, 6 pages, Oct 17-21(2004) (CD-ROM)

    • NAID

      130005052895

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [雑誌論文] Enhanced kefiran production by mixed culture of Lactobacillus kefiranofaciens and Saccharomyces cerevisiae2003

    • 著者名/発表者名
      B.Cheirsilp, H.Shimizu, S.Shioya
    • 雑誌名

      Journal of Biotechnology 100

      ページ: 45-53

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15360441
  • [雑誌論文] Interactions between Lactobacillus kefiranofaciens and Saccharomyce scerevisiae in mixed culture of kefiran production2003

    • 著者名/発表者名
      B.Cheirsilp, H.Shoji, H.Shimizu, S.Shioya
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 96

      ページ: 278-284

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15360441
  • [雑誌論文] Interactions between Lactobacillus kefiranofaciens and Saccharomyce scerevisiae in mixed culture of kefiran production.2003

    • 著者名/発表者名
      B.Cheirsilp, H.Shoji, H.Shimizu, S.Shioya
    • 雑誌名

      Journal of Bioscience and Bioengineering 96

      ページ: 278-284

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15360441
  • [産業財産権] ホスホエノールピルビン酸カルボキシラーゼを活性化することができるポリペプチド2023

    • 発明者名
      松村浩由、戸谷吉博、清水浩 他7名
    • 権利者名
      松村浩由、戸谷吉博、清水浩 他7名
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2023
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 計算機工学を基盤とするバイオテクノロジーの高度化2024

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      化学工学会バイオプロセス講演会「生物機能を利用したモノづくり」に貢献するプロセス強化
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] マルチカラー光による大腸菌代謝経路のフラックス制御技術の開発2024

    • 著者名/発表者名
      赤木 駿斗、清水 浩、戸谷 吉博
    • 学会等名
      化学工学会第89年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 大腸菌におけるメバロン酸生産のための光遺伝学技術を利用した代謝工学2024

    • 著者名/発表者名
      櫻井 翔太、清水 浩、戸谷 吉博
    • 学会等名
      化学工学会第89年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] グリコールアルデヒドがシアノバクテリアの代謝に与える影響の解析2024

    • 著者名/発表者名
      今田 辰海,戸谷 吉博,清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第89年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [学会発表] 機械学習を活用した酵素の分子認識特性の変換2023

    • 著者名/発表者名
      二井手 哲平、杉木 創、森 聖也、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第54回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] Metabolic Engineering Based on in Silico Design and Experimental Analysis for Bioproduction2023

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      ASBA2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 光駆動プロトンポンプを利用した大腸菌の酸耐性の強化と有用物質生産への応用2023

    • 著者名/発表者名
      小林祐摩、佐野海瑚人、弘埜陽子、松田史生、石井純、原清敬、清水浩、戸谷吉博
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 進化と構造の情報を組み込んだ酵素の耐熱化デザイン2023

    • 著者名/発表者名
      宮脇佳汰、二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 光遺伝学による複数酵素を対象とした代謝フラックス抑制技術の開発2023

    • 著者名/発表者名
      櫻井翔太、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] EL222-based optogenetic flux control on the glycolytic pathways in Escherichia coli2023

    • 著者名/発表者名
      Hayto Akagi、 Hiroshi Shimizu、 Yoshihiro Toya
    • 学会等名
      Metabolic Engineering 15
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] Light-driven ATP regeneration for enhancing 3-hydroxypropionic acid and isoprenol productions in Escherichia coli2023

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Toya、Mikoto Sano、Ryo Tanaka、 Kentaro Kamata、Fumio Matsuda、Jun Ishii、 Yoko Hirono-Hara、 Kiyotaka Y. Hara、 Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Metabolic Engineering 15
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] モデル基盤代謝デザインと指向性進化による微生物創製2023

    • 著者名/発表者名
      清水 浩、戸谷 吉博、古澤 力、芝井 厚、堀之内 貴明、鈴木 宏明、徳山 健斗、二井手 哲平
    • 学会等名
      化学工学会第54回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] エレメンタリーモード解析による非酸化的解糖経路を導入したブチロラクタム生産大腸菌の代謝デザイン2023

    • 著者名/発表者名
      三吉 健太、二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第88年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 酵素の基質特異性決定残基の同定におけるロジステック回帰モデルの有用性2023

    • 著者名/発表者名
      二井手哲平、杉木創、森聖也、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] Optimal production of mevalonate by modification of ribosome-binding sequences of Escherichia coli chromosome2023

    • 著者名/発表者名
      Shogo Sawada、Yoshihiro Toya、Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Metabolic Engineering 15
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] モデルベース指向性進化による中枢代謝の各経路における律速の解放2023

    • 著者名/発表者名
      戸谷吉博、三吉健太、川本優一、芝井厚、古澤力、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第88年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] リボソーム結合配列の改変による幅広い解糖系のフラックス比を持つ大腸菌ライブラリの構築2023

    • 著者名/発表者名
      下谷朋輝、澤田将吾、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 大腸菌におけるギ酸資化経路を稼働させるための培養条件の探索2023

    • 著者名/発表者名
      巽慶太郎、小林祐摩、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] Machine learning-guided cofactor specificity conversion of a malic enzyme using sequence datasets divided by catalytic properties2023

    • 著者名/発表者名
      Teppei Niide、 Sou Sugiki、 Yoshihiro Toya、 Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Metabolic Engineering 15
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 非酸化的解糖経路を導入した大腸菌によるブチロラクタム生産のための代謝経路改変2023

    • 著者名/発表者名
      三吉健太、一色衣香、二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 光遺伝学技術を利用した代謝フラックス制御とその応用2023

    • 著者名/発表者名
      戸谷 吉博、赤木 駿斗、櫻井 翔太、川西 寿和、塚本 雅士、清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第54回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 光遺伝学代謝フラックス制御を利用した大腸菌の1,3-プロパンジオール生産2023

    • 著者名/発表者名
      川西寿和、櫻井翔太、清水浩、戸谷吉博
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 機械学習を用いた代謝酵素の基質特異性決定残基の推定と変換2023

    • 著者名/発表者名
      森聖也、二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] マルチカラー光による大腸菌の代謝フラックス分布の光遺伝学的制御2023

    • 著者名/発表者名
      赤木駿斗、清水浩、戸谷吉博
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] Metabolic design of butyrolactam-producing Escherichia coli introducing non-oxidative glycolysis by elementary mode analysis2023

    • 著者名/発表者名
      Kenta Miyoshi、 Teppei Niide、 Yoshihiro Toya、 Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Metabolic Engineering 15
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 蛍光タンパク質センサを利用した大腸菌の新規NADPH再生反応の同定2023

    • 著者名/発表者名
      上野航一郎、澤田将吾、石橋真衣、神田義貴、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第75回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] Effect of fluctuating light condition on photosynthesis and central carbon metabolism in Synechosystis sp. PCC 68032022

    • 著者名/発表者名
      Tatsumi Imada, Chiaki Yamamoto, Yoshihiro Toya, and Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [学会発表] マイクロドロップレットを用いた大腸菌指向進化実験のとりく み2022

    • 著者名/発表者名
      佐藤玲子、大竹理寛、高昱偲、戸谷吉博、清水浩、鈴木宏明
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 指向性進化を目的としたマイクロ流路細胞培養システムの開発2022

    • 著者名/発表者名
      大竹理寛、佐藤玲子、戸谷吉博、清水浩、鈴木宏明
    • 学会等名
      日本機械学会2022年度年次大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] シアノバクテリアにおけるEntner-Doudoroff経路の生理学的役割2022

    • 著者名/発表者名
      今田辰海、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [学会発表] ロドプシンによる光駆動プロトンポンプが大腸菌の弱酸耐性に及ぼす影響2022

    • 著者名/発表者名
      小林 祐摩、佐野 海瑚人、弘埜 陽子、松田 史生、石井 純、原 清敬、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第87年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] シアノバクテリアにおけるエントナードウドロフ経路の生理学的影響の解析2022

    • 著者名/発表者名
      今田辰海,戸谷吉博,清水浩
    • 学会等名
      第63回日本植物生理学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [学会発表] 微生物共培養のための精製タグ付きタンパク質を利用した13C代謝フラックス比解析技術の開発2022

    • 著者名/発表者名
      川本優一、二井手哲平、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] In silico and Experimental Metabolic Flux Analyses and their Applications to Fermentation Processes2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      2022 Agricultural Biotechnology Symposium, Metabolomics for Food and Human Health, Center for Food and Bioconvergence,
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 異なる炭素源を消費する2種類の大腸菌株を用いた共培養によるイソプレノール生産2022

    • 著者名/発表者名
      村上茉奈美、川井隆太郎、三吉健太、芝井厚、前田智也、堀之内貴明、古澤力、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 非酸化的解糖経路の有望な目的化合物の検討とin silico代謝デザイン2022

    • 著者名/発表者名
      三吉 健太、一色 衣香、二井手 哲平、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 微生物共培養のための精製タンパク質を利用した13C代謝フラックス比解析技術の開発2022

    • 著者名/発表者名
      川本優一、清水浩、戸谷吉博
    • 学会等名
      化学工学会第87年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] マルチカラー光による代謝経路のフラックス制御に向けた検討2022

    • 著者名/発表者名
      赤木駿斗、清水浩、戸谷吉博
    • 学会等名
      化学工学会第87年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] In silico代謝デザインプラットフォームと代謝フラックス解析による微生物発酵の育種とプロセス開発の高度化2022

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      生物工学会中部支部第9回CHUBU懇話会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 人工的な相利共生関係を利用した指向性進化による有用物質生産菌の開発2022

    • 著者名/発表者名
      川井 隆太郎、戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第53回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] アンチセンスRNAを利用した光照射による代謝フラックス制御技術の開発2022

    • 著者名/発表者名
      櫻井 翔太、戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 青色光応答タンパク質を利用した中枢代謝フラックスの制御技術の開発2022

    • 著者名/発表者名
      赤木 駿斗、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 大腸菌における非酸化的解糖系の機能評価と有用物質生産への応用可能性の検討2022

    • 著者名/発表者名
      三吉 健太、川井 隆太郎、二井手 哲平、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第87年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] CO2排出を抑制した物質生産に向けた大腸菌における逆グリオキシル酸経路の利用2022

    • 著者名/発表者名
      田中恒作、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第53回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 大腸菌の染色体上リボゾーム結合部位改変を利用した中枢炭素代謝フラックスの精密制御2022

    • 著者名/発表者名
      澤田将吾、松田史生、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第53回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] In silico and Experimental Metabolic Flux Analyses and their Applications to Fermentation Processes2022

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Regulation
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [学会発表] 共培養代謝工学のための経路分断方法の検討2022

    • 著者名/発表者名
      多田一紀、清水浩、戸谷吉博
    • 学会等名
      化学工学会第87年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 大腸菌におけるロドプシンの光駆動プロトンポンプが弱酸耐性に及ぼす影響2022

    • 著者名/発表者名
      小林祐摩、佐野海瑚人、弘埜陽子、松田史生、石井純、原清敬、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第74回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 共培養チロシン生産に適した代謝改変の検討2022

    • 著者名/発表者名
      多田一紀、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第53回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] mBFPセンサーを使った栄養飢餓大腸菌における細胞内NADPHレベルの摂動解析2021

    • 著者名/発表者名
      上野 航一郎、戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] FBA シミュレーションによるシアノバクテリアにおける PSI/PSII励起比と光合成電子伝達フラックスの関係ならびに NDH-1 の機能解析2021

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      第6回光合成細菌ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 逆グリオキシル酸経路を導入した大腸菌の開発と代謝評価2021

    • 著者名/発表者名
      田中 恒作、 戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 大腸菌染色体上のリボソーム結合配列改変による中枢代謝フラックスの調節2021

    • 著者名/発表者名
      澤田 将吾、松田 史生、 戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 機械学習を利用した代謝酵素の補酵素特異性の設計と活性測定による検証2021

    • 著者名/発表者名
      杉木 創、二井手 哲平、戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 動的代謝モデルを用いたシアノバクテリアのカルビン回路における制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      田島 遼太郎,池原 万由, 戸谷 吉博, 清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [学会発表] メバロン酸取り込み能力が強化された進化株のゲノム変異解析2021

    • 著者名/発表者名
      村上 茉奈美、川井 隆太郎、前田 智也、堀之内 貴明、古澤 力、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] NAD(P)H dehydrogenase deletion enhances accumulation of polyhydroxybutyrate in Synechocystis sp. PCC 68032021

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Yajima, Masakazu Toyoshima, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 環境調和型ものづくり-発酵技術の高度化-2021

    • 著者名/発表者名
      清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会 ランチタイムセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] モデル基盤代謝デザインと指向性進化による高効率細胞工場の創製2021

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      日本化学会第101春季年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 指向性進化を目的とした細胞長期培養マイクロデバイスの開発2021

    • 著者名/発表者名
      大竹理寛、佐藤玲子、戸谷吉博、清水浩、鈴木宏明
    • 学会等名
      日本機械学会第12回マイクロ・ナノ工学シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 代謝シミュレーションと指向性進化に基づく有用物質生産微生物の開発2021

    • 著者名/発表者名
      戸谷 吉博, 川井 隆太郎,三吉 健太,村上 茉奈美,一色 衣香,堀之内 貴明,前田 智也,古澤 力,清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第52回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 青色光による遺伝子発現制御系を用いた大腸菌代謝制御の検討2021

    • 著者名/発表者名
      赤木 駿斗、塚本 雅士、戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第52回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803のΔndhD1/D2株を用いたレドックスバランス感知フィコビリソーム分解制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シアノバクテリアの代謝工学2021

    • 著者名/発表者名
      清水 浩,戸谷 吉博,豊島 正和,山本 千晶
    • 学会等名
      化学工学会第52回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K19825
  • [学会発表] 連続培養を用いた指向性進化実験による大腸菌のメバロン酸取り込み能力の強化2021

    • 著者名/発表者名
      村上茉奈美、川井隆太郎、前田智也、堀之内貴明、古澤力、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      日本農芸化学会2021年度大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 機械学習を用いたリンゴ酸酵素の補酵素特異性の予測2021

    • 著者名/発表者名
      杉木 創、二井手 哲平、 戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第52回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 光合成生物のシステムバイオロジー2021

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 動的代謝モデルを用いたカルビン回路の代謝制御機構の解析2021

    • 著者名/発表者名
      田島 遼太郎、池原 万由、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      第62回日本植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 大腸菌生体内における非酸化的解糖系経路の代謝フラックスの評価2021

    • 著者名/発表者名
      三吉 健太、 川井 隆太郎、 二井手 哲平、戸谷 吉博、 清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 蛍光タンパク質を利用した共培養のための菌体比率制御技術の開発2021

    • 著者名/発表者名
      楠田みのり、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第86年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 目的物質生産フラックス強化のためのシミュレーションに基づく増殖連動型の代謝設計2021

    • 著者名/発表者名
      戸谷 吉博、一色 衣香、施 欣馳、清水 浩
    • 学会等名
      第73回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] In silico代謝デザインに基づく非酸化的解糖系依存の大腸菌株の創出2020

    • 著者名/発表者名
      三吉 健太、川井 隆太郎、堀之内 貴明、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      日本農芸化学会2020年度大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 13C-metabolic flux analysis reveals photosynthetic cofactor production rates in cyanobacteria2020

    • 著者名/発表者名
      Chiaki Yamamoto、 Sayaka Kitamura、Masakazu Toyoshima、Yoshihiro Toya、 Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      上海交通大学学術交流セミナー
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析を用いたシアノバクテリアにおける光化学系からのATP/NADPH生産速度の推定2020

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      日本植物生理学会2020年度大阪年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 実験室進化実験による大腸菌の非酸化的解糖経路のフラックス増強2020

    • 著者名/発表者名
      三吉健太、川井隆太郎、堀之内貴明、前田智也、古澤力、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第51回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの光合成と代謝のシミュレーション予測による適応機構の解析2020

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      日本植物学会第84回大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 光誘導スイッチを利用した代謝フラックスの動的な調節技術の開発2020

    • 著者名/発表者名
      塚本雅士、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第51回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 微生物物質生産の代謝デザインと細胞性能評価2020

    • 著者名/発表者名
      清水浩 戸谷吉博
    • 学会等名
      化学工学会第51回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 化学量論モデルを用いたFBAシミュレーションによるシアノバクテリアの光合成電子伝達の解析2020

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、 植野嘉文、 戸谷吉博、秋本誠志、 清水浩
    • 学会等名
      第5回光合成細菌ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 代謝モデルを利用した指向性進化による大腸菌イソプレノール合成のボトルネック解消2020

    • 著者名/発表者名
      川井隆太郎、三吉健太、堀之内貴明、前田智也、古澤力、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      日本生物工学会【関西支部】2020年度 学生オンライン発表会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 相利共生関係を利用した増殖連動型の有用物質生産株の代謝設計2020

    • 著者名/発表者名
      川井隆太郎、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第51回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の光合成電子伝達経路の選択的使用の解明2020

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、 戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      日本植物生理学会2020年度大阪年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シアノバクテリアのカルビン回路の反応速度論モデルの開発2020

    • 著者名/発表者名
      田島遼太郎、池原万由、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第85年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 試験管内反応系を利用した代謝経路の律速段階の同定2020

    • 著者名/発表者名
      北村 さや香、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第51回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析によるシアノバクテリアにおける光化学反応の補酵素生産速度の推定2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度秋季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] In silico Design of Metabolic Pathways and Adaptive Laboratory Evolution for Improvement of Valuable Compounds Production2019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      2019 KSBB Sprilng Meeting and International Symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H00839
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる異なるPSI/PSII励起比におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達の解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      2019年度ラン藻ゲノム交流会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Metabolic Engineering to Create Microbial Cell Factories2019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      The 21st Academic Exchange Seminar Between Shanghai Jiao Tong University And Osaka University
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] FBAによるシアノバクテリアの光合成電子伝達フラックス状態の解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度秋季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] QconCAT法を用いたシアノバクテリア光合成装置の絶対定量に関する研究2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、大西一輝、阪田真澄、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      新光合成、光合成若手の会ジョイント若手ワークショップ
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる単波長光照射下におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達経路のフラックス状態の解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、山本千晶、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の網羅的定量プロテオーム解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第60回植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの中心代謝の13C代謝フラックス解析2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さやか、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第61回植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 大腸菌の共培養によるイソプレノール合成経路のボトルネックの解消2019

    • 著者名/発表者名
      川井隆太郎、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] プロトン駆動力による細胞内代謝制御2019

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 異なるPSI/PSII励起比における光合成電子伝達並びに呼吸鎖のフラックスバランス解析2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Metabolic Engineering of Synechocystis sp. PCC68032019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi、Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio
    • 学会等名
      APCChE 2019
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の網羅的定量プロテオームと絶対定量2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、大西一輝、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      藍藻の分子生物学2019
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの中心代謝の13C代謝フラックス解析2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さやか、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] FBA simulation of photosynthetic electron flow of Synechocystis sp. PCC 6803 under different spectral light condition2019

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Yamamoto Chiaki 、Ueno Yoshifumi、Toya Yoshihiro 、Akimoto Seiji,、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      日米二国間セミナー
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] in silico analysis and design of photosynthesis and metabolic pathways of Synechocystis sp. PCC68032019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      日米二国間セミナー
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] FBAによる単波長光照射下におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達と代謝のシミュレーション2019

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第10回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Integration of in silico Genetic Modification Design and Adaptive Laboratory Evolution to Increase in Productivity of Target Compounds2019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Conference on Metabolic Science 2019
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [学会発表] In silico Metabolic Pathway Design and Experimental Flux Analysis for Creation of Microbial Cell Factory2019

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      KMB 2019 46th Annual Meeting & International Symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H00839
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析に基づくシアノバクテリアの単波長光照射下に対する応答解析2019

    • 著者名/発表者名
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第71回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] フェノールが大腸菌の中枢代謝に及ぼす影響の解析2018

    • 著者名/発表者名
      北村さや香、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] 様々な波長の光照射下におけるシアノバクテリアの解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 動的代謝モデルアンサンブルを用いたエタノール生産シアノバクテリアの代謝工学2018

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Expanding the space of actual metabolic network in Escherichia coli by adaptive laboratory evolution2018

    • 著者名/発表者名
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、 Horinouchi Takaaki,、Furusawa Chikara、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      Metabolic Engineering 12
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] シアノバクテリアの代謝モデルを利用した動的解析に向けて2018

    • 著者名/発表者名
      戸谷吉博、豊島正和、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 13C-Metabolic flux analysis of the central carbon metabolism in three cancer cell lines2018

    • 著者名/発表者名
      Uehara Hikaru,、Araki Chie、Maeda Kousuke、Okahashi Nobuyuki、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      YABEC2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析を用いたSynechocystis sp. PCC 6803のndhF遺伝子破壊株におけるNADPH消費機構の寄与率の解明2018

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Rational metabolic engineering of central metabolism in cyanobacteria using kinetic model ensemble2018

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Nagai Hikaru、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 安定同位体非定常の13C代謝フラックス解析およびプロテオーム解析によるn-ブタノールを生産するSynechococcus elongatus PCC 7942の代謝状態の推定2018

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、植林希代加、戸谷吉博、傳寶雄大、Putri Sastia、松田史生、福崎英一郎、James C Liao、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第83年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Target phosphoproteome analysis of Synchocystis sp PCC 6803 using nano liquid chromatography- triple quadrupole mass spectrometry2018

    • 著者名/発表者名
      Tokumaru Yuma、Toyoshima Masakazu、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] FBAを用いた様々な波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の野生株とNDH-1欠損株の代謝シミュレーション2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] FBAシミュレーションによる単波長光照射下におけるPSI/PSII励起比とサイクリック電子伝達の解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度秋季領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 代謝工学に基づく大腸菌フェノール生産株の育種2018

    • 著者名/発表者名
      北村さや香, 戸谷吉博, 清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第83年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] Target phosphoproteome analysis of Synchocystis sp PCC 6803 using nano liquid chromatography- triple quadrupole mass spectrometry2018

    • 著者名/発表者名
      Tokumaru Yuma、Toyoshima Masakazu、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      13th KAIST-OSAKA U Symposium 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Dynamic modeling of central metabolism in cyanobacteria for improving ethanol production2018

    • 著者名/発表者名
      Nishiguchi Hiroki、Nagai Hikaru、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      13th KAIST-OSAKA U Symposium 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] FBAを用いた様々な波長の光条件下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の代謝シミュレーション2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 増殖連動型物質生産のin silico解析における反応律速点の同定法の開発と実験検証2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩、徳山健斗、戸谷吉博、松田史生
    • 学会等名
      化学工学会第50回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] Systems Biology and Metabolic Engineering of Photosynthetic Organisms2018

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] プロトン駆動力による細胞内代謝制御2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 四重極タンデム質量分析装置を用いたSynechocystis sp. PCC 6803のターゲットリン酸化プロテオーム解析2018

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨・豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第59回日本植物生理学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 様々な波長の光照射下のSynechocystis sp. PCC 6803 の野生株とNDH-1欠損株の生育を代謝シミュレーションする2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 適応進化実験によるシアノバクテリア強光耐性株の獲得とその解析2018

    • 著者名/発表者名
      吉川勝徳、小川健一、戸谷吉博、秋本誠志、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 代謝工学による光合成の統合解析と工学応用2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会 シンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] クラミドモナス光化学系の定量プロテオミクス法の開発2018

    • 著者名/発表者名
      大西一輝、徳丸雄磨、得津隆太郎、皆川純、豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] がん種の異なる細胞間での中心代謝における13C代謝フラックス解析2018

    • 著者名/発表者名
      上原ひかる、荒木千絵、前田昂亮 、岡橋伸幸、松田史生、高橋智聡、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [学会発表] 計算機工学に基づく代謝設計とその有効性の実証に関する研究2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会 生物工学功績賞受賞講演
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] 光量変化に対するシアノバクテリア代謝応答の解析2018

    • 著者名/発表者名
      丸山正晴、西口大貴、豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      日本農芸化学会2018年度大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 計算機工学に基づく代謝設計とその有効性の実証に関する研究2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会 生物工学功績賞受賞講演
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] クラミドモナス光化学系の定量プロテオーム解析とQconCAT法による絶対定量2018

    • 著者名/発表者名
      大西一輝、徳丸雄磨、 得津隆太郎、 皆川純、 豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シアノバクテリア中心炭素代謝における光量変化時の短期応答の解析2018

    • 著者名/発表者名
      丸山正晴、西口大貴、豊島正和、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第70回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シアノバクテリアのゲノムスケール代謝モデルを用いたFBAシミュレーションによる解析2018

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第5回分子珪藻研究会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] クラミドモナス光化学系の定量プロテオミクス法の検討と利用2018

    • 著者名/発表者名
      大西一輝, 徳丸雄磨, 得津隆太郎, 皆川純, 豊島正和, 松田史生, 清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 微生物バイオプロセスにおける計測と育種・プロセス開発への展開2018

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      日本生物工学会バイオ計測サイエンス研究部会第一回シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] Relationship between PSI/PSII excitation ratio and photosynthetic electron transport of Synechocystis sp. PCC 6803 by FBA simulation2018

    • 著者名/発表者名
      Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • 学会等名
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] QconCAT法を用いたシアノバクテリア光化学装置の定量プロテオミクス2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨、植林希代加、徳山健斗、和田圭介、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第65回質量分析総合討論会 2017 つくば
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 光合成微生物の代謝モデルの開発と応用2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、吉川勝徳、 松田史生、 清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803の光化学反応を精緻化したゲノムスケールモデルを用いた様々な光条件における代謝シミュレーション2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] nanoLC-MSを用いた網羅的定量プロテオーム解析に向けたタンパク質抽出方法の検討2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、大西一輝、徳丸雄磨、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803の精緻化した代謝モデルを用いた光合成研究への応用2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第10回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 実験室進化実験に基づく大腸菌の高コハク酸生産に有効な変異同定2017

    • 著者名/発表者名
      徳山 健斗, 戸谷 吉博, 堀之内 貴明, 古澤 力, 清水 浩,
    • 学会等名
      化学工学会 第82年会
    • 発表場所
      芝浦工業大学豊洲キャンパス(東京都江東区)
    • 年月日
      2017-03-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] 代謝物濃度絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シグマ因子SigEによるシアノバクテリア代謝制御の定量プロテオーム解析2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨、植林希代加、小山内崇、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 代謝物絶対定量データを用いたシアノバクテリア動的代謝モデル構築2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第11回メタボロームシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シアノバクテリアのシステムバイオロジーによる統合理解と工学応用2017

    • 著者名/発表者名
      清水浩、豊島正和、戸谷吉博、松田史生
    • 学会等名
      藍藻の分子生物学2017
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 代謝物濃度の絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴, 永井暉, 松田史生, 清水浩
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析による細胞の生理状態の理解と工学応用2017

    • 著者名/発表者名
      清水浩, 松田史生, 戸谷吉博, 岡橋伸幸, 前田昂亮
    • 学会等名
      化学工学会第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] シアノバクテリアのSigEの代謝制御解明に向けた定量プロテオーム解析 "2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨、植林希代加、豊島正和、小山内崇、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Chlamydomonas reinhardtiiの定量プロテオミクスのための膜タンパク質可溶化手法の検討2017

    • 著者名/発表者名
      大西一輝、徳丸雄磨、阪田真澄、豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 13C代謝フラックス解析およびプロテオーム解析を用いたn-ブタノール生産シアノバクテリア株の代謝解析2017

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、植林希代加、戸谷吉博、傳寶雄大、Putri Sastia、松田史生、福崎 英一郎、Liao James、清水浩
    • 学会等名
      第69回日本生物工学会大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 代謝物濃度絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • 著者名/発表者名
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第65回質量分析総合討論会 2017 つくば
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803の中心代謝経路と光化学系の制御メカニズムの解析2017

    • 著者名/発表者名
      和田圭介、戸谷吉博、吉川勝徳、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第49回秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 光合成微生物の化学量論モデルを利用したシミュレーションとその応用2017

    • 著者名/発表者名
      戸谷吉博,吉川勝徳,松田史生,清水浩
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Quantitative proteome analysis of microalgae under high light stress2017

    • 著者名/発表者名
      Masakazu Toyoshima, Masumi Sakata, Kazuki Ohnishi, Yuma Tokumaru, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      I-Bios2017
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] nanoLC-MSを用いたシアノバクテリアの網羅的定量プロテオーム解析2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、阪田真澄、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      藍藻の分子生物学2017
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 光量条件がシアノバクテリアの代謝フラックスに及ぼす影響の解析2017

    • 著者名/発表者名
      上田賢太朗、仲嶋翼、吉川勝徳、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] シグマ因子SigEによるSynechocystis sp. PCC 6803のプロテオームの制御2017

    • 著者名/発表者名
      徳丸雄磨, 植林希代加, 小山内崇, 松田史生, 清水浩
    • 学会等名
      第58回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2017-03-16
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803における多様な波長の光環境下での代謝シミュレーション2017

    • 著者名/発表者名
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 定常期における大腸菌メバロン酸生産株の13C代謝フラックス解析2017

    • 著者名/発表者名
      増田亜美、徳山健斗、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会 第82年会
    • 発表場所
      芝浦工業大学豊洲キャンパス(東京都江東区)
    • 年月日
      2017-03-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] ブタノール生産シアノバクテリアの代謝解析2017

    • 著者名/発表者名
      和田 圭介、植林 希代加、 戸谷 吉博、傳寶 雄大、Putri Sastia 、松田 史生、福崎 英一郎、 Liao James C ,、清水 浩
    • 学会等名
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 光量変化に対するシアノバクテリア代謝適応機構の解析2017

    • 著者名/発表者名
      丸山正晴・西口大貴、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第11回メタボロームシンポジウム
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] Integration of in silico design and experimental evaluation of metabolic pathways for creation of microbial cell factories,2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      International Conference on the Metabolic Science,
    • 発表場所
      Nanjiao Hotel, Shanghai China,
    • 年月日
      2016-10-20
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] In silico代謝デザインと13C代謝フラックス解析による微生物細胞工場の創製2016

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第6回合成生物工学シンポジウム
    • 発表場所
      神戸大学百年記念館六甲ホール(兵庫県神戸市灘区)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] メバロン酸生産大腸菌の細胞内代謝状態の定量的な評価2016

    • 著者名/発表者名
      永井 暉, 戸谷 吉博, 松田 史生, 清水 浩
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会(2016)
    • 発表場所
      冨山国際会議場 ANAクラウンプラザホテル富山(富山県富山市)
    • 年月日
      2016-09-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] 13C-metabolic flux analysis for rational design of metabolic pathway modification of the industrially useful microorganisms2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      The 13th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms
    • 発表場所
      East Lake Hotel, Wuhan, China
    • 年月日
      2016-10-16
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] #in silico#代謝設計と実験室進化実験の統合によるコハク酸高生産大腸菌の構築2016

    • 著者名/発表者名
      徳山 健斗、戸谷 吉博、清水 浩
    • 学会等名
      化学工学会第48回秋季大会
    • 発表場所
      徳島大学 常三島キャンパス(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2016-09-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] Integration of in silico design and experimental evaluation of metabolic pathways for creation of microbial cell factories,2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      International Conference on the Metabolic Science,
    • 発表場所
      Nanjiao Hotel, Shanghai China,
    • 年月日
      2016-10-20
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] 大腸菌による効率的なメバロン酸生産のための代謝解析2016

    • 著者名/発表者名
      戸谷吉博、和田圭介、増田亜美、徳山健斗、坂野聡美、吉川勝徳、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第48回秋季大会
    • 発表場所
      徳島大学 常三島キャンパス(徳島県徳島市)
    • 年月日
      2016-09-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] メバロン酸生産大腸菌株の定常期における代謝状態の解明2016

    • 著者名/発表者名
      増田亜美,戸谷 吉博、徳山 健斗、坂野 聡美、吉川 勝徳、清水 浩
    • 学会等名
      第68回日本生物工学会大会(2016)
    • 発表場所
      冨山国際会議場 ANAクラウンプラザホテル富山(富山県富山市)
    • 年月日
      2016-09-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] 13C-Metabolic Flux Analysis for Mevalonate-Producing Strain of Escherichia coli.2016

    • 著者名/発表者名
      Wada, K., Toya, Y., Matsuda, F. and Shimizu, H.
    • 学会等名
      Metabolic Engineering 11
    • 発表場所
      Awaji Yumebutai(兵庫県淡路市)
    • 年月日
      2016-06-26
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] グリセロールからのコハク酸生産に向けたin silico代謝設計と実験評価2016

    • 著者名/発表者名
      徳山健斗、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      2016年度生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー
    • 発表場所
      ホテルコンチネンタル府中(東京都府中市)
    • 年月日
      2016-07-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] Metabolic flux measurement for efficient mevalonate production in Escherichia coli2016

    • 著者名/発表者名
      Yoshihiro Toya, Keisuke Wada, Ami Masuda, Kento Tokuyama, Satomi Banno, Katsunori Yoshikawa, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      i-BioP2016
    • 発表場所
      Haeundae Grand Hotel , Busan, South Korea
    • 年月日
      2016-12-16
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [学会発表] 13C-metabolic flux analysis for rational design of metabolic pathway modification of the industrially useful microorganisms2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      The 13th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms
    • 発表場所
      East Lake Hotel, Wuhan, China
    • 年月日
      2016-10-16
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 代謝フラックスを基盤とする物質生産法の開発2016

    • 著者名/発表者名
      清水 浩、松田 史生、戸谷 吉博
    • 学会等名
      2016年農芸化学会
    • 発表場所
      札幌教育文化会館大ホール(北海道札幌市)
    • 年月日
      2016-03-27
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 代謝物濃度絶対定量によるシアノバクテリア代謝律速点の解析2016

    • 著者名/発表者名
      西口大貴, 永井 暉, 松田 史生, 清水 浩
    • 学会等名
      第10回メタボロームシンポジウム
    • 発表場所
      鶴岡メタボロームキャンパス(山形県鶴岡市)
    • 年月日
      2016-10-19
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [学会発表] 全自動実験室進化システムを用いた多系列・多種ストレス環境の実験室進化による大腸菌のストレス適応戦略の解析2015

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明、鈴木真吾、清水浩、古澤力
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸公債会議場(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-02
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Synechocystis sp. PCC 6803光化学系の定量プロテオーム分析系の構築2015

    • 著者名/発表者名
      植林希代加、松田史生、日浅夏希、小倉泰郎、平野一郎、清水浩
    • 学会等名
      ラン藻の分子生物学2015
    • 発表場所
      かずさアカデミアホール(千葉県木更津市)
    • 年月日
      2015-11-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 全自動実験室進化による様々な化合物ストレスに対する耐性大腸菌の創生と耐性化機構の解析2015

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明、鈴木真吾、清水浩、古澤力
    • 学会等名
      第67回日本生物工学大会
    • 発表場所
      城山観光ホテル(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2015-10-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 微生物による物質生産のための代謝デザインと細胞評価2015

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      近畿バイオインダストリー振興会議第31回バイオマス研究会講演会
    • 発表場所
      大阪科学技術センター,大阪
    • 年月日
      2015-03-24
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] <SUP>13</SUP>C代謝フラックス解析に用いる<SUP>13</SUP>C標識炭素源の最適化2015

    • 著者名/発表者名
      前田昂亮、岡橋伸幸、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      日本質量分析学会 第63回質量分析総合討論会 2015
    • 発表場所
      つくば国際会議場エポカルつくば(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2015-06-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 大腸菌代謝フラックス解析の実験デザインの最適化2015

    • 著者名/発表者名
      前田昂亮、岡橋伸幸、松田史生、清水浩
    • 学会等名
      第67回日本生物工学会大会(2015)
    • 発表場所
      城山観光ホテル(鹿児島県鹿児島市)
    • 年月日
      2015-10-26
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 光合成微生物<I>Synechocystis</I> sp. PCC 6803中心代謝酵素の定量プロテオミクス2015

    • 著者名/発表者名
      日浅夏希、松田史生、小倉泰郎、平野一郎、清水浩
    • 学会等名
      日本質量分析学会 第63回質量分析総合討論会 2015
    • 発表場所
      つくば国際会議場エポカルつくば(茨城県つくば市)
    • 年月日
      2015-06-17
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 物質生産のための代謝デザインと細胞評価2014

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      新化学技術推進協会(JACI)
    • 発表場所
      新化学技術推進協会(JACI),東京
    • 年月日
      2014-12-09
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] <I>Synechocystis</I> sp. PCC 6803の強光耐性株の解析2014

    • 著者名/発表者名
      吉川勝徳、小川健一、秋本誠志、清水浩
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学(富山)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 代謝シミュレーションを用いた、微生物によるものづくりのための多重遺伝子破壊探索手法の開発2014

    • 著者名/発表者名
      大野聡, 清水浩、古澤力
    • 学会等名
      生命情報若手の会 第5回研究会
    • 発表場所
      東京大学 検見川セミナーハウス(千葉)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 微細藻細胞工場の創製のための代謝工学基盤技術開発2014

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      "未来へのバイオ技術"勉強会 「藻類が拓くグリーンバイオ成長戦略のラストステージ」
    • 発表場所
      バイオインダストリー協会,東京
    • 年月日
      2014-08-18
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 人工進化実験による<i>Synechocystis</i> sp. PCC 6803へのイソブタノール耐性の賦与2014

    • 著者名/発表者名
      松迫 卓也、仲嶋翼、吉川勝徳、清水浩
    • 学会等名
      日本農芸化学大会2014大会
    • 発表場所
      明治大学(東京)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 全自動実験室進化システムの構築と大腸菌の多系列・多種ストレス環境下での実験室進化2014

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明,源晃明,鈴木真吾,清水浩,古澤力
    • 学会等名
      生命情報科学若手の会第5回研究会
    • 発表場所
      東京大学 検見川セミナーハウス(千葉)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Systems metabolic engineering - Rational design of microbial cell factories2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Asian Congress on Biotechnology 2013
    • 発表場所
      Indian Institute of Technology Delhi(India)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] International collaborative research on systems metablic engineering for low carbon society2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Biochemical and Molecular engineering XVIII
    • 発表場所
      Beijing Pharma and Biotech Center, Beijing(China)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] ラボオートメーションによる全自動多系列実験室進化システムの構築2013

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 源晃明, 鈴木真吾, 清水浩, 古澤力
    • 学会等名
      第65回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 代謝シミュレーションに基づいた3HP高生産大腸菌の構築2013

    • 著者名/発表者名
      徳山 健斗、大野 聡、吉川 勝徳、古澤 力、清水 浩
    • 学会等名
      生物工学会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] <i>in silico</i>スクリーニングにより代謝物質生産が予測された大腸菌多重遺伝子破壊株の特徴解析2013

    • 著者名/発表者名
      大野聡, 古澤力、清水浩
    • 学会等名
      生物工学会
    • 発表場所
      広島国際会議場(広島)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 全自動実験室進化システムによる大腸菌の多系列・多種ストレス環境の実験室進化2013

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明,源晃明,鈴木真吾,清水浩,古澤力
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会(MBSJ2013)
    • 発表場所
      神戸国際会議場(兵庫)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Systems metabolic engineering for creation of superior microbial cell factories2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Systems Biotechnology of Microalgae for Bioproduction, International Symposium and Exhibition
    • 発表場所
      EXCO, Daegu, Korea
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Application of Genome Scale Models to Design of Microbial Cell Factories2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      2nd Conference on Constraint-based Reconstruction and Analysis (COBRA 2012)
    • 発表場所
      Hotel Marienlyst, Helsing&oslash;r, Denmark
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Integration of in silico and experimental approaches for creation of microbial cell factories2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      14th Asia Pacific Confederation of Chemical Engineering(APCChE 2012)
    • 発表場所
      Suntec Singapore International Convention & Exhibition Center, Singapore
    • 年月日
      2012-02-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Systems Metabolic Engineering -Rational Design of Microbial Cell Factories2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      神戸国際会議場,兵庫
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Genome-wide multi-omics analysis of ethanol stress tolerant strain of Escherichia2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Metabolic Engineering IX
    • 発表場所
      Le Bellevue Congress and Exhibition centre in Biarritz, France
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Integration of in silico and experimental approaches for creation of microbial cell factories2012

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      14th Asia Pacific Confederation of Chemical Engineering (APCChE 2012)
    • 発表場所
      Suntec Singapore International Convention & Exhibition Center (Singapore)(招待講演)
    • 年月日
      2012-02-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Systems Metabolic Engineering for Bioproduction Development2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress(IUMS2011)
    • 発表場所
      Sapporo Convention Center
    • 年月日
      2011-09-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [学会発表] Genome Scale Metabolic Flux Design and Experimental Evaluation of Cellular Performance2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      The 2nd iBioP Asian Symposium (iBioP2011)
    • 発表場所
      POSTECH (Pohang University of Science and Technology), Pohang, (South Korea)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [学会発表] 大腸菌エタノール耐性進化株の次世代シーケンサを用いた全ゲノム解析2011

    • 著者名/発表者名
      小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      第64回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      東京農工大学
    • 年月日
      2011-09-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] エタノールストレス環境下の進化実験により得られた大腸菌のゲノムワイドな変異解析と遺伝子発現解析2011

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第43回秋季大会
    • 発表場所
      名古屋工業大学(愛知県)
    • 年月日
      2011-09-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Systems Metabolic Engineering for Bioproduction Development2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress(IUMS2011)
    • 発表場所
      Sapporo Convention Center, Hokkaido (Japan)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [学会発表] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains under Ethanol Stress2011

    • 著者名/発表者名
      Naoaki Ono, Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Asian Congress on Biotechnology(ACB-2011)
    • 発表場所
      Shanghai, China
    • 年月日
      2011-05-13
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Whole genome resequencing of experimentally evolved Escherichia coli using a next generation sequencer2011

    • 著者名/発表者名
      小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      日本生物物理学会第49回年会
    • 発表場所
      兵庫県立大学
    • 年月日
      2011-09-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      化学工学会 第76年会
    • 発表場所
      東京農工大学小金井キャンパス、東京都
    • 年月日
      2011-03-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Genome Scale Metabolic Flux Design and Experimental Evaluation of Cellular Performance2011

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      The 2nd iBioP Asian Symposium (iBioP2011)
    • 発表場所
      POSTECH (Pohang University of Science and Technology), Pohang, South Korea
    • 年月日
      2011-12-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [学会発表] エタノールストレス環境下の進化実験により得られた大腸菌のゲノムワイドな変異解析と遺伝子発現解2011

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第43回秋季大会
    • 発表場所
      名古屋工業大学
    • 年月日
      2011-09-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      化学工学会第76年会
    • 発表場所
      東京農工大学
    • 年月日
      2011-03-23
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Systems Biotechnology for Creation of Microbial Cell Factory2010

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      2010 International Symposium on Advanced Biological Engineering (ISABE'2010)
    • 発表場所
      Beijing Friendship Hotel, Beijing (China)(招待講演)
    • 年月日
      2010-07-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の全ゲノム変異解析・遺伝子発現解析2010

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      定量生物学の会第二回年会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2010-01-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 複数時間スケールを持つ環境適応ダイナミクス:エタノールストレス環境下での大腸菌人工進化実験における網羅的表現型/遺伝子型解析2010

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      第48回生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2010-09-20
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Systems Biotechnology for Creation of Microbial Cell Factroy2010

    • 著者名/発表者名
      HiroshiShimizu
    • 学会等名
      2010 International Symposium on Advanced Biological Engineering(ISABE' 2010)
    • 発表場所
      Beijing, China
    • 年月日
      2010-07-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也, 小野直亮
    • 学会等名
      定量生物学の会第三回年会
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所
    • 年月日
      2010-11-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      定量生物学の会第三回年会
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所
    • 年月日
      2010-11-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
    • 発表場所
      神戸ポートピアアイランド,兵庫県
    • 年月日
      2010-12-10
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010

    • 著者名/発表者名
      小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
    • 学会等名
      第62回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
    • 年月日
      2010-10-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明、清水浩
    • 学会等名
      定量生物学の会 第三回年会
    • 発表場所
      東京大学生産技術研究所、東京都
    • 年月日
      2010-11-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 人工進化実験によって得られたエタノール耐性大腸菌株の網羅的遺伝子発現解析とゲノム異変解析2010

    • 著者名/発表者名
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
    • 年月日
      2010-10-28
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] タイリングアレイを用いたエタノール耐性大腸菌株のゲノム変異解析2009

    • 著者名/発表者名
      玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
    • 学会等名
      第61回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains Under Ethanol Stress2009

    • 著者名/発表者名
      Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      The 20th International Conference on Genome Informatics(GIW 2009)
    • 発表場所
      Yokohama, Japan
    • 年月日
      2009-12-14
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] システムバイオテクノロジーによる生物生産2009

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      日本生物工学会第61回大会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays2009

    • 著者名/発表者名
      Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
    • 学会等名
      Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioChEC' 09)
    • 発表場所
      Kobe, Japan
    • 年月日
      2009-11-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] システムバイオテクノロジーによる生物生産2009

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      第61回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-25
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009

    • 著者名/発表者名
      小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
    • 学会等名
      第61回日本生物工学会大会
    • 発表場所
      名古屋大学
    • 年月日
      2009-09-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] 次世代シーケンサにおけるメイトペアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009

    • 著者名/発表者名
      小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
    • 学会等名
      第47回生物物理学会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学
    • 年月日
      2009-11-01
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [学会発表] コリネ型細菌のグルタミン酸生産期における代謝フラックス解析法の確立と補充経路の役割の解明2007

    • 著者名/発表者名
      白井、清水, ら6名
    • 学会等名
      日本生物工学会平成19年度大会
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2007-09-27
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Development of genome-scale metabolic analysis system of Corynebacterium glutamicum2007

    • 著者名/発表者名
      Y., Shinfuku, H., Shimizu, et. al.
    • 学会等名
      Annual meeting of Society of the Society for Biotechnology Japan
    • 発表場所
      Hiroshima University
    • 年月日
      2007-09-27
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Corynebacterium glutamicumのゲノムスケール代謝解析システムの開発2007

    • 著者名/発表者名
      新福、清水, ら4名
    • 学会等名
      日本生物工学会平成19年度大会
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2007-09-27
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] ストレス環境下における酵母の遺伝子破壊株の網羅的解析2007

    • 著者名/発表者名
      吉川、清水, ら6名
    • 学会等名
      日本生物工学会平成19年度大会
    • 発表場所
      広島大学
    • 年月日
      2007-09-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Genome-wide analysis of yeast deletion mutants under stress conditions2007

    • 著者名/発表者名
      K., Yoshikawa, H., Shimizu, et. al.
    • 学会等名
      Annual meeting of Society of the Society for Biotechnology Japan
    • 発表場所
      Hiroshima University
    • 年月日
      2007-09-25
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Genetic engineering of the central metabolic pathway for succinate production in Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Yun Hee Jeong, H. Shimizu, ら4名
    • 学会等名
      ユネスコバイオテクノロジー国際大学院研修講座発表会
    • 発表場所
      大阪大学
    • 年月日
      2007-09-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Inverse metabolic engineering by integration of multiple omics analyses2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi, Shimizu, et. al.
    • 学会等名
      10th Computer Application for Biotechnology (CABO8)
    • 発表場所
      Cancun Mexico
    • 年月日
      2007-06-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Molecular Breeding based on Multi-Omics Analyses2007

    • 著者名/発表者名
      H. Shimizu, ら8名
    • 学会等名
      Asia Pacific Biochemical Engineering 2007
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 年月日
      2007-11-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] 生物生産のためのシステムバイオテクノロジー2007

    • 著者名/発表者名
      清水浩
    • 学会等名
      バイオインフォマティクス学会第17回システムバイオロジー研究会
    • 発表場所
      奈良先端科学技術大学院大学
    • 年月日
      2007-11-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • 著者名/発表者名
      T., Shirai, H., Shimizu, et. al.
    • 学会等名
      Annual meeting of Society of the Society for Biotechnology Japan
    • 発表場所
      Hiroshima University
    • 年月日
      2007-09-27
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Genome-wide analysis of yeast single gene deletion strains under osmotic and ethanol stress conditions2007

    • 著者名/発表者名
      K., Yoshikawa, H., Shimizu, et. al.
    • 学会等名
      Annual Meeting of The Molecular Biology Society of Japan
    • 発表場所
      Pacifico Yokohama
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Inverse metabolic engineering by integration of multiple omics analyses2007

    • 著者名/発表者名
      H. Shimizu, ら8名
    • 学会等名
      10th Computer Applications in Biotechnology(CAB10), June 4-6, Vol. 1, 15-20,
    • 発表場所
      Cancun Mexico
    • 年月日
      2007-06-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Genetic engineering if central carbon metabolic pathway for suucinate production in Saccharomyces cerevisiae2007

    • 著者名/発表者名
      Y.H., Jeong, H., Shimizu, et. al.
    • 学会等名
      Final Presentation of The 3b UNESCO Postgraduate Inter-University Course in Biotechnology 2006. 2007
    • 発表場所
      Osaka University
    • 年月日
      2007-09-20
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] 浸透圧・エタノールストレス環境下における酵母1遺伝子破壊株の網羅的解析2007

    • 著者名/発表者名
      吉川、清水, ら6名
    • 学会等名
      日本分子生物学会大会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2007-12-11
    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Systems Biotechnology for Bio-Production2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi, Shimizu
    • 学会等名
      Japanese Society for Bioinformatics, the 17th meeting of division of Systems Biology
    • 発表場所
      NAIST
    • 年月日
      2007-11-28
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Molecular breeding based on multi-omics analyses2007

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi, Shimizu, et. al.
    • 学会等名
      Asia Pacific Biochemical Engineering 2007
    • 発表場所
      Taipei, Taiwan
    • 年月日
      2007-11-05
    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Inverse metabolic engineering by integration of multiple omics analyses2007

    • 著者名/発表者名
      H. Shimizu, ら8名
    • 学会等名
      10th Computer Applications in Biotechnology (CAB10), June 4-6, Vol. 1, 15-20,
    • 発表場所
      Cancun Mexico
    • 年月日
      2007-06-05
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [学会発表] Integration of in silico Design and Experimental Evaluation for Creation of Microbial Cell Factories

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      Metabolic Engineering X
    • 発表場所
      Vancouver, Canada
    • 年月日
      2014-06-15 – 2014-06-19
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 人工進化実験によるSynechocystis sp. PCC 6803のイソブタノール耐性株の取得と変異解析

    • 著者名/発表者名
      松迫卓也、 仲嶋翼、 吉川勝徳、清水浩
    • 学会等名
      第5回日本光合成学会年会
    • 発表場所
      近畿大学農学部,奈良
    • 年月日
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 大腸菌を用いた定常期におけるメバロン酸生産

    • 著者名/発表者名
      増田亜美、戸谷吉博、徳山健斗、坂野聡美、吉川勝徳、清水浩
    • 学会等名
      日本農芸化学会大会2015
    • 発表場所
      岡山大学津島キャンパス,岡山
    • 年月日
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] in silico代謝予測に基づいた3-ヒドロキシプロピオン酸高生産大腸菌の構築

    • 著者名/発表者名
      徳山 健斗、大野 聡、吉川 勝徳、古澤 力、清水 浩
    • 学会等名
      生物工学若手の会 夏のセミナー2014
    • 発表場所
      神戸セミナーハウス,兵庫
    • 年月日
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 細胞内遊離代謝物質の13C標識情報に基づくフラックス解析法の構築

    • 著者名/発表者名
      岡橋 伸幸、梶畠 秀一、古澤 力、清水 浩
    • 学会等名
      生物工学若手の会 夏のセミナー2014
    • 発表場所
      神戸セミナーハウス,兵庫
    • 年月日
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 人工進化実験による<i>Synechocystis</i> sp. PCC 6803 のイソブタノール耐性株の獲得と変異解析

    • 著者名/発表者名
      松迫卓也、仲嶋翼、吉川勝徳、清水浩
    • 学会等名
      第66回日本生物工学会大会(2014)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター,北海道
    • 年月日
      2014-09-09 – 2014-09-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] Integration of in silico and Experimental Approaches for Creation of Microbial Cell Factories

    • 著者名/発表者名
      Hiroshi Shimizu
    • 学会等名
      2014 KSBB Spring Meeting and International
    • 発表場所
      Gyeongju, Korea
    • 年月日
      2014-04-09 – 2014-04-11
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] グリセロール単一炭素源における正確な代謝フラックス推定のための<sup>13</sup>C標識条件の検討

    • 著者名/発表者名
      大橋秀伍、戸谷吉博、清水浩
    • 学会等名
      第66回日本生物工学会大会(2014)
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター,北海道
    • 年月日
      2014-09-09 – 2014-09-11
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] 微生物育種に向けた多重遺伝子破壊のin silicoスクリーニング

    • 著者名/発表者名
      大野 聡、古澤 力、清水 浩
    • 学会等名
      生物工学若手の会 夏のセミナー2014
    • 発表場所
      神戸セミナーハウス,兵庫
    • 年月日
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [学会発表] フラックスバランス解析に基づく有用物質生産微生物の構築

    • 著者名/発表者名
      清水 浩、吉川 勝徳、古澤 力、平沢 敬、戸谷 吉博、松田 史生
    • 学会等名
      第46回化学工学会秋季大会
    • 発表場所
      九州大学 伊都キャンパス,福岡
    • 年月日
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • 1.  塩谷 捨明 (50026259)
    共同の研究課題数: 10件
    共同の研究成果数: 3件
  • 2.  戸谷 吉博 (70582162)
    共同の研究課題数: 8件
    共同の研究成果数: 102件
  • 3.  古澤 力 (00372631)
    共同の研究課題数: 6件
    共同の研究成果数: 50件
  • 4.  永久 圭介 (00324806)
    共同の研究課題数: 5件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  平沢 敬 (20407125)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 25件
  • 6.  菅 健一 (20029250)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  松田 史生 (50462734)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 23件
  • 8.  大政 健史 (00252586)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  内山 圭司 (60294039)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  二井手 哲平 (20802705)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 2件
  • 11.  中嶋 幹男 (00273590)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  堀之内 貴明 (60610988)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 9件
  • 13.  小野 直亮 (60395118)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 18件
  • 14.  吉川 勝徳 (20599279)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 9件
  • 15.  片倉 啓雄 (50263207)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  仁宮 一章 (10379125)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  皆川 純 (80280725)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  江夏 敏郎 (20029010)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  小山内 崇 (60512316)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 20.  坂本 亘 (20222002)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  園池 公毅 (30226716)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 22.  宗景 ゆり (30423247)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  久堀 徹 (40181094)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  魚住 信之 (40223515)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  高橋 裕一郎 (50183447)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  鹿内 利治 (70273852)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 27.  栗栖 源嗣 (90294131)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 28.  矢守 航 (90638363)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 29.  鈴木 宏明 (20372427)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 30.  堀 克敏 (50302956)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 31.  津川 裕司 (30647235)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 32.  吉本 将悟 (90806291)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 33.  高橋 智聡
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 34.  加藤 裕介
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 35.  山田 真紀
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 36.  長野 稔
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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