野島陽水 Nojima Yosui

研究者番号	30815717
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-6821-0093
所属 (現在)	2025年度: 大阪大学, 数理・データ科学教育研究センター, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2022年度: 大阪大学, 数理・データ科学教育研究センター, 特任講師(常勤)
審査区分/研究分野	研究代表者小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
キーワード	研究代表者マルチオミックス / 特発性肺線維症 / ビッグデータ / マルチオミクス / 創薬探索 / 計算生物学 / ドラッグリポジショニング / IPF / 機械学習 / AI / 人工知能

ＡＩを活用したデータ駆動的研究による新規抗線維化薬の探索研究代表者
- 研究代表者
  
  野島陽水
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分37030:ケミカルバイオロジー関連
- 研究機関
  大阪大学

すべて 2023 2022 2021 2020

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Integration of pharmacoproteomic and computational approaches reveals the cellular signal transduction pathways affected by apatinib in gastric cancer cell lines.2023
- 著者名/発表者名
  Nojima, Y., Aoki, M., Re, S., Hirano, H., Abe, Y., Narumi, R., Muraoka, S., Shoji, H., Honda, K., Tomonaga, T., Mizuguchi, K., Boku, N., and Adachi, J.
- 雑誌名
  
  Comput Struct Biotechnol J
  
  巻: 21 ページ: 2172-2187
- DOI
  10.1016/j.csbj.2023.03.006
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H03544, KAKENHI-PROJECT-20K07333, KAKENHI-PROJECT-20K15422, KAKENHI-PROJECT-20K17069, KAKENHI-PROJECT-23K20389, KAKENHI-PROJECT-22K08068
[雑誌論文] Temporal dynamics from phosphoproteomics using endoscopic biopsy specimens provides new therapeutic targets in stage IV gastric cancer2022
- 著者名/発表者名
  Hirano H, Abe Y, Nojima Y, Aoki M, Shoji H, Isoyama J, Honda K, Boku N, Mizuguchi K, Tomonaga T, Adachi J.
- 雑誌名
  
  Sci Rep.
  
  巻: 12(1) 号: 1 ページ: 4419-4419
- DOI
  10.1038/s41598-022-08430-7
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08432, KAKENHI-PROJECT-20H03544, KAKENHI-PROJECT-20H03749, KAKENHI-PROJECT-20K15422, KAKENHI-PROJECT-20K07333, KAKENHI-PROJECT-20K17069, KAKENHI-PROJECT-23K20389, KAKENHI-PROJECT-19H03856
[雑誌論文] CD14 and lipopolysaccharide-binding protein as novel biomarkers for sarcoidosis by proteomics of serum extracellular vesicles.2022
- 著者名/発表者名
  Futami Y, Takeda Y, KobaT, Narumi R, Nojima Y, Ito M, Nakayama M, Ishida M,Yoshimura H, Naito Y, Fukushima K, Takimoto T, Edahiro R, Matsuki T, Nojima S, Hirata H, Koyama S, Iwahori K, Nagatomo I, Shirai Y, Suga Y, Satoh S, Futami S, Miyake K, Shiroyama T, Inoue Y, Adachi J, Tomonaga T, Ueda K, Kumanogoh A.
- 雑誌名
  
  International immunology
  
  巻: - 号: 6 ページ: 1-1
- DOI
  10.1093/intimm/dxac009
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08642, KAKENHI-PROJECT-19K08650, KAKENHI-PROJECT-20K15422, KAKENHI-PROJECT-22K08283, KAKENHI-PROJECT-22K08299, KAKENHI-PROJECT-20K17180
[雑誌論文] Expression of Cancer Stem Cell Markers EpCAM and CD90 Is Correlated with Anti- and Pro-Oncogenic EphA2 Signaling in Hepatocellular Carcinoma2021
- 著者名/発表者名
  Asakura Nobuhiko、Nakamura Naotoshi、Muroi Atsushi、Nojima Yosui、Yamashita Taro、Kaneko Shuichi、Ikeda Kazuki、Koshikawa Naohiko、Suzuki Takashi
- 雑誌名
  
  International Journal of Molecular Sciences
  
  巻: 22 号: 16 ページ: 8652-8652
- DOI
  10.3390/ijms22168652
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H05422, KAKENHI-PLANNED-16H06576, KAKENHI-PROJECT-20K15422, KAKENHI-INTERNATIONAL-16K21739, KAKENHI-PROJECT-16H06277, KAKENHI-PLANNED-17H06329, KAKENHI-PROJECT-21K09840
[雑誌論文] Proteomics of serum extracellular vesicles identifies a novel COPD biomarker, fibulin-3 from elastic fibres.2021
- 著者名/発表者名
  Koba, Takeda, Narumi, Shiromizu, Nojima, Ito, Kuroyama, Futami, Takimoto, Matsuki, Edahiro, Nojima, Hayama, Fukushima, Hirata, Koyama, Iwahori, Nagatomo, Suzuki, Shirai, Murakami, Nakanishi, Nakatani, Suga, Miyake, Shiroyama, Kida, Sasaki, Ueda, Mizuguchi, Adachi, Tomonaga, Kumanogoh
- 雑誌名
  
  ERJ open research.
  
  巻: 7(1) 号: 1 ページ: 00658-2020
- DOI
  10.1183/23120541.00658-2020
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08642, KAKENHI-PROJECT-20K15422, KAKENHI-PROJECT-20K17180, KAKENHI-PROJECT-18K17923, KAKENHI-PROJECT-19K16557, KAKENHI-PROJECT-18H05282, KAKENHI-PROJECT-19K08650
[雑誌論文] Omics Data Analysis Tools for Biomarker Discovery and the Tutorial2021
- 著者名/発表者名
  Nojima Yosui、Takeda Yoshito
- 雑誌名
  
  Springer Proceedings in Mathematics & Statistics
  
  巻: volume 370 ページ: 266-273
- DOI
  10.1007/978-981-16-4866-3_19
- ISBN
  9789811648656, 9789811648663
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15422
[雑誌論文] Estimation of relationships between chemical substructures and antibiotic resistance-related gene expression in bacteria: Adapting a canonical correlation analysis for small sample data of gathered features using consensus clustering2020
- 著者名/発表者名
  Esaki, T., Horinouchi, T., Natsume-Kitatani, Y., Nojima, Y., and Matsui, H.
- 雑誌名
  
  ＣＢＩジャーナル
  
  巻: 20 号: 0 ページ: 58-61
- DOI
  10.1273/cbij.20.58
- NAID
  130007921242
- ISSN
  1347-0442, 1347-6297
- 年月日
  2020-09-30
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K11858, KAKENHI-PROJECT-20K15422
[雑誌論文] Panomicon: A web-based environment for interactive, visual analysis of multi-omics data2020
- 著者名/発表者名
  Allendes Osorio Rodolfo S.、Johan Nystrom-Persson、Nojima Yosui、Kosugi Yuji、Mizuguchi Kenji、Natsume-Kitatani Yayoi
- 雑誌名
  
  Heliyon
  
  巻: 6 号: 8 ページ: e04618-e04618
- DOI
  10.1016/j.heliyon.2020.e04618
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15422
[雑誌論文] Metabolomic analysis of fibrotic mice combined with public RNA‐Seq human lung data reveal potential diagnostic biomarker candidates for lung fibrosis2020
- 著者名/発表者名
  Nojima Yosui、Takeda Yoshito、Maeda Yohei、Bamba Takeshi、Fukusaki Eiichiro、Itoh Mari N.、Mizuguchi Kenji、Kumanogoh Atsushi
- 雑誌名
  
  FEBS Open Bio
  
  巻: 10 号: 11 ページ: 2427-2436
- DOI
  10.1002/2211-5463.12982
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08650, KAKENHI-PROJECT-20K15422
[学会発表] シングルセルRNA-Seq解析による家族性大腸腺腫症悪性化メカニズムの解明2022
- 著者名/発表者名
  今井綾, 野島陽水, 八尾良司, 鈴木貴
- 学会等名
  応用数理学会　第18回研究部会連合発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15422
[学会発表] オミクスデータを活用した肺線維症バイオマーカー探索に関する研究2021
- 著者名/発表者名
  野島　陽水
- 学会等名
  第17回研究部会連合発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K15422

1. 朴成和

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
2. 庄司敏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
3. 武田吉人

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
4. 中村直俊

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
5. 本田一文

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
6. 庄司広和

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
7. 朝長毅

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
8. 足立淳

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
9. 滝本宜之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
10. 井上義一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

野島 陽水 Nojima Yosui

研究課題

研究成果

共同研究者

ＡＩを活用したデータ駆動的研究による新規抗線維化薬の探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] Integration of pharmacoproteomic and computational approaches reveals the cellular signal transduction pathways affected by apatinib in gastric cancer cell lines.2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Temporal dynamics from phosphoproteomics using endoscopic biopsy specimens provides new therapeutic targets in stage IV gastric cancer2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] CD14 and lipopolysaccharide-binding protein as novel biomarkers for sarcoidosis by proteomics of serum extracellular vesicles.2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Expression of Cancer Stem Cell Markers EpCAM and CD90 Is Correlated with Anti- and Pro-Oncogenic EphA2 Signaling in Hepatocellular Carcinoma2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Proteomics of serum extracellular vesicles identifies a novel COPD biomarker, fibulin-3 from elastic fibres.2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Omics Data Analysis Tools for Biomarker Discovery and the Tutorial2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

ISBN

データソース

[雑誌論文] Estimation of relationships between chemical substructures and antibiotic resistance-related gene expression in bacteria: Adapting a canonical correlation analysis for small sample data of gathered features using consensus clustering2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

年月日

言語

データソース

[雑誌論文] Panomicon: A web-based environment for interactive, visual analysis of multi-omics data2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Metabolomic analysis of fibrotic mice combined with public RNA‐Seq human lung data reveal potential diagnostic biomarker candidates for lung fibrosis2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] シングルセルRNA-Seq解析による家族性大腸腺腫症悪性化メカニズムの解明2022

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] オミクスデータを活用した肺線維症バイオマーカー探索に関する研究2021

著者名/発表者名

学会等名

データソース

野島陽水 Nojima Yosui