亀田倫史 Kameda Tomoshi

研究者番号	40415774
その他のID	https://orcid.org/0000-0001-9508-5366
所属 (現在)	2025年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 上級主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 上級主任研究員 2016年度 – 2022年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 情報・人間工学領域, 主任研究員 2016年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬基盤研究部門, 主任研究員 2015年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 人工知能研究センター, 主任研究員 2014年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 創薬基盤研究部門, 主任研究員 … もっと見る 2013年度: 独立行政法人産業技術総合研究所, ゲノム情報研究センター, 研究員 2012年度: 独立行政法人産業技術総合研究所, 生命情報工学研究センター, 主任研究員 2011年度: 独立行政法人産業技術総合研究所, 生命情報工学研究センター, 研究員隠す
審査区分/研究分野	研究代表者中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 生体生命情報学研究代表者以外小区分28010:ナノ構造化学関連 / 中区分63:環境解析評価およびその関連分野 / 小区分47020:薬系分析および物理化学関連 / 小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む / 中区分27:化学工学およびその関連分野 / 中区分28:ナノマイクロ科学およびその関連分野 / システムゲノム科学 / 生命・健康・医療情報学
キーワード	研究代表者シュードウイルス / カロリメトリー / スパイク蛋白質 / 進化予測 / 分子動力学シミュレーション / 機械学習 / 新型コロナウイルス / 分子動力学 / 分子動力学(MD) / 立体構造予測 / RNA / 蛋白質 … もっと見る研究代表者以外 … もっと見るタンパク質 / タンパク質コロナ / ナノ粒子 / 分子動力学計算 / 酸化還元 / カーボンナノチューブ / 分子動力学 / RNA2次構造 / RNA２次構造 / マイクロプラスチック / ナノプラスチック / 脂質膜 / ドラッグデリバリ―システム / 膜透過 / 環状ペプチド / DDS / 膜透過ペプチド / 食品成分 / がん腫瘍学 / がん予防学 / 天然化合物 / 分子動力学シミュレーション / ケモプロテオミクス / ペリリルアルコール / セサミノール / がん予防 / 抗体 / 機械学習 / 進化分子工学 / リフォールディング / エピトランスクリプトーム解析 / エピとランスクリプトーム解析 / ＲＮＡ2次構造 / エヒトランスプリクトーム / エネルギーパラメタ / バイオインフォマティクス / エピトランスクリプトーム / 修飾塩基 / RNA立体構造 / RNA・タンパク質相互作用 / RNAタンパク質相互作用 / ドッキング計算 / RNA-タンパク質相互作用隠す

ナノプラスチックのコロナ形成の科学
- 研究代表者
  
  平野篤
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2029
- 研究種目
  
  挑戦的研究(開拓)
- 審査区分
  
  中区分63:環境解析評価およびその関連分野
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
脂質二重膜透過アッセイ系と人工知能による膜透過性環状ペプチドの合理的設計
- 研究代表者
  
  池田恵介
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分47020:薬系分析および物理化学関連
- 研究機関
  富山大学
分子動力学シミュレーション・機械学習を組み合わせた新型コロナウイルス進化予測研究代表者
- 研究代表者
  
  亀田倫史
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
ケモプロテオミクスと分子動力学シミュレーションによるがん予防創薬基盤の創製
- 研究代表者
  
  渡邉元樹
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分58020:衛生学および公衆衛生学分野関連:実験系を含む
- 研究機関
  京都府立医科大学
ナノ粒子と遷移金属が協同的に引き起こす酸化ストレスの原理実証
- 研究代表者
  
  平野篤
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分28010:ナノ構造化学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
機械学習が道先案内する進化分子工学：がん治療抗体のスマート成熟プロセス提案
- 研究代表者
  
  梅津光央
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分27:化学工学およびその関連分野
- 研究機関
  東北大学
カーボンナノチューブを活用したタンパク質の高効率リフォールディング
- 研究代表者
  
  平野篤
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分28:ナノマイクロ科学およびその関連分野
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
超高純度カーボンナノチューブを用いたタンパク質コロナ形成機構の解明
- 研究代表者
  
  平野篤
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分28010:ナノ構造化学関連
- 研究機関
  国立研究開発法人産業技術総合研究所
エピトランスクリプトーム解析のためのRNAインフォマティクス基盤技術
- 研究代表者
  
  浅井潔
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
RNA・タンパク質相互作用の網羅的予測と検証
- 研究代表者
  
  浅井潔
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  東京大学
マルチスケールシミュレーションによる核酸立体構造予測研究代表者
- 研究代表者
  
  亀田倫史
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2012
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  独立行政法人産業技術総合研究所

すべて 2024 2023 2022 2021 2016 2015 2014 2013 2012 2011 その他

すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Coenzyme corona formation on carbon nanotubes leads to disruption of the redox balance in metabolic reactions2023
- 著者名/発表者名
  Hirano Atsushi、Kameda Tomoshi、Wada Momoyo、Tanaka Takeshi、Kataura Hiromichi
- 雑誌名
  
  Nanoscale
  
  巻: 15 号: 5 ページ: 2340-2353
- DOI
  10.1039/d2nr05213j
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05668, KAKENHI-PROJECT-23K23163
[雑誌論文] Solubilization of Carbon Nanobelts in Aqueous Solutions: Optical and Colloidal Properties2023
- 著者名/発表者名
  Hirano Atsushi、Kameda Tomoshi、Wada Momoyo、Tanaka Takeshi、Kataura Hiromichi
- 雑誌名
  
  Nano Letters
  
  巻: 23 号: 23 ページ: 11167-11173
- DOI
  10.1021/acs.nanolett.3c03673
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H05668, KAKENHI-PROJECT-23K23163
[雑誌論文] Fine-Tuning and Enhancement of pH-Dependent Membrane Permeation of Cyclic Peptides by Utilizing Noncanonical Amino Acids with Extended Side Chains2023
- 著者名/発表者名
  Matsuda Motomi、Ikeda Keisuke、Kameda Tomoshi、Nakao Hiroyuki、Nakano Minoru
- 雑誌名
  
  Journal of Medicinal Chemistry
  
  巻: 66 号: 10 ページ: 7054-7062
- DOI
  10.1021/acs.jmedchem.3c00628
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K14144, KAKENHI-PROJECT-23K23461, KAKENHI-PROJECT-23K27311
[雑誌論文] Protein’s Protein Corona: Nanoscale Size Evolution of Human Immunoglobulin G Aggregates Induced by Serum Albumin2022
- 著者名/発表者名
  Nakayama Tomohito、Kobayashi Kaito、Kameda Tomoshi、Hase Muneaki、Hirano Atsushi
- 雑誌名
  
  ACS Applied Materials & Interfaces
  
  巻: 14 号: 29 ページ: 32937-32947
- DOI
  10.1021/acsami.2c08271
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[雑誌論文] アロマフィリシティ・インデックス：芳香族表面に対するアミノ酸の親和性2022
- 著者名/発表者名
  平野篤、亀田倫史
- 雑誌名
  
  生物工学会誌
  
  巻: 100 号: 1 ページ: 29-37
- DOI
  10.34565/seibutsukogaku.100.1_29
- NAID
  130008143997
- ISSN
  0919-3758, 2435-8630
- 年月日
  2022-01-25
- 言語
  日本語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[雑誌論文] Free energy and kinetic rate calculation via non-equilibrium molecular simulation: application to biomolecules2022
- 著者名/発表者名
  Iida Shinji, Tomoshi Kameda
- 雑誌名
  
  Biophysical Reviews
  
  巻: 14 号: 6 ページ: 1303-1314
- DOI
  10.1007/s12551-022-01036-3
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H00553
[雑誌論文] A chemoproteoinformatics approach demonstrates that aspirin increases sensitivity to MEK inhibition by directly binding to RPS52022
- 著者名/発表者名
  Watanabe Motoki、Boku Shogen、Kobayashi Kaito、Kurumida Yoichi、Sukeno Mamiko、Masuda Mitsuharu、Mizushima Katsura、Kato Chikage、Iizumi Yosuke、Hirota Kiichi、Naito Yuji、Mutoh Michihiro、Kameda Tomoshi、Sakai Toshiyuki
- 雑誌名
  
  PNAS Nexus
  
  巻: 1 号: 2
- DOI
  10.1093/pnasnexus/pgac059
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489, KAKENHI-PROJECT-22K18407, KAKENHI-PROJECT-19H01079
[雑誌論文] Stabilization of CDK6 by ribosomal protein uS7, a target protein of the natural product fucoxanthinol2022
- 著者名/発表者名
  Iizumi Yosuke, Sowa Yoshihiro, Goi Wakana, Aono Yuichi, Watanabe Motoki, Kurumida Yoichi, Kameda Tomoshi, Akaji Kenichi, Kitagawa Masatoshi, Sakai Toshiyuki.
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 5 号: 1 ページ: 564-564
- DOI
  10.1038/s42003-022-03522-6
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K07378, KAKENHI-PROJECT-22K10489, KAKENHI-PROJECT-22K18407, KAKENHI-PROJECT-19H01079
[雑誌論文] アミノ酸側鎖と芳香族表面の親和性（アロマフィリシティ）：実験による定性評価と分子動力学計算による定量評価2022
- 著者名/発表者名
  HIRANO Atsushi、KAMEDA Tomoshi
- 雑誌名
  
  生物物理
  
  巻: 62 号: 1 ページ: 46-49
- DOI
  10.2142/biophys.62.46
- ISSN
  0582-4052, 1347-4219
- 言語
  日本語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[雑誌論文] Aromaphilicity Index of Amino Acids: Molecular Dynamics Simulations of the Protein Binding Affinity for Carbon Nanomaterials2021
- 著者名/発表者名
  Hirano Atsushi、Kameda Tomoshi
- 雑誌名
  
  ACS Applied Nano Materials
  
  巻: 4 号: 3 ページ: 2486-2495
- DOI
  10.1021/acsanm.0c03047
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[雑誌論文] The solubility of N-acetyl amino acid amides in organic acid and alcohol solutions: Mechanistic insight into structural protein solubilization2021
- 著者名/発表者名
  Hirano Atsushi、Wada Momoyo、Sato Takehiro K.、Kameda Tomoshi
- 雑誌名
  
  International Journal of Biological Macromolecules
  
  巻: 178 ページ: 607-615
- DOI
  10.1016/j.ijbiomac.2021.02.141
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[雑誌論文] Comprehensive prediction of lncRNA–RNA interactions in human transcriptome2016
- 著者名/発表者名
  Goro Terai#, Junichi Iwakiri#, Tomoshi Kameda, Michiaki Hamada*, Kiyoshi Asai*
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 17 号: S1 ページ: 12-12
- DOI
  10.1186/s12864-015-2307-5
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24680031, KAKENHI-PROJECT-25240044
[雑誌論文] Improved Accuracy in RNA-Protein Rigid Body Docking by Incorporating Force Field for Molecular Dynamics Simulation into the Scoring Function2016
- 著者名/発表者名
  Junichi Iwakiri, Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai, and Tomoshi Kameda
- 雑誌名
  
  J. Chem. Theory Comput
  
  巻: 12(9) 号: 9 ページ: 4688-5697
- DOI
  10.1021/acs.jctc.6b00254
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Predicting RNA Duplex Dimerization Free-Energy Changes upon Mutations Using Molecular Dynamics Simulations2015
- 著者名/発表者名
  Shun Sakuraba, Kiyoshi Asai, Tomoshi Kameda
- 雑誌名
  
  he journal of physical chemistry letters
  
  巻: 6(21) 号: 21 ページ: 4341-4358
- DOI
  10.1021/acs.jpclett.5b01984
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[雑誌論文] Analysis of base-pairing probabilities of RNA molecules involved in protein-RNA interactions2013
- 著者名/発表者名
  Junichi Iwakiri, Tomoshi Kameda, Kiyoshi Asai, Michiaki Hamada
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 29 号: 20 ページ: 2524-2528
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btt453
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22240031, KAKENHI-PROJECT-24680031, KAKENHI-PROJECT-25240044, KAKENHI-PROJECT-221S0002
[雑誌論文] Lanthanide-assisted NMR evaluation of a dynamic ensemble of oligosaccharide conformations.2012
- 著者名/発表者名
  S.Yamamoto, Y.Zhang, T.Yamaguchi, T.Kameda, and K.Kato
- 雑誌名
  
  Chem. Commun.
  
  巻: 48 号: 39 ページ: 4752-4754
- DOI
  10.1039/c2cc30353a
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-20107004, KAKENHI-PROJECT-21370050, KAKENHI-PROJECT-23700359
[雑誌論文] On easy implementation of a variant of the replica exchange with solute tempering in GROMACS2011
- 著者名/発表者名
  T. Terakawa, T. Kameda, S. Takada
- 雑誌名
  
  J. Comp.Chem
  
  巻: vol.32, No.7 号: 7 ページ: 1228-1234
- DOI
  10.1002/jcc.21703
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22370057, KAKENHI-PROJECT-23700359
[雑誌論文] Combined Use of Replica-Exchange Molecular Dynamics and Magic-Angle-Spinning Solid-State NMR Spectral Simulations for Determining the Structure and Orientation of Membrane-Bound Peptide2011
- 著者名/発表者名
  Keisuke Ikeda, Tomoshi Kameda, Erisa Harada, Hideo Akutsu, and Toshimichi Fujiwara
- 雑誌名
  
  J. Phys. Chem. B
  
  巻: 115 号: 29 ページ: 9327-9336
- DOI
  10.1021/jp205290t
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23700359
[学会発表] Solubilization of Carbon Nanobelts in Aqueous Surfactant Solutions2024
- 著者名/発表者名
  Atsushi Hirano, Tomoshi Kameda, Momoyo Wada, Takeshi Tanaka, Hiromichi Kataura
- 学会等名
  第66回フラーレン・ナノチューブ・グラフェン総合シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23163
[学会発表] A chemoproteoinformatics approach demonstrates that aspirin increases sensitivity to MEK inhibition by directly binding to RPS52023
- 著者名/発表者名
  Shogen Boku, Motoki Watanabe, Kaito Kobayashi, Yoichi Kurumida, Mamiko Sukeno, Mitsuharu Masuda, Katsura Mizushima, Chikage Kato, Yosuke Iizumi, Kiichi Hirota, Yuji Naito, Michihiro Mutoh, Tomoshi Kameda, Toshiyuki Sakai
- 学会等名
  第20回日本臨床腫瘍学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] Dissociation Rate Calculation via Constant-force Steered Molecular Dynamics Simulation2023
- 著者名/発表者名
  Shinji Iida, Tomoshi Kameda
- 学会等名
  The 2023 Annual Biophysical Society Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H00553
[学会発表] OH基を有する天然物質の標的タンパク質同定法の開発と抗がんメカニズムの解明2023
- 著者名/発表者名
  飯泉陽介, 曽和義広, 後居和佳奈, 青野裕一, 渡邉元樹, 来見田遥一, 亀田倫史, 赤路健一, 北川雅敏, 酒井敏行
- 学会等名
  第８２回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] OH基を有する化合物の標的タンパク質同定法の開発と抗がん作用の機序解明2023
- 著者名/発表者名
  飯泉陽介, 曽和義広, 後居和佳奈, 青野裕一, 渡邉元樹, 来見田遥一, 亀田倫史, 赤路健一, 北川雅敏, 酒井敏行
- 学会等名
  日本農芸化学会2023年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] OH基を有する化合物全般に使える標的タンパク質同定法の開発2023
- 著者名/発表者名
  飯泉陽介, 曽和義広, 後居和佳奈, 青野裕一, 渡邉元樹, 来見田遥一, 亀田倫史, 赤路健一, 北川雅敏, 酒井敏行
- 学会等名
  第２８回日本フードファクター学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] Control of pH-dependent lipid bilayer permeation of cyclic peptides with noncanonical amino acids2023
- 著者名/発表者名
  Keisuke Ikeda, Motomi Matsuda, Tomoshi Kameda, Hiroyuki Nakao, Minoru Nakano
- 学会等名
  ICOM2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K27311
[学会発表] OH基を有する化合物の標的タンパク質同定法の開発と作用機序解明2023
- 著者名/発表者名
  飯泉陽介, 曽和義広, 後居和佳奈, 青野裕一, 渡邉元樹, 来見田遥一, 亀田倫史, 赤路健一, 北川雅敏, 酒井敏行
- 学会等名
  第22回分子予防環境医学研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] 環状ペプチドの pH 依存的な脂質膜透過活性の制御2023
- 著者名/発表者名
  池田恵介, 松田幹望, 亀田倫史, 中尾裕之, 中野実
- 学会等名
  第44回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K27311
[学会発表] OH基が一つあれば、化合物の標的タンパク質を同定できる手法の開発2023
- 著者名/発表者名
  飯泉陽介, 曽和義広, 後居和佳奈, 青野裕一, 渡邉元樹, 来見田遥一, 亀田倫史, 赤路健一, 北川雅敏, 酒井敏行
- 学会等名
  日本ケミカルバイオロジー学会第17回年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] A chemoproteoinformatics approach demonstrates that aspirin increases sensitivity to MEK inhibition by directly binding to RPS52023
- 著者名/発表者名
  Shogen Boku, Motoki Watanabe, Tomoshi Kameda
- 学会等名
  The 6th International Cancer Research Symposium
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] ポストゲノム時代のケモプロテオインフォマティクス創薬戦略2022
- 著者名/発表者名
  渡邉元樹, 朴将源, 亀田倫史
- 学会等名
  がん予防学術大会2022
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] Carbon Nanotubes Induce Oxidative Stress in Coenzyme-Dependent Metabolic Reactions2022
- 著者名/発表者名
  平野篤、亀田倫史、和田百代、田中丈士、片浦弘道
- 学会等名
  第62回フラーレン・ナノチューブ・グラフェン総合シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[学会発表] ポストゲノム時代のケモプロテオインフォマティクス創薬戦略－天然化合物から化学予防剤へ―2022
- 著者名/発表者名
  渡邉元樹, 朴将源, 亀田倫史
- 学会等名
  第81回日本癌学会学術集会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K10489
[学会発表] Non-equilibrium Molecular Dynamics Simulation under Constant Force Revisited2022
- 著者名/発表者名
  Shinji Iida, Tomoshi Kameda
- 学会等名
  第60回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H00553
[学会発表] Aromaphilicity index: アミノ酸と芳香族表面の相互作用の指標2021
- 著者名/発表者名
  平野篤、亀田倫史
- 学会等名
  第21回日本蛋白質科学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[学会発表] Aromaphilicity index of amino acids: Prediction of protein binding affinity for aromatic surfaces2021
- 著者名/発表者名
  平野篤、亀田倫史
- 学会等名
  第59回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[学会発表] Application of next-generation sequencing analysis in the directed evolution for creating antibody mimic2021
- 著者名/発表者名
  Tomoyuki Ito, Hafumi Nishi, Thuy Duong Nguyen, Yutaka Saito, Tomoshi Kameda, Hikaru Nakazawa, Koji Tsuda, Mitsuo Umetsu
- 学会等名
  65th Biophysical Society Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00315
[学会発表] Aromaphilicity: the affinity for graphene and carbon nanotubes determined by experiments and simulations2021
- 著者名/発表者名
  平野篤、亀田倫史、和田百代、田中丈士、片浦弘道
- 学会等名
  第61回フラーレン・ナノチューブ・グラフェン総合シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H01809
[学会発表] Improved accuracy in RNA-protein rigid body docking by incorporating force eld for molecular dynamics simulation into the scoring function2016
- 著者名/発表者名
  unichi Iwakiri, Michiaki Hamada, Kiyoshi Asai, Tomoshi Kameda
- 学会等名
  RNA2016
- 発表場所
  京都国際会議場
- 年月日
  2016-06-29
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] Predicting RNA-RNA duplex dimerization energy from the molecular dynamics simulation2016
- 著者名/発表者名
  Shun Sakuraba, Tomoshi Kameda and Kiyoshi Asai
- 学会等名
  RNA2016
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H02484
[学会発表] RNA-RNA の相対結合自由エネルギー計算2016
- 著者名/発表者名
  桜庭俊, 浅井潔, 亀田倫史
- 学会等名
  第19回理論化学討論会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H02484
[学会発表] 分子動力学法による核酸修飾塩基対の結合エネルギー予測2015
- 著者名/発表者名
  桜庭俊、亀田倫史、浅井潔
- 学会等名
  第17回日本RNA学会年会
- 発表場所
  北海道札幌市　ホテルライフォート札幌
- 年月日
  2015-07-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] 分子動力学計算を用いた蛋白質・RNA 複合体立体構㐀予測2015
- 著者名/発表者名
  由良敬，岩切淳一，浜田道昭，浅井潔，亀田倫史
- 学会等名
  第17回日本RNA学会年会
- 発表場所
  札幌パークホテル
- 年月日
  2015-07-15
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] ヒトトランスクリプトームにおける網羅的 lncRNA-RNA 相互作用予測2015
- 著者名/発表者名
  寺井悟朗、岩切淳一、亀田倫史、浜田道昭、浅井潔
- 学会等名
  第17回日本RNA学会年会
- 発表場所
  札幌パークホテル
- 年月日
  2015-07-15
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] RNA 発現量を用いた組織特異的 lncRNA-mRNA 相互作用予測2015
- 著者名/発表者名
  岩切淳一、寺井悟朗、亀田倫史、浅井潔、浜田道昭
- 学会等名
  第17回日本RNA学会年会
- 発表場所
  札幌パークホテル
- 年月日
  2015-07-15
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] 分子動力学計算を用いたRNA・タンパク質複合体立体構造予測2015
- 著者名/発表者名
  由良敬、岩切淳一、浜田道昭、浅井潔、亀田倫史
- 学会等名
  第17回日本RNA学会年会
- 発表場所
  北海道札幌市　ホテルライフォート札幌
- 年月日
  2015-07-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] RNA－タンパク質相互作用予測法の開発2014
- 著者名/発表者名
  岩切淳一、亀田倫史、浅井潔、浜田道昭
- 学会等名
  第16回日本RNA学会年会
- 発表場所
  愛知県名古屋市　ウインクあいち
- 年月日
  2014-07-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] 分子動力学計算を用いたRNA・タンパク質複合体立体構造予測2014
- 著者名/発表者名
  由良敬、岩切淳一、浜田道昭、浅井潔、亀田倫史
- 学会等名
  第16回日本RNA学会年会
- 発表場所
  愛知県名古屋市　ウインクあいち
- 年月日
  2014-07-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] 粗視化モデル分子動力学法を用いた RNA 立体構造予測2012
- 著者名/発表者名
  亀田倫史
- 学会等名
  日本生物物理学会
- 発表場所
  名古屋大学(愛知県)
- 年月日
  2012-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23700359
[学会発表] 分子動力学シミュレーション技術による化合物可溶化メカニズムの解明2012
- 著者名/発表者名
  亀田倫史
- 学会等名
  CBI学会(招待講演)
- 発表場所
  東京・総評会館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23700359
[学会発表] 粗視化モデル分子動力学法を用いたRNA 立体構造予測2012
- 著者名/発表者名
  亀田倫史
- 学会等名
  日本生物物理学会
- 発表場所
  名古屋大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23700359
[学会発表] NMRと分子動力学法との融合2011
- 著者名/発表者名
  亀田倫史
- 学会等名
  第12回若手NMR研究会(招待講演)
- 発表場所
  滋賀・琵琶湖リゾートクラブ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23700359
[学会発表] 蛋白質異常凝集の原理と制御2011
- 著者名/発表者名
  亀田倫史
- 学会等名
  大阪大学蛋白質研究所・蛋白研セミナー(招待講演)
- 発表場所
  大阪・大阪大学蛋白質研究所
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23700359
[学会発表] 分子動力学計算を用いた蛋白質・RNA 複合体立体構造予測
- 著者名/発表者名
  由良敬、岩切淳一、浜田道昭、浅井潔、亀田倫史
- 学会等名
  第16回日本RNA学会
- 発表場所
  名古屋
- 年月日
  2014-07-23 – 2014-07-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] 分子動力学計算を用いた蛋白質･RNA 複合体立体構造予測
- 著者名/発表者名
  由良敬、岩切淳一、浜田道昭、浅井潔、亀田倫史
- 学会等名
  第52回日本生物物理学会
- 発表場所
  札幌
- 年月日
  2014-09-25 – 2014-09-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044
[学会発表] RNA-タンパク質相互作用予測手法の開発
- 著者名/発表者名
  岩切淳一、亀田倫史、浅井潔、浜田道昭
- 学会等名
  第16回日本RNA学会
- 発表場所
  名古屋
- 年月日
  2014-07-23 – 2014-07-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25240044

1. 平野篤 (90613547)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 10件
2. 白木賢太郎 (90334797)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
3. 浅井潔 (30356357)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 16件
4. 浜田道昭 (00596538)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 12件
5. 齋藤裕 (60721496)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
6. 由良敬 (50252226)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
7. 梅津光央 (70333846)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
8. 石黒亮 (70373264)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 阿部洋 (80415067)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 櫻庭俊 (90647380)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. 田中丈士 (30415707)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
12. 津田宏治 (90357517)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
13. 伊藤智之 (40987880)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
14. 中道優介 (20751217)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 森田英嗣 (70344653)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 来見田遥一 (80976762)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 小林海渡 (31003957)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 渡邉元樹 (40723581)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 10件
19. 池田恵介 (00553281)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
20. 中尾裕之 (00805020)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
21. 片浦弘道

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
22. 加藤晃一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
23. 高田彰二

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
24. 北川雅敏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

亀田 倫史 Kameda Tomoshi

研究課題

研究成果

共同研究者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

分子動力学シミュレーション・機械学習を組み合わせた新型コロナウイルス進化予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

マルチスケールシミュレーションによる核酸立体構造予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Coenzyme corona formation on carbon nanotubes leads to disruption of the redox balance in metabolic reactions2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Solubilization of Carbon Nanobelts in Aqueous Solutions: Optical and Colloidal Properties2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Fine-Tuning and Enhancement of pH-Dependent Membrane Permeation of Cyclic Peptides by Utilizing Noncanonical Amino Acids with Extended Side Chains2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Protein’s Protein Corona: Nanoscale Size Evolution of Human Immunoglobulin G Aggregates Induced by Serum Albumin2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

亀田倫史 Kameda Tomoshi

[雑誌論文] Comprehensive prediction of lncRNA–RNA interactions in human transcriptome2016