松田秀雄 MATSUDA Hideo

研究者番号	50183950
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-4701-3779
外部サイト
所属 (現在)	2025年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 招へい教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2024年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授 2012年度 – 2021年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 教授 2007年度 – 2011年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 2006年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授 2002年度 – 2005年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 … もっと見る 2004年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授 2002年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 助教授 1997年度 – 2001年度: 大阪大学, 大学院・基礎工学研究科, 助教授 2000年度: 大阪大学, 大学院・基礎工学研究科情報数理系専攻, 助教授 1999年度: 大阪大学, 大学院・基礎工学研究所, 助教授 1996年度: 大阪大学, 基礎工学研究科, 助教授 1995年度 – 1996年度: 大阪大学, 基礎工学部, 助教授 1994年度: 神戸大学, 光学部, 助教授 1994年度: 神戸大学, 工学部, 助教授 1992年度 – 1993年度: 神戸大学, 工学部, 講師 1989年度 – 1990年度: 神戸大学, 工学部, 講師 1989年度: 神戸大学, 工学部, 助手 1987年度: 神戸大学, 工学部, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者知能情報学 / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 生命・健康・医療情報学 / システムゲノム科学 / 理工系 / 生物系 / 複合領域 / 計算科学研究代表者以外生物系 / 小区分42040:実験動物学関連 … もっと見る / 知能情報学 / 情報工学 / 電子通信系統工学 / 食品科学 / 機械工作隠す
キーワード	研究代表者バイオインフォマティクス / 遺伝子発現解析 / 遺伝子配列解析 / 1細胞トランスクリプトーム解析 / 細胞追跡 / ゲノム情報解析 / cDNA / 分子進化 / 細胞系譜解析 / 細胞系譜推定 … もっと見る / 細胞遊走 / ベイジアンネットワーク / 代謝パスウェイ / 機能注釈 / マイクロアレイ / クラスタリング / 人工生命 / 遺伝的アルゴリズム / ゲノム情報処理 / 細胞系譜 / 1細胞RNAシーケンス / 細胞アトラス / 免疫細胞 / 細胞イメージング解析 / 細胞イメージング / Genome Information Analysis / Metabolic Pathway / DNAチップ / 脂肪細胞 / 生体イメージング / 遺伝子制御ネットワーク / 細胞分化 / 遺伝子ネットワーク / 異種データベース / 情報システム / データグリッド / モチーフ / 生物情報科学 / 遺伝子分類 / 組合せ最適化 / 最尤法 / 分子系統解析 / 並列処理 / 細胞種推定 / 融合遺伝子検出 / 遺伝子発現プロファイル解析 / RNAシーケンシングデータ解析 / １細胞トランスクリプトーム / １細胞トランスクリプトーム解析 / 炎症 / 1細胞トランスクリプトーム / 生体イメージング解析 / 1細胞RNAシーケンス解析 / 1細胞RNAシーケンシング解析 / 時系列データ解析 / トランスクリプトーム解析 / ネットワーク解析 / １細胞RNAシーケンシング / 1細胞RNAシーケンシング / 動的ベイジアンネットワークモデル / 遺伝子制御ネットワーク推定 / 生体シミュレーション / 炎症反応 / 細胞動態 / セグメンテーション / イメージング解析 / Knowledgebase / Database Federation / Genome Database / Grid Computing / データ検索インターフェース / XML / 知識ベース / データベース連携 / ゲノムデータベース / グリッドコンピューティング / Gene Regulatory Network / Transcription Factor Binding Site / Transcription Factor / Microarray / 配列モチーフ / 転写因子結合配列 / 転写因子 / 代謝経路 / Gene Sequence Analysis / cDNA Microarray / Functional Annotation / Gene Interactions / Gene Exnression Analysis / 遺伝子相互作用 / Bioinformatics / multiple alignment / metabolic pathway / gene expression pattern / DNA chip / gene classification / genetic sequence analysis / 多重アライメント / 代謝反応パスウェイ / 遺伝子発現パターン / 大規模データ解析 / 褐色脂肪細胞 / 熱産生 / microRNA / モデル化とシミュレーション / 細胞トラッキング / 蛍光イメージング / バイオイメージインフォマティクス / 数理モデル / 画像処理 / 細胞画像解析 / 遺伝子発現プロファイル / 大規模ファルシステム / ワークフロー / Webサービス / 大規模ファイルシステム / 情報検索 / ゲノム情報 / 系統樹 / 分子系統樹 / コード領域予測 / 最尤推定 / 論理型言語 / データベース … もっと見る研究代表者以外データベース / Prolog / siRNA / 配列解析 / ゲノムアノテーション / バイオインフォマティクス / 転写因子 / ブラストイド / iPS細胞 / ES細胞 / 全能性 / Image Processing of Micrographs / Phenome / Comparative Genomics / Transcription Start Site Analysis / Genome Sequencing / Bioinformatics / ゲノム / アミノ酸モチーフ / アラインメント / ヒトゲノム / データマイニング / アルゴリズム / ゲノム情報 / オリゴマ設計 / DNAチップ / ゲノム解析ソフトウエア / ゲノム配列解読 / 遺伝子発現量解析 / RNAi / 遺伝子予測 / 顕微鏡画像解析 / フェノーム / 表現型 / 比較ゲノム / 転写開始点 / ゲノム解読 / Genetic diseases / Pathway / Molecular interactions / Network / Database / Protein structure prediction / Gene function prediction / Genome analysis / 遺伝子疾患 / パスウェイ / 分子間相互作用 / ネットワーク / タンパク質立体構造予測 / 遺伝子機能予測 / ゲノム解析 / Workstation network / Field / Agent / Multi-agent / Distributed computing / 並列処理 / 協調処理 / ワークステーションネットワーク / リ-クステーションネットワーク / 場 / エージェント / マルチエージェント / 分散協調処理 / knowledge base / relational database / processor array / data base machine / 関係ベ-タ・ベ-ス / デ-タ・ベ-スマシン / 関係デ-タベ-ス / 知識ベ-ス / デ-タベ-スマシン / 関係データベース / 知識ベース / プロセッサアレイ / データベースマシン / マイクロプロセッサ並列処理 / 多次元ディジタルフィルタの構成 / 多次元ディジタルフィルタの設計 / 多次元ディジタル信号処理 / メタボリック症候群 / 褐色脂肪 / 脂肪細胞 / エネルギー代謝 / 肥満 / 植物ゲノム解析 / 発現解析 / ゲノムリシーケンス / 疾患関連遺伝子解析 / 病原微生物解析 / ゲノムリシーケンス / 表現型解析 / 情報解析 / マルチエージェントシステムソフトウェアプロセス / 生産性 / リスケジュ-リング / スケジュ-リング / 生産時点情報管理 / 生産管理 / 生産情報 / 分散処理 / シミュレーション / リスケジューリング / POPシステム / CIM 隠す

自律的な初期胚形成が可能な全能性状態の誘導
- 研究代表者
  
  堀江恭二
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分42040:実験動物学関連
- 研究機関
  奈良県立医科大学
情報量基準に基づく細胞アトラスからの細胞系譜の推定手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
炎症進行過程の解明のための１細胞トランスクリプトームデータの統合解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  大阪大学
情報量基準に基づく細胞集団の多重分類・比較方式の開発と細胞アトラスへの応用研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
生体イメージングによる炎症細胞の遊走動態の解析とシミュレーション手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 研究機関
  大阪大学
ベイジアンネットワークによる遺伝子制御予測に基づく細胞多様性の解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
リアルタイム生体イメージングによる網羅的な細胞動態の解析研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大阪大学
脂肪細胞の分化転換における遺伝子ネットワークの網羅的解析技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大阪大学
４Ｄイメージングによる生体環境の動的解析研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  大阪大学
エネルギー消費代謝を制御する褐色脂肪細胞の発生機構と生理的役割の解明
- 研究代表者
  
  河田照雄
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 研究分野
  
  食品科学
- 研究機関
  京都大学
細胞分化過程の解明のための遺伝子ネットワーク解析技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  大阪大学
データグリッドによる異分野科学データベース統合技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  大阪大学
異分野科学データベースからの大量情報統合技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2006
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  大阪大学
情報解析および成果公開のための支援活動
- 研究代表者
  
  高木利久
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学
ゲノムレベルでの遺伝子機能情報の統合化と遺伝子システム解明への応用研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2003 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  大阪大学
グリッドコンピューティングによる連携型ゲノム知識ベースの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2003 – 2004
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  計算科学
- 研究機関
  大阪大学
ゲノムレベルでの遺伝子機能情報の統合化研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2001 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  大阪大学
人工生命による遺伝子相互作用ネットワークの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2001 – 2002
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  大阪大学
ゲノム統合データベースからの知識発見
- 研究代表者
  
  森下真一
- 研究期間 (年度)
  2000 – 2004
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学
人工生命による遺伝子制御ネットワークの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1999 – 2000
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  大阪大学
人工生命による分子進化のモデル化と遺伝子情報の統合解析研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1997 – 1998
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  大阪大学
人工生命による分子進化のモデル化と遺伝子配列の機能解析研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1996
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  大阪大学
ゲノムの生物知識情報
- 研究代表者
  
  金久實
- 研究期間 (年度)
  1996 – 2000
- 研究種目
  
  特定領域研究(A)
- 研究機関
  京都大学
最尤法による分子進化の並列解析システムの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  大阪大学
人工生命による分子進化のモデルと並列シミュレーション研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1995
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  大阪大学
最尤法によるゲノム情報の並列多重解析システムの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1994
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  神戸大学
人工生命による生体機構のモデル化と並列シミュレーション研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1994
- 研究種目
  
  奨励研究(A)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  神戸大学
並列協調処理システム記述用言語処理系のワークステーション連結型並列計算機での実現
- 研究代表者
  
  金田悠紀夫
- 研究期間 (年度)
  1994 – 1995
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  神戸大学
データ並列論理言語によるゲノム情報データベースシステムの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  1993
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  神戸大学
論理プログラミングにおけるソフトウェア構成プロセスのモデル化に関する研究
- 研究代表者
  
  金田悠紀夫
- 研究期間 (年度)
  1992
- 研究種目
  
  重点領域研究
- 研究機関
  神戸大学
インテリジェント生産時点情報管理(POP)に関する研究
- 研究代表者
  
  藤井進
- 研究期間 (年度)
  1989 – 1990
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  機械工作
- 研究機関
  神戸大学
一次元プロセッサアレイ型データ・ベースマシンの研究
- 研究代表者
  
  金田悠紀夫
- 研究期間 (年度)
  1989 – 1990
- 研究種目
  
  一般研究(C)
- 研究分野
  
  情報工学
- 研究機関
  神戸大学
マイクロプロセッサの立体アレイによる3次元情報の高速処理に関する研究
- 研究代表者
  
  前川禎男
- 研究期間 (年度)
  1986 – 1987
- 研究種目
  
  一般研究(B)
- 研究分野
  
  電子通信系統工学
- 研究機関
  神戸大学

[雑誌論文] Accurate Detection of Fusion Genes in Long-Read Transcriptome Datasets from Multiple Cancer Cell Lines2024
- 著者名/発表者名
  Keigo Masuda、Yoshiaki Sota、Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2024 14th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: －ページ: 7-13
- DOI
  10.1145/3640900.3640909
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19827
[雑誌論文] Detecting Fusion Genes in Long-Read Transcriptome Sequencing Data with FUGAREC2024
- 著者名/発表者名
  Keigo Masuda、Yoshiaki Sota、Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics
  
  巻: 17 号: 0 ページ: 1-9
- DOI
  10.2197/ipsjtbio.17.1
- ISSN
  1882-6679
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19827
[雑誌論文] Pseudotime-based Deep Learning of Gene Regulatory Relationships from Single-Cell Expression Data2023
- 著者名/発表者名
  Koki Nishi、Junko Yoshida、Shigeto Seno、Kyoji Horie、Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2023 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology
  
  巻: －ページ: 56-62
- DOI
  10.1145/3620679.3620688
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19827
[雑誌論文] A Cell Tracking Method for Dynamic Analysis of Immune Cells Based on Deep Learning2023
- 著者名/発表者名
  Aya Watanabe,Kenji Fujimoto,Hironori Shigeta,Shigeto Seno,Yutaka Uchida,Masaru Ishii,Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  International Journal of Machine Learning
  
  巻: 13 号: 2 ページ: 64-69
- DOI
  10.18178/ijml.2023.13.2.1130
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19827
[雑誌論文] Inference of Cell-Cell Communication for Detecting Immune Disease-Associated Signaling Pathways using Single-Cell RNA-seq2022
- 著者名/発表者名
  Akihiro Nomura,Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2022 9th International Conference on Biomedical and Bioinformatics Engineering
  
  巻: - ページ: 74-80
- DOI
  10.1145/3574198.3574210
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19827
[雑誌論文] A Novel Method for Fusion Gene Detection using Both End-Fragment Sequences of Long Reads2022
- 著者名/発表者名
  Keigo Masuda,Yoshiaki Sota,Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2022 9th International Conference on Biomedical and Bioinformatics Engineering
  
  巻: - ページ: 88-92
- DOI
  10.1145/3574198.3574212
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19827
[雑誌論文] A Novel Method for Gene Regulatory Network Inference with Pseudotime Data Using Information Criterion2022
- 著者名/発表者名
  Shuhei Yao, Kaito Uemura, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: 12
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[雑誌論文] Detection of Biomarkers for Epithelial-Mesenchymal Transition with Single-Cell Trajectory Inference2022
- 著者名/発表者名
  Murayama Kosho、Matsuda Hideo
- 雑誌名
  
  Frontiers in Bioscience-Landmark
  
  巻: 27 号: 4 ページ: 127-127
- DOI
  10.31083/j.fbl2704127
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-17H06391, KAKENHI-PUBLICLY-20H04947, KAKENHI-PROJECT-18H04124
[雑誌論文] A Method for Detection of Markers for Epithelial-Mesenchymal Transition based on Single Cell Transcriptomic Data2022
- 著者名/発表者名
  Kosho Murayama, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of 12th International Conference on Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: －ページ: 57-62
- DOI
  10.1145/3510427.3510436
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894, KAKENHI-ORGANIZER-17H06391, KAKENHI-PUBLICLY-20H04947, KAKENHI-PROJECT-18H04124
[雑誌論文] Identification of Lineage Markers for T Cell Immune Dysregulation in Sarcoidosis using Single-Cell RNA-seq2022
- 著者名/発表者名
  Akihiro Nomura, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: 12
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894
[雑誌論文] Detecting Lineage-Specific Marker Genes for Tumor Evolution Based on Single Cell Transcriptome2021
- 著者名/発表者名
  Murayama Kosho、Graduate School of Information Science and Technology, Osaka University, Suita, Osaka, Japan、Matsuda Hideo
- 雑誌名
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: 11 号: 3 ページ: 50-57
- DOI
  10.17706/ijbbb.2021.11.3.50-57
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-17H06391, KAKENHI-PUBLICLY-20H04947
[雑誌論文] Detecting Lineage-specific Marker Genes for Tumor Evolution based on Single Cell Transcriptome2021
- 著者名/発表者名
  Kosho Murayama, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: 11
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[雑誌論文] A CNN-based cell tracking method for multi-slice intravital imaging data2021
- 著者名/発表者名
  Fujimoto Kenji、Mizugaki Tsubasa、Rajkumar Utkrisht、Shigeta Hironori、Seno Shigeto、Uchida Yutaka、Ishii Masaru、Bafna Vineet、Matsuda Hideo
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 12th ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology, and Health Informatics
  
  巻: 35 ページ: 1-7
- DOI
  10.1145/3459930.3469559
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-17H06391, KAKENHI-PUBLICLY-20H04947
[雑誌論文] 炎症の進行過程解明のための一細胞トランスクリプトーム解析2020
- 著者名/発表者名
  松田秀雄
- 雑誌名
  
  医学のあゆみ
  
  巻: 275 ページ: 1085-1091
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-20H04947
[雑誌論文] Thrombomodulin induces anti-inflammatory effects by inhibiting the rolling adhesion of leukocytes in vivo.2020
- 著者名/発表者名
  Nishizawa S, Kikuta J, Seno S, Kajiki M, Tsujita R, Mizuno H, Sudo T, Ao T, Matsuda H, Ishii M.
- 雑誌名
  
  J Pharmacol Sci.
  
  巻: 143 号: 1 ページ: 17-22
- DOI
  10.1016/j.jphs.2020.01.001
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K17906, KAKENHI-PUBLICLY-18H05035, KAKENHI-PROJECT-18K16114, KAKENHI-PROJECT-20K17378
[雑誌論文] Long non-coding RNA 2310069B03Rik functions as a suppressor of Ucp1 expression under prolonged cold exposure in murine beige adipocytes2020
- 著者名/発表者名
  Mari Iwase, Shoko Sakai, Shigeto Seno, Yu-Sheng Yeh, Tony Kuo, Haruya Takahashi, Wataru Nomura, Huei-Fen Jheng, Paul Horton, Naoki Osato, Hideo Matsuda, Kazuo Inoue, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto
- 雑誌名
  
  Bioscience, biotechnology, and biochemistry
  
  巻: 84 号: 2 ページ: 305-313
- DOI
  10.1080/09168451.2019.1677451
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00387, KAKENHI-PROJECT-18H04124, KAKENHI-PROJECT-19H02910
[雑誌論文] Improvement of detection performance of fusion genes from RNA-Seq data by clustering short reads2019
- 著者名/発表者名
  Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Naoki Osato, Masafumi Shimoda, Shinzaburo Noguchi, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 印刷中
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[雑誌論文] 生体蛍光観察動画像の深度を考慮した深層学習による細胞追跡精度の改善2019
- 著者名/発表者名
  嶋田彩人, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 間下以大, 内田穣, 石井優, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌数理モデル化と応用
  
  巻: 印刷中
- NAID
  170000150463
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05035
[雑誌論文] Direct cell-cell contact between mature osteoblasts and osteoclasts dynamically controls their functions in vivo2018
- 著者名/発表者名
  Masayuki Furuya、Junichi Kikuta、Sayumi Fujimori、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 300-300
- DOI
  10.1038/s41467-017-02541-w
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-17K11005, KAKENHI-PROJECT-16K12525, KAKENHI-PROJECT-15H05671, KAKENHI-PROJECT-16H02619
[雑誌論文] The dipeptidyl peptidase-4 (DPP-4) inhibitor teneligliptin enhances brown adipose tissue function, thereby preventing obesity in mice2018
- 著者名/発表者名
  Takeda Kenichiro、Sawazaki Honami、Takahashi Haruya、Yeh Yu-Sheng、Jheng Huei-Fen、Nomura Wataru、Ara Takeshi、Takahashi Nobuyuki、Seno Shigeto、Osato Naoki、Matsuda Hideo、Kawada Teruo、Goto Tsuyoshi
- 雑誌名
  
  FEBS Open Bio
  
  巻: 8 号: 11 ページ: 1782-1793
- DOI
  10.1002/2211-5463.12498
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H02551, KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-16K12525
[雑誌論文] The hepatokine FGF21 is crucial for peroxisome proliferator-activated receptor-α agonist-induced amelioration of metabolic disorders in obese mice2017
- 著者名/発表者名
  Tsuyoshi Goto、Mariko Hirata、Yumeko Aoki、Mari Iwase、Haruya Takahashi、Minji Kim、Yongjia Li、Huei-Fen Jheng、Wataru Nomura、Nobuyuki Takahashi、Chu-Sook Kim、Rina Yu、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  The Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 292 号: 22 ページ: 9175-9190
- DOI
  10.1074/jbc.m116.767590
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-16K07734, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] Bone marrow cavity segmentation using graph-cuts with wavelet-based texture feature2017
- 著者名/発表者名
  Shigeta Hironori、Mashita Tomohiro、Junichi Kikuta、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 15 号: 05 ページ: 1740004-1740004
- DOI
  10.1142/s0219720017400042
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-16K12525
[雑誌論文] Detecting shifts in gene regulatory networks during time-course experiments at single-time-point temporal resolution2016
- 著者名/発表者名
  Yoichi Takenaka, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  J. Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 13 号: 05 ページ: 1543002-1543020
- DOI
  10.1142/s0219720015430027
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00402, KAKENHI-PROJECT-24700294, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] Proinflammatory cytokine interleukin-1β suppresses cold-induced thermogenesis in adipocytes2016
- 著者名/発表者名
  Tsuyoshi Goto, Supaporn Naknukool, Rieko Yoshitake, Yuki Hanafusa, Soshi Tokiwa, Yongjia Li, Tomoya Sakamoto, Takahiro Nitta, Minji Kim, Nobuyuki Takahashi, Rina Yu, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Teruo Kawada
- 雑誌名
  
  Cytokine
  
  巻: 77 ページ: 107-114
- DOI
  10.1016/j.cyto.2015.11.001
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] グラフカットを用いた骨髄腔画像の領域分割2015
- 著者名/発表者名
  宇佐見潤, 繁田浩功, 間下以大, 黒田嘉宏, 菊田順一, 瀬尾茂人, 石井優, 松田秀雄, 竹村治雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌数理モデル化と応用
  
  巻: ８ページ: 18-27
- NAID
  110009886640
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[雑誌論文] Metagenome fragment classification based on multiple motif-occurrence profiles2014
- 著者名/発表者名
  Naoki Matsushita, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  PeerJ
  
  巻: 2: e559 ページ: 1-13
- DOI
  10.7717/peerj.559
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24650155, KAKENHI-PROJECT-24700294, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法2013
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌　数理モデル化と応用
  
  巻: 6(3) ページ: 140-150
- NAID
  110009550153
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[雑誌論文] An estimation method for a cellular-state-specific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles2013
- 著者名/発表者名
  Ryo Araki, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Gene
  
  巻: Vol.518 号: 1 ページ: 17-25
- DOI
  10.1016/j.gene.2012.11.090
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125, KAKENHI-PROJECT-22680023, KAKENHI-PROJECT-24650155, KAKENHI-PROJECT-24700294
[雑誌論文] A Method for Isoform Prediction from RNA-Seq Data by Iterative Mapping2012
- 著者名/発表者名
  Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics
  
  巻: 5 号: 0 ページ: 27-33
- DOI
  10.2197/ipsjtbio.5.27
- NAID
  130002124175
- ISSN
  1882-6679
- 言語
  英語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[雑誌論文] An estimation method for inference of gene regulatory network using Bayesian network with uniting of partial problems2012
- 著者名/発表者名
  Yukito Watanabe, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: Vol.13 号: Suppl 1 ページ: S12-S12
- DOI
  10.1186/1471-2164-13-s1-s12
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125, KAKENHI-PROJECT-22680023
[雑誌論文] 細胞分化クロストークのモデル化と細胞分化クロストーク遺伝子の推定手法2011
- 著者名/発表者名
  吉澤陽志, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌数理モデル化と応用
  
  巻: 4巻ページ: 59-68
- NAID
  40019257169
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[雑誌論文] Inference of S-system models of gene regulatory networks using immune algorithm2011
- 著者名/発表者名
  Tomoyoshi Nakayama, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: Vol.9 号: supp01 ページ: 75-86
- DOI
  10.1142/s0219720011005768
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[雑誌論文] Gene expression profile prospectively predicts peritoneal relapse after curative surgery of gastric cancer2010
- 著者名/発表者名
  A.Takeno, I.Takemasa, S.Seno, M.Yamasaki, M.Motoori, H.Miyata, K.Nakajima, S.Takiguchi, Y.Fujiwara, T.Nishida, T.Okayama, K.Matsubara, Y.Takenaka, H.Matsuda, M.Monden, M.Mori, Y.Doki
- 雑誌名
  
  Annals of Surgical Oncology
  
  巻: Vol.17 ページ: 1033-1042
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[雑誌論文] A combination method of the tanimoto coefficient and proximity measure of random forest for compound activity prediction2008
- 著者名/発表者名
  Kawamura, G. (Matsuda, H.)
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics 49(SIG5)
  
  ページ: 46-57
- NAID
  110006684909
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17020001
[雑誌論文] A Distributed-Processing System for Accelerating Biological Research using Data-Staging2008
- 著者名/発表者名
  Y., Kido・S., Seno・S., Date・Y., Takenaka・H., Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics (印刷中)
- NAID
  110006684910
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[雑誌論文] A Combination Method of the Tanimoto Coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction2008
- 著者名/発表者名
  G., Kawamura・S., Seno・Y., Takenaka・H., Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics (印刷中)
- NAID
  110006824830
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[雑誌論文] A distributed-processing system for accelerating biological research using data-staging2008
- 著者名/発表者名
  Kido, Y. (Matsuda, H.)
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics 49(SIG5)
  
  ページ: 58-64
- NAID
  110006684910
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17020001
[雑誌論文] Compound-Transporter Interaction Studies using Canonical Correlation Analysis2007
- 著者名/発表者名
  M., Kitajima・Y., Minowa・H., Matsuda・Y., Okuno
- 雑誌名
  
  Chem-Bio Informatics Journal 7
  
  ページ: 24-34
- NAID
  130004138177
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[雑誌論文] Retrieving functionally similar bioinformatics workflows using TF-IDF filtering2007
- 著者名/発表者名
  Seo, J., (Matsuda, H.)
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics 48 (SIG5)
  
  ページ: 20-29
- NAID
  110006242959
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17020001
[雑誌論文] Inference of Transcriptional Regulatory Networks using CAGE Transcriptome Dataset of Mus musculus2006
- 著者名/発表者名
  K.Taki, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering (CD-ROM)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18049053
[雑誌論文] Extraction of Functionally Similar Bioinformatics Workflows2006
- 著者名/発表者名
  J.Seo, S.Seno, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of International Workshop on Dstibute Applications, Web Services, Tools and GRID Infrastructures for Bioinformatics 6
  
  ページ: 70-74
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18049053
[雑誌論文] 遺伝子発現プロファイルを用いた遺伝子制御ネットワーク推定のためのバイクラスタリングの応用2006
- 著者名/発表者名
  瀧浩平, 竹中要一, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌 : 数理モデル化と応用 47・15
  
  ページ: 118-128
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18049053
[雑誌論文] A Method for Exploring Tissue-Specific Functions based on Information Content of Gene Ontology Terms using CAGE Tags2006
- 著者名/発表者名
  S.Maekawa, A.Matsumoto, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Proceedings of World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering (CD-ROM)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18049053
[雑誌論文] An OGSA-based Integration of Life Science Resources2005
- 著者名/発表者名
  T.Kosaka, Y.Tohsato, S.Date, H.Matsuda, S.Shimojo
- 雑誌名
  
  Methods of Information in Medicine 44-2 (in press)
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] Heterogeneous Database Federation using Grid Technology for Drug Discovery Process2005
- 著者名/発表者名
  Y.Tohsato, T.Kosaka, S.Date, S.Shimojo, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Lecture Notes in Bioinformatics 3370
  
  ページ: 43-52
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] An OGSA-based Integration of Life Science Resources2005
- 著者名/発表者名
  T.Kosaka, Y.Tohsato, S.Date, H.Matsuda, S.Shimojo
- 雑誌名
  
  Methods of Information in Medicine 44・2(in press)
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] Architecture of a Grid-Enabled Research Platform with Location-Transparency for Bioinformatics2005
- 著者名/発表者名
  Y.Tohsato, T.Kosaka, S.Date, S.Shimojo, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Lecture Notes in Bioinformatics 3370
  
  ページ: 43-52
- NAID
  130003997344
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] Graph-based Clustering for Finding Distant Relationships in a Large Set of Protein Sequences2004
- 著者名/発表者名
  Kawaji, H., Takenaka, Y., Matsuda, H.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics 20(2)
  
  ページ: 243-252
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Biased biological functions of horizontally transferred genes in prokarvotic genomes2004
- 著者名/発表者名
  Y.Nakamura, T.I toh, H.Matsuda, T.Goiobori.
- 雑誌名
  
  Nature Genetics 36・7
  
  ページ: 760-766
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Architecture of a Grid-Enabled Research Platform with Location-Transparency for Bioinformatics2004
- 著者名/発表者名
  Y.Kido S.Date S.Takeda S.Hatano J.Ma S.Shimoio H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Genome Informatics l5・2
  
  ページ: 3-12
- NAID
  130003997344
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] A Method for Clustering Expression Data Based on Graph Structure2004
- 著者名/発表者名
  S.Seno, R.Teramoto, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 15-2
  
  ページ: 151-160
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] 遺伝子の機能分類を利用した遺伝子制御ネットワーク推定手法2004
- 著者名/発表者名
  瀧浩平, 寺本礼仁, 竹中要一, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報科学技術レターズ 3
  
  ページ: 23-24
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] MaXML : Mouse Annotation XML2004
- 著者名/発表者名
  Kasukawa, T., Bono, H., Hayashizaki, Y., Okazaki, Y., Matsuda, H.
- 雑誌名
  
  In Silico Biology 4(3)
  
  ページ: 7-15
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Architecture of a Grid-Enabled Research Platform with Location-Transparency for Bioinformatics2004
- 著者名/発表者名
  Y.Kido, S.Date, S.Takeda, S.Hatano, J.Ma, S.Shimojo, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 15-2
  
  ページ: 3-12
- NAID
  130003997344
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] Development of a database system for drug discovery by employing grid technology2004
- 著者名/発表者名
  K.Taki, R.Teramoto, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Information Technology Letters 3
  
  ページ: 365-369
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] Biased Biological Functions of Horizontally Transferred Genes in Prokaryotic Genomes2004
- 著者名/発表者名
  Nakamura, Y., Itoh, T., Matsuda, H., Gojobori, T.
- 雑誌名
  
  Nature Genetics 36(7)
  
  ページ: 760-766
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] A Method for Clustering Expression Data Based on Graph Structure2004
- 著者名/発表者名
  S.Seno R.Teramoto Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 15・2
  
  ページ: 151-160
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Biased biological functions of horizontally transferred genes in prokaryotic genomes2004
- 著者名/発表者名
  Y.Nakamura, T.Itoh, H.Matsuda, T.Gojobori
- 雑誌名
  
  Nature Genetics 36・7
  
  ページ: 760-766
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] 遺伝子の機能分類を利用した遺伝子制御ネットワーク推定手法2004
- 著者名/発表者名
  瀧浩平, 寺本礼仁, 竹中要一, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報科学技術レターズ 3
  
  ページ: 23-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Biased biological functions of horizontally transferred genes in prokaryotic genomes2004
- 著者名/発表者名
  Y.Nakamura, T.Itoh, H.Matsuda, T.Gojobori
- 雑誌名
  
  Nature Genetics 36-7
  
  ページ: 760-766
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] Architecture of a Grid-Enabled Research Platform with Location-Transparency for Bioinformatics2004
- 著者名/発表者名
  Y.Kido, S.Date, S.Takeda, S.Hatano, J.Ma, S.Shimojo, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 15・2
  
  ページ: 3-12
- NAID
  130003997344
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] Inference method of gene regulatory networks using gene functional classification2004
- 著者名/発表者名
  Taki, K., Teramoto, R., Takenaka, Y., Matsuda, H.
- 雑誌名
  
  Information Technology Letters 3
  
  ページ: 23-24
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] A Method for Clustering Expression Data Based on Graph Structure2004
- 著者名/発表者名
  S.Seno, R.Teramoto, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  Genome Informatics 15・2
  
  ページ: 151-160
- 説明
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15607013
[雑誌論文] A Clustering Method for Comparative Analysis between Genomes and Pathways2003
- 著者名/発表者名
  Miyake, S., Tohsato, Y., Takenaka, Y., Matsuda, H.
- 雑誌名
  
  8th International Conference on Database Systems for Advanced Applications DASFAA2003
  
  ページ: 327-334
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Mouse Proteome Analysis2003
- 著者名/発表者名
  Kanapin, A., Batalov, S., Davis, M.J., Gough, J., Grimmond, S., Kawaji, H., Magrane, M., Matsuda, H., Schoenbach, C., Teasdale, R.D., RIKEN GER Group, GSL Members, Yuan, Z.
- 雑誌名
  
  Genome Research 13(6b)
  
  ページ: 1335-1344
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Exploration of Novel Motifs derived from Mouse cDNA sequences2002
- 著者名/発表者名
  Kawaji, H., Schoenbach, C., Matsuo, Y., Kawai, J., Okazaki, Y., Hayashizaki, Y., Matsuda, H.
- 雑誌名
  
  Genome Research 12(3)
  
  ページ: 367-378
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] An Application of a Pathway Alignment Method to the Analysis of Metabolic Pathways, Research Communications in Biochemistry2001
- 著者名/発表者名
  Tohsato, Y., Matsuda, H, Hashimoto, A.
- 雑誌名
  
  Cell and Molecular Biology 15(3/4)
  
  ページ: 179-191
- 説明
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15011229
[雑誌論文] Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows using TF-IDF Filtering
- 著者名/発表者名
  J.Seo, S.Seno, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics (印刷中)
- NAID
  110006595438
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18049053
[産業財産権] 評価方法、評価装置およびプログラム2018
- 発明者名
  石井優、菊田順一、松田秀雄、瀬尾茂人
- 権利者名
  石井優、菊田順一、松田秀雄、瀬尾茂人
- 産業財産権種類
  特許
- 産業財産権番号
  2018-007571
- 出願年月日
  2018
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] A clustering method based on cell type identification for single-cell RNA-seq data2022
- 著者名/発表者名
  Sohta Nishida,Junko Yoshida,Shigeto Seno,Kyoji Horie,Hideo Matsuda
- 学会等名
  The Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2022)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19827
[学会発表] 炎症刺激に対する免疫細胞の動態解析のための深層学習に基づく細胞追跡手法2022
- 著者名/発表者名
  渡部綾,ブライソンジェームス, 藤本健二, 繁田浩功, 瀬尾茂人, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第137回数理モデル化と問題解決研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-20H04947
[学会発表] A method for classification of cell migration types based on cell-tracking results from live-cell imaging2021
- 著者名/発表者名
  Aya Watanabe, Tsubasa Mizugaki, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  29th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 20th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-20H04947
[学会発表] Cell trajectory inference for mouse stem cell differentiation using cell type information from single-cell RNA-seq data2021
- 著者名/発表者名
  Yutaka Izeki, Mona Mizutome, Junko Yoshida, Shigeto Seno, Kyoji Horie, Hideo Matsuda
- 学会等名
  29th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 20th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894
[学会発表] Cell trajectory inference for revealing differentiation process of mouse stem cells using single cell RNA-seq data2020
- 著者名/発表者名
  Takumi Adachi, Junko Yoshida, Shigeto Seno, Kyoji Horie, Hideo Matsuda
- 学会等名
  28th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894
[学会発表] A method for tracking cell migration in vivo based on deep learning with target detection2020
- 著者名/発表者名
  Tsubasa Mizugaki, Utkrisht Rajkumar, Kenji Fujimoto, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Vineet Bafna, Hideo Matsuda
- 学会等名
  28th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-20H04947
[学会発表] Single-cell transcriptome analysis for elucidating cell dynamics2019
- 著者名/発表者名
  Naoki Osato, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Single cell biology meets diagnostics - 12th International workshop on approaches to single cell analysis
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[学会発表] A method for inferring gene regulatory networks based on pseudo time-series gene expression profiles from single-cell RNA-seq data2019
- 著者名/発表者名
  Kaito Uemura, Naoki Osato, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[学会発表] Single-cell RNA-seq analysis combined with live cell imaging on inflammatory response2019
- 著者名/発表者名
  Hideo Matsuda, Naoki Osato, Yutaka Uchida, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Masaru Ishii
- 学会等名
  27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05035
[学会発表] A study on novel estimation method of cell differentiation lineage by single cell trajectory inference2019
- 著者名/発表者名
  Shuhei Yao, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894
[学会発表] Single-cell transcriptome analysis of mouse leukocytes in inflammatory stimulation2019
- 著者名/発表者名
  Naoki Osato, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05035
[学会発表] Analyzing leukocyte migration trajectories by deformable image matching2019
- 著者名/発表者名
  Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Shino Nishizawa, Yutaka Uchida, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  19th International Conference on IEEE Bioinformatics and BioEngineering (BIBE)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05035
[学会発表] Detection of fusion genes from human breast cancer cell-line RNA-Seq data using shifted short read clustering2018
- 著者名/発表者名
  Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Naoki Osato, Masafumi Shimoda, Shinzaburo Noguchi, Hideo Matsuda
- 学会等名
  IEEE 18th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE 2018)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[学会発表] Asymmetric integration of single-cell transcriptomic data using latent Dirichlet allocation and procrustes analysis2018
- 著者名/発表者名
  Mitsuhisa Eto, Wataru Hirota, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  The 9th Integrative Data Analysis in Systems Biology (IDEAS 2018)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05035
[学会発表] 細胞画像のセグメンテーション精度向上のための画像類推を用いた学習データ拡張2018
- 著者名/発表者名
  赤沢秀樹, 渡邊誓旅, 繁田浩功, 間下以大, 瀬尾茂人, 松田秀雄
- 学会等名
  第21回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2018
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] Clustering of cells for single cell analysis using latent Dirichlet allocation2017
- 著者名/発表者名
  Mitsuhiro Eto, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2017)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 細胞個体の移動傾向の違いを考慮したグローバルデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法2017
- 著者名/発表者名
  伊藤澄美, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第112回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  清温荘（岩手県）
- 年月日
  2017-02-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] 蛍光顕微鏡画像のためのグラフカットによる毛細血管の抽出手法2017
- 著者名/発表者名
  嶋田彩人, 繁田浩功, 瀬尾茂人, 池田わたる, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  第16回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] 畳み込みニューラルネットワークを用いた脂肪細胞セグメンテーションにおける分割精度改善手法の提案2017
- 著者名/発表者名
  薮崎隼人, 瀬尾茂人, 竹中要一, 後藤剛, 河田照雄, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第112回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  清温荘（岩手県）
- 年月日
  2017-02-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 一細胞解析のための潜在的ディリクレ配分法を用いた遺伝子群の機能予測手法2017
- 著者名/発表者名
  江藤充宏, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  NGS現場の会第五回研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] A method of bioimage analysis for spatial pattern of cellular interaction and intercalation2017
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno, Masayuki Furuya, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2017)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] １細胞RNA-seqの特性を考慮した遺伝子発現差解析手法の検討2017
- 著者名/発表者名
  大里直樹, 繁田浩功, 瀬尾茂人, 松田秀雄
- 学会等名
  NGS現場の会第五回研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] Analyzing cell migration dynamics from intravital imaging by deformable image matching2017
- 著者名/発表者名
  Hideo Matsuda, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Junichi Kikuta, Masaru Ishii
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2017)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] A bone marrow cavity segmentation method using wavelet-based texture feature2016
- 著者名/発表者名
  Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Shigeto Seno, Haruo Takemura, Hideo Matsuda, Masaru Ishii
- 学会等名
  International Conference on Pattern Recognition (ICPR2016)
- 発表場所
  Cancun Center, Cancun, Mexico
- 年月日
  2016-12-04
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] ウェーブレット特徴量を用いた生体骨組織の骨髄腔の領域分割手法2016
- 著者名/発表者名
  繁田浩功, 間下以大, 菊田順一, 瀬尾茂人, 竹村治雄, 松田秀雄, 石井優
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016
- 発表場所
  大阪大学銀杏会館（大阪府）
- 年月日
  2016-06-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] An accurate estimation method for expression profiles of novel transcripts from RNA-Seq data2016
- 著者名/発表者名
  F. Iwasaki, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016)
- 発表場所
  Swan and Dolphin Hotel, Orlando, USA
- 年月日
  2016-07-08
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 模様特徴量とグラフカットを利用した生体骨組織の骨髄腔の領域分割2016
- 著者名/発表者名
  繁田浩功，間下以大，菊田順一，瀬尾茂人，石井優，松田秀雄
- 学会等名
  第5回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  東京国際交流館プラザ平成（東京都）
- 年月日
  2016-09-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] Bayesian network inference from gene expression profiles with a small number of samples2016
- 著者名/発表者名
  K. Saito, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2016)
- 発表場所
  UCLA, Los Angeles, USA
- 年月日
  2016-04-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] A method for reducing false positives of target genes of microRNAs by combining two prediction tools2016
- 著者名/発表者名
  H. Matsuda, J. Tsuda, S. Seno, Y. Takenaka
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016)
- 発表場所
  Swan and Dolphin Hotel, Orlando, USA
- 年月日
  2016-07-08
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] Dynamic analysis of gene regulations using leaving-one-out expression profile2016
- 著者名/発表者名
  Y. Takenaka, S. Seno, H. Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2016)
- 発表場所
  UCLA, Los Angeles, USA
- 年月日
  2016-04-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 小サンプル数データに対するベイジアンネットワークのスコアベース構造学習改善手法2016
- 著者名/発表者名
  齋藤和正, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第45回バイオ情報学研究発表会
- 発表場所
  北陸先端科学技術大学院大学（石川県）
- 年月日
  2016-03-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] オプティカルフローとウェーブレット解析を用いた白血球の動態の解析手法2016
- 著者名/発表者名
  松原周平, 瀬尾茂人, 西澤志乃, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016
- 発表場所
  大阪大学銀杏会館（大阪府）
- 年月日
  2016-06-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] 脂肪細胞の遺伝子解析：白色脂肪細胞の寒冷刺激による褐色化の機構解明2014
- 著者名/発表者名
  松田秀雄
- 学会等名
  第３回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  仙台国際センター（宮城県）
- 年月日
  2014-10-04
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 大域データ対応付けの反復実行による細胞追跡精度の改善手法2014
- 著者名/発表者名
  藏重昂平, 福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第39回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  大阪大学情報科学研究科（大阪府）
- 年月日
  2014-09-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] ゲノム情報からのビッグデータの解析2014
- 著者名/発表者名
  松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会組込みシステムシンポジウム
- 発表場所
  国立オリンピック記念青少年センター（東京都）
- 年月日
  2014-10-23
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法2014
- 著者名/発表者名
  津田絢子, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第38回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
- 年月日
  2014-06-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] ＩＬ－１βが白色脂肪細胞におけるUCP1発現に及ぼす影響2014
- 著者名/発表者名
  吉竹里依子、Naknukool Supaporn、花房祐希、坂本智弥、後藤　　剛、高橋信之、大安裕美、瀬尾茂人、松田秀雄、河田照雄
- 学会等名
  第35回日本肥満学会
- 発表場所
  宮崎市　シーガイアコンベンションセンター
- 年月日
  2014-10-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22228001
[学会発表] ライフサイエンスにおけるビッグデータの解析2014
- 著者名/発表者名
  松田秀雄
- 学会等名
  グリッド協議会神戸セミナー
- 発表場所
  理化学研究所計算科学研究機構（兵庫県）
- 年月日
  2014-09-12
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] タイムラプスイメージングによる細胞周期観測画像の時空間解析2014
- 著者名/発表者名
  福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ
- 発表場所
  岡崎コンファレンスセンター（愛知県）
- 年月日
  2014-06-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] 経時観測蛍光画像からのモーションヒストリーイメージを用いた細胞分裂の検出方法2013
- 著者名/発表者名
  福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013
- 発表場所
  国立情報学研究所, 東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] Global Data Associationによる経時観察画像における破骨前駆細胞の自動追跡手法2013
- 著者名/発表者名
  尾野貴広, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013
- 発表場所
  国立情報学研究所, 東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] スパコンによる遺伝子ネットワーク解析2012
- 著者名/発表者名
  松田秀雄
- 学会等名
  電子情報通信学会2012年総合大会
- 発表場所
  岡山大学(岡山県)
- 年月日
  2012-03-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Large-Scale Gene Regulatory Network Analysis for Adipocyte Differentiation on High-Performance Computer2012
- 著者名/発表者名
  Hideo Matsuda
- 学会等名
  The 23rd International Conference on Genome Informatics (GIW2012)
- 発表場所
  National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan
- 年月日
  2012-12-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Estimate Dynamic Gene Regulatory Networks in Adipocyte Differentiation for Detecting Changes of Gene Regulations by Splitting Time Course Data2012
- 著者名/発表者名
  Tomoyoshi Nakayama, Yoshiyuki Kido,Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  23rd International Conference on Genome Informatics(GIW2012)
- 発表場所
  National Cheng Kung University, Tainan, Taiwan
- 年月日
  2012-12-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Direct unique gene regulatory networks along dendrogram of cell differentiation2011
- 著者名/発表者名
  Ryo Araki, Yoichi Takenaka, Tomoshige Ohno, Yukito Watanabe, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  InCoB/ISCB-Asia Joint Conference 2011
- 発表場所
  Renaissance Hotel, Kuala Lumpur, Malaysia
- 年月日
  2011-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Network analysis for time-series expression profile using nested effects models2011
- 著者名/発表者名
  Tatsuya Kitaguchi, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  The 2011 Joint Conference of CBI and JSBi (CBI/JSBi2011)
- 発表場所
  Kobe International Conference Center, Hyogo.
- 年月日
  2011-11-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] A Directed Graphical Gaussian Model for Inferring Gene Regulatory Networks2011
- 著者名/発表者名
  Tomoshige Ohno, Kiyoshi Yoshizawa, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  The 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2011)
- 発表場所
  Austria Center Vienna, Vienna, Austria
- 年月日
  2011-07-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] A Method for Inference of Gene Regulatory Network based on Bayesian Network with Uniting of Partial Problems2011
- 著者名/発表者名
  Yukito Watanabe, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  The 19th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2011)
- 発表場所
  Austria Center Vienna, Vienna, Austria.
- 年月日
  2011-07-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Reconstruction of Gene Regulatory Networks for Drug Target Discovery2010
- 著者名/発表者名
  Hideo Matsuda
- 学会等名
  The 3rd National Seminar and Workshop on Computer Aided-Drug Design: Virtual Screening (CADD2010)
- 発表場所
  Gurney Hotel, Penang, Malaysia
- 年月日
  2010-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] An estimation method of S-system model of gene regulatory networks using immune algorithm2010
- 著者名/発表者名
  T.Nakayama, S.Seno, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Sysmtes for Molecular Biology (ISMB2010)
- 発表場所
  Hynes Convention Center, Boston (USA)
- 年月日
  2010-07-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Revealing regulatory relationships of crosstalk with multiple time-series gene expression profiles2010
- 著者名/発表者名
  Kiyoshi Yoshizawa, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  The 2010 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2010)
- 発表場所
  Centennial Hall, Kyushu University School of Medicine, Fukuoka.
- 年月日
  2010-12-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Revealing regulatory relationships of crosstalk with multiple time-series gene expression profiles2010
- 著者名/発表者名
  K.Yoshizawa, S.Seno, Y.Takenaka, H.Matsuda
- 学会等名
  Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2010)
- 発表場所
  九州大学医学部百年講堂、福岡県
- 年月日
  2010-12-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] 大規模遺伝子ネットワーク解析とその応用2010
- 著者名/発表者名
  松田秀雄
- 学会等名
  情報計算化学生物学会2010年大会
- 発表場所
  学術総合センター、東京都(招待講演)
- 年月日
  2010-09-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Reconstruction of gene regulatory networks for drug target discovery2010
- 著者名/発表者名
  H.Matsuda
- 学会等名
  3rd Workshop on Computer Aided-Drug Design (CADD2010)
- 発表場所
  Gurney Hotel, Penang (Malaysia)(招待講演)
- 年月日
  2010-12-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Architecture of an Efficient Data Transfer System and Manager for Genome-wide Analysis Workflows2008
- 著者名/発表者名
  J. Seo, Y. Kido, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  3rd MEI International Symposium
- 発表場所
  サンフランシスコ、アメリカ
- 年月日
  2008-12-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[学会発表] An Efficient Data Transfer, on Workflows for Genome-wide Analysis2008
- 著者名/発表者名
  J. Seo, Y. Kido, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  An Efficient Data Transfer, on Workflows for Genome-wide Analysis
- 発表場所
  千里中央、大阪
- 年月日
  2008-12-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[学会発表] A Method for Making a New Reference Set of PDB Entries for Retrieving Protein 3D Structures with Structural Annotations2008
- 著者名/発表者名
  M. Hamada, Y. Kido, S. Seno, H. Daiyasu, Y. Takenaka. H. Matsuda
- 学会等名
  Annual Conf Japanese Society for Bioinformatics
- 発表場所
  千里中央、大阪
- 年月日
  2008-12-15
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[学会発表] A Data Transmission Method for Web Services in Bioinformatics Workflows2008
- 著者名/発表者名
  J. Seo, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  Intl Conf Intelligent Systems for Molecular Biology
- 発表場所
  トロント、カナダ
- 年月日
  2008-07-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[学会発表] A Method for Reducing Bounds of Compound Search by Dividing Structure Key2008
- 著者名/発表者名
  T. Shimizu, Y. Kido, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  Annual Conf Japanese Society for Bioinformatics
- 発表場所
  千里中央、大阪
- 年月日
  2008-12-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[学会発表] グラフ構造を用いた組織特異的な選択的スプライシングの解析手法2007
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人、竹中要一、松田秀雄
- 学会等名
  日本分子生物学会第30回大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2007-12-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17020001
[学会発表] A Method for Retrieving Functionally Similar Bioinformatics Workflows2007
- 著者名/発表者名
  J., Seo・S., Seno・Y., Takenaka・H., Matsuda
- 学会等名
  Annual Conference of Japanese Society for Bioinformatics
- 発表場所
  東京,日本科学未来館
- 年月日
  2007-12-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19024050
[学会発表] Large-Scale Gene Regulatory Network Analysis for Adipocyte Differentiation on High-Performance Computer
- 著者名/発表者名
  Hideo Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Genome Informatics (GIW2012)
- 発表場所
  National Cheng Kung University, Taiwan
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125
[学会発表] Improvement approach of cell tracking accuracy by using inter-frame information
- 著者名/発表者名
  Kohei Kurashige, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Bioimage Informatics Conference
- 発表場所
  フラームスブラバント州庁舎（ルーベン、ベルギー）
- 年月日
  2014-10-08 – 2014-10-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] An automatic event detection method using semi-supervised learning for time-lapse imaging data
- 著者名/発表者名
  Kojiro Fukuda, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Bioimage Informatics Conference
- 発表場所
  フラームスブラバント州庁舎（ルーベン、ベルギー）
- 年月日
  2014-10-08 – 2014-10-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229

1. 瀬尾茂人 (30432462)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 39件
2. 金田悠紀夫 (80107979)

共同の研究課題数: 4件

共同の研究成果数: 0件
3. 田村直之 (60207248)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
4. 竹中要一 (00324830)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 28件
5. 高木利久 (30110836)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
6. 森下真一 (90292854)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
7. 久原哲 (00153320)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
8. 金久實 (70183275)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
9. 河田照雄 (10177701)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
10. 石井優 (10324758)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 13件
11. 前川禎男 (20031057)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
12. 阿久津達也 (90261859)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
13. 坊農秀雅 (20364789)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
14. 高橋信之 (50370135)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
15. 後藤剛 (10550311)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
16. 斉藤昌之 (80036441)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 松田哲也 (00209561)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
18. 荻原剛志 (90231224)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 瀧和男 (20243321)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 宮野悟 (50128104)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 後藤修 (40142111)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 土井晃一郎 (10345126)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 瀬々潤 (40361539)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 伊達進 (20346175)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
25. 藤井進 (00031112)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 綿谷泰典 (90230945)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 熊本悦子 (00221383)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 池田雅夫 (00031146)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 三道弘明 (40167440)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 中條拓伯 (80217736)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 雛元孝夫 (50031141)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 和田耕一 (30175145)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
33. 中井謙太 (60217643)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
34. 森浩禎 (90182203)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
35. 蓑島伸生 (90181966)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
36. 西田友是 (10131690)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
37. 堀江恭二 (30333446)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
38. AMRI Ez-Zoubir

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
39. 浅井潔

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
40. 大里直樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
41. 菊田順一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

松田 秀雄 MATSUDA Hideo

研究課題

研究成果

共同研究者

自律的な初期胚形成が可能な全能性状態の誘導

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

情報量基準に基づく細胞アトラスからの細胞系譜の推定手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

炎症進行過程の解明のための１細胞トランスクリプトームデータの統合解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

情報量基準に基づく細胞集団の多重分類・比較方式の開発と細胞アトラスへの応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

生体イメージングによる炎症細胞の遊走動態の解析とシミュレーション手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

ベイジアンネットワークによる遺伝子制御予測に基づく細胞多様性の解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

リアルタイム生体イメージングによる網羅的な細胞動態の解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

脂肪細胞の分化転換における遺伝子ネットワークの網羅的解析技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

４Ｄイメージングによる生体環境の動的解析研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

エネルギー消費代謝を制御する褐色脂肪細胞の発生機構と生理的役割の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

細胞分化過程の解明のための遺伝子ネットワーク解析技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

データグリッドによる異分野科学データベース統合技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

異分野科学データベースからの大量情報統合技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

松田秀雄 MATSUDA Hideo