久木田洋児 Kukita Yoji

研究者番号	60372744
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪国際がんセンター(研究所), その他部局等, ゲノム病理ユニット主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪国際がんセンター(研究所), その他部局等, ゲノム病理ユニット主任研究員 2022年度 – 2023年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪国際がんセンター(研究所), その他部局等, ゲノム病理ユニット主任研究員 2018年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 特任准教授 2017年度: 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 特任准教授 2016年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪国際がんセンター(研究所), 研究所, 主任研究員 … もっと見る 2014年度 – 2015年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所), 研究所, 主任研究員 2013年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所) 2013年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所), その他部局等, 研究員 2012年度 – 2013年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所), 研究所, 研究員 2010年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所), 研究所, 研究員 2009年度 – 2010年度: 地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所), 研究所, 研究員 2009年度: 大阪府立病院機構, 大阪府立成人病センター研究所, 研究員 2009年度: 大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所), 研究員 2007年度 – 2008年度: 九州大学, 生体防御医学研究所, 助教隠す
審査区分/研究分野	研究代表者小区分56020:整形外科学関連 / 腫瘍診断学 / ゲノム医科学 / 基礎ゲノム科学研究代表者以外小区分56020:整形外科学関連 / 小区分53010:消化器内科学関連 / 遺伝・ゲノム動態 / 生物系
キーワード	研究代表者癌 / 融合遺伝子 / 悪性軟部腫瘍 / 希少がん / 核酸 / 腫瘍マーカー / 体細胞変異 / ALK融合遺伝子 / 血中循環腫瘍DNA / 血中遊離DNA … もっと見る / 疾患関連遺伝子 / 遺伝子 / ゲノム / ハプロタイプ / ゲノム多様性 … もっと見る研究代表者以外ハプロタイプ / 骨軟部腫瘍 / 階層的クラスタリング / mRNA 発現解析 / DNA メチル化解析 / 遺伝子発現 / がん / 転写調節因子 / 細胞増殖 / 腸上皮化生 / 細胞分化 / 転写因子 / 消化管上皮 / 遺伝子多様性 / ヒトゲノム構造多様性 / 全身性エリテマトーデス(SLE) / ゲノムワイドな関連解析 / ゲノムワイドな確定ハプロタイプ / 胞状奇胎 / ソフトウェア「QSNP lite」 / 高精度アレル頻度決定 / SSCP解析 / 一塩基多型(SNP) / CpGアイランド / 家族性滲出性硝子体網膜症 / SLE / DHaploDB / 日本人確定ハプロタイプ / プールDNAによるゲノムワイド関連解析 / QSNPlite / 全胞状奇胎 / 確定ハプロタイプ / 一塩基多型 / PLACE-SSCP / 関連解析 / データベース / SSCP / 自己免疫疾患 / 疾患関連解析 / SNP 隠す

分子的肉腫分類のためのRNA発現とDNAメチル化によるクラスタリングの比較検討
- 研究代表者
  
  中村ハルミ
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分56020:整形外科学関連
- 研究機関
  医療法人徳洲会湘南鎌倉総合病院(臨床研究センター)
消化管上皮の発生・分化原理の理解に基づく化生発症メカニズムの解明
- 研究代表者
  
  森健太郎
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分53010:消化器内科学関連
- 研究機関
  金沢医科大学
エピゲノム解析による新規疾患分類候補肉腫の発生・増殖機序の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  久木田洋児
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分56020:整形外科学関連
- 研究機関
  地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪国際がんセンター(研究所)
ＤＮＡ分子高精度配列決定及び絶対定量技術による血中遊離ＤＮＡ解析システムの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  久木田洋児
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  腫瘍診断学
- 研究機関
  奈良先端科学技術大学院大学
   地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪国際がんセンター(研究所)
家族性及び同胞癌症例ゲノム解析による遺伝性癌原因遺伝子の同定とその応用研究代表者
- 研究代表者
  
  久木田洋児
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  ゲノム医科学
- 研究機関
  地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所)
日本人ハプロイドゲノムの超並列シークエンス解析による構造多型の完全解明
- 研究代表者
  
  田平知子
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2013
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  遺伝・ゲノム動態
- 研究機関
  九州大学
ハプロイドDNAを用いた日本人ゲノム多様性情報基盤の高度化研究代表者
- 研究代表者
  
  久木田洋児
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2010
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  基礎ゲノム科学
- 研究機関
  地方独立行政法人大阪府立病院機構大阪府立成人病センター(研究所)
定量的一塩基多型解析技術の開発と医療への応用
- 研究代表者
  
  田平知子, 林健志
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  九州大学

[図書] バイオイノベーションに向けて～バイオテクノロジーの新技術からの新しい視点～2019
- 著者名/発表者名
  植田充美, 城口克之, 小川泰策, 笹川洋平, 二階堂愛, 久木田洋児, 他
- 総ページ数
  258
- 出版者
  シーエムシー出版
- ISBN
  9784781314112
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[図書] リキッドバイオプシー―体液中腫瘍マーカーの検出・解析技術―2017
- 著者名/発表者名
  落谷孝広、前川真人、洪泰浩、加藤菊也、田原栄俊、前田瑞夫、細川和生、北森武彦、一木隆範、馬渡和真、今井靖、黒田雅彦、村上善基、湯川博、菊池春人、戸塚実、丹羽修、植松美幸、野村祐介、久木田洋児、他
- 総ページ数
  288
- 出版者
  シーエムシー出版
- ISBN
  9784781312590
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[図書] SNP ゲノタイピング(総論) 「DNAチップ/マイクロアレイ臨床応用の実際」(油谷浩幸編)2008
- 著者名/発表者名
  久木田洋児, 林健志
- 出版者
  メディカルATゥ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] A method for extending target regions of genomic profiling by combining a custom probe pool with a commercial targeted panel2023
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Kunimasa K, Akazawa T, Mizote Y, Tahara H
- 雑誌名
  
  The Journal of Applied Laboratory Medicine
  
  巻: 8 号: 6 ページ: 1065-1073
- DOI
  10.1093/jalm/jfad069
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K09368
[雑誌論文] 膵癌における次世代シーケンサーを用いた血中循環腫瘍DNA検出系―臨床応用の可能性について2018
- 著者名/発表者名
  大川和良, 高田良司, 片山和宏, 久木田洋児, 加藤菊也
- 雑誌名
  
  膵臓
  
  巻: 33 号: 6 ページ: 937-943
- DOI
  10.2958/suizo.33.937
- NAID
  130007569035
- ISSN
  0913-0071, 1881-2805
- 年月日
  2018-12-25
- 言語
  日本語
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Selective identification of somatic mutations in pancreatic cancer cells through a combination of next-generation sequencing of plasma DNA using molecular barcodes and a bioinformatic variant filter2018
- 著者名/発表者名
  Kukita Yoji、Ohkawa Kazuyoshi、Takada Ryoji、Uehara Hiroyuki、Katayama Kazuhiro、Kato Kikuya
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 13 号: 2 ページ: e0192611-e0192611
- DOI
  10.1371/journal.pone.0192611
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Transient appearance of circulating tumor DNA associated with de novo treatment.2016
- 著者名/発表者名
  Kato K, Uchida J, Kukita Y, Kumagai T, Nishino K, Inoue T, Kimura M, Imamura F
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 38639-38639
- DOI
  10.1038/srep38639
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Homozygous inactivation of CHEK2 is linked to a familial case of multiple primary lung cancer with accompanying cancers in other organs.2016
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Okami J, Yoneda-Kato N, Nakamae I, Kawabata T, Higashiyama M, Kato J, Kodama K, Kato K
- 雑誌名
  
  Cold Spring Harbor Molecular Case Studies
  
  巻: 2 号: 6 ページ: a001032-a001032
- DOI
  10.1101/mcs.a001032
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Dynamics of circulating tumor DNA represented by the activating and resistant mutations in epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor treatment.2016
- 著者名/発表者名
  Uchida J, Imamura F, Kukita Y, Oba S, Kumagai T, Nishino K, Inoue T, Kimura M, Kato K
- 雑誌名
  
  Cancer Science
  
  巻: 107 号: 3 ページ: 353-358
- DOI
  10.1111/cas.12860
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[雑誌論文] Monitoring of treatment responses and clonal evolution of tumor cells by circulating tumor DNA of heterogeneous mutant EGFR genes in lung cancer.2016
- 著者名/発表者名
  Imamura F, Uchida J, Kukita Y, Kumagai T, Nishino K, Inoue T, Kimura M, Oba S, Kato K
- 雑誌名
  
  Lung Cancer
  
  巻: 94 ページ: 68-73
- DOI
  10.1016/j.lungcan.2016.01.023
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180, KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Characterization of the T cell receptor beta chain repertoire in tumor infiltrating lymphocytes2016
- 著者名/発表者名
  Nakanishi, K., Kukita, Y., Segawa, H., Inoue, N., Ohue, M., Kato, K.
- 雑誌名
  
  Cancer Medicine
  
  巻: 5 号: 9 ページ: 2513-2521
- DOI
  10.1002/cam4.828
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H04703, KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Numerical indices based on circulating tumor DNA for the evaluation of therapeutic response and disease progression in lung cancer patients.2016
- 著者名/発表者名
  Kato K, Uchida J, Kukita Y, Kumagai T, Nishino K, Inoue T, Kimura M, Oba S, Imamura F
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 29093-29093
- DOI
  10.1038/srep29093
- NAID
  120006323742
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Early responses of EGFR circulating tumor DNA to EGFR tyrosine kinase inhibitors in lung cancer treatment.2016
- 著者名/発表者名
  Imamura F, Uchida J, Kukita Y, Kumagai T, Nishino K, Inoue T, Kimura M, Kato K
- 雑誌名
  
  Oncotarget
  
  巻: 7 号: 44 ページ: 71782-71789
- DOI
  10.18632/oncotarget.12373
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[雑誌論文] Monitoring gastric cancer progression with circulating tumour DNA2015
- 著者名/発表者名
  Hamakawa T, Kukita Y, Kurokawa Y, Miyazaki Y, Takahashi T, Yamasaki M, Miyata H, Nakajima K, Taniguchi K, Takiguchi S, Mori M, Doki Y, Kato K
- 雑誌名
  
  British Journal of Cancer
  
  巻: 112 号: 2 ページ: 352-356
- DOI
  10.1038/bjc.2014.609
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180, KAKENHI-PROJECT-26461977
[雑誌論文] Diagnostic Accuracy of Noninvasive Genotyping of EGFR in Lung Cancer Patients by Deep Sequencing of Plasma Cell-Free DNA.2015
- 著者名/発表者名
  Uchida J, Kato K, Kukita Y, Kumagai T, Nishino K, Daga H, Nagatomo I, Inoue T, Kimura M, Oba S, Ito Y, Takeda K, Imamura F
- 雑誌名
  
  Clinical Chemistry
  
  巻: 61 号: 9 ページ: 1191-1196
- DOI
  10.1373/clinchem.2015.241414
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[雑誌論文] High-fidelity target sequencing of individual molecules identified using barcode sequences: de novo detection and absolute quantitation of mutations in plasma cell-free DNA from cancer patients.2015
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Matoba R, Uchida J, Hamakawa T, Doki Y, Imamura F, Kato K
- 雑誌名
  
  DNA Research
  
  巻: 22 号: 4 ページ: 269-277
- DOI
  10.1093/dnares/dsv010
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[雑誌論文] A definitive haplotype map of structural variation determined by microarray analysis of duplicated haploid genomes2014
- 著者名/発表者名
  Tahira T, Yahara K, Kukita Y, Higasa K, Kato K, Wake N, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Genomics Data
  
  巻: 印刷中ページ: 55-59
- DOI
  10.1016/j.gdata.2014.04.006
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657005
[雑誌論文] Quantitative identification of mutant alleles derived from lung cancer in plasma cell-free DNA via anomaly detection using deep sequencing data2013
- 著者名/発表者名
  Kukita, Y., Uchida, J., Oba, S., Nishino, K., Kumagai, T., Taniguchi, K., Okuyama, T., Imamura, F., Kato, K.
- 雑誌名
  
  PloS one
  
  巻: 8(11)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657005
[雑誌論文] Quantitative identification of mutant alleles derived from lung cancer in plasma cell-free DNA via anomaly detection using deep sequencing data2013
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Uchida J, Oba S, Nishino K, Kumagai T, Taniguchi K, Okuyama T, Imamura F, Kato K
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 8 号: 11 ページ: e81468-e81468
- DOI
  10.1371/journal.pone.0081468
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[雑誌論文] Conversion of a molecular classifier obtained by gene expression profiling into a classifier based on real-time PCR : a prognosis predictor for gliomas.2010
- 著者名/発表者名
  Kawarazaki S, Taniguchi K, Shirahata M, Kukita Y, Kanemoto M, Mikuni N, Hashimoto N, Miyamoto S, Takahashi JA, Kato K.
- 雑誌名
  
  BMC Medical Genomics 3
  
  ページ: 52-52
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[雑誌論文] A definitive haplotype map as determined by genotyping duplicated haploid genomes finds a predominant haplotype preference at copy number variation events.2010
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Yahara K, Tahira T, Higasa K, Sonoda M, Yamamoto K, Kato K, Wake N, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Am.J.Hum.Genet. 86(6)
  
  ページ: 918-928
- NAID
  120002239171
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] A definitive haplotype map as determined by genotyping duplicated haploid genomes finds a predominant haplotype preference at copy number variation events.2010
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et al.
- 雑誌名
  
  Am.J.Hum.Genet.
  
  巻: 86 ページ: 918-928
- NAID
  120002239171
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] A definitive haplotype map as determined by genotyping duplicated haploid genomes finds a predominant haplotype preference at copy-number variation events.2010
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Yahara K, Tahira T, Higasa K, Sonoda M, Yamamoto K, Kato K, Wake N, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  American Journal of Human Genetics 86
  
  ページ: 918-928
- NAID
  120002239171
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[雑誌論文] Impact of group IVA cytosolic phospholipase A2 gene polymorphisms on phenotypic features of patients with familial adenomatous polyposis.2010
- 著者名/発表者名
  Umeno J, Matsumoto T, Esaki M, Kukita Y, Tahira T, Yanaru-Fujisawa R, Nakamura S, Arima H, Hirahashi M, Hayashi K, Iida M.
- 雑誌名
  
  International Journal of Colorectal Disease 25
  
  ページ: 293-301
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[雑誌論文] A definitive haplotype map as determined by genotyping duplicated haploid genomes finds a predominant haplotype preference at copy-number variation events.2010
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et al
- 雑誌名
  
  American Journal of Human Genetics
  
  巻: 86 ページ: 918-928
- NAID
  120002239171
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[雑誌論文] Evaluation of haplotype inference using definitive haplotype data obtained from complete hydatidiform moles, and its significance for the analyses of positively selected regions.2009
- 著者名/発表者名
  Higasa K, Kukita Y, Kato K, Wake N, Tahira T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  PLoS Genetics 5(5)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Evaluation of haplotype inference using definitive haplotype data obtained from complete hydatidiform moles, and its significance for the analyses of positively selected regions.2009
- 著者名/発表者名
  Higasa K, Kukita Y, Kato K, Wake N, Tahira T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  PLoS Genetics 5
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[雑誌論文] Estimation of SNP allele frequencies by SSCP analysis of poolepooleolepooleleNA.2009
- 著者名/発表者名
  Tahira T, Kukita Y, Higasa K, Okazaki Y, Yoshinaga A, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Methods in Molecular Biology 578
  
  ページ: 193-207
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Narrowing the regions of allelic losses of chromosome 1p36 in meningioma tissues by an improved SSCP analysis.2008
- 著者名/発表者名
  Guan Y, Hata N, Kuga D, Yoshimoto K, Mizoguchi M, Shono T, Suzuki S, Tahira T, Kukita Y, Higasa K, Yokoyama N, Nagata S, Iwaki T, Sasaki T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Int.J.Cancer 122(8)
  
  ページ: 1820-1826
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Prevalence of copy number neutral LOH in glioblastomas revealed by genome-wide analysis of laser- microdissected tissues.2008
- 著者名/発表者名
  Kuga D, Mizoguchi M, Guan Y, Hata N, Yoshimoto K, Shono T, Suzuki SO, Kukita Y, Tahira T, Nagata S, Sasaki T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Neuro Oncol 10(6)
  
  ページ: 995-1003
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Prevalence of copy-number neutral LOH in glioblastomas revealed by genomewide analysis of laser-microdissected tissues.2008
- 著者名/発表者名
  Kuga D, Mizoguchi M, Guan Y, Hata N, Yoshimoto K, Shono T, Suzuki SO, Kukita Y, Tahira T, Nagata S, Sasaki T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Neuro Oncology 10
  
  ページ: 995-1003
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[雑誌論文] Narrowing of the regions of allelic losses of chromosome 1p36 in meningioma tissues by an improved SSCP analysis.2008
- 著者名/発表者名
  Guan Y, Hata N, Kuga D, Yoshimoto K, Mizoguchi M, Shono T, Suzuki SO, Tahira T, Kukita Y, Higasa K, Yokoyama N, Nagata S, Iwaki T, Sasaki T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  International Journal of Cancer 122
  
  ページ: 1820-1826
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[雑誌論文] D-HaploDB : a database of definitive haplotypes determined by genotyping complete hydatidiform mole samples.2007
- 著者名/発表者名
  Higasa K, Miyatake K, Kukita Y, Tahira T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res. 35
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Optimization of capillary array electrophoresis single strand conformation polymorphism analysis for routine molecular diagnostics.2006
- 著者名/発表者名
  Jespersgaard C, Larsen LA, Baba S, Kukita Y, Tahira T, Christiansen M, Vuust J, Hayashi K, Andersen PS.
- 雑誌名
  
  Electrophoresis 27(19)
  
  ページ: 3816-3822
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Allelic Losses of Chromosome 10 in Glioma Tissues Detected by Quantitative Single-Strand Conformation Polymorphism Analysis.2006
- 著者名/発表者名
  Hata N, Yoshimoto K, Yokoyama N, Mizoguchi M, Shono T, Guan Y, Tahira T, Kukita Y, Higasa K, Nagata S, Iwaki T, Sasaki T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Clin.Chem 52(3)
  
  ページ: 370-378
- NAID
  120000986935
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] QSNPlite, a software system for quantitative analysis of SNPs based on capillary array SSCP analysis.2006
- 著者名/発表者名
  Tahira T, Okazaki Y, Miura K, Yoshinaga A, Masumoto K, Higasa K, Kukita Y, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Electrophoresis 27(19)
  
  ページ: 3869-3878
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] dbQSNP : a database of SNPs in human promoter regions with allele frequency information determined by single-strand conformation polymorphism- based method.2005
- 著者名/発表者名
  Tahira T, Baba S, Higasa K, Kukita Y, Suzuki Y, Sugano S, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Human Mutation 26(2)
  
  ページ: 69-77
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Genome-wide definitive haplotypes determined using a collection of complete hydatidiform moles2005
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et al.
- 雑誌名
  
  Genome Res. 15
  
  ページ: 1511-1518
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[雑誌論文] Genome-wide definitive haplotypes determined using a collection of complete hydatidiform moles.2005
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Miyatake K, Stokowski R, Hinds D, Higasa K, Wake N, Hirakawa T, Kato H, Matsuda T, Pant K, Cox D, Tahira T, Hayashi K.
- 雑誌名
  
  Genome Res. 15(11)
  
  ページ: 1511-1518
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[学会発表] Detection and analysis of fusion genes from rare tumor cases by targeted RNA sequencing2023
- 著者名/発表者名
  久木田洋児, 中村ハルミ, 竹中聡, 屋木敏也
- 学会等名
  第82回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K09368
[学会発表] Selective detection of somatic mutations in circulating tumor DNA from pancreatic cancer patients by next-generation sequencing and a bioinformatic variant filter2018
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Takada R, Okawa K, Katayama K, Kato K
- 学会等名
  Human Genome Meeting 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[学会発表] Selective detection of somatic mutations in circulating tumor DNA from cancer patients2017
- 著者名/発表者名
  久木田洋児, 高田良司, 大川和良, 片山和宏, 加藤菊也
- 学会等名
  第76回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[学会発表] Non-overlapping integrated reads sequencing system for de novo detection of mutations in circulating tumor DNA（NOIRシーケンスシステムよる癌患者由来血漿DNA中のde novo突然変異検出）2016
- 著者名/発表者名
  久木田洋児, 内田純二, 高田良司, 今村文生, 片山和宏, 加藤菊也
- 学会等名
  第75回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  横浜
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[学会発表] Non-overlapping integrated reads sequencing system (NOIR SeqS) for de novo detection and absolute quantitation of mutations in circulating tumor DNA.2016
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, Matoba R, Uchida J, Takada R, Hamakawa T, Doki Y, Imamura F, Katayama K, Kato K
- 学会等名
  Advances in Genome Biology and Technology 2016
- 発表場所
  アメリカ合衆国オーランド市
- 年月日
  2016-02-12
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[学会発表] DNA分子高精度配列決定及び絶対定量による血中遊離ＤＮＡ中の突然変異検出2016
- 著者名/発表者名
  久木田洋児
- 学会等名
  NGS現場の会血液核酸マーカー分科会第2回研究会
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07157
[学会発表] DNAバーコード技術を使った高精度DNAシーケンシング2015
- 著者名/発表者名
  久木田洋児
- 学会等名
  第20回JBICバイオ関連基盤技術研究会
- 発表場所
  東京都
- 年月日
  2015-07-23
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[学会発表] 次世代シーケンサーを使った癌患者血漿DNA中突然変異検出システムの開発2015
- 著者名/発表者名
  久木田洋児, 内田純二, 的場亮, 今村文生, 加藤菊也
- 学会等名
  NGS現場の会　第四回研究会
- 発表場所
  茨城県つくば市
- 年月日
  2015-07-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[学会発表] Detection of mutations in plasma DNA from cancer patients by high-fidelity target sequencing of individual molecules.2015
- 著者名/発表者名
  久木田洋児, 的場亮, 内田純二, 浜川卓也, 土岐祐一郎, 今村文生, 加藤菊也
- 学会等名
  第74回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  愛知県名古屋市
- 年月日
  2015-10-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[学会発表] 次世代シーケンサーによる肺癌患者血中DNA変異の定量的検出2014
- 著者名/発表者名
  久木田洋児
- 学会等名
  NGS現場の会　血液核酸マーカー分科会
- 発表場所
  東京大学
- 年月日
  2014-05-23
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[学会発表] 日本人ハプロイド試料のゲノムワイド解析により同定された構造多型の機能予測2013
- 著者名/発表者名
  田平知子, 久木田洋児, 矢原耕史, 山本健, 加藤聖子, 和氣徳夫, 林健志
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2013-12-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657005
[学会発表] Structural variations of pharmacogenetic genes detected in haploid genomes of Japanese population2013
- 著者名/発表者名
  田平知子, 久木田洋児, 加藤聖子, 和氣徳夫, 林健志
- 学会等名
  第72回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2013-10-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657005
[学会発表] 日本人ハプロイド試料のゲノムワイド解析により同定された構造多型の機能予測2013
- 著者名/発表者名
  田平知子, 久木田洋児, 矢原耕史, 山本健, 加藤聖子, 和氣徳夫, 林健志
- 学会等名
  第36回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657005
[学会発表] Quantitative detection of mutations in plasma DNA of cancer　patients by use of anomaly detection with deep sequencing2013
- 著者名/発表者名
  久木田洋児、内田純二、大羽成征、西野和美、熊谷融、谷口一也、奥山貴子、二木俊江、今村文生、加藤菊也
- 学会等名
  第72回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  横浜市
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[学会発表] 日本人集団の確定的ハプロタイプ決定とゲノム薬理学への応用2013
- 著者名/発表者名
  田平知子, 久木田洋児, 矢原耕史, 山本健, 加藤聖子, 和気徳夫, 林健志
- 学会等名
  日本薬学会第133年会
- 発表場所
  横浜
- 年月日
  2013-03-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657005
[学会発表] 全エキソン配列解析による同胞がん罹患症例の原因遺伝子変異の探索2010
- 著者名/発表者名
  久木田洋児
- 学会等名
  第33回日本分子生物学会年会第83回日本生化学学会合同大会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2010-12-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[学会発表] SNP/CNV haplotype map determined using complete hydatidiform moles carrying haploid genomes.2009
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et al.
- 学会等名
  Personal Genome, Cold Spring Harbor Laboratory meeting
- 発表場所
  New York, U.S.A.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[学会発表] Detection of human copy number variations using complete hydatidiform moles carrying haploid genomes2008
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et.al.
- 学会等名
  58th Annual Meeting of the American Society of Human Genetic
- 発表場所
  Philadelphia, USA
- 年月日
  2008-11-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[学会発表] Detection of human copy number variations using a collection of complete hydatidiform moles : a strategy of CNV-detection using human haploid genomes2008
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et.al.
- 学会等名
  Cold Spring Harbor Laboratory Meeting " The Biology of Genomes"
- 発表場所
  米国・ニューヨーク
- 年月日
  2008-05-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[学会発表] Detection of human copy number variations using complete hydatidiform moles carrying haploid genomes.2008
- 著者名/発表者名
  Kukita Y.
- 学会等名
  58st Annual Meeting of the American Society of Human Genetics.
- 発表場所
  米国・フィラデルフィア
- 年月日
  2008-11-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[学会発表] Detection of human copy number variations using complete hydatidiform moles carrying haploid genomes2008
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et.al.
- 学会等名
  58st Annual Meeting of the American Society of Humar Genetics
- 発表場所
  米国・フィラデルフィア
- 年月日
  2008-11-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[学会発表] Detection of human copy number variations using a collection of complete hydatidiform moles-A strategy of CNV-detection using human haploid genomes2008
- 著者名/発表者名
  Kukita Y, et.al.
- 学会等名
  2008 Cold Spring Harbor Laboratory Meeting on The Biology of Genomes
- 発表場所
  New York, USA
- 年月日
  2008-05-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[学会発表] Detection of human copy number variations using a collection of complete hydatidiform moles : a strategy of CNV-detection using human haploid genomes.2008
- 著者名/発表者名
  Kukita Y.
- 学会等名
  Cold Spring Harbor Laboratory Meeting "The Biology of Genomes"
- 発表場所
  米国・ニューヨーク
- 年月日
  2008-05-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20681020
[学会発表] Detecton of human copy number variations using a collection of Japanese complete hydatidiform moles2007
- 著者名/発表者名
  Kukita, Y, et. al.
- 学会等名
  The 7th international workshop on advanced genomics
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[学会発表] Detecton of human copy number variations using a collection of Japanese complete hydatidiform moles2007
- 著者名/発表者名
  Kukita, Y, et. al.
- 学会等名
  57th Annual Meeting of the American Society of Human Genetic
- 発表場所
  San Diego, USA
- 年月日
  2007-10-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019051
[学会発表] High-fidelity DNA sequencing of single molecules monitoring errors introduced into barcode sequences
- 著者名/発表者名
  久木田洋児，的場亮，加藤菊也
- 学会等名
  第37回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  横浜市
- 年月日
  2014-11-25 – 2014-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180
[学会発表] A method to trim erroneous barcode-tags for molecular counting of target DNA with massively parallel sequencing
- 著者名/発表者名
  久木田洋児，的場亮，加藤菊也
- 学会等名
  第73回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  横浜市
- 年月日
  2014-09-25 – 2014-09-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25430180

1. 田平知子 (50155230)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 16件
2. 林健志 (00019671)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 17件
3. 中村ハルミ (80164325)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 1件
4. 加藤菊也 (60194809)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 21件
5. 堀内孝彦 (90219212)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 日笠幸一郎 (10419583)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
7. 山本健 (60274528)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
8. 和氣徳夫 (60091584)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
9. 森健太郎 (50397296)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 黒岡尚徳 (00293879)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 吉田研一 (60854502)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 井上徳光

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

久木田 洋児 Kukita Yoji

研究課題

研究成果

共同研究者

分子的肉腫分類のためのRNA発現とDNAメチル化によるクラスタリングの比較検討

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

消化管上皮の発生・分化原理の理解に基づく化生発症メカニズムの解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

エピゲノム解析による新規疾患分類候補肉腫の発生・増殖機序の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ＤＮＡ分子高精度配列決定及び絶対定量技術による血中遊離ＤＮＡ解析システムの開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

家族性及び同胞癌症例ゲノム解析による遺伝性癌原因遺伝子の同定とその応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

日本人ハプロイドゲノムの超並列シークエンス解析による構造多型の完全解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

ハプロイドDNAを用いた日本人ゲノム多様性情報基盤の高度化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

定量的一塩基多型解析技術の開発と医療への応用

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] バイオイノベーションに向けて～バイオテクノロジーの新技術からの新しい視点～2019

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] リキッドバイオプシー―体液中腫瘍マーカーの検出・解析技術―2017

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] SNP ゲノタイピング(総論) 「DNAチップ/マイクロアレイ臨床応用の実際」(油谷浩幸編)2008

著者名/発表者名

出版者

データソース

[雑誌論文] A method for extending target regions of genomic profiling by combining a custom probe pool with a commercial targeted panel2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 膵癌における次世代シーケンサーを用いた血中循環腫瘍DNA検出系―臨床応用の可能性について2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

ISSN

年月日

久木田洋児 Kukita Yoji