小野直亮 ONO Naoaki

研究者番号	60395118
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 奈良先端科学技術大学院大学, データ駆動型サイエンス創造センター, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2025年度: 奈良先端科学技術大学院大学, データ駆動型サイエンス創造センター, 准教授 2017年度 – 2018年度: 奈良先端科学技術大学院大学, データ駆動型サイエンス創造センター, 准教授 2015年度 – 2016年度: 奈良先端科学技術大学院大学, 情報科学研究科, 助教 2011年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 特任准 2009年度 – 2011年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 特任准教授
審査区分/研究分野	研究代表者理工系 / 小区分90130:医用システム関連 / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 生体生命情報学研究代表者以外小区分40020:木質科学関連 / 生物機能・バイオプロセス
キーワード	研究代表者診断支援 / 深層学習 / 医用画像解析 / 膵がん / 免疫染色 / 病理組織画像 / 遺伝子発現解析 / 長期コホート解析 / 腎臓Perfusionモデル / PET画像 … もっと見る / 診断支援モデル / 代謝疾患 / 冠動脈疾患 / 深層学習モデル / PETイメージング / 多種染色法 / 教師なしクラスタリング / 病理組織画像解析 / バイオインフォマティクス / すい癌 / 組織画像検査 / 生体生命情報学 / Deep Neural Network / 変異解析 / 実験室進化 / DNAマイクロアレイ / 数理生物学 / モデル化 / 発現制御 / 遺伝子 / マイクロアレイ … もっと見る研究代表者以外統合ゲノム科学 / 代謝物解析 / 発現遺伝子解析 / 統合ゲノム解析 / ポドフィロトキシン / リグナン / 比増殖速度 / 発現プロファイル / バイオプロダクション / 進化工学 / ストレス耐性 / 変異解析 / DNAマイクロアレイ / ゲノム隠す

Recurrent 3D-UNetを用いたPET時系列からの灌流機能画像の生成研究代表者
- 研究代表者
  
  小野直亮
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2029
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分90130:医用システム関連
- 研究機関
  奈良先端科学技術大学院大学
統合ゲノム解析に基づく抗腫瘍性リグナン生合成機構の解明
- 研究代表者
  
  梅澤俊明
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分40020:木質科学関連
- 研究機関
  京都大学
分散学習ネットワークモデルを用いた病理組織画像の特徴抽出の最適化研究代表者
- 研究代表者
  
  小野直亮
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  奈良先端科学技術大学院大学
PETを用いた代謝疾患の動態解析のための統計モデルの開発研究代表者
- 研究代表者
  
  小野直亮
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2026
- 研究種目
  
  国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B))
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  奈良先端科学技術大学院大学
深層学習を用いたすい癌の病理組織画像からの細胞タイプ識別モデルの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  小野直亮
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2018
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  奈良先端科学技術大学院大学
遺伝子発現情報のクラスタリングにもとづいた肺がん組織病理画像の特徴抽出研究代表者
- 研究代表者
  
  小野直亮
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2016
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  奈良先端科学技術大学院大学
全ゲノム一塩基レベル変異解析に基づくストレス耐性細胞の創製
- 研究代表者
  
  清水浩
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2011
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生物機能・バイオプロセス
- 研究機関
  大阪大学
遺伝子型、発現型の網羅的解析に基づく遺伝子制御機構の進化的シミュレーション研究代表者
- 研究代表者
  
  小野直亮
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2010
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  大阪大学

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すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Quantitative evaluation model of variable diagnosis for chest X-ray images using deep learning2024
- 著者名/発表者名
  Nakagawa Shota、Ono Naoaki、Hakamata Yukichika、Ishii Takashi、Saito Akira、Yanagimoto Shintaro、Kanaya Shigehiko
- 雑誌名
  
  PLOS Digital Health
  
  巻: 3 号: 3 ページ: e0000460-e0000460
- DOI
  10.1371/journal.pdig.0000460
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21KK0183, KAKENHI-PROJECT-22K08277, KAKENHI-PROJECT-21K12111
[雑誌論文] Two O-methyltransferases from Phylogenetically Unrelated Cow Parsley (Anthriscus sylvestris) and Hinoki-asunaro (Thujopsis dolabrata var. hondae) as a Signature of Lineage-specific Evolution in Lignan Biosynthesis2023
- 著者名/発表者名
  Masaomi Yamamura, Masato Kumatani, Akira Shiraishi, Yu Matsuura, Keisuke Kobayashi, Ayano Suzuki, Atsushi Kawamura, Honoo Satake, Safendrri Komara Ragamustari, Shiro Suzuki, Hideyuki Suzuki, Daisuke Shibata, Shingo Kawai, Eiichiro Ono, Toshiaki Umezawa
- 雑誌名
  
  Plant and Cell Physiology
  
  巻: 64 号: 1 ページ: 124-147
- DOI
  10.1093/pcp/pcac164
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23671, KAKENHI-PROJECT-23K23921
[雑誌論文] <i>Anthriscus sylvestris</i> Deoxypodophyllotoxin Synthase Involved in?the Podophyllotoxin Biosynthesis2023
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Keisuke、Yamamura Masaomi、Mikami Bunzo、Shiraishi Akira、Kumatani Masato、Satake Honoo、Ono Eiichiro、Umezawa Toshiaki
- 雑誌名
  
  Plant And Cell Physiology
  
  巻: 64 号: 12 ページ: 1436-1448
- DOI
  10.1093/pcp/pcad103
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K23671, KAKENHI-PROJECT-23K23921
[雑誌論文] Information maximization-based clustering of histopathology images using deep learning2023
- 著者名/発表者名
  MI Rumman, N Ono, K Ohuchida, MD Altaf-Ul-Amin, M Huang, S Kanaya
- 雑誌名
  
  PLOS Digital Health
  
  巻: 2 号: 12 ページ: e0000391-e0000391
- DOI
  10.1371/journal.pdig.0000391
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K05739, KAKENHI-PROJECT-21K12111
[雑誌論文] Classification of ischemia from myocardial polar maps in 15O?H2O cardiac perfusion imaging using a convolutional neural network2022
- 著者名/発表者名
  Teuho Jarmo、Schultz Jussi、Kl?n Riku、Knuuti Juhani、Saraste Antti、Ono Naoaki、Kanaya Shigehiko
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 2839-2839
- DOI
  10.1038/s41598-022-06604-x
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21KK0183, KAKENHI-PROJECT-22KF0261
[雑誌論文] Classification of lung adenocarcinoma transcriptome subtypes from pathological images using deep convolutional networks2018
- 著者名/発表者名
  3.Antonio, V. A. A., Ono, N., Saito, A., Sato, T., Altaf-Ul-Amin, M., & Kanaya, S.
- 雑誌名
  
  International journal of computer assisted radiology and surgery
  
  巻: 13(12) 号: 12 ページ: 1905-1913
- DOI
  10.1007/s11548-018-1835-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K00406, KAKENHI-PROJECT-18K08170, KAKENHI-PUBLICLY-17H05297
[雑誌論文] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2011
- 著者名/発表者名
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 11 ページ: 579-579
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Transition from positive to neutral in mutation fixation along with continuing rising fitness in thermal adaptive evolution.2010
- 著者名/発表者名
  Toshihiko Kishimoto, Leo Iijima, Makoto Tatsumi, Naoaki Ono, Ayana Oyake, Tomomi Hashimoto, Moe Matsuo, Masato Okubo, Shingo Suzuki, Kotaro Mori, Akiko Kashiwagi, Chikara Furusawa, Bei-Wen Ying, Tetsuya Yomo
- 雑誌名
  
  PLoS Genet Vol.6, No.10
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress.2010
- 著者名/発表者名
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics Vol.11
  
  ページ: 579-579
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2010
- 著者名/発表者名
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 579-579
- DOI
  10.1186/1471-2164-11-579
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[雑誌論文] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays2009
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono
- 雑誌名
  
  Proc.of Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioChEC'09)
- NAID
  210000003657
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Development of a thermodynamic model to predict hybridization on high-density oligonucleotide microarray.2009
- 著者名/発表者名
  Ono, N., Suzuki, S., Furusawa, C., Shimizu, H., Yomo, T.
- 雑誌名
  
  Proc. of the International Symposium on Complex Systems Biology
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Genome-wide mutational and expression analysis of evolved Escherichia coli strains under ethanol stress.2009
- 著者名/発表者名
  Horinouchi, T., Tamaoka, K., Furusawa, C., Hirasawa, T., Ono, N., Suzuki, S., Yomo, T., Shimizu, H.
- 雑誌名
  
  Proc. of the 20th International Conference on Genome Informatics (GIW 2009)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Model-based analysis of non-specific binding for background correction of high-density oligonucleotide microarrays.2009
- 著者名/発表者名
  Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Tomoharu Agata, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
- 雑誌名
  
  Bioinfromatics Vol.25, No.1
  
  ページ: 36-41
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Genome-wide mutational and expression analysis of ethanol-tolerant Escherichia coli.2009
- 著者名/発表者名
  Horinouchi, T., Tamaoka, K., Furusawa, C., Hirasawa, T., Ono, N., Suzuki, S., Yomo, T., Shimizu, H.
- 雑誌名
  
  Proc. of the International Symposium on Complex Systems Biology
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays.2009
- 著者名/発表者名
  Ono, N., Suzuki, S., Furusawa, C., Shimizu, H., Yomo, T.
- 雑誌名
  
  Proc. of Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009 (APBioChEC' 09)
- NAID
  210000003657
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[雑誌論文] Development of a thermodynamic model to predict hybridization on high-density oligonucleotide microarray2009
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono
- 雑誌名
  
  Proc.of the International Symposium on Complex Systems Biology
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] Feature Extraction and Unsupervised Clustering of Histopathological Images of Pancreatic Cancer Using Information Maximization2022
- 著者名/発表者名
  Rumman Mahfujul Islam、Ono Naoaki、Ohuchida Kenoki、Altaf-Ul-Amin Md.、Huang Ming、Kanaya Shigehiko
- 学会等名
  2022 IEEE 11th Global Conference on Consumer Electronics (GCCE)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K12111
[学会発表] Straightforward Clustering for Morphological-Level Pancreatic Carcinoma Identification2022
- 著者名/発表者名
  Guangxian Zhu, Zheng Chen, Kenoki Ohuchida, Ming Huang, Naoaki Ono, MD. Amin, and Shigehiko Kanaya
- 学会等名
  Engineering in Medicine and Biology Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K12111
[学会発表] 深層学習を用いたすい癌の病理組織画像からの細胞タイプ識別モデルの構築2018
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  「多元計算解剖学」第４回国際シンポジウムについて
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05297
[学会発表] Feature extraction and Cluster analysis of Pancreatic Pathological Image Based on Unsupervised Convolutional Neural Network2018
- 著者名/発表者名
  Konosuke Asano, Naoaki Ono, Chika Iwamoto, Kenoki Ohuchida, Koji Shindo, Shigehiko Kanaya
- 学会等名
  BIBM 2018 : 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-17H05297
[学会発表] Implementation of Stacked Convolutional Neural Networks for the Classification of Lung Adenocarcinoma Transcriptome Subtypes2017
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono
- 学会等名
  The International Forum on Medical Imaging in Asia (IFMIA) 2017
- 発表場所
  Tenbusu Naha, Naha, Okinawa
- 年月日
  2017-01-19
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H01123
[学会発表] Feature Extraction of Lung Cancer Pathological Images Using Convolutional Autoencoder2017
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono
- 学会等名
  The 3rd International Symposium on Multi-disciplinary Computational Anatomy
- 発表場所
  Nara Prefectural Cultural Center, Nara
- 年月日
  2017-03-08
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H01123
[学会発表] 畳み込みニューラルネットワークを用いた肺がん病理画像の高効率自己符号化の実装2016
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  医用画像工学会
- 発表場所
  千葉大学、千葉
- 年月日
  2016-07-21
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H01123
[学会発表] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  化学工学会第76年会
- 発表場所
  東京農工大学
- 年月日
  2011-03-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- 学会等名
  化学工学会第76年会
- 発表場所
  東京農工大学
- 年月日
  2011-03-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains under Ethanol Stress2011
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono, Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo Hiroshi Shimizu
- 学会等名
  Asian Congress on Biotechnology(ACB-2011)
- 発表場所
  Shanghai, China
- 年月日
  2011-05-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] illuminaを用いた大腸菌全ゲノムリシーケンシング2011
- 著者名/発表者名
  小野直亮, Roche, SOLiD
- 学会等名
  NGS(次世代シークエンサ)現場の会第1回研究会
- 発表場所
  熱海ニューフジヤホテル,静岡県
- 年月日
  2011-05-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains under Ethanol Stress2011
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono
- 学会等名
  Asian Congress on Biotechnology (ACB-2011)
- 発表場所
  Shanghai Everbright Convention & Exhibition Centre (SECEC), Shanghai (China)
- 年月日
  2011-05-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] エタノールストレス環境下の進化実験により得られた大腸菌のゲノムワイドな変異解析と遺伝子発現解2011
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  化学工学会第43回秋季大会
- 発表場所
  名古屋工業大学
- 年月日
  2011-09-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 大腸菌エタノール耐性進化株の次世代シーケンサを用いた全ゲノム解析2011
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  第64回日本生物工学会大会
- 発表場所
  東京農工大学
- 年月日
  2011-09-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 大腸菌エタノール耐性進化株の次世代シーケンサを用いた全ゲノム解析2011
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  第64回日本生物工学会大会
- 発表場所
  東京農工大学(東京都)
- 年月日
  2011-09-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] Roche, SOLiD, illuminaを用いた大腸菌全ゲノムリシーケンシング2011
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  NGS(次世代シークエンサ)現場の会第1回研究会
- 発表場所
  熱海ニューフジヤホテル(静岡県)
- 年月日
  2011-05-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] Whole genome resequencing of experimentally evolved Escherichia coli using a next generation sequencer2011
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  日本生物物理学会第49回年会
- 発表場所
  兵庫県立大学(兵庫県)
- 年月日
  2011-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] Whole genome resequencing of experimentally evolved Escherichia coli using a next generation sequencer2011
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  日本生物物理学会第49回年会
- 発表場所
  兵庫県立大学
- 年月日
  2011-09-16
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
- 発表場所
  神戸ポートピアアイランド,兵庫県
- 年月日
  2010-12-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- 学会等名
  第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2010-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- 学会等名
  化学工学会第76年会
- 発表場所
  東京農工大学
- 年月日
  2010-03-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所
- 年月日
  2010-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の全ゲノム変異解析・遺伝子発現解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  定量生物学の会第二回年会
- 年月日
  2010-01-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  第62回日本生物工学会大会
- 発表場所
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット、宮崎県
- 年月日
  2010-10-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也, 小野直亮
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所
- 年月日
  2010-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 人工進化実験によって得られたエタノール耐性大腸菌株の網羅的遺伝子発現解析とゲノム異変解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- 年月日
  2010-10-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  第62回日本生物工学会大会
- 発表場所
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明、玉岡邦康、古澤力、小野直亮、鈴木真吾、平沢敬、四方哲也、清水浩
- 学会等名
  第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
- 発表場所
  神戸ポートアイランド
- 年月日
  2010-12-04
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 複数時間スケールを持つ環境適応ダイナミクス:エタノールストレス環境下での大腸菌人工進化実験における網羅的表現型/遺伝子型解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  第48回生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 高密度オリゴヌクレオチドアレイにおけるハイブリダイゼーションの熱力学モデルを用いた発現解析および変異解析アルゴリズムの開発2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  定量生物学の会第二回年会
- 発表場所
  大阪大学
- 年月日
  2010-01-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所
- 年月日
  2010-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所
- 年月日
  2010-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の全ゲノム変異解析・遺伝子発現解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  定量生物学の会第二回年会
- 発表場所
  大阪大学
- 年月日
  2010-01-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  第62回日本生物工学会大会
- 発表場所
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- 年月日
  2010-10-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 人工進化実験によって得られたエタノール耐性大腸菌株の網羅的遺伝子発現解析とゲノム異変解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  第62回日本生物工学会大会
- 発表場所
  宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所、東京都
- 年月日
  2010-11-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 高密度オリゴヌクレオチドアレイにおけるハイブリダイゼーションの熱力学モデルを用いた発現解析および変異解析アルゴリズムの開発2010
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  定量生物学の会第二回年会
- 年月日
  2010-01-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬,小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学生産技術研究所
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 複数時間スケールを持つ環境適応ダイナミクス:エタノールストレス環境下での大腸菌人工進化実験における網羅的表現型/遺伝子型解析2010
- 著者名/発表者名
  堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  第48回生物物理学会年会
- 発表場所
  東北大学
- 年月日
  2010-09-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] タイリングアレイを用いたエタノール耐性大腸菌株のゲノム変異解析2009
- 著者名/発表者名
  玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  第61回日本生物工学会大会
- 発表場所
  名古屋大学
- 年月日
  2009-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] 次世代シーケンサにおけるメイトベアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  第47回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  アスティ徳島
- 年月日
  2009-11-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 次世代シーケンサにおけるメイトペアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  第47回生物物理学会年会
- 発表場所
  徳島文理大学
- 年月日
  2009-11-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] タイリングアレイを用いたエタノール耐性大腸菌株のゲノム変異解析2009
- 著者名/発表者名
  玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  第61回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays2009
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
- 学会等名
  Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioChEC' 09)
- 発表場所
  Kobe, Japan
- 年月日
  2009-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- 著者名/発表者名
  小野直亮、鈴木真吾、古澤力、清水浩、四方哲也
- 学会等名
  第61回日本生物工学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] エタノール耐性大腸菌株のタイリングアレイを用いたゲノムワイド変異解析2009
- 著者名/発表者名
  玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
- 学会等名
  生物工学若手研究者の集い夏のセミナー2009
- 発表場所
  コミュニティ嵯峨野
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] 次世代シーケンサにおけるメイトペアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  第47回日本生物物理学会年会
- 年月日
  2009-11-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains Under Ethanol Stress2009
- 著者名/発表者名
  Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu
- 学会等名
  The 20th International Conference on Genome Informatics(GIW 2009)
- 発表場所
  Yokohama, Japan
- 年月日
  2009-12-14
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] メイトペア情報に基づいてた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  日本生物工学会第61回大会
- 発表場所
  名古屋大学
- 年月日
  2009-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- 著者名/発表者名
  小野直亮
- 学会等名
  第61回日本生物工学会大会
- 発表場所
  名古屋大学
- 年月日
  2009-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324
[学会発表] A model-based analysis method for detection of single-bace substitution using resequencing microarrays2009
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono
- 学会等名
  Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioCHEC'09)
- 発表場所
  神戸国際会議場
- 年月日
  2009-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009
- 著者名/発表者名
  小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
- 学会等名
  第61回日本生物工学会大会
- 発表場所
  名古屋大学
- 年月日
  2009-09-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21360401
[学会発表] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays.2009
- 著者名/発表者名
  Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
- 学会等名
  Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009 (APBioChEC'09)
- 発表場所
  Kobe International Conference Center Port Island, Kobe, Japan.
- 年月日
  2009-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21700324

1. 清水浩 (00226250)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 18件
2. 古澤力 (00372631)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 18件
3. 平沢敬 (20407125)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 13件
4. 大内田研宙 (20452708)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
5. 飯田秀博 (30322720)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 下地佐恵香 (50791563)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 梅澤俊明 (80151926)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
8. 山村正臣 (00948367)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
9. 飛松裕基 (20734221)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 金谷重彦 (90224584)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. AMIN MD.ALTAFUL

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

小野 直亮 ONO Naoaki

研究課題

研究成果

共同研究者

Recurrent 3D-UNetを用いたPET時系列からの灌流機能画像の生成研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

統合ゲノム解析に基づく抗腫瘍性リグナン生合成機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

分散学習ネットワークモデルを用いた病理組織画像の特徴抽出の最適化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

PETを用いた代謝疾患の動態解析のための統計モデルの開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

深層学習を用いたすい癌の病理組織画像からの細胞タイプ識別モデルの構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

遺伝子発現情報のクラスタリングにもとづいた肺がん組織病理画像の特徴抽出研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

全ゲノム一塩基レベル変異解析に基づくストレス耐性細胞の創製

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

遺伝子型、発現型の網羅的解析に基づく遺伝子制御機構の進化的シミュレーション研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Quantitative evaluation model of variable diagnosis for chest X-ray images using deep learning2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Two O-methyltransferases from Phylogenetically Unrelated Cow Parsley (Anthriscus sylvestris) and Hinoki-asunaro (Thujopsis dolabrata var. hondae) as a Signature of Lineage-specific Evolution in Lignan Biosynthesis2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] <i>Anthriscus sylvestris</i> Deoxypodophyllotoxin Synthase Involved in?the Podophyllotoxin Biosynthesis2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Information maximization-based clustering of histopathology images using deep learning2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Classification of ischemia from myocardial polar maps in 15O?H2O cardiac perfusion imaging using a convolutional neural network2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Classification of lung adenocarcinoma transcriptome subtypes from pathological images using deep convolutional networks2018

著者名/発表者名

雑誌名

小野直亮 ONO Naoaki