小倉淳 Ogura Atsushi

研究者番号	60465929
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-5610-9940
所属 (現在)	2025年度: 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2025年度: 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授 2018年度 – 2023年度: 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 教授 2015年度 – 2018年度: 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 2014年度: 長浜バイオ大学, 公私立大学の部局等, 准教授 2013年度 – 2014年度: 長浜バイオ大学, コンピュータバイオサイエンス学科, 准教授 … もっと見る 2013年度: 長浜バイオ大学, バイオサイエンス学部, 准教授 2012年度: 徳島大学, 学内共同利用施設等, 講師 2012年度: 徳島大学, 疾患プロテオゲノム研究センター, 講師 2009年度: お茶の水女子大学, お茶大アカデミックプロダクション, 特任助教隠す
審査区分/研究分野	研究代表者中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野 / 遺伝・ゲノム動態研究代表者以外小区分60080:データベース関連 / 小区分45030:多様性生物学および分類学関連 / 生物多様性・分類 / 環境影響評価 / 複合領域 / 森林科学 / 動物生理・行動 / 生物系
キーワード	研究代表者進化 / ゾウリムシ / クロレラ / 共生 / 遺伝子伝播 / ゲノム / 遺伝子移行 / 藻類 / 巨大ウイルス / 次世代シーケンス … もっと見る / 比較トランスクリプトーム / 眼の多様性 / トランスクリプトーム / 眼 … もっと見る研究代表者以外ゲノム / 細胞内共生 / 藻類 / 繊毛虫 / ブナ / 進化 / グラフ分析 / 遺伝子相関ネットワーク / ランキング変動 / 二次共生 / 原生動物 / クロレラ / 植物化 / トランスクリプトーム / ゲノミクス / 遺伝子発現 / ブナ林 / 環境影響評価 / データベース / ランキング再計算 / ランキング / 単一細胞遺伝子発現データ / サラマンダーアルジー / 進化・多様性 / Pediludiella daitoensis / Stentor pyriformis / ラッパムシ / ミドリゾウリムシ / 光合成亢進 / 遺伝子発現解析 / 人工知能 / プロテオミクス / 葉緑体リボソーム / 光合成 / プロテオーム / 衰退兆候 / クラスタリング / 細胞マーカー遺伝子 / 細胞系譜 / 単一細胞トランスクリプトーム解析 / 細胞社会モデル / 状態遷移マーカー遺伝子探索 / 炎症モデル構築 / 体細胞変異 / マーカー遺伝子探索 / 細胞系譜再構築 / NGSデータ解析 / 炎症細胞の遷移 / 単一細胞トランスクリプトーム / 盗葉緑体 / ゲノム進化 / 共生 / ズークロレラ / 継続的共生 / 共生藻 / 機能注釈 / リファレンスゲノム / ブナ（Fagus crenata) / ブナ（Fagus crenata） / ゲノムアセンブリ / 次世代シーケンス / DNA-seq / RNA-seq / ドラフトゲノム / 機能ゲノム学 / 環境ゲノミクス / 進化学 / 感覚系 / 化学受容 / 海洋動物 / 脳 / 深海 / 極限環境 / 熱水噴出孔 / 神経系 / 熱水動物 / アノテーション / 表現型 / 疾患情報モデル / 情報生物学 / 脳・神経系 / 疾患情報隠す

変遷するネットワークにおけるランキング追跡と変動要因の関係の解明
- 研究代表者
  
  浅野泰仁
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2027
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分60080:データベース関連
- 研究機関
  東洋大学
藻類共生型原生動物の多様性・生態的意義の探求と進化に関する研究
- 研究代表者
  
  保科亮
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分45030:多様性生物学および分類学関連
- 研究機関
  長浜バイオ大学
時系列ネットワークにおけるランキング変動要因推定と炎症進行分析への応用
- 研究代表者
  
  浅野泰仁
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分60080:データベース関連
- 研究機関
  東洋大学
巨大ウイルスのクロレラへの全ゲノム挿入とクロレラ-ミドリゾウリムシ共生進化機構研究代表者
- 研究代表者
  
  小倉淳
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分45:個体レベルから集団レベルの生物学と人類学およびその関連分野
- 研究機関
  長浜バイオ大学
藻類と原生動物における細胞内共生形態の解明
- 研究代表者
  
  保科亮
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分45030:多様性生物学および分類学関連
- 研究機関
  長浜バイオ大学
単一細胞シークエンスデータに基づく細胞社会学のための情報手法の開発とデータ解析
- 研究代表者
  
  池尾一穂
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
ゲノム動態解析に基づくブナ林の衰退兆候の評価法
- 研究代表者
  
  齋藤秀之
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  環境影響評価
- 研究機関
  北海道大学
多数の藻類を細胞内共生させる原生動物における共生形態の多様性と進化に関する研究
- 研究代表者
  
  保科亮
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生物多様性・分類
- 研究機関
  長浜バイオ大学
ゲノム網羅的な発現遺伝子を指標にしたブナ林の環境影響評価
- 研究代表者
  
  齋藤秀之
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  環境影響評価
- 研究機関
  北海道大学
樹木の機能ゲノム学の創出に向けたブナ目のリファレンス・ゲノム構築法
- 研究代表者
  
  齋藤秀之
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2015
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  森林科学
- 研究機関
  北海道大学
繊毛虫類における細胞内共生藻の多様性と共生藻選択に関する研究
- 研究代表者
  
  保科亮
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生物多様性・分類
- 研究機関
  長浜バイオ大学
極限還元環境における化学認識機構の進化多様性に関する研究
- 研究代表者
  
  滋野修一
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  動物生理・行動
- 研究機関
  独立行政法人海洋研究開発機構
眼形態多様性を生み出す遺伝子発現ネットワークの分子進化研究代表者
- 研究代表者
  
  小倉淳
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2013
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  遺伝・ゲノム動態
- 研究機関
  長浜バイオ大学
   徳島大学
病態のシステム的理解と疾患情報モデルの構築
- 研究代表者
  
  五條堀孝
- 研究期間 (年度)
  2005 – 2009
- 研究種目
  
  特定領域研究
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  国立遺伝学研究所

[図書] Metatranscriptome"Genome Analysis : Current Procedures and Applications2014
- 著者名/発表者名
  Ogura A
- 出版者
  Horizon press (ISBN : 978-1-908230-29-4)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[図書] Genome Analysis: Current Procedures and Applications2014
- 著者名/発表者名
  Ogura A
- 総ページ数
  374
- 出版者
  Horizon press
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[図書] 頭足類の比較ゲノムプラットフォームの展望2013
- 著者名/発表者名
  小倉淳
- 総ページ数
  7
- 出版者
  比較生理生化学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[図書] 頭足類の比較ゲノムプラットフォームの展望, 比較生理生化学会誌2013
- 著者名/発表者名
  小倉淳
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Single-Cell Transcriptome Profiling of Pancreatic Islets From Early Diabetic Mice Identifies Anxa10 for Ca2+ Allostasis Toward β-Cell Failure2023
- 著者名/発表者名
  Motomura K, Matsuzaka T, Shichino S, Ogawa T, Pan H, Nakajima T, Asano Y, Okayama T, Takeuchi T, Ohno H, Han SI, Miyamoto T, Takeuchi Y, Sekiya M, Sone H, Yahagi N, Nakagawa Y, Oda T, Ueha S, Ikeo K, Ogura A, Matsushima K, Shimano H.
- 雑誌名
  
  Diabetes
  
  巻: 73 号: 1 ページ: 75-92
- DOI
  10.2337/db23-0212
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K18444, KAKENHI-PROJECT-22K12043, KAKENHI-PROJECT-22K17769, KAKENHI-PLANNED-22H05064, KAKENHI-PROJECT-22H00474, KAKENHI-PROJECT-21H03371, KAKENHI-PROJECT-23K23562
[雑誌論文] Current trends in RNA virus detection through metatranscriptome sequencing data2023
- 著者名/発表者名
  Nakagawa So、Sakaguchi Shoichi、Ogura Atsushi、Mineta Katsuhiko、Endo Toshinori、Suzuki Yoshiyuki、Gojobori Takashi
- 雑誌名
  
  FEBS Open Bio
  
  巻: accepted 号: 6 ページ: 992-1000
- DOI
  10.1002/2211-5463.13626
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21452, KAKENHI-PROJECT-22K14999
[雑誌論文] A novel ND1 mitochondrial DNA mutation is maternally inherited in growth hormone transgenesis in amago salmon (Oncorhynchus masou ishikawae)2022
- 著者名/発表者名
  Tomohiko Sato, Naoko Goto-Inoue, Masaya Kimishima, Jike Toyoharu, Ryuhei Minei, Atsushi Ogura, Hiroyuki Nagoya, Tsukasa Mori
- 雑誌名
  
  Scientific Report
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 1-14
- DOI
  10.1038/s41598-022-10521-4
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H03864, KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] Genomics and effective trait candidates of edible insects2022
- 著者名/発表者名
  Nakajima Yuichi、Ogura Atsushi
- 雑誌名
  
  Food Bioscience
  
  巻: 48 ページ: 101793-101793
- DOI
  10.1016/j.fbio.2022.101793
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] The draft genome sequence of the Brahminy blindsnake Indotyphlops braminus2022
- 著者名/発表者名
  Khedkar Gulab、Kambayashi Chiaki、Tabata Hiromasa、Takemura Ikuyo、Minei Ryuhei、Ogura Atsushi、Kurabayashi Atsushi
- 雑誌名
  
  Scientific Data
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 1-7
- DOI
  10.1038/s41597-022-01530-z
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20J22729, KAKENHI-PROJECT-20K21452, KAKENHI-PROJECT-18H02497
[雑誌論文] Whole-genome resequencing of large yellow croaker (Larimichthys crocea) reveals the population structure and signatures of environmental adaptation2021
- 著者名/発表者名
  Kon Tetsuo、Pei Liyi、Ichikawa Ryota、Chen Chunyan、Wang Ping、Takemura Ikuyo、Ye Yingying、Yan Xiaojun、Guo Baoying、Li Weiye、Lauden Hagai Nsobi、Tabata Hiromasa、Pan Hao、Omori Yoshihiro、Ogura Atsushi、Jiang Lihua
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 11235-11235
- DOI
  10.1038/s41598-021-90645-1
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03420, KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] Whole-genome sequencing of endangered Zhoushan cattle suggests its origin and the association of MC1R with black coat colour2021
- 著者名/発表者名
  Jiang Lihua、Kon Tetsuo、Chen Chunyan、Ichikawa Ryota、Zheng Qiyuan、Pei Liyi、Takemura Ikuyo、Nsobi Lauden Hagai、Tabata Hiromasa、Pan Hao、Omori Yoshihiro、Ogura Atsushi
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 17359-17359
- DOI
  10.1038/s41598-021-96896-2
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03420, KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] Enrichment of Uncommon Bacteria in Soil by Fractionation Using a Metal Mesh Device2021
- 著者名/発表者名
  KAMBA Seiji、OGURA Atsushi、MIURA Yoshiko、HASEGAWA Makoto
- 雑誌名
  
  Analytical Sciences
  
  巻: 37 号: 9 ページ: 1295-1300
- DOI
  10.2116/analsci.21P042
- NAID
  130008087322
- ISSN
  0910-6340, 1348-2246
- 年月日
  2021-09-10
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05739, KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] Time-Series Analysis of Gene Correlation Networks based on Single-Cell Transcriptome Data2021
- 著者名/発表者名
  Asano Yasuhito、Ogawa Tatsuro、Shichino Shigeyuki、Ueha Satoshi、Matsushima Koji、Ogura Atsushi
- 雑誌名
  
  2021 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM)
  
  巻: - ページ: 2134-2141
- DOI
  10.1109/bibm52615.2021.9669412
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-17H06391, KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] A novel circular ssDNA virus of the phylum Cressdnaviricota discovered in metagenomic data from otter clams (Lutraria rhynchaena)2020
- 著者名/発表者名
  Kim Oanh T. P.、Kagaya Yuki、Tran Hoang S.、Minei Ryuhei、Tran Trang T. H.、Duong Ha T. T.、Le Binh T. N.、Dang Lua T.、Kinoshita Kengo、Ogura Atsushi、Yura Kei
- 雑誌名
  
  Archives of Virology
  
  巻: 165 号: 12 ページ: 2921-2926
- DOI
  10.1007/s00705-020-04819-9
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21452, KAKENHI-PROJECT-19J15617
[雑誌論文] Molecular Characterization and Evolution Analysis of Two Forms of TLR5 and TLR13 Genes Base on Larimichthys crocea Genome Data2020
- 著者名/発表者名
  Jiang Lihua、Pei Liyi、Wang Ping、Liu Liqin、Li Gong、Liu Binjian、L Zhenming、Hiromasa Tabata、Pan Hao、Ogura Atsushi
- 雑誌名
  
  International Journal of Genomics
  
  巻: 2020 ページ: 1-17
- DOI
  10.1155/2020/4895037
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] Genomic and Transcriptomic Analyses of Bioluminescence Genes in the Enope Squid Watasenia scintillans2020
- 著者名/発表者名
  Yoshida Masa-aki、Imoto Junichi、Kawai Yuri、Funahashi Satomi、Minei Ryuhei、Akizuki Yuki、Ogura Atsushi、Nakabayashi Kazuhiko、Yura Kei、Ikeo Kazuho
- 雑誌名
  
  Marine Biotechnology
  
  巻: 22 号: 6 ページ: 760-771
- DOI
  10.1007/s10126-020-10001-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21452, KAKENHI-PROJECT-19H03200, KAKENHI-PROJECT-19J15617
[雑誌論文] Diversity of Light Sensing Molecules and Their Expression During the Embryogenesis of the Cuttlefish (Sepia officinalis)2020
- 著者名/発表者名
  Bonad Morgane、Ogura Atsushi、Corre Erwan、Bassaglia Yann、Bonnaud-Ponticelli Laure
- 雑誌名
  
  Frontiers in Physiology
  
  巻: 11
- DOI
  10.3389/fphys.2020.521989
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21452
[雑誌論文] The increased frequency of methicillin-resistant Staphylococcus aureus with low MIC of beta-lactam antibiotics isolated from hospitalized patients2020
- 著者名/発表者名
  Iwata Y、Sakai N、Yoneda I、Satou K、Furuichi K、Senda Y、Sakai-Takemori Y、Wada T、Fujita S、Ogura H、Sato K、Minami T、Yamaguchi K、Kitajima S、Toyama T、Yamamura Y、Miyagawa T、Hara A、Shimizu M、Sakai Y、Ikeo K、Shichino S、Ueha S、Nakajima T、Matsushima K、Wada T
- 雑誌名
  
  Journal of Infection and Chemotherapy
  
  巻: 26 号: 6 ページ: 604-610
- DOI
  10.1016/j.jiac.2020.01.016
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-17H06392, KAKENHI-PLANNED-17H06399, KAKENHI-ORGANIZER-17H06391, KAKENHI-PLANNED-17H06394, KAKENHI-PROJECT-20K08605
[雑誌論文] Specific features of fibrotic lung fibroblasts highly sensitive to fibrotic processes mediated via TGF-β-ERK5 interaction.2019
- 著者名/発表者名
  Kadoya K, Togo S, Tulafu M, Namba Y, Iwai M, Watanabe J, Okabe T, Jin J, Kodama Y, Kitamura H, Ogura T, Kitamura N, Ikeo K, Takeda T, Kondo N, Takahashi K.
- 雑誌名
  
  Cell Physiol Biochem
  
  巻: 52 号: 4 ページ: 822-837
- DOI
  10.33594/000000057
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K10653, KAKENHI-PLANNED-17H06399
[雑誌論文] De novo assembly of middle-sized genome using MinION and Illumina sequencers2018
- 著者名/発表者名
  Minei Ryuhei、Hoshina Ryo、Ogura Atsushi
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 19 号: 1
- DOI
  10.1186/s12864-018-5067-1
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[雑誌論文] Cephalopod eye evolution was modulated by the acquisition of Pax-6 splicing variants2014
- 著者名/発表者名
  Yoshida M., Yura K., Ogura A.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 4 ページ: 4256-4256
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Sensing deep extreme environments: the receptor cell types, brain centers, and multi-layer neural packaging of hydrothermal vent endemic worms2014
- 著者名/発表者名
  Shigeno S., Ogura A., Mori T., Toyohara H., Yoshida T., Tsuchida S., Fujikura K.
- 雑誌名
  
  Frontiers in Zoology
  
  巻: 11:82 号: 1
- DOI
  10.1186/s12983-014-0082-9
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657058
[雑誌論文] The complete mitochondrial genome of the pygmy squid, Idiosepius (Cephalopoda : Decapodiformes): the first representative from the family Idiosepiidae2014
- 著者名/発表者名
  Hall NE., Hanzak J., Allcock AL., Cooke IR., Ogura A., Strugnell JM.
- 雑誌名
  
  Mitochondrial DNA
  
  ページ: 1940-1736
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Cephalopod eye evolution was modulated by the acquisition of Pax-6 splicing variants2014
- 著者名/発表者名
  Yoshida MA, Yura K, Ogura A.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 4256-4256
- DOI
  10.1038/srep04256
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J05107, KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Integrative omics analysis reveals differentially dist ibuted proteins in dimorphic euspermatozoa of the squid, Loligo bleekeri2014
- 著者名/発表者名
  Yoshida M., Yamada L , Ochi H., Iwata Y., Tamura-Nakano M., Sawada H., Sauer W.H.H., Ogura A., Hirohashi N.
- 雑誌名
  
  BBRC
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Loss of the six3/6 controlling pathways might have resulted in pinhole-eye evolution in Nautilus2013
- 著者名/発表者名
  Ogura A, et al.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 3 号: 1 ページ: 1432-1432
- DOI
  10.1038/srep01432
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J05107, KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Transcriptome analysis of Nautilus and pygmy squid developing eye provides insights in lens and eye evolution2013
- 著者名/発表者名
  Sousounis K, Ogura A., Tsonis PA
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 8(10)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] The complete mitochondrial genome of the pygmy squid, Idiosepius (Cephalopoda: Decapodiformes): the first representative from the family Idiosepiidae2013
- 著者名/発表者名
  Hall NE., Hanzak J., Allcock AL., Cooke IR., Ogura A., *Strugnell JM.
- 雑誌名
  
  Mitochondrial DNA
  
  巻: 1940 号: 1 ページ: 1736-1736
- DOI
  10.3109/19401736.2013.865180
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Loss of the six3/6 controlling pathways might have resulted in pinhole-eye evolution in Nautilus2013
- 著者名/発表者名
  Ogura A., Yoshida M., Moritaki T., Okuda Y., Sese J., Shimizu KK., Sousounis K., Tsonis PA.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 3 ページ: 1432-1432
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Transcriptome analysis of Nautilus and pygmy squid developing eye provides insights in lens and eye evolution2013
- 著者名/発表者名
  Sousounis K, *Ogura A., *Tsonis PA.
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 8(10) 号: 10 ページ: e78054-e78054
- DOI
  10.1371/journal.pone.0078054
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Comparison of Gene Expression Profile of Epiretinal Membranes Obtained from Eyes with Proliferative Vitreoretinopathy to That of Secondary Epiretinal Membranes2013
- 著者名/発表者名
  Asato R., Yoshida S., Ogura A., Nakama T., Ishikawa K., Nakao S., Sassa Y., Enaida H., Oshima Y., Ikeo K., Gojobori T., Kono T., Ishibashi T.
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 8(1)
- NAID
  120005227330
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Systematic Measurement of Missmatch Effect for Designing Inter-Species Microarray2012
- 著者名/発表者名
  Fukuzaki M., Yoshida M., Ogura A., Sese J.
- 雑誌名
  
  BIBM 2012
  
  ページ: 478-481
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Cephalopod Genomics : A Plan of Strategies and Organization2012
- 著者名/発表者名
  Albertin CB, Bonnaud L, Brown CT, Crookes-Goodson WJ, da Fonseca RR, Cristo CD, Dilkes BP, Edsinger-Gonzales E, Freeman RJ, Hanlon RT, Koenig KM, Lindgren AR, Martindale MQ, Minx P, Moroz LL, Nödl MT, Nyholm SV, Ogura A., Pungor JR, Rosenthal JJC, Schwarz EM, Shigeno S, Strugnell JM, Wollesen T, Zhang G, Ragsdale CW
- 雑誌名
  
  Stand. Genomic Sci.
  
  巻: 7
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[雑誌論文] Expression Profile of Fibrovascular Membranes from Patients with Proliferative Diabetic Retinopathy.2010
- 著者名/発表者名
  Yoshida, S., Ogura, A., Ishikawa, K., Yoshida, A., Kohno, R., Yamaji, Y., Ikeo, K., Gojobori, T., Kono, T., Ishibashi, T. Gene
- 雑誌名
  
  Br J Ophthalmol (In press)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019065
[雑誌論文] Molecular characterization of the developmental gene in eyes: Through data-mining on integrated transcriptome databases.2006
- 著者名/発表者名
  Choy KW, Wang CC, Ogura A, Lau TK, Rogers MS, Ikeo K, Gojobori T. Tang, LY., Lam, DS., Chung, TK. Pang, CP.
- 雑誌名
  
  Clin. Biochem. 39(3)
  
  ページ: 224-230
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019065
[雑誌論文] Genomic annotation of 15, 809 ESTs identified from pooled early gestation human eyes.2006
- 著者名/発表者名
  Choy KW, Wang CC, Ogura A, Lau TK, Rogers MS, Ikeo K, Gojobori T. Lam, DS., Pang, CP.
- 雑誌名
  
  Phys 25(1)
  
  ページ: 9-15
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019065
[雑誌論文] Estimation of ancestral gene set of bilaterian animals and its implication to dynamic change of gene content in bilaterian evolution.2005
- 著者名/発表者名
  A.Ogura
- 雑誌名
  
  Gene 345・1
  
  ページ: 65-71
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17019065
[学会発表] 1 細胞単位の遺伝子発現の時系列データに対する遺伝子の疾患の進行による関係性の変化の抽出2024
- 著者名/発表者名
  増田智也、浅野泰仁、小川達郎、七野成之、上羽悟史、松島綱治、小倉淳
- 学会等名
  第16回データ工学と情報マネジメントに関するフォーラム(DEIM 2024)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12043
[学会発表] 共生できなくなった偏性共生クロレラChlorella variabilis変異株のオミクスアプローチによる共生メカニズム解明2019
- 著者名/発表者名
  嶺井隆平, 保科亮, 藍川晋平, 洲崎敏伸, 小倉淳
- 学会等名
  日本藻類学会第43回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] 非共生クロレラから発見された共生クロレラ特異的巨大ウイルス全ゲノム挿入2018
- 著者名/発表者名
  村瀬佳乃, 嶺井隆平, 保科亮, 小倉淳
- 学会等名
  日本共生生物学会第2回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] ブナの健全性指標におけるリボソームRNAの可能性2018
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・神村章子・樋口亮・小倉淳
- 学会等名
  第67回北方森林学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H01884
[学会発表] ミドリゾウリムシ共生クロレラのゲノム・トランスクリプトーム解析から明らかになった細胞内二次共生初期におけるゲノムの変化2018
- 著者名/発表者名
  嶺井隆平, 保科亮, 洲崎敏伸, 小倉淳
- 学会等名
  日本共生生物学会第2回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] ミドリゾウリムシ共生クロレラのゲノム・トランスクリプトーム解析から明らかになった大規模な遺伝子増加と共生の関連性2018
- 著者名/発表者名
  嶺井隆平, 保科亮, 洲崎敏伸, 小倉淳
- 学会等名
  日本原生生物学会第51回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] 遺伝子発現プロファイルに基づくブナ林の衰退兆候の検出2018
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・神村章子・小林壱德久・山口高志・和田尚之・樋口亮・小倉淳・瀬々潤
- 学会等名
  第129回日本森林学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H01884
[学会発表] ブナのドラフトゲノム2017
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・小林壱德久・神村章子・小倉淳・瀬々潤
- 学会等名
  第66回北方森林学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H01884
[学会発表] 遺伝子ネットワーク解析によるブナ衰退現象の因果推論2017
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・小林壱德久・和田尚之・小倉淳・瀬々潤
- 学会等名
  日本森林学会
- 発表場所
  鹿児島大学（鹿児島市）
- 年月日
  2017-03-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26281030
[学会発表] クロレラ共生種・自由生活種、そして巨大ウイルスウイルスのゲノム比較から迫るゲノム共進化とウイルス抵抗性2017
- 著者名/発表者名
  嶺井隆平, 秋月祐輝, 植田侑希, 保科亮, 小倉淳
- 学会等名
  NGS現場の会第5回研究会仙台
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] ブナ過熟木の葉における遺伝子発現プロファイル2017
- 著者名/発表者名
  樋口亮・斎藤秀之・和田尚之・小倉淳・瀬々潤・渋谷正人・小池孝良
- 学会等名
  第66回北方森林学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17H01884
[学会発表] De novo endosymbiotic green algae genome assembly Nanopore MinION2017
- 著者名/発表者名
  Ryuhei Minei, Ryo Hoshina, Atsushi Ogura
- 学会等名
  The International Conference on Genome Science: from Basic Research to Applications, HanoiThe International Conference on Genome Science: from Basic Research to Applications, Hanoi
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] Genomic changes of symbiont for the multi-algae retaining protists2017
- 著者名/発表者名
  Atsushi Ogura, Yuki Akizuki, Ryuhei Minei, Ryo Hoshina
- 学会等名
  VI Euro Evo Devo, Uppsala, Sweden
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] クロレラゲノムに挿入された巨大ウイルスPBCV-1の化石ゲノムの考察2017
- 著者名/発表者名
  村瀬佳乃, 福本龍馬, 嶺井隆平, 保科亮, 小倉淳
- 学会等名
  日本分子生物学会第40回大会神戸
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] Nanopore MiniONで共生クロレラのゲノムを決めてみました！ ―サンガーシーケンサーで決定されたゲノムにMiniONは勝てるのか？2017
- 著者名/発表者名
  嶺井隆平, 保科亮, 小倉淳
- 学会等名
  生命情報科学若手の会第9回大会蒲郡
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] Evolutionary genomics change of symbiont in relation to giant virus2017
- 著者名/発表者名
  Ryo Hoshina, Ryuhei Minei, Atsushi Ogura
- 学会等名
  The International Conference on Genome Science: from Basic Research to Applications, Hanoi
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] ロングリードNGS MinIONを用いた中型ゲノムパイプラインの構築 ~共生藻類Chlorella variabilisのゲノム決定をとおして~2017
- 著者名/発表者名
  嶺井隆平, 保科亮, 小倉淳
- 学会等名
  日本分子生物学会第40回大会神戸
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] ゲノム網羅的な発現遺伝子を用いたブナ林の環境影響評価－トランスクリプトーム解析とプロテオーム解析による衰退指標の探索－2016
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・神村章子・小林壱徳久・高須賀太一・堀千明・杉村逸郎・和田尚之・山田宰靖・瀬々潤・小倉淳・清水健太郎・齋藤央嗣・谷脇徹・相原敬次
- 学会等名
  山地森林域の生物・環境モニタリング第10回ワークショップ
- 発表場所
  新潟市万代市民文化会館（新潟県新潟市）
- 年月日
  2016-03-13
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26281030
[学会発表] RNA-seqに基づくブナ衰退木の葉の発現変動遺伝子解析2016
- 著者名/発表者名
  小林壱德久・斎藤秀之・齋藤央嗣・谷脇徹・相原敬次・小倉淳・瀬々潤・渋谷正人・小池孝良
- 学会等名
  北方森林学会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター (札幌市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26281030
[学会発表] クロレラ共生種・自由生活種、そして巨大ウイルスウイルスのゲノム比較から迫るゲノム共進化とウイルス抵抗性獲得機構2016
- 著者名/発表者名
  嶺井隆平, 秋月祐輝, 植田侑希, 保科亮, 小倉淳
- 学会等名
  日本分子生物学会第39回大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
- 年月日
  2016-11-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] 発現遺伝子のオミックス解析によるブナ成木の衰退度の評価法～トランスクリプトーム VS.プロテオーム～2016
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・高須賀太一・堀千明・神村章子・小林壱徳久・和田尚之・齋藤央嗣・谷脇徹・相原敬次・小倉淳・瀬々潤
- 学会等名
  北方森林学会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター (札幌市）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26281030
[学会発表] Genomic changes of symbiont for the multi-algae retaining protists2016
- 著者名/発表者名
  Atsushi Ogura, Yuki Akizuki, Ryuhei Minei, Ryo Hoshina
- 学会等名
  VI Euro Evo Devo,
- 発表場所
  Uppsala, Sweden
- 年月日
  2016-07-26
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07491
[学会発表] クロレラ共生種・自由生活種のゲノム比較から迫る共生初期メカニズムの解明2015
- 著者名/発表者名
  秋月祐輝, 保科亮, 寺林靖宣, 吉良聡, 佐藤昭之, 北川正成, 小倉淳
- 学会等名
  日本分子生物学会第38回大会/日本生化学会第88回大会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2015-12-01
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25840141
[学会発表] 熱水噴出域の極限環境適応種から探る化学センシングとその分子基盤2015
- 著者名/発表者名
  荻野哲也, 前川真吾, 滋野修一, 藤倉克則, 小倉淳, 豊原治彦
- 学会等名
  アクアゲノムシンポジウム
- 発表場所
  東京海洋大学、東京都港区
- 年月日
  2015-05-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657058
[学会発表] 熱水噴出孔適応動物から探る新規バイオセンサー2015
- 著者名/発表者名
  荻野哲也, 滋野修一, 前川真吾, 西村大希, 小倉淳, 藤倉克則, 豊原治彦
- 学会等名
  第17回マリンバイオテクノロジー学会大会
- 発表場所
  東京海洋大学、東京都港区
- 年月日
  2015-05-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657058
[学会発表] 比較ゲノム・トランスクリプトーム研究から迫る眼多様化メカニズム2014
- 著者名/発表者名
  小倉淳
- 学会等名
  遺伝研研究集会-ゲノム編集時代の分子進化
- 発表場所
  国立遺伝学研究所
- 年月日
  2014-06-28
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] The unusual brains in deep-sea hydrothermal vent environment: the neural tracts and multi-layer cellular packaging of the alvinellid worms2014
- 著者名/発表者名
  Shigeno S., Ogura A., Yoshida M., Mori T., Toyohara H., Yoshida T., Tsuchida S., Fujikura K.
- 学会等名
  International Congress of Neuroethology/JSCPB
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター、北海道札幌市
- 年月日
  2014-07-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657058
[学会発表] 次世代シーケンス解析に基づく生物の多様性と進化メカニズムの研究2014
- 著者名/発表者名
  小倉淳
- 発表場所
  北海道大学
- 年月日
  2014-03-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] Evolutionary Genomics of Cephalopods2014
- 著者名/発表者名
  Ogura A
- 学会等名
  PAG XXII
- 発表場所
  Sad Diego, USA
- 年月日
  2014-01-17
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] 遺伝子の発現解析は林木のストレス診断に有効か？－ブナ林の事例から－2014
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・瀬々潤・小倉淳・齋藤央嗣・谷脇徹・中村佐知子・村中康秀・山口高志・野口泉
- 学会等名
  北方森林学会
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター（札幌市）
- 年月日
  2014-11-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26281030
[学会発表] Novel role of PERK-regulated non-coding RNAs in the unfolded protein response revealed by comprehensive gene expression analysis2013
- 著者名/発表者名
  Ogura A
- 学会等名
  The 24th CDB meeting
- 発表場所
  Kobe, Japan
- 年月日
  2013-06-13
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] Genomes of Cephalopods2012
- 著者名/発表者名
  Ogura A
- 学会等名
  NESCent meeting "Path to CephalopodGenomics"
- 発表場所
  Durham, USA
- 年月日
  2012-05-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] Comparative Transcriptomics for Eye Diversification of Cephalopod : Evolution of Camera eye and Pinhole eye2012
- 著者名/発表者名
  Ogura A
- 学会等名
  Society for Molecular Biology and Evolution 2012
- 発表場所
  Ireland, Dublin
- 年月日
  2012-06-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] オウムガイおよびイカ胚の比較RNAseqに見る頭足類カメラ眼の進化メカニズム2012
- 著者名/発表者名
  吉田真明, 小倉淳
- 学会等名
  NGS現場の会
- 発表場所
  神戸
- 年月日
  2012-05-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] Sensing extreme environment: the diverse chemical receptors identified by comprehensive RNAseq analysis of hydrothermal vent endemic animals
- 著者名/発表者名
  Shigeno S., Ogura A., Tsuchida S., Fujikura K.
- 学会等名
  5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems
- 発表場所
  Victoria conference center, Victoria, Canada
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24657058
[学会発表] Evolutionary Genomics of Cephalopods
- 著者名/発表者名
  Ogura A.
- 学会等名
  PAG XXII
- 発表場所
  San Diego
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] 酸性および酸化性ストレスがブナの葉の遺伝子発現パターンに与える影響
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・神村章子・瀬々潤・小倉淳
- 学会等名
  日本森林学会
- 発表場所
  北海道大学農学部（札幌市）
- 年月日
  2015-03-27 – 2015-03-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26281030
[学会発表] Cyclops phenocopy in squids indicates common and diverged mechanisms of eye field determination
- 著者名/発表者名
  Yoshida M., Gojobori T.,Ogura A.
- 学会等名
  Euro Evo Devo
- 発表場所
  Risbon University (Portugal)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] Genomes of Cephalopods
- 著者名/発表者名
  Ogura A.
- 学会等名
  NESCent meeting
- 発表場所
  Duke University (USA)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] Comparative Transcriptomics for Eye Diversification of Cephalopod: Evolution of Camera eye and Pinhole eye
- 著者名/発表者名
  Ogura A.
- 学会等名
  SMBE
- 発表場所
  Dublin Convention Centre (Ireland)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] 次世代シーケンス解析に基づく生物の多様性と進化メカニズムの研究
- 著者名/発表者名
  小倉淳
- 学会等名
  非モデル生物のための次世代シーケンサー活用術
- 発表場所
  札幌
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770002
[学会発表] ゲノム網羅的な発現遺伝子を用いたブナ林の環境影響評価法－丹沢ブナ林の事例－
- 著者名/発表者名
  斎藤秀之・神村章子・山田宰靖・瀬々潤・小倉淳・清水(稲継)理恵・清水健太郎・齋藤央嗣・谷脇徹
- 学会等名
  山地森林域の生物・環境モニタリング第9回ワークショップ
- 発表場所
  神奈川大学KUポートスクエア（横浜市）
- 年月日
  2015-03-10 – 2015-03-11
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26281030

1. 保科亮 (40373089)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 15件
2. 齋藤秀之 (70312395)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 0件
3. 池尾一穂 (20249949)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
4. 瀬々潤 (40361539)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 7件
5. 楠岡泰 (80359265)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
6. 洲崎敏伸 (00187692)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
7. 浅野泰仁 (20361157)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
8. 五條堀孝 (50162136)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
9. 鈴木善幸 (70353430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 遠藤俊徳 (00323692)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 峯田克彦 (40374615)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 滋野修一 (90360560)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
13. 神崎亮平 (40221907)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 菅原秀明 (80231372)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 山口高志 (90462316)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
16. 渡邉日出海 (30322754)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 太田聡史 (30391890)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 高須賀太一 (70748409)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 野口泉

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
20. 齋藤央嗣

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
21. 谷脇徹

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
22. 家合浩明

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 村中康秀

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
24. 須田降一

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
25. 大森義裕

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
26. 井上菜穂子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
27. 上羽悟史

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
28. 斎藤秀之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 11件
29. 森司

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
30. 十合晋作

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
31. 松坂賢

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
32. 松島綱治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
33. 七野成之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

小倉 淳 Ogura Atsushi

研究課題

研究成果

共同研究者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

巨大ウイルスのクロレラへの全ゲノム挿入とクロレラ-ミドリゾウリムシ共生進化機構研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

眼形態多様性を生み出す遺伝子発現ネットワークの分子進化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] Metatranscriptome"Genome Analysis : Current Procedures and Applications2014

著者名/発表者名

出版者

データソース

小倉淳 Ogura Atsushi