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林 武司  HAYASHI Takeshi

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 70370674
その他のID
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2021年度: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 次世代作物開発研究センター, ユニット長
2019年度: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 次世代作物開発研究センター, ユニット長
2015年度: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 中央農業総合研究センター, 上席研究員
2014年度: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, その他部局等, 研究員
2011年度 – 2013年度: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 中央農業総合研究センター, 上席研究員 … もっと見る
2012年度: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 中央農業総合研究センター情報利用研究領域, 上席研究員
2010年度: 独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 中央農業総合研究センター・データマイイング研究チーム, チーム長
2009年度: 独立行政法人農業環境技術研究所, 動物科学研究領域, 主任研究員
2007年度 – 2009年度: 独立行政法人農業生物資源研究所, 動物科学研究領域, 主任研究員 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者以外
小区分39030:園芸科学関連 / 遺伝育種科学 / 育種学 / 作物学・雑草学
キーワード
研究代表者以外
イネ / ゲノミックセレクション / ゲノム育種 / 環境応答 / モデル化 / 相関ネットワーク / オーミクス / ゲノム情報 / 食味(おいしさ) / 味覚センサー … もっと見る / GC-MS / RNA-seq / SNPs / ゲノムシークエンス / オミクス解析 / 果皮色 / 果実重 / 味覚 / 香気成分 / 有機酸 / 糖 / 発現遺伝子 / トランスオミクス / 食味関連遺伝子 / メタボロミクス / 味・香り / 高精度ゲノム / ネットワーク解析 / eGWAS / TWAS / GWAS / 糖・有機酸 / 統合オミクス / 食味科学 / おいしさ / 香り / 味 / 果実 / 作物モデル / 気候変動 / 遺伝子 / ゲノム / 育種学 / 組換え近交系 / 予測モデル / 作物生育モデル / 収量構成要素 / 出穂 / 選抜方法 / 量的形質遺伝子座(QTL) / 機械学習 / 一塩基多型(SNP) / 量的遺伝子座(QTL) / 選抜方式 / 作物育種 / 育種シミュレーション / 一塩基多型(SNP) / 量的遺伝子座(QTL) / 遺伝 / 植物育種 / 早晩性 / 遺伝学 / 発育生理学 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (40件)
  • 共同研究者

    (13人)
  •  イチジク遺伝資源を用いた果実の味・香り制御遺伝子の網羅的解析と食味科学への展開

    • 研究代表者
      池上 秀利
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分39030:園芸科学関連
    • 研究機関
      福岡県農林業総合試験場
  •  環境適応型品種をデザインするための統合的モデル化手法の開発

    • 研究代表者
      岩田 洋佳
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      遺伝育種科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  ゲノミックセレクションを活用した革新的作物育種システムの構築

    • 研究代表者
      岩田 洋佳
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2012
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      育種学
    • 研究機関
      東京大学
  •  作物生育モデルと遺伝モデルの連携による作物環境応答の生態遺伝的メカニズムの解明

    • 研究代表者
      長谷川 利拡
    • 研究期間 (年度)
      2007 – 2009
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      作物学・雑草学
    • 研究機関
      独立行政法人農業環境技術研究所

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すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] Analysis of the Segregation Distortion of FcRAN1 Genotypes Based on Whole-Genome Resequencing of Fig (Ficus carica L.) Breeding Parents2021

    • 著者名/発表者名
      Ikegami Hidetoshi, Shirasawa Kenta, Yakushiji Hiroshi, Yabe Shiori, Sato Masaru, Hayashi Takeshi, Tashiro Kosuke, Nogata Hitoshi
    • 雑誌名

      Frontiers in Plant Science

      巻: 12

    • DOI

      10.3389/fpls.2021.647599

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02952
  • [雑誌論文] Island-model genomic selection for long-term genetic improvement of autogamous crops2016

    • 著者名/発表者名
      Shiori Yabe, Masanori Yamasaki, Kaworu Ebana, Takeshi Hayashi, Hiiroyoshi Iwata
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 11(4) 号: 4 ページ: e0153945-e0153945

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0153945

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [雑誌論文] Genomics-assisted breeding in fruit trees2016

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Iwata, Mai F. Minamikawa, Hiromi Kajiya-Kanegae, Motoyuki Ishimori, Takeshi Hayashi
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 66 号: 1 ページ: 100-115

    • DOI

      10.1270/jsbbs.66.100

    • NAID

      130005141822

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 言語
      英語
    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [雑誌論文] Toward integration of genomic selection with crop modelling: the development of an integrated approach to predicting rice heading dates2016

    • 著者名/発表者名
      Akio Onogi, Maya Watanabe, Toshihiro Mochizuki, Takeshi Hayashi, Hiroshi Nakagawa, Toshihiro Hasegawa, Hiroyoshi Iwata
    • 雑誌名

      Theoretical and Applied Genetics

      巻: 129 号: 4 ページ: 805-817

    • DOI

      10.1007/s00122-016-2667-5

    • 査読あり / 謝辞記載あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [雑誌論文] Genomic Prediction of Biological Shape: Elliptic Fourier Analysis and Kernel Partial Least Squares (PLS) Regression Applied to Grain Shape Prediction in Rice (Oryza sativa L.)2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Iwata, Kaworu Ebana, Yusaku Uga, Takeshi Hayashi
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 10(3) 号: 3 ページ: e0120610-e0120610

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0120610

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [雑誌論文] 植物育種のためのオミックス・データ解析入門2014

    • 著者名/発表者名
      小林 正明, 大柳 一, 矢野 健太郎, 岩田 洋佳
    • 雑誌名

      育種学研究

      巻: 16 号: 2 ページ: 93-99

    • DOI

      10.1270/jsbbr.16.93

    • NAID

      130004438693

    • ISSN
      1344-7629, 1348-1290
    • 言語
      日本語
    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [雑誌論文] A Bayesian method and its variational approximation for prediction of genomic breeding values in multiple traits2013

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T, Iwata H
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 14 号: 1 ページ: 34-34

    • DOI

      10.1186/1471-2105-14-34

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [雑誌論文] Potential assessment of genome- wide association study and genomic selection in Japanese pear Pyrus pyrifolia2013

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Terakami S, TakadaN, Sawamura Y, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 63 ページ: 125-140

    • NAID

      10031151532

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [雑誌論文] Potential assessment of genome-wide association study and genomic selection in Japanese pear <i>Pyrus pyrifolia</i>2013

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Terakami S, Takada N, Sawamura Y, Yamamoto T
    • 雑誌名

      Breeding Science

      巻: 63 号: 1 ページ: 125-140

    • DOI

      10.1270/jsbbs.63.125

    • NAID

      10031151532

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
    • 言語
      英語
    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [雑誌論文] A Bayesian methodand its variational approximation for prediction of genomic breeding values in multiple traits2013

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T, Iwata H
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 14 ページ: 34-34

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [雑誌論文] Prospects for genomic selection in conifer breeding : a simulation study of Cryptomeria japonica2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Tsumura Y
    • 雑誌名

      Tree Genetics & Genomes

      巻: 7 号: 4 ページ: 747-758

    • DOI

      10.1007/s11295-011-0371-9

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [雑誌論文] DNAマーカーの育種への利用について-DNAマーカー育種の基礎と応用、そして将来展望-2011

    • 著者名/発表者名
      福田篤徳、田中淳一、平林秀介、福岡修一、トラ田淳史、岩田洋佳
    • 雑誌名

      Techno Innovation

      巻: 77 ページ: 36-45

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [雑誌論文] A Bayesian method for simultaneously detectingg mendelian and imprinted quantitative trait loci in experimental crosses of outbred species2008

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T.
    • 雑誌名

      Genetics 178

      ページ: 527-538

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19208003
  • [雑誌論文] A Bayesian method for simultaneously detecting mendelian and imprinted quantitative trait loci in experimental crosses of outbred species2008

    • 著者名/発表者名
      Hayashi, T.
    • 雑誌名

      Genetics 178

      ページ: 527-538

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19208003
  • [学会発表] 高解像全ゲノム関連解析によるイチジク果皮色形質原因遺伝子候補の同定2021

    • 著者名/発表者名
      池上秀利・矢部志央理 ・林武司・白澤健太・吉川郁恵・石橋美咲・白武勝裕・佐藤大・田代康介・野方仁
    • 学会等名
      令和3年度園芸学会秋季大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02952
  • [学会発表] イチジクFcRAN1座アレルにおける分離比歪みの観察とその遺伝的要因の解析2020

    • 著者名/発表者名
      池上秀利, 白澤健太, 薬師寺博, 矢部志央理, 佐藤大, 林武司, 田代康介, 野方仁
    • 学会等名
      日本育種学会第138回講演会(令和2年度秋季大会)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02952
  • [学会発表] イチジクのゲノミック予測に基づくF1分離予測2019

    • 著者名/発表者名
      矢部志央理, 白澤健太, 池上秀利, 姫野修一, 野方仁, 田代康介, 林武司
    • 学会等名
      日本育種学会 第136回講演会(令和元年度秋季大会)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19H02952
  • [学会発表] イネのバイオマスと収量を予測する:作物モデルとゲノム予測モデルを融合した新しいモデル2016

    • 著者名/発表者名
      戸田悠介、若月ひとみ、江花薫子、山崎将紀、鐘ケ江弘美、林武司、中川博視、長谷川利拡、岩田洋佳
    • 学会等名
      日本育種学会第129回講演会
    • 発表場所
      横浜市立大学 (横浜市金沢区)
    • 年月日
      2016-03-21
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [学会発表] Genomic prediction of trait segregation in progeny populations: examples in Japanese pear and rice2013

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Yoshioka T, Yamasaki M, Ebana K, Terakami S, Takada N, Saito T, Yamamoto T
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XXI
    • 発表場所
      アメリカ合衆国、サンディエゴ
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] ゲノミックセレクションモデルに基づくイネF2集団における出穂期分離の予測2013

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、吉岡拓磨、小野木章雄、江花薫子、林武司、山崎将紀
    • 学会等名
      日本育種学会 第123回講演会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] ゲノムワイドモデルおよびQTLモデルを用いたイネ戻し交雑近交系の開花フェノロジー予測2013

    • 著者名/発表者名
      渡部真哉、望月俊宏、林武司、中川博視、長谷川利拡、岩田洋佳
    • 学会等名
      日本育種学会 第123回講演会
    • 発表場所
      東京農業大学(東京)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] Building a better model for predicting biological shapes based on genomic data.2013

    • 著者名/発表者名
      Hiroyoshi Iwata, Kaworu Ebana, Yusaku Uga, Takeshi Hayashi
    • 学会等名
      The 3rd International Symposium of Biological Shape Analysis (ISBSA)
    • 発表場所
      Univ. of Tokyo (Tokyo)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [学会発表] 循環ゲノミックセレクションを用いた並列育種:イネにおけるシミュレーション2013

    • 著者名/発表者名
      矢部志央理、山崎将紀、江花薫子、林武司、岩田洋佳
    • 学会等名
      日本育種学会第124回講演会
    • 発表場所
      鹿児島大学(鹿児島県)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [学会発表] ゲノム情報から形態を予測する2013

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、江花薫子、宇賀優作、林武司
    • 学会等名
      日本生態学会第60回大会
    • 発表場所
      静岡県コンペンションアーツセンター(静岡)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] ゲノミクスとモルフォメトリクスの融合:植物形状の体系的改良に向けて2012

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、江花薫子、宇賀優作、林武司
    • 学会等名
      第22回 日本数理生物学会 年会
    • 発表場所
      岡山大学津島キャンパス(岡山)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] 推定ハプロタイプ情報を用いたゲノミックセレクションの精度:ニホンナシデータにおける検証2012

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、林武司、寺上伸吾、高田教臣、斎藤寿広、山本俊哉
    • 学会等名
      日本育種学会 第122回講演会
    • 発表場所
      京都産業大学(京都)
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] Genomic prediction of promising crosses based on genome-wide marker and phenotype data of parental varieties: a case study in Japanese pear Pyrus pyrifolia2012

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Hayashi T, Terakami S, Takada N, Saito T, Yamamoto T
    • 学会等名
      XVth Meeting of the EUCARPIA Section - Biometrics in Plant Breeding -
    • 発表場所
      ドイツ、シュツットガルト
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] Accuracy of genomic selection in rice breeding ; simulations and cross-validation2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Ebana K, Yamasaki M, Ideta O, Taguchi-Shiobara F, Hayashi T
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XIX
    • 発表場所
      サンディエゴ・タウンアンドカントリーホテルUSA
    • 年月日
      2011-01-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] Integration of Genomics and Morphometrics Approaches Toward Systematic Plant Shape Improvement2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Ebana K, Uga Y, Hayashi T
    • 学会等名
      2nd ISBSA
    • 発表場所
      沖縄県男女共同参画センターてぃるる(沖縄県)
    • 年月日
      2011-09-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] Non-MCMC methods for effective Bayesian analysis of high-dimensional genomic data2011

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T, Iwata H
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XIX
    • 発表場所
      サンディエゴ・タウンアンドカントリーホテルUSA
    • 年月日
      2011-01-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] コメ粒形のゲノムワイドアソシエーション解析とゲノム情報に基づく予測2011

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳, 江花薫子、宇賀優作、林武司
    • 学会等名
      日本育種学会第120回公演会
    • 発表場所
      福井県立大学(福井県)
    • 年月日
      2011-09-24
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] イネ育種におけるゲノミックセレクションの精度:シミュレーションと実データによる評価2011

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、井下侑人、江花薫子、山崎将紀、出田収、田口(塩原)文緒、林武司
    • 学会等名
      日本育種学会
    • 発表場所
      横浜市立大
    • 年月日
      2011-03-29
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] Non-MCMC methods for effective Bayesian analysis of high-dimensional genomic data2011

    • 著者名/発表者名
      Hayashi T, Iwata H
    • 学会等名
      Plant and Animal Genome XIX
    • 発表場所
      アメリカ合衆国、サンディエゴ
    • 年月日
      2011-01-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] Integration of Genomics and Morphometrics Approaches Toward Systematic Plant Shape Improvement2011

    • 著者名/発表者名
      Iwata H, Ebana K, Uga Y, Hayashi T
    • 学会等名
      2nd ISBSA
    • 発表場所
      沖縄県男 女共同参画センターてぃるる(沖縄県)
    • 年月日
      2011-09-09
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] ゲノムワイドマーカー利用育種に向けて:ゲノムワイドアソシエーション研究とゲノミックセレクション2011

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、江花薫子、宇賀優作、林武司
    • 学会等名
      個体群生態学会第27回大会
    • 発表場所
      岡山大学(岡山県)
    • 年月日
      2011-10-16
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] イネ育苗期おける二酸化炭素濃度上昇の応答に関するQTLsの検出2010

    • 著者名/発表者名
      程為国・酒井英光・林武司・長谷川利拡
    • 学会等名
      日本作物学会第229回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学農学部
    • 年月日
      2010-03-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19208003
  • [学会発表] ベイズ手法を用いた遺伝育種研究2010

    • 著者名/発表者名
      林武司
    • 学会等名
      日本計量生物学会
    • 発表場所
      統計数理研究所
    • 年月日
      2010-05-22
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22380010
  • [学会発表] イネ育苗期おける二酸化炭素濃度上昇の応答に関するqtlsの検出2010

    • 著者名/発表者名
      程為国・酒井英光・林武司・長谷川利拡
    • 学会等名
      日本作物学会第229回講演会
    • 発表場所
      宇都宮大学農学部
    • 年月日
      2010-03-30
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19208003
  • [学会発表] 作物モデルとゲノムワイド予測モデルを組み合わせた新たな統計学的モデル:イネ出穂期予測への適用

    • 著者名/発表者名
      小野木 章雄, 渡辺 真哉, 望月 俊宏, 林 武司, 中川 博視, 長谷川 利拡, 岩田 洋佳
    • 学会等名
      日本育種学会第126回講演会
    • 発表場所
      南九州大学(宮崎県、都城市)
    • 年月日
      2014-09-26 – 2014-09-27
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • [学会発表] ゲノムワイドマーカーを用いて生物のかたちを予測する:玄米形予測への適用

    • 著者名/発表者名
      岩田洋佳、江花薫子、宇賀優作、林武司
    • 学会等名
      第23回数理生物学会大会
    • 発表場所
      静岡大学(静岡県)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25252002
  • 1.  岩田 洋佳 (00355489)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 28件
  • 2.  長谷川 利拡 (10228455)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 5件
  • 3.  中川 博視 (90207738)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 3件
  • 4.  江花 薫子 (00370643)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 16件
  • 5.  望月 俊宏 (60239572)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  大澤 良 (80211788)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  二宮 正士 (90355488)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  山崎 将紀 (00432550)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 9.  池上 秀利 (40502414)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 10.  田代 康介 (00192170)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 11.  佐藤 大 (30454052)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 3件
  • 12.  白澤 健太 (60527026)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件
  • 13.  矢部 志央理 (60767771)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 4件

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