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洞田 慎一  HORATA Shinichi

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 70377125
外部サイト
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2005年度 – 2006年度: 総合研究大学院大学, 葉山高等研究センター, 上級研究員
2005年度: 総合研究大学院大学, 上級研究員
審査区分/研究分野
研究代表者以外
進化生物学 / 生物系
キーワード
研究代表者以外
SOM / Self-Organizing Map / 自己組織化マップ / オリゴヌクレオチド頻度 / phylogenetic prediction / genome signature / 地球シミュレータ / メタゲノム / 生体生命情報学 / 応用微生物 … もっと見る / 難培養性微生物 / oligonucleotide frequencies / phylogenetic classification / Methagenome / Earth Simulator / Phylogenetic prediction / Protein function prediction / Environmental microorganisms / Bioinformatics / トリペプチド頻度 / 環境ゲノム / タンパク質機能推定 / 生物系統推定 / 自己組織化マツプ / メタゲノム解析 / 進化 / 蛋白質機能推定 / 遺伝子機能推定 / uncultured microorganisms / transcription factor / the Earth Simulator / oligonucleotide frequency / ゲノム配列 / 連続塩基頻度 / 系統推定 / 環境微生物 / oligonucleotide / 地球シュミレータ / 連続塩基出現頻度 / 機能未知タンパク / 2連アミノ酸頻度 / 3連アミノ酸頻度 / オリゴペプチド頻度 / 水平伝播遺伝子 / ウイルス / 細菌 / 病原微生物 / metagenome / environmental microorganism / uncultured microorganism 隠す
  • 研究課題

    (4件)
  • 研究成果

    (3件)
  • 共同研究者

    (3人)
  •  全ゲノム情報に基づいた病原微生物と常在菌の多様性と病原遺伝子に関する情報学的研究

    • 研究代表者
      池村 淑道
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      長浜バイオ大学
  •  配列相同性検索に依存しない生物系統と機能推定法の確立と分子進化学への応用

    • 研究代表者
      池村 淑道
    • 研究期間 (年度)
      2006 – 2007
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      進化生物学
    • 研究機関
      長浜バイオ大学
  •  全ゲノム情報に基づいた病原微生物と常在菌の多様性と病原遺伝子に関する情報学的研究

    • 研究代表者
      池村 淑道
    • 研究期間 (年度)
      2005
    • 研究種目
      特定領域研究
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      総合研究大学院大学
  •  ゲノム塩基配列に潜む生物種の個性の情報学的探索と生物進化多様性の研究

    • 研究代表者
      池村 淑道
    • 研究期間 (年度)
      2004 – 2005
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 研究分野
      進化生物学
    • 研究機関
      総合研究大学院大学

すべて 2005

すべて 雑誌論文

  • [雑誌論文] Torus Self-Organizing Map for Bioinformatics,2005

    • 著者名/発表者名
      Horata, S., Ikemura, T., Yukawa
    • 雑誌名

      Proceedings of Workshop 2005 on Self-Organizing maps 2005

      ページ: 235-242

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16570190
  • [雑誌論文] Torus Self-Organizing Map for Bioinformatics2005

    • 著者名/発表者名
      Horata, S., Ikemura, T., Yukawa
    • 雑誌名

      Proceedings of Workshop 2005 on Self-Organizing Maps 2005

      ページ: 235-242

    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17019018
  • [雑誌論文] Torus Self-Organizing Map for Bioinformatics2005

    • 著者名/発表者名
      Horata, S., Ikemura, T., Yukawa
    • 雑誌名

      Proceedings of Workshop 2005 on Self-Organizing Maps 2005

      ページ: 235-242

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16570190
  • 1.  池村 淑道 (50025475)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 3件
  • 2.  阿部 貴志 (30390628)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  深川 竜郎 (60321600)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件

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