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鎌田 真由美  Kamada Mayumi

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 70749077
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 北里大学, 未来工学部, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2024年度: 北里大学, 未来工学部, 教授
2017年度 – 2023年度: 京都大学, 医学研究科, 准教授
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 生物物理学
研究代表者以外
学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 小区分53010:消化器内科学関連 / 小区分13010:数理物理および物性基礎関連
キーワード
研究代表者
ゲノムバリアント / ゲノム医療 / 時系列解析 / タンパク質立体構造ダイナミクス / ゲノム構造多型 / データ基盤構築 / マルチモーダルデータ / マルチモーダルデータの統合 / マルチモーダル / データモデル … もっと見る / データ統合 / 薬剤耐性 / 特徴抽出 / 時系列分析 / 低次元特徴量表現 / タンパク質構造ダイナミクス / 生体生命情報学 / ウェーブレット解析 / 分子動力学シミュレーション / 薬剤感受性 / 構造ダイナミクス / タンパク質立体構造 … もっと見る
研究代表者以外
深層学習 / 天然物有機化学 / ケミカルバイオロジー / 生物活性分子 / 化合物潜在空間 / システム生物 / 生命情報 / 疾患アトラクター / 機械学習 / アルツハイマー病 / 遺伝子・環境相互作用 / 多因子疾患の発症機序 / 多様性 / 遺伝子変異 / 大腸腺腫 / オルガノイド培養 / 大腸管状腺腫 / 薬理発現 / 動力学的反応論 / 非線形非平衡現象 / 階層的データマイニング / 非線形動力学 / 非平衡ダイナミクス / 薬理の分子機構 / 次元縮約 / 生体分子の機能発現 / 分子内非平衡 / 次元圧縮 / 大自由度カオス / 集団運動 / トレンド成分 / ウエーブレット変換 / 非定常 / ラチェット / 機能発現 / 生体分子 / 時系列解析 / wavelet変換 / カオス / 非平衡 / 階層性 隠す
  • 研究課題

    (8件)
  • 研究成果

    (20件)
  • 共同研究者

    (23人)
  •  天然物が織り成す化合物潜在空間が拓く生物活性分子デザイン

    • 研究代表者
      菊地 和也
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅱ)
    • 研究機関
      大阪大学
  •  マルチモーダルな生物活性情報の統合と活用に向けた情報基盤設計研究代表者

    • 研究代表者
      鎌田 真由美
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅱ)
    • 研究機関
      北里大学
      京都大学
  •  ヒトゲノム構造多型データ類似性検索のための基盤技術開発研究代表者

    • 研究代表者
      鎌田 真由美
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  多因子疾患の環境曝露の発症機序への影響の深層学習によるシステム的解明

    • 研究代表者
      荻島 創一
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2023
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      東北大学
  •  生体分子の動力学計算に対する階層的データマイニングの開拓と薬理の動的機構への応用

    • 研究代表者
      戸田 幹人
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分13010:数理物理および物性基礎関連
    • 研究機関
      奈良女子大学
  •  大腸管状腺腫の遺伝子変異プロファイルおよび生物学的多様性についての研究

    • 研究代表者
      山田 敦
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分53010:消化器内科学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  タンパク質の構造ダイナミクスに基づくゲノムバリアントと分子機能の関連解析研究代表者

    • 研究代表者
      鎌田 真由美
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2020
    • 研究種目
      若手研究
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      京都大学
  •  遺伝子変異によるタンパク質立体構造の動態変化検出手法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      鎌田 真由美
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2018
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生物物理学
    • 研究機関
      京都大学

すべて 2023 2022 2021 2019 2018

すべて 雑誌論文 学会発表

  • [雑誌論文] 医薬品関連文書の利活用に向けたインタビューフォームの構造化の提案2023

    • 著者名/発表者名
      長尾 知生子、鎌田 真由美、中津井 雅彦、深川 明子、片山 俊明、川島 秀一、水口 賢司、安倍 理加
    • 雑誌名

      医薬品情報学

      巻: 24 号: 4 ページ: 187-195

    • DOI

      10.11256/jjdi.24.187

    • ISSN
      1345-1464, 1883-423X
    • 年月日
      2023-02-28
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [雑誌論文] Inhibition of the bone morphogenetic protein pathway suppresses tumor growth through downregulation of epidermal growth factor receptor in <scp>MEK</scp>/<scp>ERK</scp>‐dependent colorectal cancer2023

    • 著者名/発表者名
      Shimizu Shota、Kondo Jumpei、Onuma Kunishige、Coppo Roberto、Ota Kasumi、Kamada Mayumi、Harada Yohei、Tanaka Yoshihisa、Nakazawa Mai Adachi、Tamada Yoshinori、Okuno Yasushi、Kawada Kenji、Obama Kazutaka、Coffey Robert J.、Fujiwara Yoshiyuki、Inoue Masahiro
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: 114 号: 9 ページ: 3636-3648

    • DOI

      10.1111/cas.15882

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22KF0212, KAKENHI-PROJECT-21K07942, KAKENHI-PROJECT-22K19456, KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [雑誌論文] Distinct but interchangeable subpopulations of colorectal cancer cells with different growth fates and drug sensitivity2023

    • 著者名/発表者名
      Coppo Roberto、Kondo Jumpei、Iida Keita、Okada Mariko、Onuma Kunishige、Tanaka Yoshihisa、Kamada Mayumi、Ohue Masayuki、Kawada Kenji、Obama Kazutaka、Inoue Masahiro
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 26 号: 2 ページ: 105962-105962

    • DOI

      10.1016/j.isci.2023.105962

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K07942, KAKENHI-PROJECT-22K19456, KAKENHI-PROJECT-21H02714, KAKENHI-PROJECT-22KF0212, KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [雑誌論文] ゲノム医療と日本における取り組みについて2023

    • 著者名/発表者名
      鎌田 真由美、河合 洋介
    • 雑誌名

      JSBi Bioinformatics Review

      巻: 4 号: 2 ページ: 81-90

    • DOI

      10.11234/jsbibr.2023.2

    • ISSN
      2435-7022
    • 言語
      日本語
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K11319
  • [雑誌論文] Clinicopathological and molecular characterization of deficient mismatch repair colorectal cancer2022

    • 著者名/発表者名
      Yamada Atsushi、Yamamoto Yoshihiro、Minamiguchi Sachiko、Kamada Mayumi、Sunami Tomohiko、Ohashi Shinya、Seno Hiroshi、Kawada Kenji、Muto Manabu
    • 雑誌名

      Human Pathology

      巻: 130 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.humpath.2022.09.005

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [雑誌論文] Machine learning-based prediction of relapse in rheumatoid arthritis patients using data on ultrasound examination and blood test2022

    • 著者名/発表者名
      Matsuo Hidemasa、Kamada Mayumi、Imamura Akari、Shimizu Madoka、Inagaki Maiko、Tsuji Yuko、Hashimoto Motomu、Tanaka Masao、Ito Hiromu、Fujii Yasutomo
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 7224-7224

    • DOI

      10.1038/s41598-022-11361-y

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K08475, KAKENHI-PROJECT-18K12103, KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [雑誌論文] Network-based pathogenicity prediction for variants of uncertain significance2021

    • 著者名/発表者名
      Kamada Mayumi、Takagi Atsuko、Kojima Ryosuke、Tanaka Yoshihisa、Nakatsui Masahiko、Tanabe Noriko、Hirata Makoto、Yoshida Teruhiko、Okuno Yasushi
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2021.07.15.452566

    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [雑誌論文] AIM in Genomic Basis of Medicine: Applications2021

    • 著者名/発表者名
      Kamada Mayumi, Okuno Yasushi
    • 雑誌名

      Artificial Intelligence in Medicine

      巻: - ページ: 1-10

    • DOI

      10.1007/978-3-030-58080-3_264-1

    • ISBN
      9783030580803
    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [雑誌論文] Distinct and interchangeable growing patterns in colorectal cancer stem-like cells are regulated by Musashi-12021

    • 著者名/発表者名
      Coppo Roberto、Kondo Jumpei、Iida Keita、Okada Mariko、Onuma Kunishige、Tanaka Yoshihisa、Kamada Mayumi、Ohue Masayuki、Kawada Kenji、Obama Kazutaka、Inoue Masahiro
    • 雑誌名

      bioRxiv

      巻: -

    • DOI

      10.1101/2021.11.25.469977

    • オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21H03537
  • [学会発表] A Comparative Study and Normalization Strategies for Structural Variant Analysis2023

    • 著者名/発表者名
      Mayumi KAMADA, Toshiaki KATAYAMA, Yosuke KAWAI
    • 学会等名
      The International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB) 2023
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K11319
  • [学会発表] 医療・創薬研究におけるデータ統合2023

    • 著者名/発表者名
      鎌田 真由美
    • 学会等名
      2023年日本バイオインフォマティクス学会年会・第12回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2023)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04886
  • [学会発表] Elucidation of Mortality Triggers Using Temporal Predictive Models2023

    • 著者名/発表者名
      Tatsuki YAMAMOTO, Yuzuha TSUJI , Minoru SAKURAGI , Yuji OKAMOTO , Mayumi KAMADA , Yasushi OKUNO
    • 学会等名
      情報計算化学生物学会2023年大会(CBI2023)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04886
  • [学会発表] pplication of Machine Learning Models in Prediction of Disease Therapeutic Target Molecules Using Gene Expression Profiles2023

    • 著者名/発表者名
      Narumi Hatano, Mayumi Kamada, Ryosuke Kojima, Hiroaki Iwata, Yasushi Okuno
    • 学会等名
      情報計算化学生物学会2023年大会(CBI2023)
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04886
  • [学会発表] Structural dynamics of biomolecules and application to genomic medicine2021

    • 著者名/発表者名
      鎌田真由美
    • 学会等名
      「複雑系数理:物理・化学・生物・情報 と カオス」シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K20398
  • [学会発表] Evaluation of differences in protein dynamics caused by genomic variant using time-series data2019

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kamada, Mikito Toda
    • 学会等名
      The annual international conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K20398
  • [学会発表] Construction of clinical genome information database to promote precision medicine2018

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kamada, Masahiko Nakatsui, Yasushi Okuno
    • 学会等名
      The 63rd Annual Meeting of the Japan Society of Human Genetics
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K17837
  • [学会発表] Feature extraction using wavelet transformation to reveal genomic variant effects on binding affinity of EGFR2018

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kamada, Mikito Toda
    • 学会等名
      The Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC) 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K17837
  • [学会発表] Feature extraction using wavelet transformation to reveal genomic variant effect on binding affinity of EGFR2018

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kamada, Mikito Toda
    • 学会等名
      The 16th Asia Pacific Bioinformatics Conference (APBC),
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K17837
  • [学会発表] Detection of differences in protein dynamics due to genomic mutation using wavelet transform2018

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kamada, Mikito Toda
    • 学会等名
      2018 European Conference on Computational Biology (ECCB)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K17837
  • [学会発表] Developing prediction methods for disease treatment and prevention taking into account individual variability2018

    • 著者名/発表者名
      Mayumi Kamada
    • 学会等名
      5th RIKEN-KI/SciLifeLab Symposium
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K17837
  • 1.  片山 俊明 (60396869)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 2.  戸田 幹人 (70197896)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  山田 敦 (20569610)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  森藤 紳哉 (30273832)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  井上 正宏 (10342990)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 2件
  • 6.  近藤 純平 (80624593)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 7.  荻島 創一 (40447496)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  川島 秀一 (50314274)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  宮下 哲典 (60323995)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  小島 諒介 (70807651)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 11.  水野 聖士 (80646795)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  菊地 和也 (70292951)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  榊原 康文 (10287427)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  伊藤 寛晃 (20758205)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  丹羽 節 (30584396)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  荒井 緑 (40373261)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  大森 建 (50282819)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  大上 雅史 (50743209)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  上田 実 (60265931)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  吉田 稔 (80191617)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  河合 洋介 (30435515)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 22.  COPPO ROBERTO
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 23.  松尾 英将
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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