阿部興 Abe Ko

研究者番号	70832533
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京科学大学, 総合研究院, プロジェクト講師
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2024年度: 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, プロジェクト講師 2020年度 – 2022年度: 神戸薬科大学, 薬学部, 講師
審査区分/研究分野	研究代表者小区分62010:生命、健康および医療情報学関連研究代表者以外小区分43030:機能生物化学関連 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
キーワード	研究代表者時系列データ / マルチオミクス / 数理モデル / 因果推論 / 腸内細菌叢研究代表者以外無菌炎症 / 自然免疫 / 行列因子分解 / 相互作用ネットワーク / 時空間解析 … もっと見る / ベイズモデリング / 空間トランスクリプトーム / シングルセルオミクス / 細胞ダイナミクス / 因子分解 / マルチオミクス / 深層生成モデル / 細胞運命決定 / 細胞間コミュニケーション / 一細胞解析 / ベイズモデル隠す

NF-κBに依存しない自然免疫誘導メカニズムの解明
- 研究代表者
  
  倉石貴透
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43030:機能生物化学関連
- 研究機関
  金沢大学
腸内細菌叢と疾病の因果関係推定のための数理モデルの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  阿部興
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  若手研究
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  神戸薬科大学
多細胞ダイナミクスを紐解くベイズモデリング技術の開発
- 研究代表者
  
  島村徹平
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2022
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  名古屋大学

すべて 2022 2021 2020

すべて雑誌論文

[雑誌論文] An analysis modality for vascular structures combining tissue-clearing technology and topological data analysis2022
- 著者名/発表者名
  Takahashi K, Abe K, Kubota SI, Fukatsu N, Morishita Y, Yoshimatsu Y, Satoshi Hirakawa, Yoshiaki Kubota, Tetsuro Watabe, Shogo Ehata, Hiroki R. Ueda, Teppei Shimamura, Kohei Miyazono
- 雑誌名
  
  Nature Communiactions
  
  巻: 13 号: 1 ページ: 5239-5239
- DOI
  10.1038/s41467-022-32848-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K07094, KAKENHI-PROJECT-22K15435, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-18H05270, KAKENHI-PROJECT-20H03851, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PLANNED-17H06326, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PROJECT-20H00513
[雑誌論文] Hierarchical non-negative matrix factorization using clinical information for microbial communities2021
- 著者名/発表者名
  Abe Ko、Hirayama Masaaki、Ohno Kinji、Shimamura Teppei
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 22 号: 1 ページ: 104-104
- DOI
  10.1186/s12864-021-07401-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22802, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H03561, KAKENHI-PROJECT-20H04281
[雑誌論文] A mixture-of-experts deep generative model for integrated analysis of single-cell multiomics data2021
- 著者名/発表者名
  Minoura Kodai、Abe Ko、Nam Hyunha、Nishikawa Hiroyoshi、Shimamura Teppei
- 雑誌名
  
  Cell Reports Methods
  
  巻: 1(5) 号: 5 ページ: 100071-100071
- DOI
  10.1016/j.crmeth.2021.100071
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832
[雑誌論文] ARHGAP10, which encodes Rho GTPase-activating protein 10, is a novel gene for schizophrenia risk2020
- 著者名/発表者名
  Mariko Sekiguchi, Akiko Kodama,... Emiko Shishido,... Daisuke Mori, Norio Ozaki
- 雑誌名
  
  Translational psychiatry
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 1-15
- DOI
  10.1038/s41398-020-00917-z
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08072, KAKENHI-PROJECT-20K07082, KAKENHI-PROJECT-20K07965, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-18K14816, KAKENHI-PROJECT-20K16488, KAKENHI-PROJECT-20K16625, KAKENHI-PROJECT-19H05467, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-18H04040, KAKENHI-PROJECT-20H03611, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-17K07383, KAKENHI-PROJECT-18K15512, KAKENHI-PROJECT-19K16111, KAKENHI-PROJECT-16H06277, KAKENHI-PROJECT-17H04252, KAKENHI-PROJECT-18KT0022
[雑誌論文] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2020
- 著者名/発表者名
  Higashijima Y, Matsui Y, Shimamura T, Nakaki R, Nagai N, Tsutsumi S, Abe Y, Link VM, Osaka M, Yoshida M, Watanabe R, Tanaka T, Taguchi A, Miura M, Ruan X, Li G, Inoue T, Nangaku M, Kimura H, Furukawa T, Aburatani H, Wada Y, Ruan Y, Glass CK, Kanki Y
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal
  
  巻: 39 号: 7 ページ: 1-1
- DOI
  10.15252/embj.2019103949
- NAID
  120006902140
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K23850, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PLANNED-19H05744, KAKENHI-PROJECT-17H03614, KAKENHI-PROJECT-17J07088, KAKENHI-PROJECT-17K15991, KAKENHI-PROJECT-19K21297, KAKENHI-PROJECT-20K09448, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-20K17242, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-18H02803, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-19K22679, KAKENHI-ORGANIZER-19H05739, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-20H03432
[雑誌論文] CYBERTRACK2.0: zero-inflated model-based cell clustering and population tracking method for longitudinal mass cytometry data2020
- 著者名/発表者名
  Minoura K*, Abe K*, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T§
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: - 号: 11 ページ: 873-873
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btaa873
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-17K15738, KAKENHI-PROJECT-17H06162, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832
[雑誌論文] Model-based clustering for flow and mass cytometry data with clinical information2020
- 著者名/発表者名
  Abe K, Minoura K, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T§
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 21(Suppl 13) 号: S13 ページ: 393-393
- DOI
  10.1186/s12859-020-03671-7
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-17K15738, KAKENHI-PROJECT-17H06162

1. 島村徹平 (00623943)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
2. 倉石貴透 (90613167)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
3. 堀亜紀 (90825150)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
4. 小関準 (20616669)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 大野欽司

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
6. 東島恵美子(宍戸恵美子)

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
7. 永井直

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
8. 吉松康裕

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

阿部 興 Abe Ko

研究課題

研究成果

共同研究者

NF-κBに依存しない自然免疫誘導メカニズムの解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

腸内細菌叢と疾病の因果関係推定のための数理モデルの構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

多細胞ダイナミクスを紐解くベイズモデリング技術の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] An analysis modality for vascular structures combining tissue-clearing technology and topological data analysis2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Hierarchical non-negative matrix factorization using clinical information for microbial communities2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] A mixture-of-experts deep generative model for integrated analysis of single-cell multiomics data2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] ARHGAP10, which encodes Rho GTPase-activating protein 10, is a novel gene for schizophrenia risk2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

NAID

データソース

[雑誌論文] CYBERTRACK2.0: zero-inflated model-based cell clustering and population tracking method for longitudinal mass cytometry data2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Model-based clustering for flow and mass cytometry data with clinical information2020

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

阿部興 Abe Ko