島村徹平 SHIMAMURA Teppei

研究者番号	00623943
その他のID
所属 (現在)	2019年度: 名古屋大学, 医学系研究科, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2014年度 – 2019年度: 名古屋大学, 医学系研究科, 特任准教授 2017年度: 名古屋大学, 大学院医学系研究科, 特任准教授 2015年度: 名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授 2014年度 – 2015年度: 名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任准教授 2013年度: 東京大学, 医科学研究所, 助教
審査区分/研究分野	研究代表者生命・健康・医療情報学 / 生命・健康・医療情報学 / 生物系研究代表者以外複合領域 / 腫瘍生物学 / 小区分50010:腫瘍生物学関連
キーワード	研究代表者システム生物学 / バイオインフォマティクス / ネットワーク解析 / マルチオミクス / ベイズモデル / 次世代シークエンサー / 高次クロマチン構造 / エピゲノム / 遺伝子ネットワーク / 発現制御 … もっと見る研究代表者以外がん / システム生物学 / バイオインフォマティクス / 統計的モデリング / がん幹細胞 / 乳がん / ゲノム科学 / 遺伝統計学 / スーパーコンピュータ / 遺伝子ネットワーク / シークエンス解析 / 人工知能 / Single cell / cancer stem cells / breast cancer, / semaphoring, neuropilin / RNAシークエンス / シングルセル / 幹細胞 / 1細胞 / スフェロイド培養 / 遺伝子発現 / neuropilin / PDXモデル / がん微小環境 / 低pH / がん代謝 / 転写・代謝制御 / 転写制御 / ゲノム変異 / １細胞 / PDX / スフェロイド / トリプルネガティブ乳がん / IGF / セマフォリン / ニューロピリン隠す

精神疾患の階層横断的理解を加速する数理モデリング技術の開発研究代表者継続中
- 研究代表者
  
  島村徹平
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  名古屋大学
生命現象の階層横断的な理解を可能する統計的モデリング技術の開発研究代表者継続中
- 研究代表者
  
  島村徹平
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 研究機関
  名古屋大学
乳がんゲノム遺伝子変異と幹細胞性に基づく不均一性および階層性の統合解明継続中
- 研究代表者
  
  後藤典子
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分50010:腫瘍生物学関連
- 研究機関
  金沢大学
低pH腫瘍微小環境による悪性化機構の解明
- 研究代表者
  
  大澤毅
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2017
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  腫瘍生物学
- 研究機関
  東京大学
機能性ncRNA探索のための転写調節ネットワークアトラス研究代表者
- 研究代表者
  
  島村徹平
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  名古屋大学
スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索継続中
- 研究代表者
  
  宮野悟
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京大学
最小単位オミクス総合解析による乳がん組織多様性の解明
- 研究代表者
  
  後藤典子
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  腫瘍生物学
- 研究機関
  金沢大学
細胞内代謝シフトを解析、統合、理解するためのベイズモデリング研究代表者
- 研究代表者
  
  島村徹平
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2018
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  名古屋大学
高次エピゲノムが生み出す生命情報を読み解く統計解析法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  島村徹平
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  名古屋大学
   東京大学
計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成
- 研究代表者
  
  宮野悟
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2014
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京大学

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すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics2019
- 著者名/発表者名
  Shimamura Teppei、Matsui Yusuke、Kajino Taisuke、Ito Satoshi、Takahashi Takashi、Miyano Satoru
- 雑誌名
  
  LNBI
  
  巻: 10834 ページ: 124-137
- DOI
  10.1007/978-3-030-14160-8_13
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18151, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-16K16146
[雑誌論文] PRC2-mediated transcriptomic alterations at the embryonic stage govern tumorigenesis and clinical outcome in MYCN-driven neuroblastoma.2019
- 著者名/発表者名
  Hiraga T, Myoui A, Hashimoto N, Sasaki A, Hata K, Morita Y, Yoshikawa H, Rosen CJ, Mundy GR, Yoneda T.
- 雑誌名
  
  Cancer Res
  
  巻: 72(16) ページ: 1283-1295
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390505, KAKENHI-PROJECT-22300338, KAKENHI-PROJECT-22390296, KAKENHI-PROJECT-22501015, KAKENHI-PROJECT-22590052, KAKENHI-PROJECT-22590267, KAKENHI-PROJECT-22590268, KAKENHI-PROJECT-22659075, KAKENHI-PROJECT-23227005, KAKENHI-PROJECT-23240126, KAKENHI-PROJECT-23380186, KAKENHI-PROJECT-23590998, KAKENHI-PROJECT-23592444, KAKENHI-PROJECT-23659883, KAKENHI-PROJECT-23792052, KAKENHI-PROJECT-24390149, KAKENHI-PROJECT-24390209, KAKENHI-PROJECT-24390319, KAKENHI-PROJECT-24510304, KAKENHI-PROJECT-24590375, KAKENHI-PROJECT-24591172, KAKENHI-PROJECT-24592514, KAKENHI-PROJECT-24650446, KAKENHI-PROJECT-24659362, KAKENHI-PROJECT-24659491, KAKENHI-PROJECT-24790052, KAKENHI-PROJECT-24791180, KAKENHI-PROJECT-24791434, KAKENHI-PROJECT-24791439, KAKENHI-PROJECT-24890257, KAKENHI-PROJECT-25221205, KAKENHI-PROJECT-25461335, KAKENHI-PROJECT-25462202, KAKENHI-PROJECT-25462272, KAKENHI-PROJECT-25830072, KAKENHI-PROJECT-25830101, KAKENHI-PROJECT-25860293, KAKENHI-PROJECT-25861204, KAKENHI-PROJECT-25870071, KAKENHI-PROJECT-15K10275, KAKENHI-PROJECT-26461935, KAKENHI-PLANNED-22117002, KAKENHI-PUBLICLY-15H01197, KAKENHI-PUBLICLY-16H00749, KAKENHI-PROJECT-16H02470, KAKENHI-PROJECT-15H04294, KAKENHI-PROJECT-26293172, KAKENHI-PROJECT-26440068, KAKENHI-PROJECT-15K21282, KAKENHI-PROJECT-16K08984, KAKENHI-PROJECT-16K10584, KAKENHI-PLANNED-22112010, KAKENHI-PROJECT-17K11148, KAKENHI-PROJECT-17K12773, KAKENHI-PROJECT-17K16799, KAKENHI-PROJECT-17K16882, KAKENHI-PROJECT-17H04051, KAKENHI-PROJECT-18H02676, KAKENHI-PROJECT-15K06994, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16H06276
[雑誌論文] ENIGMA: An Enterotype-Like Unigram Mixture Model for Microbial Association Analysis.2019
- 著者名/発表者名
  Abe K, Hirayama H, Ohno K, Shimamura T.
- 雑誌名
  
  BMC Genomics
  
  巻: 20(Suppl 2) ページ: 191-191
- DOI
  10.1186/s12864-019-5476-9
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition2019
- 著者名/発表者名
  Matsui Yusuke、Miyano Satoru、Shimamura Teppei
- 雑誌名
  
  LNBI
  
  巻: 10834 ページ: 115-123
- DOI
  10.1007/978-3-030-14160-8_12
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18151, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-16K16146
[雑誌論文] A network of networks approach for modeling interconnected brain tissue-specific networks2019
- 著者名/発表者名
  Kawakubo H, Matsui Y, Kushima I, Ozaki N, Shimamura T.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: - ページ: 1-10
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btz032
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Regnase-1-mediated post-transcriptional regulation is essential for hematopoietic stem and progenitor cell homeostasis.2019
- 著者名/発表者名
  Kidoya H, Muramatsu F, Shimamura T, Jia W, Satoh T, Hayashi Y, Naito H, Kunisaki Y, Arai F, Seki M, Suzuki Y, Osawa T, Akira S., Takakura N.
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 10 ページ: 1072-1072
- DOI
  10.1038/s41467-019-09028-w
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04797, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04897, KAKENHI-PROJECT-16H02470, KAKENHI-PROJECT-17H04208, KAKENHI-PROJECT-18H02841, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-26710005
[雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics.2018
- 著者名/発表者名
  Shimamura T, Matsui Y, Kajino T, Ito S, Takahashi T, Miyano S.
- 雑誌名
  
  Lecture Notes in Bioinformatics
  
  巻: 10834 ページ: 115-123
- DOI
  10.1101/349928
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Prognostic relevance of genetic alterations in diffuse lower-grade gliomas.2018
- 著者名/発表者名
  Aoki Kosuke、Nakamura Hideo、Suzuki Hiromichi et al.
- 雑誌名
  
  Neuro Oncol.
  
  巻: 20 ページ: 66-67
- DOI
  10.1093/neuonc/nox132
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K10761, KAKENHI-PROJECT-17K16643, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17H00758, KAKENHI-PROJECT-16H05436, KAKENHI-PROJECT-15K10337, KAKENHI-PROJECT-17K10862, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition.2018
- 著者名/発表者名
  Matsui Y, Miyano S, Shimamura T.
- 雑誌名
  
  Lecture Notes in Bioinformatics
  
  巻: 10834 ページ: 124-137
- DOI
  10.1101/149252
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] ATR inhibition controls aggressive prostate tumors deficient in Y-linked histone demethylase KDM5D2018
- 著者名/発表者名
  Komura K、Yoshikawa Y, Shimamura T, Chakraborty G, Gerke TA, Hinohara K, Chadalavada K, Jeong SH, Armenia J, Du SY, Mazzu YZ, Taniguchi K, Ibuki N, Meyer CA, Nanjangud GJ, Inamoto T, Lee GM, Mucci LA, Azuma H, Sweeney CJ, Kantoff PW.
- 雑誌名
  
  J Clin Invest128(7)
  
  巻: 128(7) ページ: 2979-2995
- DOI
  10.1172/jci96769
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K11033, KAKENHI-PROJECT-18K16716, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-17K16821
[雑誌論文] Integrated molecular characterization of the lethal pediatric cancer pancreatoblastoma.2018
- 著者名/発表者名
  Isobe T, Seki M, Yoshida K, Sekiguchi M, Shiozawa Y, Shiraishi Y,..., Kataoka K, Sato Y, Kawai T, Chiba K, Tanaka H, Shimamura T, Kato M, Iguchi A, Hama A, Taguchi T, Akiyama M, Fujimura J, Inoue A, Ito T, Deguchi T, Kiyotani C, Iehara T, Hosoi H, Oka A, Sanada M, Tanaka Y, Hata K, Miyano S, Ogawa S, Takita J
- 雑誌名
  
  Cancer Research
  
  巻: 78(4) ページ: 865-876
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-17-2581
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17H04224, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Adaptive NetworkProfiler for Identifying Cancer Characteristic-Specific Gene Regulatory Networks.2018
- 著者名/発表者名
  Park H, Shimamura T, Imoto S, Miyano S
- 雑誌名
  
  Journal of Computational Biology
  
  巻: 25(2) ページ: 130-145
- DOI
  10.1089/cmb.2017.0120
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] A temporal shift of the evolutionary principle shaping intratumor heterogeneity in colorectal cancer.2018
- 著者名/発表者名
  Saito T, Niida A, Uchi R, Hirata H, Kodama M, Okimoto T, Murakami K, Suzuki Y, Ogawa S, Miyano S, Mimori K, et al.
- 雑誌名
  
  Nat Commun
  
  巻: 9 ページ: 1-10
- DOI
  10.1038/s41467-018-05226-0
- NAID
  120006551763
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K08695, KAKENHI-PROJECT-18K07946, KAKENHI-PROJECT-18K08009, KAKENHI-PROJECT-18K08649, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K10543, KAKENHI-PROJECT-17K19608
[雑誌論文] Dynamically and epigenetically coordinated GATA/ETS/SOX transcription factor expression is indispensable for endothelial cell differentiation2018
- 著者名/発表者名
  Kanki Y, Nakaki R, Shimamura T, Matsunaga T, Yamamizu K, Katayama S, Suehiro JI, Osawa T, Aburatani H, Kodama T, Wada Y, Yamashita JK, Minami T.
- 雑誌名
  
  Nucleic Acids Res.
  
  巻: 印刷中ページ: 4344-4358
- DOI
  10.1093/nar/gkx159
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H01348, KAKENHI-PROJECT-26250041, KAKENHI-PROJECT-26290035, KAKENHI-PROJECT-26710013, KAKENHI-PROJECT-26430121, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K15438, KAKENHI-PROJECT-15KK0251, KAKENHI-PROJECT-26710005, KAKENHI-PUBLICLY-16H01567, KAKENHI-PROJECT-17H03580, KAKENHI-PROJECT-17H03614, KAKENHI-PROJECT-16K14605, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] A latent allocation model for the analysis of microbial composition and disease2018
- 著者名/発表者名
  Abe K, Hirayama H, Ohno K, Shimamura T.
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 19(Suppl 19) ページ: 519-519
- DOI
  10.1186/s12859-018-2530-6
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Comparative analyses of copy-number variation in autism spectrum disorder and schizophrenia reveal etiological overlap and biological insights2018
- 著者名/発表者名
  Kushima I, (27名中略）, Hashimoto R,(80名中29番目) , et al.
- 雑誌名
  
  Cell Rep.
  
  巻: 24(11) ページ: 2838-2838
- DOI
  10.1016/j.celrep.2018.08.022
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KT0022, KAKENHI-PROJECT-16K10248, KAKENHI-PROJECT-17K10295, KAKENHI-PROJECT-18K07590, KAKENHI-PROJECT-16K19763, KAKENHI-PROJECT-17K16403, KAKENHI-PROJECT-15KK0339, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-17H00883, KAKENHI-PROJECT-16H05375, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-17H05090, KAKENHI-PROJECT-16K08421, KAKENHI-PROJECT-16K09965, KAKENHI-PROJECT-16K15554, KAKENHI-PROJECT-16K19759, KAKENHI-PROJECT-16K21046, KAKENHI-PROJECT-18K15512, KAKENHI-PROJECT-26293261
[雑誌論文] Identification of Cardiomyocyte-Fated Progenitors from Human-Induced Pluripotent Stem Cells Marked with CD82.2018
- 著者名/発表者名
  Takeda Masafumi、Kanki Yasuharu、Masumoto Hidetoshi、Funakoshi Shunsuke、Hatani Takeshi、Fukushima Hiroyuki、Izumi-Taguchi Akashi、Matsui Yusuke、Shimamura Teppei、Yoshida Yoshinori、Yamashita Jun K.
- 雑誌名
  
  Cell Rep
  
  巻: 22 ページ: 546-556
- DOI
  10.1016/j.celrep.2017.12.057
- NAID
  120006460050
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K15438, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15H04819, KAKENHI-PROJECT-17H03614, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K19402, KAKENHI-PROJECT-15KK0251, KAKENHI-PROJECT-18K18151, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16K16146
[雑誌論文] ER stress signaling promotes the survival of cancer 'persister cells' tolerant to EGFR tyrosine kinase inhibitors.2017
- 著者名/発表者名
  Terai Hideki、Kitajima Shunsuke、Potter Danielle S.、Matsui Yusuke、et al.
- 雑誌名
  
  Cancer Res
  
  巻: 78 ページ: 1044-1057
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-17-1904
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K16146, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] High-resolution copy number variation analysis of schizophrenia in Japan2017
- 著者名/発表者名
  Kushima I, Aleksic B, Nakatochi M, Shimamura T, Shiino T, Yoshimi A, Kimura H, Takasaki Y, Wang C, Xing J, Ishizuka K, Oya-Ito T, Nakamura Y, Arioka Y, Maeda T, Yamamoto M, Yoshida M, Noma H, Hamada S, Morikawa M, Uno Y, Okada T, Iidaka T, Iritani S, Yamamoto T,
- 雑誌名
  
  Molecular psychiatry
  
  巻: 22 ページ: 1-11
- DOI
  10.1038/mp.2016.88
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-24116001, KAKENHI-PLANNED-24116002, KAKENHI-ORGANIZER-25117001, KAKENHI-PROJECT-25253074, KAKENHI-PROJECT-16H05375, KAKENHI-PROJECT-16H05380, KAKENHI-PROJECT-26461742, KAKENHI-PROJECT-15K14973, KAKENHI-PROJECT-15K19720, KAKENHI-PROJECT-15K09802, KAKENHI-PROJECT-24500986, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K08421, KAKENHI-PROJECT-17K10295, KAKENHI-PLANNED-25117010, KAKENHI-PROJECT-16K15559
[雑誌論文] Long Noncoding RNA JHDM1D-AS1 Promotes Tumor Growth by Regulating Angiogenesis in Response to Nutrient Starvation.2017
- 著者名/発表者名
  Kondo A, Nonaka A, Shimamura T, Yamamoto S, Yoshida T, Kodama T, Aburatani H, Osawa T
- 雑誌名
  
  Mol Cell Biol
  
  巻: 37
- DOI
  10.1128/mcb.00125-17
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K14987, KAKENHI-PROJECT-26710005, KAKENHI-PUBLICLY-16H01567, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K14605, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Recurrent SPI1 (PU.1) Fusions in High-risk Pediatric T Cell Acute Lymphoblastic Leukemia2017
- 著者名/発表者名
  Seki M, Kimura S, Isobe T, Yoshida K, (13 authors), Masuda K, Kawamoto H, Ohki K, Kato M, Arakawa Y, Koh K, Hanada R, Moritake H, Akiyama M, Kobayashi R, Deguchi T, Hashii Y, Imamura T, Sato A, Kiyokawa N, Oka A, Hayashi Y, Takagi M, Manabe A, Ohara A, Horibe K, Sanada M, Iwama A, Mano H, Miyano S, Ogawa S, Takita J
- 雑誌名
  
  Nature genetis
  
  巻: 49 ページ: 1274-1281
- DOI
  10.1038/ng.3900
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K09870, KAKENHI-PROJECT-17K10130, KAKENHI-PROJECT-17K10136, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H02544, KAKENHI-PROJECT-17H04224, KAKENHI-PROJECT-17H04234, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K15498, KAKENHI-PROJECT-16K19574, KAKENHI-PROJECT-17K16242, KAKENHI-PROJECT-15H05707, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Japanese genome-wide association study identifies a significant colorectal cancer susceptibility locus at chromosome 10p142017
- 著者名/発表者名
  Takahashi Y, Sugimachi K, Yamamoto K, Niida A, Shimamura T, Sato T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Sugihara K, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Moriya Y, Suzuki Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  Cancer Sci
  
  巻: 108(11) ページ: 2239-2247
- DOI
  10.1111/cas.13391
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-17K12773, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] PRC2-mediated transcriptomic alterations at the embryonic stage govern tumorigenesis and clinical outcome in MYCN-driven neuroblastoma.2017
- 著者名/発表者名
  2.Tsubota S, Kishida S, Shimamura T, Ohira M, Yamashita S, Cao D, Kiyonari S, Ushijima T, Kadomatsu K.
- 雑誌名
  
  Cancer Research
  
  巻: 77 ページ: 5259-5271
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-16-3144
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K08617, KAKENHI-PROJECT-17K10131, KAKENHI-PROJECT-16H05139, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K18442
[雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition2017
- 著者名/発表者名
  Matsui Yusuke, Miyano Satoru, Shimamura Teppei
- 雑誌名
  
  Proceedings of CIBB2017
  
  巻: 1 ページ: 1-6
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[雑誌論文] Extracellular Acidic pH Activates the Sterol Regulatory Element-Binding Protein 2 to Promote Tumor Progression2017
- 著者名/発表者名
  Kondo A, Yamamoto S, Nakaki R, Shimamura T, Hamakubo T, Sakai J, Kodama T, Yoshida T, Aburatani H and Osawa T
- 雑誌名
  
  Cell Rep
  
  巻: 18 ページ: 2228-2242
- DOI
  10.1016/j.celrep.2017.02.006
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-16H01567, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-26710005, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K14605, KAKENHI-PROJECT-16H06390, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Comprehensive genetic analysis of donor cell derived leukemia with KMT2A rearrangement.2017
- 著者名/発表者名
  Taniguchi R, Muramatsu H, Okuno Y, Suzuki K, Obu S, Nakatochi M, Shimamura T, Takahashi Y, Horikoshi Y, Watanabe K, Kojima S.
- 雑誌名
  
  Pediatr Blood Cancer
  
  巻: 65(2)
- DOI
  10.1002/pbc.26823
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] ddiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells.2017
- 著者名/発表者名
  Tominaga K, Shimamura T, Kimura N, Murayama T, Matsubara D, Kanauchi H, Niida A, Shimizu S, Nishioka K, Tsuji E, Yano M, Sugano S, Shimono Y, Ishii H, Saya H, Mori M, Akashi K, Tada K, Ogawa T, Tojo A, Miyano S, Gotoh N.
- 雑誌名
  
  Oncogene
  
  巻: 36 ページ: 1276-1286
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H04294
[雑誌論文] Addiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells.2017
- 著者名/発表者名
  Tominaga K, Shimamura T, Kimura N, Murayama T, Matsubara D, Kanauchi H, Niida A, Shimizu S, Nishioka K, Tsuji EI, Yano M, Sugano S, Shimono Y, Ishii H, Saya H, Mori M, Akashi K, Tada KI, Ogawa T, Tojo A, Miyano S, Gotoh N
- 雑誌名
  
  Oncogene.
  
  巻: 36(9) ページ: 1276-1286
- DOI
  10.1038/onc.2016.293
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-16H06391, KAKENHI-PROJECT-16J40231, KAKENHI-PROJECT-15K14381, KAKENHI-PROJECT-16K08672, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics2017
- 著者名/発表者名
  Shimamura Teppei, Matsui Yusuke, Kajino Taisuke, Takahashi Takashi, Miyano Satoru
- 雑誌名
  
  Proceedings of CIBB2017
  
  巻: 1 ページ: 1-6
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[雑誌論文] phyC: Clustering cancer evolutionary trees2017
- 著者名/発表者名
  Matsui Y, Niida A, Uchi R, Mimori K, Miyano S, Shimamura T:
- 雑誌名
  
  PLoS Comput Biol
  
  巻: 13(5) ページ: 1005509-1005509
- DOI
  10.1371/journal.pcbi.1005509
- 査読あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-16K16146, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Aberrant Methylation of FOXE1 Contributes to a Poor Prognosis for Patients with Colorectal Cancer2016
- 著者名/発表者名
  Sugimachi K, Matsumura T, Shimamura T, Hirata H, Uchi R, Ueda M, Sakimura S, Iguchi T, Eguchi H, Masuda T, Morita K, Takenaka K, Maehara Y, Mori M, Mimori K.
- 雑誌名
  
  Annals of Surgical Oncology
  
  巻: 23(12) ページ: 3948-3955
- DOI
  10.1245/s10434-016-5289-x
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K10543, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] NECAB3 Promotes Activation of Hypoxia-inducible factor-1 during Normoxia and Enhances Tumourigenicity of Cancer Cells.2016
- 著者名/発表者名
  1.Nakaoka HJ, Hara T, Yoshino S, Kanamori A, Matsui Y, Shimamura T, Sato H, Murakami Y, Seiki M, Sakamoto T
- 雑誌名
  
  Scientific Reports,
  
  巻: 6 ページ: 0-0
- DOI
  10.1038/srep22784
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K06829, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-24591313, KAKENHI-PROJECT-25460382, KAKENHI-PROJECT-26640121, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25290051, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16H04695
[雑誌論文] A likelihood-free filtering method via approximate Bayesian computation in evaluating biological simulation models2016
- 著者名/発表者名
  Hasegawa T, Niida A, Mori T, Shimamura T, Yamaguchi R, Miyano S, Akutsu T, Imoto S
- 雑誌名
  
  Computational Statistics and Data Analysis
  
  巻: 94 ページ: 63-74
- DOI
  10.1016/j.csda.2015.08.003
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H06008, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] D3M: detection of differential distributions of methylation levels2016
- 著者名/発表者名
  Matsui Y, Mizuta M, Miyano S, Shimamura T
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 印刷中ページ: 2248-2255
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btw138
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-25540008, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Genomic landscape of esophageal squamous cell carcinoma a Japanese population2016
- 著者名/発表者名
  Sawada G, Niida A, Uchi R, Hirata H, Shimamura T, (38 authors), Mimori K
- 雑誌名
  
  Gastroenterology.
  
  巻: 150(5) ページ: 1049-1051
- DOI
  10.1053/j.gastro.2016.01.035
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-14J10908, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003, KAKENHI-PROJECT-25290043, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-16H04692, KAKENHI-PROJECT-26293303, KAKENHI-PROJECT-26461994, KAKENHI-PROJECT-15K15496, KAKENHI-PROJECT-15K05577
[雑誌論文] Integrated multiregional analysis proposing a new model of colorectal cancer evolution2016
- 著者名/発表者名
  R. Uchi (他40名, 山本36番目)
- 雑誌名
  
  PLoS Genet
  
  巻: 12 ページ: 1005778-1005778
- DOI
  10.1371/journal.pgen.1005778
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K10150, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H05707, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-25462038, KAKENHI-PROJECT-25462070, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521, KAKENHI-PROJECT-26861003, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-26461994, KAKENHI-PROJECT-15K19899, KAKENHI-PROJECT-15K10170, KAKENHI-PROJECT-15H05325
[雑誌論文] Mutational landscape and clonal architecture in grade-II/III gliomas.2015
- 著者名/発表者名
  Suzuki H, Aoki K, Natsume A, Ogawa S. et al.
- 雑誌名
  
  Nat Genet
  
  巻: 47 ページ: 458-468
- DOI
  10.1038/ng.3273
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134006, KAKENHI-PLANNED-23107010, KAKENHI-PROJECT-24390341, KAKENHI-PROJECT-15K10337, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K19964, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-26640088, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25861268, KAKENHI-PROJECT-25290048
[雑誌論文] An Integrative Analysis to Identify Driver Genes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma.2015
- 著者名/発表者名
  Sawada G, Niida A, Hirata H, Komatsu H, Uchi R, Shimamura T, Takahashi Y, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Takano Y, Ueda M, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Yamasaki M, Tanaka F, Tachimori Y, Kajiyama Y, Natsugoe S, Fujita H, Tanaka Y, Calin G, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  PLoS One.
  
  巻: 10(10)
- DOI
  10.1371/journal.pone.0139808
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003
[雑誌論文] Comparison of chemotherapeutic agents as a myeloablative conditioning with TBI for pediatric ALL: a study from the pediatric ALL working group of the JSHCT.2015
- 著者名/発表者名
  Seki M, Nishimura R, Yoshida K, Shimamura T, Shiraishi Y, Sato Y, Kato M, Chiba K, Tanaka H, Hoshino N, Nagae G, Shiozawa Y, Okuno Y, Hosoi H, Tanaka Y, Okita H, Miyachi M, Souzaki R, Taguchi T, Koh K, Hanada R, Kato K, Nomura Y, Akiyama M, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Aburatani H, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J.
- 雑誌名
  
  Pediatr Blood Cancer.
  
  巻: 6 ページ: 1844-50
- DOI
  10.1038/ncomms8557
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08987, KAKENHI-PROJECT-26461566, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-25461611, KAKENHI-PROJECT-25670482, KAKENHI-PROJECT-26670493, KAKENHI-PROJECT-26670766, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521, KAKENHI-PROJECT-26293242
[雑誌論文] Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks2015
- 著者名/発表者名
  Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T
- 雑誌名
  
  MC Syst Biol
  
  巻: 9(1) ページ: 14-14
- NAID
  120005749949
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Integrated molecular analysis of adult T-cell leukemia/lymphoma.2015
- 著者名/発表者名
  Kataoka K, Nagata Y, Kitanaka A, Shiraishi Y, Shimamura T, Yasunaga J, Totoki Y, Chiba K, Sato-Otsubo A, Nagae G, et al.
- 雑誌名
  
  Nat Genet
  
  巻: 47(11) ページ: 1304-1315
- DOI
  10.1038/ng.3415
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K08987, KAKENHI-PROJECT-15K09479, KAKENHI-PROJECT-15K09507, KAKENHI-PROJECT-26460554, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-25250020, KAKENHI-PROJECT-26893127, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521, KAKENHI-PROJECT-25293219
[雑誌論文] Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks2015
- 著者名/発表者名
  Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T.
- 雑誌名
  
  BMC Systems Biology
  
  巻: 9 ページ: 14-14
- DOI
  10.1186/s12918-015-0154-2
- NAID
  120005749949
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24300111, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] High performance computing of a fusion gene detection pipeline on the K computer2015
- 著者名/発表者名
  Ito S, Shiraishi Y, Shimamura T, Chiba K, Miyano S
- 雑誌名
  
  BIBM
  
  巻: 2015 ページ: 1441-1447
- DOI
  10.1109/bibm.2015.7359888
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-15H05912
[雑誌論文] Elevated beta-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs.2015
- 著者名/発表者名
  Nakata A, Yoshida R, Yamaguchi R, Yamauchi M, Tamada Y, Fujita A, Shimamura T, Imoto S, Higuchi T, Nomura M, Kimura T, Nokihara H, Higashiyama M, Kondoh K, Nishihara H, Tojo A, Yano S, Miyano S, Gotoh N
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 5 ページ: 13076-13076
- DOI
  10.1038/srep13076
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K18426, KAKENHI-PROJECT-15K20965, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04294, KAKENHI-PROJECT-26640072, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] Loss of CDCP1 expression promotes invasiveness and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma2014
- 著者名/発表者名
  Sawada G, Takahashi Y, Niida A, Shimamura T, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Uchi R, Takano Y, Ueda M, Hirata H, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  Ann Surg Oncol
  
  巻: 21 Suppl 4 ページ: 640-647
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Robust prediction of anti-cancer drug sensitivity and sensitivity-specific biomarker2014
- 著者名/発表者名
  Park H, Shimamura T, Miyano S, Imoto S
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 9(10)
- DOI
  10.1371/journal.pone.0108990
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] Allelic Imbalance at an 8q24 Oncogenic SNP is involved in activating MYC in human colorectal cancer2014
- 著者名/発表者名
  Sugimachi K, Niida A, Yamamoto K, Shimamura T, Imoto S, Iinuma H, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Sugihara K, Maehara Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  Ann Surg Oncol
  
  巻: 21 Suppl 4 ページ: 515-521
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Loss of CDCP1 expression promotes invasiveness and poor prognosis in esophageal2014
- 著者名/発表者名
  Sawada G, Takahashi Y, Niida A, Shimamura T, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Uchi R, Takano Y, Ueda M, Hirata H, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K.
- 雑誌名
  
  Ann Surg Oncol
  
  巻: 4 ページ: 640-647
- DOI
  10.1245/s10434-014-3740-4
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24592005, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003
[雑誌論文] Robust prediction of anti-cancer drug sensitivity and sensitivity-specific biomarker2014
- 著者名/発表者名
  Park H, Shimamura T, Miyano S, Imoto S
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 9(1)
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Allelic imbalance at an 8q24 oncogenic SNP is involved in activating MYC in human colorectal cancer2014
- 著者名/発表者名
  Sugimachi K, Niida A, Yamamoto K, Shimamura T, Imoto S, Iinuma H, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Sugihara K, Maehara Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
- 雑誌名
  
  Ann Surg Oncol.
  
  巻: 21 ページ: 3468-3476
- DOI
  10.1245/s10434-013-3468-6
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24591984, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma.2014
- 著者名/発表者名
  Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
- 雑誌名
  
  Cancer Res.
  
  巻: 74 ページ: 2742-2749
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-13-2470
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23390269, KAKENHI-PROJECT-25253095, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26293242, KAKENHI-PROJECT-26670493
[雑誌論文] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma2014
- 著者名/発表者名
  Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
- 雑誌名
  
  Cancer Res.
  
  巻: 74（１０）ページ: 2742-2749
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Integrated molecular analysis of clear-cell renalcell carcinoma2014
- 著者名/発表者名
  Sato Y, Yoshida K
- 雑誌名
  
  Nat Genet
  
  巻: 45 ページ: 860-7
- DOI
  10.1038/ng.2699
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J04216, KAKENHI-PLANNED-22134008, KAKENHI-PLANNED-24112006, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-24700272, KAKENHI-PROJECT-25291023, KAKENHI-PROJECT-25670446, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521
[雑誌論文] Systems biology analysis of Drosophila in vivo screen data elucidates core networks for DNA damage repair in SCA12014
- 著者名/発表者名
  Barclay, S.S., Tamura, T., Ito H., Fujita, K., Tagawa, K., Shimamura, T., Katsuta, A., Shiwaku, H., Sone, M., Imoto, S., Miyano, S. and Okazawa, H.
- 雑誌名
  
  Hum Mol Genet.
  
  巻: 23 ページ: 1345-1364
- DOI
  10.1093/hmg/ddt524
- 査読あり / オープンアクセスとしている
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-22110001, KAKENHI-PLANNED-22110002, KAKENHI-PROJECT-23500401, KAKENHI-PROJECT-24500378, KAKENHI-PROJECT-24700374, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] The tumor-suppressive miR-497-195 cluster targets multiple cell-cycle regulators in hepatocellular carcinoma2013
- 著者名/発表者名
  Furuta M
- 雑誌名
  
  PLOS One
  
  巻: 8
- DOI
  10.1371/journal.pone.0060155
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-22130001, KAKENHI-PLANNED-22134002, KAKENHI-PROJECT-22240090, KAKENHI-PROJECT-23390077, KAKENHI-PROJECT-25250019, KAKENHI-PROJECT-25253081, KAKENHI-PROJECT-25640062, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Recurrent mutations in multiple components of the cohesin complex in myeloid neoplasms2013
- 著者名/発表者名
  Kon A, Shih LY, Sanada M, Shiraishi Y, Okuno Y, Nagae G, Nishimoto A, Nowak D, Sato Y, Shimamura T, Tanaka H, Chiba K, Yamaguchi T, Otsu M, Obara N, Nakamaki T, Ishiyama K, Nolte F, Hofmann WK, Miyawaki S, Chiba S, Mori H, Nakauchi H, Koeffler HP, Aburatani H, Haferlach T, Shirahige K, Miyano S, Ogawa S.
- 雑誌名
  
  Nature Genet.
  
  巻: 45(10) ページ: 1232-1237
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Recurrent mutations in multiple components of the cohesin complex inmyeloid neoplasms2013
- 著者名/発表者名
  Kon A, Yoshida K
- 雑誌名
  
  Nature Genetics
  
  巻: 45 ページ: 1232-1237
- DOI
  10.1038/ng.2731
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J04216, KAKENHI-PLANNED-22134003, KAKENHI-PLANNED-22134006, KAKENHI-PROJECT-22221009, KAKENHI-PLANNED-23106004, KAKENHI-PROJECT-23249052, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-24249056, KAKENHI-PROJECT-24390242, KAKENHI-PROJECT-24659458, KAKENHI-PROJECT-25290065, KAKENHI-PROJECT-25461408, KAKENHI-PROJECT-25670446, KAKENHI-PROJECT-25670471, KAKENHI-PROJECT-25670489, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521
[雑誌論文] Plastin3 is a novel marker for circulating tumor cells undergoing the epithelial-mesenchymal transition and is associated with colorectal cancer prognosis2013
- 著者名/発表者名
  Yokobori T, Iinuma H, Shimamura T, Imoto S, Sugimachi K, Ishii H, Iwatsuki M, Ota D, Ohkuma M, Iwaya T, Nishida N, Kogo R, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Toh H, Sato T, Barnard GF, Fukagawa T, Yamamoto S, Nakanishi H, Sasaki S, Miyano S, Watanabe T, Kuwano H, Mimori K, Pantel K, Mori M.
- 雑誌名
  
  Cancer Res.
  
  巻: 1; 73(7) ページ: 2059-2069
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-12-0326
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23591937, KAKENHI-PLANNED-24108006, KAKENHI-PROJECT-24591984, KAKENHI-PROJECT-25430111, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-25730173
[雑誌論文] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor-associated macrophages2013
- 著者名/発表者名
  Shimamura T, Wang F, Suehiro J, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M
- 雑誌名
  
  Cancer Research
  
  巻: 73 ページ: 3019-28
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-12-3231
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23300342, KAKENHI-PROJECT-23701047, KAKENHI-PUBLICLY-24116509, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-24650609, KAKENHI-PROJECT-24700969, KAKENHI-PROJECT-24710227, KAKENHI-PUBLICLY-25118505, KAKENHI-PUBLICLY-25125707, KAKENHI-PUBLICLY-25134706, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25893063
[雑誌論文] Integrated molecular analysis of clear-cell renal cell carcinoma2013
- 著者名/発表者名
  Sato Y, Yoshizato T, Shiraishi Y, Maekawa S, Okuno Y, Kamura T, Shimamura T, Sato-Otsubo A, Nagae G, Suzuki H, Nagata Y, Yoshida K, Kon A, Suzuki Y, Chiba K, Tanaka H, Niida A, Fujimoto A, Tsunoda T, Morikawa T, Maeda D, Kume H, Sugano S, Fukayama M, Aburatani H, Sanada M, Miyano S, Homma Y, Ogawa S.
- 雑誌名
  
  Nature Genet.
  
  巻: 45(8) ページ: 860-867
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor associated macrophages2013
- 著者名/発表者名
  Osawa T, Tsuchida R, Muramatsu M, Shimamura T, Wang F, Suehiro JI, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M.
- 雑誌名
  
  Cancer Res.
  
  巻: 73(10) ページ: 3019-3028
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Plastin3 is a novel marker for circulating tumor cells undergoing the epithelial-mesenchymal transition and is associated with colorectal cancer prognosis2013
- 著者名/発表者名
  Yokobori T, Iinuma H, Shimamura T, Imoto S, Sugimachi K, Ishii H, Iwatsuki M, Ota D, Ohkuma M, Iwaya T, Nishida N, Kogo R, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Toh H, Sato T, Barnard GF, Fukagawa T, Yamamoto S, Nakanishi H, Sasaki S, Miyano S, Watanabe T, Kuwano H, Mimori K, Pantel K, Mori M
- 雑誌名
  
  Cancer Res.
  
  巻: 73(7) ページ: 2059-2069
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Epidermal growth factor receptor tyrosine kinase defines criticalprognostic genes of stage I lung adenocarcinoma2012
- 著者名/発表者名
  後藤　典子
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 7
- DOI
  10.1371/journal.pone.0043923
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22130009, KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PROJECT-23390062, KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Identifying Gene pathways associated with cancer characteristics via sparse statistical methods2012
- 著者名/発表者名
  Kawano S, Shimamura T, Niida A, Imoto S, Yamaguchi R, Nagasaki M, Yoshida R, Print C, Miyano S
- 雑誌名
  
  IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
  
  巻: 9(4) ページ: 966-972
- DOI
  10.1109/tcbb.2012.48
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Statistical model-based testing to evaluate the recurrence of genomic aberrations2012
- 著者名/発表者名
  Niida A, Imoto S, Shimamura T, Miyano S
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 28(12)
- DOI
  10.1093/bioinformatics/bts203
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] N-cadherin expression is a potential survival mechanism of gefitinib-resistant lung cancer cells2011
- 著者名/発表者名
  Yamauchi M, Yoshino I, Yamaguchi R, Shimamura T, Nagasaki M, Imoto S, Niida A, Koizumi F, Kohno T, Yokota J, Miyano S, Gotoh N
- 雑誌名
  
  Am J Cancer Res
  
  巻: 1(7) ページ: 828-833
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] SiGN : large-scale gene network estimation environment for high performance computing2011
- 著者名/発表者名
  Tamada Y, Shimamura T, Yamaguchi R, Imoto S, Nagasaki M, Miyano S
- 雑誌名
  
  Genome Informatics
  
  巻: 25 ページ: 40-52
- NAID
  130004567842
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Inferring contagion in regulatory networks2011
- 著者名/発表者名
  Fujita A, Sato JR, Demas MAA, Yamaguchi R, Shimamura T, Ferreira CE, Sogayar, MC, Miyano S
- 雑誌名
  
  IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
  
  巻: 8(2) ページ: 570-576
- DOI
  10.1109/tcbb.2010.40
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] A novel network profiling analysis reveals system changes in epithelial-mesenchymal transition2011
- 著者名/発表者名
  Shimamura, T., Imoto, S., Shimada, Y., Hosono, Y., Niida, A., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Takahashi, T., Miyano, S
- 雑誌名
  
  PLoS ONE
  
  巻: 6
- DOI
  10.1371/journal.pone.0020804
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21249037, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PLANNED-22134005
[雑誌論文] Inferring dynamic gene networks under varying conditions for transcriptomic network comparison2010
- 著者名/発表者名
  Shimamura, T., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Miyano, S.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 26(8) ページ: 1064-1072
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Discovering functional gene pathways associated with cancer heterogeneity via sparse supervised learning2010
- 著者名/発表者名
  Kawano, S., Shimamura, T., Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Yoshida, R., Print, C., Miyano, S.
- 雑誌名
  
  Proc.IEEE 10th International Symposium on Bioinformatics & Bioengineering
  
  ページ: 253-258
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Collocation-based sparse estimation for constructing dynamic gene networks2010
- 著者名/発表者名
  Shimamura, T., Imoto, S., Nagasaki, M., Yamauchi, M., Yamaguchi, R., Fujita, A., Tamada, Y, Gotoh, N., Miyano, S.
- 雑誌名
  
  Genome Informatics
  
  巻: 24 ページ: 164-178
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[雑誌論文] Model-free unsupervised gene set screening based on information enrichment in expression profiles2010
- 著者名/発表者名
  Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Fujita, A., Shimamura, T., Miyano, S.
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 26(24) ページ: 3090-3097
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22134004
[学会発表] 腫瘍内不均一性の一細胞トランスクリプトーム解析のためのバイオインフォマティクス2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第77回日本癌学会学術総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
[学会発表] がん微小環境における細胞間相互作用のモデリング2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  2018年度統計関連学会連合大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] バイオインフォマティクスにおけるスパースモデリング2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  日本行動計量学会　第46回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
[学会発表] がん免疫システムの時間・空間・個体間多様性を読み解くデータサイエンス2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
[学会発表] Sparse Regression Modeling of Drug Response with A Localized Estimation Framework2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  The Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
[学会発表] データサイエンスとの連携・融合による生命科学研究の新時代2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第61回日本神経化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] がん免疫システムの時間・空間・個体間多様性を読み解くデータサイエンス2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第41回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] 疾患メタゲノム解析のためのベイズモデリング2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第7回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
[学会発表] Sparse Regression Modeling of Drug Response with A Localized Estimation Framework2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  The Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2018
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] バイオインフォマティクスにおけるスパースモデリング2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  日本行動計量学会　第46回大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] データサイエンスとの連携・融合による生命科学研究の新時代2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第61回日本神経化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
[学会発表] 疾患メタゲノム解析のためのベイズモデリング2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第7回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] がん微小環境における細胞間相互作用のモデリング2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  2018年度統計関連学会連合大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
[学会発表] 腫瘍内不均一性の一細胞トランスクリプトーム解析のためのバイオインフォマティクス2018
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第77回日本癌学会学術総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] 生命科学におけるビッグデータ駆動型科学の実践と将来2017
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  2017年度生命科学系学会合同年次大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] 生命科学におけるビッグデータ駆動型科学の実践と将来2017
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  2017年度生命科学系学会合同年次大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] GIMLET: Identifying Biological Modulators in Context-Specific Gene Regulation Using Local Energy Statistics2017
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  CIBB2017(Computational Intelligence methods for Bioinformatics and Biostatistics)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] Sparse Regression Modeling of Drug Response with A Localized Estimation Framework2017
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  ISMB/ECCB2017(Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16TH European Conference on Computational Biology)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] システム生物学的アプローチに基づくオミックス統合解析2016
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第３９回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] システム生物学的アプローチに基づくオミックス統合解析2016
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第３９回分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] 局所距離相関に基づくモジュレーター因子の網羅的探索法2016
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  2016年度統計関連学会連合大会
- 発表場所
  金沢大学（石川県金沢市）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] Identifying biological modulators using local energy statistics2016
- 著者名/発表者名
  Teppei Shimamura
- 学会等名
  CMStatistics 2016 (ERCIM2016)
- 発表場所
  セビリア大学（スペイン、セビリア）
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] マルチオミックス情報に基づくがんのモジュレーター因子の網羅的探索2016
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第５回生命医薬情報学連合大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] マルチオミックス情報に基づくがんのモジュレーター因子の網羅的探索2016
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第5回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  東京国際交流館プラザ平成（東京都江東区）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] Analysis of Big Data - Genome Data -2016
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  実世界データ循環学サマースクール2016
- 発表場所
  ハノイ工科大学（ベトナム、ハノイ）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] がんの俯瞰的理解のための統合的統計モデリング2015
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第38回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
- 年月日
  2015-12-02
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] オミックスビッグデータ解析の現状と課題2015
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  平成２６年度「複雑データの解析法に関する研究会」
- 発表場所
  統計数理研究所（東京都立川市）
- 年月日
  2015-02-19
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] Bayesian integrated analysis of chromatin interaction maps2015
- 著者名/発表者名
  Shimamura T
- 学会等名
  Pacific Symposium on Biocomputing 2015
- 発表場所
  The Fairmont Orchid, Hawaii （アメリカ、ハワイ州）
- 年月日
  2015-01-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] Discovering modulators of gene regulation by local energy statistics2015
- 著者名/発表者名
  Teppei Shimamura
- 学会等名
  IFCS2015
- 発表場所
  ボローニャ大学（イタリア、ボローニャ）
- 年月日
  2015-07-07
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] Discovering modulators of gene regulation by local energy statistics2015
- 著者名/発表者名
  Teppei Shimamura
- 学会等名
  IFCS2015
- 発表場所
  ボローニャ大学（イタリア、ボローニャ）
- 年月日
  2015-07-07
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] がん悪性化に寄与する発現制御調整因子のイン・シリコ探索2015
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  がんゲノムの情報と数理
- 発表場所
  東京大学医科学研究所（東京都港区）
- 年月日
  2015-09-30
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] がんの俯瞰的理解のための統合的統計モデリング2015
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第38回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H05325
[学会発表] がん悪性化に寄与する発現制御調整因子のイン・シリコ探索2015
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  がんゲノムの情報と数理
- 発表場所
  東京大学医科学研究所（東京都港区）
- 年月日
  2015-09-30
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] がんの俯瞰的理解のための統合的統計モデリング2015
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第38回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
- 年月日
  2015-12-02
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K12139
[学会発表] Integrative systems understanding of cancer metabolism with constraint-based modeling of metabolic flux2014
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第73回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  パシフィコ横浜（神奈川県横浜市）
- 年月日
  2014-09-26
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] オミクス解析におけるグラフィックス2014
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  日本計算機統計学会第２８回シンポジウム
- 発表場所
  沖縄科学技術大学院大学（沖縄県恩納村）
- 年月日
  2014-11-15
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] Systems analysis of cancer metabolism with constraint-based model of metabolic flux2014
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  第８７回日本生化学会大会
- 発表場所
  国立京都国際会館（京都府京都市）
- 年月日
  2014-10-17
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] Hierarchical Bayes model-based analysis of chromatin interaction maps2013
- 著者名/発表者名
  Shimamura T
- 学会等名
  Genome Informatics
- 発表場所
  Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] Accurate detection of chromatin interactions from ChIA-PET sequencing data with a hierarchical Bayes model2013
- 著者名/発表者名
  Shimamura T
- 学会等名
  Clinical Genomics and Informatics Europe
- 発表場所
  Sheraton Hotel and Spa, Lisbon, Portugal
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173
[学会発表] 抗がん剤感受性予測に向けてのバイオインフォマティクスの現状と課題
- 著者名/発表者名
  島村徹平
- 学会等名
  日本計算機統計学会第27回大会
- 発表場所
  青森県弘前大学
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25730173

1. 白石友一 (70516880)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 10件
2. 後藤典子 (10251448)

共同の研究課題数: 3件

共同の研究成果数: 6件
3. 宮野悟 (50128104)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 39件
4. 井元清哉 (10345027)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 22件
5. 山口類 (90380675)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 14件
6. 玉田嘉紀 (80435495)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
7. 大澤毅 (50567592)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 9件
8. 東條有伸 (00211681)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
9. 岡本康司 (80342913)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
10. 長崎正朗 (90396862)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
11. 樋口知之 (70202273)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
12. 茅野光範 (20590095)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 神吉康晴 (00534869)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
14. PARK HEEWON (70756642)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
15. 新井田厚司 (00772493)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
16. 片山琴絵 (40581195)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 張耀中 (60817138)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 鈴木穣 (40323646)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
19. 多田敬一郎 (80271568)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 三森功士

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 10件
21. 杉町圭史

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
22. 中村英夫

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
23. 秀拓一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
24. 入谷修司

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
25. アレクシッチブランコ

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
26. 主藤朝也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
27. 油谷浩幸

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 8件
28. 岡崎祥子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
29. 藤井眞一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
30. 工藤正俊

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
31. 黒田敬

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
32. 東辻久子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
33. 森口尚

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
34. 七戸俊明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
35. 平野聡

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
36. 土川貴裕

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
37. 中村透

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
38. 山口憲孝

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
39. 佐藤慎哉

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
40. 中村晶

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
41. 吉野裕史

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
42. 中川昌之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
43. 榎田英樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
44. 野畑二次郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
45. 杉田智

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
46. 坂口大

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
47. 北川雅敏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
48. 坂本毅治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
49. 稲元輝生

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
50. 山下潤

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
51. 末弘淳一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
52. 真田昌

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
53. 佐藤亜以子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
54. 川崎善博

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
55. 渡辺俊二

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
56. 武田匡史

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
57. 石井秀始

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
58. 松原大祐

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
59. 新井文用

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
60. 吉田亮

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
61. 江口英利

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 5件
62. 増田隆明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
63. 稲澤譲治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
64. 小崎健一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
65. 田中真二

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
66. 青木恒介

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
67. 竹内一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
68. 小川誠司

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 6件
69. 若林俊彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
70. 夏目敦至

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
71. 本村和也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
72. 松井佑介

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 9件
73. 阿部竜也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
74. 鈴木啓道

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
75. 鈴木孝禎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
76. 近藤豊

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
77. 加藤忠史

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
78. 吉川武男

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
79. 豊田倫子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
80. 尾崎紀夫

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
81. 糸川昌成

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
82. 橋本亮太

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
83. 久島周

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
84. 伊藤友子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
85. 吉見陽

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
86. 土岐祐一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
87. 平田秀成

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 4件
88. 永江玄太

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 5件
89. 滝田順子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 5件
90. 西村力

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
91. 林泰秀

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
92. 加藤元博

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
93. 野中綾

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
94. 平賀徹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
95. 関戸好孝

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
96. 川井章

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
97. 竹下啓蔵

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
98. 佐藤昇志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
99. 伊藤俊樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
100. 入野康宏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
101. 伊集院壮

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
102. 竹縄忠臣

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
103. 長谷川純矢

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
104. 徳田恵美

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
105. 水野拓也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
106. 清水佳奈子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
107. 櫻井俊治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
108. 小柳悟

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
109. 矢野聖二

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
110. 山本雄広

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
111. 山本靖彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
112. 山本博

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
113. 井上博雅

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
114. 東辻宏明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
115. 浅井大輔

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
116. 田中真実

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
117. 林洋光

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
118. 齋藤元伸

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
119. 堀口道子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
120. 堀正敏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
121. 尾崎博

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
122. 浦本秀隆

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
123. 宗知子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
124. 倉津純一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
125. 篠島直樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
126. Lang Frederick F.

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
127. 宮林弘至

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
128. 岩本高行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
129. 三井伸二

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
130. 平島浩太郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
131. 佐藤大希

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
132. 井上純一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
133. 水野健作

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
134. 高倉伸幸

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
135. 丸澤宏之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
136. 孫戈虹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
137. 波江野洋

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
138. 山本君代

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
139. 井手迫俊彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
140. 米森雅也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
141. 平松宏祐

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
142. 深見希代子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
143. 加藤光保

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
144. 北川恭子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
145. 佐藤博

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
146. 村上善則

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
147. 清木元治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
148. 北中明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
149. 安永純一朗

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
150. 永田安伸

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
151. 松岡雅雄

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
152. 増田喬子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
153. 岩間厚志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
154. 昆彩奈

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
155. 東治人

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
156. 高橋隆

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
157. 前原喜彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
158. 村上和成

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
159. 兒玉雅明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
160. 水上一弘

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
161. 長谷川嵩矩

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
162. 渡辺聡明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
163. 飯沼久恵

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
164. 山田英樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
165. 南敬

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
166. 和田洋一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
167. 水田正弘

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
168. 石川俊平

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
169. 中内啓光

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
170. 小原直

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
171. 大津真

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
172. 山本健

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
173. 佐藤秀明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
174. 岸田聡

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
175. 市川美紀

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
176. 門松健治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
177. 清成信一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
178. 森正樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
179. 岩谷岳

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
180. 田中文明

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
181. 中西速夫

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
182. 酒井寿郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
183. 湯浅保仁

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
184. 土田里香

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
185. 岡田俊

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
186. 江川純

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
187. 船曳康子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
188. 木村亮

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
189. 染矢俊幸

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
190. 鳥居洋太

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
191. 井口友宏

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
192. 角田達彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
193. 藤本明洋

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
194. 宮冬樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
195. 嘉村巧

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
196. 赤司浩一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
197. 下野洋平

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
198. 岡澤均

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
199. 曽根雅紀

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
200. 田村拓也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
201. 田川一彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
202. 国崎祐哉

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
203. 中田飛鳥

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

島村 徹平 SHIMAMURA Teppei

研究課題

研究成果

共同研究者

精神疾患の階層横断的理解を加速する数理モデリング技術の開発研究代表者継続中

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

生命現象の階層横断的な理解を可能する統計的モデリング技術の開発研究代表者継続中

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

乳がんゲノム遺伝子変異と幹細胞性に基づく不均一性および階層性の統合解明継続中

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

低pH腫瘍微小環境による悪性化機構の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

機能性ncRNA探索のための転写調節ネットワークアトラス研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索継続中

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

最小単位オミクス総合解析による乳がん組織多様性の解明

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

細胞内代謝シフトを解析、統合、理解するためのベイズモデリング研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

高次エピゲノムが生み出す生命情報を読み解く統計解析法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] PRC2-mediated transcriptomic alterations at the embryonic stage govern tumorigenesis and clinical outcome in MYCN-driven neuroblastoma.2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] ENIGMA: An Enterotype-Like Unigram Mixture Model for Microbial Association Analysis.2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition2019

著者名/発表者名

雑誌名

島村徹平 SHIMAMURA Teppei