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島村 徹平  SHIMAMURA Teppei

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 00623943
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 東京科学大学, 総合研究院, 教授
2025年度: 名古屋大学, 医学系研究科, 特任教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2023年度 – 2024年度: 名古屋大学, 医学系研究科, 特任教授
2022年度 – 2024年度: 東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 教授
2019年度 – 2023年度: 名古屋大学, 医学系研究科, 教授
2014年度 – 2018年度: 名古屋大学, 医学系研究科, 特任准教授
2017年度: 名古屋大学, 大学院医学系研究科, 特任准教授 … もっと見る
2015年度: 名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 准教授
2014年度 – 2015年度: 名古屋大学, 医学(系)研究科(研究院), 特任准教授
2013年度: 東京大学, 医科学研究所, 助教 隠す
審査区分/研究分野
研究代表者
生命・健康・医療情報学 / 生物系 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 複合領域 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 中区分62:応用情報学およびその関連分野
研究代表者以外
腫瘍生物学 / 複合領域 / 小区分56010:脳神経外科学関連 / 中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 小区分50010:腫瘍生物学関連
キーワード
研究代表者
深層生成モデル / ベイズモデリング / マルチオミクス / システム生物学 / 空間トランスクリプトーム / 行列因子分解 / ネットワーク解析 / ベイズモデル / バイオインフォマティクス / 細胞ダイナミクス … もっと見る / 細胞間コミュニケーション / スパースモデリング / 臓器連関 / 一細胞解析 / マルチモーダル解析 / シングルセル解析 / 空間トランスクリプトーム解析 / シングルセルトランスクリプトーム解析 / イメージング高解像度化 / 一細胞オミクス / 相互作用ネットワーク / 時空間解析 / シングルセルオミクス / 因子分解 / 細胞運命決定 / トランスオミクス / テンソル因子分解 / 細胞間相互作用 / 深層学習 / 因子分解モデル / トピックモデル / マルチオミクス解析 / メタゲノム / 種間横断的解析 / モジュールネットワーク / 数理モデリング / 代謝 / フローサイトメトリー / メタボローム / 生体生命情報学 / 代謝シフト / 代謝ネットワーク / 転写制御 / 発現制御 / 遺伝子ネットワーク / エピゲノム / 高次クロマチン構造 / 次世代シークエンサー … もっと見る
研究代表者以外
バイオインフォマティクス / 1細胞 / 乳がん / がん幹細胞 / スーパーコンピュータ / 統計的モデリング / システム生物学 / がん / RNA / スプライシング / U1 snRNA / 髄芽腫 / エクサカイン / DOHaD / プラセントカイン / 妊娠 / 運動 / 空間的オミックス解析 / エピゲノム / RNA解析 / ゲノム・メタゲノム / 次世代シーケンサー / シングルセル解析 / オミックス解析 / メタゲノム / ゲノム / 広報 / 若手支援 / 研究資源共有化 / 技術支援 / 細胞外マトリックス / 1細胞 / ゲノム変異 / ニューロピリン / セマフォリン / IGF / トリプルネガティブ乳がん / スフェロイド / PDX / 転写制御 / 転写・代謝制御 / がん代謝 / 低pH / がん微小環境 / 人工知能 / PDXモデル / neuropilin / 遺伝子発現 / スフェロイド培養 / 幹細胞 / シングルセル / RNAシークエンス / semaphoring, neuropilin / breast cancer, / cancer stem cells / Single cell / シークエンス解析 / 遺伝子ネットワーク / 遺伝統計学 / ゲノム科学 隠す
  • 研究課題

    (19件)
  • 研究成果

    (267件)
  • 共同研究者

    (117人)
  •  胎盤による両親の運動情報の集約と次世代への臓器特異的な情報分散システムの解明

    • 研究代表者
      楠山 譲二
    • 研究期間 (年度)
      2024 – 2026
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野
    • 研究機関
      東京医科歯科大学
  •  領域研究「細胞外情報を統御するマルチモーダルECM」の統括と運営

    • 研究代表者
      藤原 裕展
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      国立研究開発法人理化学研究所
  •  次世代深層学習による細胞外情報システムモデリング・シミュレーション研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(A)
    • 審査区分
      学術変革領域研究区分(Ⅲ)
    • 研究機関
      東京医科歯科大学
  •  ベイズ深層学習による細胞ダイナミクスの新次元俯瞰研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2023
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

    • 研究代表者
      黒川 顕
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2027
    • 研究種目
      学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成)
    • 研究機関
      国立遺伝学研究所
  •  SHH型髄芽腫における異常RNAプロセシングの解明

    • 研究代表者
      鈴木 啓道
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分56010:脳神経外科学関連
    • 研究機関
      国立研究開発法人国立がん研究センター
  •  常在細菌叢の機能理解に向けた疾患関連細菌叢アトラスの創出研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分62:応用情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  臓器連関トランスオミクスを読み解くベイズモデリング技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2021
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  多細胞ダイナミクスを紐解くベイズモデリング技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  精神疾患の階層横断的理解を加速する数理モデリング技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2020
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      生物系
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  生命現象の階層横断的な理解を可能する統計的モデリング技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  乳がんゲノム遺伝子変異と幹細胞性に基づく不均一性および階層性の統合解明

    • 研究代表者
      後藤 典子
    • 研究期間 (年度)
      2018 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 審査区分
      小区分50010:腫瘍生物学関連
    • 研究機関
      金沢大学
  •  低pH腫瘍微小環境による悪性化機構の解明

    • 研究代表者
      大澤 毅
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2017
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      腫瘍生物学
    • 研究機関
      東京大学
  •  機能性ncRNA探索のための転写調節ネットワークアトラス研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      挑戦的萌芽研究
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  最小単位オミクス総合解析による乳がん組織多様性の解明

    • 研究代表者
      後藤 典子
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2017
    • 研究種目
      基盤研究(B)
    • 研究分野
      腫瘍生物学
    • 研究機関
      金沢大学
  •  細胞内代謝シフトを解析、統合、理解するためのベイズモデリング研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2018
    • 研究種目
      若手研究(A)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      名古屋大学
  •  スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京大学
  •  高次エピゲノムが生み出す生命情報を読み解く統計解析法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      島村 徹平
    • 研究期間 (年度)
      2013 – 2015
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      生命・健康・医療情報学
    • 研究機関
      名古屋大学
      東京大学
  •  計算とシミュレーションによるがんシステム学の創成

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2010 – 2014
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 その他

すべて 雑誌論文 学会発表 図書 その他

  • [図書] 実験医学増刊 Vol.41 No.15、シングルセルマルチモーダル解析の最新技術―同一細胞・異なる細胞のモダリティ統合に向けてのアプローチ2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 総ページ数
      244
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758104135
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [図書] 実験医学増刊 Vol.41 No.15、オミクス解析が明らかにする治療標的としてのがん代謝機構2023

    • 著者名/発表者名
      三森功士、北川彰洋、島村徹平
    • 総ページ数
      222
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758104135
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [図書] 実験医学別冊最強のステップUPシリーズ 空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド、空間トランスクリプトームに基づく細胞間相互作用ネットワークの解析技術2022

    • 著者名/発表者名
      小嶋泰弘、島村徹平
    • 総ページ数
      244
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758122610
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [図書] 実験医学別冊最強のステップUPシリーズ 空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド、空間トランスクリプトームに基づく細胞間相互作用ネットワークの解析技術2022

    • 著者名/発表者名
      小嶋泰弘、島村徹平
    • 総ページ数
      244
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758122610
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [図書] 実験医学別冊最強のステップUPシリーズ 空間オミクス解析スタートアップ実践ガイド、空間トランスクリプトームに基づく細胞間相互作用ネットワークの解析技術2022

    • 著者名/発表者名
      小嶋泰弘、島村徹平
    • 総ページ数
      244
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      9784758122610
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [雑誌論文] Single-cell colocalization analysis using a deep generative model2024

    • 著者名/発表者名
      Kojima Yasuhiro、Mii Shinji、Hayashi Shuto、Hirose Haruka、Ishikawa Masato、Akiyama Masashi、Enomoto Atsushi、Shimamura Teppei
    • 雑誌名

      Cell Systems

      巻: 15 号: 2 ページ: 180-192

    • DOI

      10.1016/j.cels.2024.01.007

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K16991, KAKENHI-PROJECT-22K07000, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Spatial and single-cell colocalisation analysis reveals MDK-mediated immunosuppressive environment with regulatory T cells in colorectal carcinogenesis2024

    • 著者名/発表者名
      Hashimoto Masahiro、Kojima Yasuhiro et. al.
    • 雑誌名

      eBioMedicine

      巻: 103 ページ: 105102-105102

    • DOI

      10.1016/j.ebiom.2024.105102

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K16991, KAKENHI-PROJECT-22K08894, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-23K06662, KAKENHI-PROJECT-23K08215, KAKENHI-PROJECT-21K07179, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-23K24164, KAKENHI-PROJECT-23K24941
  • [雑誌論文] Topological data analysis of protein structure and inter/intra-molecular interaction changes attributable to amino acid mutations2023

    • 著者名/発表者名
      Koseki Jun、Hayashi Shuto、Kojima Yasuhiro、Hirose Haruka、Shimamura Teppei
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 21 ページ: 2950-2959

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2023.05.009

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K17993, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23K24941
  • [雑誌論文] Metastases and treatment-resistant lineages in patient-derived cancer cells of colorectal cancer2023

    • 著者名/発表者名
      Fujino Shiki、Miyoshi Norikatsu、Ito Aya、Hayashi Rie、Yasui Masayoshi、Matsuda Chu、Ohue Masayuki、Horie Masafumi、Yachida Shinichi、Koseki Jun、Shimamura Teppei、Hata Tsuyoshi、Ogino Takayuki、Takahashi Hidekazu、Uemura Mamoru、Mizushima Tsunekazu、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 号: 1 ページ: 1191-1191

    • DOI

      10.1038/s42003-023-05562-y

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K08128, KAKENHI-PROJECT-21K08709, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-23K24941
  • [雑誌論文] 特集 未病の科学 Ⅰ.未病の数理研究 変分自己符号化器を用いた細胞状態遷移のゆらぎ解析と未病研究への応用2023

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平、小嶋 泰弘
    • 雑誌名

      生体の科学

      巻: 74 号: 2 ページ: 118-122

    • DOI

      10.11477/mf.2425201655

    • ISSN
      0370-9531, 1883-5503
    • 年月日
      2023-04-15
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Convergent genomic diversity and novel BCAA metabolism in intrahepatic cholangiocarcinoma2023

    • 著者名/発表者名
      Kitagawa A, Osawa T,Noda M,Kobayashi Y, Aki S,Nakano Y,Saito T,Shimizu D,Komatsu H,Sugaya M,Takahashi J,...Mimori K.
    • 雑誌名

      Br J Cancer

      巻: - 号: 12 ページ: 22068-22068

    • DOI

      10.1038/s41416-023-02256-4

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K08826, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K07260, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PROJECT-23K18234, KAKENHI-PROJECT-22K07774, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-21K08745, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23K24164
  • [雑誌論文] A pyrenoid-localized protein SAGA1 is necessary for Ca2+-binding protein CAS-dependent expression of nuclear genes encoding inorganic carbon transporters in Chlamydomonas reinhardtii2023

    • 著者名/発表者名
      Shimamura Daisuke、Yamano Takashi、Niikawa Yuki、Hu Donghui、Fukuzawa Hideya
    • 雑誌名

      Photosynthesis Research

      巻: - 号: 2 ページ: 181-192

    • DOI

      10.1007/s11120-022-00996-7

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H03073, KAKENHI-PROJECT-21K19145, KAKENHI-PUBLICLY-21H05660, KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Hypoxia activates SREBP2 through Golgi disassembly in bone marrow-derived monocytes for enhanced tumor growth2023

    • 著者名/発表者名
      Nakahara R, Aki S, Sugaya M, Hirose H, Kato M, Maeda K, Sakamoto DM, Kojima Y, Nishida M, Ando R, Muramatsu M, Pan M, Tsuchida R, Matsumura Y, Yanai H, Takano H, Yao R, Sando S, Shibuya M, Sakai J, Kodama T, Kidoya H, Shimamura T, Osawa T.
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 42 号: 22 ページ: 15252-15252

    • DOI

      10.15252/embj.2023114032

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K18411, KAKENHI-PROJECT-23K18234, KAKENHI-PROJECT-23KJ0581, KAKENHI-PROJECT-22KJ0927, KAKENHI-PUBLICLY-23H04772, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-21H04826, KAKENHI-PROJECT-23K24149
  • [雑誌論文] Plucked scalp hair follicle samples are useful RNA sources for mRNA analysis of most genodermatosis-associated genes2023

    • 著者名/発表者名
      Takeuchi So、Takeichi Takuya、Muro Yoshinao、Shimamura Teppei、Akiyama Masashi
    • 雑誌名

      Journal of Dermatological Science

      巻: 111 号: 2 ページ: 68-70

    • DOI

      10.1016/j.jdermsci.2023.06.004

    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [雑誌論文] Spatial and single-cell transcriptomics decipher the cellular environment containing HLA-G+ cancer cells and SPP1+ macrophages in colorectal cancer2023

    • 著者名/発表者名
      Ozato Y, Mimori K(28番目),他26名
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 42 号: 1 ページ: 111929-111929

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111929

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K08908, KAKENHI-PROJECT-22K19464, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-19K07659, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PROJECT-23K24164, KAKENHI-PROJECT-22K08894, KAKENHI-PROJECT-22K09006, KAKENHI-PROJECT-23K06662, KAKENHI-PROJECT-23K08128, KAKENHI-PROJECT-21K07179
  • [雑誌論文] Acidic Extracellular pH Drives Accumulation of N1-Acetylspermidine and Recruitment of Pro-Tumor Neutrophils2023

    • 著者名/発表者名
      Kato M, Maeda K, Nakahara R, Hirose H, Kondo A, Aki S, Sugaya M, Hibino S, Nishida M, Hasegawa M, Morita H, Ando R, Tsuchida R, Yoshida M, Kodama T, Yanai H, Shimamura T and Osawa T
    • 雑誌名

      PNAS Nexus

      巻: 10 号: 10 ページ: 1093-1093

    • DOI

      10.1093/pnasnexus/pgad306

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K18234, KAKENHI-PROJECT-23KJ0581, KAKENHI-PROJECT-22KJ0927, KAKENHI-PUBLICLY-23H04772, KAKENHI-PLANNED-23H04882, KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23H05473, KAKENHI-PROJECT-23K24149
  • [雑誌論文] Increased flexibility of the SARS-CoV-2 RNA-binding site causes resistance to remdesivir2023

    • 著者名/発表者名
      Torii Shiho、Kim Kwang Su、Koseki Jun、Suzuki Rigel、Iwanami Shoya、Fujita Yasuhisa、Jeong Yong Dam、Ito Jumpei、Asakura Hiroyuki、Nagashima Mami、Sadamasu Kenji、Yoshimura Kazuhisa、Sato Kei、Matsuura Yoshiharu、Shimamura Teppei、Iwami Shingo、Fukuhara Takasuke、The Genotype to Phenotype Japan (G2P-Japan) Consortium
    • 雑誌名

      PLOS Pathogens

      巻: 19 号: 3 ページ: e1011231-e1011231

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1011231

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K19829, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PROJECT-23K24941, KAKENHI-PUBLICLY-22H05215
  • [雑誌論文] UNMF: a unified nonnegative matrix factorization for multi-dimensional omics data2023

    • 著者名/発表者名
      Abe Ko、Shimamura Teppei
    • 雑誌名

      Briefings in Bioinformatics

      巻: 24 号: 5

    • DOI

      10.1093/bib/bbad253

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938, KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Metabolic remodeling of pyrimidine synthesis pathway and serine synthesis pathway in human glioblastoma2022

    • 著者名/発表者名
      Nakamizo Akira、Miyamatsu Yuichiro、Hirose Haruka、Amano Toshiyuki、Matsuo Satoshi、Fujiwara Minako、Shimamura Teppei、Yoshimoto Koji
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 12 号: 1 ページ: 16277-16277

    • DOI

      10.1038/s41598-022-20613-w

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-19K09541, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [雑誌論文] Bayesian statistical method for detecting structural and topological diversity in polymorphic proteins2022

    • 著者名/発表者名
      Hayashi Shuto、Koseki Jun、Shimamura Teppei
    • 雑誌名

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      巻: 20 ページ: 6519-6525

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2022.11.038

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K17993, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PROJECT-23K24941
  • [雑誌論文] UVB-Induced Skin Autoinflammation Due to Nlrp1b Mutation and Its Inhibition by Anti-IL-1β Antibody2022

    • 著者名/発表者名
      Murase Yuya、Takeichi Takuya、Koseki Jun、Miyasaka Yuki、Muro Yoshinao、Ohno Tamio、Shimamura Teppei、Akiyama Masashi
    • 雑誌名

      Frontiers in Immunology

      巻: 13 ページ: 876390-876390

    • DOI

      10.3389/fimmu.2022.876390

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-18K16058, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [雑誌論文] Detecting time-evolving phenotypic components of adverse reactions against BNT162b2 SARS-CoV-2 vaccine via non-negative tensor factorization2022

    • 著者名/発表者名
      Ikeda Kei、Nakada Taka-Aki、Kageyama Takahiro、Tanaka Shigeru、Yoshida Naoki、Ishikawa Tetsuo、Goshima Yuki、Otaki Natsuko、Iwami Shingo、Shimamura Teppei、Taniguchi Toshibumi、Igari Hidetoshi、Hanaoka Hideki、Yokote Koutaro、Tsuyuzaki Koki、Nakajima Hiroshi、Kawakami Eiryo
    • 雑誌名

      iScience

      巻: 25 号: 10 ページ: 105237-105237

    • DOI

      10.1016/j.isci.2022.105237

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21837, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-19K20406, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [雑誌論文] Exome sequencing of Japanese schizophrenia multiplex families supports the involvement of calcium ion channels2022

    • 著者名/発表者名
      Toyama Miho、Takasaki Yuto、Branko Aleksic、Kimura Hiroki、Kato Hidekazu、Nawa Yoshihiro、Kushima Itaru、Ishizuka Kanako、Shimamura Teppei、Ogi Tomoo、Ozaki Norio
    • 雑誌名

      PLOS ONE

      巻: 17(5) 号: 5 ページ: e0268321-e0268321

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0268321

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20K20602, KAKENHI-PROJECT-21H04815, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-21H02848, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [雑誌論文] An analysis modality for vascular structures combining tissue-clearing technology and topological data analysis2022

    • 著者名/発表者名
      Takahashi K, Abe K, Kubota SI, Fukatsu N, Morishita Y, Yoshimatsu Y, Satoshi Hirakawa, Yoshiaki Kubota, Tetsuro Watabe, Shogo Ehata, Hiroki R. Ueda, Teppei Shimamura, Kohei Miyazono
    • 雑誌名

      Nature Communiactions

      巻: 13 号: 1 ページ: 5239-5239

    • DOI

      10.1038/s41467-022-32848-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K07094, KAKENHI-PROJECT-22K15435, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-18H05270, KAKENHI-PROJECT-20H03851, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PLANNED-17H06326, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PROJECT-20H00513
  • [雑誌論文] A bifurcation concept for B-lymphoid/plasmacytoid dendritic cells with largely fluctuating transcriptome dynamics.2022

    • 著者名/発表者名
      Nagaharu K, Kojima Y, Hirose H, Minoura K, Hinohara K, Minami H, Kageyama Y, Sugimoto Y, Masuya M, Nii S, Seki M, Suzuki Y, Tawara I, Shimamura T, Katayama N, Nishikawa H, Ohishi K.
    • 雑誌名

      Cell Rep.

      巻: 40 号: 9 ページ: 111260-111260

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2022.111260

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22K10838, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-22H00455, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [雑誌論文] Metabolome and transcriptome analysis on muscle of sporadic inclusion body myositis.2022

    • 著者名/発表者名
      Murakami, A., Noda, S., Kazuta, T., Hirano, S., Kimura, S., Nakanishi, H., Matsuo, K., Tsujikawa, K., Iida, M., Koike, H., Sakamoto, K., Hara, Y., Kuru, S., Kadomatsu, K., Shimamura, T., Ogi, T., Katsuno, M.
    • 雑誌名

      Ann Clin Transl Neurol.

      巻: 9 号: 10 ページ: 1602-1615

    • DOI

      10.1002/acn3.51657

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K18251, KAKENHI-PROJECT-22K15705, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-21K20686, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [雑誌論文] Smoking enhances the expression of angiotensin‐converting enzyme 2 involved in the efficiency of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 infection2022

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Rigel、Ono Yuki、Noshita Koji、Kim Kwang Su、Ito Hayato、Morioka Yuhei、Tamura Tomokazu、Okuzaki Daisuke、Tagawa Tetsuzo、Takenaka Tomoyoshi、Yoshizumi Tomoharu、Shimamura Teppei、Iwami Shingo、Fukuhara Takasuke
    • 雑誌名

      Microbiology and Immunology

      巻: 67 号: 1 ページ: 22-31

    • DOI

      10.1111/1348-0421.13034

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-21H02736, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-22H04839, KAKENHI-PROJECT-23K27671
  • [雑誌論文] A mixture-of-experts deep generative model for integrated analysis of single-cell multiomics data2021

    • 著者名/発表者名
      Minoura Kodai、Abe Ko、Nam Hyunha、Nishikawa Hiroyoshi、Shimamura Teppei
    • 雑誌名

      Cell Reports Methods

      巻: 1(5) 号: 5 ページ: 100071-100071

    • DOI

      10.1016/j.crmeth.2021.100071

    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [雑誌論文] Depletion of central memory CD8+ T cells might impede the antitumor therapeutic effect of Mogamulizumab2021

    • 著者名/発表者名
      Maeda Yuka、Wada Hisashi、Sugiyama Daisuke、Saito Takuro、Irie Takuma、Itahashi Kota、Minoura Kodai、Suzuki Susumu、Kojima Takashi、Kakimi Kazuhiro、Nakajima Jun、Funakoshi Takeru、Iida Shinsuke、Oka Mikio、Shimamura Teppei、Doi Toshihiko、Doki Yuichiro、Nakayama Eiichi、Ueda Ryuzo、Nishikawa Hiroyoshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 12(1) 号: 1 ページ: 7280-7280

    • DOI

      10.1038/s41467-021-27574-0

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-17H06162, KAKENHI-PROJECT-19H03729, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-21K07112, KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [雑誌論文] Hierarchical non-negative matrix factorization using clinical information for microbial communities2021

    • 著者名/発表者名
      Abe Ko、Hirayama Masaaki、Ohno Kinji、Shimamura Teppei
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 22 号: 1 ページ: 104-104

    • DOI

      10.1186/s12864-021-07401-y

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K22802, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H03561, KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [雑誌論文] Integrated multiomics analysis of hepatoblastoma unravels its heterogeneity and provides novel druggable targets.2020

    • 著者名/発表者名
      Sekiguchi M, Seki M, Kawai T, Yoshida K, Yoshida M, Isobe T, Hoshino N, Shirai R, Tanaka M, Souzaki R, Watanabe K, Arakawa Y, Nannya Y, Suzuki H, Fujii Y, Kataoka K, Shiraishi Y, Chiba K, Tanaka H, Shimamura T, Sato Y, Sato-Otsubo A, Kimura S, Kubota Y, Hiwatari M, et al
    • 雑誌名

      NPJ Precis Oncol.

      巻: Jul 7;4:20. 号: 1 ページ: 20-20

    • DOI

      10.1038/s41698-020-0125-y

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K07693, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-19H05656, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20H00528
  • [雑誌論文] CYBERTRACK2.0: zero-inflated model-based cell clustering and population tracking method for longitudinal mass cytometry data2020

    • 著者名/発表者名
      Minoura K*, Abe K*, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T§
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: - 号: 11 ページ: 873-873

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btaa873

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-17K15738, KAKENHI-PROJECT-17H06162, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [雑誌論文] Meta‐Analysis of Gut Dysbiosis in Parkinson's Disease2020

    • 著者名/発表者名
      Nishiwaki Hiroshi、Ito Mikako、Ishida Tomohiro、Hamaguchi Tomonari、Maeda Tetsuya、Kashihara Kenichi、Tsuboi Yoshio、Ueyama Jun、Shimamura Teppei、Mori Hiroshi、Kurokawa Ken、Katsuno Masahisa、Hirayama Masaaki、Ohno Kinji
    • 雑誌名

      Movement Disorders

      巻: 35 号: 9 ページ: 1626-1635

    • DOI

      10.1002/mds.28119

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K08001, KAKENHI-PROJECT-20K06925, KAKENHI-PROJECT-19K22802, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H03561, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-17K07094
  • [雑誌論文] ARHGAP10, which encodes Rho GTPase-activating protein 10, is a novel gene for schizophrenia risk2020

    • 著者名/発表者名
      Mariko Sekiguchi, Akiko Kodama,... Emiko Shishido,... Daisuke Mori, Norio Ozaki
    • 雑誌名

      Translational psychiatry

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-15

    • DOI

      10.1038/s41398-020-00917-z

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K08072, KAKENHI-PROJECT-20K07082, KAKENHI-PROJECT-20K07965, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-18K14816, KAKENHI-PROJECT-20K16488, KAKENHI-PROJECT-20K16625, KAKENHI-PROJECT-19H05467, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-18H04040, KAKENHI-PROJECT-20H03611, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-17K07383, KAKENHI-PROJECT-18K15512, KAKENHI-PROJECT-19K16111, KAKENHI-PROJECT-16H06277, KAKENHI-PROJECT-17H04252, KAKENHI-PROJECT-18KT0022
  • [雑誌論文] Coordinated demethylation of H3K9 and H3K27 is required for rapid inflammatory responses of endothelial cells2020

    • 著者名/発表者名
      Higashijima Y, Matsui Y, Shimamura T, Nakaki R, Nagai N, Tsutsumi S, Abe Y, Link VM, Osaka M, Yoshida M, Watanabe R, Tanaka T, Taguchi A, Miura M, Ruan X, Li G, Inoue T, Nangaku M, Kimura H, Furukawa T, Aburatani H, Wada Y, Ruan Y, Glass CK, Kanki Y
    • 雑誌名

      The EMBO Journal

      巻: 39 号: 7 ページ: 1-1

    • DOI

      10.15252/embj.2019103949

    • NAID

      120006902140

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K23850, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PLANNED-18H05527, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PLANNED-19H05744, KAKENHI-PROJECT-17H03614, KAKENHI-PROJECT-17J07088, KAKENHI-PROJECT-17K15991, KAKENHI-PROJECT-19K21297, KAKENHI-PROJECT-20K09448, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PROJECT-20K17242, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-18H02803, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-19K22679, KAKENHI-ORGANIZER-19H05739, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-20H03432
  • [雑誌論文] Model-based clustering for flow and mass cytometry data with clinical information2020

    • 著者名/発表者名
      Abe K, Minoura K, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T§
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 21(Suppl 13) 号: S13 ページ: 393-393

    • DOI

      10.1186/s12859-020-03671-7

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-17K15738, KAKENHI-PROJECT-17H06162
  • [雑誌論文] EXOSC9 depletion attenuates P-body formation, stress resistance, and tumorigenicity of cancer cells.2020

    • 著者名/発表者名
      Yoshino S, Matsui Y, Fukui Y, Seki M, Yamaguchi K, Kanamori A, Saitoh Y, Shimamura T, Suzuki Y, Furukawa Y, Kaneko S, Seiki M, Murakami Y, Inoue JI, Sakamoto T.
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 10 号: 1 ページ: 9275-9275

    • DOI

      10.1038/s41598-020-66455-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07659, KAKENHI-PROJECT-20K07563, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-INTERNATIONAL-16K21739, KAKENHI-ORGANIZER-16H06573, KAKENHI-PLANNED-16H06575, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-18H03207
  • [雑誌論文] Short-Chain Fatty Acid-Producing Gut Microbiota Is Decreased in Parkinson’s Disease but Not in Rapid-Eye-Movement Sleep Behavior Disorder2020

    • 著者名/発表者名
      Nishiwaki Hiroshi、Hamaguchi Tomonari、Ito Mikako、Ishida Tomohiro、Maeda Tetsuya、Kashihara Kenichi、Tsuboi Yoshio、Ueyama Jun、Shimamura Teppei、Mori Hiroshi、Kurokawa Ken、Katsuno Masahisa、Hirayama Masaaki、Ohno Kinji
    • 雑誌名

      mSystems

      巻: 5 号: 6

    • DOI

      10.1128/msystems.00797-20

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K08001, KAKENHI-PROJECT-20K06925, KAKENHI-PROJECT-19K22802, KAKENHI-PROJECT-20K21832, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PUBLICLY-20H04841, KAKENHI-PROJECT-20H03561, KAKENHI-PROJECT-20H04281, KAKENHI-PROJECT-17K07094
  • [雑誌論文] Pathogenic Epigenetic Consequences of Genetic Alterations in IDH-Wild-Type Diffuse Astrocytic Gliomas2019

    • 著者名/発表者名
      Ohka Fumiharu、Shinjo Keiko、Deguchi Shoichi、Matsui Yusuke et al.
    • 雑誌名

      Cancer Research

      巻: 79 号: 19 ページ: 4814-4827

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-19-1272

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K18151, KAKENHI-PROJECT-19KK0228, KAKENHI-PLANNED-17H06356, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-17H03582, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-17K07247
  • [雑誌論文] Phosphoethanolamine Accumulation Protects Cancer Cells under Glutamine Starvation through Downregulation of PCYT22019

    • 著者名/発表者名
      Osawa T, Shimamura T, Saito K, Hasegawa Y, Ishii N, Nishida M, Ando R, Kondo A, Anwar M, Kato K, Endo K, Yamano S, Kanki Y, Matsumura Y, Minami T, Tanaka T, Anai M, Wada Y, Wanibuchi H, Hayashi M, Hamada A, Yoshida M, Yachida S, Nakao M, Sakai J, Aburatani H, Shibuya M, Hanada K, Miyano S, Soga T, Kodama T
    • 雑誌名

      Cell Rep.

      巻: 29(1) 号: 1 ページ: 89-103

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2019.08.087

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04688, KAKENHI-PUBLICLY-18H04797, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04897, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-16H06390, KAKENHI-PROJECT-19H01031, KAKENHI-PROJECT-17H03614, KAKENHI-PROJECT-19H03496, KAKENHI-PROJECT-18K16132
  • [雑誌論文] Divergent lncRNA MYMLR regulates MYC by eliciting DNA looping and promoter-enhancer interaction2019

    • 著者名/発表者名
      Kajino T, Shimamura T, Gong S, Yanagisawa K, Ida L, Nakatochi M, Griesing S, Shimada Y, Kano K, Suzuki M, Miyano S
    • 雑誌名

      EMBO J

      巻: 38 号: 17 ページ: 1-13

    • DOI

      10.15252/embj.201798441

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K08174, KAKENHI-PLANNED-15H05910, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-18H02698
  • [雑誌論文] ENIGMA: An Enterotype-Like Unigram Mixture Model for Microbial Association Analysis.2019

    • 著者名/発表者名
      Abe K, Hirayama H, Ohno K, Shimamura T.
    • 雑誌名

      BMC Genomics

      巻: 20(Suppl 2) 号: S2 ページ: 191-191

    • DOI

      10.1186/s12864-019-5476-9

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [雑誌論文] Replication stress triggers microsatellite destabilization and hypermutation leading to clonal expansion in vitro2019

    • 著者名/発表者名
      Matsuno Yusuke、Atsumi Yuko、Shimizu Atsuhiro、Katayama Kotoe、Fujimori Haruka、Hyodo Mai、Minakawa Yusuke、Nakatsu Yoshimichi、Kaneko Syuzo、Hamamoto Ryuji、Shimamura Teppei、Miyano Satoru、Tsuzuki Teruhisa、Hanaoka Fumio、Yoshioka Ken-ichi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 3925-3925

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11760-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K11542, KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04908, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-19H03429
  • [雑誌論文] Model-based cell clustering and population tracking for time-series flow cytometry data.2019

    • 著者名/発表者名
      Minoura K, Abe K, Maeda Y, Nishikawa H, Shimamura T.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 20(Suppl 23) 号: S23 ページ: 633-633

    • DOI

      10.1186/s12859-019-3294-3

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-17H06162
  • [雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition2019

    • 著者名/発表者名
      Matsu Y, Miyano S, Shimamura T
    • 雑誌名

      LNBI

      巻: 10834 ページ: 115-123

    • DOI

      10.1007/978-3-030-14160-8_12

    • ISBN
      9783030141592, 9783030141608
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-16K16146, KAKENHI-PROJECT-18K18151
  • [雑誌論文] A Network of Networks Approach for Modeling Interconnected Brain Tissue-Specific Networks.2019

    • 著者名/発表者名
      Kawakubo H, Matsui Y, Kushima I, Ozaki N, Shimamura T.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: - 号: 17 ページ: 1-10

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btz032

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-18K18151, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [雑誌論文] Distinct methylation levels of mature microRNAs in gastrointestinal cancers2019

    • 著者名/発表者名
      Konno Masamitsu、Koseki Jun、Asai Ayumu、Yamagata Akira、Shimamura Teppei、Motooka Daisuke、Okuzaki Daisuke、Kawamoto Koichi、Mizushima Tsunekazu、Eguchi Hidetoshi、Takiguchi Shuji、Satoh Taroh、Mimori Koshi、Ochiya Takahiro、Doki Yuichiro、Ofusa Ken、Mori Masaki、Ishii Hideshi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 3888-3888

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11826-1

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K08617, KAKENHI-PROJECT-18K08704, KAKENHI-PROJECT-19K07688, KAKENHI-PROJECT-19K09172, KAKENHI-PROJECT-19K22658, KAKENHI-PROJECT-18KK0251, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-17H04282, KAKENHI-PROJECT-19H03715, KAKENHI-PROJECT-18K16355, KAKENHI-PROJECT-18K16356, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics2019

    • 著者名/発表者名
      Shimamura T, Matsui Y, Kajino T, Ito S, Takahashi T, Miyano S
    • 雑誌名

      LNBI

      巻: 10834 ページ: 124-137

    • DOI

      10.1007/978-3-030-14160-8_13

    • ISBN
      9783030141592, 9783030141608
    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04899, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-16K16146, KAKENHI-PROJECT-18K18151
  • [雑誌論文] Regnase-1-mediated post-transcriptional regulation is essential for hematopoietic stem and progenitor cell homeostasis2019

    • 著者名/発表者名
      Kidoya H, Muramatsu F, Shimamura T, Jia W, Satoh T, Hayashi Y, Naito H, Kunisaki Y, Arai F, Seki M, Suzuki Y, Osawa T, Akira S., Takakura N.
    • 雑誌名

      Nature Commun,

      巻: 10 号: 1 ページ: 1072-1072

    • DOI

      10.1038/s41467-019-09028-w

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04797, KAKENHI-PUBLICLY-18H04897, KAKENHI-PROJECT-16H02470, KAKENHI-PROJECT-17H04208, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-26710005, KAKENHI-PROJECT-19K22553, KAKENHI-PROJECT-19K16742, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-18H02841, KAKENHI-PROJECT-19H03496
  • [雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics.2018

    • 著者名/発表者名
      Shimamura T, Matsui Y, Kajino T, Ito S, Takahashi T, Miyano S.
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Bioinformatics

      巻: 10834 ページ: 115-123

    • DOI

      10.1101/349928

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition.2018

    • 著者名/発表者名
      Matsui Y, Miyano S, Shimamura T.
    • 雑誌名

      Lecture Notes in Bioinformatics

      巻: 10834 ページ: 124-137

    • DOI

      10.1101/149252

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] hibition controls aggressive prostate tumors deficient in Y-linked histone demethylase KDM5D.2018

    • 著者名/発表者名
      Komura K、Yoshikawa Y, Shimamura T, Chakraborty G, Gerke TA, Hinohara K, Chadalavada K, Jeong SH, Armenia J, Du SY, Mazzu YZ, Taniguchi K, Ibuki N, Meyer CA, Nanjangud GJ, Inamoto T, Lee GM, Mucci LA, Azuma H, Sweeney CJ, Kantoff PW.
    • 雑誌名

      Journal of Clinical Investigation

      巻: 128(7) 号: 7 ページ: 2979-95

    • DOI

      10.1172/jci96769

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K11033, KAKENHI-PROJECT-18K16716, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-17K16821
  • [雑誌論文] Integrated Molecular Characterization of the Lethal Pediatric Cancer Pancreatoblastoma2018

    • 著者名/発表者名
      Isobe T, Seki M, Yoshida K, Sekiguchi M, Shiozawa Y, Shiraishi Y,..., Kataoka K, Sato Y, Kawai T, Chiba K, Tanaka H, Shimamura T, Kato M, Iguchi A, Hama A, Taguchi T, Akiyama M, Fujimura J, Inoue A, Ito T, Deguchi T, Kiyotani C, Iehara T, Hosoi H, Oka A, Sanada M, Tanaka Y, Hata K, Miyano S, Ogawa S, Takita J
    • 雑誌名

      Cancer Res

      巻: 78(4) 号: 4 ページ: 865-876

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-17-2581

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17H04224, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Adaptive NetworkProfiler for Identifying Cancer Characteristic-Specific Gene Regulatory Networks2018

    • 著者名/発表者名
      Park H, Shimamura T, Imoto S, Miyano S
    • 雑誌名

      J Comput Biol

      巻: 25(2) 号: 2 ページ: 130-145

    • DOI

      10.1089/cmb.2017.0120

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] A temporal shift of the evolutionary principle shaping intratumor heterogeneity in colorectal cancer2018

    • 著者名/発表者名
      Saito T, Niida A, Uchi R, Hirata H, Kodama M, Okimoto T, Murakami K, Suzuki Y, Ogawa S, Miyano S, Mimori K, et al.
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 9 号: 1 ページ: 2884-2884

    • DOI

      10.1038/s41467-018-05226-0

    • NAID

      120006551763

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K08695, KAKENHI-PROJECT-18K07946, KAKENHI-PROJECT-18K08009, KAKENHI-PROJECT-18K08649, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-18H03207, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K10543, KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-15H05707
  • [雑誌論文] A latent allocation model for the analysis of microbial composition and disease2018

    • 著者名/発表者名
      Abe K, Hirayama H, Ohno K, Shimamura T.
    • 雑誌名

      BMC Bioinformatics

      巻: 19(Suppl 19) 号: S19 ページ: 519-519

    • DOI

      10.1186/s12859-018-2530-6

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Comparative Analyses of Copy-Number Variation in Autism Spectrum Disorder and Schizophrenia Reveal Etiological Overlap and Biological Insights.2018

    • 著者名/発表者名
      Kushima I, (27名中略), Hashimoto R,(80名中29番目) , et al.
    • 雑誌名

      Cell Rep

      巻: 24(11) 号: 11 ページ: 2838-2856

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2018.08.022

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18KT0022, KAKENHI-PROJECT-16K10248, KAKENHI-PROJECT-17K10295, KAKENHI-PROJECT-18K07590, KAKENHI-PROJECT-16K19763, KAKENHI-PROJECT-17K16403, KAKENHI-PROJECT-15KK0339, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-17H00883, KAKENHI-PROJECT-16H05375, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-17H05090, KAKENHI-PROJECT-16K08421, KAKENHI-PROJECT-16K09965, KAKENHI-PROJECT-16K15554, KAKENHI-PROJECT-16K19759, KAKENHI-PROJECT-16K21046, KAKENHI-PROJECT-18K15512, KAKENHI-PROJECT-26293261, KAKENHI-PROJECT-16H05380
  • [雑誌論文] Identification of Cardiomyocyte-Fated Progenitors from Human-Induced Pluripotent Stem Cells Marked with CD822018

    • 著者名/発表者名
      Takeda Masafumi、Kanki Yasuharu、Masumoto Hidetoshi、Funakoshi Shunsuke、Hatani Takeshi、Fukushima Hiroyuki、Izumi-Taguchi Akashi、Matsui Yusuke、Shimamura Teppei、Yoshida Yoshinori、Yamashita Jun K.
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 22 号: 2 ページ: 546-556

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.12.057

    • NAID

      120006460050

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K15438, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15H04819, KAKENHI-PROJECT-17H03614, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K19402, KAKENHI-PROJECT-15KK0251, KAKENHI-PROJECT-18K18151, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16K16146
  • [雑誌論文] Prognostic relevance of genetic alterations in diffuse lower-grade gliomas2017

    • 著者名/発表者名
      Aoki Kosuke、Nakamura Hideo、Suzuki Hiromichi et al.
    • 雑誌名

      Neuro-Oncology

      巻: 20 号: 1 ページ: 66-77

    • DOI

      10.1093/neuonc/nox132

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K10761, KAKENHI-PROJECT-17K16643, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-17H00758, KAKENHI-PROJECT-16H05436, KAKENHI-PROJECT-15K10337, KAKENHI-PROJECT-17K10862, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] ER Stress Signaling Promotes the Survival of Cancer “Persister Cells” Tolerant to EGFR Tyrosine Kinase Inhibitors2017

    • 著者名/発表者名
      Terai Hideki、Kitajima Shunsuke、Potter Danielle S.、Matsui Yusuke、et al.
    • 雑誌名

      Cancer Research

      巻: 78 号: 4 ページ: 1044-1057

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-17-1904

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K16146, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] High-resolution copy number variation analysis of schizophrenia in Japan.2017

    • 著者名/発表者名
      Kushima I, Aleksic B, Nakatochi M, Shimamura T, Shiino T, Yoshimi A, Kimura H, Takasaki Y, Wang C, Xing J, Ishizuka K, Oya-Ito T, Nakamura Y, Arioka Y, Maeda T, Yamamoto M, Yoshida M, Noma H, Hamada S, Morikawa M, Uno Y, Okada T, Iidaka T, Iritani S, Yamamoto T,
    • 雑誌名

      Molecular Psychiatry

      巻: 22 号: 3 ページ: 430-440

    • DOI

      10.1038/mp.2016.88

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-24116001, KAKENHI-PLANNED-24116002, KAKENHI-ORGANIZER-25117001, KAKENHI-PLANNED-25117010, KAKENHI-PROJECT-25253074, KAKENHI-PROJECT-16H05375, KAKENHI-PROJECT-16H05380, KAKENHI-PROJECT-26461742, KAKENHI-PROJECT-15K14973, KAKENHI-PROJECT-15K19720, KAKENHI-PROJECT-15K09802, KAKENHI-PROJECT-24500986, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K15559, KAKENHI-PROJECT-16K08421, KAKENHI-PROJECT-17K10295
  • [雑誌論文] Long Noncoding RNA JHDM1D-AS1 Promotes Tumor Growth by Regulating Angiogenesis in Response to Nutrient Starvation2017

    • 著者名/発表者名
      Kondo A, Nonaka A, Shimamura T, Yamamoto S, Yoshida T, Kodama T, Aburatani H, Osawa T
    • 雑誌名

      Molecular and Cellular Biology

      巻: 37 号: 18

    • DOI

      10.1128/mcb.00125-17

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K14987, KAKENHI-PROJECT-26710005, KAKENHI-PUBLICLY-16H01567, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K14605, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] PRC2-mediated transcriptomic alterations at the embryonic stage govern tumorigenesis and clinical outcome in MYCN-driven neuroblastoma.2017

    • 著者名/発表者名
      Tsubota S, Kishida S, Shimamura T, Ohira M, Yamashita S, Cao D, Kiyonari S, Ushijima T, Kadomatsu K.
    • 雑誌名

      Cancer Res

      巻: 77(19) ページ: 5259-5271

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Recurrent SPI1 (PU.1) fusions in high-risk pediatric T cell acute lymphoblastic leukemia.2017

    • 著者名/発表者名
      Seki M, Kimura S, Isobe T, Yoshida K, (13 authors), Masuda K, Kawamoto H, Ohki K, Kato M, Arakawa Y, Koh K, Hanada R, Moritake H, Akiyama M, Kobayashi R, Deguchi T, Hashii Y, Imamura T, Sato A, Kiyokawa N, Oka A, Hayashi Y, Takagi M, Manabe A, Ohara A, Horibe K, Sanada M, Iwama A, Mano H, Miyano S, Ogawa S, Takita J
    • 雑誌名

      Nature Genetics

      巻: 49 号: 8 ページ: 1274-1281

    • DOI

      10.1038/ng.3900

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K09870, KAKENHI-PROJECT-17K10130, KAKENHI-PROJECT-17K10136, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H02544, KAKENHI-PROJECT-17H04224, KAKENHI-PROJECT-17H04234, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K15498, KAKENHI-PROJECT-16K19574, KAKENHI-PROJECT-17K16242, KAKENHI-PROJECT-15H05707, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Dynamically and epigenetically coordinated GATA/ETS/SOX transcription is indispensable for endothelial cell differentiation2017

    • 著者名/発表者名
      Kanki Y, Nakaki R, Shimamura T, Matsunaga T, Yamamizu K, Katayama S, Suehiro JI, Osawa T, Aburatani H, Kodama T, Wada Y, Yamashita JK, Minami T.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Research

      巻: 印刷中 号: 8 ページ: 4344-4358

    • DOI

      10.1093/nar/gkx159

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-15H01348, KAKENHI-PROJECT-26250041, KAKENHI-PROJECT-26290035, KAKENHI-PROJECT-26710013, KAKENHI-PROJECT-26430121, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K15438, KAKENHI-PROJECT-15KK0251, KAKENHI-PROJECT-26710005, KAKENHI-PUBLICLY-16H01567, KAKENHI-PROJECT-17H03580, KAKENHI-PROJECT-17H03614, KAKENHI-PROJECT-16K14605, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Japanese genome-wide association study identifies a significant colorectal cancer susceptibility locus at chromosome 10p14.2017

    • 著者名/発表者名
      Takahashi Y, Sugimachi K, Yamamoto K, Niida A, Shimamura T, Sato T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Sugihara K, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Moriya Y, Suzuki Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
    • 雑誌名

      Cancer Sci.

      巻: 108(11) 号: 11 ページ: 2239-2247

    • DOI

      10.1111/cas.13391

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-17K12773, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] PRC2-Mediated Transcriptomic Alterations at the Embryonic Stage Govern Tumorigenesis and Clinical Outcome in MYCN-Driven Neuroblastoma2017

    • 著者名/発表者名
      2.Tsubota S, Kishida S, Shimamura T, Ohira M, Yamashita S, Cao D, Kiyonari S, Ushijima T, Kadomatsu K.
    • 雑誌名

      Cancer Res.

      巻: 77 号: 19 ページ: 5259-5271

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-16-3144

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16K08617, KAKENHI-PROJECT-17K10131, KAKENHI-PROJECT-16H05139, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K18442
  • [雑誌論文] Tumor subclonal progression model for cancer hallmark acquisition2017

    • 著者名/発表者名
      Matsui Yusuke, Miyano Satoru, Shimamura Teppei
    • 雑誌名

      Proceedings of CIBB2017

      巻: 1 ページ: 1-6

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [雑誌論文] Extracellular Acidic pH Activates the Sterol Regulatory Element-binding Protein 2 to Promote Tumor Progression2017

    • 著者名/発表者名
      Kondo A, Yamamoto S, Nakaki R, Shimamura T, Hamakubo T, Sakai J, Kodama T, Yoshida T, Aburatani H and Osawa T
    • 雑誌名

      Cell Reports

      巻: 18 号: 9 ページ: 2228-2242

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2017.02.006

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01567, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-26710005, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-16K14605, KAKENHI-PROJECT-16H06390, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Comprehensive genetic analysis of donor cell derived leukemia with KMT2A rearrangement.2017

    • 著者名/発表者名
      Taniguchi R, Muramatsu H, Okuno Y, Suzuki K, Obu S, Nakatochi M, Shimamura T, Takahashi Y, Horikoshi Y, Watanabe K, Kojima S.
    • 雑誌名

      Pediatr Blood Cancer

      巻: 65(2) 号: 2

    • DOI

      10.1002/pbc.26823

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] ddiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells.2017

    • 著者名/発表者名
      Tominaga K, Shimamura T, Kimura N, Murayama T, Matsubara D, Kanauchi H, Niida A, Shimizu S, Nishioka K, Tsuji E, Yano M, Sugano S, Shimono Y, Ishii H, Saya H, Mori M, Akashi K, Tada K, Ogawa T, Tojo A, Miyano S, Gotoh N.
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 36 ページ: 1276-1286

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H04294
  • [雑誌論文] Addiction to the IGF2-ID1-IGF2 circuit for maintenance of the breast cancer stem-like cells2017

    • 著者名/発表者名
      Tominaga K, Shimamura T, Kimura N, Murayama T, Matsubara D, Kanauchi H, Niida A, Shimizu S, Nishioka K, Tsuji EI, Yano M, Sugano S, Shimono Y, Ishii H, Saya H, Mori M, Akashi K, Tada KI, Ogawa T, Tojo A, Miyano S, Gotoh N
    • 雑誌名

      Oncogene

      巻: 36(9) 号: 9 ページ: 1276-1286

    • DOI

      10.1038/onc.2016.293

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-16H06391, KAKENHI-PROJECT-15H04294, KAKENHI-PROJECT-16J40231, KAKENHI-PROJECT-15K14381, KAKENHI-PROJECT-16K08672, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] GIMLET: Identifying biological modulators in context-specific gene regulation using local energy statistics2017

    • 著者名/発表者名
      Shimamura Teppei, Matsui Yusuke, Kajino Taisuke, Takahashi Takashi, Miyano Satoru
    • 雑誌名

      Proceedings of CIBB2017

      巻: 1 ページ: 1-6

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [雑誌論文] phyC: Clustering cancer evolutionary trees.2017

    • 著者名/発表者名
      Matsui Y, Niida A, Uchi R, Mimori K, Miyano S, Shimamura T:
    • 雑誌名

      PLoS Comput Biol.

      巻: 13(5) 号: 5 ページ: 1005509-1005509

    • DOI

      10.1371/journal.pcbi.1005509

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K19608, KAKENHI-PROJECT-16K16146, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Aberrant Methylation of FOXE1 Contributes to a Poor Prognosis for Patients with Colorectal Cancer.2016

    • 著者名/発表者名
      Sugimachi K, Matsumura T, Shimamura T, Hirata H, Uchi R, Ueda M, Sakimura S, Iguchi T, Eguchi H, Masuda T, Morita K, Takenaka K, Maehara Y, Mori M, Mimori K.
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol.

      巻: 23(12) 号: 12 ページ: 3948-3955

    • DOI

      10.1245/s10434-016-5289-x

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-16H01576, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-15K10168, KAKENHI-PROJECT-16K07177, KAKENHI-PROJECT-16K10543, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Genomic Landscape of Esophageal Squamous Cell Carcinoma in a Japanese Population.2016

    • 著者名/発表者名
      G. Sawada (他43名, 山本21番目)
    • 雑誌名

      Gastroenterology

      巻: 150 号: 5 ページ: 1171-1182

    • DOI

      10.1053/j.gastro.2016.01.035

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-14J10908, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003, KAKENHI-PROJECT-25290043, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-15H05791, KAKENHI-PROJECT-16H04692, KAKENHI-PROJECT-26293303, KAKENHI-PROJECT-26461994, KAKENHI-PROJECT-15K15496
  • [雑誌論文] NECAB3 Promotes Activation of Hypoxia-inducible factor-1 during Normoxia and Enhances Tumourigenicity of Cancer Cells2016

    • 著者名/発表者名
      1.Nakaoka HJ, Hara T, Yoshino S, Kanamori A, Matsui Y, Shimamura T, Sato H, Murakami Y, Seiki M, Sakamoto T
    • 雑誌名

      Sci Rep

      巻: 6 号: 1 ページ: 22784-22784

    • DOI

      10.1038/srep22784

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K06829, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-24591313, KAKENHI-PROJECT-25460382, KAKENHI-PROJECT-26640121, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25290051, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15H05325, KAKENHI-PROJECT-16H04695
  • [雑誌論文] Detection of differential distributions of methylation patterns2016

    • 著者名/発表者名
      Matsui Y, Mizuta M, Miyano S, Shimamura T
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 印刷中 号: 15 ページ: 1-8

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btw138

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-25540008, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PUBLICLY-16H01572, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Integrated Multiregional Analysis Proposing a New Model of Colorectal Cancer Evolution.2016

    • 著者名/発表者名
      R. Uchi (他40名, 山本36番目)
    • 雑誌名

      PLoS Genetics

      巻: 12 号: 2 ページ: 1-24

    • DOI

      10.1371/journal.pgen.1005778

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K05577, KAKENHI-PROJECT-15K10150, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H05707, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-25462038, KAKENHI-PROJECT-25462070, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521, KAKENHI-PROJECT-26861003, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-26461994, KAKENHI-PROJECT-15K19899, KAKENHI-PROJECT-15K10170, KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [雑誌論文] Mutational landscape and clonal architecture in grade II and III gliomas2015

    • 著者名/発表者名
      Suzuki H, Aoki K, Natsume A, Ogawa S. et al.
    • 雑誌名

      Nat Genet.

      巻: 47 号: 5 ページ: 458-468

    • DOI

      10.1038/ng.3273

    • 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134006, KAKENHI-PLANNED-23107010, KAKENHI-PROJECT-24390341, KAKENHI-PROJECT-15K10337, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K19964, KAKENHI-PLANNED-15H05909, KAKENHI-PROJECT-26640088, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25861268, KAKENHI-PROJECT-25290048
  • [雑誌論文] An Integrative Analysis to Identify Driver Genes in Esophageal Squamous Cell Carcinoma2015

    • 著者名/発表者名
      Sawada G, Niida A, Hirata H, Komatsu H, Uchi R, Shimamura T, Takahashi Y, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Takano Y, Ueda M, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Yamasaki M, Tanaka F, Tachimori Y, Kajiyama Y, Natsugoe S, Fujita H, Tanaka Y, Calin G, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 10(10) 号: 10 ページ: e0139808-e0139808

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0139808

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04921, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-26670608, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003
  • [雑誌論文] Integrated genetic and epigenetic analysis defines novel molecular subgroups in rhabdomyosarcoma.2015

    • 著者名/発表者名
      Seki M, Nishimura R, Yoshida K, Shimamura T, Shiraishi Y, Sato Y, Kato M, Chiba K, Tanaka H, Hoshino N, Nagae G, Shiozawa Y, Okuno Y, Hosoi H, Tanaka Y, Okita H, Miyachi M, Souzaki R, Taguchi T, Koh K, Hanada R, Kato K, Nomura Y, Akiyama M, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Aburatani H, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J.
    • 雑誌名

      Nat Commun.

      巻: 6 号: 1 ページ: 7557-7557

    • DOI

      10.1038/ncomms8557

    • NAID

      120005623266

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K08987, KAKENHI-PROJECT-26461566, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-25461611, KAKENHI-PROJECT-25670482, KAKENHI-PROJECT-26670493, KAKENHI-PROJECT-26670766, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521, KAKENHI-PROJECT-26293242
  • [雑誌論文] Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks2015

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T
    • 雑誌名

      MC Syst Biol

      巻: 9(1) ページ: 14-14

    • NAID

      120005749949

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Integrated molecular analysis of adult T cell leukemia/lymphoma.2015

    • 著者名/発表者名
      Kataoka K, Nagata Y, Kitanaka A, Shiraishi Y, Shimamura T, Yasunaga J, Totoki Y, Chiba K, Sato-Otsubo A, Nagae G, et al.
    • 雑誌名

      Nat Genet.

      巻: 47(11) 号: 11 ページ: 1304-15

    • DOI

      10.1038/ng.3415

    • 査読あり / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K08987, KAKENHI-PROJECT-15K09479, KAKENHI-PROJECT-15K09507, KAKENHI-PROJECT-26460554, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-25250020, KAKENHI-PROJECT-26893127, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521, KAKENHI-PROJECT-25293219
  • [雑誌論文] Genomic data assimilation using a higher moment filtering technique for restoration of gene regulatory networks2015

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Mori T, Yamaguchi R, Shimamura T, Miyano S, Imoto S, Akutsu T.
    • 雑誌名

      BMC Systems Biology

      巻: 9 号: 1 ページ: 14-14

    • DOI

      10.1186/s12918-015-0154-2

    • NAID

      120005749949

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24300111, KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] A likelihood-free filtering method via approximate Bayesian computation in evaluating biological simulation models2015

    • 著者名/発表者名
      Hasegawa T, Niida A, Mori T, Shimamura T, Yamaguchi R, Miyano S, Akutsu T, Imoto S
    • 雑誌名

      Computational Statistics & Data Analysis

      巻: 94 ページ: 63-74

    • DOI

      10.1016/j.csda.2015.08.003

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H06008, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] High performance computing of a fusion gene detection pipeline on the K computer2015

    • 著者名/発表者名
      Ito S, Shiraishi Y, Shimamura T, Chiba K, Miyano S
    • 雑誌名

      BIBM

      巻: 2015 ページ: 1441-1447

    • DOI

      10.1109/bibm.2015.7359888

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912
  • [雑誌論文] Elevated β-catenin pathway as a novel target for patients with resistance to EGF receptor targeting drugs2015

    • 著者名/発表者名
      Nakata A, Yoshida R, Yamaguchi R, Yamauchi M, Tamada Y, Fujita A, Shimamura T, Imoto S, Higuchi T, Nomura M, Kimura T, Nokihara H, Higashiyama M, Kondoh K, Nishihara H, Tojo A, Yano S, Miyano S, Gotoh N
    • 雑誌名

      Scientific Report

      巻: 5 号: 1 ページ: 13076-13076

    • DOI

      10.1038/srep13076

    • NAID

      120005764206

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139, KAKENHI-PROJECT-15K18426, KAKENHI-PROJECT-15K20965, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-15H04294, KAKENHI-PROJECT-26640072, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] Loss of CDCP1 expression promotes invasiveness and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma2014

    • 著者名/発表者名
      Sawada G, Takahashi Y, Niida A, Shimamura T, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Uchi R, Takano Y, Ueda M, Hirata H, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol

      巻: 21 Suppl 4 ページ: 640-647

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Robust prediction of anti-cancer drug sensitivity and sensitivity-specific biomarker2014

    • 著者名/発表者名
      Park H, Shimamura T, Miyano S, Imoto S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9(10) 号: 10 ページ: e108990-e108990

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0108990

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] Allelic Imbalance at an 8q24 Oncogenic SNP is involved in activating MYC in human colorectal cancer2014

    • 著者名/発表者名
      Sugimachi K, Niida A, Yamamoto K, Shimamura T, Imoto S, Iinuma H, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Sugihara K, Maehara Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol

      巻: 21 Suppl 4 ページ: 515-521

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Loss of CDCP1 expression promotes invasiveness and poor prognosis in esophageal squamous cell carcinoma.2014

    • 著者名/発表者名
      Sawada G, Takahashi Y, Niida A, Shimamura T, Kurashige J, Matsumura T, Ueo H, Uchi R, Takano Y, Ueda M, Hirata H, Sakimura S, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Sugimachi K, Miyano S, Doki Y, Mori M, Mimori K.
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol.

      巻: 4 号: S4 ページ: 640-647

    • DOI

      10.1245/s10434-014-3740-4

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24592005, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26861003
  • [雑誌論文] Robust prediction of anti-cancer drug sensitivity and sensitivity-specific biomarker2014

    • 著者名/発表者名
      Park H, Shimamura T, Miyano S, Imoto S
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 9(1)

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Allelic Imbalance at an 8q24 Oncogenic SNP is Involved in Activating MYC in Human Colorectal Cancer2014

    • 著者名/発表者名
      Sugimachi K, Niida A, Yamamoto K, Shimamura T, Imoto S, Iinuma H, Shinden Y, Eguchi H, Sudo T, Watanabe M, Tanaka J, Kudo S, Hase K, Kusunoki M, Yamada K, Shimada Y, Sugihara K, Maehara Y, Miyano S, Mori M, Mimori K
    • 雑誌名

      Ann Surg Oncol

      巻: 21 号: S4 ページ: 3468-3476

    • DOI

      10.1245/s10434-013-3468-6

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-24591984, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma2014

    • 著者名/発表者名
      Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
    • 雑誌名

      Cancer Res

      巻: 74 号: 10 ページ: 2742-9

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-13-2470

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23390269, KAKENHI-PROJECT-25253095, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-26293242, KAKENHI-PROJECT-26670493
  • [雑誌論文] Biallelic DICER1 mutations in sporadic pleuropulmonary blastoma2014

    • 著者名/発表者名
      Seki M, Yoshida K, Shiraishi Y, Shimamura T, Sato Y, Nishimura R, Okuno Y, Chiba K, Tanaka H, Kato K, Kato M, Hanada R, Nomura Y, Park MJ, Ishida T, Oka A, Igarashi T, Miyano S, Hayashi Y, Ogawa S, Takita J
    • 雑誌名

      Cancer Res.

      巻: 74(10) ページ: 2742-2749

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Systems biology analysis of Drosophila in vivo screen data elucidates core networks for DNA damage repair in SCA1.2014

    • 著者名/発表者名
      Barclay, S.S., Tamura, T., Ito H., Fujita, K., Tagawa, K., Shimamura, T., Katsuta, A., Shiwaku, H., Sone, M., Imoto, S., Miyano, S. and Okazawa, H.
    • 雑誌名

      Hum Mol Genet

      巻: 23 号: 5 ページ: 1345-1364

    • DOI

      10.1093/hmg/ddt524

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-22110001, KAKENHI-PLANNED-22110002, KAKENHI-PROJECT-23500401, KAKENHI-PROJECT-24500378, KAKENHI-PROJECT-24700374, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] The Tumor-suppressive mir-497-195 cluster targets multiple cell-cycle regulators in hepatocellular carcinoma.2013

    • 著者名/発表者名
      Furuta M
    • 雑誌名

      PLoS One

      巻: 8 号: 3 ページ: e60155-e60155

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0060155

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-ORGANIZER-22130001, KAKENHI-PLANNED-22134002, KAKENHI-PROJECT-22240090, KAKENHI-PROJECT-23390077, KAKENHI-PROJECT-25250019, KAKENHI-PROJECT-25253081, KAKENHI-PROJECT-25640062, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Recurrent mutations in multiple components of the cohesin complex in myeloid neoplasms2013

    • 著者名/発表者名
      Kon A, Shih LY, Sanada M, Shiraishi Y, Okuno Y, Nagae G, Nishimoto A, Nowak D, Sato Y, Shimamura T, Tanaka H, Chiba K, Yamaguchi T, Otsu M, Obara N, Nakamaki T, Ishiyama K, Nolte F, Hofmann WK, Miyawaki S, Chiba S, Mori H, Nakauchi H, Koeffler HP, Aburatani H, Haferlach T, Shirahige K, Miyano S, Ogawa S.
    • 雑誌名

      Nature Genet.

      巻: 45(10) ページ: 1232-1237

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Recurrent mutations in multiple components of the cohesin complex in myeloid neoplasms.2013

    • 著者名/発表者名
      Kon A, Yoshida K
    • 雑誌名

      Nature Genet.

      巻: 45 号: 10 ページ: 1232-1237

    • DOI

      10.1038/ng.2731

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12J04216, KAKENHI-PLANNED-22134003, KAKENHI-PLANNED-22134006, KAKENHI-PROJECT-22221009, KAKENHI-PLANNED-23106004, KAKENHI-PROJECT-23249052, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-24249056, KAKENHI-PROJECT-24390242, KAKENHI-PROJECT-24659458, KAKENHI-PROJECT-25290065, KAKENHI-PROJECT-25461408, KAKENHI-PROJECT-25670446, KAKENHI-PROJECT-25670471, KAKENHI-PROJECT-25670489, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521
  • [雑誌論文] Plastin3 is a novel marker for circulating tumor cells undergoing the epithelial-mesenchymal transition and is associated with colorectal cancer prognosis.2013

    • 著者名/発表者名
      Yokobori T, Iinuma H, Shimamura T, Imoto S, Sugimachi K, Ishii H, Iwatsuki M, Ota D, Ohkuma M, Iwaya T, Nishida N, Kogo R, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Toh H, Sato T, Barnard GF, Fukagawa T, Yamamoto S, Nakanishi H, Sasaki S, Miyano S, Watanabe T, Kuwano H, Mimori K, Pantel K, Mori M.
    • 雑誌名

      Cancer Res

      巻: 1; 73(7) 号: 7 ページ: 2059-69

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-12-0326

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23591937, KAKENHI-PLANNED-24108006, KAKENHI-PROJECT-24591984, KAKENHI-PROJECT-25430111, KAKENHI-PROJECT-25461953, KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [雑誌論文] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor associated macrophages2013

    • 著者名/発表者名
      Shimamura T, Wang F, Suehiro J, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M
    • 雑誌名

      Cancer Res

      巻: 73 号: 10 ページ: 3019-3028

    • DOI

      10.1158/0008-5472.can-12-3231

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23300342, KAKENHI-PROJECT-23701047, KAKENHI-PUBLICLY-24116509, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-24650609, KAKENHI-PROJECT-24700969, KAKENHI-PROJECT-24710227, KAKENHI-PUBLICLY-25118505, KAKENHI-PUBLICLY-25125707, KAKENHI-PUBLICLY-25134706, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25893063
  • [雑誌論文] Integrated molecular analysis of clear-cell renal cell carcinoma2013

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Yoshizato T, Shiraishi Y, Maekawa S, Okuno Y, Kamura T, Shimamura T, Sato-Otsubo A, Nagae G, Suzuki H, Nagata Y, Yoshida K, Kon A, Suzuki Y, Chiba K, Tanaka H, Niida A, Fujimoto A, Tsunoda T, Morikawa T, Maeda D, Kume H, Sugano S, Fukayama M, Aburatani H, Sanada M, Miyano S, Homma Y, Ogawa S.
    • 雑誌名

      Nature Genet.

      巻: 45(8) ページ: 860-867

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Inhibition of histone demethylase JMJD1A improves anti-angiogenic therapy and reduces tumor associated macrophages2013

    • 著者名/発表者名
      Osawa T, Tsuchida R, Muramatsu M, Shimamura T, Wang F, Suehiro JI, Kanki Y, Wada Y, Yuasa Y, Aburatani H, Miyano S, Minami T, Kodama T, Shibuya M.
    • 雑誌名

      Cancer Res.

      巻: 73(10) ページ: 3019-3028

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Integrated molecular analysis of clear-cell renal cell carcinoma.2013

    • 著者名/発表者名
      Sato Y, Yoshida K
    • 雑誌名

      Nature Genet.

      巻: 45 号: 8 ページ: 860-867

    • DOI

      10.1038/ng.2699

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-12J04216, KAKENHI-PLANNED-22134008, KAKENHI-PLANNED-24112006, KAKENHI-PROJECT-24221011, KAKENHI-PROJECT-24700272, KAKENHI-PROJECT-25291023, KAKENHI-PROJECT-25670446, KAKENHI-PROJECT-25730173, KAKENHI-PROJECT-25860521
  • [雑誌論文] Plastin3 is a novel marker for circulating tumor cells undergoing the epithelial-mesenchymal transition and is associated with colorectal cancer prognosis2013

    • 著者名/発表者名
      Yokobori T, Iinuma H, Shimamura T, Imoto S, Sugimachi K, Ishii H, Iwatsuki M, Ota D, Ohkuma M, Iwaya T, Nishida N, Kogo R, Sudo T, Tanaka F, Shibata K, Toh H, Sato T, Barnard GF, Fukagawa T, Yamamoto S, Nakanishi H, Sasaki S, Miyano S, Watanabe T, Kuwano H, Mimori K, Pantel K, Mori M
    • 雑誌名

      Cancer Res.

      巻: 73(7) ページ: 2059-2069

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Epidermal growth factor receptor tyrosine kinase defines critical prognostic genes of stage I lung adenocarcinoma2012

    • 著者名/発表者名
      後藤 典子
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 7 号: 9 ページ: e43923-e43923

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0043923

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22130009, KAKENHI-PROJECT-22300099, KAKENHI-PROJECT-23390062, KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Identifying Gene pathways associated with cancer characteristics via sparse statistical methods2012

    • 著者名/発表者名
      Kawano S, Shimamura T, Niida A, Imoto S, Yamaguchi R, Nagasaki M, Yoshida R, Print C, Miyano S
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 9(4) 号: 4 ページ: 966-972

    • DOI

      10.1109/tcbb.2012.48

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Statistical model-based testing to evaluate the recurrence of genomic aberrations2012

    • 著者名/発表者名
      Niida A, Imoto S, Shimamura T, Miyano S
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 28(12) 号: 12 ページ: i115-i120

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/bts203

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] N-cadherin expression is a potential survival mechanism of gefitinib-resistant lung cancer cells2011

    • 著者名/発表者名
      Yamauchi M, Yoshino I, Yamaguchi R, Shimamura T, Nagasaki M, Imoto S, Niida A, Koizumi F, Kohno T, Yokota J, Miyano S, Gotoh N
    • 雑誌名

      Am J Cancer Res

      巻: 1(7) ページ: 828-833

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] SiGN : large-scale gene network estimation environment for high performance computing2011

    • 著者名/発表者名
      Tamada Y, Shimamura T, Yamaguchi R, Imoto S, Nagasaki M, Miyano S
    • 雑誌名

      Genome Informatics

      巻: 25 ページ: 40-52

    • NAID

      130004567842

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Inferring contagion in regulatory networks2011

    • 著者名/発表者名
      Fujita A, Sato JR, Demas MAA, Yamaguchi R, Shimamura T, Ferreira CE, Sogayar, MC, Miyano S
    • 雑誌名

      IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics

      巻: 8(2) 号: 2 ページ: 570-576

    • DOI

      10.1109/tcbb.2010.40

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] A novel network profiling analysis reveals system changes in epithelial-mesenchymal transition2011

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, T., Imoto, S., Shimada, Y., Hosono, Y., Niida, A., Nagasaki, M., Yamaguchi, R., Takahashi, T., Miyano, S
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 6 号: 6 ページ: e20804-e20804

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0020804

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21249037, KAKENHI-PLANNED-22134004, KAKENHI-PLANNED-22134005
  • [雑誌論文] Inferring dynamic gene networks under varying conditions for transcriptomic network comparison2010

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, T., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 26(8) ページ: 1064-1072

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Discovering functional gene pathways associated with cancer heterogeneity via sparse supervised learning2010

    • 著者名/発表者名
      Kawano, S., Shimamura, T., Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Yoshida, R., Print, C., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Proc.IEEE 10th International Symposium on Bioinformatics & Bioengineering

      ページ: 253-258

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Collocation-based sparse estimation for constructing dynamic gene networks2010

    • 著者名/発表者名
      Shimamura, T., Imoto, S., Nagasaki, M., Yamauchi, M., Yamaguchi, R., Fujita, A., Tamada, Y, Gotoh, N., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Genome Informatics

      巻: 24 ページ: 164-178

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [雑誌論文] Model-free unsupervised gene set screening based on information enrichment in expression profiles2010

    • 著者名/発表者名
      Niida, A., Imoto, S., Yamaguchi, R., Nagasaki, M., Fujita, A., Shimamura, T., Miyano, S.
    • 雑誌名

      Bioinformatics

      巻: 26(24) ページ: 3090-3097

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-22134004
  • [学会発表] Deep generative models to reveal cellular level dynamics and communication2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics(ICIAM2023)
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層生成モデルによる細胞運命決定シミュレーション2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 生成AIで紐解く多細胞システムの動作原理2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      日本学術会議 生物系薬学分科会 公開シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [学会発表] 深層学習による細胞ダイナミクスの新次元俯瞰2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回がんと代謝研究会・若手の会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [学会発表] 未病検知のための深層生成モデルの開発と応用2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回日本メディカルAI学会学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [学会発表] Deep generative models to reveal cellular level dynamics and communication2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      ICIAM2023
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [学会発表] Functional analysis of LCI15, which suppresses the CO2-concentrating mechanism in the green algae Chlamydomonas reinhardtii2023

    • 著者名/発表者名
      Shizuka Miichi、Daisuke Shimamura、Junko Yasuda、Takashi Yamano、Hideya Fukuzawa
    • 学会等名
      19th International Student Seminar
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層生成モデルによる細胞運命決定シュミレーション2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第96回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [学会発表] 深層生成モデルで読み解く生命システムの動作原理2023

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第7回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] 深層学習による細胞ダイナミクスの新次元俯瞰2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回がんと代謝研究会・若手の会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 未病検知のための深層生成モデルの開発と応用2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回日本メディカルAI学会学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層生成モデルで読み解く生命システムの動作原理2023

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第7回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] AIのレンズを通じて見る多細胞システムのダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-23H04938
  • [学会発表] AIのレンズを通じて見る多細胞システムのダイナミクス2023

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] データから読み解く生命医科学2022

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      脳神経内科医のためのバイオインフォマティクス・ハンズオン 2021
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第60回日本癌治療学会学術集会会長企画シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会企画シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      LINK-Jセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] A New Modality Using Deep Learning for Elucidating Tumor Microenvironment2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会企画シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      LINK-Jセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] 深層生成モデルで読み解く生命システムの動作原理2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第7回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] A new modality for elucidating tumor microenvironment using deep learning2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Identification of human pDC/B bifurcation with highly fluctuating cell state dynamics2022

    • 著者名/発表者名
      永春 圭規、小嶋 泰弘、廣瀬 遥香、日野原 邦彦、 杦本 由香、 仁井 栄、俵 功、島村 徹平、片山 直之、大石 晃嗣
    • 学会等名
      第84回日本血液学会学術集会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会企画シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] Estimating fluctuations in cell state dynamics and predicting fate bifurcations under influenza infection using deep learning2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第20回あわじ感染と免疫国際フォーラム
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] Abnormal pyrenoid morphology due to the SAGA1 mutation affects CAS-dependent gene expression and CAS localization in Chlamydomonas reinhardtii2022

    • 著者名/発表者名
      Daisuke Shimamura、Takashi Yamano、Yuuki Niikawa、Hu Donghui、Hideya Fukuzawa
    • 学会等名
      The 10th International Symposium on Inorganic Carbon Utilization by Aquatic Photosynthetic Organisms
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      LINK-Jセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] データから読み解く生命医科学2022

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      脳神経内科医のためのバイオインフォマティクス・ハンズオン 2021
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] A new modality for elucidating tumor microenvironment using deep learning2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第95回日本生化学会大会企画シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] Estimating fluctuations in cell state dynamics and predicting fate bifurcations under influenza infection using deep learning2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第20回あわじ感染と免疫国際フォーラム
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 細胞間コミュニケーションを読み解くためのデータ科学2022

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第6回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] 深層学習で細胞社会を読み解く2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会フォーラム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] 深層学習で細胞社会を読み解く2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層学習で細胞社会を読み解く2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会フォーラム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Estimating fluctuations in cell state dynamics and predicting fate bifurcations under influenza infection using deep learning2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第20回あわじ感染と免疫国際フォーラム
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] 細胞間コミュニケーションを読み解くためのデータ科学2022

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第6回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第60回日本癌治療学会学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 細胞間コミュニケーションを読み解くためのデータ科学2022

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第6回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] データから読み解く生命医科学2022

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      脳神経内科医のためのバイオインフォマティクス・ハンズオン 2021
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] A new modality for elucidating tumor microenvironment using deep learning2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第81回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Unveiling highly fluctuating single-cell transcriptome dynamics at a novel bifurcation point in human lymphoid pathway2022

    • 著者名/発表者名
      Keiki Nagaharu、Yasuhiro Kojima、Yuki Kageyama、Yuka Sugimoto、Masahiro Masuya、Shigeru Nii、Masahide Seki、Yutaka Suzuki、Isao Tawara、Teppei Shimamura、Naoyuki Katayama、Kohshi Ohishi
    • 学会等名
      64th ASH Annual Meeting & Exposition
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第60回日本癌治療学会学術集会会長企画シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Estimating fluctuations in cell state dynamics and predicting fate bifurcations under influenza infection using deep learning2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第20回あわじ感染と免疫国際フォーラム
    • 招待講演 / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [学会発表] 深層学習で細胞社会を読み解く2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会フォーラム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 深層学習による生体内微小環境の新次元俯瞰2022

    • 著者名/発表者名
      島村 徹平
    • 学会等名
      第60回日本癌治療学会学術集会会長企画シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-22H04839
  • [学会発表] データとモデルが駆動する生命科学2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第32回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 細胞間コミュニケーションを読み解く深層学習2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] Deep learning to decipher cell dynamics and cell-cell interactions2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 一細胞マルチモーダル情報をデータとモデルから読み解く2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      産業技術研究所人工知能研究センター第51回AIセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Modeling cell population dynamics and cell-to-cell communication from single-cell multi-omics data2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Deep learning to decipher cell dynamics and cell-cell interactions2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 細胞集団のダイナミクスを捉えるためのベイズモデリング2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 細胞間コミュニケーションを読み解く深層学習2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 細胞集団のダイナミクスを捉えるためのベイズモデリング2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 細胞間コミュニケーションを読み解く深層学習2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第94回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Modeling cell population dynamics and cell-to-cell communication from single-cell multi-omics data2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] 細胞集団のダイナミクスを捉えるためのベイズモデリング2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] Deep learning to decipher cell dynamics and cell-cell interactions2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第44回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] データとモデルが駆動する生命科学2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第32回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] データとモデルが駆動する生命科学2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第32回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 一細胞マルチモーダル情報をデータとモデルから読み解く2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      産業技術研究所人工知能研究センター第51回AIセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] 細胞集団のダイナミクスを捉えるためのベイズモデリング2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回理論免疫学ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] シングルセルオミクス解析のためのAI技術の最新動向2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第39回内分泌代謝学サマーセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] シングルセルオミクス解析のためのAI技術の最新動向2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第39回内分泌代謝学サマーセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] シングルセルオミクス解析のためのAI技術の最新動向2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第39回内分泌代謝学サマーセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 一細胞マルチモーダル情報をデータとモデルから読み解く2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      産業技術研究所人工知能研究センター第51回AIセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] Modeling cell population dynamics and cell-to-cell communication from single-cell multi-omics data2021

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第80回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] がん研究における一細胞解析のためのモデリング・AI 技術の最新動向2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 今こそ知りたい!行列因子分解~ゼロから始めるマルチオミクス解析~2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      代謝統合オミクス若手技術セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 臓器連関トランスオミクス解析のためのベイズモデリング2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] データサイエンスを駆動力とした多細胞ダイナミクスの数理モデリング2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      新学術領域「細胞ダイバース」第3回若手ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 多細胞時空間動態のベイズモデリングとその応用2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第2回日本メディカルAI学会学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] がん研究における一細胞解析のためのモデリング・AI 技術の最新動向2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] 数理モデリングによる生命現象の理解と制御2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      東北大学加齢研究所セミナー・キャノンメディカルシステムズARL共催セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 多細胞時空間動態のベイズモデリングとその応用2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第2回日本メディカルAI学会学術集会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 数理モデリングによる生命現象の理解と制御2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      東北大学加齢研究所セミナー・キャノンメディカルシステムズARL共催セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 臓器連関トランスオミクス解析のためのベイズモデリング2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 今こそ知りたい!行列因子分解~ゼロから始めるマルチオミクス解析~2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      代謝統合オミクス若手技術セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] データサイエンスを駆動力とした多細胞ダイナミクスの数理モデリング2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      新学術領域「細胞ダイバース」第3回若手ワークショップ
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] がん研究における一細胞解析のためのモデリング・AI 技術の最新動向2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 臓器連関トランスオミクス解析のためのベイズモデリング2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] がん研究における一細胞解析のためのモデリング・AI 技術の最新動向2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第79回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 今こそ知りたい!行列因子分解~ゼロから始めるマルチオミクス解析~2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      代謝統合オミクス若手技術セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-20H04841
  • [学会発表] 今こそ知りたい!行列因子分解~ゼロから始めるマルチオミクス解析~2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      代謝統合オミクス若手技術セミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K21832
  • [学会発表] 臓器連関トランスオミクス解析のためのベイズモデリング2020

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第93回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20H04281
  • [学会発表] 医学と予兆学~疾病発生および治癒効果の予兆に向けて~2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      名古屋大学予兆学シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 多細胞時空間解析のためのデータサイエンス2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第11回がんゲノム・エピゲノム数理統計研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 一細胞時空間オミクス解析のためのデータサイエンス2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 一細胞遺伝子発現プロファイルからの細胞集団および細胞間コミュニケーションの動態モデリング2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 拡張された非負値行列因子分解によるオミクスデータの解析2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      2019年度統計関連学会連合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 一細胞時空間オミクス解析のためのデータサイエンス2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第92回日本生化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] データサイエンスを駆動力とした多細胞時空間動態のモデリング2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      Single-Cell 2019 OSAKAセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] データサイエンスを駆動力とした多細胞時空間動態のモデリング2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      Single-Cell 2019 OSAKAセミナー
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] データサイエンスとAIで迫る時空間オミクス研究の現在と未来2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「がん研究の新機軸」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 拡張された非負値行列因子分解によるオミクスデータの解析2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      2019年度統計関連学会連合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 多細胞時空間解析のためのデータサイエンス2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] がん免疫療法の耐性化ダイナミクスを理解するための数理モデリング2019

    • 著者名/発表者名
      阿部興、島村徹平
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会2019年年会・第8回生命医薬情報学連合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 一細胞遺伝子発現プロファイルからの細胞集団および細胞間コミュニケーションの動態モデリング2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第57回日本生物物理学会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] がん免疫療法の耐性化ダイナミクスを理解するための数理モデリング2019

    • 著者名/発表者名
      阿部興、島村徹平
    • 学会等名
      日本バイオインフォマティクス学会2019年年会・第8回生命医薬情報学連合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 多細胞時空間解析のためのデータサイエンス2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第42回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-19H05210
  • [学会発表] 多細胞時空間解析のためのデータサイエンス2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第11回がんゲノム・エピゲノム数理統計研究会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 医学と予兆学~疾病発生および治癒効果の予兆に向けて~2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      名古屋大学予兆学シンポジウム
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] データサイエンスとAIで迫る時空間オミクス研究の現在と未来2019

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「がん研究の新機軸」
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 腫瘍内不均一性の一細胞トランスクリプトーム解析のためのバイオインフォマティクス2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第77回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] がん微小環境における細胞間相互作用のモデリング2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      2018年度統計関連学会連合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] バイオインフォマティクスにおけるスパースモデリング2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      日本行動計量学会 第46回大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] がん免疫システムの時間・空間・個体間多様性を読み解くデータサイエンス2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] Sparse Regression Modeling of Drug Response with A Localized Estimation Framework2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      The Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] データサイエンスとの連携・融合による生命科学研究の新時代2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第61回日本神経化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] がん免疫システムの時間・空間・個体間多様性を読み解くデータサイエンス2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] 疾患メタゲノム解析のためのベイズモデリング2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第7回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] Sparse Regression Modeling of Drug Response with A Localized Estimation Framework2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      The Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2018
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] バイオインフォマティクスにおけるスパースモデリング2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      日本行動計量学会 第46回大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] データサイエンスとの連携・融合による生命科学研究の新時代2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第61回日本神経化学会大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 疾患メタゲノム解析のためのベイズモデリング2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第7回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2018)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] がん微小環境における細胞間相互作用のモデリング2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      2018年度統計関連学会連合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PUBLICLY-18H04798
  • [学会発表] 腫瘍内不均一性の一細胞トランスクリプトーム解析のためのバイオインフォマティクス2018

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第77回日本癌学会学術総会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] 生命科学におけるビッグデータ駆動型科学の実践と将来2017

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] 生命科学におけるビッグデータ駆動型科学の実践と将来2017

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] GIMLET: Identifying Biological Modulators in Context-Specific Gene Regulation Using Local Energy Statistics2017

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      CIBB2017(Computational Intelligence methods for Bioinformatics and Biostatistics)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] Sparse Regression Modeling of Drug Response with A Localized Estimation Framework2017

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      ISMB/ECCB2017(Intelligent Systems for Molecular Biology and the 16TH European Conference on Computational Biology)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] システム生物学的アプローチに基づくオミックス統合解析2016

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会年会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] システム生物学的アプローチに基づくオミックス統合解析2016

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第39回分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] 局所距離相関に基づくモジュレーター因子の網羅的探索法2016

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      2016年度統計関連学会連合大会
    • 発表場所
      金沢大学(石川県金沢市)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] Identifying biological modulators using local energy statistics2016

    • 著者名/発表者名
      Teppei Shimamura
    • 学会等名
      CMStatistics 2016 (ERCIM2016)
    • 発表場所
      セビリア大学(スペイン、セビリア)
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] マルチオミックス情報に基づくがんのモジュレーター因子の網羅的探索2016

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回生命医薬情報学連合大会
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] マルチオミックス情報に基づくがんのモジュレーター因子の網羅的探索2016

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第5回生命医薬情報学連合大会
    • 発表場所
      東京国際交流館プラザ平成(東京都江東区)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] Analysis of Big Data - Genome Data -2016

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      実世界データ循環学サマースクール2016
    • 発表場所
      ハノイ工科大学(ベトナム、ハノイ)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] がんの俯瞰的理解のための統合的統計モデリング2015

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-02
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] オミックスビッグデータ解析の現状と課題2015

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      平成26年度「複雑データの解析法に関する研究会」
    • 発表場所
      統計数理研究所(東京都立川市)
    • 年月日
      2015-02-19
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] Bayesian integrated analysis of chromatin interaction maps2015

    • 著者名/発表者名
      Shimamura T
    • 学会等名
      Pacific Symposium on Biocomputing 2015
    • 発表場所
      The Fairmont Orchid, Hawaii (アメリカ、ハワイ州)
    • 年月日
      2015-01-06
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] Discovering modulators of gene regulation by local energy statistics2015

    • 著者名/発表者名
      Teppei Shimamura
    • 学会等名
      IFCS2015
    • 発表場所
      ボローニャ大学(イタリア、ボローニャ)
    • 年月日
      2015-07-07
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] Discovering modulators of gene regulation by local energy statistics2015

    • 著者名/発表者名
      Teppei Shimamura
    • 学会等名
      IFCS2015
    • 発表場所
      ボローニャ大学(イタリア、ボローニャ)
    • 年月日
      2015-07-07
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] がん悪性化に寄与する発現制御調整因子のイン・シリコ探索2015

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      がんゲノムの情報と数理
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所(東京都港区)
    • 年月日
      2015-09-30
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] がんの俯瞰的理解のための統合的統計モデリング2015

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15H05325
  • [学会発表] がん悪性化に寄与する発現制御調整因子のイン・シリコ探索2015

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      がんゲノムの情報と数理
    • 発表場所
      東京大学医科学研究所(東京都港区)
    • 年月日
      2015-09-30
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] がんの俯瞰的理解のための統合的統計モデリング2015

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第38回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • 年月日
      2015-12-02
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-15K12139
  • [学会発表] Integrative systems understanding of cancer metabolism with constraint-based modeling of metabolic flux2014

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第73回日本癌学会学術総会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • 年月日
      2014-09-26
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] オミクス解析におけるグラフィックス2014

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      日本計算機統計学会第28回シンポジウム
    • 発表場所
      沖縄科学技術大学院大学(沖縄県恩納村)
    • 年月日
      2014-11-15
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] Systems analysis of cancer metabolism with constraint-based model of metabolic flux2014

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      第87回日本生化学会大会
    • 発表場所
      国立京都国際会館(京都府京都市)
    • 年月日
      2014-10-17
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] Hierarchical Bayes model-based analysis of chromatin interaction maps2013

    • 著者名/発表者名
      Shimamura T
    • 学会等名
      Genome Informatics
    • 発表場所
      Cold Spring Harbor Laboratory, NY, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] Accurate detection of chromatin interactions from ChIA-PET sequencing data with a hierarchical Bayes model2013

    • 著者名/発表者名
      Shimamura T
    • 学会等名
      Clinical Genomics and Informatics Europe
    • 発表場所
      Sheraton Hotel and Spa, Lisbon, Portugal
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • [学会発表] 抗がん剤感受性予測に向けてのバイオインフォマティクスの現状と課題

    • 著者名/発表者名
      島村徹平
    • 学会等名
      日本計算機統計学会第27回大会
    • 発表場所
      青森県弘前大学
    • 招待講演
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25730173
  • []

  • 1.  白石 友一 (70516880)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 5件
  • 2.  後藤 典子 (10251448)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 4件
  • 3.  宮野 悟 (50128104)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 26件
  • 4.  井元 清哉 (10345027)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 16件
  • 5.  山口 類 (90380675)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 10件
  • 6.  玉田 嘉紀 (80435495)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 2件
  • 7.  大澤 毅 (50567592)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 3件
  • 8.  東條 有伸 (00211681)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 9.  岡本 康司 (80342913)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  鈴木 穣 (40323646)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 11.  長崎 正朗 (90396862)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 7件
  • 12.  樋口 知之 (70202273)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  茅野 光範 (20590095)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  神吉 康晴 (00534869)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 15.  PARK HEEWON (70756642)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 16.  新井田 厚司 (00772493)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 17.  片山 琴絵 (40581195)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  張 耀中 (60817138)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  多田 敬一郎 (80271568)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 20.  阿部 興 (70832533)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  藤原 裕展 (20615744)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 22.  木戸屋 浩康 (00543886)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  高橋 淑子 (10183857)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  鳴瀧 彩絵 (10508203)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  秋元 文 (10585805)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  長山 雅晴 (20314289)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 27.  出口 真次 (30379713)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 28.  永樂 元次 (40415097)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 29.  関口 清俊 (50187845)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 30.  松田 知己 (50419206)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 31.  高田 慎治 (60206753)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 32.  岸田 晶夫 (60224929)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 33.  大槻 純男 (60323036)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 34.  三輪 佳宏 (70263845)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 35.  三井 優輔 (70634129)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 36.  山城 義人 (70751923)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 37.  秋吉 一成 (90201285)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 38.  板倉 英祐 (90754218)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 39.  黒川 顕 (20343246)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 40.  川嶋 実苗 (00396706)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 41.  豊田 敦 (10267495)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 42.  中村 保一 (60370920)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 43.  野口 英樹 (50333349)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 44.  森 宙史 (40610837)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 45.  西村 祐貴 (20783012)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 46.  Frith Martin (40462832)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 47.  森下 真一 (90292854)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 48.  浅井 潔 (30356357)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 49.  笠原 雅弘 (60376605)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 50.  中谷 明弘 (60301149)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 51.  波江野 洋 (70706754)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 52.  伊藤 武彦 (90501106)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 53.  山田 拓司 (10437262)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 54.  高橋 弘喜 (60548460)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 55.  浜田 道昭 (00596538)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 56.  瀬々 潤 (40361539)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 57.  平川 英樹 (80372746)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 58.  熊谷 雄太郎 (00528408)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 59.  林 哲也 (10173014)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 60.  岩崎 渉 (50545019)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 61.  楠山 譲二 (70596105)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 62.  八田 稔久 (20238025)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 63.  鈴木 啓道 (90751024)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 64.  中村 英夫
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 65.  秀 拓一郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 66.  植村 健
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 67.  柳澤 聖
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 68.  坂本 毅治
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 69.  稲元 輝生
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 70.  杉町 圭史
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 71.  主藤 朝也
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 72.  山野 隆志
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 73.  桝屋 正浩
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 74.  前田 哲也
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 75.  石井 秀始
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 76.  林 周斗
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 77.  三森 功士
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 5件
  • 78.  山本 健
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 79.  松井 佑介
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 80.  小川 誠司
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 81.  加藤 忠史
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 82.  植村 守
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 83.  永江 玄太
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 84.  野中 綾
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 85.  小嶋 泰弘
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 2件
  • 86.  浜本 隆二
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 87.  金子 修三
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 88.  石川 哲朗
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 89.  増田 喬子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 90.  東 治人
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 91.  高橋 隆
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 92.  樋渡 光輝
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 93.  前原 喜彦
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 94.  江口 英利
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 95.  村上 和成
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 96.  兒玉 雅明
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 97.  高橋 純一
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 98.  渡辺 聡明
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 99.  飯沼 久恵
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 100.  山田 英樹
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 101.  滝田 順子
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 102.  南 敬
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 103.  吉松 康裕
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 104.  岸田 聡
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 105.  大野 欽司
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 3件
  • 106.  東島 恵美子(宍戸恵美子)
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 107.  酒井 寿郎
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 108.  松村 欣宏
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 109.  田中 文明
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 110.  岩谷 岳
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 111.  湯浅 保仁
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 112.  橋本 亮太
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 113.  永井 直
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 114.  今野 雅允
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 115.  門松 健治
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 116.  岩見 真吾
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 117.  岡澤 均
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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