山田拓司 Yamada Takuji

研究者番号	10437262
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京科学大学, 生命理工学院, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 2018年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 2016年度: 東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 2013年度 – 2015年度: 東京工業大学, 生命理工学研究科, 講師
審査区分/研究分野	研究代表者ゲノム生物学 / 理工系研究代表者以外小区分56030:泌尿器科学関連 / 産婦人科学
キーワード	研究代表者バイオインフォマティクス / 代謝ネットワーク / メタゲノム / 腸内細菌 / データベース / ヒト腸内細菌 / メタゲノミクス / 応用微生物 / 酵素 / 遺伝子予測 … もっと見る研究代表者以外 … もっと見るメタゲノム / メタゲノム解析 / エピゲノム / メタボローム解析 / 腸内細菌 / 前立腺癌 / GWAS / lifestyle / metagenome analysis / short chain fatty acid / metabolome analysis / life style / microbiome / prostate cancer / スーパーコンピュータ / 空間的オミックス解析 / RNA解析 / ゲノム・メタゲノム / 次世代シーケンサー / バイオインフォマティクス / シングルセル解析 / オミックス解析 / ゲノム / ゲノムアノテーション / ゲノム多型 / ゲノムアッセンブル / スーパーコンピューター / 1細胞解析 / RNA-Seq / リシーケンシング / 新規ゲノム配列決定 / 次世代DNAシーケンサー / 生殖医学 / 産科学 / 炎症性疾患 / 子宮内膜症 / 早産 / 腸内細菌叢隠す

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 研究代表者
  
  黒川顕
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2027
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成)
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
遺伝的素因、生活習慣、腸内細菌叢の多面的解析に基づく前立腺癌の早期診断戦略の構築
- 研究代表者
  
  野々村祝夫
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分56030:泌尿器科学関連
- 研究機関
  大阪大学
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
- 研究代表者
  
  小原雄治
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2021
- 研究種目
  
  新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』
- 研究機関
  国立遺伝学研究所
メタゲノム解析による切迫早産例、子宮内膜症例における腟内ならびに腸内細菌叢の解析
- 研究代表者
  
  齋藤滋
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2016
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  産婦人科学
- 研究機関
  富山大学
真菌類ゲノムからの新規酵素遺伝子発見研究代表者
- 研究代表者
  
  山田拓司
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2014
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  東京工業大学
ヒト腸内細菌叢代謝機構の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  山田拓司
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  東京工業大学

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すべて雑誌論文学会発表図書産業財産権

[図書] ゲノムでたどる古代の日本列島2023
- 著者名/発表者名
  斎藤成也監修・著、山田康弘、太田博樹、内藤健、神澤秀明、菅裕著
- 総ページ数
  287
- 出版者
  東京書籍
- ISBN
  9784487816613
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[図書] もっとよくわかる! 腸内細菌叢～健康と疾患を司る“もう1つの臓器”(実験医学別冊もっとよくわかる! シリーズ)2019
- 著者名/発表者名
  中村祐哉、山田拓司(福田真嗣編集)
- ページ
  107-111
- 総ページ数
  147
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Regulation of lymphoid-myeloid lineage bias through regnase-1/3-mediated control of Nfkbiz2024
- 著者名/発表者名
  3.Uehata T, Yamada S, Ori D, Vandenbon A, Giladi A, Jelinski A, Murakawa Y, Watanabe H, Takeuchi K, Toratani K, Mino T, Kiryu H, Standley DM, Tsujimura T, IkawaT, Kondoh G, Landthaler M, Kawamoto H, Rodewald HR, Amit I, Yamamoto R, Miyazaki M, Takeuchi O
- 雑誌名
  
  Blood
  
  巻: 143 号: 3 ページ: 243-257
- DOI
  10.1182/blood.2023020903
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KF0209, KAKENHI-PROJECT-23K11299, KAKENHI-PROJECT-20K12059, KAKENHI-PROJECT-22K19430, KAKENHI-PROJECT-22KF0226, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-23H00402, KAKENHI-PROJECT-23K27425
[雑誌論文] Leveraging explainable AI for gut microbiome-based colorectal cancer classification2023
- 著者名/発表者名
  Rynazal Ryza、Fujisawa Kota、Shiroma Hirotsugu、Salim Felix、Mizutani Sayaka、Shiba Satoshi、Yachida Shinichi、Yamada Takuji
- 雑誌名
  
  Genome Biology
  
  巻: 24 号: 1
- DOI
  10.1186/s13059-023-02858-4
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08416, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-19J40249, KAKENHI-PROJECT-22K16336
[雑誌論文] Genome analysis of Parmales, the sister group of diatoms, reveals the evolutionary specialization of diatoms from phago-mixotrophs to photoautotrophs2023
- 著者名/発表者名
  Ban Hiroki、Sato Shinya、Yoshikawa Shinya、Yamada Kazumasa、Nakamura Yoji、Ichinomiya Mutsuo、Sato Naoki、Blanc-Mathieu Romain、Endo Hisashi、Kuwata Akira、Ogata Hiroyuki
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 697-697
- DOI
  10.1038/s42003-023-05002-x
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21H05309, KAKENHI-PROJECT-22H04925
[雑誌論文] The cytosolic lncRNA dutA affects STATa signaling and developmental commitment in Dictyostelium2023
- 著者名/発表者名
 Saga Yukika、Shimoyama Yudai、Yamada Yoko、Morikawa Naoki、Kawata Takefumi
- 雑誌名
 
 Genes to Cells
 
 巻: 28 号: 2 ページ: 111-128
- DOI
 10.1111/gtc.12997
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
 KAKENHI-PROJECT-20K06672, KAKENHI-PROJECT-22H04925
[雑誌論文] Association Between Diet and Fusobacterium nucleatum in the Feces of Healthy Adults: A Hospital-based Cross-sectional Study2022
- 著者名/発表者名
 Narii Nobuhiro、Zha Ling、Sobue Tomotaka、Kitamura Tetsuhisa、Shiba Satoshi、Mizutani Sayaka、Yamada Takuji、Yachida Shinichi
- 雑誌名
 
 Cancer Prevention Research
 
 巻: 16 号: 2 ページ: 119-126
- DOI
 10.1158/1940-6207.capr-22-0399
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
 KAKENHI-PROJECT-19K08416, KAKENHI-PROJECT-22K16336, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-19J40249
[雑誌論文] XRCC1 counteracts poly(ADP ribose)polymerase (PARP) poisons, olaparib and talazoparib, and a clinical alkylating agent, temozolomide, by promoting the removal of trapped PARP1 from broken DNA.2022
- 著者名/発表者名
  Hirota Kouji、Ooka Masato、Shimizu Naoto、Yamada Kousei、Tsuda Masataka、Ibrahim Mahmoud Abdelghany、Yamada Shintaro、Sasanuma Hiroyuki、Masutani Mitsuko、Takeda Shunichi
- 雑誌名
  
  Genes to Cells
  
  巻: in press 号: 5 ページ: 331-344
- DOI
  10.1111/gtc.12929
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04267, KAKENHI-PROJECT-20H04337, KAKENHI-PROJECT-21K19235, KAKENHI-PROJECT-19KK0210, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Surgical Treatment for Colorectal Cancer Partially Restores Gut Microbiome and Metabolome Traits.2022
- 著者名/発表者名
  Shiroma H, Shiba S, Erawijantari PP, Takamaru H, Yamada M, Sakamoto T, Kanemitsu Y, Mizutani S, Soga T, Saito Y, Shibata T, Fukuda S, Yachida S, Yamada T.
- 雑誌名
  
  mSystems
  
  巻: 7 号: 2
- DOI
  10.1128/msystems.00018-22
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K15800, KAKENHI-PROJECT-19J40249, KAKENHI-PROJECT-19K08416, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-22K16336
[雑誌論文] Mediation effect of intestinal microbiota on the relationship between fiber intake and colorectal cancer2022
- 著者名/発表者名
  Shimomura Yoshimitsu、Zha Ling、Komukai Sho、Narii Nobuhiro、Sobue Tomotaka、Kitamura Tetsuhisa、Shiba Satoshi、Mizutani Sayaka、Yamada Takuji、Sawada Norie、Yachida Shinichi
- 雑誌名
  
  International Journal of Cancer
  
  巻: 152 号: 9 ページ: 1752-1762
- DOI
  10.1002/ijc.34398
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08416, KAKENHI-PROJECT-22K16336, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-19J40249
[雑誌論文] Prediction of RNA-protein interactions using a nucleotide language model2022
- 著者名/発表者名
  Yamada Keisuke、Hamada Michiaki
- 雑誌名
  
  Bioinformatics Advances
  
  巻: 2 号: 1
- DOI
  10.1093/bioadv/vbac023
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H05879, KAKENHI-PROJECT-17K20032, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-20H00624
[雑誌論文] Establishment of a reference single-cell RNA sequencing dataset for human pancreatic adenocarcinoma2022
- 著者名/発表者名
  Chijimatsu R、Kobayashi S、Takeda Y、Kitakaze M、Tatekawa S、Tachibana N、Saito T、Ennishi D、Tomida S、Sasaki K、Yamada D、Tomimaru Y、Takahashi H、Doki Y、Eguchi H
- 雑誌名
  
  iScience
  
  巻: 25 号: 8 ページ: 104659-104659
- DOI
  10.1016/j.isci.2022.104659
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K08773, KAKENHI-PROJECT-21K19526, KAKENHI-PROJECT-22H04922, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-20H00541, KAKENHI-PROJECT-20K16824, KAKENHI-PROJECT-20K18053
[雑誌論文] Hitherto-Unnoticed Self-Transmissible Plasmids Widely Distributed among Different Environments in Japan2022
- 著者名/発表者名
  Hayakawa Masaya、Tokuda Maho、Kaneko Kensei、Nakamichi Koichiro、Yamamoto Yukie、Kamijo Tatsuya、Umeki Honoka、Chiba Reimi、Yamada Ryo、Mori Mitsuya、Yanagiya Kosuke、Moriuchi Ryota、Yuki Masahiro、Dohra Hideo、Futamata Hiroyuki、Ohkuma Moriya、Kimbara Kazuhide、Shintani Masaki
- 雑誌名
  
  Applied and Environmental Microbiology
  
  巻: 88 号: 18
- DOI
  10.1128/aem.01114-22
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20KK0128, KAKENHI-PROJECT-22H04925, KAKENHI-PROJECT-22KJ1504, KAKENHI-PLANNED-19H05686, KAKENHI-PLANNED-19H05689
[雑誌論文] Cell cycle arrest determines adult neural stem cell ontogeny by an embryonic Notch-nonoscillatory Hey1 module2021
- 著者名/発表者名
  Harada Yujin、Yamada Mayumi、Imayoshi Itaru、Kageyama Ryoichiro、Suzuki Yutaka、Kuniya Takaaki、Furutachi Shohei、Kawaguchi Daichi、Gotoh Yukiko
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 6562-6562
- DOI
  10.1038/s41467-021-26605-0
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06481, KAKENHI-PROJECT-20K06667, KAKENHI-PROJECT-21K15180, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] The putative RNA-binding protein Dri1 promotes the loading of kinesin-14/Klp2 to the mitotic spindle and is sequestered into heat-induced protein aggregates in fission yeast2021
- 著者名/発表者名
  Masashi Yukawa, Mitsuki Ohishi, Yusuke Yamada and Takashi Toda
- 雑誌名
  
  International Journal of Molecular Sciences
  
  巻: 22 号: 9 ページ: 4795-4795
- DOI
  10.3390/ijms22094795
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K05813, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Representation learning applications in biological sequence analysis2021
- 著者名/発表者名
  Hitoshi Iuchi, Taro Matsutani, Keisuke Yamada, Natsuki Iwano, Shunsuke Sumi, Shion Hosoda, Shitao Zhao, Tsukasa Fukunaga, Michiaki Hamada
- 雑誌名
  
  Computational and Structural Biotechnology Journal
  
  巻: 19 ページ: 3198-3208
- DOI
  10.1016/j.csbj.2021.05.039
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21J15897, KAKENHI-PROJECT-21K15078, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Metagenomic analysis of gut microbiota reveals its role in trimethylamine metabolism in heart failure2021
- 著者名/発表者名
  Emoto Takuo、Hayashi Tomohiro、Tabata Tokiko、Yamashita Tomoya、Watanabe Hikaru、Takahashi Tomoya、Gotoh Yasuhiro、Kami Kenjiro、Yoshida Naofumi、Saito Yoshihiro、Tanaka Hidekazu、Matsumoto Kensuke、Hayashi Tetsuya、Yamada Takuji、Hirata Ken-ichi
- 雑誌名
  
  International Journal of Cardiology
  
  巻: 338 ページ: 138-142
- DOI
  10.1016/j.ijcard.2021.06.003
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03653, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Comparative analysis using the draft genome sequence of California poppy (Eschscholzia californica) for exploring the candidate genes involved in benzylisoquinoline alkaloid biosynthesis2021
- 著者名/発表者名
  Yasuyuki Yamada, Hideki Hirakawa, Kentaro Hori, Yohei Minakuchi, Atsushi Toyoda, Nobukazu Shitan, Fumihiko Sato
- 雑誌名
  
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
  
  巻: 85 号: 4 ページ: 851-859
- DOI
  10.1093/bbb/zbaa091
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Hepatic resistance to cold ferroptosis in a mammalian hibernator Syrian hamster depends on effective storage of diet-derived α-tocopherol2021
- 著者名/発表者名
  Anegawa Daisuke、Sugiura Yuki、Matsuoka Yuta、Sone Masamitsu、Shichiri Mototada、Otsuka Reo、Ishida Noriko、Yamada Ken-ichi、Suematsu Makoto、Miura Masayuki、Yamaguchi Yoshifumi
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 796-796
- DOI
  10.1038/s42003-021-02297-6
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-20H05766, KAKENHI-PROJECT-21H04774, KAKENHI-PROJECT-19H04046, KAKENHI-PROJECT-21K19206, KAKENHI-PROJECT-21K15240, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Uncovering the Role of Gut Microbiota in Amino Acid Metabolic Disturbances in Heart Failure Through Metagenomic Analysis2021
- 著者名/発表者名
  Hayashi Tomohiro、Yamashita Tomoya、Takahashi Tomoya、Tabata Tokiko、Watanabe Hikaru、Gotoh Yasuhiro、Shinohara Masakazu、Kami Kenjiro、Tanaka Hidekazu、Matsumoto Kensuke、Hayashi Tetsuya、Yamada Takuji、Hirata Ken-ichi
- 雑誌名
  
  Frontiers in Cardiovascular Medicine
  
  巻: 8 ページ: 789325-789325
- DOI
  10.3389/fcvm.2021.789325
- NAID
  120007181728
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03653, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Immuno-Surgical Management of Pancreatic Cancer with Analysis of Cancer Exosomes2020
- 著者名/発表者名
  Takeda Yu、Kobayashi Shogo、Kitakaze Masatoshi、Yamada Daisaku、Akita Hirofumi、Asai Ayumu、Konno Masamitsu、Arai Takahiro、Kitagawa Toru、Ofusa Ken、Yabumoto Masami、Hirotsu Takaaki、Vecchione Andrea、Taniguchi Masateru、Doki Yuichiro、Eguchi Hidetoshi、Ishii Hideshi
- 雑誌名
  
  Cells
  
  巻: 9 号: 7 ページ: 1645-1645
- DOI
  10.3390/cells9071645
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07688, KAKENHI-PROJECT-20K16414, KAKENHI-PROJECT-18KK0251, KAKENHI-PROJECT-19H00852, KAKENHI-PROJECT-18K08704, KAKENHI-PROJECT-19K22658, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Metabolic labeling of RNA using multiple ribonucleoside analogs enables the simultaneous evaluation of RNA synthesis and degradation rates2020
- 著者名/発表者名
  Kawata Kentaro、Wakida Hiroyasu、Yamada Toshimichi、Taniue Kenzui、Han Han、Seki Masahide、Suzuki Yutaka、Akimitsu Nobuyoshi
- 雑誌名
  
  Genome Research
  
  巻: 30 号: 10 ページ: 1481-1491
- DOI
  10.1101/gr.264408.120
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K16635, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] A possible beneficial effect of Bacteroides on faecal lipopolysaccharide activity and cardiovascular diseases2020
- 著者名/発表者名
  Yoshida Naofumi、Yamashita Tomoya、Kishino Shigenobu、Watanabe Hikaru、Sasaki Kengo、Sasaki Daisuke、Tabata Tokiko、Sugiyama Yuta、Kitamura Nahoko、Saito Yoshihiro、Emoto Takuo、Hayashi Tomohiro、Takahashi Tomoya、Shinohara Masakazu、Osawa Ro、Kondo Akihiko、Yamada Takuji、Ogawa Jun、Hirata Ken-ichi
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1 ページ: 13009-13009
- DOI
  10.1038/s41598-020-69983-z
- NAID
  120006879534
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21603, KAKENHI-PROJECT-19H03653, KAKENHI-PROJECT-20H03676, KAKENHI-PROJECT-18K05487, KAKENHI-PROJECT-19K23944, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Transient IGF-1R inhibition combined with osimertinib eradicates AXL-low expressing EGFR mutated lung cancer2020
- 著者名/発表者名
  Wang Rong、Yamada Tadaaki、Kita Kenji、Taniguchi Hirokazu、Arai Sachiko、Fukuda Koji、Terashima Minoru、Ishimura Akihiko、Nishiyama Akihiro、Tanimoto Azusa、Takeuchi Shinji、Ohtsubo Koshiro、Wang Wei、Suzuki Takeshi、Yano Seiji et. al.
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 11 号: 1 ページ: 4607-4607
- DOI
  10.1038/s41467-020-18442-4
- NAID
  120007186801
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07346, KAKENHI-PROJECT-19K07686, KAKENHI-PROJECT-19K22578, KAKENHI-PROJECT-20K22837, KAKENHI-PROJECT-19H03433, KAKENHI-PROJECT-19H03499, KAKENHI-PROJECT-19H03665, KAKENHI-PROJECT-18K06057, KAKENHI-PROJECT-18K08141, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Systematic Analysis of Targets of Pumilio-mediated mRNA Decay Reveals that PUM1 Repression by DNA Damage Activates Translesion Synthesis2020
- 著者名/発表者名
  Toshimichi Yamada, Naoto Imamachi, Katsutoshi Imamura, Kenzui Taniue, Takeshi Kawamura, Yutaka Suzuki, Masami Nagahama, Nobuyoshi Akimitsu
- 雑誌名
  
  Cell Reports
  
  巻: - 号: 5 ページ: 107542-107542
- DOI
  10.1016/j.celrep.2020.107542
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18KT0016, KAKENHI-PROJECT-17KK0163, KAKENHI-PROJECT-18K06640, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Metagenomic analysis of colorectal cancer datasets identifies cross-cohort microbial diagnostic signatures and a link with choline degradation2019
- 著者名/発表者名
  Andrew Maltez Thomas, Paolo Manghi, Francesco Asnicar, Edoardo Pasolli, Federica Armanini, Moreno Zolfo, Francesco Beghini, Serena Manara, Nicolai Karcher, Chiara Pozzi, Sara Gandini, Davide Serrano, Sonia Tarallo, Antonio Francavilla, Gaetano Gallo, Mario Trompetto, Giulio Ferrero, Sayaka Mizutani, Hirotsugu Shiroma, Tatsuhiro Shibata, Shinichi Yachida, Takuji Yamada, Nicola Segata, et al.
- 雑誌名
  
  Nature Madicine
  
  巻: 25 号: 12 ページ: 667-678
- DOI
  10.1038/s41591-019-0663-4
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Metagenomic and metabolomic analyses reveal distinct stage-specific phenotypes of the gut microbiota in colorectal cancer2019
- 著者名/発表者名
  Yachida Shinichi、Mizutani Sayaka、Shiroma Hirotsugu、Shiba Satoshi、Nakajima Takeshi、Sakamoto Taku、Saito Yutaka、Fukuda Shinji、Shibata Tatsuhiro、Yamada Takuji
- 雑誌名
  
  Nature Medicine
  
  巻: 25 号: 6 ページ: 968-976
- DOI
  10.1038/s41591-019-0458-7
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K08416, KAKENHI-PROJECT-18K15800, KAKENHI-PUBLICLY-18H04805, KAKENHI-PROJECT-16H06373, KAKENHI-PROJECT-19J40249, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] FuncTree2 : an interaotive radial tree for functional hierarchies and omics data visualization2019
- 著者名/発表者名
  Y Darzi, Y Yamate, T Yamada
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 35 号: 21 ページ: 4519-4521
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btz245
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Contributions of regulated transcription and mRNA decay to the dynamics of gene expression2019
- 著者名/発表者名
  Yamada T., Akimitsu N.
- 雑誌名
  
  WIREs RNA
  
  巻: 10 号: 1
- DOI
  10.1002/wrna.1508
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17J11266, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] VITCOMIC2: Visualization tool for the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene amplicons and metagenomic shotgun sequencing.2018
- 著者名/発表者名
  Mori H, Maruyama T, Yano M, Yamada T, Kurokawa K
- 雑誌名
  
  BMC Syst. Biol.
  
  巻: 12 号: S2 ページ: 30-30
- DOI
  10.1186/s12918-018-0545-2
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-17H01854, KAKENHI-PROJECT-15K07214, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Diminished nuclear RNA decay upon Salmonella infection upregulates antibacterial noncoding RNAs2018
- 著者名/発表者名
  Imamura Katsutoshi、Takaya Akiko、Ishida Yo‐ichi、Fukuoka Yayoi、Taya Toshiki、Nakaki Ryo、Kakeda Miho、Imamachi Naoto、Sato Aiko、Yamada Toshimichi、Onoguchi‐Mizutani Rena、Akizuki Gen、Tanu Tanzina、Tao Kazuyuki、Miyao Sotaro、Suzuki Yutaka、Nagahama Masami、Yamamoto Tomoko、Jensen Torben Heick、Akimitsu Nobuyoshi
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal
  
  巻: 37 号: 13
- DOI
  10.15252/embj.201797723
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K06640, KAKENHI-PROJECT-18K07102, KAKENHI-PROJECT-18K14899, KAKENHI-PROJECT-17J11266, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Bacteroides vulgatus and Bacteroides dorei reduce gut microbial lipopolysachharide production and inhibit atherosclerosis.2018
- 著者名/発表者名
  Yoshida N, Emoto T, Yamashita T, Watanabe H, Hayashi T, Tabata T, Hoshi N, Hatano N, Sasaki N, Mizoguchi T, Amin HZ, Hirota Y, Ogawa W, Yamada T, Hirata K.
- 雑誌名
  
  Circulation.
  
  巻: 138 号: 22 ページ: 2486-2498
- DOI
  10.1161/circulationaha.118.033714
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K09497, KAKENHI-PROJECT-16K09516, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Gut Microbiome and Plasma Microbiome-Related Metabolites in Patients With Decompensated and Compensated Heart Failure2018
- 著者名/発表者名
  Hayashi T, Yamashita T, Watanabe H, Kami K, Yoshida N, Tabata T, Emoto T, Sasaki N, Mizoguchi T, Irino Y, Toh R, Shinohara M, Okada Y, Ogawa W, Yamada T, Hirata K.
- 雑誌名
  
  Circulation Journal
  
  巻: 83 号: 1 ページ: 182-192
- DOI
  10.1253/circj.CJ-18-0468
- NAID
  130007550393
- ISSN
  1346-9843, 1347-4820
- 年月日
  2018-12-25
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K09497, KAKENHI-PROJECT-17K09579, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Poly(ethylene glycol)ーpoly(lysine) block copolymerーubenimex conjugate targets aminopeptidase N and exerts an antitumor effect in hepatocellular carcinoma stem cells2018
- 著者名/発表者名
  Toshiyama, R., Konno, M., Eguchi, H., Takemoto, H., Noda, T., Asai, A., Koseki, J., Haraguchi, N., Ueda, Y. Matsushita, K., Asukai, K., Ohashi, T., Iwagami, Y., Yamada, D., Sakai, D., Asaoka, T., Kudo, T., Kawamoto, K., Gotoh, K., Kobayashi, S., Satoh, T., Doki, Y., Nishiyama, N., Mori, M., Ishii, H.
- 雑誌名
  
  Oncogene
  
  巻: 38 号: 2 ページ: 244-260
- DOI
  10.1038/s41388-018-0406-x
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K16355, KAKENHI-PROJECT-18K16356, KAKENHI-PROJECT-18KK0251, KAKENHI-PROJECT-18H04163, KAKENHI-PROJECT-17H04282, KAKENHI-PROJECT-16F16058, KAKENHI-PROJECT-17K19698, KAKENHI-PROJECT-16H06276, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Bolidophyceae, a Sister Picoplanktonic Group of Diatoms ? A Review2018
- 著者名/発表者名
  Kuwata Akira、Yamada Kazumasa、Ichinomiya Mutsuo、Yoshikawa Shinya、Tragin Margot、Vaulot Daniel、Lopes dos Santos Adriana
- 雑誌名
  
  Frontiers in Marine Science
  
  巻: 5 ページ: 1-17
- DOI
  10.3389/fmars.2018.00370
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K07515, KAKENHI-PROJECT-17J01950, KAKENHI-PROJECT-16K07489, KAKENHI-PROJECT-15K14784, KAKENHI-PROJECT-17H03724, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Mining of the Uncharacterized Cytochrome P450 Genes Involved in Alkaloid Biosynthesis in California Poppy Using a Draft Genome Sequence2018
- 著者名/発表者名
  Hori Kentaro、Yamada Yasuyuki、Purwanto Ratmoyo、Minakuchi Yohei、Toyoda Atsushi、Hirakawa Hideki、Sato Fumihiko
- 雑誌名
  
  Plant and Cell Physiology
  
  巻: 59 号: 2 ページ: 222-233
- DOI
  10.1093/pcp/pcx210
- NAID
  120006384165
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26221201, KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Diminished nuclear RNA decay upon Salmonella infection upregulates antibacterial noncoding RNAs2018
- 著者名/発表者名
  Imamura K, Takaya A, Ishida Y, Fukuoka Y, Taya T, Nakaki R, Kakeda M, Imamachi N, Sato A, Yamada T, Onoguchi-Mizutani R, Akizuki G, Tanu T, Tao K, Miyao S, Suzuki Y, Nagahama M, Yamamoto T, Jensen TH, Akimitsu N.
- 雑誌名
  
  EMBO Journal
- 説明
  accepted
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[雑誌論文] Comprehensive genetic exploration of selective tooth agenesis of mandibular incisors by exome sequencing2017
- 著者名/発表者名
  Yamaguchi T, Hosomichi K, Yano K, Kim Y, Nakaoka H, Kimura R, Otsuka H, Nonaka N, Haga S, Takahashi M, Shirota T, Kikkawa Y, Yamada A, Kamijo R, Park SB, Nakamura M, Maki K, Inoue I
- 雑誌名
  
  Hum Genome Variation
  
  巻: 印刷中号: 1 ページ: 17005-17005
- DOI
  10.1038/hgv.2017.5
- NAID
  120006891152
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-16H06502, KAKENHI-PROJECT-15H02373, KAKENHI-PROJECT-15H05016, KAKENHI-PROJECT-26430195, KAKENHI-PROJECT-15K20367, KAKENHI-PROJECT-15K11051, KAKENHI-PROJECT-16K15782, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-17K19804, KAKENHI-PROJECT-17K17089, KAKENHI-PROJECT-25251043, KAKENHI-PROJECT-16K15843
[雑誌論文] Comprehensive microbiome analysis of tonsillar crypts in IgA nephropathy2017
- 著者名/発表者名
  Watanabe H, Goto S, Mori H, Higashi K, Hosomichi K, Aizawa N, Takahashi N, Tsuchida M, Suzuki Y, Yamada T, Horii A, Inoue I, Kurokawa K, Narita I.
- 雑誌名
  
  Nephrol Dial Transplant
  
  巻: in press ページ: 2072-2079
- DOI
  10.1093/ndt/gfw343
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26293201, KAKENHI-PROJECT-26670429, KAKENHI-PROJECT-15K09250, KAKENHI-PROJECT-16H06279, KAKENHI-PROJECT-15H02373
[雑誌論文] Identification of Enzyme Genes Using Chemical Structure Alignments of Substrate-Product Pairs.2016
- 著者名/発表者名
  Moriya, Y., Yamada, T., Okuda, S., Nakagawa, Z., Kotera, M., Tokimatsu, T., Kanehisa, M. & Goto, S.
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  巻: 56 号: 3 ページ: 510-516
- DOI
  10.1021/acs.jcim.5b00216
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016, KAKENHI-PROJECT-26242088
[雑誌論文] DomSign: a top-down annotation pipeline to enlarge enzyme space in the protein universe.2015
- 著者名/発表者名
  Wang T, Mori H, Zhang C, Kurokawa K, Xing X, Yamada T
- 雑誌名
  
  BMC Bioinformatics
  
  巻: 16 号: 1 ページ: 96-96
- DOI
  10.1186/s12859-015-0499-y
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24770015, KAKENHI-PUBLICLY-25108708, KAKENHI-PROJECT-25710016, KAKENHI-PROJECT-26670717, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PLANNED-26106004
[雑誌論文] FuncTree: Functional Analysis and Visualization for Large-Scale Omics Data.2015
- 著者名/発表者名
  Uchiyama T, Irie M, Mori H, Kurokawa K, Yamada T.
- 雑誌名
  
  PLoS One.
  
  巻: 10 号: 5 ページ: e0126967-e0126967
- DOI
  10.1371/journal.pone.0126967
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26670717, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PLANNED-26106004, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25710016
[産業財産権] 早期大腸癌の検出方法2017
- 発明者名
  山田拓司, 福田真嗣, 谷内田真一
- 出願年月日
  2017
- 外国
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 珪藻の進化・繁栄の謎を握る未知の藻類:パルマ藻の生物学2024
- 著者名/発表者名
  桑田晃、伴広輝、中村洋路、山田和正、佐藤晋也、緒方博之、一宮睦雄
- 学会等名
  日本藻類学会第48回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] トウガラシのRNA分解活性を制御するRNase MC-like遺伝子の同定2024
- 著者名/発表者名
  山崎彬、白澤健太、山田寛子、細川宗孝
- 学会等名
  園芸学会令和6年度春季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] 珪藻の進化・繁栄の謎を握る未知の藻類:パルマ藻の生物学2023
- 著者名/発表者名
  桑田晃、伴広輝、中村洋路、山田和正、佐藤晋也、緒方博之、一宮睦雄
- 学会等名
  日本海洋学会2023年度秋季大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] Squalomixコンソーシアムによるサメ・エイ類の分子生物学研究：脊椎動物の進化と多様性の成立ちを理解するために2023
- 著者名/発表者名
  山口和晃、川口茜、宇野好宣、門田満隆、西村理、松本瑠偉、喜屋武樹、加登岡大希、都築信隆、山内信弥、山田一幸、兵藤晋、佐藤圭一、工樂樹洋
- 学会等名
  第46回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] 光操作技術とNGS 解析を用いた、神経幹細胞の制御メカニズムの解明2022
- 著者名/発表者名
  山田真弓
- 学会等名
  第18回成体脳ニューロン新生懇談会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] miRNA 改変型核酸医薬品はマウス消化器がんモデルで腫瘍を効果的に抑制する2022
- 著者名/発表者名
  佐藤広陸、佐々木一樹、荒尾泰子、中山実香、竹田佑、山田大作、富丸慶人、三吉範克、高橋秀典、小林省吾、森正樹、土岐祐一郎、江口英利、石井秀始
- 学会等名
  第81回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] 光操作技術を用いた神経幹細胞の制御メカニズムの解析2022
- 著者名/発表者名
  山田真弓、長崎真治、Seongchun Yang、今吉格
- 学会等名
  NEURO2022　第45回日本神経科学大会第65回日本神経化学会大会第32回日本神経回路学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] 下気道におけるM細胞の分化機構の解明2022
- 著者名/発表者名
  木村俊介, 山田恭央, 中村有孝, 河合真悟, 長谷耕二
- 学会等名
  第6回日本骨免疫学会ウィンタースクール
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 膵癌のシングルセル RNA シークエンスデータセットの統合と再構築2022
- 著者名/発表者名
  竹田佑、千々松良太、小林省吾、北風雅敏、山田大作、高橋秀典、森正樹、土岐祐一郎、江口英利、石井秀始
- 学会等名
  第81回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22H04925
[学会発表] Uncovering the Role of Gut Microbiota in Amino Acid Metabolic Disturbances in Heart Failure Through Metagenomic Analysis2022
- 著者名/発表者名
  林友鴻, 山下智也, 高橋和也, 田畑論子, 渡邊日佳流, 後藤恭宏, 篠原正和, 紙健次郎, 田中秀和, 松本賢亮, 林哲也, 山田拓司, 平田健一
- 学会等名
  第86回日本循環器学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] IncP-1群プラスミドの宿主域の違いを生む因子の探索2022
- 著者名/発表者名
  德田真穂, 山田亮, 金原和秀, 新谷政己
- 学会等名
  日本農芸化学会2022年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 気管内挿管チューブに定着し実験進化したAcinetobacter baumanniiの病原性解析2022
- 著者名/発表者名
  鴨志田剛, 山口大貴, 山田倫暉, 竹本訓彦, 八尋錦之助
- 学会等名
  第95回日本細菌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 微生物統合データベースMicrobeDB. jpを用いたマイクロバイオーム研究への応用2022
- 著者名/発表者名
  森宙史, 藤澤貴智, 西出浩世, 矢口貴志, 高橋弘喜, 中川善一, 山田拓司, 内山郁夫, 中村保一, 黒川顕
- 学会等名
  第16回日本ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Analysis of neural stem cell regulatory mechanisms using optogenetics2021
- 著者名/発表者名
  Mayumi Yamada
- 学会等名
  The Front Lines of Biomedical Research on the Nervous System
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] The genome biology of Parmales (Bolidophyceae), a sister group of diatomsThe genome biology of Parmales (Bolidophyceae), a sister group of diatoms.2021
- 著者名/発表者名
  伴広輝, 佐藤晋也, 吉川伸哉, 山田和正, 中村洋路, 一宮睦雄, 遠藤寿, Romain Blanc-Mathieu, 桑田晃, 緒方博之
- 学会等名
  Molecular life of diatoms 6
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] シリカ被殻を持つ真核藻類 : パルマ藻・珪藻の比較ゲノム解析2021
- 著者名/発表者名
  伴広輝、桑田晃、中村洋路、佐藤晋也、吉川伸哉、山田和正、一宮睦雄、緒方博之
- 学会等名
  日本藻類学会第45回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 医療機器に高度接着する細菌の樹立とその病原性解析2021
- 著者名/発表者名
  山田倫暉, 鴨志田剛, 永嶺沙也佳, 岡田知子, 山口大貴, 藤室雅弘
- 学会等名
  第94回日本生化学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 微生物統合データベース MicrobeDB. jp version 3とマイクロバイオーム解析2021
- 著者名/発表者名
  森宙史、藤澤貴智、西出浩世、矢口貴志、高橋弘喜、中川善一、山田拓司、内山郁夫、中村保一、黒川顕
- 学会等名
  第15回日本ゲノム微生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Intestinal microbiota in heart failure2020
- 著者名/発表者名
  Tomoya Yamashita, Tokiko Tabata, Takuo Emoto, Tomohiro Hayashi, Hikaru Watanabe, Tomoya Takahashi, Naofumi Yoshida, Yoshihiro Saito, Takuji Yamada, Ken-ichi Hirata
- 学会等名
  第84回日本循環器学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Dynamic transcriptional regulation of neural stem cells by bHLH factors2020
- 著者名/発表者名
  山田真弓
- 学会等名
  第63回日本神経化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 新規に分離された珪質型ボリド藻Tetraparma属3種の分子系統解析2020
- 著者名/発表者名
  新川裕大、山田和正、吉川伸哉、桑田晃、一宮睦雄、佐藤晋也
- 学会等名
  日本藻類学会第44回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] YMPHOID-MYELOID CELL FATE DETERMINATION BY ENDORIBONUCLEASES REGNASE-1 AND -32020
- 著者名/発表者名
  Takuya, U., Yamada, S., Miyazaki, M., Giladi, A., Vandenbon, A., Amit, I., Kawamoto, H., Takeuchi, O.
- 学会等名
  8th Annual Meeting ; International Cytokine & Interferon Society
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Patient-specific circulating tumor DNA monitoring using esophageal squamous cell cancer gene panel and digital PCR2019
- 著者名/発表者名
  Takeshi Iwaya, Fumitaka Endo, Yasushi Sasaki, Noriyuki Sasaki, Mizunori Yaegashi, Yuji Akiyama, Akira Sasaki, Mari Masuda, Tesshi Yamada, Takashi Tokino, Satoshi Nishizuka
- 学会等名
  アメリカ癌学会
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Metagenomic and metabolomic analyses in colorectal cancer2019
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  Microbiome Movement - Drug Development, Singapore
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Metagenomic and metabolomic analyses reveal dynamic shifts in gut microbiota along the adenoma-carcinoma sequence in colorectal cancer2019
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  OIST Workshop "A World of Microbiota"
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 染色体構造中における減数分裂期DSB形成機構2019
- 著者名/発表者名
  山田貴富、太田邦史、村上浩士
- 学会等名
  第52回酵母遺伝学フォーラム研究報告会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 腸内細菌ってなんだ??-ヒト腸内メタゲノム解析が広げる医療2019
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  東京工業大学社会人アカデミー人間数理情報アカデミー2019
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Chromatin-mediated control of meiotic recombination in fission yeast2019
- 著者名/発表者名
  山田貴富
- 学会等名
  遺伝研研究会「有性生殖における染色体・クロマチン・核動態に関する研究会」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Patient-specific circulating tumor DNA monitoring using esophageal squamous cell cancer gene panel and digital PCR.2019
- 著者名/発表者名
  Iwaya T, Endo F, Sasaki Y, Sasaki N, Yaegashi M, Akiyama Y, Sasaki A, Masuda M, Yamada T, Tokino T, Nishizuka S.
- 学会等名
  Amerian Association for Cancer Research (AACR)
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 神経幹細胞におけるbHLH型転写因子のダイナミックな発現制御機構2019
- 著者名/発表者名
  山田真弓
- 学会等名
  NEURO2019
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Therapeutic response monitoring using digital PCR for patient-specific circulating tumor DNA identified by an esophageal squamous cell carcinoma-specific sequencing panel.2018
- 著者名/発表者名
  Takeshi Iwaya, Fumitaka Endo, Yasushi Sasaki, Yuji Akiyama, Akira Sasaki, Mari Masuda, Tesshi Yamada, Takashi Tokino, Satoshi Nishizuka
- 学会等名
  米国臨床腫瘍学会
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Human gut microbiome associated with colorectal cancer2017
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  第76回日本癌学会学術総会(日本、横浜)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Exploitation of a liquid biopsy system using circulating tumor DNA in esophageal cancer patients2017
- 著者名/発表者名
  Takeshi Iwaya, Fumitaka Endo, Yasushi Sasaki, Mizunori Yaegashi, Takehiro Chiba, Yuji Akiyama, Mari Masuda, Tesshi Yamada, Takashi Tokino, Satoshi Nishizuka
- 学会等名
  第76回日本癌学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Biology of a picoeukaryotic phytoplankton, Parmales(Bolidophyceae), a sister group of diatoms2017
- 著者名/発表者名
  桑田晃, 一宮睦雄, 吉川伸哉, 山田和正, 河地正伸, Mary-Hélène Noël, 斉藤憲治, 中村洋路, 沢田健, Adriana Lopes dos Santos, Daniel Vaulot
- 学会等名
  The IVth International Conference "Molecular Life of Diatoms"
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 大腸がん発病に伴うヒト腸内細菌のマルチオミクス解析2017
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  第17回日本抗加齢医学会総会(日本、東京)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Morphological and transcriptome analysis in cell wall formation of Triparma laevis2017
- 著者名/発表者名
  吉川伸哉, 佐藤晋也, 山崎誠司, 山田和正, 一宮睦雄, 斉藤憲治, 中村洋路, 佐藤直樹, 桑田晃
- 学会等名
  The IVth International Conference "Molecular Life of Diatoms"
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] パルマ藻Triparma Iaevisの細胞壁形成機構の解析2017
- 著者名/発表者名
  吉川伸哉, 佐藤晋也, 山崎誠司, 一柳紀凛, 山田和正, 一宮睦雄, 斉藤憲治, 中村洋路, 佐藤直樹, 桑田晃
- 学会等名
  日本植物学会第81回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Discovery of a silicified scaly bolidophyte, the novel lineage matching with the hypothetical ancestor of diatoms2017
- 著者名/発表者名
  山田和正, 山崎誠司, 佐藤晋也, 吉川伸哉, 桑田晃, 一宮睦雄
- 学会等名
  第11回国際藻類学会
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 新規培養株の確立により示されたパルマ藻の系統的多様性2017
- 著者名/発表者名
  山田和正, 山﨑誠司, 佐藤晋也, 吉川伸哉, 桑田晃, 一宮睦雄
- 学会等名
  2017年日本プランクトン学会・日本ベントス学会合同大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] VITCOMIC2 : Visualization tool for the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene amplicons and metagenomic shotgun sequencing2017
- 著者名/発表者名
  Mori H, Maruyama T, Yano M, Yamada T, Kurokawa K.
- 学会等名
  GIW 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ヒト腸内細菌データベースとその利用2017
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  第69回日本生物工学会大会(日本、東京)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] ヒト腸内細菌と大腸がん発病モデル2017
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  日本マイクロバイオームコンソーシアム(JMBC)設立記念シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] VITCOMIC2 : visualization of the phylogenetic composition of microbial communities based on 16S rRNA gene amplicons and metagenomic shotgun sequencing2017
- 著者名/発表者名
  Mori H, Maruyama T, Yano M, Yamada T, Kurokawa K.
- 学会等名
  ProkaGenomics 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] 大腸がん発病に伴うヒト腸内細菌のマルチオミクス解析2017
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  第42回日本医用マススペクトル学会(日本、東京)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06279
[学会発表] Fecal metagenomic analysis of colorectal cancer cohort2015
- 著者名/発表者名
  Takuji Yamada
- 学会等名
  第74回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  名古屋国際会議場
- 年月日
  2015-10-08
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016
[学会発表] Metabolic pathway database for Human gut microbiome2015
- 著者名/発表者名
  山田　拓司
- 学会等名
  第67回日本生物工学会大会
- 発表場所
  鹿児島
- 年月日
  2015-10-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26670717
[学会発表] ヒト腸内細菌代謝機能データベースの構築2015
- 著者名/発表者名
  山田　拓司
- 学会等名
  第15回日本抗加齢医学会総会
- 発表場所
  福岡
- 年月日
  2015-05-29
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26670717
[学会発表] Metabolic pathway database for Human gut microbiome2015
- 著者名/発表者名
  Takuji Yamada
- 学会等名
  第67回日本生物工学会大会
- 発表場所
  城山観光ホテル（鹿児島）
- 年月日
  2015-10-26
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016
[学会発表] ヒト腸内細菌代謝経路データベースの構築2015
- 著者名/発表者名
  山田　拓司
- 学会等名
  第366回CBI学会講演会
- 発表場所
  大阪
- 年月日
  2015-11-05
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26670717
[学会発表] ヒト腸内細菌代謝機能データベースの構築2015
- 著者名/発表者名
  Takuji Yamada
- 学会等名
  第15回日本抗加齢医学会総会
- 発表場所
  福岡国際会議場
- 年月日
  2015-05-29
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016
[学会発表] Metabolic pathway database for Human gut microbiome2015
- 著者名/発表者名
  Takuji Yamada
- 学会等名
  International Symposium for Frontier of Bioinformatics
- 発表場所
  Tokyo
- 年月日
  2015-10-16
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26670717
[学会発表] Fecal metagenomic analysis of colorectal cancer cohort2015
- 著者名/発表者名
  山田　拓司
- 学会等名
  第74回日本癌学会学術総会
- 発表場所
  名古屋
- 年月日
  2015-10-08
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26670717
[学会発表] Metabolic pathway database for human microbiome2014
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  第５回アジアトピックカンファレンス
- 発表場所
  神戸ポートピアホテル　神戸
- 年月日
  2014-10-21
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016
[学会発表] ヒト腸内細菌叢代謝データベースの構築2014
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  第17回日本臨床腸内微生物学会
- 発表場所
  東京慈恵会医科大学　東京
- 年月日
  2014-10-04
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016
[学会発表] Metabolic pathway database for human microbiome2014
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  1st international Symposium on Mucosal Immunity and Vaccine Development 2014
- 発表場所
  The University of Tokyo　東京
- 年月日
  2014-10-21
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016
[学会発表] 腸内細菌代謝反応データベースの構築2014
- 著者名/発表者名
  山田拓司
- 学会等名
  第46回日本動脈硬化学会総会・学術集会
- 発表場所
  京王プラザホテル　東京
- 年月日
  2014-07-10
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25710016

1. 川嶋実苗 (00396706)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 豊田敦 (10267495)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
3. 鈴木穣 (40323646)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
4. 林哲也 (10173014)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 4件
5. 黒川顕 (20343246)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
6. 中村保一 (60370920)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 11件
7. 野口英樹 (50333349)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
8. 岩崎渉 (50545019)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
9. 森下真一 (90292854)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
10. 浅井潔 (30356357)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
11. 笠原雅弘 (60376605)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
12. 伊藤武彦 (90501106)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
13. 高橋弘喜 (60548460)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 6件
14. 浜田道昭 (00596538)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
15. 瀬々潤 (40361539)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
16. 小椋義俊 (40363585)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
17. 森宙史 (40610837)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 8件
18. フリスマーティン (40462832)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
19. 平川英樹 (80372746)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
20. 齋藤滋 (30175351)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 小原雄治 (70135292)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 加藤和人 (10202011)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 三井純 (70579862)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
24. 時野隆至 (40202197)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
25. 久原哲 (00153320)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 榊原康文 (10287427)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
27. 高木利久 (30110836)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 位田隆一 (40127543)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
29. 山縣然太朗 (10210337)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 増井徹 (50150082)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 武藤香織 (50345766)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 児玉聡 (80372366)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
33. 瀬戸山晃一 (00379075)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
34. 小門穂 (20706650)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
35. 大橋範子 (50739430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
36. 藤山秋佐夫 (60142311)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
37. 井ノ上逸朗 (00192500)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
38. 中岡博史 (70611193)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
39. 菅野純夫 (60162848)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
40. 辻省次 (70150612)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
41. 後藤恭宏 (20558358)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
42. 中村佳司 (60706216)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
43. 奥野未来 (30814462)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
44. 仲瀬裕志 (60362498)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
45. 佐々木泰史 (70322328)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
46. 井戸川雅史 (00404749)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
47. 丹下正一朗 (40571211)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
48. 小笠原理 (00435512)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
49. 谷澤靖洋 (90836511)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
50. 近藤伸二 (30415161)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
51. 木立尚孝 (80415778)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
52. 梶谷嶺 (40756706)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
53. 田代康介 (00192170)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
54. 鈴木拓 (20381254)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
55. 能正勝彦 (10597339)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
56. 甲斐正広 (80260777)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
57. 西村祐貴 (20783012)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
58. 中谷明弘 (60301149)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
59. 波江野洋 (70706754)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
60. 島村徹平 (00623943)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
61. 熊谷雄太郎 (00528408)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
62. 野々村祝夫 (30263263)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
63. 柴知史 (00797003)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
64. 谷内田真一 (20359920)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
65. 松下慎 (40824785)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
66. 藤田和利 (50636181)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
67. 波多野浩士 (60762234)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
68. 岡田随象 (70727411)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
69. 中村昇太 (90432434)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
70. 山下智也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 4件
71. 石井秀始

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
72. 山口良文

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
73. 細道一善

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
74. 吉川伸哉

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
75. 渡辺博文

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
76. 川田健文

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
77. 後藤由季子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
78. 湯川格史

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
79. 水谷紗弥佳

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 4件
80. 笹沼博之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
81. 今野雅允

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
82. 川田健太郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
83. 村川泰裕

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
84. 長浜正己

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
85. 佐藤晋也

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
86. 平田健一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
87. 浅井歩

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
88. 鈴木健之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
89. 秋光信佳

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
90. 佐藤文彦

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
91. 山田泰之

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
92. 成田一衛

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
93. 後藤眞

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
94. 山田葉子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
95. 千々松良太

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
96. 新谷政己

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

山田 拓司 Yamada Takuji

研究課題

研究成果

共同研究者

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

遺伝的素因、生活習慣、腸内細菌叢の多面的解析に基づく前立腺癌の早期診断戦略の構築

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

メタゲノム解析による切迫早産例、子宮内膜症例における腟内ならびに腸内細菌叢の解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

真菌類ゲノムからの新規酵素遺伝子発見研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

ヒト腸内細菌叢代謝機構の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[図書] ゲノムでたどる古代の日本列島2023

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

ISBN

データソース

[図書] もっとよくわかる! 腸内細菌叢～健康と疾患を司る“もう1つの臓器”(実験医学別冊 もっとよくわかる! シリーズ)2019

著者名/発表者名

ページ

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Regulation of lymphoid-myeloid lineage bias through regnase-1/3-mediated control of Nfkbiz2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Leveraging explainable AI for gut microbiome-based colorectal cancer classification2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Genome analysis of Parmales, the sister group of diatoms, reveals the evolutionary specialization of diatoms from phago-mixotrophs to photoautotrophs2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] The cytosolic lncRNA <i>dutA</i> affects STATa signaling and developmental commitment in <i>Dictyostelium</i>2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Association Between Diet and <i>Fusobacterium nucleatum</i> in the Feces of Healthy Adults: A Hospital-based Cross-sectional Study2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] XRCC1 counteracts poly(ADP ribose)polymerase (PARP) poisons, olaparib and talazoparib, and a clinical alkylating agent, temozolomide, by promoting the removal of trapped PARP1 from broken DNA.2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

山田拓司 Yamada Takuji

[図書] もっとよくわかる! 腸内細菌叢～健康と疾患を司る“もう1つの臓器”(実験医学別冊もっとよくわかる! シリーズ)2019