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片山 琴絵  Katayama Kotoe

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 40581195
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 東京大学, 医科学研究所, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2025年度: 東京大学, 医科学研究所, 准教授
2021年度 – 2023年度: 東京大学, 医科学研究所, 准教授
2017年度 – 2020年度: 東京大学, 医科学研究所, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
研究代表者以外
小区分56030:泌尿器科学関連 / 中区分56:生体機能および感覚に関する外科学およびその関連分野 / 整形外科学 / 複合領域
キーワード
研究代表者
バイオインフォマティクス / 短鎖リード / 長鎖リード / 確率分布 / 接合分布関数 / シンボリックデータ / 単一細胞解析 / がん
研究代表者以外
がん / cfDNA … もっと見る / 次世代シークエンシング / 残存微小がん / シークエンシング / モデル / クロナリティ / 骨軟部肉腫 / 整形外科 / ゲノム / 癌 / 融合遺伝子 / 骨軟部腫瘍 / がんゲノム / ゲノム解析 / 肉腫 / 人工知能 / バイオインフォマティクス / 統計的モデリング / システム生物学 隠す
  • 研究課題

    (6件)
  • 研究成果

    (9件)
  • 共同研究者

    (61人)
  •  微小残存がんを検出する次世代シークエンシングを用いた革新的手法の開発と検証研究

    • 研究代表者
      植村 元秀
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分56030:泌尿器科学関連
    • 研究機関
      福島県立医科大学
  •  短鎖・長鎖リード統合とヒト完全参照配列によるがん多層オミクスデータ解析法の開発研究代表者

    • 研究代表者
      片山 琴絵
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  時空間内包型数理的解析手法によるがん細胞のクロナリティの新たな理解

    • 研究代表者
      植村 元秀
    • 研究期間 (年度)
      2022 – 2024
    • 研究種目
      挑戦的研究(萌芽)
    • 審査区分
      中区分56:生体機能および感覚に関する外科学およびその関連分野
    • 研究機関
      福島県立医科大学
  •  腫瘍組織多様性理解のための単一細胞に対する時空間内包型数理的解析手法の提案研究代表者

    • 研究代表者
      片山 琴絵
    • 研究期間 (年度)
      2019 – 2021
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
    • 研究機関
      東京大学
  •  骨軟部腫瘍における診断マーカーの同定と腫瘍概念の再構築を目指した融合遺伝子の探索

    • 研究代表者
      松田 浩一
    • 研究期間 (年度)
      2016 – 2020
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 研究分野
      整形外科学
    • 研究機関
      東京大学
  •  スーパーコンピューティングと革新的情報技術によるがんシステムの新次元探索

    • 研究代表者
      宮野 悟
    • 研究期間 (年度)
      2015 – 2019
    • 研究種目
      新学術領域研究(研究領域提案型)
    • 審査区分
      複合領域
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2023 2022 2021 2019 2018

すべて 雑誌論文

  • [雑誌論文] KMT2C expression and DNA homologous recombination repair factors in lung cancers with a high-grade fetal adenocarcinoma component2023

    • 著者名/発表者名
      Suzuki Masaki、Kasajima Rika、Yokose Tomoyuki、Shimizu Eigo、Hatakeyama Seira、Yamaguchi Kiyoshi、Yokoyama Kazuaki、Katayama Kotoe、Yamaguchi Rui、Furukawa Yoichi、Miyano Satoru、Imoto Seiya、Shinozaki-Ushiku Aya、Ushiku Tetsuo、Miyagi Yohei
    • 雑誌名

      Translational Lung Cancer Research

      巻: 12 号: 8 ページ: 1738-1751

    • DOI

      10.21037/tlcr-23-137

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-23K11300
  • [雑誌論文] Histological markers, sickle-shaped blood vessels, myxoid area, and infiltrating growth pattern help stratify the prognosis of patients with myxofibrosarcoma/undifferentiated sarcoma2023

    • 著者名/発表者名
      Washimi Kota、Kasajima Rika、Shimizu Eigo、Sato Shinya、Okubo Yoichiro、Yoshioka Emi、Narimatsu Hiroto、Hiruma Toru、Katayama Kotoe、Yamaguchi Rui、Yamaguchi Kiyoshi、Furukawa Yoichi、Miyano Satoru、Imoto Seiya、Yokose Tomoyuki、Miyagi Yohei
    • 雑誌名

      Scientific Reports

      巻: 13 号: 1

    • DOI

      10.1038/s41598-023-34026-w

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-20K09422, KAKENHI-PROJECT-20K16210, KAKENHI-PROJECT-23K11300
  • [雑誌論文] Early dynamics of circulating tumor DNA predict clinical response to immune checkpoint inhibitors in metastatic renal cell carcinoma2022

    • 著者名/発表者名
      Koh Yoko、Nakano Kosuke、Katayama Kotoe、Yamamichi Gaku、Yumiba Satoru、Tomiyama Eisuke、Matsushita Makoto、Hayashi Yujiro、Yamamoto Yoshiyuki、Kato Taigo、Hatano Koji、Kawashima Atsunari、Ujike Takeshi、Imamura Ryoichi、Yamaguchi Rui、Imoto Seiya、Shiotsu Yukimasa、Nonomura Norio、Uemura Motohide
    • 雑誌名

      International Journal of Urology

      巻: 2 号: 5 ページ: 462-469

    • DOI

      10.1111/iju.14816

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K09728, KAKENHI-PROJECT-19K12215
  • [雑誌論文] Perioperative circulating tumor DNA enables the identification of patients with poor prognosis in upper tract urothelial carcinoma2022

    • 著者名/発表者名
      Nakano K, Koh Y, Yamamichi G, Yumiba S, Tomiyama E, Matsushita M, Hayashi Y, Wang C, Ishizuya Y, Yamamoto Y, Kato T, Hatano K, Kawashima A, Ujike T, Fujita K, Kiyotani K, Katayama K, Yamaguchi R, Imoto S, Imamura R, Nonomura N, Uemura M
    • 雑誌名

      Cancer Science

      巻: - 号: 5 ページ: 1830-1842

    • DOI

      10.1111/cas.15334

    • 査読あり
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PROJECT-19H03522
  • [雑誌論文] COVID-19 risk assessment at the opening ceremony of the Tokyo 2020 Olympic Games2021

    • 著者名/発表者名
      Murakami Michio、Miura Fuminari、Kitajima Masaaki、Fujii Kenkichi、Yasutaka Tetsuo、Iwasaki Yuichi、Ono Kyoko、Shimazu Yuzo、Sorano Sumire、Okuda Tomoaki、Ozaki Akihiko、Katayama Kotoe、Nishikawa Yoshitaka、Kobashi Yurie、Sawano Toyoaki、Abe Toshiki、Saito Masaya M.、Tsubokura Masaharu、Naito Wataru、Imoto Seiya
    • 雑誌名

      Microbial Risk Analysis

      巻: - ページ: 100162-100162

    • DOI

      10.1016/j.mran.2021.100162

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PROJECT-22KJ2358
  • [雑誌論文] Replication stress triggers microsatellite destabilization and hypermutation leading to clonal expansion in vitro2019

    • 著者名/発表者名
      Matsuno Yusuke、Atsumi Yuko、Shimizu Atsuhiro、Katayama Kotoe、Fujimori Haruka、Hyodo Mai、Minakawa Yusuke、Nakatsu Yoshimichi、Kaneko Syuzo、Hamamoto Ryuji、Shimamura Teppei、Miyano Satoru、Tsuzuki Teruhisa、Hanaoka Fumio、Yoshioka Ken-ichi
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 3925-3925

    • DOI

      10.1038/s41467-019-11760-2

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-18K11542, KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PUBLICLY-18H04798, KAKENHI-PUBLICLY-18H04908, KAKENHI-PUBLICLY-19H05210, KAKENHI-PROJECT-19H03429
  • [雑誌論文] Massively parallel sequencing of tenosynovial giant cell tumors reveals novel CSF1 fusion transcripts and novel somatic CBL mutations2019

    • 著者名/発表者名
      Tsuda Yusuke、Matsubara Daisuke (5th) etc
    • 雑誌名

      International Journal of Cancer

      巻: 145 号: 12 ページ: 3276

    • DOI

      10.1002/ijc.32421

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07441, KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16H02676, KAKENHI-PROJECT-17H03596, KAKENHI-PROJECT-18H02933, KAKENHI-PROJECT-19H03444, KAKENHI-PROJECT-16K08672, KAKENHI-PROJECT-18K15303
  • [雑誌論文] Integrated exome and RNA sequencing of dedifferentiated liposarcoma2019

    • 著者名/発表者名
      Hirata Makoto、Matsubara Daisuke (21th) etc
    • 雑誌名

      Nature Communications

      巻: 10 号: 1 ページ: 1-12

    • DOI

      10.1038/s41467-019-13286-z

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-19K07441, KAKENHI-PROJECT-19K07791, KAKENHI-PROJECT-19K09206, KAKENHI-PROJECT-19K12215, KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-16H02676, KAKENHI-PROJECT-17H03596, KAKENHI-PROJECT-18H02933, KAKENHI-PROJECT-19H03444, KAKENHI-PROJECT-16K08672
  • [雑誌論文] Genomic Heterogeneity Within Individual Prostate Cancer Foci Impacts Predictive Biomarkers of Targeted Therapy2018

    • 著者名/発表者名
      VanderWeele DJ, Finney R, Katayama K, Gillard M, Paner G, Imoto S, Yamaguchi R, Wheeler D, Lack J, Cam M, Pontier A, Nguyen YTM, Maejima K, Sasaki-Oku A, Nakano K, Tanaka H, Vander Griend D, Kubo M, Ratain MJ, Miyano S, Nakagawa H
    • 雑誌名

      Eur Urol Focus

      巻: pii: S2405-4569(18) 号: 3 ページ: 30007-5

    • DOI

      10.1016/j.euf.2018.01.006

    • 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PLANNED-15H05912, KAKENHI-PROJECT-19K12215
  • 1.  山口 類 (90380675)
    共同の研究課題数: 4件
    共同の研究成果数: 1件
  • 2.  井元 清哉 (10345027)
    共同の研究課題数: 3件
    共同の研究成果数: 1件
  • 3.  植村 元秀 (40631015)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 4.  宮野 悟 (50128104)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 5.  松田 浩一 (90401257)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 6.  島村 徹平 (00623943)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 7.  白石 友一 (70516880)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 8.  PARK HEEWON (70756642)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 9.  新井田 厚司 (00772493)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 10.  張 耀中 (60817138)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 11.  玉田 嘉紀 (80435495)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 12.  中村 卓郎 (00180373)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 13.  中山 タラントロバート (00365298)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 14.  竹中 聡 (00588379)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 15.  高阪 真路 (00627119)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 16.  松本 嘉寛 (10346794)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 17.  植田 幸嗣 (10509110)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 18.  穴澤 卯圭 (20245525)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 19.  比留間 徹 (20254188)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 20.  河野 博隆 (20345218)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 21.  阿江 啓介 (20376726)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 22.  小林 寛 (20407951)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 23.  堀内 圭輔 (30327564)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 24.  河本 旭哉 (30420558)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 25.  平賀 博明 (30501530)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 26.  土屋 弘行 (40227434)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 27.  坂本 昭夫 (40335964)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 28.  朴木 寛弥 (40336863)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 29.  秋山 達 (40376471)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 30.  大隈 知威 (40806189)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 31.  元井 亨 (50291315)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 32.  西田 佳弘 (50332698)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 33.  中川 英刀 (50361621)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 34.  平田 真 (50401071)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 35.  米本 司 (50506318)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 36.  馬場 一郎 (60330073)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 37.  小田 義直 (70291515)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 38.  末原 義之 (70509405)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 39.  國定 俊之 (80346428)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 40.  山田 聡 (80405208)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 41.  相羽 久輝 (70793834)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 42.  松原 大祐 (80415554)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 1件
  • 43.  川井 章 (90252965)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 44.  筑紫 聡 (90378109)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 45.  綿貫 宗則 (90451575)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 46.  王谷 英達 (60727965)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 47.  吉川 秀樹 (60191558)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 48.  中 紀文 (90601964)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 49.  岡本 健 (30414113)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 50.  五嶋 孝博 (20272544)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 51.  岩田 慎太郎 (90549685)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 52.  小林 恭 (00642406)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 53.  野々村 祝夫 (30263263)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 54.  小島 祥敬 (60305539)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 55.  寺田 直樹 (60636637)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 56.  星 誠二 (70813137)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 57.  佐藤 慎哉
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 58.  鷲見 公太
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 59.  氏家 剛
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 60.  浜本 隆二
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件
  • 61.  金子 修三
    共同の研究課題数: 0件
    共同の研究成果数: 1件

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