関嶋政和 Sekijima Masakazu

研究者番号	80371053
その他のID	https://orcid.org/0000-0002-3806-9535
所属 (現在)	2024年度: 東京科学大学, 情報理工学院, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2020年度 – 2024年度: 東京工業大学, 情報理工学院, 准教授 2016年度 – 2018年度: 東京工業大学, 科学技術創成研究院, 准教授 2012年度 – 2016年度: 東京工業大学, 学術国際情報センター, 准教授 2011年度 – 2013年度: 東京工業大学, 学内共同利用施設等, 准教授 2008年度: 独立行政法人産業技術総合研究所, 生命情報工学研究センター, 研究員 2007年度: 産業技術総合研究所, 生命情報工学研究センター, 研究員
審査区分/研究分野	研究代表者学術変革領域研究区分(Ⅱ) / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 生命・健康・医療情報学 / 創薬化学 / 生体生命情報学研究代表者以外生体生命情報学 / 知能情報学
キーワード	研究代表者ケモインフォマティクス / バイオインフォマティクス / 機械学習 / スーパーコンピュータ / 創薬 / 分子動力学シミュレーション / AI創薬 / IT創薬 / コンピュータシミュレーション / 自動合成 … もっと見る / ロボット / 抗規制原虫薬 / 寄生原虫 / 抗寄生原虫治療薬 / in vitroアッセイ / in silico創薬 / ハイパフォーマンス・コンピューティング / 量子化学計算 / 分子シミュレーション / スーパーコンピューティング / SDGs / 顧みられない熱帯病 / スマート創薬 / ドッキングシミュレーション / 生体生命情報学 / ハイパフォーマンスコンピューティング / フオールデイング / フォールディング / 隠れマルコフモデル / タンパク質 / 生命情報工学 … もっと見る研究代表者以外分子シミュレーション / ハイパフォーマンス・コンピューティング / 薬学 / アルゴリズム / 生体生命情報学 / 三次構造 / 3次構造 / ab initioモデリング / 蛋白質 / 高分子 / 3次元構造予測 / サンプリング / max-sum / ポテンシャルエネルギー / MCMC / Max-Sumアルゴリズム / 因子グラフ / 立体構造 / タンパク質隠す

多層SKIPコネクションを導入した条件付きVAEによる高精度な化合物生成手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  関嶋政和
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅱ)
- 研究機関
  東京工業大学
in silicoとロボットによる創薬支援システムの開発とシャーガス病治療薬探索研究代表者
- 研究代表者
  
  関嶋政和
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2023
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  東京工業大学
in silicoとin vitroの融合によるトリパノソーマ原虫治療薬探索研究代表者
- 研究代表者
  
  関嶋政和
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  東京工業大学
熱帯病治療薬開発に向けた新薬開発高度化研究代表者
- 研究代表者
  
  関嶋政和
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2014
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  創薬化学
- 研究機関
  東京工業大学
複数分子を標的とした新薬設計手法の開発
- 研究代表者
  
  秋山泰
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  東京工業大学
グラフィカルモデルを用いた高分子ポテンシャルデコーダの開発
- 研究代表者
  
  篠崎隆宏
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2013
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  知能情報学
- 研究機関
  東京工業大学
   千葉大学
自由エネルギー地形解析による異常プリオンタンパク質のフォールディング原理の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  関嶋政和
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  独立行政法人産業技術総合研究所

[雑誌論文] PRA-Pred: Structure-based prediction of protein-RNA binding affinity2024
- 著者名/発表者名
  Harini K.、Sekijima M.、Gromiha M. Michael
- 雑誌名
  
  International Journal of Biological Macromolecules
  
  巻: 259 ページ: 129490-129490
- DOI
  10.1016/j.ijbiomac.2024.129490
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Gargoyles: An Open Source Graph-Based Molecular Optimization Method Based on Deep Reinforcement Learning2023
- 著者名/発表者名
  Erikawa Daiki、Yasuo Nobuaki、Suzuki Takamasa、Nakamura Shogo、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 8 号: 40 ページ: 37431-37441
- DOI
  10.1021/acsomega.3c05430
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Enhancing the Performance of AlphaFold Through Modified Storage Method and Optimization of HHblits on TSUBAME3.0 Supercomputer2023
- 著者名/発表者名
  Fujita Hayato、Nomura Akihiro、Endo Toshio、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2023 Congress in Computer Science, Computer Engineering, & Applied Computing (CSCE)
  
  巻: - ページ: 2140-2146
- DOI
  10.1109/csce60160.2023.00351
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Discovery of a Hidden Trypanosoma cruzi Spermidine Synthase Binding Site and Inhibitors through In Silico, In Vitro, and X-ray Crystallography2023
- 著者名/発表者名
  Yoshino Ryunosuke、Yasuo Nobuaki、Hagiwara Yohsuke、Ishida Takashi、Inaoka Daniel Ken、Amano Yasushi、Tateishi Yukihiro、Ohno Kazuki、Namatame Ichiji、Niimi Tatsuya、Orita Masaya、Kita Kiyoshi、Akiyama Yutaka、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  ACS Omega
  
  巻: 8 号: 29 ページ: 25850-25860
- DOI
  10.1021/acsomega.3c01314
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Predicting Chemical Reaction Product by Graph Transformer2023
- 著者名/発表者名
  Makino Shunya、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2023 Congress in Computer Science, Computer Engineering, & Applied Computing (CSCE)
  
  巻: - ページ: 2147-2152
- DOI
  10.1109/csce60160.2023.00352
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Statistical potentials for RNA-protein interactions optimized by CMA-ES2022
- 著者名/発表者名
  Kimura Takayuki、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu、Lustig Brooke
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Graphics and Modelling
  
  巻: 110 ページ: 108044-108044
- DOI
  10.1016/j.jmgm.2021.108044
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] An Improved Model for Predicting Compound Retrosynthesizability Using Machine Learning2022
- 著者名/発表者名
  Ozawa Mami、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2022 IEEE 22nd International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE)
  
  巻: - ページ: 210-216
- DOI
  10.1109/bibe55377.2022.00052
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Dephospho-Coenzyme A Kinase Is an Exploitable Drug Target against Plasmodium falciparum: Identification of Selective Inhibitors by High-Throughput Screening of a Large Chemical Compound Library2022
- 著者名/発表者名
  Nurkanto Arif、Imamura Riyo、Rahmawati Yulia、Prabandari Erwahyuni Endang、Waluyo Danang、Annoura Takeshi、Yamamoto Kazuki、Sekijima Masakazu、Nishimura Yuki、Okabe Takayoshi、Shiba Tomoo、Shibata Norio、Kojima Hirotatsu、Duffy James、Nozaki Tomoyoshi
- 雑誌名
  
  Antimicrobial Agents and Chemotherapy
  
  巻: 66 号: 11
- DOI
  10.1128/aac.00420-22
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Toxicokinetic analysis of the anticoagulant rodenticides warfarin & diphacinone in Egyptian fruit bats (Rousettus aegyptiacus) as a comparative sensitivity assessment for Bonin fruit bats (Pteropus pselaphon)2022
- 著者名/発表者名
  Takeda Kazuki、Manago Kosuke、Morita Ayuko、Kawai Yusuke K.、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu、Ikenaka Yoshinori、Hashimoto Takuma、Minato Ryuichi、Oyamada Yusuke、Horikoshi Kazuo、Suzuki Hajime、Ishizuka Mayumi、Nakayama Shouta M.M.
- 雑誌名
  
  Ecotoxicology and Environmental Safety
  
  巻: 243 ページ: 113971-113971
- DOI
  10.1016/j.ecoenv.2022.113971
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620, KAKENHI-PROJECT-21H04919, KAKENHI-PROJECT-21K14988
[雑誌論文] Multidimensional analyses of the pathomechanism caused by the non-catalytic GNE variant, c.620A>T, in patients with GNE myopathy2022
- 著者名/発表者名
  Yoshioka Wakako、Iida Aritoshi、Sonehara Kyuto、Yamamoto Kazuki、Oya Yasushi、Mori-Yoshimura Madoka、Kurashige Takashi、Okubo Mariko、Ogawa Megumu、Matsuda Fumihiko、Higasa Koichiro、Hayashi Shinichiro、Nakamura Harumasa、Sekijima Masakazu、Okada Yukinori、Noguchi Satoru、Nishino Ichizo
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 21806-21806
- DOI
  10.1038/s41598-022-26419-0
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K06961, KAKENHI-PROJECT-20H00620, KAKENHI-PROJECT-23K21722
[雑誌論文] Novel Calcium-Binding Ablating Mutations Induce Constitutive RET Activity and Drive Tumorigenesis2022
- 著者名/発表者名
  Tabata Junya、Nakaoku Takashi、Araki Mitsugu、Yoshino Ryunosuke、Kohsaka Shinji、Otsuka Ayaka、Ikegami Masachika、Ui Ayako、Kanno Shin-ichiro、Miyoshi Keiko、Matsumoto Shigeyuki、Sagae Yukari、Yasui Akira、Sekijima Masakazu、Mano Hiroyuki、Okuno Yasushi、Okamoto Aikou、Kohno Takashi
- 雑誌名
  
  Cancer Research
  
  巻: 82 号: 20 ページ: 3751-3762
- DOI
  10.1158/0008-5472.can-22-0834
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00545, KAKENHI-PROJECT-20H00620, KAKENHI-PROJECT-21H02795
[雑誌論文] Screening for Inhibitors of Main Protease in SARS-CoV-2: In Silico and In Vitro Approach Avoiding Peptidyl Secondary Amides2022
- 著者名/発表者名
  Yamamoto Kazuki Z.、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  巻: 62 号: 2 ページ: 350-358
- DOI
  10.1021/acs.jcim.1c01087
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Tuning of Bayesian optimization for materials synthesis: simulation of the one-dimensional case2022
- 著者名/発表者名
  Nakayama Ryo、Shimizu Ryota、Haga Taishi、Kimura Takefumi、Ando Yasunobu、Kobayashi Shigeru、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu、Hitosugi Taro
- 雑誌名
  
  Science and Technology of Advanced Materials: Methods
  
  巻: 2 号: 1 ページ: 119-128
- DOI
  10.1080/27660400.2022.2066489
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K14692, KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Computer aided drug discovery review for infectious diseases with case study of anti-Chagas project2021
- 著者名/発表者名
  Yasuo Nobuaki、Ishida Takashi、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Parasitology International
  
  巻: 83 ページ: 102366-102366
- DOI
  10.1016/j.parint.2021.102366
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Tackling Covid‐19 using disordered‐to‐order transition of residues in the spike protein upon angiotensin‐converting enzyme 2 binding2021
- 著者名/発表者名
  Yesudhas Dhanusha、Srivastava Ambuj、Sekijima Masakazu、Gromiha M. Michael
- 雑誌名
  
  Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics
  
  巻: 89 号: 9 ページ: 1158-1166
- DOI
  10.1002/prot.26088
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Biochemical Studies of Mitochondrial Malate: Quinone Oxidoreductase from Toxoplasma gondii2021
- 著者名/発表者名
  Acharjee Rajib、Talaam Keith、Hartuti Endah、Matsuo Yuichi、Sakura Takaya、Gloria Bundutidi、Hidano Shinya、Kido Yasutoshi、Mori Mihoko、Shiomi Kazuro、Sekijima Masakazu、Nozaki Tomoyoshi、Umeda Kousuke、Nishikawa Yoshifumi、Hamano Shinjiro、Kita Kiyoshi、Inaoka Daniel
- 雑誌名
  
  International Journal of Molecular Sciences
  
  巻: 22 号: 15 ページ: 7830-7830
- DOI
  10.3390/ijms22157830
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K07523, KAKENHI-PROJECT-18KK0454, KAKENHI-PROJECT-20H00620, KAKENHI-PROJECT-19H03436
[雑誌論文] Effect of charged mutation on aggregation of a pentapeptide: Insights from molecular dynamics simulations2021
- 著者名/発表者名
  Prabakaran R.、Rawat Puneet、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu、Kumar Sandeep、Gromiha M. Michael
- 雑誌名
  
  Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics
  
  巻: 90 号: 2 ページ: 405-417
- DOI
  10.1002/prot.26230
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] MERMAID: an open source automated hit-to-lead method based on deep reinforcement learning2021
- 著者名/発表者名
  Erikawa Daiki、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Journal of Cheminformatics
  
  巻: 13 号: 1
- DOI
  10.1186/s13321-021-00572-6
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Identification of key interactions between SARS-CoV-2 main protease and inhibitor drug candidates2020
- 著者名/発表者名
  Yoshino Ryunosuke、Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 10 号: 1
- DOI
  10.1038/s41598-020-69337-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[雑誌論文] Improved Method of Structure-Based Virtual Screening via Interaction-Energy-Based Learning2019
- 著者名/発表者名
  Yasuo Nobuaki、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Journal of Chemical Information and Modeling
  
  巻: 59 号: 3 ページ: 1050-1061
- DOI
  10.1021/acs.jcim.8b00673
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-16J09021
[雑誌論文] Exploring the selectivity of inhibitor complexes with Bcl-2 and Bcl-XL: A molecular dynamics simulation approach2018
- 著者名/発表者名
  Wakui Naoki、Yoshino Ryunosuke、Yasuo Nobuaki、Ohue Masahito、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Journal of Molecular Graphics and Modelling
  
  巻: 79 ページ: 166-174
- DOI
  10.1016/j.jmgm.2017.11.011
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-17H01814, KAKENHI-PROJECT-16J09021, KAKENHI-PROJECT-15K16081
[雑誌論文] Predicting Strategies for Lead Optimization via Learning to Rank2018
- 著者名/発表者名
  Yasuo Nobuaki、Watanabe Keisuke、Hara Hideto、Rikimaru Kentaro、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics
  
  巻: 11 号: 0 ページ: 41-47
- DOI
  10.2197/ipsjtbio.11.41
- NAID
  130007528710
- ISSN
  1882-6679
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-16J09021
[雑誌論文] CoDe-DTI: Collaborative Deep Learning-based Drug-Target Interaction Prediction2018
- 著者名/発表者名
  Yasuo Nobuaki、Nakashima Yusuke、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Proceedings of 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics & Biomedicine
  
  巻: －ページ: 792-797
- DOI
  10.1109/bibm.2018.8621368
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-16J09021
[雑誌論文] Compound property enhancement by virtual compound synthesis2018
- 著者名/発表者名
  Arai Naoki、Yoshikawa Shunsuke、Yasuo Nobuaki、Yoshino Ryunosuke、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 16 号: 03 ページ: 1840016-1840016
- DOI
  10.1142/s0219720018400164
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18150, KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-16J09021
[雑誌論文] An iterative compound screening contest method for identifying target protein inhibitors using the tyrosine-protein kinase Yes2017
- 著者名/発表者名
  Shuntaro Chiba, 他30名（George Chikenji は16番目の著者）
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 1-13
- DOI
  10.1038/s41598-017-10275-4
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K07315, KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-17H01814, KAKENHI-PROJECT-16J09021, KAKENHI-PROJECT-17J06897
[雑誌論文] In silico, in vitro, X-ray crystallography, and integrated strategies for discovering spermidine synthase inhibitors for Chagas disease2017
- 著者名/発表者名
  Yoshino Ryunosuke、Yasuo Nobuaki、Hagiwara Yohsuke、Ishida Takashi、Inaoka Daniel Ken、Amano Yasushi、Tateishi Yukihiro、Ohno Kazuki、Namatame Ichiji、Niimi Tatsuya、Orita Masaya、Kita Kiyoshi、Akiyama Yutaka、Sekijima Masakazu
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 7 号: 1 ページ: 1-9
- DOI
  10.1038/s41598-017-06411-9
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-17H01814, KAKENHI-PROJECT-16J09021, KAKENHI-PROJECT-15K16082, KAKENHI-PROJECT-16K19114
[雑誌論文] Identification of type I and type II inhibitors of c-Yes kinase using in silico and experimental techniques2017
- 著者名/発表者名
  Ramakrishnan Chandrasekaran、Mary Thangakani Anthony、Velmurugan Devadasan、Anantha Krishnan Dhanabalan、Sekijima Masakazu、Akiyama Yutaka、Gromiha M. Michael
- 雑誌名
  
  Journal of Biomolecular Structure and Dynamics
  
  巻: 36 号: 6 ページ: 1566-1576
- DOI
  10.1080/07391102.2017.1329098
- 査読あり / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-17H01814
[雑誌論文] オープンイノベーションによるIT創薬：コンテスト形式による薬剤候補化合物の探索2016
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 雑誌名
  
  情報管理
  
  巻: 58 号: 12 ページ: 900-907
- DOI
  10.1241/johokanri.58.900
- NAID
  130005131231
- ISSN
  0021-7298, 1347-1597
- 言語
  日本語
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[雑誌論文] Application for evaluating and visualizing the sequence conservation of ligand-binding sites2015
- 著者名/発表者名
  N. Yasuo and M. Sekijima
- 雑誌名
  
  IPSJ Transaction on Bioinformatics
  
  巻: 未定
- NAID
  130005087634
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[雑誌論文] Application for evaluating and visualizing the sequence conservation of ligand-binding sites2015
- 著者名/発表者名
  N. Yasuo and M. Sekijima
- 雑誌名
  
  IPSJ Transaction on Bioinformatics
  
  巻: 8
- NAID
  130005087634
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[雑誌論文] Structure based approach for understanding organism specific recognition of protein-RNA complexes2015
- 著者名/発表者名
  R. Nagarajan, S. Pankaj Chothani, C. Ramakrishnan, M. Sekijima, and M. M. Gromiha
- 雑誌名
  
  Biology Direct
  
  巻: 10(8) 号: 1 ページ: 1-13
- DOI
  10.1186/s13062-015-0039-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044, KAKENHI-PROJECT-25870222
[雑誌論文] Identification of potential inhibitors based on compound proposal contest: Tyrosine-protein kinase Yes as a target2015
- 著者名/発表者名
  Chiba S, Akiyama Y, Sekijima M.
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 5 号: 1 ページ: 1-13
- DOI
  10.1038/srep17209
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044, KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-15J11261, KAKENHI-PROJECT-25430186, KAKENHI-PROJECT-26730152, KAKENHI-PUBLICLY-26120528
[雑誌論文] 2.Pharmacophore Modeling for Anti-Chagas Drug Design Using the Fragment Molecular Orbital Method2015
- 著者名/発表者名
  Yoshino R, Yasuo N, Inaoka DK, Hagiwara Y, Ohno K, Orita M, Inoue M, Shiba T, Harada S, Honma T, Balogun EO, da Rocha JR, Montanari CA, Kita K, Sekijima M
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 10 号: 5 ページ: 1-15
- DOI
  10.1371/journal.pone.0125829
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26440027, KAKENHI-PROJECT-24240044, KAKENHI-PROJECT-26253003, KAKENHI-PROJECT-26253025, KAKENHI-PROJECT-15H02776, KAKENHI-PROJECT-26870119
[雑誌論文] Molecular mechanisms underlying oseltamivir resistance mediated by an I117V substitution in the NA of H5N1 avian influenza viruses2013
- 著者名/発表者名
  Takano R, Kiso M, Igarashi M, Le QM, Sekijima M, Ito K, Takada A, Kawaoka Y
- 雑誌名
  
  J Infect Dis
  
  巻: 207 号: 1 ページ: 89-97
- DOI
  10.1093/infdis/jis633
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23780305, KAKENHI-PROJECT-24240044
[雑誌論文] Accelerating quantum chemistry calculations with graphical processing units - toward in high-density (HD) silico drug discovery2013
- 著者名/発表者名
  Hagiwara Y , Ohno K , Orita M , Koga R , Endo T , Akiyama Y , Sekijima M.
- 雑誌名
  
  Curr Comput Aided Drug Des. 2013
  
  巻: Vol. 9, No. 3, ページ: 396-401
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[雑誌論文] Database of the clinical phenotypes, genotypes, and mutant arylsulfatase B structures in mucopolysaccharidosis type VI2012
- 著者名/発表者名
  Saito S, et al
- 雑誌名
  
  J.Hum.Genet.
  
  巻: 57 号: 4 ページ: 280-282
- DOI
  10.1038/jhg.2012.6
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21390314, KAKENHI-PROJECT-22790173, KAKENHI-PROJECT-23659527, KAKENHI-PROJECT-24240044, KAKENHI-PROJECT-24590218
[雑誌論文] Distance-based Factor Graph Linearization and Sampled Max-sum Algorithm for Efficient 3D Potential Decoding of Macromolecules2011
- 著者名/発表者名
  Takahiro Shinozaki, Toshinao Iwaki, Shiqiao Du, Masakazu Sekijima and Sadaoki Furui
- 雑誌名
  
  IPSJ Transaction on Bioinformatics
  
  巻: Vol. 4 ページ: 34-44
- NAID
  130001288766
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[雑誌論文] Distance-based Factor Graph Linearization and Sampled Max-sum Algorithm for Efficient 3D Potential Decoding of Macromolecules2011
- 著者名/発表者名
  Takahiro Shinozaki, Toshinao Iwaki, Shiqiao Du, Masakazu Sekijima, Sadaoki Furui
- 雑誌名
  
  IPSJ Transaction on Bioinformatics
  
  巻: 4 ページ: 34-44
- NAID
  130001288766
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[雑誌論文] State transition probability analysis of protein folding based on large scale molecular dynamics simulation2008
- 著者名/発表者名
  S. Tokunaga, K.Ikeda, S. Honda, Y. Sawada, Y. Muraoka,T. Noguchi, M. Sekijima
- 雑誌名
  
  In Proceedingsof the 17th IASTED International Conference on Applied Simulation and Modelling (ASM2008)
  
  ページ: 164-169
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Optimization and Evaluation of Parallel Molecular Dynamics Simulation on Blue Gene/L2007
- 著者名/発表者名
  M. Sekijima, J. Doi, T. Noguchi, and S. Shimizu
- 雑誌名
  
  In Proceedingsof the IASTED International Conference on Parallel and Distributed Computer and Networks (PDCN2007)
  
  ページ: 257-262
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] High-Density Surface Reconstruction of Fine Arts and Documents for Complete Reproduction and Counterfeit Detection2007
- 著者名/発表者名
  J. Doi, K. Shimizu, and M. Sekijima
- 雑誌名
  
  In Proceedings of the 2007 IEEE International Conference on Networking, Sensing and Control (ICNSC2007)
  
  ページ: 392-397
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Dvelopment of SVM based Prediction System for Metalbinding Sites in Protein2007
- 著者名/発表者名
  M. Nakazawa, M. Takata, K. Yokota, T. Noguchi, M. Sekijima, and K. Joe
- 雑誌名
  
  In Proceedings of the International Conference on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA 2007)
  
  ページ: 972-978
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Development of Molecular Dynamics Simulation based Flexible Docking System2007
- 著者名/発表者名
  S. Kimura, M. Sekijima, M. Takata, T. Noguchi, and K. Joe
- 雑誌名
  
  In Proceedings of the 2007 International Conference on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA 2007)
  
  ページ: 739-745
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Optimization of Molecular Dynamics Simulation on Cell Processor2007
- 著者名/発表者名
  M. Sasaki, M. Sekijima, M. Takata, and K. Joe
- 雑誌名
  
  In Proceedings of the 2007 International Conference on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA 2007)
  
  ページ: 780-786
- NAID
  110006345455
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Free Energy Landscape Analysis System based on Parallel Molecular Dynamics Simulation2007
- 著者名/発表者名
  M.Sekijima, et. al.
- 雑誌名
  
  IPSJ Transaction on Bioznformatics Vol.48 No.SIG17(TBIO3)
  
  ページ: 30-39
- NAID
  110006453191
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Free Energy Landscape Analysis System based on Parallel Molecular Dynamics Simulation2007
- 著者名/発表者名
  M. Sekijima, J. Doi, S. Honda, T. Noguchi, and S. Shimizu, and Y. Akiyama
- 雑誌名
  
  IPSJ Transaction on Bioinformatics, Vol.48 No.SIG17(TBIO3)
  
  ページ: 30-39
- NAID
  110006453191
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Large Scale Computing for Protein-Protein Binding Free Energy Calculation
- 著者名/発表者名
  J. Ikeda, K. Ohno, S. Akioka, M. Orita, Y. Muraoka, T. Noguchi, M. Sekijima
- 雑誌名
  
  In Proceedings of the 2008 International Conference on Parallel and Distributed Processing Techniques and Applications (PDPTA 2008)
  
  ページ: 771-775
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[雑誌論文] Crystal Structure of a Ten-Amino Acid Protein
- 著者名/発表者名
  S. Honda, T. Akiba, Y. Kato, Y. Sawada, M. Sekijima, M. Ishimura, A. Ooishi, H. Watanabe, T. Odahara, H. Kazuaki
- 雑誌名
  
  Journal of the American Chemical Society (accepted)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[学会発表] Expression of an active ASCT/SCS cycle in Mycobacterium smegmatis confers resistance to Bedaquiline2023
- 著者名/発表者名
  Mavinga Gloria Bundutidi, Ando Yuri, Matsuo Yuichi, Hayashishita Mizuki, Mochizuki Kota, Cook Gregory M., Sekijima Masakazu, Sakura Takaya, Hamano Shinjiro, Hirayama Kenji, Kita Kiyoshi, Ken Daniel Inaoka
- 学会等名
  Gordon Research Conferences on Bioenergetics, Proctor Academy, New Hampshire
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] パレート最適を考慮したHit-to-Leadにおける多目的最適化手法の開発2023
- 著者名/発表者名
  鈴木敬将・安尾信明・関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第143回MPS・第74回BIO合同研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Transformerを用いたグラフ翻訳による分子最適化手法の開発2023
- 著者名/発表者名
  牧野峻也, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第85回全国大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] タンパク質ーリガンド結合部位の特徴量化の改善に関する研究2023
- 著者名/発表者名
  塩澤理紗・安尾信明・関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第143回MPS・第74回BIO合同研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] パレート最適化を用いた多目的最適なde novo分子生成2023
- 著者名/発表者名
  鈴木敬将, Ma Dian, 中村彰悟, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第143年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Efficiency Improvements in Drug Discovery through Machine Learning and the Challenges to Overcome2023
- 著者名/発表者名
  Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2023年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] パレート最適化MCTSを用いたde novo分子生成手法の開発2023
- 著者名/発表者名
  鈴木敬将, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第85回全国大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] タンパク質のリガンド結合部位の特徴量化手法の改善に関する研究2023
- 著者名/発表者名
  塩澤理紗, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第85回全国大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Development of hit-to-lead molecular optimization by multi-objective Monte Carlo Tree Search2023
- 著者名/発表者名
  Takamasa SUZUKI, Nobuaki YASUO, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2023年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Trypanosomal ASCT and alternative oxidase as tools to study Mycobacterium bioenergetics2023
- 著者名/発表者名
  Mavinga Gloria Bundutidi, Ando Yuri, Matsuo Yuichi, Hayashishita Mizuki, Mochizuki Kota, Cook Gregory M., Sekijima Masakazu, Sakura Takaya, Hamano Shinjiro, Hirayama Kenji, Kita Kiyoshi, Ken Daniel Inaoka
- 学会等名
  11th Meeting GlycoNov/AdipoTryp
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] 機械学習によるタンパク質のアポ構造からホロ構造の予測手法の開発2022
- 著者名/発表者名
  李明曄, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第69回バイオ研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] 機械学習による化合物の逆合成解析可能性予測手法の開発2022
- 著者名/発表者名
  小澤真実, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第69回バイオ研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] 深層強化学習による任意の分子を出発点とした分子最適化手法の開発2022
- 著者名/発表者名
  恵利川大樹，安尾信明，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第84回全国大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Hit Identification for SARS-CoV-2 Main Protease Using Convolutional Neural Network2022
- 著者名/発表者名
  Nobuyuki Yasuo, Hiroshi Yoda, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Prediction of Protein Binding Region on RNA with Transformer and Attention Augmentation2022
- 著者名/発表者名
  Takayuki Kimura, Nobuyuki Yasuo, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Prediction of Chemical Reaction Type with Hierarchical Graph Neural Networks2022
- 著者名/発表者名
  Tatsuya Ishimoto, Nobuyuki Yasuo, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] In Silico and In Vitro Screening for Inhibitors of SARSCoV-2 Main Protease Avoiding Peptidyl Secondary Amides2022
- 著者名/発表者名
  Kazuki Yamamoto, Nobuyuki Yasuo, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] An Enhanced Machine Learning Models for Predicting Retrosynthesis Accessibility2022
- 著者名/発表者名
  Mami Ozawa, Nobuyuki Yasuo, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Multi-Objective Molecular Optimization Using Monte Carlo Tree Search2022
- 著者名/発表者名
  Suzuki Takamasa, Ma Dian, Nobuyuki Yasuo, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] In silico drug design by Molecular Generative Model and Docking2022
- 著者名/発表者名
  Dian Ma, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第69回バイオ研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] 任意の分子を出発点とするグラフベースの分子最適化手法の開発2022
- 著者名/発表者名
  恵利川大樹, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第69回バイオ研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] 機械学習を用いた蛋白質のリガンド結合部位の形状を考慮した化合物の生成手法の開発2022
- 著者名/発表者名
  村田翔太朗，安尾信明，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第84回全国大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Molecular Optimization by Graph Generative Model using Transformers2022
- 著者名/発表者名
  Shunya Makino, Nobuyuki Yasuo, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2022年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] 機械学習を用いた化合物の最適化と創薬への応用2022
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第143年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] 新薬研究・開発における人工知能の適用と高度化2021
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第141回年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Generation of derivative for small organic compound via Monte Carlo Tree Search2020
- 著者名/発表者名
  Daiki Erikawa, Nobuaki Yasuo and Masakazu Sekijima
- 学会等名
  第９回生命医薬情報学連合大会（IIBMP2020）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] Augmented Realityによる創薬のためのタンパク質・リガンド可視化システムの開発2020
- 著者名/発表者名
  小山敦史 , 川田信吾 , 坂本亘 , 安尾信明 , 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会研究報告数理モデル化と問題解決（MPS）,2020-MPS-129(7),1-4 (2020-07-20)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] COVID-19と将来の感染症に向き合うシミュレーションと機械学習基盤2020
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 学会等名
  第9回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2020)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20H00620
[学会発表] リゾリン脂質の疎水性部は膜受容体結合時にどこに位置するか2019
- 著者名/発表者名
  佐山美紗, 上水明治, 井上飛鳥, 青木淳賢, 関嶋政和, 尾谷優子, 大和田智彦
- 学会等名
  日本薬学会第139年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Mixed Realityを用いたタンパク質・リガンド立体構造可視化による医薬品設計支援システムの開発2019
- 著者名/発表者名
  小山敦史, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第139年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] ディープラーニングを用いたタンパク質 - リガンド結合予測手法の開発2019
- 著者名/発表者名
  依田洸, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第139年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] A Concept of Automated Lead Optimization Method by Compound Property Enhancement and Learning to Rank2018
- 著者名/発表者名
  N. Yasuo, K. Watanabe, N. Arai,H. Hara, K. Rikimaru, M. Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] 脂質リガンドの GPCR への結合機構の解明のための誘導体合成と計算科学の融合研究2018
- 著者名/発表者名
  佐山美紗，井上飛鳥，青木淳賢，広川貴次，関嶋政和，尾谷優子，大和田智彦
- 学会等名
  日本薬学会第138年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Mixed Realityを用いた蛋白質・リガンドの三次元可視化による創薬支援システムの開発2018
- 著者名/発表者名
  小山敦史, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会2018年大会(IIBMP2018)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Web-based systems to build virtual compound libraries with specified direction2018
- 著者名/発表者名
  Nobuaki Yasuo, Naoki Arai, Shunsuke Yoshikawa, Ryunosuke Yoshino, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  Biophysical society 62nd annual meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Development of Mixed Reality-based Protein and Ligand Tertiary Structure Visualization System2018
- 著者名/発表者名
  小山敦史, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  CBI学会2018年大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Random forestを用いたドッキング構造の学習によるバーチャルスクリーニングのポスト処理2017
- 著者名/発表者名
  安尾信明，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第79回全国大会
- 発表場所
  名古屋大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] スーパーコンピューティング、AI、Mixed Ralityによる創薬基盤の開発とスマート創薬への応用」第6２回構造生物応用研究会2017
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 学会等名
  第6２回構造生物応用研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] 機械学習を用いた化合物合成経路の予測2017
- 著者名/発表者名
  渡辺敬介,　安尾信明,　新井直樹, 関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第137年会
- 発表場所
  仙台国際センター
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] Exploring the selectivity of inhibitor complexes with Bcl-2 and Bcl-XL: a molecular dynamics simulation approach2017
- 著者名/発表者名
  Naoki Wakui, Ryunosuke Yoshino, Nobuaki Yasuo, Masahito Ohue and Masakazu Sekijima
- 学会等名
  第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2017)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] スマート創薬に期待されるGPUによる高速化2017
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 学会等名
  CBI 学会2017年大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] スマート創薬がAIと共に語りたい明日2017
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 学会等名
  人工知能学会第104回人工知能基本問題研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] ドッキング構造の機械学習を用いた高精度なバーチャルスクリーニング手法の開発2017
- 著者名/発表者名
  安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第137年会
- 発表場所
  仙台国際センター
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] スマート創薬の為の基盤環境整備と応用2017
- 著者名/発表者名
  関嶋政和
- 学会等名
  第6回生命医薬情報学連合大会(IIBMP 2017)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] 機械学習を用いた化合物合成経路の予測2017
- 著者名/発表者名
  渡辺敬介,　安尾信明,　新井直樹, 関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第137年会
- 発表場所
  仙台国際センター
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] インシリコスクリーニング技術を用いた抗シャーガス病の治療薬探索2017
- 著者名/発表者名
  吉野龍ノ介 , 安尾信明 , 萩原陽介 , 石田貴士 , 稲岡健 , 天野靖士 , 立石幸寛 , 大野一樹 , 生田目一寿 , 新美達也 , 折田正弥 , 北潔 , 秋山泰 , 関嶋政和
- 学会等名
  第52回情報処理学会バイオ情報学研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Mixed Realityを用いたタンパク質構造描画システムの開発2017
- 著者名/発表者名
  坂本　亘，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第79回全国大会
- 発表場所
  名古屋大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] 機械学習を用いた創薬におけるリード化合物最適化経路の予測2017
- 著者名/発表者名
  安尾信明 , 渡辺敬介 , 新井直樹 , 関嶋政和
- 学会等名
  第50回情報処理学会バイオ情報学研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] ドッキング構造の機械学習を用いた高精度なバーチャルスクリーニング手法の開発2017
- 著者名/発表者名
  安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  日本薬学会第137年会
- 発表場所
  仙台国際センター
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] ランク学習を用いた創薬における化合物合成経路予測2017
- 著者名/発表者名
  渡辺敬介，安尾信明，新井直樹，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第79回全国大会
- 発表場所
  名古屋大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Mixed Realityによる創薬支援システムの開発と応用2017
- 著者名/発表者名
  坂本亘，関嶋政和
- 学会等名
  第50回情報処理学会バイオ情報学研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Postprocessing protein-ligand docking based on the distance among interaction energy vectors2016
- 著者名/発表者名
  安尾信明，関嶋政和
- 学会等名
  CBI学会2016年大会
- 発表場所
  タワーホール船堀
- 年月日
  2016-10-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] Drug repositioning for Chagas disease by docking simulation and in vitro assay2016
- 著者名/発表者名
  吉野龍ノ介, 安尾信明, 黒田浩正, 関嶋政和
- 学会等名
  CBI学会2016年大会
- 発表場所
  タワーホール船堀
- 年月日
  2016-10-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15H02776
[学会発表] 方向性を持たせたグラフ構造変換による仮想化合物ライブラリの構築の研究2015
- 著者名/発表者名
  吉川舜亮, 安尾信明, 吉野龍ノ介, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会　第41回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  北海道大学
- 年月日
  2015-03-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] オープンイノベーションコンテストによるIT創薬2015
- 著者名/発表者名
  千葉峻太朗，池田和由，石田貴士，大野一樹，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会研究報告
- 発表場所
  神奈川県横浜市, 慶応義塾大学
- 年月日
  2015-09-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] 配列相同性に基づくタンパク質のリガンド結合候補部位の評価2015
- 著者名/発表者名
  安尾信明，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第41回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  北海道大学
- 年月日
  2015-03-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] 方向性を持たせたグラフ構造変換による仮想化合物ライブラリの構築の研究2015
- 著者名/発表者名
  吉川舜亮，安尾信明，吉野龍ノ介，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第41回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  北海道大学
- 年月日
  2015-03-20
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] SCMS2.0によるタンパク質ポテンシャルエネルギー最小化の諸条件における評価2014
- 著者名/発表者名
  篠崎隆宏、関嶋政和
- 学会等名
  バイオ情報学研究会
- 発表場所
  九州工業大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] SCMS2.0によるタンパク質ポテンシャルエネルギー最小化の諸条件における評価2014
- 著者名/発表者名
  篠崎隆宏, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会バイオ情報学研究会(SIGBIO)第37回研究会
- 発表場所
  九州工業大学
- 年月日
  2014-03-05
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] ハッシュテーブル及びde Bruijn Graphの分割による、ゲノム解析の消費メモリ量の低減2014
- 著者名/発表者名
  杉浦典和 , 石田貴士 , 秋山泰 , 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第76回全国大会
- 発表場所
  東京都,　東京電機大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] SCMS2.0によるタンパク質ポテンシャルエネルギー最小化の諸条件における評価2014
- 著者名/発表者名
  篠崎隆宏 , 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第37回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  福岡県, 九州工業大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] De Bruijn Graphの分割によるVelvetの消費メモリの低減2013
- 著者名/発表者名
  杉浦典和 , 石田貴士 , 秋山泰 , 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第36回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  東京都, 東京工業大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] 分子動力学シミュレーションで探る阻害剤結合によって誘起されるdengue virusプロテアーゼの特徴的な構造2013
- 著者名/発表者名
  千葉峻太朗 , 萩原陽介 , 大野一樹 , 折田正弥 , 関嶋政和
- 学会等名
  第54回日本熱帯医学会大会
- 発表場所
  長崎県, 長崎ブリックホール
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] FMO法を用いた抗dengue virus薬の創薬標的蛋白質と既知化合物間の相互作用解析2013
- 著者名/発表者名
  吉野龍ノ介，安尾信明，千葉峻太朗，萩原陽介，大野一樹，折田正弥，関嶋政和
- 学会等名
  第54回日本熱帯医学会大会
- 発表場所
  長崎
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] 結合自由エネルギー予測を用いたクリアランス経路予測の改善に関する研究2013
- 著者名/発表者名
  齊藤有紀，石田貴士，関嶋政和，秋山　泰
- 学会等名
  情報処理学会　第34回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  沖縄科学技術大学院大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] Sparse k-mer graphアルゴリズムの評価とVelvetへの実装2013
- 著者名/発表者名
  吉川舜亮 , 石田貴士 , 関嶋政和 , 秋山　泰
- 学会等名
  情報処理学会第34回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  沖縄県, 沖縄科学技術大学院大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] 分子動力学シミュレーションで探る阻害剤結合によって誘起されるdengue virusプロテアーゼの特徴的な構造2013
- 著者名/発表者名
  千葉峻太朗，萩原陽介，大野一樹，折田正弥，関嶋政和
- 学会等名
  54回日本熱帯医学会大会
- 発表場所
  長崎
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] FMO法を用いた抗dengue virus薬の創薬標的蛋白質と既知化合物間の相互作用解析2013
- 著者名/発表者名
  吉野龍ノ介 , 安尾信明 , 千葉峻太朗 , 萩原陽介 , 大野一樹 , 折田正弥 , 関嶋政和
- 学会等名
  第54回日本熱帯医学会大会
- 発表場所
  長崎県, 長崎ブリックホール
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] FMO 法を用いた抗トリパノソーマ候補薬と標的蛋白質間の相互作用解析2013
- 著者名/発表者名
  吉野龍ノ介, 安尾信明, 萩原陽介, 大野一樹, 折田正弥, 井上将行, 原田繁春, 本間光貴, 稲岡健, 北潔, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会　第36回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  東京工業大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] 結合自由エネルギー予測を用いたクリアランス経路予測の改善に関する研究2013
- 著者名/発表者名
  齊藤有紀 , 石田貴士 , 関嶋政和 , 秋山泰
- 学会等名
  情報処理学会第34回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  沖縄県, 沖縄科学技術大学院大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] Slice Chain Max-Sumアルゴリズムによるタンパク質のポテンシャルエネルギー最小化に関する研究2012
- 著者名/発表者名
  猪瀬直人, 篠崎隆宏, 杜世橋, 古井貞煕, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会バイオ情報学研究会(SIGBIO)第28回研究会
- 発表場所
  東北大学
- 年月日
  2012-03-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] Slice Chain Max-Sumアルゴリズムによるタンパク質のポテンシャルエネルギー最小化に関する研究2012
- 著者名/発表者名
  猪瀬直人，篠崎隆宏，杜世橋，古井貞煕，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会バイオ情報学研究会(SIG BIO), 第28回研究会
- 発表場所
  仙台市　東北大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] Protein Potential Energy Minimization Using Slice Chain Max-Sum Algorithm2012
- 著者名/発表者名
  Naoto Inose,Takahiro Shinozaki, Shiqiao Du, Sadaoki Furui, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  26th Annual symposium of The Protein society
- 発表場所
  アメリカサンディエゴ
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] Macromolecular Potential Energy Minimization Based on Slice-Wise Sampling and Max-Sum Algorithm2012
- 著者名/発表者名
  Takahiro Shinozaki, Naoto Inose, Shiqiao Du, Sadaoki Furuiy and Masakazu Sekijima
- 学会等名
  The 7th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics
- 発表場所
  Tokyo Institute of Technology
- 年月日
  2012-11-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] Protein Potential Energy Minimization Using Slice Chain Max-Sum Algorithm2012
- 著者名/発表者名
  Naoto Inose, Takahiro Shinozaki, Shiqiao Du, Sadaoki Furui and Masakazu Sekijima
- 学会等名
  The 26th Annual Symposium of The Protein Society
- 発表場所
  San Diego
- 年月日
  2012-08-06
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] Macromolecular Potential Energy Minimization Based on Slice-Wise Sampling and Max-Sum Algorithm2012
- 著者名/発表者名
  Takahiro Shinozaki, Naoto Inose, Shiqiao Du, Sadaoki Furuiy, Masakazu Sekijima
- 学会等名
  The 7th IAPR International Conference on Pattern Recognition in Bioinformatics
- 発表場所
  東京都目黒区
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] Distance-based Graph Linearization and Sampled Max-sum Algorithm for Efficient 3D Potential Decoding of Macromolecules2011
- 著者名/発表者名
  Takahiro Shinozaki，Toshinao Iwaki，Shiqiao Du，Masakazu Sekijima，Sadaoki Furui
- 学会等名
  情報処理学会バイオ情報学研究会(SIG BIO), 第２６回研究会
- 発表場所
  神戸市　神戸大学
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23650068
[学会発表] 超並列計算機を用いた生体分子解析 -疾病関連蛋白質解析と世界最小蛋白質設計への応用-2007
- 著者名/発表者名
  関嶋政和、本田真也、野口保
- 学会等名
  次世代スーパーコンピューティング・シンポジウム2007
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[学会発表] Free Energy Landscape Analysis of Prion Protein2007
- 著者名/発表者名
  M. Sekijima, C. Motono, Y. Akiyama, and T.Noguchi
- 学会等名
  51th Biophysical Society Annual Meeting
- 発表場所
  Baltimore
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[学会発表] 超並列計算機を用いた生体分子解析一疾病関連蛋白質解析と世界最小蛋白質設計への応用-2007
- 著者名/発表者名
  関嶋政和, ほか
- 学会等名
  次世代スーパーコンピューティング・シンポジウム2007
- 発表場所
  東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700279
[学会発表] 残基との相互作用エネルギーに基づくドッキングシミュレーション結果の絞り込み
- 著者名/発表者名
  宮津知美，安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第77回全国大会
- 発表場所
  京都大学
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] タンパク質立体構造中のリガンド結合候補部位における配列保存性評価手法の開発
- 著者名/発表者名
  安尾信明，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第77回全国大会
- 発表場所
  京都大学
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] 多段階グラフ拡張による仮想化合物ライブラリ構築の研究
- 著者名/発表者名
  吉川舜亮, 安尾信明, 吉野龍ノ介, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第77回全国大会
- 発表場所
  京都大学
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] タンパク質立体構造中のリガンド結合候補部位における配列保存性評価手法の開発
- 著者名/発表者名
  安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第77回全国大会
- 発表場所
  京都大学
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] GPUを用いたエネルギー計算の並列化によるドッキングシミュレーションの高速化
- 著者名/発表者名
  佐々木崇浩, 宇田川拓郎, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第75回全国大会
- 発表場所
  東北大学（宮城）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] 配列相同性に基づくタンパク質のリガンド結合候補部位の評価
- 著者名/発表者名
  安尾信明，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会　第38回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  沖縄科学技術大学院大学
- 年月日
  2014-06-25 – 2014-06-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] 多段階グラフ拡張による仮想化合物ライブラリ構築の研究
- 著者名/発表者名
  吉川舜亮，安尾信明，吉野龍ノ介，関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第77回全国大会
- 発表場所
  京都大学
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] Discovery of dengue virus protease inhibitors and their inhibitionmechanism through docking simulation
- 著者名/発表者名
  千葉峻太朗, 萩原陽介, 大野一樹, 本坊和也, 折田正弥, 関嶋政和
- 学会等名
  第55回日本熱帯医学会大会・第29回日本国際保健医療学会学術大会
- 発表場所
  東京女子医科大学・国際医療協力研修センター
- 年月日
  2014-11-01 – 2014-11-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222
[学会発表] CPU-アクセラレータ間の負荷分散による分子動力学法の効率化
- 著者名/発表者名
  宇田川拓郎, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会研究報告 2012-HPC-136
- 発表場所
  沖縄産業支援センター（沖縄）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] 残基との相互作用エネルギーに基づくドッキングシミュレーション結果の絞り込み
- 著者名/発表者名
  宮津知美, 安尾信明, 関嶋政和
- 学会等名
  情報処理学会第77回全国大会
- 発表場所
  京都大学
- 年月日
  2015-03-17 – 2015-03-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] Discovery of dengue virus protease inhibitors and their inhibitionmechanism through docking simulation
- 著者名/発表者名
  千葉峻太朗, 萩原陽介, 大野一樹, 本坊和也, 折田正弥, 関嶋政和
- 学会等名
  第55回日本熱帯医学会大会・第29回日本国際保健医療学会学術大会
- 発表場所
  国立国際医療研究センター
- 年月日
  2014-11-01 – 2014-11-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24240044
[学会発表] Development of a novel anti trypanosoma drug
- 著者名/発表者名
  R. Yoshino, N. Yasuo, Y. Hagiwara, K. Ohno, I. Namatame, M. Orita, M. Sekijima
- 学会等名
  CBI学会2014年大会
- 発表場所
  タワーホール船堀
- 年月日
  2014-10-28 – 2014-10-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25870222

1. 秋山泰 (30243091)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 9件
2. 平山謙二 (60189868)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
3. 篠崎隆宏 (80447903)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 11件
4. 篠田浩一 (10343097)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 瀬々潤 (40361539)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 稲岡健ダニエル (10623803)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
7. 庄司満 (30339139)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 樺島祥介 (80260652)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 北潔

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
10. 五十嵐学

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
11. 千見寺浄慈

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
12. 林晋一郎

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
13. 河野隆志

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
14. 志波智生

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
15. 中山亮

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
16. 吉野龍ノ介

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

関嶋 政和 Sekijima Masakazu

研究課題

研究成果

共同研究者

多層SKIPコネクションを導入した条件付きVAEによる高精度な化合物生成手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

in silicoとロボットによる創薬支援システムの開発とシャーガス病治療薬探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

in silicoとin vitroの融合によるトリパノソーマ原虫治療薬探索研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

熱帯病治療薬開発に向けた新薬開発高度化研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

複数分子を標的とした新薬設計手法の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

グラフィカルモデルを用いた高分子ポテンシャルデコーダの開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

自由エネルギー地形解析による異常プリオンタンパク質のフォールディング原理の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] PRA-Pred: Structure-based prediction of protein-RNA binding affinity2024

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Gargoyles: An Open Source Graph-Based Molecular Optimization Method Based on Deep Reinforcement Learning2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Enhancing the Performance of AlphaFold Through Modified Storage Method and Optimization of HHblits on TSUBAME3.0 Supercomputer2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Discovery of a Hidden Trypanosoma cruzi Spermidine Synthase Binding Site and Inhibitors through In Silico, In Vitro, and X-ray Crystallography2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Predicting Chemical Reaction Product by Graph Transformer2023

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] Statistical potentials for RNA-protein interactions optimized by CMA-ES2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] An Improved Model for Predicting Compound Retrosynthesizability Using Machine Learning2022

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

関嶋政和 Sekijima Masakazu

[雑誌論文] Multidimensional analyses of the pathomechanism caused by the non-catalytic GNE variant, c.620A>T, in patients with GNE myopathy2022