大田佳宏 Ota Yoshihiro

研究者番号	80436592
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 大学院数理科学研究科, 客員教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2016年度 – 2017年度: 東京大学, 大学院数理科学研究科, 特任教授 2014年度 – 2015年度: 東京大学, 数理(科)学研究科(研究院), 特任教授 2013年度: 東京大学, 数理(科)学研究科(研究院), 特任准教授 2011年度 – 2012年度: 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任助教 2010年度 – 2012年度: 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任研究員 2007年度 – 2008年度: 東京大学, 先端科学技術研究センター, 特任研究員 2007年度: 東京大学, 先端科学技術研究センター, リサーチフェロー
審査区分/研究分野	研究代表者生体生命情報学 / 生命・健康・医療情報学研究代表者以外システムゲノム科学 / ゲノム生物学 / 生物分子科学 / 応用ゲノム科学
キーワード	研究代表者シミュレーション / 転写 / 超離散系 / 遺伝子 / セルオートマトン / 時空間解析 / ダイナミクス / 時空間 / 位相幾何学 / 数理モデル … もっと見る / 離散系 / 遺伝子転写 / 配列解析 / 超離散 / バイオインフォマティクス / RNA / RNAPII / ネットワーク / パスウェイ / テキストマイニング / シグネチャ / ハブ遺伝子 / シグネチャパスウェイ / シグネチャ解析 / マルチプルエッジ … もっと見る研究代表者以外ヒストン修飾 / プロテオミクス / シミュレーション / ゲノム科学 / 散逸構造 / 転写過程 / モデル化 / RNAポリメレース / エピゲノム / 炎症 / RNAポリメレースII / 転写 / 内皮細胞 / TNFα / RNA ポリメレース / モノクローナル抗体 / RNAプロセッシング / 核タンパク質 / 軟X線顕微鏡 / 核内受容体 / 軟Ｘ線顕微鏡 / 生体イメージング / 核微細構造 / クロマチン修飾 / 核小体 / 核スペックル / 細胞周期 / 転写調節 / スプライシング / 複合体解析 / 膜タンパク質複合体 / 転写複合体 / リン酸化隠す

位相幾何と超離散の融合によるシングルセルの遺伝子転写運動の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  大田佳宏
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  東京大学
超離散時空間解析と大規模配列解析の融合による遺伝子転写原理の解明研究代表者
- 研究代表者
  
  大田佳宏
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  東京大学
転写ファクトリーの熱力学と情報処理の研究
- 研究代表者
  
  井原茂男
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2012
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
炎症刺激で駆動する転写の波における転写ファクトリーとエピゲノム修飾相互作用の解析
- 研究代表者
  
  和田洋一郎
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  ゲノム生物学
- 研究機関
  東京大学
転写のダイナミクス解析と高精度シミュレーションに関する研究研究代表者
- 研究代表者
  
  大田佳宏
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2011
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  東京大学
転写マシナリーと核内微細構造のダイナミックプロテオミクス
- 研究代表者
  
  浜窪隆雄
- 研究期間 (年度)
  2008 – 2012
- 研究種目
  
  基盤研究(S)
- 研究分野
  
  生物分子科学
- 研究機関
  東京大学
リン酸化シグナルパスウェイ解析
- 研究代表者
  
  井原茂男
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  応用ゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
マルチプルエッジを用いたシグネチャ解析によるパスウェイ変動予測研究代表者
- 研究代表者
  
  大田佳宏
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2008
- 研究種目
  
  若手研究(スタートアップ)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  東京大学

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すべて雑誌論文学会発表

[雑誌論文] Direct Evidence for Pitavastatin Induced Chromatin Structure Change in the KLF4 Gene in Endothelial Cells.2014
- 著者名/発表者名
  Maejima T, Inoue T, Kanki Y, Kohro T, Li G, Ohta Y, Kimura H, Kobayashi M, Taguchi A, Tsutsumi S, Iwanari H, Yamamoto S, Aruga H, Dong S, Stevens JF, Poh HM, Yamamoto K, Kawamura T, Mimura I,
- 雑誌名
  
  PLoS One.
  
  巻: 9 号: 5 ページ: e96005-e96005
- DOI
  10.1371/journal.pone.0096005
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J08634, KAKENHI-PROJECT-22229009, KAKENHI-PROJECT-24500360, KAKENHI-PLANNED-25116005, KAKENHI-PUBLICLY-25118505, KAKENHI-PUBLICLY-25125707, KAKENHI-PROJECT-25670035, KAKENHI-PROJECT-25670619, KAKENHI-PROJECT-26250041, KAKENHI-PROJECT-26290035, KAKENHI-PROJECT-26430121, KAKENHI-PROJECT-26560395, KAKENHI-PROJECT-26640069, KAKENHI-PROJECT-26670397, KAKENHI-PROJECT-26710013, KAKENHI-PROJECT-26860627, KAKENHI-PUBLICLY-26116708
[雑誌論文] 真核生物の転写機構の数理解析2014
- 著者名/発表者名
  井原茂男, 大田佳宏
- 雑誌名
  
  「生体の科学」(医学書院)
  
  巻: Vol.65, No.5 ページ: 458-459
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360
[雑誌論文] 遺伝子転写機構の時空間シミュレーション2014
- 著者名/発表者名
  大田佳宏, 井原茂男
- 雑誌名
  
  「生体の科学」(医学書院)
  
  巻: Vol.65, No.5 ページ: 458-459
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360
[雑誌論文] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2013
- 著者名/発表者名
  Ohta Y and Ihara S
- 雑誌名
  
  RIMS Kokyuroku Bessatsu
  
  巻: 未定
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360
[雑誌論文] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2013
- 著者名/発表者名
  Yoshihiro Ohta and Sigeo Ihara
- 雑誌名
  
  Publications of the Research Institute for Mathematical Sciences
  
  巻: in press
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651201
[雑誌論文] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2013
- 著者名/発表者名
  Yoshihiro Ohta and Sigeo Ihara
- 雑誌名
  
  RIMS Kokyuroku Bessatsu
  
  巻: B41 ページ: 101-124
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360
[雑誌論文] A path preference cellular-automaton model for traffic flow through transit points and its application to the transcription process in biology2012
- 著者名/発表者名
  Yoshihiro Ohta, Akinobu Nishiyama, Yoichiro Wada, Yijun Ruan, Tatsuhiko Kodama, Takashi Tsuboi, Tetsuji Tokihiro and Sigeo Ihara
- 雑誌名
  
  Phys. Rev. E
  
  巻: 86 号: 2 ページ: 021918-021918
- DOI
  10.1103/physreve.86.021918
- URL
  http://link.aps.org/doi/10.1103/PhysRevE.86.021918
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21340034, KAKENHI-PROJECT-22310117, KAKENHI-PROJECT-23540071, KAKENHI-PROJECT-23651201, KAKENHI-PROJECT-24224002, KAKENHI-PROJECT-24500360
[雑誌論文] Path-preference cellular-automaton model for traffic flow through transit points and its application to the transcription process in human cells.2012
- 著者名/発表者名
  Ohta Y, Nishiyama A, Wada Y, Ruan Y, Kodama T, Tsuboi T, Tokihiro T, Ihara S.
- 雑誌名
  
  Phys Rev E Stat Nonlin Soft Matter Phys
  
  巻: 86 ページ: 21918-21918
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310117
[雑誌論文] Cellular-automaton model of the cooperative dynamics of RNA polymerase II during transcription in human cells.2011
- 著者名/発表者名
  Ohta Y, et al.
- 雑誌名
  
  Physical Review E
  
  巻: 84 号: 4 ページ: 15-15
- DOI
  10.1103/physreve.84.041922
- URL
  http://link.aps.org/doi/10.1103/PhysRevE.84.041922
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310117, KAKENHI-PROJECT-22700309, KAKENHI-PROJECT-23651201
[雑誌論文] Cellular-automaton model of the cooperative dynamics of RNA polymerase II during transcription in human cells2011
- 著者名/発表者名
  Ohta Y, Kodama T, Ihara S
- 雑誌名
  
  Phys. Rev. E (Stat. Nonlin. Soft Matter Phys.）
  
  巻: ８４
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651201
[雑誌論文] Sev ere dermatitis with loss of epidermal Langerh ans cells in human and mouse zinc deficiency.2011
- 著者名/発表者名
  Kawamura T, Ohta Y, et al.
- 雑誌名
  
  The Journal of Clinical Investigation
  
  巻: 84 号: 2 ページ: 722-732
- DOI
  10.1172/jci58618
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310117, KAKENHI-PROJECT-22700309, KAKENHI-PROJECT-23390282, KAKENHI-PROJECT-23591641, KAKENHI-PROJECT-24500360, KAKENHI-PROJECT-24659529
[雑誌論文] Epigenetically coordinated GATA2 binding is necessary for endothelium specific endomucin sxpression2011
- 著者名/発表者名
  Kanki Y, Kohro T, Jiang S, Tsutsumi S, Mimura I, Suehiro J, Wada Y, Ohta Y, Ihara S, Iwanari H, Naito M, Hamakubo T, Aburatani H, Kodama T, Minami T.
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal in press
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[雑誌論文] Epigenetically coordinated GATAT2 binding is necessary for endothelium-specific endomucin expression2011
- 著者名/発表者名
  Kanki Y, Kohro T, Jiang S, Tsutsumi S, Mimura I, Suehiro J, Wada Y, Ohta Y, Ihara S, Iwanari H, Naito M, Hamakubo T, Aburatani H, Kodama T, Minami T
- 雑誌名
  
  EMBO J
  
  巻: 30 号: 13 ページ: 2582-95
- DOI
  10.1038/emboj.2011.173
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-10J02514, KAKENHI-PROJECT-20221009, KAKENHI-PROJECT-20221010, KAKENHI-ORGANIZER-22112001, KAKENHI-PROJECT-22310117, KAKENHI-PROJECT-22700309, KAKENHI-PROJECT-22700875, KAKENHI-PUBLICLY-23125503, KAKENHI-PROJECT-23659050
[雑誌論文] Proteomic analysis of native hepatocyte nuclear factor-4a(HNF4a)isoforms, phosphorylation status, and nteractive cofactors2011
- 著者名/発表者名
  Daigo_K, Kawamura T, Ohta Y, Ohashi R, Katayose S, Tanaka T, Aburatani H, Naito M, Kodama T, Ihara S, Hamakubo T.
- 雑誌名
  
  J Biol Chem. 286(1)
  
  ページ: 674-686
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[雑誌論文] Proteomic analysis of native hepatocyte nuclear factor-4alpha (HNF4alpha) isoforms, phosphorylation status, and interactive cofactors.2011
- 著者名/発表者名
  Daigo, K, Kawamura T, Ohta Y, et al.
- 雑誌名
  
  The Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 286 ページ: 674-686
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310117
[雑誌論文] Proteomic analysis of native hepatocyte nuclear factor-4α (HNF4α) isoforms, phosphorylation status, and interactive cofactors2011
- 著者名/発表者名
  Daigo K, Kawamura T, Ohta Y, Ohashi R, Katayose S, Tanaka T, Aburatani H, Naito M, Kodama T, Ihara S, Hamakubo T
- 雑誌名
  
  J Biol Chem
  
  巻: 286(1) 号: 1 ページ: 674-686
- DOI
  10.1074/jbc.m110.154732
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010, KAKENHI-PROJECT-22590331, KAKENHI-PROJECT-22700309
[雑誌論文] Epigenetically coordinated GATA2binding is necessary for endothelium specific endomucin sxpression2011
- 著者名/発表者名
  Kanki Y, Kohro T, Jiang S, Tsutsumi S, Mimura I, Suehiro J, Wada Y, Ohta Y, Ihara S, Iwanari H, Naito M, Hamakubo T, Aburatani H, Kodama T, Minami T.
- 雑誌名
  
  The EMBO Journal
  
  巻: in press(掲載確定)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[雑誌論文] Active RNA Polymerases : Mobile or Immobile Molecular Machines.2010
- 著者名/発表者名
  Papantonis A, Larkin JD, Wada Y.Ohta Y, Ihara S, Kodama T, Cook PR
- 雑誌名
  
  PLoS Biology
  
  巻: Issue 7
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[雑誌論文] Active RNA polymerases2010
- 著者名/発表者名
  Papantonis, A., Larkin, J. D., Wada, Y., Ohta, Y., Ihara, S., Kodama, T., and Cook, P. R.
- 雑誌名
  
  mobile or immobile molecular machines PLoS biology 8
  
  巻: e1000419.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310117
[雑誌論文] Active RNA Polymerases : Mobile or Immobile Molecular Machines?2010
- 著者名/発表者名
  Papantonis A, Larkin JD, Wada Y, Ohta Y, Ihara S, Kodama T, Cook PR
- 雑誌名
  
  PLoS Biology
  
  巻: Volume8, Issue7 号: 7 ページ: e1000419-e1000419
- DOI
  10.1371/journal.pbio.1000419
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700309
[雑誌論文] A wave of nascent transcription on activated human genes.2009
- 著者名/発表者名
  Wada Y, Ohta Y, Hamakubo T, Shirahige K, Aburatani H, Kodama T, Cook PR, Ihara S., et al.
- 雑誌名
  
  Proc Natl Acad Sci USA. Oct 27 ; 106(43)
  
  ページ: 18357-61
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[雑誌論文] A wave of nascent transcription on activated human genes2009
- 著者名/発表者名
  Wada Y, Ohta Y, Xu M, Tsutsumi S, Minami T, Inoue K, Komura D, Kitakami J, Oshida N, Papantonis A, Izumi A, Kobayashi M, Meguro H, Kanki Y, Mimura I, Yamamoto K, Mataki C, Hamakubo T, Shirahige K, Aburatani H, Kimura H, Kodama T, Cook PR, Ihara S
- 雑誌名
  
  Proc Natl Acad Sci U S A
  
  巻: 106(43) 号: 43 ページ: 18357-18361
- DOI
  10.1073/pnas.0902573106
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[雑誌論文] A wave of nascent transcription on activated human genes.2009
- 著者名/発表者名
  Wada Y, Ohta Y, Xu M, Tsutsumi S, Minami T, Inoue K, Komura D, Kitakami J, Oshida N, Papantonis A, Izumi A, Kobayashi M, Meguro H, Kanki Y, Mimura I, Yamamoto K, Mataki C, Hamakubos T, Shirahige K, Aburatani H, Kimura H, Kodama T, Cook PR, Ihara S.
- 雑誌名
  
  Proc Natl Acad Sci USA 106(43)
  
  ページ: 18357-18361
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[雑誌論文] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription
- 著者名/発表者名
  Yoshihiro Ohta and Sigeo Ihara
- 雑誌名
  
  Publications of the Research Institute for Mathematical Sciences (Supplement)
  
  巻: (in press)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651201
[学会発表] AI Smart Robot Network for Biomedical Analysis2017
- 著者名/発表者名
  Yoshihiro Ohta
- 学会等名
  AI in Asia
- 発表場所
  早稲田大学国際会議場井深大記念ホール
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00397
[学会発表] Dynamic Approaches to Living System in Cell Biology2016
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  第68 回日本細胞生物学会大会　細胞生物学の生命動態研究シンポジウム
- 発表場所
  京都テルサ大会議室
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00397
[学会発表] Cellular-automaton model of the cooperative dynamics of RNA polymerase II during the transcription process in human cells2015
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  文部科学省科学技術試験研究委託事業「数学・数理科学と諸科学・産業との協働によるイノベーション創出のための研究促進プログラム」生命ダイナミクスの数理とその応用
- 発表場所
  東京大学大学院数理科学研究科大講堂
- 年月日
  2015-12-11
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00397
[学会発表] Ultradiscrete Modeling of Pol II dynamics for gene transcription2015
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  BMB2015 第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会合同大会
- 発表場所
  神戸商工会議所3階神商ホールB（第27会場）
- 年月日
  2015-12-03
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00397
[学会発表] 遺伝子の転写機構解明のための数理モデル2015
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  Seminar on Mathematics for various disciplines (諸分野のための数学研究会)
- 発表場所
  東京大学大学院数理科学研究科
- 年月日
  2015-01-27
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360
[学会発表] 転写過程の超離散モデリングとシミュレーション2012
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  京都大学数理解析研究所研究集会
- 発表場所
  京都大学益川ホール
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310117
[学会発表] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2012
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  数理解析研究所共同研究集会「非線形離散可積分系の拡がり」
- 発表場所
  京都大学益川ホール(京都府）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651201
[学会発表] Proteomic analysis of circulating pentraxin3 (PTX3) complexes in sepsis revealed the PTX3-NETs complex formation: Implication of new protectiveroles against sepsis2012
- 著者名/発表者名
  Kenji Daigo, Naotaka Yamaguchi, Takeshi Kawamura, Koichi Matsubara,Shuying Jiang, Riuko Ohashi, Yukio Sudou, Makoto Naito, Kenji Inoue, and Takao Hamakubo
- 学会等名
  9th International Conference on Innate Immunity
- 発表場所
  ギリシャ
- 年月日
  2012-06-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[学会発表] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2012
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  数理解析研究所共同研究集会「非線形離散可積分系の拡がり」
- 発表場所
  京都大学益川ホール (京都府) (招待講演)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23651201
[学会発表] 転写過程の超離散モデリングとシミュレーション2012
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  京都大学数理解析研究所研究集会
- 発表場所
  京都大学　益川ホール（京都府）
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360
[学会発表] High Density Spatial and Temporal Simulation Reveals Transcriptional Dynamics2011
- 著者名/発表者名
  Ohta, Yoshihiro
- 学会等名
  The Pacific Symposium on Biocomputing(PSB) 2011
- 発表場所
  Kona, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700309
[学会発表] High Density Spatial and Temporal Simulation Reveals Transcriptional Dynamics2011
- 著者名/発表者名
  大田佳宏、Yoshihiro
- 学会等名
  The Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2011
- 発表場所
  Kona, USA.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310117
[学会発表] High Density Spatial and Temporal Simulation Reveals Transcriptional Dynamics2011
- 著者名/発表者名
  Ohta, Yoshihiro
- 学会等名
  The Pacific Symposium on Biocomputing (PSB) 2011
- 発表場所
  Kona, USA.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22700309
[学会発表] High Density Spatial and Temporal Simulation Reveals Transcription Dynamics2011
- 著者名/発表者名
  Ohta Y, Wada Y, Kodama T, Ihara S
- 学会等名
  Pacific Symposium on Biocomputing
- 発表場所
  Hawaii/U.S
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[学会発表] Genome-wide Analysis of PPARd/RXRa Heterodimer Reveals Antiinflammatory Action of PPARd Ligand in Macrophages.2010
- 著者名/発表者名
  Tanaka T, Ohta Y, Ihara S, kobama T, et al.
- 学会等名
  Keystone Symposia
- 発表場所
  Keystone, Colorado, USA,
- 年月日
  2010-03-24
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20221010
[学会発表] MultipleSnapshots Obtained Using Genomic TilingArrays Reveal the Dynamics ofTranscription in Human UmbilicalEndothelial Cells2008
- 著者名/発表者名
  Tatsuhiko Kodama, Yoshihiro Ohta, MengXu, Takashi Minami1, Youichiro Wada, Shu-ichi Tsutsumi, Shumpei Ishikawa,Takao HamakuboHiroyuki Aburatani, PeterR Cook, and Sigeo Ihara
- 発表場所
  SydneyAustralia
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19800009
[学会発表] Multiple Snapshots Obtained Using Genomic Tiling Arrays Reveal the Dynamics of Transcription in Human Umbilical2008
- 著者名/発表者名
  Tatsuhiko Kodama, Yoshihiro Ohta, Meng Xu, Takashi Minami, Youichiro Wada, Shu-ichi Tsutsumi, Shumpei Ishikawa, Takao Hamakubo, Hiroyuki Aburatani, Peter R Cook, and Sigeo Ihara
- 学会等名
  Endothelial Cells
- 発表場所
  Sydney, Australia
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310129
[学会発表] Packet traffic analysis of interactome networks2007
- 著者名/発表者名
  Nobuhiko Oshida, Naoko S. Nishikawa, Yoshihiro Ohta, Rikako Suzuki, and Sigeo Ihara
- 学会等名
  The Conference on Interactome Networks, Welcome Trust
- 発表場所
  UK
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310129
[学会発表] HIGH-RESOLUTION TARGETED PROTEOMICS OF ENDOGENOUS NUCLEAR RECEPTOR COMPLEX USING HIGH-QUALITY IMMUNOMAGNETIC BEADS2007
- 著者名/発表者名
  Kenji Daigo, Takeshi Kawamura, Satoshi Katayose, Toshiya Tanaka, Yoshihiro Ohta Sieo Ihara
- 学会等名
  Cold spring Harvar Meeting, Mecharlisms of eukaryotic transcription
- 発表場所
  Cold spring Harvar,NY,US
- 年月日
  2007-08-30
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310129
[学会発表] Packet traffic analysis of interactome networks.The Conference on Interactome Networks2007
- 著者名/発表者名
  Nobuhiko Oshida, Naoko S.Nishikawa, Yoshihiro Ohta, Rikako Suzuki and Sieo Ihara
- 学会等名
  Welcome Trust/Coldspring Harvar Meeting Interactome Network
- 発表場所
  Welcome Trust, Hinxton,UK
- 年月日
  2007-08-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310129
[学会発表] High-resolution targeted proteomics of endogenousnuclear receptor comprex using high-quality immunomagnetic beads2007
- 著者名/発表者名
  Kenji Daigo, Takeshi Kawamura, Satoshi Katayose, Yoshihiro Ohta,Toshiya Tanaka, Sigeo Ihara, Tatsuhiko Kodama, Takao Hamakubo
- 学会等名
  Cold Spring Harbor Laboratory Mechanisms of Eukaryotic Transcription meeting
- 発表場所
  Cold Spring Harbor, NY
- 年月日
  2007-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310129
[学会発表] Robustness of the protein interaction networks2007
- 著者名/発表者名
  Nobuhiko Oshida, Jun-ichi Kitakami, Naoko S. Nishikawa, Yoshihiro Ohta, and Sieo Ihara
- 学会等名
  The 7th international workshop on advanced genomics
- 発表場所
  Tokyo
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310129
[学会発表] Robustness of the protein interaction network.2007
- 著者名/発表者名
  Nobuhiko Oshida, Jun-ichi Kitakami, Naoko S. Nishikawa, Yoshihiro Ohta, and Sigeo Ihara and Sigeo Ihara
- 学会等名
  The 7th international workshop on advanced genomics.
- 発表場所
  Tokyo, Japan.
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19800009
[学会発表] Robustness of the protein interaction network2007
- 著者名/発表者名
  Nobuhiko Oshida, Jun-ichi Kitakami, Naoko S. Nishikawa, Yoshihiro Ohta, and Sigeo Ihara
- 学会等名
  The 7th international workshop on advanced genomics
- 発表場所
  Tokyo, Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19310129
[学会発表] High-resolution targetedproteomics of endogenousnuclear receptorcomprex using high-quality immunomagneticbeads2007
- 著者名/発表者名
  Kenji Daigo, Takeshi Kawamura, SatoshiKatayose, Yoshihiro Ohta, Toshiya Tanaka, Sigeo Ihara, Tatsuhiko Kodama, TakaoHamakubo
- 学会等名
  Cold Spring Harbor LaboratoryMechanisms of Eukaryotic Transcriptionmeeting
- 発表場所
  cold Spring Harbor, NY.
- 年月日
  2007-08-31
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19800009
[学会発表] Robustness of the proteininteraction network2007
- 著者名/発表者名
  Nobuhiko Oshida, Jun-ichi Kitakami, Naoko S. Nishikawa, Yoshihiro Ohta, and Sigeo Ihara
- 学会等名
  The 7thinternational workshop on advancedgenomics
- 発表場所
  Tokyo, Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19800009
[学会発表] 転写機構解明のための数理モデルとシミュレーション
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  日本数学会（2014年度年会）
- 発表場所
  学習院大学
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360
[学会発表] 転写機構解明のための時空間数理モデル
- 著者名/発表者名
  大田佳宏
- 学会等名
  生命動態システム科学四拠点・CREST・PRESTO合同シンポジウム「生命動態の分子メカニズムと数理」
- 発表場所
  京都大学芝蘭会館稲盛ホール
- 年月日
  2015-03-16 – 2015-03-17
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24500360

1. 井原茂男 (30345136)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 24件
2. 浜窪隆雄 (90198797)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 10件
3. 川村猛 (70306835)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 5件
4. 内藤眞 (30045786)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
5. 三好元介 (40345137)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
6. 望月康弘 (80282523)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
7. 岩成宏子 (20176556)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
8. 先浜俊子 (70187061)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 太期健二 (20466866)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
10. 堀内恵子 (00456203)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
11. 大橋瑠子 (20447600)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
12. 和田洋一郎 (10322033)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
13. 神吉康晴 (00534869)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 興梠貴英 (40401046)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 南敬 (00345141)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 時弘哲治

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
17. 南敬

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

大田 佳宏 Ota Yoshihiro

研究課題

研究成果

共同研究者

位相幾何と超離散の融合によるシングルセルの遺伝子転写運動の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

超離散時空間解析と大規模配列解析の融合による遺伝子転写原理の解明研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写ファクトリーの熱力学と情報処理の研究

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

炎症刺激で駆動する転写の波における転写ファクトリーとエピゲノム修飾相互作用の解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写のダイナミクス解析と高精度シミュレーションに関する研究研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

転写マシナリーと核内微細構造のダイナミックプロテオミクス

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

リン酸化シグナルパスウェイ解析

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

マルチプルエッジを用いたシグネチャ解析によるパスウェイ変動予測研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

[雑誌論文] Direct Evidence for Pitavastatin Induced Chromatin Structure Change in the KLF4 Gene in Endothelial Cells.2014

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 真核生物の転写機構の数理解析2014

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] 遺伝子転写機構の時空間シミュレーション2014

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2013

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2013

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Ultradiscrete Modeling and Simulation for Gene Transcription2013

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] A path preference cellular-automaton model for traffic flow through transit points and its application to the transcription process in biology2012

著者名/発表者名

雑誌名

大田佳宏 Ota Yoshihiro