藤原豊史 Fujiwara Toyofumi

研究者番号	80815176
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2023年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任准教授 2019年度 – 2023年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任助教 2018年度: 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等), データサイエンス共同利用基盤施設, 特任研究員
審査区分/研究分野	研究代表者小区分90130:医用システム関連研究代表者以外小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
キーワード	研究代表者症例情報共有・統合 / 症例情報統合化技術 / 症例情報国際共有 / Phenopackets / CaseSharing / 希少・遺伝性疾患 / 症例情報管理システム研究代表者以外オントロジー / 日本語自然言語処理 / 日本語症例報告 … もっと見る / 疾患名抽出 / 日本語PDFからの情報抽出 / 情報統合 / データベース / セマンティック・ウェブ / データ統合 / コホート / ゲノムグラフ / 日本人ゲノム隠す

国際共有を前提とした症例情報統合化技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  藤原豊史
- 研究期間 (年度)
  2023 – 2025
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分90130:医用システム関連
- 研究機関
  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等)
日本語の症例報告への自動アノテーション技術の開発
- 研究代表者
  
  山本泰智
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等)
日本人のゲノム・健康・診療情報と公共知識ベースのセマンティック統合システムの開発
- 研究代表者
  
  片山俊明
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  大学共同利用機関法人情報・システム研究機構(機構本部施設等)

すべて 2024 2023 2022 2021 2020 2019 2018 その他

すべて雑誌論文学会発表図書その他

[図書] 希少疾患の診断に総力戦で取り組む2024
- 著者名/発表者名
  藤原豊史, 土肥栄佑
- 総ページ数
  4
- 出版者
  羊土社
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[図書] 月刊「細胞」研究から医療までの網羅的な希少疾患関連知識の集約/共有プラットフォーム2021
- 著者名/発表者名
  仁宮洸太、櫛田達矢、高月照江、菊池敦生、藤原豊史
- 総ページ数
  5
- 出版者
  北隆館
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[雑誌論文] Gene Ranking based on Paths from Phenotypes to Genes on Knowledge Graph2021
- 著者名/発表者名
  Yamaguchi Atsuko、Shin Jae-Moon、Fujiwara Toyofumi
- 雑誌名
  
  The 10th International Joint Conference on Knowledge Graphs
  
  巻: - ページ: 131-134
- DOI
  10.1145/3502223.3502240
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545, KAKENHI-PROJECT-21K12148
[雑誌論文] オントロジーを用いた希少・遺伝性疾患診断支援 (特集人工知能技術の医療応用)2020
- 著者名/発表者名
  藤原豊史, 仁宮洸太
- 雑誌名
  
  人工知能学会誌
  
  巻: 35 ページ: 480-486
- オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[雑誌論文] Open Agile text mining for bioinformatics: the PubAnnotation ecosystem2019
- 著者名/発表者名
  Kim Jin-Dong、Wang Yue、Fujiwara Toyofumi、Okuda Shujiro、Callahan Tiffany J、Cohen K Bretonnel
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 35 号: 21 ページ: 4372-4380
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btz227
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[雑誌論文] 難病関連データベースの活用2019
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 雑誌名
  
  Precision Medicine
  
  巻: 2 ページ: 18-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[雑誌論文] PubCaseFinder: A Case-Report-Based, Phenotype-Driven Differential-Diagnosis System for Rare Diseases2018
- 著者名/発表者名
  Fujiwara Toyofumi、Yamamoto Yasunori、Kim Jin-Dong、Buske Orion、Takagi Toshihisa
- 雑誌名
  
  The American Journal of Human Genetics
  
  巻: 103 号: 3 ページ: 389-399
- DOI
  10.1016/j.ajhg.2018.08.003
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] Development of a case database including atypical cases with emphasis on symptoms and findings using generative AI.2024
- 著者名/発表者名
  Dohi E、Hayakawa I、Matsubara T、Fujiwara T、Yamamoto Y
- 学会等名
  第4回 ROIS-DS成果報告会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] 症状・所見のアノテーションにおけるオントロジーの問題. 日本語言語資源の構築と利用性の向上2024
- 著者名/発表者名
  土肥栄祐、高月照江、建石由佳、藤原豊史、山本泰智
- 学会等名
  第30回言語処理学会 (2024.3.11-15. ライトニングトーク)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] Linking NANDO/MONDO to J-Stage Case Reports.2024
- 著者名/発表者名
  Yuka tateisi, Yasunori Yamamoto, Toyofumi Fujiwara, Eisuke Dohi.
- 学会等名
  Biomedical Linked Annotation Hackathon
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] Linking NANDO/MONDO to J-Stage Case Reports2024
- 著者名/発表者名
  Yuka tateisi, Yasunori Yamamoto, Toyofumi Fujiwara, Eisuke Dohi
- 学会等名
  Biomedical Linked Annotation Hackathon (BLAH8)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] 症状・所見のアノテーションにおけるオントロジーの問題2024
- 著者名/発表者名
  土肥栄祐、高月照江、建石由佳、藤原豊史、山本泰智.
- 学会等名
  第30回言語処理学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] Building of the Nanbyo Disease Ontology (NANDO) and portal site for intractable disease information(NanbyoData)2023
- 著者名/発表者名
  高月照江，藤原豊史
- 学会等名
  IIBMP
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] 困った時に使える難病・希少疾患検索WEBツール　ーPubCaseFinder とその実演ー2023
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  第26回日本病院総合診療医学会学術総会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] PubCaseFinderを使用した難病診断戦略と、みんなで症例登録システムを活用して症例コーパスを育てよう2023
- 著者名/発表者名
  ○土肥栄祐建石由佳山本泰智藤原豊史
- 学会等名
  第26回日本病院総合診療医学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] PubCaseFinder CaseSharing: A management system for case information on rare diseases2023
- 著者名/発表者名
  Toyofumi Fujiwara, Jae-Moon Shin, Atsuko Yamaguchi and Atsuo Kikuchi
- 学会等名
  ESHG Conference
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] PubCaseFinder: 希少・遺伝性疾患に特化した症例情報管理システムの開発2023
- 著者名/発表者名
  藤原豊史、申在紋、山口敦子、菊池敦生
- 学会等名
  第30回日本遺伝子診療学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] How to visualize the Phenotype Diversity. A Report with Alexander’s disease case reports2023
- 著者名/発表者名
  Eisuke Dohi, Yuka Tateishi, Jae-Moon Shin, Shinichiro Tago, Toyofumi Fujiwara, Yasunori Yamamoto
- 学会等名
  Human Genetics Asia
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] アレキサンダー病症例報告からの、症状多様性の可視化2023
- 著者名/発表者名
  土肥栄祐、建石由佳、申在紋、藤原豊史、山本泰智
- 学会等名
  第64回日本神経学会学術大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] The issues of each database and ontology from the viewpoints of clinicians2023
- 著者名/発表者名
  Eisuke Dohi, Yuka Tateishi, Jae-Moon Shin, Toyofumi Fujiwara, Yasunori Yamamoto
- 学会等名
  Human Genetics Asia
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] 難病・希少疾患検索システムのための言語資源データ作成：症例報告を用いたコーパス作成2023
- 著者名/発表者名
  土肥栄祐、建石由佳、藤原豊史、山本泰智
- 学会等名
  第11回日本難病医療ネットワーク学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] アレキサンダー病症例報告からの、症状多様性の可視化2023
- 著者名/発表者名
  土肥栄祐、建石由佳、申在紋、藤原豊史、山本泰智
- 学会等名
  第64回日本神経学会学術大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] CaseSharing: A case information management system in PubCaseFinder suitable for sharing rare disease cases2023
- 著者名/発表者名
  Toyofumi Fujiwara, Eisuke Dohi, Jae-Moon Shin, Yuka Tateishi, Yasunori Yamamoto, Atsuko Yamaguchi, Atsuo Kikuchi.
- 学会等名
  Human Genetics Asia
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] How to visualize the Phenotype Diversity. A Report with Alexander’s disease case reports.2023
- 著者名/発表者名
  Eisuke Dohi, Yuka Tateishi, Jae-Moon Shin, Shinichiro Tago, Toyofumi Fujiwara, Yasunori Yamamoto.
- 学会等名
  Human Genetics Asia
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] The issues of each database and ontology from the viewpoints of clinicians.2023
- 著者名/発表者名
  Eisuke Dohi, Yuka Tateishi, Jae-Moon Shin, Toyofumi Fujiwara, Yasunori Yamamoto.
- 学会等名
  Human Genetics Asia
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] CaseSharing: A case information management system in PubCaseFinder suitable for sharing rare disease cases.2023
- 著者名/発表者名
  Toyofumi Fujiwara, Eisuke Dohi, Jae-Moon Shin, Yuka Tateishi, Yasunori Yamamoto, Atsuko Yamaguchi, Atsuo Kikuchi
- 学会等名
  Human Genetics Asia
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] PubCaseFinder: Advancements and Prospects in Rare and Genetic Disease Search Services2023
- 著者名/発表者名
  申在紋，藤原豊史
- 学会等名
  IIBMP
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] CaseSharing in PubCaseFinder: A case information management system suitable for sharing rare disease cases.2023
- 著者名/発表者名
  Toyofumi Fujiwara, Eisuke Dohi
- 学会等名
  Elixir team meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] アレキサンダー病症例報告からの、症状多様性の可視化2023
- 著者名/発表者名
  ○土肥栄祐建石由佳申在紋山本泰智藤原豊史
- 学会等名
  第26回日本病院総合診療医学会学術総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] 難病・希少疾患検索システムのための言語資源データ作成：症例報告を用いたコーパス作成2023
- 著者名/発表者名
  土肥栄祐、建石由佳、藤原豊史、山本泰智
- 学会等名
  第11回日本難病医療ネットワーク学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-23K11886
[学会発表] 難病・希少疾患の症例報告を用いたコーパス作成への道のり2023
- 著者名/発表者名
  ○土肥栄祐建石由佳山本泰智藤原豊史
- 学会等名
  言語処理学会第29回年次大会併設ワークショップ JLR2023
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] 誰でも使える難病・希少疾患検索WEBツール　ーPubCaseFinder とその実演ー2022
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  Rare Disease Medical Forum 2022
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12253
[学会発表] NANDO and NanbyoData: a disease ontology for Japanese rare and intractable diseases (Nanbyo) and a portal website for providing centralized access to the latest and diverse knowledge of Nanbyo2021
- 著者名/発表者名
  Ninomiya K, Kikuchi A, Takatsuki T, Kushida T, Yamamoto Y, Katayama T, Kawashima S, Soichi O, Fujiwara T
- 学会等名
  GA4GH 9th Plenary Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 日本の難病制度の対象疾患に関する国内外の情報を集積したNANDO,NanbyoDataの公開と応用2021
- 著者名/発表者名
  仁宮洸太, 高月照江, 櫛田達矢, 菊池敦生, 藤原豊史
- 学会等名
  日本人類遺伝学会第66回大会・第28回日本遺伝子診療学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] TogoID: データベース統合の基盤となるID変換サービス2021
- 著者名/発表者名
  池田秀也、千葉啓和、藤原豊史、原薗陛正、井手隆広、片山俊明、川島秀一、箕輪真理、三橋信孝、守屋勇樹、内藤雄樹、仲里猛留、信定知江、大田達郎、小野浩雅、申在紋、鈴木拓真、高月照江、建石由佳、豊岡理人、山本泰智、八塚茂
- 学会等名
  第44回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] オントロジーによる医療情報統合とその医療応用2020
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  第40回医療情報学連合大会・第21回日本医療情報学会学術大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 希少疾患診断支援システム精度向上のための新規計算手法の開発2020
- 著者名/発表者名
  藤原豊史, 山口敦子
- 学会等名
  日本人類遺伝学会第65回
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] Novel phenotype matching algorithm used to di!erential diagnosis for rare diseases in PubCaseFinder2020
- 著者名/発表者名
  T. Fujiwara, J. Shin, A Yamaguchi
- 学会等名
  ASHG 2020 Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 国際的な情報共有による難病・希少疾患の研究を促進するオントロジーの構築2020
- 著者名/発表者名
  仁宮洸太, 山田涼太, 高月照江, 藤原豊史
- 学会等名
  第27回日本遺伝子診療学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] PubCaseFinder / PhenoTouch2020
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  第2回希少疾患インフォマティクス DS-ROIS-JOINT共同研究集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] PubCaseFinder A diagnosis assistant system for rare diseases using disease-phenotype associations from published case reports.2020
- 著者名/発表者名
  Toyofumi Fujiwara
- 学会等名
  5th International Symposium on BioComplexity
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] TogoVar: integrated database among Japanese genomic variation databases2019
- 著者名/発表者名
  Licht Toyo-oka, Nobutaka Mitsuhashi, Minae Kawashima, Toyofumi Fujiwara, Toshiaki Katayama, Shuichi Kawashima, Yuka Tateisi, and Toshihisa Takagi
- 学会等名
  The American Society of Human Genetics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] データ共有を推進のためのNBDCヒトデータベースおよび日本人集団におけるアリル頻度情報統合データベース: TogoVar2019
- 著者名/発表者名
  豊岡理人、三橋信孝、川嶋実苗、建石由佳、藤原豊史、片山俊明、川島秀一、福田亜沙美、児玉悠一、高木利久
- 学会等名
  日本人類遺伝学会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 稀少・遺伝性疾患検索プラットフォームPubCaseFinder&PhenoTouchの開発2019
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  日本人類遺伝学会第64回大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 稀少・遺伝性疾患検索システムPubCaseFinderの研究開発と使い方について2019
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  第1回・東北大学未来型医療創成センターメディカルAIセミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 希少疾患研究を促進するデータの標準化とオープン化2018
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  第1回希少疾患インフォマティクス DS-ROIS-JOINT共同研究集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 希少疾患診断支援システムPubCaseFinderを支えるオントロジーとオープンデータ2018
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  第6回日本医療情報学会-医用知能情報学研究会:人工知能学会-医用人工知能研究会合同研究会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 希少疾患診断支援システムPubCaseFinderの社会実装を目指した取組み2018
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  トーゴーの日シンポジウム2018
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] 症例報告を活用した希少疾患診断支援システムPubCaseFinderの構築2018
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  日本人類遺伝学会第63回
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[学会発表] フェノタイプを利用したヒトゲノムバリアント評価システムの開発2018
- 著者名/発表者名
  藤原豊史
- 学会等名
  第25回日本遺伝子診療学会大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K11545
[]

1. 山本泰智 (50470076)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 18件
2. 土肥栄祐 (00719213)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 20件
3. 片山俊明 (60396869)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
4. 荻島創一 (40447496)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
5. 川島秀一 (50314274)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 4件
6. 建石由佳 (60439263)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 9件
7. 山口敦子 (10346108)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
8. 申在紋 (70854199)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 7件

藤原 豊史 Fujiwara Toyofumi

研究課題

研究成果

共同研究者

国際共有を前提とした症例情報統合化技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

日本語の症例報告への自動アノテーション技術の開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

日本人のゲノム・健康・診療情報と公共知識ベースのセマンティック統合システムの開発

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

[図書] 希少疾患の診断に総力戦で取り組む2024

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[図書] 月刊「細胞」研究から医療までの網羅的な希少疾患関連知識の集約/共有プラットフォーム2021

著者名/発表者名

総ページ数

出版者

データソース

[雑誌論文] Gene Ranking based on Paths from Phenotypes to Genes on Knowledge Graph2021

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] オントロジーを用いた希少・遺伝性疾患診断支援 (特集 人工知能技術の医療応用)2020

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] Open Agile text mining for bioinformatics: the PubAnnotation ecosystem2019

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[雑誌論文] 難病関連データベースの活用2019

著者名/発表者名

雑誌名

データソース

[雑誌論文] PubCaseFinder: A Case-Report-Based, Phenotype-Driven Differential-Diagnosis System for Rare Diseases2018

著者名/発表者名

雑誌名

DOI

データソース

[学会発表] Development of a case database including atypical cases with emphasis on symptoms and findings using generative AI.2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 症状・所見のアノテーションにおけるオントロジーの問題. 日本語言語資源の構築と利用性の向上2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Linking NANDO/MONDO to J-Stage Case Reports.2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Linking NANDO/MONDO to J-Stage Case Reports2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 症状・所見のアノテーションにおけるオントロジーの問題2024

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] Building of the Nanbyo Disease Ontology (NANDO) and portal site for intractable disease information(NanbyoData)2023

著者名/発表者名

学会等名

データソース

[学会発表] 困った時に使える難病・希少疾患検索WEBツール ーPubCaseFinder とその実演ー2023

藤原豊史 Fujiwara Toyofumi

[雑誌論文] オントロジーを用いた希少・遺伝性疾患診断支援 (特集人工知能技術の医療応用)2020

[学会発表] 困った時に使える難病・希少疾患検索WEBツール　ーPubCaseFinder とその実演ー2023