小林徹也 KOBAYASI TETSUYA

研究者番号	90513359
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 東京大学, 生産技術研究所, 教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2022年度 – 2025年度: 東京大学, 生産技術研究所, 教授 2023年度: 東京大学, 生産技術研究所, 准教授 2010年度 – 2021年度: 東京大学, 生産技術研究所, 准教授 2012年度: 東京大学, 生産技術研究所, 講師 2009年度 – 2010年度: 東京大学, 生産技術研究所, 講師
審査区分/研究分野	研究代表者学術変革領域研究区分(Ⅳ) / システムゲノム科学 / 小区分13010:数理物理および物性基礎関連 / 複合領域 / 小区分43060:システムゲノム科学関連 / 構成的システム生物学 / 理工系 / 生物系研究代表者以外複合領域 / 解剖学一般(含組織学・発生学) / 発生生物学 / 生物系
キーワード	研究代表者理論生物学 / 強化学習 / 定量生物学 / T細胞 / エントロピー正則化 / 最適制御 / 非平衡熱力学 / 自己複製 / 多様性 / 低次元化 … もっと見る / バイオインフォマティクス / レパトア / NGS / T細胞受容体 / 数理モデル / 生体生命情報学 / 数理工学 / 非平衡ダイナミクス / 点過程 / GENERIC / 一般化勾配流 / 迷路探索 / 平均場制御 / 自律分散 / 自己触媒 / 情報幾何 / 完全適応 / 部分観測制御 / 確率モデリング / 受容体応答 / 最適フィルター / Fisherの基本定理 / 化学走性 / 情報幾何学 / 非平衡化学熱力学 / 分散部分観測制御 / 生物物理学 / 化学熱力学 / 学習理論 / 適応現象 / 細胞系譜 / リボソーム / 細胞分裂 / 変分構造 / ゆらぎ定理 / 深層ネットワーク / 表現型進化 / 学習ダイナミクス / クローン分布 / 自然勾配 / T細胞レパトア / 深層強化学習 / クローン選択 / 生物物理 / GUI / 整数計画法 / 再生補助医療 / 核同定 / 隠れ状態 / 分岐過程 / 発生系譜 / 着床前杯 / 生殖補助医療 / 発生 / モデル化とシミュレーション / 深層学習 / トラッキング / 系譜解析 / 力学モデル / 4Dイメージング / 着床前胚 / 免疫学 / 微分方程式モデル / シーケンス解析 / T細胞受容体レパトア / 胸腺上皮細胞 / 胸腺 / 恒常性 / 論理演算 / 分子ネットワーク / ゆらぎ / ノイズ耐性 / LDA / 1細胞 / T細胞レセプター / 次世代シーケンサー / 複雑系 / 適応免疫 / 免疫レパトア / 免疫レパートリ / バイオイメージ / 哺乳類 / 時空間動態 / 初期発生 / バイオイメージインフォマティクス / 画像解析 / バイオイメージング / シミュレーション工学 / 細胞・組織 / 発生・分化 … もっと見る研究代表者以外ライブイメージング / ゼブラフィッシュ / 発生学・形態形成学 / 細胞極性 / 情報熱力学 / 非平衡統計力学 / 生物物理学 / 情報物理学 / 非線形システム / 代謝経路 / 遺伝子回路 / 合成生物学 / 並列シュミレーション / 並列シミュレーション / 複雑ネットワーク / 確率過程 / 非線形動力学 / 人工遺伝子回路 / 発生生物学 / 卵管 / マウス / 形態形成 / イメージング / 体節形成 / ニワトリ初期胚 / 細胞遊走 / 中胚葉 / ニワトリ胚 / 数理モデル / 初期胚 / 細胞 / 発生 / 哺乳類隠す

進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理領域代表者
- 領域代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2029
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2029
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅳ)
- 研究機関
  東京大学
進化情報アセンブリの統合理論と進化則の解読技術の構築研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2025 – 2029
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅳ)
- 研究機関
  東京大学
自己複製過程の熱力学の構築研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2026
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分13010:数理物理および物性基礎関連
- 研究機関
  東京大学
原生知能のための最適性理論の構築と応用研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅳ)
- 研究機関
  東京大学
複雑ダイナミクスを内包しうる計算原理理論の構築と応用研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2024 – 2025
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(A)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅳ)
- 研究機関
  東京大学
細胞複製能の階層横断的理解研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分43060:システムゲノム科学関連
- 研究機関
  東京大学
情報物理学でひもとく生命の秩序と設計原理
- 研究代表者
  
  岡田康志
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2023
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京大学
適応過程の情報物理学的理解研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2023
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京大学
深層ネットワークを援用した表現型制約と表現型進化原理の探索と普遍構造の探求研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 研究機関
  東京大学
低次元化に基づく免疫受容体配列ダイバーシティ解析手法の改良と応用展開研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2019
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 研究機関
  東京大学
免疫恒常性の定量生物学研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2017 – 2019
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  構成的システム生物学
- 研究機関
  東京大学
発生系譜のインフォマティクス技術の構築と、胚の生きの良さの定量化への応用研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  若手研究(A)
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
シーケンスデータに基づく、免疫レパートリ構造の統計的解析手法の構築研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2016
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  東京大学
確率変動にロバスト性を有する演算素子の設計理論と分子実装研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2016
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  理工系
- 研究機関
  東京大学
PCP因子による卵管上皮における多階層をつなぐ極性形成機構の解明
- 研究代表者
  
  藤森俊彦
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2016
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  発生生物学
- 研究機関
  基礎生物学研究所
分化誘導シグナルの時空間変化：全胚ライブイメージングによる背腹分化過程の解析
- 研究代表者
  
  近藤晶子
- 研究期間 (年度)
  2013 – 2015
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  解剖学一般(含組織学・発生学)
- 研究機関
  藤田保健衛生大学
数理モデルを用いた動的な人工遺伝子回路の設計と解析
- 研究代表者
  
  山村雅幸
- 研究期間 (年度)
  2011 – 2015
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  複合領域
- 研究機関
  東京工業大学
ライブイメージングによるニワトリ胚中胚葉細胞の遊走機構の解明
- 研究代表者
  
  仲矢由紀子
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  発生生物学
- 研究機関
  独立行政法人理化学研究所
新規の全胚ライブイメージング法による体節形成の遺伝子発現ダイナミクスの時空間解析
- 研究代表者
  
  近藤晶子
- 研究期間 (年度)
  2010 – 2012
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  解剖学一般(含組織学・発生学)
- 研究機関
  藤田保健衛生大学
哺乳類初期発生の細胞コミュニティー
- 研究代表者
  
  藤森俊彦
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2013
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  基礎生物学研究所
初期胚細胞動態のインシリコ再構成技術と数理モデルの構築研究代表者
- 研究代表者
  
  小林徹也
- 研究期間 (年度)
  2009 – 2013
- 研究種目
  
  新学術領域研究(研究領域提案型)
- 審査区分
  
  生物系
- 研究機関
  東京大学

[図書] 機械学習を生命科学に使う！2020
- 著者名/発表者名
  小林　徹也、杉村　薫、舟橋　啓
- 総ページ数
  240
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758103916
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[図書] "機械学習を生命科学に使う! : シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?"2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758103916
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[図書] 機械学習を生命科学に使う！2020
- 著者名/発表者名
  小林　徹也、杉村　薫、舟橋　啓
- 総ページ数
  240
- 出版者
  羊土社
- ISBN
  9784758103916
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[図書] 定量生物学2018
- 著者名/発表者名
  小林　徹也
- 総ページ数
  290
- 出版者
  化学同人
- ISBN
  9784759817300
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06155
[雑誌論文] Population dynamics models for various forms of adaptation2023
- 著者名/発表者名
  Nakashima So、J. Kobayashi Tetsuya
- 雑誌名
  
  Biophysics and Physicobiology
  
  巻: 20 号: 3 ページ: n/a
- DOI
  10.2142/biophysico.bppb-v20.0034
- ISSN
  2189-4779
- 言語
  英語
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Forward-Backward Sweep Method for the System of HJB-FP Equations in Memory-Limited Partially Observable Stochastic Control2023
- 著者名/発表者名
  Tottori Takehiro、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Entropy
  
  巻: 25 号: 2 ページ: 208-208
- DOI
  10.3390/e25020208
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ0557, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Information geometry of dynamics on graphs and hypergraphs2023
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Tetsuya J.、Loutchko Dimitri、Kamimura Atsushi、Horiguchi Shuhei A.、Sughiyama Yuki
- 雑誌名
  
  Information Geometry
  
  巻: - 号: 1 ページ: 97-166
- DOI
  10.1007/s41884-023-00125-w
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ0632, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Decentralized Stochastic Control with Finite-Dimensional Memories: A Memory Limitation Approach2023
- 著者名/発表者名
  Tottori Takehiro、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Entropy
  
  巻: 25 号: 5 ページ: 791-791
- DOI
  10.3390/e25050791
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ0557, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Cellular gradient flow structure linking single-cell-level rules and population-level dynamics2023
- 著者名/発表者名
  Horiguchi Shuhei A.、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 5 号: 2
- DOI
  10.1103/physrevresearch.5.l022052
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ0632, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Characterizing the Asymmetry in Hardness between Synthesis and Destruction of Heteropolymers2022
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Ikumi、Sasa Shin-ichi
- 雑誌名
  
  Physical Review Letters
  
  巻: 128 号: 24 ページ: 247801-247801
- DOI
  10.1103/physrevlett.128.247801
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K20425, KAKENHI-PROJECT-23K22415, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05795
[雑誌論文] Acceleration of evolutionary processes by learning and extended Fisher's fundamental theorem2022
- 著者名/発表者名
  So Nakashima, Tetsuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 013069-013069
- DOI
  10.1103/physrevresearch.4.013069
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19J22607, KAKENHI-PROJECT-19H03216, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Kinetic derivation of the Hessian geometric structure in chemical reaction networks2022
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Tetsuya J.、Loutchko Dimitri、Kamimura Atsushi、Sughiyama Yuki
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 4 号: 3 ページ: 033066-033066
- DOI
  10.1103/physrevresearch.4.033066
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K21308, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Riemannian geometry of optimal driving and thermodynamic length and its application to chemical reaction networks2022
- 著者名/発表者名
  Loutchko Dimitri、Sughiyama Yuki、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 4 号: 4 ページ: 043049-043049
- DOI
  10.1103/physrevresearch.4.043049
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Hessian geometric structure of chemical thermodynamic systems with stoichiometric constraints2022
- 著者名/発表者名
  Sughiyama Yuki、Loutchko Dimitri、Kamimura Atsushi、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 4 号: 3 ページ: 033065-033065
- DOI
  10.1103/physrevresearch.4.033065
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K21308, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Machine Learning Approaches to TCR Repertoire Analysis2022
- 著者名/発表者名
  Katayama Yotaro、Yokota Ryo、Akiyama Taishin、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Frontiers in Immunology
  
  巻: 13 ページ: 858057-858057
- DOI
  10.3389/fimmu.2022.858057
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K19391, KAKENHI-PROJECT-19K20408, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799, KAKENHI-PROJECT-20H03441
[雑誌論文] Optimal sensing and control of run-and-tumble chemotaxis2022
- 著者名/発表者名
  Nakamura Kento、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 4 号: 1 ページ: 013120-013120
- DOI
  10.1103/physrevresearch.4.013120
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20J21362, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Comparative Study of Repertoire Classification Methods Reveals Data Efficiency of k-mer Feature Extraction2022
- 著者名/発表者名
  Katayama Yotaro、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Frontiers in Immunology
  
  巻: 13
- DOI
  10.3389/fimmu.2022.797640
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] The Onsager-Machlup Integral for Non-Reciprocal Systems with Odd Elasticity2022
- 著者名/発表者名
  Yasuda Kento、Kobayashi Akira、Lin Li-Shing、Hosaka Yuto、Sou Isamu、Komura Shigeyuki
- 雑誌名
  
  Journal of the Physical Society of Japan
  
  巻: 91 号: 1 ページ: 015001-015001
- DOI
  10.7566/jpsj.91.015001
- NAID
  210000159508
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-20H05538, KAKENHI-PROJECT-19J20271, KAKENHI-PROJECT-22KJ1640, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[雑誌論文] Chemical thermodynamics for growing systems2022
- 著者名/発表者名
  Sughiyama Yuki、Kamimura Atsushi、Loutchko Dimitri、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 4 号: 3 ページ: 033191-033191
- DOI
  10.1103/physrevresearch.4.033191
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K21308, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Hessian geometry of nonequilibrium chemical reaction networks and entropy production decompositions2022
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Tetsuya J.、Loutchko Dimitri、Kamimura Atsushi、Sughiyama Yuki
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 4 号: 3 ページ: 033208-033208
- DOI
  10.1103/physrevresearch.4.033208
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-21K21308, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] An explainable deep learning-based algorithm with an attention mechanism for predicting the live birth potential of mouse embryos2022
- 著者名/発表者名
  Tokuoka Yuta、Yamada Takahiro G.、Mashiko Daisuke、Ikeda Zenki、Kobayashi Tetsuya J.、Yamagata Kazuo、Funahashi Akira
- 雑誌名
  
  Artificial Intelligence in Medicine
  
  巻: 134 ページ: 102432-102432
- DOI
  10.1016/j.artmed.2022.102432
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ3051, KAKENHI-PLANNED-18H05528, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Memory-Limited Partially Observable Stochastic Control and Its Mean-Field Control Approach2022
- 著者名/発表者名
  Tottori Takehiro、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Entropy
  
  巻: 24 号: 11 ページ: 1599-1599
- DOI
  10.3390/e24111599
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ0557, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Asynchronous division at 4-8-cell stage of preimplantation embryos affects live birth through ICM/TE differentiation2022
- 著者名/発表者名
  Mashiko Daisuke、Ikeda Zenki、Tokoro Mikiko、Hatano Yu、Yao Tatsuma、Kobayashi Tetsuya J.、Fukunaga Noritaka、Asada Yoshimasa、Yamagata Kazuo
- 雑誌名
  
  Scientific Reports
  
  巻: 12 号: 1 ページ: 9411-9411
- DOI
  10.1038/s41598-022-13646-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ3051, KAKENHI-PLANNED-18H05528, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Representation and inference of size control laws by neural-network-aided point processes2021
- 著者名/発表者名
  Kamimura Atsushi、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 3 号: 3
- DOI
  10.1103/physrevresearch.3.033032
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Forward and Backward Bellman Equations Improve the Efficiency of the EM Algorithm for DEC-POMDP2021
- 著者名/発表者名
  Tottori Takehiro、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Entropy
  
  巻: 23 号: 5 ページ: 551-551
- DOI
  10.3390/e23050551
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22KJ0557, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] 大腸菌走化性における感知・応答の情報論的な最適性2021
- 著者名/発表者名
  中村絢斗、小林徹也
- 雑誌名
  
  生体の科学
  
  巻: 3 ページ: 239-244
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Connection between the Bacterial Chemotactic Network and Optimal Filtering2021
- 著者名/発表者名
  Kento Nakamura, Tetsuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Physical Review Letters
  
  巻: 126 号: 12 ページ: 128102-128102
- DOI
  10.1103/physrevlett.126.128102
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20J21362, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Understanding adaptive immune system as reinforcement learning2021
- 著者名/発表者名
  Kato Takuya、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Physical Review Research
  
  巻: 3 号: 1 ページ: 013222-013222
- DOI
  10.1103/physrevresearch.3.013222
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] 3D convolutional neural networks-based segmentation to acquire quantitative criteria of the nucleus during mouse embryogenesis2020
- 著者名/発表者名
  Tokuoka Yuta、Yamada Takahiro G.、Mashiko Daisuke、Ikeda Zenki、Hiroi Noriko F.、Kobayashi Tetsuya J.、Yamagata Kazuo、Funahashi Akira
- 雑誌名
  
  npj Systems Biology and Applications
  
  巻: 6 号: 1 ページ: 32-32
- DOI
  10.1038/s41540-020-00152-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-18H05528, KAKENHI-PROJECT-18H02357, KAKENHI-PROJECT-19H03216, KAKENHI-PROJECT-19J13189, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Lineage EM algorithm for inferring latent states from cellular lineage trees2020
- 著者名/発表者名
  Nakashima So、Sughiyama Yuki、Kobayashi Tetsuya J
- 雑誌名
  
  Bioinformatics
  
  巻: 36 号: 9 ページ: 2829-2838
- DOI
  10.1093/bioinformatics/btaa040
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K17763, KAKENHI-PROJECT-19H03216, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Reliable target ligand detection by noise-induced receptor cluster formation2020
- 著者名/発表者名
  Kajita Masashi K.、Aihara Kazuyuki、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science
  
  巻: 30 号: 1 ページ: 011104-011104
- DOI
  10.1063/1.5140714
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K18147, KAKENHI-PUBLICLY-18H05096, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799, KAKENHI-PROJECT-15H05707
[雑誌論文] 生命科学における機械学習の応用とその課題2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 雑誌名
  
  数理科学
  
  巻: 58 ページ: 43-49
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Bayesian gates for reliable logical operations under noisy conditions2020
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Tetsuya J
- 雑誌名
  
  PHYSICAL REVIEW E
  
  巻: 101 号: 4 ページ: 042205-042205
- DOI
  10.1103/physreve.101.042205
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Fitness Gain of Individually Sensed Information by Cells2019
- 著者名/発表者名
  Kobayashi Tetsuya J.、Sughiyama Yuki
- 雑誌名
  
  Entropy
  
  巻: 21 号: 10 ページ: 1002-1002
- DOI
  10.3390/e21101002
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216, KAKENHI-PROJECT-16K17763, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799
[雑誌論文] Quantitative analysis reveals reciprocal regulations underlying recovery dynamics of thymocytes and thymic environment in mice2019
- 著者名/発表者名
  Kaneko Kazumasa B.、Tateishi Ryosuke、Miyao Takahisa、Takakura Yuki、Akiyama Nobuko、Yokota Ryo、Akiyama Taishin、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 2 号: 1 ページ: 444-444
- DOI
  10.1038/s42003-019-0688-8
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K08622, KAKENHI-PUBLICLY-18H05096, KAKENHI-PUBLICLY-18H04989, KAKENHI-ORGANIZER-19H05794, KAKENHI-PLANNED-19H05799, KAKENHI-PROJECT-17H04038
[雑誌論文] Quantitative Analysis Reveals Reciprocal Regulations Underlying Recovery Dynamics of Thymocytes and Thymic Environment in Mice2019
- 著者名/発表者名
  Kazumasa B Kaneko, Ryosuke Tateishi, Takahisa Miyao, Yuki Takakura, Nobuko Akiyama, Ryo Yokota , Taishin Akiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Communications Biology
  
  巻: 印刷中
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[雑誌論文] Long-term hindlimb unloading causes a preferential reduction of medullary thymic epithelial cells expressing autoimmune regulator (Aire)2018
- 著者名/発表者名
  Horie Kenta、Kudo Takashi、Yoshinaga Riko、Akiyama Nobuko、Sasanuma Hiroki、Kobayashi Tetsuya J.、Shimbo Miki、Jeon Hyojung、Miyao Takahisa、Miyauchi Maki、Shirakawa Masaki、Shiba Dai、Yoshida Nobuaki、Muratani Masafumi、Takahashi Satoru、Akiyama Taishin
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 501 号: 3 ページ: 745-750
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2018.05.060
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17K08622, KAKENHI-PUBLICLY-18H04965, KAKENHI-PUBLICLY-18H04989, KAKENHI-PUBLICLY-18H05096, KAKENHI-PROJECT-17H04038, KAKENHI-ORGANIZER-15H05935
[雑誌論文] The explicit form of the rate function for semi-Markov processes and its contractions2018
- 著者名/発表者名
  Yuki Sughiyama, Testuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Journal of Physics A: Mathematical and Theoretical
  
  巻: 51 号: 12 ページ: 125001-125001
- DOI
  10.1088/1751-8121/aaab6d
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K17763, KAKENHI-PROJECT-16H06155
[雑誌論文] Stochastic and information-thermodynamic structures of population dynamics in a fluctuating environment2017
- 著者名/発表者名
  Testuya J. Kobayashi, Yuki Sughiyama
- 雑誌名
  
  Physical Review E
  
  巻: 96 号: 1 ページ: 012402-012402
- DOI
  10.1103/physreve.96.012402
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K17763, KAKENHI-PROJECT-16H06155
[雑誌論文] Quantification of Inter-Sample Differences in T-Cell Receptor Repertoires Using Sequence-Based Information2017
- 著者名/発表者名
  Yokota Ryo、Kaminaga Yuki、Kobayashi Tetsuya J.
- 雑誌名
  
  Frontiers in Immunology
  
  巻: 8 ページ: 1500-1500
- DOI
  10.3389/fimmu.2017.01500
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[雑誌論文] システム生物学と免疫系の自己-非自己識別2016
- 著者名/発表者名
  秋山泰身, 小林徹也
- 雑誌名
  
  医学の歩み
  
  巻: 259 ページ: 839-842
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[雑誌論文] Discreteness-induced transitions in multibody reaction systems2016
- 著者名/発表者名
  Yohei Saito, Yuki Sughiyama, Kunihiko Kaneko, Tetsuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Physical Review E
  
  巻: 94 号: 2 ページ: 22140-22140
- DOI
  10.1103/physreve.94.022140
- 査読あり / 謝辞記載あり
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H00800
[雑誌論文] Positive and negative regulatory mechanisms for fine-tuning cellularity and functions of medullary thymic epithelial cells2015
- 著者名/発表者名
  Taishin Akiyama, Ryosuke Tateishi, Nobuko Akiyama, Riko Yoshinaga, Tetsuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Frontier Immunology
  
  巻: 6 ページ: 1-6
- DOI
  10.3389/fimmu.2015.00461
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433, KAKENHI-PUBLICLY-15H01150, KAKENHI-PROJECT-26670234
[雑誌論文] Improved and robust detection of cell nuclei from four dimensional fluorescence images.2014
- 著者名/発表者名
  Bashar MK, Yamagata K, Kobayashi TJ.
- 雑誌名
  
  PLoS One
  
  巻: 9 号: 7 ページ: e101891-e101891
- DOI
  10.1371/journal.pone.0101891
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-21116001, KAKENHI-PLANNED-25116005, KAKENHI-PUBLICLY-25125712, KAKENHI-PROJECT-25712035, KAKENHI-PROJECT-26660250
[雑誌論文] 細胞のふるまいを読み解く時系列に潜む情報量2013
- 著者名/発表者名
  小林徹也、上村淳
- 雑誌名
  
  実験医学
  
  巻: Vol.31(8) ページ: 1239-1244
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Single Cell Visualization of Yeast Gene Expression Shows Correlation of Epigenetic Switching Between Multiple Heterochromatic Regions Through Multiple Generations2013
- 著者名/発表者名
  Y.Mano, T.J. Kobayashi, J.Nakayama, H.Uchida, M.Oki
- 雑誌名
  
  Plos Biology
  
  巻: Vol.11
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] 定量データが切り開く生命科学2013
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 雑誌名
  
  実験医学
  
  巻: 31 ページ: 1202-1208
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-23119008
[雑誌論文] Single Cell Visualization of Yeast Gene Expression Shows Correlation of Epigenetic Switching Between Multiple Heterochromatic Regions Through Multiple Generations2013
- 著者名/発表者名
  Yasunobu Mano, Tetsuya J. Kobayashi, Jun-ichi Nakayama, Hiroyuki Uchida, Masaya Oki
- 雑誌名
  
  Plos Biology
  
  巻: 11 号: 7 ページ: e1001601-e1001601
- DOI
  10.1371/journal.pbio.1001601
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006, KAKENHI-ORGANIZER-23114001, KAKENHI-PLANNED-23114005, KAKENHI-PLANNED-23119008, KAKENHI-PROJECT-23370004
[雑誌論文] 定量データが切り開く生命科学2013
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 雑誌名
  
  実験医学
  
  巻: Vol.31(8) ページ: 1202-1208
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Automatic Extraction of Nuclei Centroids of Mouse Embronic Cells from Fluorescence Microscopy Images2012
- 著者名/発表者名
  K.Bashar, K.Komatsu, T.Fujimori, T.J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Plos One
  
  巻: Vol.7(5)
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Automatic Extraction of Nuclei Centroids of Mouse Embry- onic Cells from Fluorescence Microscopy Images2012
- 著者名/発表者名
  Md. Khayrul Bashar, Koji Komatsu, Toshihiko Fujimori and Tetsuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Plos One
  
  巻: 7 号: 5 ページ: e35550-e35550
- DOI
  10.1371/journal.pone.0035550
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006, KAKENHI-PLANNED-21116005
[雑誌論文] Information processing and integration with intracellular kinetics near critical point2012
- 著者名/発表者名
  A.Kamimura,T.J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Frontiers in Physiology
  
  巻: Vol.3 ページ: 203-203
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Theoretical aspect of cellular decision- making and information processing2012
- 著者名/発表者名
  Kobayashi TJ, Kamimura, A
- 雑誌名
  
  Adv Exp Med Biol.
  
  巻: 736 ページ: 275-91
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22570210
[雑誌論文] Information Processing and integration with intracellular dynamics near critical point2012
- 著者名/発表者名
  A. Kamimura, T. J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Frontiers in Fractal Physiology
  
  巻: 3 ページ: 203-203
- DOI
  10.3389/fphys.2012.00203
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-12J08104, KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Physiological intracellular crowdedness is defined by perimeter to area ratio of subcellular compartments2012
- 著者名/発表者名
  N.Hiroi, T.Okuhara, T.Kubojima, K.Iba, A.Tabira, S.Yamashita, Y.Okada, T.J. Kobayashi,A. Funahashi
- 雑誌名
  
  Frontiers in Physiology
  
  巻: Vol.3 ページ: 293-293
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Physiological intracellular crowdedness is defined by perimeter to area ratio of subcellular compartments2012
- 著者名/発表者名
  Noriko Hiroi, Takahiro Okuhara, Takeshi Kubojima, Keisuke Iba, Akito Tabira, Shuji Yamashita, Yasunori Okada, Tetsuya J. Kobayashi, Akira Funahashi
- 雑誌名
  
  Frontiers in Physiology
  
  巻: 7 ページ: 293-293
- DOI
  10.3389/fphys.2012.00293
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Theoretical aspect of cellular decision-making and information processing2012
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 雑誌名
  
  Advances in Experimental Medicine and Biology
  
  巻: vol. 736 ページ: 275-291
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-23119008
[雑誌論文] Dynamics of intracellular information decoding2011
- 著者名/発表者名
  Kobayashi TJ, Kamimura A
- 雑誌名
  
  Phys Biol.
  
  巻: 8 ページ: 55007-55007
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22570210
[雑誌論文] Perturbation analyses of intermolecular interactions2011
- 著者名/発表者名
  Koyama YM, Kobayashi TJ, Tomoda S, Hiroki R
- 雑誌名
  
  Physical Review
  
  巻: E84 ページ: 46702-46702
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22570210
[雑誌論文] Connection between noise- induced symmetry breaking and an information -decoding function for intracellular networks2011
- 著者名/発表者名
  Kobayashi TJ
- 雑誌名
  
  Physical Review Letters
  
  巻: 106 ページ: 228101-228101
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22570210
[雑誌論文] Perturbation analyses of intermolecular interactions2011
- 著者名/発表者名
  Yohei M.Koyama, Tetsuya J.Kobayashi, Hiroki R.Ueda
- 雑誌名
  
  Physical Review E
  
  巻: 84 ページ: 26704-26704
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Perturbation analyses of intermolecular interactions2011
- 著者名/発表者名
  Y. M. Koyama, T.J. Kobayashi, H.R. Ueda
- 雑誌名
  
  Physical Review E
  
  巻: Vol.84 ページ: 26704-26704
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Dynamics of Intracellular Information decoding2011
- 著者名/発表者名
  Kobayashi TJ, Atsushi Kamimura A
- 雑誌名
  
  Physical Biology
  
  巻: 8 ページ: 55007-55007
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22570210
[雑誌論文] Atypical Cadherins Dachsous and Fat Control Dynamics of Noncentrosomal Microtubules in Planar Cell Polarity2010
- 著者名/発表者名
  Toshiyuki Harumoto, Masayoshi Ito, Yuko Shimada, Tetsuya J.Kobayashi, Hiroki R.Ueda, Bingwei Lu
- 雑誌名
  
  Developmental cell
  
  巻: 19 ページ: 389-401
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Atypical Cadherins Dachsous and Fat Control Dynamics of Noncentrosomal Microtubules in Planar Cell Polarity2010
- 著者名/発表者名
  T.Harumoto, M.Ito, Y.Shimada,T.J. Kobayashi, H.R. Ueda, B.Lu, T.Uemura
- 雑誌名
  
  Developmental cell
  
  巻: Vol.19 ページ: 389-401
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[雑誌論文] Atypical Cadherins Dachsous and Fat Control Dynamics of Noncentrosomal Microtubules in Planar Cell Polarity2010
- 著者名/発表者名
  Harumoto T, Ito M, Shimada Y, Kobayashi TJ, Ueda HR, Lu B, and Uemura T
- 雑誌名
  
  Developmental cell
  
  巻: 19 ページ: 389-401
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22570210
[雑誌論文] Implementation of Dynamic Bayesian Decision Making by Intracellular Kinetics2010
- 著者名/発表者名
  Kobayashi TJ
- 雑誌名
  
  Physical Review Letters
  
  巻: 104 ページ: 228104-228104
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22570210
[学会発表] ストレス条件下における髄質胸腺上皮細胞の分化ダイナミクス変化の情報学的解析2024
- 著者名/発表者名
  木下恭兵, 小林徹也
- 学会等名
  第８回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 計算資源制限を伴う最適推定制御とその生体情報処理への応用：記憶の相転移2024
- 著者名/発表者名
  鳥取岳広, 小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会第十一回年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞増殖を統合した分化軌道推定手法の開発と胸腺細胞のロバスト性解明への応用2024
- 著者名/発表者名
  木下恭兵, 小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会第十一回年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] epiNMF: a Novel Method to Uncover the Influence of Epigenome on Local Mutation Rates2024
- 著者名/発表者名
  Machiko Katori, Hiroyuki Yamasaki, Tetsuya Yamada-Saito, Tetsuya J. Kobayashi, Shoi Shi
- 学会等名
  Gordon Research Seminar, DNA Damage, Mutation and Cancer
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞集団の勾配流によるモデリング2024
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  第８回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 環境を通じて情報共有する細胞集団の強化学習的理解2024
- 著者名/発表者名
  加藤雅己, 小林徹也
- 学会等名
  第８回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 歴史から紐解く化学反応論と化学熱力学2024
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会第十一回年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 一般化勾配流による多細胞システムのモデル化2024
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会第十一回年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] ジャンプ過程に対する線形可解な確率最適制御2023
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  2023年度数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 化学反応システムの熱力学とその応用2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会第十回年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Chemical thermodynamics for growing compartments with stoichiometric constraints2023
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  日本生物物理学会第61回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 観測と記憶が制限された確率最適制御問題の解法：確率空間上のポントリャーギンの最小原理と前向き後向きスイープ法2023
- 著者名/発表者名
  鳥取岳広, 小林徹也
- 学会等名
  計測自動制御学会第10回制御部門マルチシンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 深層学習によるTCR-pMHC結合予測2023
- 著者名/発表者名
  堅山耀太郎, 小林徹也
- 学会等名
  第7回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Noise-induced receptor clustering as a functional role of noise for reducing errors in target ligand detection2023
- 著者名/発表者名
  Masashi K. Kajita, Kazuyuki Aihara, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  28th International Conference on Statistical Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Uncovering the Influence of Epigenetics on Local Mutation Rates through a Comprehensive Analysis of Epigenomic and Genomic Data2023
- 著者名/発表者名
  Machiko Katori, Tetsuya Yamada, Tetsuya J. Kobayashi, Shoi Shi
- 学会等名
  Probabilistic Modeling in Genomics 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Using and Creating Control Theory for Biological Problems2023
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Limits of gradient sensing with a dynamically changing cell shape2023
- 著者名/発表者名
  Kento Nakamura, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  28th International Conference on Statistical Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Cellular gradient flow structure connects single-cell-level rules and population-level dynamics2023
- 著者名/発表者名
  Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  STATPHY, Satellite Meeting, Statistical Physics, Information-Processing in Living Systems
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] The Hessian Geometry of Thermodynamic Uncertainty Relations in Chemical Reaction Networks2023
- 著者名/発表者名
  Dimitri Loutchko, Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  28th International Conference on Statistical Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 胸腺上皮細胞のシングルセル解析2023
- 著者名/発表者名
  木下恭兵, 小林徹也
- 学会等名
  第7回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] グラフニューラルネットワークによる分子表現と匂い認知の予測への応用2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第7回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 体積成長を考慮した自己複製系の化学熱力学2023
- 著者名/発表者名
  上村淳, 杉山友規, 小林徹也
- 学会等名
  「細胞を創る」研究会16.0
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 機械学習ベースの隠れ状態推定手法の比較と生物データへの応用2023
- 著者名/発表者名
  谷本佑馬, 上村淳, 小林徹也
- 学会等名
  第26回情報論的学習理論ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Information Geometry of Equilibrium and Nonequilibrium Chemical Reaction Networks2023
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi, Dimitri Loutchko, Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama
- 学会等名
  28th International Conference on Statistical Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Optimality of Biological Information Processing2023
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Biomedical Mathematics Online Colloquium
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] ゆらいだ生体時系列データから隠れた変動を見出す機械・深層学習手法2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第96回日本生化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Optimal Information Processing and Control in Living Systems with limited resources2023
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  STATPHYS28 Satellite Meeting:Statistical Physics and Information-Processing in Living Systems
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Hessian geometric derivation of macroscopic thermodynamic uncertainty relations (TUR)2023
- 著者名/発表者名
  Dimitri Loutchko, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞を創るための平衡・非平衡化学熱力学2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也, 杉山友規, Dimitri Loutchko, 上村淳
- 学会等名
  「細胞を創る」研究会16.0
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 生物学的制約を考慮した最適推定制御問題における記憶の相転移2023
- 著者名/発表者名
  鳥取岳広, 小林徹也
- 学会等名
  日本物理学会2023年秋季大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Chemical thermodynamics for growing protocells2023
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Origins of Life Donostia Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Generalized gradient flow modeling of the cellular population dynamics and a T-cell immune response model2023
- 著者名/発表者名
  Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 8th CIJK Conference on Mathematical and Theoretical Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 伸長方向を制御する細胞による勾配方向の推定限界2023
- 著者名/発表者名
  中村絢斗, 小林徹也
- 学会等名
  2023年度数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 環境を通じて情報共有する細胞集団の強化学習的理解2023
- 著者名/発表者名
  加藤雅己, 小林徹也
- 学会等名
  2023年度数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] ハイパーグラフ上の非線形一般化勾配流とその情報幾何学構造2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第26回情報論的学習理論ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Chemical thermodynamics for growing compartments2023
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Molecular Origins of Life
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] The fate of growing systems under themorynamic and stoichiometric constraints2023
- 著者名/発表者名
  Atsushi Kamimura, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  28th International Conference on Statistical Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Cellular gradient flow structure connects single-cell-level rules and population-level dynamics2023
- 著者名/発表者名
  Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] リソース制約部分観測最適制御理論：生体情報処理の理解にむけた自由エネルギー原理とは違うルート2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  「あいまい脳」班会議
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Partially Observable Stochastic Control with Memory Limitation and Mean-Field Approach2023
- 著者名/発表者名
  Takehiro Tottori, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  10th International Congress on Industrial and Applied Mathematics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 分散型確率最適制御問題に対する記憶制限アプローチ2023
- 著者名/発表者名
  鳥取岳広, 小林徹也
- 学会等名
  第67回システム制御情報学会研究発表講演会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] グラフNNによる化学分子表現学習とその匂い認知予測への応用2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也, 梦吉, 舟橋啓
- 学会等名
  日本生物物理学会第61回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Spectral Graph NNによる化学分子表現とその匂い認知予測への応用2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  2023年度数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] リソース制約部分観測最適制御理論：生体情報処理の理解にむけた自由エネルギー原理とは違うルート2023
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  「あいまい脳」班会議
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Cellular gradient flow structure connects single-cell-level rules and population-level dynamics2023
- 著者名/発表者名
  Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  28th International Conference on Statistical Physics
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞集団動態の勾配流によるモデリング2023
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  第７回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Optimal information processing and motor control of run-and-tumble chemotaxis under stochastic fluctuation2022
- 著者名/発表者名
  Kento Nakamura, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Evolution of Thymic Involution Through the Lens of Learning Theory2022
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  第51回日本免疫学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Riemannian Geometry of Chemical Reaction Networks and its Applications to Optimal Driving and Sensitivity2022
- 著者名/発表者名
  Dimitri Loutchko, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Workshop on Non-equilibrium Phenomena in Physics and Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Chemical thermodynamics for growing systems2022
- 著者名/発表者名
  杉山友規, 上村敦・LoutchkoDimitri, 小林徹也
- 学会等名
  RIMS共同研究集会「ランダム力学系・非自励力学系研究の展望：理論と応用」
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Cell competition in a hybrid mechanochemical model2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  25th Anniversary Symposium of German-Japanese Joint Research Project on Nonequilibrium Statistical Physics Perspectives for Future Collaboration
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] T細胞系の定量生物学：発生からレパトアまで2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第2回ASHBi 数理ヒト生物学研究会 (MathHuB研究会)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Information Geometry of Equilibrium and Nonequilibrium Chemical Reaction Networks2022
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Workshop on Non-equilibrium Phenomena in Physics and Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 記憶が制限された部分観測確率制御2022
- 著者名/発表者名
  鳥取岳広, 小林徹也
- 学会等名
  日本物理学会2022年秋季大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] "ラマン―オミクス対応が明らかにする細胞構成要素連動性の重要性（英語タイトル：Raman-omics correspondence reveals stoichiometric balance constrains on omics changes）"2022
- 著者名/発表者名
  亀井健一郎、小林鉱石、野添嵩、中岡秀憲、若本祐一
- 学会等名
  第45回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 記憶が制限された部分観測確率制御に対する平均場制御アプローチ2022
- 著者名/発表者名
  鳥取岳広, 小林徹也
- 学会等名
  第65回自動制御連合講演会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] T細胞系の定量生物学：発生からレパトアまで2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第2回ASHBi 数理ヒト生物学研究会 (MathHuB研究会)
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] A general approach to chemical thermodynamics and constraints for growing systems2022
- 著者名/発表者名
  杉山友規, 上村淳, Dimitri Loutchko, 小林徹也
- 学会等名
  日本生物物理学会第60回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Gradient flow of the heterogeneous cellular population and a T-cell immune response model.2022
- 著者名/発表者名
  Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  12th European Conference on Mathematical and Theoretical Biology (ECMTB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞集団動態と１細胞動態の一般化勾配流によるモデリング2022
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  ソフトバイオ研究会2022
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Information Geometry of Equilibrium and Nonequilibrium Chemical Reaction Networks2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  Workshop on Non-equilibrium Phenomena in Physics and Biology
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Hessian Geometric Structure of Equilibrium and Nonequilibrium Chemical Reaction Newtworks2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  理研 iTEMSセミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Hessian Geometric Structure of Equilibrium and Nonequilibrium Chemical Reaction Newtworks2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  理研 iTEMSセミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Chemical Thermodynamics of Growing Systems2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  ICTP-KIAS School on Statistical Physics for Life Sciences
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] グラフ・ハイパーグラフ上のダイナミクスの情報幾何学2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  JST数学関連3領域連携WS「情報科学と拓く新しい数理科学」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] 細胞集団の勾配流と1細胞動態の法則2022
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  2022年度数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] グラフ・ハイパーグラフ上のダイナミクスの情報幾何学2022
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  JST数学関連3領域連携WS「情報科学と拓く新しい数理科学」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 前向き後向きBellman方程式による分散型部分観測確率制御の効率化2021
- 著者名/発表者名
  鳥取岳広, 小林徹也
- 学会等名
  第 64 回自動制御連合講演会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 学習による進化の加速とFisherの基本定理の拡張2021
- 著者名/発表者名
  中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  2021年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 集団動態における生物学的コストとリーマン多様体上の勾配流:免疫系への応用2021
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  2021年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 生体における化学情報処理機構の定量生物学2021
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第4回センサ＆IoTセミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Representation and inference of cell growth and division by neural-network-aided point processes2021
- 著者名/発表者名
  上村淳, 小林徹也
- 学会等名
  日本生物物理学会第59回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Acceleration of evolutionary processes by learning and extended Fisher's fundamental theorem2021
- 著者名/発表者名
  So Nakashima, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 20th Congress of the International Union for Pure and Applied Biophysics (IUPAB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 単細胞はどこまでよくできているか？最適フィルター・最適制御理論に基づくバクテリア化学感知機構の最適性の検証2021
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  統計物理と統計科学の連続セミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Biochemical implementation of optimal control for run-and-tumble chemotaxis2021
- 著者名/発表者名
  Kento Nakamura, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 20th Congress of the International Union for Pure and Applied Biophysics (IUPAB)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 学習による進化の加速とFisherの基本定理の拡張2021
- 著者名/発表者名
  中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  2021年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Acceleration of evolutionary processes by learning and extended Fisher's fundamental theorem2021
- 著者名/発表者名
  So Nakashima, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 20th Congress of the International Union for Pure and Applied Biophysics (IUPAB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] Estimating Bacterial Quantitative Proteomes from Cellular Raman Spectra2021
- 著者名/発表者名
  Ken-ichiro F Kamei, Koseki J Kobayashi-Kirschvink, Hidenori Nakaoka, and Yuichi Wakamoto
- 学会等名
  BPS2021 65th Biophysical Society Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] Repertoire seqと機械学習2021
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第５回理論免疫学ワークショップ
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Poisson 点過程と Ginibre 点過程上での連続パーコレーションと確率論的感染症モデル2021
- 著者名/発表者名
  香取真知子, 香取眞理, 小林徹也
- 学会等名
  2021年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 推定・制御の最適性に基づくバクテリア化学走性の理解2021
- 著者名/発表者名
  中村絢斗, 小林徹也
- 学会等名
  第 64 回自動制御連合講演会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] T細胞レパトアデータによる免疫状態の分類手法について2021
- 著者名/発表者名
  堅山耀太郎, 小林徹也
- 学会等名
  第６回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 機械学習による免疫レパトア分類2021
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  iB Seminar：名古屋大学ハイブリッドセミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] バクテリア化学走性機構の最適性2021
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第十回生命医薬情報連合大会(IIBMP2021)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 生命現象をとらえる理論的方法とその展開：情報から構造まで2021
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  東京大学理学部物理学科・2021年度後期物理学教室コロキウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Representation and inference of cell growth and division by neural-network-aided point processes2021
- 著者名/発表者名
  上村淳, 小林徹也
- 学会等名
  日本生物物理学会第59回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 機械学習によるシングルセル・ダイナミクスからの生物学的原理の解読2021
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  日本生物物理学会第59回年次大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞集団の勾配流とT細胞分化モデル2021
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  第６回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] A gradient flow of the heterogeneous cellular population2021
- 著者名/発表者名
  Shuhei A. Horiguchi, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  International Conference on "Emergence of Cooperation and Organization in Groups of Animals and Non-living Objects" (ICMMA 2021)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 感知ノイズ下の run-and-tumble 型化学走性の最適な制御方式2021
- 著者名/発表者名
  中村絢斗 , 小林徹也
- 学会等名
  2021年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 生物学における機械学習的アプローチの最先端2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第43回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Deciphering latent growth mode of cells from cellular lineage trees2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  Establishing International Research Network of Mathematical Oncology
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Optimality of the sensory system of Escherichia coli2020
- 著者名/発表者名
  Kento Nakamura, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  2020 Society of Mathematical Biology Virtual Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Deciphering latent growth mode of cells from cellular lineage trees2020
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Establishing International Research Network of Mathematical Oncology
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 学習理論に基づく胸腺の機能的意義2020
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  第５回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 免疫系における胸腺の強化学習の観点からの機能的意義2020
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 増殖系における個の学習がもつ役割の考察2020
- 著者名/発表者名
  中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 獲得免疫系の定量生物学2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Understanding biological sensing and its optimality2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  Universal Principles in Biological Systems and their Evolution
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Information processing in cellular systems and the fitness value of information2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  Computational Principles in Active Perception and Reinforcement Learning in the Brain
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Lineage EM Algorithm for Inferring Latent States from Cellular Lineage Trees2020
- 著者名/発表者名
  So Nakashima, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  2020 Society of Mathematical Biology Virtual Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] Information processing in cellular systems and the fitness value of information2020
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Computational Principles in Active Perception and Reinforcement Learning in the Brain
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 増殖系における個の学習がもつ役割の考察2020
- 著者名/発表者名
  中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 生物学における機械学習的アプローチの最先端2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第43回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Repertoire seqと機械学習2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第５回理論免疫学ワークショップ
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 生物学における機械学習的アプローチの最先端2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第43回日本分子生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] Lineage EM Algorithm for Inferring Latent States from Cellular Lineage Trees2020
- 著者名/発表者名
  So Nakashima, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  2020 Society of Mathematical Biology Virtual Annual Meeting
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Deciphering latent growth mode of cells from cellular lineage trees2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  ワークショップ「数理腫瘍学の研究」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 獲得免疫系の定量生物学2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] バクテリア走化性の情報物理学2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也, 中村絢斗
- 学会等名
  第58回日本生物物理学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 増殖系における個の学習がもつ役割の考察2020
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] 最適確率制御システムと大腸菌化学走性過程の対応2020
- 著者名/発表者名
  中村絢斗, 小林徹也
- 学会等名
  2020年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Deciphering latent growth mode of cells from cellular lineage trees2020
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Establishing International Research Network of Mathematical Oncology
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 免疫T細胞の抗原識別における確率ノイズの構造2019
- 著者名/発表者名
  梶田真司, 合原一幸, 小林徹也
- 学会等名
  2019年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05096
[学会発表] 情報から捉える生命現象2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会　北海道キャラバン 2019
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 増殖系と隠れマルコフモデルの対応に基づく学習の考察(A Study on Learning in Growing Population on the Basis of Hidden Markov Model)2019
- 著者名/発表者名
  中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] ライブセルイメージングおよび単一胚移植による産まれる発生パターンの解析2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  有性生殖にかかわる染色体・クロマチン・核動態に関する研究会(遺伝研研究会)
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] T細胞の分化時間を一定に保つ適応メカニズム2019
- 著者名/発表者名
  金子和正, 小林徹也
- 学会等名
  2019年度日本数理生物学会年会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05096
[学会発表] バクテリアの走化性における濃度変化の推定ダイナミクス2019
- 著者名/発表者名
  中村絢斗, 小林徹也
- 学会等名
  2019年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 免疫学習の数理2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第３回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05096
[学会発表] Understanding adaptive immunity as a reinforcement learning system2019
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Reinforcement Learning & Biological Intelligence
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04814
[学会発表] 免疫学習の数理2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第３回理論免疫学ワークショップ
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] 増殖系と隠れマルコフモデルの対応に基づく学習の考察(A Study on Learning in Growing Population on the Basis of Hidden Markov Model)2019
- 著者名/発表者名
  中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 免疫恒常性維持機構への数理的アプローチ2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  細胞ダイバース第四回公開シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] 強化学習に基づいた適応免疫学習過程のモデル化2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第９回定量生物学の会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04814
[学会発表] Fitness response relation of a multitype age-structured population dynamics2019
- 著者名/発表者名
  杉山友規, 中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] 免疫細胞多様性の強化学習モデルの解析2019
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  2019年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05096
[学会発表] Understanding adaptive immune system as reinforcement learning2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  Interface between Immunology & Quantitative Biology
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] 免疫細胞多様性の強化学習モデルの解析2019
- 著者名/発表者名
  堀口修平, 小林徹也
- 学会等名
  2019年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 免疫恒常性維持機構への数理的アプローチ2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也，金子和正，秋山泰身
- 学会等名
  細胞ダイバース第四回公開シンポジウム
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05096
[学会発表] 情報から捉える生命現象2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会　北海道キャラバン 2019
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞ダイバーシティーへの数理的アプローチ2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第92回日本生化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H03216
[学会発表] T細胞の分化時間を一定に保つ適応メカニズム2019
- 著者名/発表者名
  金子和正, 小林徹也
- 学会等名
  2019年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 免疫T細胞の抗原識別における確率ノイズの構造2019
- 著者名/発表者名
  梶田真司, 合原一幸, 小林徹也
- 学会等名
  2019年度日本数理生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 抗原識別における確率的ノイズの役割(A role of stochastic noise in ligand discrimination)2019
- 著者名/発表者名
  梶田真司, 合原一幸, 小林徹也
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] Deciphering latent growth mode of cells from cellular lineage trees2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  ワークショップ「数理腫瘍学の研究」
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] マウス着床前発生における細胞数半自動計測法を用いた産仔に繋がる胚の解析2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] Fitness response relation of a multitype age-structured population dynamics2019
- 著者名/発表者名
  杉山友規, 中島蒼, 小林徹也
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞ダイバーシティーへの数理的アプローチ2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第92回日本生化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] 細胞ダイバーシティーへの数理的アプローチ2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第92回日本生化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05096
[学会発表] Information processing in cellular systems and the fitness value of information2019
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Computational Principles in Active Perception and Reinforcement Learning in the Brain
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 細胞ダイバーシティーへの数理的アプローチ2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第92回日本生化学会大会：組織・臓器の構築と制御の統合的理解を目指した細胞ダイバーシティー研究
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-19H05799
[学会発表] 免疫学習の数理2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第３回理論免疫学ワークショップ
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H04814
[学会発表] T細胞集団の恒常性と多様性の数理的理解2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  1細胞解析と数理モデリングの融合がもたらす細胞社会ダイバーシティーの理解
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] 抗原識別における確率的ノイズの役割(A role of stochastic noise in ligand discrimination)2019
- 著者名/発表者名
  梶田真司, 合原一幸, 小林徹也
- 学会等名
  第57回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-18H05096
[学会発表] 情報から捉える生命現象2019
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会北海道キャラバン 2019
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-19H05794
[学会発表] A data-driven model for collective cell motion in Dictyostelium discoideum2018
- 著者名/発表者名
  Keizaburo Nishikino, Ryo Yokota, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06155
[学会発表] Analyzing and modeling of early embryo development2018
- 著者名/発表者名
  Takaaki Matsui, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  第56回日本生物物理学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06155
[学会発表] 細胞系譜から隠れた増殖モードを推定する2018
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第15回生物数学の理論とその応用 -次世代の数理科学への展開-
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06155
[学会発表] Modeling homeostatic dynamics of thymic T cell development2017
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Mathematical Innovation for Biomedicine
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] Theoretical analysis of thymic T cell development dynamics via interaction with thymic epithelial cells2017
- 著者名/発表者名
  Kazumasa Kaneko, Ryo Yokota, Taishin Akiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  EMBL conference Quantitative Principles in Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] A retrospective approach towards population dynamics under fluctuating environment / A retrospective analysis of the muti-state age-structured population dynamics2017
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi, and Yuki Sughiyama
- 学会等名
  Ancestral lines in populations under selection
- 招待講演 / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06155
[学会発表] 胸腺T細胞分化の数理モデリング2017
- 著者名/発表者名
  金子和正, 横田亮, 秋山泰身, 小林徹也
- 学会等名
  第2回理論免疫学WS
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] 胸腺における上皮細胞との相互作用によるT細胞分化制御の理論解析2017
- 著者名/発表者名
  金子和正, 横田亮, 秋山泰身, 小林徹也
- 学会等名
  第１回理論免疫学ワークショップ2017
- 発表場所
  JMSアステールプラザ, 広島
- 年月日
  2017-01-19
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] サンプル間における T 細胞受容体の定量的レパトア解析2017
- 著者名/発表者名
  横田亮, 神永祐貴，小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会　第八回年会
- 発表場所
  基礎生物学研究所
- 年月日
  2017-01-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] 力学系モデルによる免疫細胞の分化制御プロセスの理論解析2017
- 著者名/発表者名
  金子和正, 横田亮, 秋山泰身, 小林徹也
- 学会等名
  定量生物学の会　第八回年会
- 発表場所
  基礎生物学研究所
- 年月日
  2017-01-08
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Mathematical modeling of thymic T cell development via interaction with thymic epithelial cells2017
- 著者名/発表者名
  Kazumasa Kaneko, Ryo Yokota, Taishin Akiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  第46回日本免疫学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] Modeling homeostatic dynamics of thymic T cell development2017
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  LyonSysBio 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] 情報からとらえる生命現象2017
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  応用物理学会有機分子・バイオエレクトロニクス分科会2月研究会
- 発表場所
  東京大学駒場第 II キャンパス生産技術研究所大会議室
- 年月日
  2017-02-21
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H00800
[学会発表] Theoretical analysis of thymic T cell development via interaction with thymic epithelial cells2017
- 著者名/発表者名
  Kazumasa Kaneko, Ryo Yokota, Taishin Akiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 2017 (27th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-17KT0014
[学会発表] EM based algorithm to infer both phenotypic state and cell division properties from lineage information2017
- 著者名/発表者名
  So Nakashima, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  EMBL conference Quantitative Principles in Biology
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06155
[学会発表] 定量免疫学に向けて2017
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第１回理論免疫学ワークショップ2017
- 発表場所
  JMSアステールプラザ, 広島
- 年月日
  2017-01-19
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Modeling and inferring dynamics of T cell population dynamics in thymus2016
- 著者名/発表者名
  Kazumasa Kaneko, Ryo Yokota, Taishin Akiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  第45回日本免疫学会学術集会
- 発表場所
  沖縄コンベンションセンター
- 年月日
  2016-12-05
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Discreteness-induced transition in multi-body reaction systems2016
- 著者名/発表者名
  Yohei Saito, Yuki Sughiyama, Kunihiko Kaneko, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 2016 (26th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology
- 発表場所
  Shiiki Hall, Kyushu Univ, Fukuoka, Japan
- 年月日
  2016-09-07
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H00800
[学会発表] Quantification of intersample difference in TCR sequences2016
- 著者名/発表者名
  Ryo Yokota, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  第45回日本免疫学会学術集会
- 発表場所
  沖縄コンベンションセンター
- 年月日
  2016-12-05
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] 免疫細胞の分化プロセスの力学系によるモデリング2016
- 著者名/発表者名
  金子和正, 横田亮, 秋山泰身, 小林徹也
- 学会等名
  生命情報科学若手の会第8回研究会
- 発表場所
  北海道伊達市大滝セミナーハウスおよび北海道大学
- 年月日
  2016-10-12
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Modeling and inferring dynamics of T cell population in thymus2016
- 著者名/発表者名
  Kazumasa Kaneko, Ryo Yokota, Taishin Akiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 2016 (26th) annual meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology
- 発表場所
  Shiiki Hall, Kyushu Univ, Fukuoka, Japan
- 年月日
  2016-09-07
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Modeling and inferring dynamics of T cell population dynamics in thymus2016
- 著者名/発表者名
  Kazumasa Kaneko, Ryo Yokota, Taishin Akiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  生物物理学会第54回年会
- 発表場所
  つくば国際会議場
- 年月日
  2016-11-25
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Discreteness-induced transition in multi-body reaction systems2016
- 著者名/発表者名
  Yohei Saito, Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  生物物理学会第54回年会
- 発表場所
  つくば国際会議場
- 年月日
  2016-11-25
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PUBLICLY-15H00800
[学会発表] Steady State Thermodynamics in Population Dynamics2016
- 著者名/発表者名
  Yuki Sughiyama, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  生物物理学会第54回年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H06155
[学会発表] Quantification of the intersample difference in T cell population2016
- 著者名/発表者名
  Ryo Yokota, Yuki Kaminaga, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  生物物理学会第54回年会
- 発表場所
  つくば国際会議場
- 年月日
  2016-11-25
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Statistical analysis shows non-randomness of V/J gene selection in human TCR.2015
- 著者名/発表者名
  Yotaro Katayama, Ryo Yokota, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 44th Annual Meetings of The Japanese Society for Immunology
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター(北海道)
- 年月日
  2015-11-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] Systems-Biological Approaches for TCR Repertoire Analysis2015
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  The 44th Annual Meetings of The Japanese Society for Immunology
- 発表場所
  札幌コンベンションセンター(北海道)
- 年月日
  2015-11-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K14433
[学会発表] ミクロな細胞システムにおけるゆらぎと確率的情報処理2014
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  続日本ゆらぎ現象研究会
- 発表場所
  東京工業大学, 東京
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Information Decoding in Microscopic Biological Processes2013
- 著者名/発表者名
  T.J. Kobayashi
- 学会等名
  35th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Analysis of changes in Epigenetic gene expression by single cell2013
- 著者名/発表者名
  Masaya Oki, Tetsuya. J. Kobayashi
- 学会等名
  酵母からのエピジェネティクス研究へのメッセージ; ～酵母が明らかにする生命科学の最先端～
- 発表場所
  グランディア芳泉,福井
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 大局的細胞移動推定及び局所的相対位置関係類似度を用いた密な状態における3次元細胞トラッキング2013
- 著者名/発表者名
  備瀬竜馬、佐藤洋一、近藤晶子、小林徹也、大沼清
- 学会等名
  第16回画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013
- 発表場所
  国立情報学研究所、東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25460258
[学会発表] Dynamic Information Processing in Biological Sensing Systems2013
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Nonlinear Theory and Its Applications (NOLTA) 2013
- 発表場所
  Santa Fe, US
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Single-cell Stochastic Dynamics of Epigenetic Regulation in Yeast2013
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  NGS現場の会第三回研究会
- 発表場所
  神戸国際会議場,神戸
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Information Decoding in Microscopic Biological Processes2013
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  35th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
- 発表場所
  Osaka International Convension Center, Osaka, Japan
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Dynamic Information Processing in Biological Sensing Systems2013
- 著者名/発表者名
  T. J. Kobayashi
- 学会等名
  Nonlinear Theory and Its Applications 2013
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Information-theoretical Approach for Biological Sensing Phenomena2013
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  iCeMS One-Day Symposium on Theoretical and Computational Biology
- 発表場所
  iCeMs, Kyoto
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Analyzing Stochastic Dynamics of Cellular & Multi-cellular Systems2013
- 著者名/発表者名
  Kobayashi
- 学会等名
  The 61th NIBB Conference "Cellular Community in Mammalian Embryogenesis"
- 発表場所
  Okazaki Conference Center, Aichi, Japan
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 密な状況での細胞群の3次元追跡2013
- 著者名/発表者名
  備瀬竜馬、佐藤洋一、近藤晶子、小林徹也、大沼清
- 学会等名
  第13回東京大学生命科学シンポジウム
- 発表場所
  東京大学本郷キャンパス、東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25460258
[学会発表] Role of Adaptive Dynamics in Stochastic Cellular Sensing Systems2013
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第51回日本生物物理学会年会
- 発表場所
  国立京都国際会館
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Dynamics of Bayesian Inference and its Application to Cellular Decision-Making2013
- 著者名/発表者名
  T.J. Kobayashi
- 学会等名
  Information, probability and inference in systems biology (IPISB 2013)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Nuclear Centroids and Volumes Extraction from Four Dimensional Fluorescence Images: A Preliminary Study for Embryo Condition Assessment2013
- 著者名/発表者名
  Khayrul Bashar, Kazuo Yamagata, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  35th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
- 発表場所
  Osaka International Convension Center, Osaka, Japan
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Nuclei Identification from Fluorescence Images using Graph Mining2013
- 著者名/発表者名
  Khayrul Bashar, Kazuo Yamagata, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  35th Annual International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society
- 発表場所
  Osaka International Convension Center, Osaka, Japan
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] "Dynamics of Bayesian Inference and its Application to Cellular Decision-Making"2013
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Information, probability and inference in systems biology (IPISB 2013)
- 発表場所
  ICMS, Edinburgh, UK,
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Bayesian Information Processing in Stochastic Biological Systems2013
- 著者名/発表者名
  T.J. Kobayashi
- 学会等名
  International Conference of Noise and Fluctuation 2013
- 発表場所
  Montpellier, France
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 情報ダイナミクスの生命科学2012
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 - 情報計算化学生物学会
- 発表場所
  タワーホール船堀
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 細胞システムにおける確率的情報処理2012
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  システム分子行動学　数理シンポジウム
- 発表場所
  東京大学
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Detection of Three Dimensional Centroids of Cell Nuclei from Fluorescence Microscopy Images2012
- 著者名/発表者名
  Md. Khayrul Bashar, Koji Komatsu, Toshihiko Fujimori, and Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  CDB Symposium 2012 Quantitative Developmental Biology
- 発表場所
  Riken, Kobe, Japan
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Segmenting Cell Nuclei from Three Dimensional Fluorescence Microscopy Images2012
- 著者名/発表者名
  Md. Khayrul Bashar, Koji Komatsu, Toshihiko Fujimori, and Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Joint symposium by JST/BBSRC(UK) Molecular Imaging and Systems Biology
- 発表場所
  University of Tokyo, Japan
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Bayesian Approach for Cellular Information Processing2012
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Dynamic Days Asia Pacific 7
- 発表場所
  Taipei, Taiwan
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 細胞システムにおける確率的情報処理の数理2012
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  情報統計力学の最前線　―確率が繋ぐ自然現象と情報処理の数理―
- 発表場所
  東北大学
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 情報ダイナミクスの生命科学2012
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  生命医薬情報学連合大会 -情報計算化学生物学会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Statistical approach towards intracellular information processing2012
- 著者名/発表者名
  Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  Workshop on Applied Physics and Statistics for Quantitative Biology
- 発表場所
  The Institute of Statistical Mathematics, Research and Organization of Information and Systems, JAPAN
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 生体システムにおける情報ダイナミクス2012
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  ネットワーク構造と生命現象
- 発表場所
  JR博多シティ　大会議室
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Improved detection of cell centroids from fluorescence images by adaptive filtering2012
- 著者名/発表者名
  Md. Khayrul Bashar, Koji Komatsu, Toshihiko Fujimori, and Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  International conference of Systems Biology 2012
- 発表場所
  Univ. Toronto,Toronto, Canada
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Mathematical modeling for cost-effective cell-cell communication2012
- 著者名/発表者名
  Tomoyuki Yamada, Atsushi Kamimura, Tetsuya J. Kobayashi
- 学会等名
  International Symposium on Artificial Life and Robotics 17th '12
- 発表場所
  Beppu, Japan
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Three dimensional cell nuclei extraction from fluorescence microscopy images using locally adaptive threshold2011
- 著者名/発表者名
  M.K.Bashar, K.Komatsu, Tetesuya J.Kobayashi, T.Fujimori
- 学会等名
  ICSB2011 Workshop Microscopic Image Analysis with Applications in Biology (MIAAB'2011)
- 発表場所
  ドイツ・ハイデルベルグ
- 年月日
  2011-09-02
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 定量的な生命科学と情報・数理技術2011
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第84回日本生化学会大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] バイオイメージインフォマティクス～理論生物学・定量生物学の視点から～2011
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ2011
- 発表場所
  理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(交流棟1階)
- 年月日
  2011-01-28
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 細胞間信号伝達におけるコミュニケーションコストの数理的解析2011
- 著者名/発表者名
  山田智之, 上村淳, 小林徹也
- 学会等名
  第21回日本数理生物学会年会
- 発表場所
  明治大学リバティータワー
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] バイオイメージングと画像情報処理の技術 : 定量的な解析にむけて2011
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  日本顕微鏡学会第55回シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Mathematical analysis of cost-effective cell-cell communication(コストを考慮した細胞間コミュニケーションの数理的解析)2011
- 著者名/発表者名
  山田智之, 上村淳, 小林徹也
- 学会等名
  第49回生物物理学会年会
- 発表場所
  兵庫県立大学姫路書写キャンパス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Detecting Nuclei-centroids of Mouse Embryonic Cells from Fluorescence Microscopy Images2011
- 著者名/発表者名
  M.K.Bashar, K.Komatsu, Tetesuya J.Kobayashi, T.Fujimori
- 学会等名
  International conference of Systems Biology 2011
- 発表場所
  ドイツ・ハイデルベルグ
- 年月日
  2011-08-30
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] バイオイメージングと画像情報処理の技術：定量的な解析にむけて2011
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  日本顕微鏡学会第55回シンポジウム
- 発表場所
  サンポート高松　かがわ国際会議場
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] GPGPUを用いたバイオイメージの高速画像処理2011
- 著者名/発表者名
  舟橋啓, 太田信之, 小林徹也, 広井賀子
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ2011
- 発表場所
  理化学研究所横浜研究所
- 年月日
  2011-01-28
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 定量的な生命科学と情報・数理技術2011
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第84回日本生化学会大会
- 発表場所
  国立京都国際会館
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 定量的な生命科学とバイオイメージング2010
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第19回日本バイオイメージング学会学術集会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 細胞機能としての情報処理2010
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] Towards Automatic Cell Segmentation and Tracking Using Fluorescence Microscopy Images2010
- 著者名/発表者名
  M.K.Bashar, T.J.Kobayashi
- 学会等名
  定量生物学の会第三回年会
- 発表場所
  東京大学・生産技術研究所
- 年月日
  2010-11-27
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 定量的な生命科学とバイオイメージング2010
- 著者名/発表者名
  小林徹也
- 学会等名
  第19回日本バイオイメージング学会学術集会
- 発表場所
  慶應義塾大学日吉キャンパス来往舎
- 年月日
  2010-09-10
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 画像解析によるin vivo細胞内粒子運動の統計的性質の解析2010
- 著者名/発表者名
  小林徹也, 舟橋啓, 春本敏之, 太田信之, 上田泰己, 上村匡
- 学会等名
  MIRU2010 Workshop:細胞内画像処理
- 発表場所
  釧路・釧路市国際交流センター
- 年月日
  2010-07-26
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] AUTOMATIC SEGMENTATION OF ABDOMINAL BLOOD VESSELS FROM CONTRASTED X-RAY CT IMAGES2010
- 著者名/発表者名
  M.K.Bashar, K.Mori, T.J.Kobayashi
- 学会等名
  6th International Conference on Electrical & Computer Engineering (ICECE) 2010
- 発表場所
  Dhaka, Bangladesh
- 年月日
  2010-12-18
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-21116006
[学会発表] 3D Cell Tracking under dense cell culture conditions by preserving the structure of neighbor cells
- 著者名/発表者名
  Ryoma Bise, Yoichi Sato, Akiko Kondow, Tetsuya J. Kobayashi, Kiyoshi Ohnuma
- 学会等名
  IEEE International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2014
- 発表場所
  北京、中華人民共和国
- 年月日
  2014-04-29 – 2014-05-02
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-25460258

1. 藤森俊彦 (80301274)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
2. 舟橋啓 (70324548)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 4件
3. 近藤晶子 (90396838)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
4. 大沼清 (50396834)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 3件
5. 野中茂紀 (90435529)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 0件
6. 横田亮 (80733154)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 11件
7. 佐々木洋 (10211939)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
8. 目野主税 (20311764)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 鈴木厚 (00264606)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 広井賀子 (20548408)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
11. 本多久夫 (10289118)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
12. 仲矢由紀子 (70415256)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
13. 堀昌平 (50392113)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
14. 佐藤洋一 (70302627)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 3件
15. 山村雅幸 (00220442)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
16. 小長谷明彦 (00301200)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
17. 鈴木泰博 (50292983)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
18. 望月敦史 (10304726)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 高安美佐子 (20296776)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
20. 小野功 (20078166)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
21. 伊藤浩史 (20512627)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
22. 関根亮二 (70730232)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
23. 秋山泰身 (50327665)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
24. 若本祐一 (30517884)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
25. 岡田康志 (50272430)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
26. 佐々真一 (30235238)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
27. 石島秋彦 (80301216)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
28. 沙川貴大 (60610805)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
29. 伊藤創祐 (00771221)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
30. 澤井哲 (20500367)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
31. 竹内一将 (50622304)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
32. 川口喬吾 (00787319)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
33. 青木一洋 (80511427)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
34. 松岡里実 (00569733)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
35. 神原丈敏 (40451637)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
36. 福岡創 (50447190)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
37. 榎佐和子 (50467635)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
38. 池崎圭吾 (10722960)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
39. 蔡栄淑 (40378716)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
40. 森下喜弘 (00404062)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
41. 岩城光宏 (30432503)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
42. 猪股秀彦 (60372166)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
43. 中島昭彦 (90612119)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
44. 堅山耀太郎

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
45. 神永祐貴

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
46. 金子和正

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 6件
47. 梶田真司

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
48. 山縣一夫

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
49. 秋山伸子

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 2件
50. 上村淳

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 4件
51. 杉山友規

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件
52. 好村滋行

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件

小林 徹也 KOBAYASI TETSUYA

研究課題

研究成果

共同研究者

進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理領域代表者

領域代表者

研究期間 (年度)

研究種目

進化情報アセンブリによる生命機能の創出原理研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

進化情報アセンブリの統合理論と進化則の解読技術の構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

自己複製過程の熱力学の構築研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

原生知能のための最適性理論の構築と応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

複雑ダイナミクスを内包しうる計算原理理論の構築と応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

細胞複製能の階層横断的理解研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

情報物理学でひもとく生命の秩序と設計原理

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

適応過程の情報物理学的理解研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

深層ネットワークを援用した表現型制約と表現型進化原理の探索と普遍構造の探求研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

低次元化に基づく免疫受容体配列ダイバーシティ解析手法の改良と応用展開研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究機関

免疫恒常性の定量生物学研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

発生系譜のインフォマティクス技術の構築と、胚の生きの良さの定量化への応用研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

シーケンスデータに基づく、免疫レパートリ構造の統計的解析手法の構築研究代表者

研究代表者

小林徹也 KOBAYASI TETSUYA