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SHIMIZU Hiroshi  清水 浩

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SHIMIZU Hioroshi  清水 浩

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Researcher Number 00226250
Other IDs
Affiliation (Current) 2022: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2011 – 2022: 大阪大学, 情報科学研究科, 教授
2009 – 2011: Osaka University, 大学院・情報科学研究科, 教授
2007: Osaka University, Graduate School of Information Science and Technology, Professor
2006: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 教授
2003 – 2005: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 教授 … More
2004: 大阪大学, 情報科学研究科, 教授
1998 – 2001: 大阪大学, 大学院・工学研究科, 助教授
1995 – 1997: Department of Biotechnology, Faculty of Engineering. Osaka University, Associate, 工学部, 助教授
1990 – 1994: Faculty of Engineering, Osaka University, Assistant Professor, 工学部, 助手 Less
Review Section/Research Field
Principal Investigator
生物・生体工学 / Biofunction/Bioprocess / Bioinformatics/Life informatics / Biological Sciences / Biofunction/Bioprocess / Chemical engineering and related fields / Broad Section D / Medium-sized Section 27:Chemical engineering and related fields / Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
Except Principal Investigator
生物・生体工学 / 化学工学 / Biofunction/Bioprocess / Biological Sciences
Keywords
Principal Investigator
ゲノムスケールモデル / 代謝フラックス解析 / 光合成 / シミュレーション / 代謝フラックス / 代謝反応モデル / DNAマイクロアレイ / ストレス耐性 / 進化工学 / 物質生産 … More / 代謝工学 / ゲノムスケール代謝モデル / 生物情報工学 / 指向性進化 / ファジィ理論 / 状態認識 / ファジィメンバシップ関数 / 代謝反応モルフラックス / エラーベクトル / 画像解析 / 糸状菌 / オートレギュレータ / 抗生物質生産 / 形態変化 / 大腸菌 / 生命体情報ネットワーク / 細胞間相互作用 / 適応 / フローサイトメトリー / 連続培養系 / GFP / ダイナミクス / 生物ネットワーク / 細胞集団 / フローサイトメータ / ダイナミクス解析 / ゲノム / 変異解析 / バイオプロダクション / 発現プロファイル / 比増殖速度 / 微細藻類 / 強光条件 / マルチオミクス / 乳酸菌 / 酵母 / 混合培養 / ナイシン / カスケード制御 / バクテリオシン / 溶存酸素濃度 / マルトース / ラクトース / lactic acid bacteria / yeasts / mixed culture / nisin / cascade controller / bacteriocin / dissolved oxygen concentration / maltose / 生分解性ポリマー / モル分率 / ランダム共重合 / ブロック共重合 / 多変数制御 / モデル予測制御 / 分解特性 / Biodegradable polymer / Metabolic Engineering / Mole Fraction of Monomer Units / Random Copolymer / Block Copolymer / Multivariable Controller / Model Predictive Controller / インシリコ代謝変動予測 / 同位体標識トレース実験 / 微生物生産 / in silica prediction / metabolic flux analysis / isotope trace experiment / Genome scale model / microbial production / システム生物学 / システムバイオテクノロジー / システムバイオロジー / 反応速度論 / インシリコデザイン / がん細胞 / 代謝解析 / ロボット / マイクロリアクタ / 有用物質生産 / 変動光 … More
Except Principal Investigator
乳酸菌 / Enterococcus faecium / 比増殖速度 / PF System / モデル化 / Specific growth rate / PHB / NMR / 酵母 / Lactic acid bacteria / エンテロシンA / バクテリオシン / シャトルベクター / E.faecium / Lactobacillus kefiranofaciens / グルタチオン / グルタチオン化生産速度 / 推定制御系 / 拡張カルマンフィルタ- / 最大原理 / 最適パタ-ン / グルタチオン比生産速度 / 拡張カルマンフイルタ- / 最適バタ-ン / PFystem / 最適化 / Glutathione / Estimation and control system / Extended Kalman filter / Specific production rate of glutathione / Maximum principle / Optimal profile of mu / 生分解性ポリマー / P(HB-co-HV)共重合物 / 分子量分布 / 共重合分率 / 基質濃度制御 / P(HB-HV)共重合物 / 一次マルコフ鎖過程 / 生分解性ポリマ- / ポリヒドロキシ酪酸 / 残存生物量 / 高分子重合度 / GPC / biodegradable polymer / P(HB-co-HV) / molecular weight distribution / mole fraction in copolymer / control of substrate concentration / 遺伝子組み換え酵母 / 温度感受性 / α-アミラーゼ / 酸性ホスファターゼ / 2段培養 / ∂ーアミラ-ゼ / 酸性ホスファタ-ゼ / Recombinant yeast / Temperature-sensitive / Rice-alpha-amylase / Acidic phosphatase / Two-stage production / プロピオン酸菌 / フローサイトメトリー / 混合培養 / 抗菌物質ナイシン / ウィスキー醸造 / マルトオリゴ糖 / フローサイトメータ / Yeast / Synergic interaction / Propionic acid bacteria / Flowcytometry / Mixed culture / Antibiotic nisin / 温度感受性組換え酵母 / 異常診断 / 自己想起型ニューラルネットワーク / ウェーブレットフィルタ / 状態認識 / ウェーブレット変換 / temperature controllable gene expression / autoassociative neural network / fault diagnosis / wavelet filter / バクテリオシン耐性遺伝子 / 発酵食品 / Lactobacillus plantarum / enterocin A / bacteriocin / shuttle vector / E. faecium / immunity for enterocin A / 糖鎖構造 / EnterocinA / Bacteriocin / Shuttle vector / Structure of sugar moiety / 共培養 / ケフィラン / yeast / co-culture / mathematical modeling / kefiran / 光合成 Less
  • Research Projects

    (24 results)
  • Research Products

    (295 results)
  • Co-Researchers

    (34 People)
  •  微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析Principal Investigator

    • Principal Investigator
      清水 浩
    • Project Period (FY)
      2021 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • Review Section
      Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
    • Research Institution
      Osaka University
  •  High performance microbial cell factories development by model based metabolic design and adaptive laboratory evolutionPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      清水 浩
    • Project Period (FY)
      2019 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
    • Review Section
      Broad Section D
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Identification of rate limiting step in metabolic pathway for bioproductions based on genome scale modelPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      清水 浩
    • Project Period (FY)
      2019
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • Review Section
      Medium-sized Section 27:Chemical engineering and related fields
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Development of Simulation System of Cancer MetabolismPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2017 – 2018
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • Research Field
      Chemical engineering and related fields
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Intracellular metabolism control of the proton motive forcePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Shimizu Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2016 – 2020
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Identification of Limiting Step and Optimization of Metabolism based on Analysis of Dynamic Behaviors of Multilayers Omics DataPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2016 – 2018
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biofunction/Bioprocess
    • Research Institution
      Osaka University
  •  新光合成:光エネルギー変換システムの再最適化

    • Principal Investigator
      皆川 純
    • Project Period (FY)
      2016 – 2020
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      National Institute for Basic Biology
  •  Creation of Stress Tolerant Microbial Cell Factories based on Multiomics Analysis of Laboratory Evolution ProcessPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU HIROSHI
    • Project Period (FY)
      2012 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • Research Field
      Biofunction/Bioprocess
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Study on inhibitory effect of high light on the cell growth and adaptation mechanism of cyanobacteriaPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2011 – 2012
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Biofunction/Bioprocess
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Creation of stress tolerant strain based on single nucleotide mutational analysis of in whole genomePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2009 – 2011
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biofunction/Bioprocess
    • Research Institution
      Osaka University
  •  In silica Design of Metabolic Pathway of Yet for Bio-ProductionofEnvironmental-Conscious Chemical ProductsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2006 – 2007
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biofunction/Bioprocess
    • Research Institution
      Osaka University
  •  大腸菌細胞間相互作用をとおしてみた生命体情報ネットワークPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      清水 浩
    • Project Period (FY)
      2004 – 2005
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • Research Field
      Bioinformatics/Life informatics
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Development of Strategy for Fermentative Production Based on Symbiosis of Microorganisms

    • Principal Investigator
      SHIOYA Suteaki
    • Project Period (FY)
      2003 – 2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biofunction/Bioprocess
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Analysis of sugar moiety of enterocin from Enterococcus faecium N15

    • Principal Investigator
      SHIOYA Suteaki
    • Project Period (FY)
      2000 – 2001
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Quality Control of a Biodegradable Polymer using A Multivariable Controller, based on Metabolic Pathway InformaionPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU Hiroshi
    • Project Period (FY)
      2000 – 2001
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Isolation of a novel bacteriocin-producing lactic acid bacteria and its use in food preservation

    • Principal Investigator
      SHIOYA Suteaki
    • Project Period (FY)
      1998 – 1999
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Development of a novel controller for antimicrobial nisin production, using interaction of microorganismsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      SHIMIZU Hiroshi
    • Project Period (FY)
      1998 – 1999
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Development of an on-line fault diagnosis and operation system for an optimal rice-alphaamylase production process of temperature-sensitive mutant of Saccharomyces cerevisiae by autoassociative neural network

    • Principal Investigator
      SHIOYA Suteaki
    • Project Period (FY)
      1996 – 1997
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  画像処理装置を用いた放線菌の形態解析と抗生物質最大生産への応用Principal Investigator

    • Principal Investigator
      清水 浩
    • Project Period (FY)
      1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  ファジィ理論と代謝反応モデルを用いた培養状態認識法の開発Principal Investigator

    • Principal Investigator
      清水 浩
    • Project Period (FY)
      1994
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  The Role of Lactic Acid Bacteria and its Application to Fermentation Processes by Ecosystem Engineering Approach.

    • Principal Investigator
      SHIOYA Suteaki
    • Project Period (FY)
      1994 – 1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
    • Research Field
      生物・生体工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Computer Control of Biodegradable Polymer Production Process by Alcaligenes eutrophus

    • Principal Investigator
      SUGA Ken-ichi
    • Project Period (FY)
      1991 – 1993
    • Research Category
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
    • Research Field
      化学工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Construction of Useful Temperature-dependent Gene Expresssion System in S. cerevisiae and It's Application to a Cultivation Process

    • Principal Investigator
      SHIOYA Suteaki
    • Project Period (FY)
      1991 – 1992
    • Research Category
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
    • Research Field
      化学工学
    • Research Institution
      Osaka University
  •  Computer Control of Glutathione Production Process by Saccharomycescerevisiae

    • Principal Investigator
      SHIOYA Suetaki
    • Project Period (FY)
      1989 – 1990
    • Research Category
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
    • Research Field
      化学工学
    • Research Institution
      Osaka University

All 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 2004 2003 Other

All Journal Article Presentation Book

  • [Book] 代謝センシング -健康,食,美容,薬,そして脳の代謝を知る- 第25章 動物培養細胞の13C代謝フラックス解析2018

    • Author(s)
      岡橋伸幸、松田史生、清水浩
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • ISBN
      9784781313504
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [Book] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 4: Indsutrial Biotechnology Products and Processes, Chapter 11. Glutamic acid fermentation: Discovery of glutamic acid-producing microorganisms, analysis of the production mechanism, metabolic engineering and industrial production process2017

    • Author(s)
      Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • Total Pages
      22
    • Publisher
      Wiley-VCH
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Book] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 8, Control of Microbial Processes2017

    • Author(s)
      Kazuyuki Shimizu, Hiroshi Shimizu, Toshiomi Yoshida,
    • Total Pages
      22
    • Publisher
      Wiley-VCH
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Book] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 7, Omics integrations for the state analysis of microbial processes2017

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu, Chikara Fursawa, Takashi Hirasawa, KatsunoriYoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, and Fumio Matsuda
    • Total Pages
      36
    • Publisher
      Wiley-VCH
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Book] BIOTECHNOLOGY, Wiley-VCH book series, Weinheim, Vol 5: Applied Bioengineering: Innovations and Future Directions, Chapter 7, Omics integrations for the state analysis of microbial processes2017

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu, Chikara Fursawa, Takashi Hirasawa, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Tomokazu Shirai, and Fumio Matsuda
    • Total Pages
      36
    • Publisher
      Wiley-VCH
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Book] Chapter 17 Glutamic Acid2014

    • Author(s)
      Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • Total Pages
      22
    • Publisher
      Weiley
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Book] 日経新聞2012

    • Author(s)
      清水浩
    • Total Pages
      14
    • Publisher
      日本経済新聞社
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [Book] 合成生物工学の隆起 ―有用物質の新たな生産法構築をめざして― 第3章 オミクス解析の視点2012

    • Author(s)
      清水 浩
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Book] バイオにもコンピュータが役立つってホント?ひらく、ひらく「バイオの世界」、14歳からの生物工学入門2012

    • Author(s)
      清水 浩
    • Total Pages
      2
    • Publisher
      化学同人
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Book] バイオ素材から樹脂原料2012

    • Author(s)
      清水 浩
    • Total Pages
      14
    • Publisher
      日経新聞
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Book] 高等研報告書1005,生物進化の持続性と転移,第2章大腸菌の長期植え継ぎ培養における表現型・遺伝子型の網羅的解析2011

    • Author(s)
      古澤力, 堀之内貴明, 清水浩
    • Publisher
      財団法人国際高等研究所
    • URL

      http://www-shimizu.ist.osaka-u.ac.jp/

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Book] 高等研報告書1005生物進化の持続性と転移(研究代表者津田一郎)2011

    • Author(s)
      古澤力, 堀之内貴明, 清水浩
    • Publisher
      第2章大腸菌の長期植え継ぎ培養における表現型・遺伝子型の網羅的解析
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Book] メタボロミクスの先端技術と応用第14章メタボロームデータを用いた代謝フラックス解析2008

    • Author(s)
      清水浩、古澤力、白井智量
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Book] バイオプロダクション 第4章 : メタボリックエンジニアリング2006

    • Author(s)
      清水 浩
    • Total Pages
      195
    • Publisher
      コロナ社
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Book] Bioproduction Chapter 4 Metabolic Engineering2006

    • Author(s)
      Hiroshi, ShimizuS (H., Chtake, ed.)
    • Total Pages
      195
    • Publisher
      Corona Inc
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Mutations in hik26 and slr1916 lead to high-light stress tolerance in Synechocystis sp. PCC68032021

    • Author(s)
      Yoshikawa Katsunori、Ogawa Kenichi、Toya Yoshihiro、Akimoto Seiji、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 4

    • DOI

      10.1038/s42003-021-01875-y

    • NAID

      120007028956

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Journal Article] Estimation of linear and cyclic electron flows in photosynthesis based on 13C-metabolic flux analysis2021

    • Author(s)
      Yamamoto Chiaki、Toyoshima Masakazu、Kitamura Sayaka、Ueno Yoshifumi、Akimoto Seiji、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 131 Issue: 3 Pages: 277-282

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.11.002

    • NAID

      40022515104

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Identification of a rate-limiting step in a metabolic pathway using the kinetic model and in vitro experiment2021

    • Author(s)
      Kitamura Sayaka、Shimizu Hiroshi、Toya Yoshihiro
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 131 Issue: 3 Pages: 271-276

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2020.10.008

    • NAID

      40022515098

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626, KAKENHI-PROJECT-18K04850
  • [Journal Article] Role of type I NADH dehydrogenase in Synechocystis sp. PCC 6803 under phycobilisome excited red light2021

    • Author(s)
      Toyoshima Masakazu、Yamamoto Chiaki、Ueno Yoshifumi、Toya Yoshihiro、Akimoto Seiji、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Plant Science

      Volume: 304 Pages: 110798-110798

    • DOI

      10.1016/j.plantsci.2020.110798

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Thioredoxin pathway in Anabaena sp. PCC 7120: activity of NADPH-thioredoxin reductase C2021

    • Author(s)
      Deschoenmaeker Frederic、Mihara Shoko、Niwa Tatsuya、Taguchi Hideki、Wakabayashi Ken-Ichi、Toyoshima Masakazu、Shimizu Hiroshi、Hisabori Toru
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: -

    • DOI

      10.1093/jb/mvab014

    • NAID

      40022687787

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Transcription Factor ArcA is a Flux Sensor for the Oxygen Consumption Rate inEscherichia coli2020

    • Author(s)
      Nochino Naoya、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Biotechnology Journal

      Volume: 15 Pages: 1900353-1900353

    • DOI

      10.1002/biot.201900353

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626, KAKENHI-PROJECT-18K04850
  • [Journal Article] Flux controlling technology for central carbon metabolism for efficient microbial bio-production2020

    • Author(s)
      Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Current Opinion in Biotechnology

      Volume: 64 Pages: 169-174

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2020.04.003

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Journal Article] 光照射により代謝フラックスをコントロールする技術の開発2020

    • Author(s)
      戸谷吉博、清水浩
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 78 Pages: 31-32

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Journal Article] Assessment of Protein Content and Phosphorylation Level in Synechocystis sp. PCC 6803 under Various Growth Conditions Using Quantitative Phosphoproteomic Analysis2020

    • Author(s)
      Toyoshima Masakazu、Tokumaru Yuma、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 25 Pages: 3582-3582

    • DOI

      10.3390/molecules25163582

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Flux balance analysis of cyanobacteria reveals selective use of photosynthetic electron transport components under different spectral light conditions2020

    • Author(s)
      Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Photosynthesis Research

      Volume: 143 Pages: 31-43

    • DOI

      10.1007/s11120-019-00678-x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Novel allosteric inhibition of phosphoribulokinase identified by ensemble kinetic modeling of Synechocystis sp. PCC 6803 metabolism2020

    • Author(s)
      Nishiguchi Hiroki、Liao James、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • Journal Title

      Metabolic Engineering Communications

      Volume: 11

    • DOI

      10.1016/j.mec.2020.e00153

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PLANNED-17H06303
  • [Journal Article] Prediction of Rate‐Limiting Reactions for Growth‐Associated Production Using a Constraint‐Based Approach2019

    • Author(s)
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Biotechnology Journal

      Volume: 14 Pages: 1800431-1800431

    • DOI

      10.1002/biot.201800431

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H00839
  • [Journal Article] Time-resolved analysis of short term metabolic adaptation at dark transition in Synechocystis sp. PCC68032019

    • Author(s)
      Maruyama Masaharu、Nishiguchi Hiroki、Toyohima Masakazu、Okahashi Nobuyuki、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Bioscience Bioengineering

      Volume: -

    • NAID

      40022037144

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Targeted proteome analysis of microalgae under high-light conditions by optimized protein extraction of photosynthetic organisms2019

    • Author(s)
      Toyoshima, M., Sakata, M., Ohnishi, K., Tokumaru, Y., Kato, Y., Tokutsu, R., Sakamoto, W., Minagawa, J., Matsuda, F., Shimizu, H.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 127 Issue: 3 Pages: 394-402

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.09.001

    • NAID

      40021846292

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K06290, KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PLANNED-16H06553
  • [Journal Article] Transomics data-driven, ensemble kinetic modeling for system-level understanding and engineering of the cyanobacteria central metabolism2019

    • Author(s)
      Nishiguchi Hiroki、Hiasa Natsuki、Uebayashi Kiyoka、Liao James、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • Journal Title

      Metabolic Engineering

      Volume: 52 Pages: 273-283

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2019.01.004

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PLANNED-17H06303
  • [Journal Article] High-yielding rice Takanari has superior photosynthetic response to a commercial rice Koshihikari under fluctuating light.2019

    • Author(s)
      Adachi Shunsuke、Tanaka Yu、Miyagi Atsuko、Kashima Makoto、Tezuka Ayumi、Toya Yoshihiro、Kobayashi Shunzo、Ohkubo Satoshi、Shimizu Hiroshi、Kawai-Yamada Maki、Sage Rowan F、Nagano Atsushi J、Yamori Wataru
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany

      Volume: 70 Pages: 5287-5297

    • DOI

      10.1093/jxb/erz304

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18K19164, KAKENHI-PROJECT-18K14386, KAKENHI-PROJECT-18KK0170, KAKENHI-PLANNED-16H06556, KAKENHI-PLANNED-16H06559, KAKENHI-PUBLICLY-19H04715, KAKENHI-PROJECT-18H02165, KAKENHI-PROJECT-18H02185
  • [Journal Article] 計算機工学に基づく代謝設計とその有効性の実証に関する研究2019

    • Author(s)
      清水 浩
    • Journal Title

      生物工学誌

      Volume: 97 Pages: 13-20

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Journal Article] Magnesium starvation improves production of malonyl-CoA-derived metabolites in Escherichia coli2019

    • Author(s)
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio、Cress Brady F.、Koffas Mattheos A.G.、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Metabolic Engineering

      Volume: 52 Pages: 215-223

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2018.12.002

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Journal Article] Metabolic flux of the oxidative pentose phosphate pathway under low light conditions in Synechocystis sp. PCC 68032018

    • Author(s)
      Ueda Kentaro、Nakajima Tsubasa、Yoshikawa Katsunori、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 126 Issue: 1 Pages: 38-43

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.01.020

    • NAID

      40021601004

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Comparative Targeted Proteomics of the Central Metabolism and Photosystems in SigE Mutant Strains of Synechocystis sp. PCC 68032018

    • Author(s)
      Tokumaru Yuma、Uebayashi Kiyoka、Toyoshima Masakazu、Osanai Takashi、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 23 Pages: 1051-1051

    • DOI

      10.3390/molecules23051051

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Optimal 13C-labeling of glycerol carbon source for precise flux estimation in Escherichia coli2018

    • Author(s)
      Toya Yoshihiro、Ohashi Shugo、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 125 Issue: 3 Pages: 301-305

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2017.09.009

    • NAID

      210000005652

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Journal Article] Application of adaptive laboratory evolution to overcome a flux limitation in an Escherichia coli production strain2018

    • Author(s)
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、Horinouchi Takaaki、Furusawa Chikara、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Biotechnology and Bioengineering

      Volume: 115 Pages: 1542-1551

    • DOI

      10.1002/bit.26568

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17K15052, KAKENHI-PROJECT-16H04576, KAKENHI-PROJECT-15J06350
  • [Journal Article] Transcriptome analysis of the cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803 and mechanisms of photoinhibition tolerance under extreme high light conditions2018

    • Author(s)
      Ogawa Kenichi、Yoshikawa Katsunori、Matsuda Fumio、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 126 Issue: 5 Pages: 596-602

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2018.05.015

    • NAID

      40021726334

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Learning from quantitative data to understand central carbon metabolism.2018

    • Author(s)
      Matsuda Fumio、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Biotechnology Advances

      Volume: 35 Pages: 971-980

    • DOI

      10.1016/j.biotechadv.2017.09.006

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-17H06303, KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Journal Article] Metabolic engineering of mevalonate-producing Escherichia coli strains based on thermodynamic analysis2018

    • Author(s)
      Nagai Hikaru、Masuda Ami、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Metabolic Engineering

      Volume: 47 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.ymben.2018.02.012

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-17H06303, KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Journal Article] Mass Spectrometry-Based Method to Study Inhibitor-Induced Metabolic Redirection in the Central Metabolism of Cancer Cells2018

    • Author(s)
      Araki Chie、Okahashi Nobuyuki、Maeda Kousuke、Shimizu Hiroshi、Matsuda Fumio
    • Journal Title

      Mass Spectrometry

      Volume: 7 Issue: 1 Pages: A0067-A0067

    • DOI

      10.5702/massspectrometry.a0067

      10.5702/massspectrometry.A0067

    • NAID

      130007396785

    • ISSN
      2186-5116, 2187-137X
    • Language
      English
    • Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [Journal Article] Metabolic engineering of isopropyl alcohol-producing Escherichia coli strains with 13C-metabolic flux analysis2017

    • Author(s)
      Okahashi Nobuyuki、Matsuda Fumio、Yoshikawa Katsunori、Shirai Tomokazu、Matsumoto Yoshiko、Wada Mitsufumi、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Biotechnolgy and Bioengineering

      Volume: 114 Pages: 2782-2793

    • DOI

      10.1002/bit.26390

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Journal Article] 13C-metabolic flux analysis for mevalonate-producing strain of Escherichia coli2017

    • Author(s)
      Keisuke Wada, Yoshihiro Toya, Satomi Banno, Katsunori Yoshikawa, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 123 Issue: 2 Pages: 177-182

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2016.08.001

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Journal Article] Metabolic engineering of Synechocystis sp. PCC 6803 for enhanced ethanol production based on flux balance analysis2017

    • Author(s)
      Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Bioprocess and Biosystems Engineering

      Volume: 40 Pages: 1-6

    • DOI

      10.1007/s00449-017-1744-8

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Identification of alcohol stress tolerance genes of Synechocystis sp. PCC 6803 using adaptive laboratory evolution2017

    • Author(s)
      Matsusako Takuya、Toya Yoshihiro、Yoshikawa Katsunori、Shimizu Hiroshi
    • Journal Title

      Biotechnology for Biofuels

      Volume: 10 Pages: 307-307

    • DOI

      10.1186/s13068-017-0996-5

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Metabolic flux analysis of Synechocystis sp. PCC6803 ΔnrtABCD mutant reveals a mechanism for metabolic adaptation to nitrogen-limited conditions2016

    • Author(s)
      Tsubasa Nakajima, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda, and Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 58 Pages: 537-545

    • DOI

      10.1093/pcp/pcx047

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Recent advances in amino acid production by microbial cells.2016

    • Author(s)
      Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Current Opinion in Biotechnology

      Volume: 42 Pages: 133-146

    • DOI

      10.1016/j.copbio.2016.04.017

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576, KAKENHI-PROJECT-16K14881
  • [Journal Article] Combinatorial deletions of glgC and phaCE enhance ethanol production in Synechocystis sp. PCC 68032016

    • Author(s)
      Katsunori Namakoshi, Tubasa Nakajima, Katsunori Yoshikawa, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology

      Volume: 239 Pages: 13-19

    • DOI

      10.1016/j.jbiotec.2016.09.016

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Journal Article] Enhancement of 1,5-diaminopentane production in a recombinant strain of <i>Corynebacterium glutamicum</i> by Tween 40 addition2016

    • Author(s)
      Yuta Matsushima, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      The Journal of General and Applied Microbiology

      Volume: 62 Issue: 1 Pages: 42-45

    • DOI

      10.2323/jgam.62.42

    • NAID

      130005127286

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • Language
      English
    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Metabolomic analysis of acid stress response in Saccharomyces cerevisiae2015

    • Author(s)
      Riyanto Heru Nugroho, Katsunori Yoshikawa, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 120 Issue: 4 Pages: 396-404

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2015.02.011

    • NAID

      110010010221

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Phenotypic Convergence in Bacterial Adaptive Evolution to Ethanol Stress2015

    • Author(s)
      Takaaki Horinouchi, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shizmiu, Chikara Furusawa
    • Journal Title

      BMC Evo Biol

      Volume: 15 Pages: 180-180

    • DOI

      10.1186/s12862-015-0454-6

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H05746, KAKENHI-PROJECT-24246134, KAKENHI-PROJECT-26640135, KAKENHI-PROJECT-26290071
  • [Journal Article] 13C-based metabolic flux analysis of Saccharomyces cerevisiae with a reduced Crabtree effect2015

    • Author(s)
      Shuichi Kajihata, Fumio Matsuda, Mika Yoshimi, Kenshi Hayakawa, Chikara Furusawa, Akihisa Kanda, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: 120 Issue: 2 Pages: 140-144

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2014.12.014

    • NAID

      210000005080

    • ISSN
      1389-1723
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Increased 3-hydroxypropionic acid production from glycerol, by modification of central metabolism in Escherichia coli2014

    • Author(s)
      Kento Tokuyama, Satoshi Ohno, Katsunori Yoshikawa, Takashi Hirasawa, Shotaro Tanaka, Chikara Furusawa and Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Microbial Cell Factories

      Volume: 13 Pages: 64-64

    • DOI

      10.1186/1475-2859-13-64

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23680030, KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Development of an automated culture system for laboratory evolution2014

    • Author(s)
      Takaaki Horinouchi, Teruaki Minamoto, Shingo Suzuki, Hiroshi Shimizu, Chikara Furusawa
    • Journal Title

      Journal of Laborarory Automation

      Volume: -

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Addendum, Potential of a Saccharomyces cerevisiae recombinant strain lacking ethanol and glycerol biosynthesis pathways in efficient anaerobic bioproduction2014

    • Author(s)
      Takashi Hirasawa, Yoshihiro Ida, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Bioengineered

      Volume: 5

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Metabolic engineering of Saccharomyces cerevisiae for improving succinic acid production based on metabolic profiling2014

    • Author(s)
      Yuma Ito, Takashi Hirasawa, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: -

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Enhanced acetic acid and succinic acid production under microaerobic conditions by <i>Corynebacterium glutamicum</i> harboring <i>Escherichia coli</i> transhydrogenase gene <i>pntAB</i>2014

    • Author(s)
      Yuto Yamauchi, Takashi Hiraswa, Msato Nishii, Chikara Furuasawa, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      The Journal of General and Applied Microbiology

      Volume: 60 Issue: 3 Pages: 112-118

    • DOI

      10.2323/jgam.60.112

    • NAID

      130004449385

    • ISSN
      0022-1260, 1349-8037
    • Language
      English
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] FastPros: screening of reaction knockout strategies for metabolic engineering2014

    • Author(s)
      Satoshi Ohno, Chikara Furusawa and Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      bioinformatics

      Volume: 30(7) Pages: 981-7

    • DOI

      10.1093/bioinformatics/btt672

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23680030, KAKENHI-PROJECT-24246134, KAKENHI-PUBLICLY-25128715
  • [Journal Article] Integrated transcriptomic and metabolomic analysis of the central metabolism of Synechocystissp2013

    • Author(s)
      Katsunori Yoshikawa
    • Journal Title

      PCC 6803 under different trophic conditions, Biotechnology Journal

      Volume: 印刷中 Pages: 571-580

    • DOI

      10.1002/biot.201200235

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [Journal Article] In silico screening of triple reaction knockout Escherichia coli strains for overproduction of useful metabolites2013

    • Author(s)
      Satoshi Ohno, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng

      Volume: 115 Pages: 221-228

    • NAID

      110009592575

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] 代謝工学の創成と発展、-代謝解析とオミクス研究との融合2012

    • Author(s)
      清水 浩
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 90 Pages: 619-620

    • NAID

      110009553229

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Journal Article] Reconstruction and verification of a genome-scale metabolic model for Synechocystis sp2011

    • Author(s)
      Katsunori Yoshikawa, Yuta Kojima, Tsubasa Nakajima, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa and Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      PCC6803, Applied Microbiology and Biotechnology

      Volume: 92:2 Pages: 347-358

    • DOI

      10.1007/s00253-011-3559-x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [Journal Article] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2010

    • Author(s)
      Takaaki Horinouchi, Hiroshi Shimizu
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: Vol.11 Pages: 579-579

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Journal Article] Transcriptome analysis of parallel-evolved Escherichia coli strains under ethanol stress2010

    • Author(s)
      Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu.
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 11 Pages: 579-579

    • DOI

      10.1186/1471-2164-11-579

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Journal Article] Dynamic change in promoter activation in lysine biosynthesis of Escherichia coli cell2008

    • Author(s)
      J. Ou, H. Shimizuら7名
    • Journal Title

      Molecular BioSystems 4巻

      Pages: 128-134

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Dynamic change in promoter activation in lysine biosynthesis of Escherichia coli cell2008

    • Author(s)
      J. Ou, H. Shimizu, ら7名
    • Journal Title

      Molecular Bio Systems 4巻

      Pages: 128-134

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Advanced Technology of Metabolomics and its Application, Chapter 14, Metabolic flux analysis based on metabolomics data2008

    • Author(s)
      H., Shimizu, C., Furusawa, T., Shirai
    • Journal Title

      CMC Publisher Inc

      Pages: 171-184

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Dynamic change in promoter activation in lysine biosynthesis of Escherichia coli cell2008

    • Author(s)
      J., Cu, H. Shimizu, et. al.
    • Journal Title

      Molecular BioSystems 4

      Pages: 128-134

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Identification of target genes for conferring ethanol stress-tolerance to yeast Saccharomyces cerevisiae based on DNA microarray data analysis2007

    • Author(s)
      T., Hirasawa, H., Shimizu, et. al.
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 131

      Pages: 33-44

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • Author(s)
      S. Shioya, H. Shimizuら8名
    • Journal Title

      Biochemical Engineering Journal 36巻

      Pages: 28-37

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Analysis of fluctuation in protein abundance without promoter regulation based on Eschrichia coli continuous culture2007

    • Author(s)
      T., Yamada, H., Shimizu
    • Journal Title

      BioSystems 90

      Pages: 614-622

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using self organizing map : biosynthesis of amino acids2007

    • Author(s)
      G., Pandey, H., Shimizu
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 75

      Pages: 415-426

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • Author(s)
      T. Shirai, H. Shimizuら6名
    • Journal Title

      Microbial Cell Factory 6巻

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using self organizing map: biosynthesis of amino acids2007

    • Author(s)
      G. Pandey, H. Shimizu, ら8名
    • Journal Title

      Applied Microbiology Biotechnology 75巻

      Pages: 415-426

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • Author(s)
      S.Shioya, H.Shimizuら全8名
    • Journal Title

      Biochemical Engineering Journal (In press)(印刷中)

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • Author(s)
      T., Shirai, H., Shimizu, et. al.
    • Journal Title

      Microbial Cell Factory 6

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using Self Organizing Map2007

    • Author(s)
      G.Pandey, H.Shimizuら全8名
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology (In press)(印刷中)

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Identification of target genes for conferring ethanol stress-tolerance to yeast Saccharomyces cerevisiae based on DNA microarray data analysis2007

    • Author(s)
      T. Hirasawa, H. Shimizu, ら8名
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 131巻

      Pages: 33-44

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Identification of target genes for conferring ethanol stress-tolerance to yeast Saccharomyces cerevisiae based on DNA microarray data analysis2007

    • Author(s)
      T. Hirasawa, H. Shimizuら8名
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 131巻

      Pages: 33-44

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Analysis of fluctuation in protein abundance without promoter regulation based on Eschrichia coli continuous culture2007

    • Author(s)
      T. Yamada, H. Shimizuら6名
    • Journal Title

      BioSystems 90巻

      Pages: 614-622

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • Author(s)
      S., Shioya, H., Shimizu, et. al.
    • Journal Title

      Biochemical Engineering Journal 36(1)

      Pages: 28-37

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Metabolic pathway rerouting through genomic data analysis for industrial application of Saccharomyces cerevisiae2007

    • Author(s)
      S. Shioya, H. Shimizu, ら8名
    • Journal Title

      Biochemical Engineering Journal 36巻

      Pages: 28-37

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • Author(s)
      T. Shirai, H. Shimizu, ら6名
    • Journal Title

      Microbial Cell Factory 6巻

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Analysis of fluctuation in protein abundance without promoter regulati on based on Eschrichia coli continuous culture2007

    • Author(s)
      T. Yamada, H. Shimizu, ら6名
    • Journal Title

      Bio Systems 90巻

      Pages: 614-622

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Extracting hidden features in saline osmotic tolerance in Saccharomyces cerevisiae from DNA micro array data using self organizing map: biosynthesis of amino acids2007

    • Author(s)
      G. Pandey, H. Shimizuら8名
    • Journal Title

      Applied Microbiology Biotechnology 75巻

      Pages: 415-426

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Comparison of transcriptional responses to osmotic stresses induced by NaCl and sorbitol additions in Saccharomyces cerevisiae using DNA microarray2006

    • Author(s)
      H.Hirasawa, H.Shimizuら全8名
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102巻6号

      Pages: 568-571

    • NAID

      110006196953

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Comparison of transcriptional responses to osmotic stresses induced by NaCI and sorbitol additions in Saccharomyces cerevisiae using DNAmicroarray2006

    • Author(s)
      H., Hirasawa, H., Shimizu, et. al.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102(6)

      Pages: 568-571

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Precise metabolic flux analysis of coryneform bacteria with gas spectrometry -mass spectrometry and verification of nuclear magnetic resonance2006

    • Author(s)
      T., Shirai, H., Shimizu, et. al.
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102(5)

      Pages: 413-424

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Analysis of fluctuation in gene expression based on continuous culture system2006

    • Author(s)
      T.Yamada, H.Shimizu et al.
    • Journal Title

      Proceedings of The 2nd International Workshop on Biologically Inspired Approaches to Advanced Information Technology LNCS 3853

      Pages: 113-127

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [Journal Article] Comparative analysis of transcriptional responses to saline stress in the laboratory and brewing strains of Saccharomyces cerevisiae with DNA microarray2006

    • Author(s)
      H.Hirasawa, H.Shimizuら全9名
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 70巻3号

      Pages: 346-357

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Precise metabolic flux analysis of coryneform bacteria with gas spectrometry-mass spectrometry and verification of nuclear magnetic resonance2006

    • Author(s)
      T.Shirai, H.Shimizuら全7名
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 102巻5号

      Pages: 413-424

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Comparative analysis of transcriptional responses to saline stress in the laboratory and brewing strains of Saccharomyces cerevisiae with DNA microarray2006

    • Author(s)
      H., Hirasawa, H., Shimizu, et. al.
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 70(3)

      Pages: 346-357

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Journal Article] Dynamic Behavior of Cell Distribution in Continuous Culture of Escherichia coli2005

    • Author(s)
      T.Yamdada, H.Shimizu et al.
    • Journal Title

      ソフトウエアバイオロジー 4

      Pages: 31-36

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [Journal Article] Dynamic Behavior of Cell Distribution in Continuous Culture of Escherichia coli2005

    • Author(s)
      T.Yamdada, H.Shimizu et al.
    • Journal Title

      ソフトウエアバイオロジー 4巻(印刷中)

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [Journal Article] Analysis of Cell Population Dynamics in Continuous Culture of Escherichia coli2004

    • Author(s)
      T.yamdada, H.Shimizu et al.
    • Journal Title

      Proceedings of 10th The Asia Pacific Confederations on Chemical Engineering (APCChE04), Kitakyushu, 6 Pages, Oct 17-21(2004) (CD-ROM)

    • NAID

      130005052895

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [Journal Article] Analysis of Cell Population Dynamics in Continuous Culture of Escherichia coli2004

    • Author(s)
      T.Yamdada, H.Shimizu et al.
    • Journal Title

      Proceedings of 10th The Asia Pacific Confederation on Chemical Engineering (APCChE04), Kitakyushu, 6 pages, Oct 17-21(2004) (CD-ROM)

    • NAID

      130005052895

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16650063
  • [Journal Article] Enhanced kefiran production by mixed culture of Lactobacillus kefiranofaciens and Saccharomyces cerevisiae2003

    • Author(s)
      B.Cheirsilp, H.Shimizu, S.Shioya
    • Journal Title

      Journal of Biotechnology 100

      Pages: 45-53

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15360441
  • [Journal Article] Interactions between Lactobacillus kefiranofaciens and Saccharomyce scerevisiae in mixed culture of kefiran production2003

    • Author(s)
      B.Cheirsilp, H.Shoji, H.Shimizu, S.Shioya
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 96

      Pages: 278-284

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15360441
  • [Journal Article] Interactions between Lactobacillus kefiranofaciens and Saccharomyce scerevisiae in mixed culture of kefiran production.2003

    • Author(s)
      B.Cheirsilp, H.Shoji, H.Shimizu, S.Shioya
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering 96

      Pages: 278-284

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15360441
  • [Presentation] Synechocystis sp. PCC 6803のΔndhD1/D2株を用いたレドックスバランス感知フィコビリソーム分解制御機構の解析2021

    • Author(s)
      豊島正和、阪田真澄、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 連続培養を用いた指向性進化実験による大腸菌のメバロン酸取り込み能力の強化2021

    • Author(s)
      村上茉奈美、川井隆太郎、前田智也、堀之内貴明、古澤力、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 光合成生物のシステムバイオロジー2021

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] NAD(P)H dehydrogenase deletion enhances accumulation of polyhydroxybutyrate in Synechocystis sp. PCC 68032021

    • Author(s)
      Masakazu Yajima, Masakazu Toyoshima, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] FBA シミュレーションによるシアノバクテリアにおける PSI/PSII励起比と光合成電子伝達フラックスの関係ならびに NDH-1 の機能解析2021

    • Author(s)
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • Organizer
      第6回光合成細菌ワークショップ
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] モデル基盤代謝デザインと指向性進化による高効率細胞工場の創製2021

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      日本化学会第101春季年会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 動的代謝モデルを用いたカルビン回路の代謝制御機構の解析2021

    • Author(s)
      田島 遼太郎、池原 万由、戸谷 吉博、清水 浩
    • Organizer
      第62回日本植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 蛍光タンパク質を利用した共培養のための菌体比率制御技術の開発2021

    • Author(s)
      楠田みのり、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第86年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 実験室進化実験による大腸菌の非酸化的解糖経路のフラックス増強2020

    • Author(s)
      三吉健太、川井隆太郎、堀之内貴明、前田智也、古澤力、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第51回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの光合成と代謝のシミュレーション予測による適応機構の解析2020

    • Author(s)
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • Organizer
      日本植物学会第84回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 光誘導スイッチを利用した代謝フラックスの動的な調節技術の開発2020

    • Author(s)
      塚本雅士、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第51回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] In silico代謝デザインに基づく非酸化的解糖系依存の大腸菌株の創出2020

    • Author(s)
      三吉 健太、川井 隆太郎、堀之内 貴明、戸谷 吉博、清水 浩
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] FBAシミュレーションによる異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の光合成電子伝達経路の選択的使用の解明2020

    • Author(s)
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、 戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • Organizer
      日本植物生理学会2020年度大阪年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シアノバクテリアのカルビン回路の反応速度論モデルの開発2020

    • Author(s)
      田島遼太郎、池原万由、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第85年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 微生物物質生産の代謝デザインと細胞性能評価2020

    • Author(s)
      清水浩 戸谷吉博
    • Organizer
      化学工学会第51回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 化学量論モデルを用いたFBAシミュレーションによるシアノバクテリアの光合成電子伝達の解析2020

    • Author(s)
      豊島正和、山本千晶、 植野嘉文、 戸谷吉博、秋本誠志、 清水浩
    • Organizer
      第5回光合成細菌ワークショップ
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 13C-metabolic flux analysis reveals photosynthetic cofactor production rates in cyanobacteria2020

    • Author(s)
      Chiaki Yamamoto、 Sayaka Kitamura、Masakazu Toyoshima、Yoshihiro Toya、 Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      上海交通大学学術交流セミナー
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 代謝モデルを利用した指向性進化による大腸菌イソプレノール合成のボトルネック解消2020

    • Author(s)
      川井隆太郎、三吉健太、堀之内貴明、前田智也、古澤力、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      日本生物工学会【関西支部】2020年度 学生オンライン発表会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 試験管内反応系を利用した代謝経路の律速段階の同定2020

    • Author(s)
      北村 さや香、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第51回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析を用いたシアノバクテリアにおける光化学系からのATP/NADPH生産速度の推定2020

    • Author(s)
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • Organizer
      日本植物生理学会2020年度大阪年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 相利共生関係を利用した増殖連動型の有用物質生産株の代謝設計2020

    • Author(s)
      川井隆太郎、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第51回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] FBAによるシアノバクテリアの光合成電子伝達フラックス状態の解析2019

    • Author(s)
      豊島正和、山本千晶、植野嘉文、戸谷吉博、秋本誠志、清水浩
    • Organizer
      令和元年度秋季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの中心代謝の13C代謝フラックス解析2019

    • Author(s)
      山本千晶、北村さやか、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第61回植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析によるシアノバクテリアにおける光化学反応の補酵素生産速度の推定2019

    • Author(s)
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      令和元年度秋季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 大腸菌の共培養によるイソプレノール合成経路のボトルネックの解消2019

    • Author(s)
      川井隆太郎、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第71回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 異なる波長の光照射下におけるシアノバクテリアの中心代謝の13C代謝フラックス解析2019

    • Author(s)
      山本千晶、北村さやか、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] FBA simulation of photosynthetic electron flow of Synechocystis sp. PCC 6803 under different spectral light condition2019

    • Author(s)
      Toyoshima Masakazu、Yamamoto Chiaki 、Ueno Yoshifumi、Toya Yoshihiro 、Akimoto Seiji,、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      日米二国間セミナー
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] in silico analysis and design of photosynthesis and metabolic pathways of Synechocystis sp. PCC68032019

    • Author(s)
      Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      日米二国間セミナー
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] プロトン駆動力による細胞内代謝制御2019

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] QconCAT法を用いたシアノバクテリア光合成装置の絶対定量に関する研究2019

    • Author(s)
      豊島正和、大西一輝、阪田真澄、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      新光合成、光合成若手の会ジョイント若手ワークショップ
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] FBAによる単波長光照射下におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達と代謝のシミュレーション2019

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第10回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Integration of in silico Genetic Modification Design and Adaptive Laboratory Evolution to Increase in Productivity of Target Compounds2019

    • Author(s)
      Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      International Conference on Metabolic Science 2019
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 異なるPSI/PSII励起比における光合成電子伝達並びに呼吸鎖のフラックスバランス解析2019

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      令和元年度春季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] FBAシミュレーションによる単波長光照射下におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達経路のフラックス状態の解析2019

    • Author(s)
      豊島正和、山本千晶、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第71回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] In silico Metabolic Pathway Design and Experimental Flux Analysis for Creation of Microbial Cell Factory2019

    • Author(s)
      Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      KMB 2019 46th Annual Meeting & International Symposium
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H00839
  • [Presentation] 異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の網羅的定量プロテオーム解析2019

    • Author(s)
      豊島正和、阪田真澄、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第60回植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] In silico Design of Metabolic Pathways and Adaptive Laboratory Evolution for Improvement of Valuable Compounds Production2019

    • Author(s)
      Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      2019 KSBB Sprilng Meeting and International Symposium
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H00839
  • [Presentation] FBAシミュレーションによる異なるPSI/PSII励起比におけるシアノバクテリアの光合成電子伝達の解析2019

    • Author(s)
      豊島正和、山本千晶、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      2019年度ラン藻ゲノム交流会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Metabolic Engineering of Synechocystis sp. PCC68032019

    • Author(s)
      Shimizu Hiroshi、Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Matsuda Fumio
    • Organizer
      APCChE 2019
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 異なる波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の網羅的定量プロテオームと絶対定量2019

    • Author(s)
      豊島正和、阪田真澄、大西一輝、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      藍藻の分子生物学2019
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Metabolic Engineering to Create Microbial Cell Factories2019

    • Author(s)
      Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      The 21st Academic Exchange Seminar Between Shanghai Jiao Tong University And Osaka University
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H05626
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析に基づくシアノバクテリアの単波長光照射下に対する応答解析2019

    • Author(s)
      山本千晶、北村さや香、豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第71回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 計算機工学に基づく代謝設計とその有効性の実証に関する研究2018

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会 生物工学功績賞受賞講演
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] 安定同位体非定常の13C代謝フラックス解析およびプロテオーム解析によるn-ブタノールを生産するSynechococcus elongatus PCC 7942の代謝状態の推定2018

    • Author(s)
      和田圭介、植林希代加、戸谷吉博、傳寶雄大、Putri Sastia、松田史生、福崎英一郎、James C Liao、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第83年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Dynamic modeling of central metabolism in cyanobacteria for improving ethanol production2018

    • Author(s)
      Nishiguchi Hiroki、Nagai Hikaru、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      13th KAIST-OSAKA U Symposium 2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Target phosphoproteome analysis of Synchocystis sp PCC 6803 using nano liquid chromatography- triple quadrupole mass spectrometry2018

    • Author(s)
      Tokumaru Yuma、Toyoshima Masakazu、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] FBAを用いた様々な波長の光条件下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の代謝シミュレーション2018

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 増殖連動型物質生産のin silico解析における反応律速点の同定法の開発と実験検証2018

    • Author(s)
      清水浩、徳山健斗、戸谷吉博、松田史生
    • Organizer
      化学工学会第50回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] Systems Biology and Metabolic Engineering of Photosynthetic Organisms2018

    • Author(s)
      Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 光量変化に対するシアノバクテリア代謝応答の解析2018

    • Author(s)
      丸山正晴、西口大貴、豊島正和、松田史生、清水浩
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] FBAを用いた様々な波長の光照射下におけるSynechocystis sp. PCC 6803の野生株とNDH-1欠損株の代謝シミュレーション2018

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] フェノールが大腸菌の中枢代謝に及ぼす影響の解析2018

    • Author(s)
      北村さや香、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] FBAシミュレーションによる単波長光照射下におけるPSI/PSII励起比とサイクリック電子伝達の解析2018

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      平成30年度秋季領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 様々な波長の光照射下におけるシアノバクテリアの解析2018

    • Author(s)
      豊島正和、阪田真澄、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 計算機工学に基づく代謝設計とその有効性の実証に関する研究2018

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会 生物工学功績賞受賞講演
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 代謝工学に基づく大腸菌フェノール生産株の育種2018

    • Author(s)
      北村さや香, 戸谷吉博, 清水浩
    • Organizer
      化学工学会第83年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] 動的代謝モデルアンサンブルを用いたエタノール生産シアノバクテリアの代謝工学2018

    • Author(s)
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] プロトン駆動力による細胞内代謝制御2018

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 四重極タンデム質量分析装置を用いたSynechocystis sp. PCC 6803のターゲットリン酸化プロテオーム解析2018

    • Author(s)
      徳丸雄磨・豊島正和、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] クラミドモナス光化学系の定量プロテオーム解析とQconCAT法による絶対定量2018

    • Author(s)
      大西一輝、徳丸雄磨、 得津隆太郎、 皆川純、 豊島正和、松田史生、清水浩
    • Organizer
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シアノバクテリア中心炭素代謝における光量変化時の短期応答の解析2018

    • Author(s)
      丸山正晴、西口大貴、豊島正和、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 様々な波長の光照射下のSynechocystis sp. PCC 6803 の野生株とNDH-1欠損株の生育を代謝シミュレーションする2018

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Expanding the space of actual metabolic network in Escherichia coli by adaptive laboratory evolution2018

    • Author(s)
      Tokuyama Kento、Toya Yoshihiro、 Horinouchi Takaaki,、Furusawa Chikara、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      Metabolic Engineering 12
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] シアノバクテリアの代謝モデルを利用した動的解析に向けて2018

    • Author(s)
      戸谷吉博、豊島正和、清水浩
    • Organizer
      平成30年度春季新光合成領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 適応進化実験によるシアノバクテリア強光耐性株の獲得とその解析2018

    • Author(s)
      吉川勝徳、小川健一、戸谷吉博、秋本誠志、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シアノバクテリアのゲノムスケール代謝モデルを用いたFBAシミュレーションによる解析2018

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第5回分子珪藻研究会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 代謝工学による光合成の統合解析と工学応用2018

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会 シンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] クラミドモナス光化学系の定量プロテオミクス法の検討と利用2018

    • Author(s)
      大西一輝, 徳丸雄磨, 得津隆太郎, 皆川純, 豊島正和, 松田史生, 清水浩
    • Organizer
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 13C-Metabolic flux analysis of the central carbon metabolism in three cancer cell lines2018

    • Author(s)
      Uehara Hikaru,、Araki Chie、Maeda Kousuke、Okahashi Nobuyuki、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      YABEC2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [Presentation] 微生物バイオプロセスにおける計測と育種・プロセス開発への展開2018

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      日本生物工学会バイオ計測サイエンス研究部会第一回シンポジウム
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析を用いたSynechocystis sp. PCC 6803のndhF遺伝子破壊株におけるNADPH消費機構の寄与率の解明2018

    • Author(s)
      和田圭介、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第59回日本植物生理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Target phosphoproteome analysis of Synchocystis sp PCC 6803 using nano liquid chromatography- triple quadrupole mass spectrometry2018

    • Author(s)
      Tokumaru Yuma、Toyoshima Masakazu、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      13th KAIST-OSAKA U Symposium 2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Rational metabolic engineering of central metabolism in cyanobacteria using kinetic model ensemble2018

    • Author(s)
      Nishiguchi Hiroki、Nagai Hikaru、Matsuda Fumio、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Relationship between PSI/PSII excitation ratio and photosynthetic electron transport of Synechocystis sp. PCC 6803 by FBA simulation2018

    • Author(s)
      Toyoshima Masakazu、Toya Yoshihiro、Shimizu Hiroshi
    • Organizer
      International Symposium on Photosynthesis and Chloroplast Biogenesis 2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] クラミドモナス光化学系の定量プロテオミクス法の開発2018

    • Author(s)
      大西一輝、徳丸雄磨、得津隆太郎、皆川純、豊島正和、松田史生、清水浩
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] がん種の異なる細胞間での中心代謝における13C代謝フラックス解析2018

    • Author(s)
      上原ひかる、荒木千絵、前田昂亮 、岡橋伸幸、松田史生、高橋智聡、清水浩
    • Organizer
      第70回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17K19012
  • [Presentation] QconCAT法を用いたシアノバクテリア光化学装置の定量プロテオミクス2017

    • Author(s)
      徳丸雄磨、植林希代加、徳山健斗、和田圭介、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第65回質量分析総合討論会 2017 つくば
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Quantitative proteome analysis of microalgae under high light stress2017

    • Author(s)
      Masakazu Toyoshima, Masumi Sakata, Kazuki Ohnishi, Yuma Tokumaru, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      I-Bios2017
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 光合成微生物の代謝モデルの開発と応用2017

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、吉川勝徳、 松田史生、 清水浩
    • Organizer
      化学工学会第49回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 実験室進化実験に基づく大腸菌の高コハク酸生産に有効な変異同定2017

    • Author(s)
      徳山 健斗, 戸谷 吉博, 堀之内 貴明, 古澤 力, 清水 浩,
    • Organizer
      化学工学会 第82年会
    • Place of Presentation
      芝浦工業大学豊洲キャンパス(東京都江東区)
    • Year and Date
      2017-03-06
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] 代謝物濃度絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • Author(s)
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第69回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] nanoLC-MSを用いたシアノバクテリアの網羅的定量プロテオーム解析2017

    • Author(s)
      豊島正和、阪田真澄、松田史生、清水浩
    • Organizer
      藍藻の分子生物学2017
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シアノバクテリアのSigEの代謝制御解明に向けた定量プロテオーム解析 "2017

    • Author(s)
      徳丸雄磨、植林希代加、豊島正和、小山内崇、松田史生、清水浩
    • Organizer
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シグマ因子SigEによるシアノバクテリア代謝制御の定量プロテオーム解析2017

    • Author(s)
      徳丸雄磨、植林希代加、小山内崇、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第69回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Chlamydomonas reinhardtiiの定量プロテオミクスのための膜タンパク質可溶化手法の検討2017

    • Author(s)
      大西一輝、徳丸雄磨、阪田真澄、豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析およびプロテオーム解析を用いたn-ブタノール生産シアノバクテリア株の代謝解析2017

    • Author(s)
      和田圭介、植林希代加、戸谷吉博、傳寶雄大、Putri Sastia、松田史生、福崎 英一郎、Liao James、清水浩
    • Organizer
      第69回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 代謝物濃度絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • Author(s)
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第65回質量分析総合討論会 2017 つくば
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 光量条件がシアノバクテリアの代謝フラックスに及ぼす影響の解析2017

    • Author(s)
      上田賢太朗、仲嶋翼、吉川勝徳、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第9回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シグマ因子SigEによるSynechocystis sp. PCC 6803のプロテオームの制御2017

    • Author(s)
      徳丸雄磨, 植林希代加, 小山内崇, 松田史生, 清水浩
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Synechocystis sp. PCC 6803における多様な波長の光環境下での代謝シミュレーション2017

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 代謝物絶対定量データを用いたシアノバクテリア動的代謝モデル構築2017

    • Author(s)
      西口大貴、永井暉、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第11回メタボロームシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 定常期における大腸菌メバロン酸生産株の13C代謝フラックス解析2017

    • Author(s)
      増田亜美、徳山健斗、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      化学工学会 第82年会
    • Place of Presentation
      芝浦工業大学豊洲キャンパス(東京都江東区)
    • Year and Date
      2017-03-06
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] ブタノール生産シアノバクテリアの代謝解析2017

    • Author(s)
      和田 圭介、植林 希代加、 戸谷 吉博、傳寶 雄大、Putri Sastia 、松田 史生、福崎 英一郎、 Liao James C ,、清水 浩
    • Organizer
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シアノバクテリアのシステムバイオロジーによる統合理解と工学応用2017

    • Author(s)
      清水浩、豊島正和、戸谷吉博、松田史生
    • Organizer
      藍藻の分子生物学2017
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 代謝物濃度の絶対定量値を用いたエタノール生産シアノバクテリア代謝律速点の解析2017

    • Author(s)
      西口大貴, 永井暉, 松田史生, 清水浩
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 13C代謝フラックス解析による細胞の生理状態の理解と工学応用2017

    • Author(s)
      清水浩, 松田史生, 戸谷吉博, 岡橋伸幸, 前田昂亮
    • Organizer
      化学工学会第49回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] Synechocystis sp. PCC 6803の中心代謝経路と光化学系の制御メカニズムの解析2017

    • Author(s)
      和田圭介、戸谷吉博、吉川勝徳、松田史生、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第49回秋季大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 光量変化に対するシアノバクテリア代謝適応機構の解析2017

    • Author(s)
      丸山正晴・西口大貴、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第11回メタボロームシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] シアノバクテリアSynechocystis sp. PCC 6803の光化学反応を精緻化したゲノムスケールモデルを用いた様々な光条件における代謝シミュレーション2017

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第69回日本生物工学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 光合成微生物の化学量論モデルを利用したシミュレーションとその応用2017

    • Author(s)
      戸谷吉博,吉川勝徳,松田史生,清水浩
    • Organizer
      第58回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      鹿児島大学郡元キャンパス(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2017-03-16
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] nanoLC-MSを用いた網羅的定量プロテオーム解析に向けたタンパク質抽出方法の検討2017

    • Author(s)
      豊島正和、阪田真澄、大西一輝、徳丸雄磨、松田史生、清水浩
    • Organizer
      科研費新学術領域研究平成29年度秋期領域会議
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Synechocystis sp. PCC 6803の精緻化した代謝モデルを用いた光合成研究への応用2017

    • Author(s)
      豊島正和、戸谷吉博、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第10回日本光合成学会年会およびシンポジウム
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 13C-metabolic flux analysis for rational design of metabolic pathway modification of the industrially useful microorganisms2016

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      The 13th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms
    • Place of Presentation
      East Lake Hotel, Wuhan, China
    • Year and Date
      2016-10-16
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] #in silico#代謝設計と実験室進化実験の統合によるコハク酸高生産大腸菌の構築2016

    • Author(s)
      徳山 健斗、戸谷 吉博、清水 浩
    • Organizer
      化学工学会第48回秋季大会
    • Place of Presentation
      徳島大学 常三島キャンパス(徳島県徳島市)
    • Year and Date
      2016-09-06
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] Integration of in silico design and experimental evaluation of metabolic pathways for creation of microbial cell factories,2016

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      International Conference on the Metabolic Science,
    • Place of Presentation
      Nanjiao Hotel, Shanghai China,
    • Year and Date
      2016-10-20
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 13C-metabolic flux analysis for rational design of metabolic pathway modification of the industrially useful microorganisms2016

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      The 13th International Symposium on the Genetics of Industrial Microorganisms
    • Place of Presentation
      East Lake Hotel, Wuhan, China
    • Year and Date
      2016-10-16
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] Integration of in silico design and experimental evaluation of metabolic pathways for creation of microbial cell factories,2016

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      International Conference on the Metabolic Science,
    • Place of Presentation
      Nanjiao Hotel, Shanghai China,
    • Year and Date
      2016-10-20
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] 大腸菌による効率的なメバロン酸生産のための代謝解析2016

    • Author(s)
      戸谷吉博、和田圭介、増田亜美、徳山健斗、坂野聡美、吉川勝徳、松田史生、清水浩
    • Organizer
      化学工学会第48回秋季大会
    • Place of Presentation
      徳島大学 常三島キャンパス(徳島県徳島市)
    • Year and Date
      2016-09-06
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] メバロン酸生産大腸菌株の定常期における代謝状態の解明2016

    • Author(s)
      増田亜美,戸谷 吉博、徳山 健斗、坂野 聡美、吉川 勝徳、清水 浩
    • Organizer
      第68回日本生物工学会大会(2016)
    • Place of Presentation
      冨山国際会議場 ANAクラウンプラザホテル富山(富山県富山市)
    • Year and Date
      2016-09-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] グリセロールからのコハク酸生産に向けたin silico代謝設計と実験評価2016

    • Author(s)
      徳山健斗、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      2016年度生物工学若手研究者の集い(若手会)夏のセミナー
    • Place of Presentation
      ホテルコンチネンタル府中(東京都府中市)
    • Year and Date
      2016-07-16
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] 13C-Metabolic Flux Analysis for Mevalonate-Producing Strain of Escherichia coli.2016

    • Author(s)
      Wada, K., Toya, Y., Matsuda, F. and Shimizu, H.
    • Organizer
      Metabolic Engineering 11
    • Place of Presentation
      Awaji Yumebutai(兵庫県淡路市)
    • Year and Date
      2016-06-26
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] In silico代謝デザインと13C代謝フラックス解析による微生物細胞工場の創製2016

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      第6回合成生物工学シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸大学百年記念館六甲ホール(兵庫県神戸市灘区)
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] メバロン酸生産大腸菌の細胞内代謝状態の定量的な評価2016

    • Author(s)
      永井 暉, 戸谷 吉博, 松田 史生, 清水 浩
    • Organizer
      第68回日本生物工学会大会(2016)
    • Place of Presentation
      冨山国際会議場 ANAクラウンプラザホテル富山(富山県富山市)
    • Year and Date
      2016-09-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] Metabolic flux measurement for efficient mevalonate production in Escherichia coli2016

    • Author(s)
      Yoshihiro Toya, Keisuke Wada, Ami Masuda, Kento Tokuyama, Satomi Banno, Katsunori Yoshikawa, Fumio Matsuda, Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      i-BioP2016
    • Place of Presentation
      Haeundae Grand Hotel , Busan, South Korea
    • Year and Date
      2016-12-16
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16H04576
  • [Presentation] 代謝フラックスを基盤とする物質生産法の開発2016

    • Author(s)
      清水 浩、松田 史生、戸谷 吉博
    • Organizer
      2016年農芸化学会
    • Place of Presentation
      札幌教育文化会館大ホール(北海道札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 代謝物濃度絶対定量によるシアノバクテリア代謝律速点の解析2016

    • Author(s)
      西口大貴, 永井 暉, 松田 史生, 清水 浩
    • Organizer
      第10回メタボロームシンポジウム
    • Place of Presentation
      鶴岡メタボロームキャンパス(山形県鶴岡市)
    • Year and Date
      2016-10-19
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-16H06559
  • [Presentation] 全自動実験室進化システムを用いた多系列・多種ストレス環境の実験室進化による大腸菌のストレス適応戦略の解析2015

    • Author(s)
      堀之内貴明、鈴木真吾、清水浩、古澤力
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸公債会議場(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 大腸菌代謝フラックス解析の実験デザインの最適化2015

    • Author(s)
      前田昂亮、岡橋伸幸、松田史生、清水浩
    • Organizer
      第67回日本生物工学会大会(2015)
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2015-10-26
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 全自動実験室進化による様々な化合物ストレスに対する耐性大腸菌の創生と耐性化機構の解析2015

    • Author(s)
      堀之内貴明、鈴木真吾、清水浩、古澤力
    • Organizer
      第67回日本生物工学大会
    • Place of Presentation
      城山観光ホテル(鹿児島県鹿児島市)
    • Year and Date
      2015-10-26
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 微生物による物質生産のための代謝デザインと細胞評価2015

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      近畿バイオインダストリー振興会議第31回バイオマス研究会講演会
    • Place of Presentation
      大阪科学技術センター,大阪
    • Year and Date
      2015-03-24
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Synechocystis sp. PCC 6803光化学系の定量プロテオーム分析系の構築2015

    • Author(s)
      植林希代加、松田史生、日浅夏希、小倉泰郎、平野一郎、清水浩
    • Organizer
      ラン藻の分子生物学2015
    • Place of Presentation
      かずさアカデミアホール(千葉県木更津市)
    • Year and Date
      2015-11-16
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] <SUP>13</SUP>C代謝フラックス解析に用いる<SUP>13</SUP>C標識炭素源の最適化2015

    • Author(s)
      前田昂亮、岡橋伸幸、松田史生、清水浩
    • Organizer
      日本質量分析学会 第63回質量分析総合討論会 2015
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場エポカルつくば(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2015-06-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 光合成微生物<I>Synechocystis</I> sp. PCC 6803中心代謝酵素の定量プロテオミクス2015

    • Author(s)
      日浅夏希、松田史生、小倉泰郎、平野一郎、清水浩
    • Organizer
      日本質量分析学会 第63回質量分析総合討論会 2015
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場エポカルつくば(茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2015-06-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 人工進化実験による<i>Synechocystis</i> sp. PCC 6803へのイソブタノール耐性の賦与2014

    • Author(s)
      松迫 卓也、仲嶋翼、吉川勝徳、清水浩
    • Organizer
      日本農芸化学大会2014大会
    • Place of Presentation
      明治大学(東京)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 物質生産のための代謝デザインと細胞評価2014

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      新化学技術推進協会(JACI)
    • Place of Presentation
      新化学技術推進協会(JACI),東京
    • Year and Date
      2014-12-09
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 全自動実験室進化システムの構築と大腸菌の多系列・多種ストレス環境下での実験室進化2014

    • Author(s)
      堀之内貴明,源晃明,鈴木真吾,清水浩,古澤力
    • Organizer
      生命情報科学若手の会第5回研究会
    • Place of Presentation
      東京大学 検見川セミナーハウス(千葉)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] <I>Synechocystis</I> sp. PCC 6803の強光耐性株の解析2014

    • Author(s)
      吉川勝徳、小川健一、秋本誠志、清水浩
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 代謝シミュレーションを用いた、微生物によるものづくりのための多重遺伝子破壊探索手法の開発2014

    • Author(s)
      大野聡, 清水浩、古澤力
    • Organizer
      生命情報若手の会 第5回研究会
    • Place of Presentation
      東京大学 検見川セミナーハウス(千葉)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 微細藻細胞工場の創製のための代謝工学基盤技術開発2014

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      "未来へのバイオ技術"勉強会 「藻類が拓くグリーンバイオ成長戦略のラストステージ」
    • Place of Presentation
      バイオインダストリー協会,東京
    • Year and Date
      2014-08-18
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Systems metabolic engineering - Rational design of microbial cell factories2013

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      Asian Congress on Biotechnology 2013
    • Place of Presentation
      Indian Institute of Technology Delhi(India)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] International collaborative research on systems metablic engineering for low carbon society2013

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      Biochemical and Molecular engineering XVIII
    • Place of Presentation
      Beijing Pharma and Biotech Center, Beijing(China)
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] ラボオートメーションによる全自動多系列実験室進化システムの構築2013

    • Author(s)
      堀之内貴明, 源晃明, 鈴木真吾, 清水浩, 古澤力
    • Organizer
      第65回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 代謝シミュレーションに基づいた3HP高生産大腸菌の構築2013

    • Author(s)
      徳山 健斗、大野 聡、吉川 勝徳、古澤 力、清水 浩
    • Organizer
      生物工学会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] <i>in silico</i>スクリーニングにより代謝物質生産が予測された大腸菌多重遺伝子破壊株の特徴解析2013

    • Author(s)
      大野聡, 古澤力、清水浩
    • Organizer
      生物工学会
    • Place of Presentation
      広島国際会議場(広島)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 全自動実験室進化システムによる大腸菌の多系列・多種ストレス環境の実験室進化2013

    • Author(s)
      堀之内貴明,源晃明,鈴木真吾,清水浩,古澤力
    • Organizer
      第36回日本分子生物学会年会(MBSJ2013)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Systems metabolic engineering for creation of superior microbial cell factories2012

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      Systems Biotechnology of Microalgae for Bioproduction, International Symposium and Exhibition
    • Place of Presentation
      EXCO, Daegu, Korea
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Systems Metabolic Engineering -Rational Design of Microbial Cell Factories2012

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場,兵庫
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Genome-wide multi-omics analysis of ethanol stress tolerant strain of Escherichia2012

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      Metabolic Engineering IX
    • Place of Presentation
      Le Bellevue Congress and Exhibition centre in Biarritz, France
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Integration of in silico and experimental approaches for creation of microbial cell factories2012

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      14th Asia Pacific Confederation of Chemical Engineering(APCChE 2012)
    • Place of Presentation
      Suntec Singapore International Convention & Exhibition Center, Singapore
    • Year and Date
      2012-02-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Integration of in silico and experimental approaches for creation of microbial cell factories2012

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      14th Asia Pacific Confederation of Chemical Engineering (APCChE 2012)
    • Place of Presentation
      Suntec Singapore International Convention & Exhibition Center (Singapore)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-02-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Application of Genome Scale Models to Design of Microbial Cell Factories2012

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      2nd Conference on Constraint-based Reconstruction and Analysis (COBRA 2012)
    • Place of Presentation
      Hotel Marienlyst, Helsing&oslash;r, Denmark
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] エタノールストレス環境下の進化実験により得られた大腸菌のゲノムワイドな変異解析と遺伝子発現解析2011

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      化学工学会第43回秋季大会
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学(愛知県)
    • Year and Date
      2011-09-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Whole genome resequencing of experimentally evolved Escherichia coli using a next generation sequencer2011

    • Author(s)
      小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      日本生物物理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      2011-09-16
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      化学工学会 第76年会
    • Place of Presentation
      東京農工大学小金井キャンパス、東京都
    • Year and Date
      2011-03-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Systems Metabolic Engineering for Bioproduction Development2011

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress(IUMS2011)
    • Place of Presentation
      Sapporo Convention Center, Hokkaido (Japan)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [Presentation] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains under Ethanol Stress2011

    • Author(s)
      Naoaki Ono, Chikara Furusawa, Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Shingo Suzuki, Takashi Hirasawa, Tetsuya Yomo Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      Asian Congress on Biotechnology(ACB-2011)
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      2011-05-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Genome Scale Metabolic Flux Design and Experimental Evaluation of Cellular Performance2011

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      The 2nd iBioP Asian Symposium (iBioP2011)
    • Place of Presentation
      POSTECH (Pohang University of Science and Technology), Pohang, South Korea
    • Year and Date
      2011-12-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [Presentation] エタノールストレス環境下の進化実験により得られた大腸菌のゲノムワイドな変異解析と遺伝子発現解2011

    • Author(s)
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      化学工学会第43回秋季大会
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学
    • Year and Date
      2011-09-05
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Systems Metabolic Engineering for Bioproduction Development2011

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress(IUMS2011)
    • Place of Presentation
      Sapporo Convention Center
    • Year and Date
      2011-09-06
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [Presentation] Genome Scale Metabolic Flux Design and Experimental Evaluation of Cellular Performance2011

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      The 2nd iBioP Asian Symposium (iBioP2011)
    • Place of Presentation
      POSTECH (Pohang University of Science and Technology), Pohang, (South Korea)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23656526
  • [Presentation] 人工進化工学と網羅的遺伝子発現情報解析によるストレス耐性細胞の創製2011

    • Author(s)
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      化学工学会第76年会
    • Place of Presentation
      東京農工大学
    • Year and Date
      2011-03-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 大腸菌エタノール耐性進化株の次世代シーケンサを用いた全ゲノム解析2011

    • Author(s)
      小野直亮, 堀之内貴明, 玉岡邦康, 鈴木真吾, 平沢敬, 古澤力, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      東京農工大学
    • Year and Date
      2011-09-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010

    • Author(s)
      堀之内貴明、清水浩
    • Organizer
      定量生物学の会 第三回年会
    • Place of Presentation
      東京大学生産技術研究所、東京都
    • Year and Date
      2010-11-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 次世代シーケンサを用いた大腸菌DH1株の全ゲノム解析2010

    • Author(s)
      小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
    • Organizer
      第62回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
    • Year and Date
      2010-10-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Systems Biotechnology for Creation of Microbial Cell Factory2010

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      2010 International Symposium on Advanced Biological Engineering (ISABE'2010)
    • Place of Presentation
      Beijing Friendship Hotel, Beijing (China)(招待講演)
    • Year and Date
      2010-07-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 人工進化実験における発現制御ダイナミクスの進化的シミュレーション2010

    • Author(s)
      堀之内貴明, 古澤力, 清水浩, 四方哲也, 小野直亮
    • Organizer
      定量生物学の会第三回年会
    • Place of Presentation
      東京大学生産技術研究所
    • Year and Date
      2010-11-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 人工進化実験によって得られたエタノール耐性大腸菌株の網羅的遺伝子発現解析とゲノム異変解析2010

    • Author(s)
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      宮崎シーガイアワールドコンベンションセンターサミット
    • Year and Date
      2010-10-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の網羅的解析によるエタノール耐性付与2010

    • Author(s)
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      定量生物学の会第三回年会
    • Place of Presentation
      東京大学生産技術研究所
    • Year and Date
      2010-11-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 大腸菌エタノールストレス人工進化株の全ゲノム変異解析・遺伝子発現解析2010

    • Author(s)
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      定量生物学の会第二回年会
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-01-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] エタノール環境下での長期植え継ぎ培養によって得られた耐性大腸菌株の遺伝子発現・ゲノム変異解析2010

    • Author(s)
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
    • Place of Presentation
      神戸ポートピアアイランド,兵庫県
    • Year and Date
      2010-12-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 複数時間スケールを持つ環境適応ダイナミクス:エタノールストレス環境下での大腸菌人工進化実験における網羅的表現型/遺伝子型解析2010

    • Author(s)
      堀之内貴明, 玉岡邦康, 古澤力, 小野直亮, 鈴木真吾, 平沢敬, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      第48回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学
    • Year and Date
      2010-09-20
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Systems Biotechnology for Creation of Microbial Cell Factroy2010

    • Author(s)
      HiroshiShimizu
    • Organizer
      2010 International Symposium on Advanced Biological Engineering(ISABE' 2010)
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2010-07-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] システムバイオテクノロジーによる生物生産2009

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      日本生物工学会第61回大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2009-09-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] 次世代シーケンサにおけるメイトペアの距離情報を利用した配列解析アルゴリズムの開発2009

    • Author(s)
      小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
    • Organizer
      第47回生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島文理大学
    • Year and Date
      2009-11-01
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] A model-based analysis method for detection of single-base substitution using resequencing microarrays2009

    • Author(s)
      Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu, Tetsuya Yomo
    • Organizer
      Asia Pacific Biochemical Engineering Conference 2009(APBioChEC' 09)
    • Place of Presentation
      Kobe, Japan
    • Year and Date
      2009-11-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] システムバイオテクノロジーによる生物生産2009

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      第61回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2009-09-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] タイリングアレイを用いたエタノール耐性大腸菌株のゲノム変異解析2009

    • Author(s)
      玉岡邦康, 堀之内貴明, 古澤力, 平沢敬, 小野直亮, 鈴木真吾, 四方哲也, 清水浩
    • Organizer
      第61回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2009-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] メイトペア情報に基づいた次世代シーケンサによるresequencing解析アルゴリズムの開発2009

    • Author(s)
      小野直亮, 鈴木真吾, 古澤力, 清水浩, 四方哲也
    • Organizer
      第61回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2009-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Genome-Wide Mutational and Expression Analyses of Evolved Escherichia Coli Strains Under Ethanol Stress2009

    • Author(s)
      Takaaki Horinouchi, Kuniyasu Tamaoka, Chikara Furusawa, Takashi Hirasawa, Naoaki Ono, Shingo Suzuki, Tetsuya Yomo, Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      The 20th International Conference on Genome Informatics(GIW 2009)
    • Place of Presentation
      Yokohama, Japan
    • Year and Date
      2009-12-14
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21360401
  • [Presentation] Genetic engineering if central carbon metabolic pathway for suucinate production in Saccharomyces cerevisiae2007

    • Author(s)
      Y.H., Jeong, H., Shimizu, et. al.
    • Organizer
      Final Presentation of The 3b UNESCO Postgraduate Inter-University Course in Biotechnology 2006. 2007
    • Place of Presentation
      Osaka University
    • Year and Date
      2007-09-20
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Molecular Breeding based on Multi-Omics Analyses2007

    • Author(s)
      H. Shimizu, ら8名
    • Organizer
      Asia Pacific Biochemical Engineering 2007
    • Place of Presentation
      Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      2007-11-05
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] 生物生産のためのシステムバイオテクノロジー2007

    • Author(s)
      清水浩
    • Organizer
      バイオインフォマティクス学会第17回システムバイオロジー研究会
    • Place of Presentation
      奈良先端科学技術大学院大学
    • Year and Date
      2007-11-28
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] 浸透圧・エタノールストレス環境下における酵母1遺伝子破壊株の網羅的解析2007

    • Author(s)
      吉川、清水, ら6名
    • Organizer
      日本分子生物学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2007-12-11
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Study on roles of anaplerotic pathways in glutamate overproduction of Corynebacterium glutamicum by metabolic flux analysis2007

    • Author(s)
      T., Shirai, H., Shimizu, et. al.
    • Organizer
      Annual meeting of Society of the Society for Biotechnology Japan
    • Place of Presentation
      Hiroshima University
    • Year and Date
      2007-09-27
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Systems Biotechnology for Bio-Production2007

    • Author(s)
      Hiroshi, Shimizu
    • Organizer
      Japanese Society for Bioinformatics, the 17th meeting of division of Systems Biology
    • Place of Presentation
      NAIST
    • Year and Date
      2007-11-28
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Genome-wide analysis of yeast single gene deletion strains under osmotic and ethanol stress conditions2007

    • Author(s)
      K., Yoshikawa, H., Shimizu, et. al.
    • Organizer
      Annual Meeting of The Molecular Biology Society of Japan
    • Place of Presentation
      Pacifico Yokohama
    • Year and Date
      2007-12-11
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Development of genome-scale metabolic analysis system of Corynebacterium glutamicum2007

    • Author(s)
      Y., Shinfuku, H., Shimizu, et. al.
    • Organizer
      Annual meeting of Society of the Society for Biotechnology Japan
    • Place of Presentation
      Hiroshima University
    • Year and Date
      2007-09-27
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Corynebacterium glutamicumのゲノムスケール代謝解析システムの開発2007

    • Author(s)
      新福、清水, ら4名
    • Organizer
      日本生物工学会平成19年度大会
    • Place of Presentation
      広島大学
    • Year and Date
      2007-09-27
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] コリネ型細菌のグルタミン酸生産期における代謝フラックス解析法の確立と補充経路の役割の解明2007

    • Author(s)
      白井、清水, ら6名
    • Organizer
      日本生物工学会平成19年度大会
    • Place of Presentation
      広島大学
    • Year and Date
      2007-09-27
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] ストレス環境下における酵母の遺伝子破壊株の網羅的解析2007

    • Author(s)
      吉川、清水, ら6名
    • Organizer
      日本生物工学会平成19年度大会
    • Place of Presentation
      広島大学
    • Year and Date
      2007-09-25
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Molecular breeding based on multi-omics analyses2007

    • Author(s)
      Hiroshi, Shimizu, et. al.
    • Organizer
      Asia Pacific Biochemical Engineering 2007
    • Place of Presentation
      Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      2007-11-05
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Genome-wide analysis of yeast deletion mutants under stress conditions2007

    • Author(s)
      K., Yoshikawa, H., Shimizu, et. al.
    • Organizer
      Annual meeting of Society of the Society for Biotechnology Japan
    • Place of Presentation
      Hiroshima University
    • Year and Date
      2007-09-25
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Genetic engineering of the central metabolic pathway for succinate production in Saccharomyces cerevisiae2007

    • Author(s)
      Yun Hee Jeong, H. Shimizu, ら4名
    • Organizer
      ユネスコバイオテクノロジー国際大学院研修講座発表会
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2007-09-20
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Inverse metabolic engineering by integration of multiple omics analyses2007

    • Author(s)
      Hiroshi, Shimizu, et. al.
    • Organizer
      10th Computer Application for Biotechnology (CABO8)
    • Place of Presentation
      Cancun Mexico
    • Year and Date
      2007-06-05
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Inverse metabolic engineering by integration of multiple omics analyses2007

    • Author(s)
      H. Shimizu, ら8名
    • Organizer
      10th Computer Applications in Biotechnology (CAB10), June 4-6, Vol. 1, 15-20,
    • Place of Presentation
      Cancun Mexico
    • Year and Date
      2007-06-05
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] Inverse metabolic engineering by integration of multiple omics analyses2007

    • Author(s)
      H. Shimizu, ら8名
    • Organizer
      10th Computer Applications in Biotechnology(CAB10), June 4-6, Vol. 1, 15-20,
    • Place of Presentation
      Cancun Mexico
    • Year and Date
      2007-06-05
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18360395
  • [Presentation] グリセロール単一炭素源における正確な代謝フラックス推定のための<sup>13</sup>C標識条件の検討

    • Author(s)
      大橋秀伍、戸谷吉博、清水浩
    • Organizer
      第66回日本生物工学会大会(2014)
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター,北海道
    • Year and Date
      2014-09-09 – 2014-09-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 人工進化実験による<i>Synechocystis</i> sp. PCC 6803 のイソブタノール耐性株の獲得と変異解析

    • Author(s)
      松迫卓也、仲嶋翼、吉川勝徳、清水浩
    • Organizer
      第66回日本生物工学会大会(2014)
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター,北海道
    • Year and Date
      2014-09-09 – 2014-09-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 微生物育種に向けた多重遺伝子破壊のin silicoスクリーニング

    • Author(s)
      大野 聡、古澤 力、清水 浩
    • Organizer
      生物工学若手の会 夏のセミナー2014
    • Place of Presentation
      神戸セミナーハウス,兵庫
    • Year and Date
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] フラックスバランス解析に基づく有用物質生産微生物の構築

    • Author(s)
      清水 浩、吉川 勝徳、古澤 力、平沢 敬、戸谷 吉博、松田 史生
    • Organizer
      第46回化学工学会秋季大会
    • Place of Presentation
      九州大学 伊都キャンパス,福岡
    • Year and Date
      2014-09-17 – 2014-09-19
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Integration of in silico and Experimental Approaches for Creation of Microbial Cell Factories

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      2014 KSBB Spring Meeting and International
    • Place of Presentation
      Gyeongju, Korea
    • Year and Date
      2014-04-09 – 2014-04-11
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] in silico代謝予測に基づいた3-ヒドロキシプロピオン酸高生産大腸菌の構築

    • Author(s)
      徳山 健斗、大野 聡、吉川 勝徳、古澤 力、清水 浩
    • Organizer
      生物工学若手の会 夏のセミナー2014
    • Place of Presentation
      神戸セミナーハウス,兵庫
    • Year and Date
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] Integration of in silico Design and Experimental Evaluation for Creation of Microbial Cell Factories

    • Author(s)
      Hiroshi Shimizu
    • Organizer
      Metabolic Engineering X
    • Place of Presentation
      Vancouver, Canada
    • Year and Date
      2014-06-15 – 2014-06-19
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 人工進化実験によるSynechocystis sp. PCC 6803のイソブタノール耐性株の取得と変異解析

    • Author(s)
      松迫卓也、 仲嶋翼、 吉川勝徳、清水浩
    • Organizer
      第5回日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      近畿大学農学部,奈良
    • Year and Date
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 大腸菌を用いた定常期におけるメバロン酸生産

    • Author(s)
      増田亜美、戸谷吉博、徳山健斗、坂野聡美、吉川勝徳、清水浩
    • Organizer
      日本農芸化学会大会2015
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス,岡山
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • [Presentation] 細胞内遊離代謝物質の13C標識情報に基づくフラックス解析法の構築

    • Author(s)
      岡橋 伸幸、梶畠 秀一、古澤 力、清水 浩
    • Organizer
      生物工学若手の会 夏のセミナー2014
    • Place of Presentation
      神戸セミナーハウス,兵庫
    • Year and Date
      2014-05-30 – 2014-05-31
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24246134
  • 1.  SHIOYA Suetaki (50026259)
    # of Collaborated Projects: 10 results
    # of Collaborated Products: 3 results
  • 2.  FURUSAWA Chikara (00372631)
    # of Collaborated Projects: 6 results
    # of Collaborated Products: 47 results
  • 3.  TOYA YOSHIHIRO (70582162)
    # of Collaborated Projects: 6 results
    # of Collaborated Products: 41 results
  • 4.  NAGAHISA Keisuke (00324806)
    # of Collaborated Projects: 5 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 5.  HIRASAWA Takashi (20407125)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 30 results
  • 6.  SUGA Ken-ichi (20029250)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 7.  MATSUDA FUMIO (50462734)
    # of Collaborated Projects: 3 results
    # of Collaborated Products: 27 results
  • 8.  OMASA Takeshi (00252586)
    # of Collaborated Projects: 3 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 9.  UCHIYAMA Keiji (60294039)
    # of Collaborated Projects: 3 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 10.  NAKAJIMA Mikio (00273590)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 11.  堀之内 貴明 (60610988)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 6 results
  • 12.  ONO Naoaki (60395118)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 18 results
  • 13.  YOSHIKAWA KATSUNORI (20599279)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 10 results
  • 14.  KATAKURA Yoshio (50263207)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 15.  NINOMIYA Kazuaki (10379125)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 16.  江夏 敏郎 (20029010)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 17.  小山内 崇 (60512316)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 3 results
  • 18.  皆川 純 (80280725)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 19.  坂本 亘 (20222002)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 20.  園池 公毅 (30226716)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 21.  宗景 ゆり (30423247)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 22.  久堀 徹 (40181094)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 23.  魚住 信之 (40223515)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 24.  高橋 裕一郎 (50183447)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 25.  鹿内 利治 (70273852)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 26.  栗栖 源嗣 (90294131)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 27.  矢守 航 (90638363)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 28.  鈴木 宏明 (20372427)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 29.  二井手 哲平 (20802705)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 30.  Takahashi Chihiro
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 31.  KATO Yusuke
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 32.  MIYAGI ATSUKO
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 33.  山田 真紀
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 34.  長野 稔
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results

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