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HANDA Naofumi  半田 直史

ORCIDConnect your ORCID iD *help
Researcher Number 00396855
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2011: The University of Tokyo, 新領域創成科学研究科, その他
2010 – 2011: 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 特任助教
2008: The University of Tokyo, 大学院・新領域創成科学研究科, 特任助教
2008: The University of Tokyo, 大学院新領域創成科学研究科, 特任助教
2007: The University of Tokyo, 大学院・新領域創成科学研究科, 寄付講座教員 … More
2006: 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 産学官連携研究員
2005 – 2006: 東京大学, 大学院・新領域創成科学研究科, 産学官連携研究員
2005: Department of Medical Genome Sciences, Graduate School of Frontier Science, SA Research Associates, 大学院新領域創成科学研究科, 産学官連携研究員(特任助手) Less
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Biological Sciences / Molecular biology / Biological Sciences / Bacteriology (including Mycology) / Genetics/Genome dynamics
Except Principal Investigator
Genetics/Genome dynamics / 基礎ゲノム科学 / Biological Sciences
Keywords
Principal Investigator
相同組換え / ゲノム / 分子モーター / ナノバイオ / タンパク-DNA相互作用 / 蛋白質-DNA相互作用 / DNA二本鎖切断 / ゲノムの安定化 / 生体ナノマシン / 1分子解析 … More / タンパク質-DNA相互作用 / DNA修復 / タンパク質結晶構造 / タンパク質相互作用 / 天然変性タンパク質 / 病原細菌 / DNA分解酵素 / 制限酵素 / 微生物ゲノム / 微生物 / 光ピンセット / 生体生命情報学 … More
Except Principal Investigator
ゲノム進化 / ゲノム再編 / 動く遺伝子 / 利己的遺伝子 / 制限酵素 / 細菌ゲノム / ゲノム / ゲノム維持 / ゲノム構築 / phage / pathogenic bacteria / bacterial genome / genome evolution / mobile element / restriction enzyme / selfish gene / genome / ファージ / 病原細菌 / Environment / Biotechnology / Protein structure / Comparative genomics / Genome evolution / Genome rearrangements / Bacteria / Genome / 非相同組換え / DNA修復 / 相同組み換え / 進化 / 遺伝子 / ゲノム安定性 / 染色体切断 / 感染症 / 枯草菌 / 遺伝子増幅 / ゲノム工学 / ゲノム・ダイナミックス / 環境 / バイオテクノロジー / たんぱく立体構造 / 比較ゲノム / 細菌 / ゲノム発現 / ゲノム機能 Less
  • Research Projects

    (10 results)
  • Research Products

    (211 results)
  • Co-Researchers

    (9 People)
  •  天然変性部位がDNAの分解と組換えの切り替えを行う酵素の反応機構Principal Investigator

    • Principal Investigator
      半田 直史
    • Project Period (FY)
      2010 – 2011
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  自己DNA識別修復酵素の自己DNAシグナル配列認識の分子機構Principal Investigator

    • Principal Investigator
      半田 直史
    • Project Period (FY)
      2010 – 2011
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Molecular biology
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Selfish DNases at a diverging point to survival, death and evolution

    • Principal Investigator
      KOBAYASHI Ichizo
    • Project Period (FY)
      2009 – 2011
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Genetics/Genome dynamics
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  自己ゲノムDNAを識別して修復するATP駆動モーターの一分子生化学Principal Investigator

    • Principal Investigator
      半田 直史
    • Project Period (FY)
      2007 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  制限酵素修飾酵素遺伝子の利己的ライフサイクル:転移・増幅・伝達の実験室での再現

    • Principal Investigator
      小林 一三
    • Project Period (FY)
      2007 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • Research Field
      Genetics/Genome dynamics
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Barrier for transfer of foreign DNA stretch from environment to prevent break-out of new pathogenic bacteriaPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      HANDA Naofumi
    • Project Period (FY)
      2007 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Bacteriology (including Mycology)
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  ゲノム維持ナノマシン:DNA分解修復を支配するATP駆動モーターの一分子生化学Principal Investigator

    • Principal Investigator
      半田 直史
    • Project Period (FY)
      2005 – 2006
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  非自己ゲノムを分解し、自己ゲノムを修復する組換え酵素の「一分子」遺伝学Principal Investigator

    • Principal Investigator
      半田 直史
    • Project Period (FY)
      2005 – 2006
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Genetics/Genome dynamics
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Selfish genetic elements involved both in the maintenance and rearrangement of the genome

    • Principal Investigator
      KOBAYASHI Ichizo
    • Project Period (FY)
      2005 – 2006
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      基礎ゲノム科学
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Death and regeneration of genome Biology of DNAdouble-strand break and the response

    • Principal Investigator
      KOBAYAHSI Ichizo
    • Project Period (FY)
      2001 – 2005
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      The University of Tokyo

All 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 2003 2001 Other

All Journal Article Presentation Book

  • [Book] DNA Double-strand Breaks and their Consequences in Bacteria、the Encyclopedia of Life Sciences2009

    • Author(s)
      I. Kobayashi, N. Handa.
    • Publisher
      Nature Publishing Group, Macmillan Reference Limited, London (on-line publication)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Book] タンパク質実験マニュアル第4章 RecBCD酵素の精製法2007

    • Author(s)
      胡桃坂編, 半田直史, 他28名
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      朝倉書店
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Book] 生化学辞典 第4版2007

    • Author(s)
      小林一三, 半田直史, 組換え酵素 : 今堀和友, 山川民夫監修 大島泰郎, 鈴木紘一 脊山洋右 新井洋由 石浦章一 大隈良典 岸本健雄, 正木春彦, 山本一夫(編)
    • Total Pages
      380
    • Publisher
      東京化学同人
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Book] 生化学辞典第4版2007

    • Author(s)
      小林 一三, 半田 直史
    • Total Pages
      1616
    • Publisher
      東京化学同人
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Book] 組換え酵素:今堀和友 山川民夫 監修 大島泰郎、鈴木紘一、脊山洋右、新井洋由、石浦章一、大隈良典、岸本健雄、正木春彦、山本一夫(編) 生化学辞典 第4版2007

    • Author(s)
      小林一三、半田直史
    • Total Pages
      380
    • Publisher
      東京化学同人
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Book] タンパク質実験マニュアル(第4章 RecBCD酵素の精製法)2007

    • Author(s)
      胡桃坂編, 半田直史, 他28名
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      朝倉書店
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Book] Biochemical Dictionary, 4th Edition2007

    • Author(s)
      Ichizo Kobayashi, Naofumi Handa
    • Total Pages
      1616
    • Publisher
      Tokyo Kagaku Dojin
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Book] 組換え酵素:今堀和友 山川民夫 監修 大島泰郎、鈴木紘一、脊山洋右、新井洋由、石浦章一、大隈良典、岸本健雄、正木春彦、山本一夫(編) 生化学辞典 第4版2007

    • Author(s)
      小林一三、半田直史
    • Total Pages
      380
    • Publisher
      東京化学同人
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Book] 「RecBCD酵素の精製法」 タンパク質実験マニュアル(胡桃坂編)2006

    • Author(s)
      半田直史
    • Total Pages
      168
    • Publisher
      朝倉書店
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Book] Purification of RecBCD enzyme in Escherichia coli in Manual for Protein Experiments ed.by Kurumizaka2006

    • Author(s)
      Naofumi Handa
    • Total Pages
      168
    • Publisher
      Asakura Shoten(Tokyo)
    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Book] 「RecBCD酵素の精製法」タンパク質実験マニュアル(胡桃坂編)2006

    • Author(s)
      半田 直史
    • Total Pages
      168
    • Publisher
      朝倉書店
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Genome-wide survey of mutual homologous recombination in a highly sexual bacterial species2012

    • Author(s)
      K Yahara, et al., I Kobayashi
    • Journal Title

      Genome Biol. Evol

      Volume: 4(5) Issue: 5 Pages: 628-640

    • DOI

      10.1093/gbe/evs043

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001, KAKENHI-PROJECT-22406026, KAKENHI-PUBLICLY-24113506, KAKENHI-PROJECT-24790412, KAKENHI-PLANNED-22114006
  • [Journal Article] Molecular determinants responsible for recognition of the single-stranded DNA regulatory sequence, χ, by RecBCD enzyme2012

    • Author(s)
      N Handa, et al., I Kobayashi, S C Kowalczykowski
    • Journal Title

      Proc. Nat.Acad. Sci. USA

      Volume: 109(23) Issue: 23 Pages: 8901-8906

    • DOI

      10.1073/pnas.1206076109

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Birth and death of genes linked to chromosomal inversion2011

    • Author(s)
      Furuta Y, Kawai M, Yahara K, Takahashi N, Handa N, Tsuru T, Oshima K, Yoshida M, Azuma T, Hattori M, Uchiyama I, Kobayashi I
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 108 Pages: 1501-1506

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a methyl-specific endonuclease2011

    • Author(s)
      Ken Ishikawa, Naofumi Handa, Lauren Sears, Lise Raleigh, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Pages: 1-10

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Evolution in an oncogenic bacterial species with extreme genome plasticity: Helicobacter pylori East Asian genomes2011

    • Author(s)
      M Kawai, et al., I Kobayashi
    • Journal Title

      BMC Microbiology

      Volume: 11 Issue: 1 Pages: 104-104

    • DOI

      10.1186/1471-2180-11-104

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Birth and death of genes linked to chromosomal inversion2011

    • Author(s)
      Furuta Y, Kawai M, Yahara K, Takahashi N, Handa N, Tsuru T, Oshima K, Yoshida M, Azuma T, Hattori M, Uchiyama I, Kobayashi I
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 108 Pages: 1501-1506

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a methyl-specific endonuclease2011

    • Author(s)
      Ishikawa K, Handa N, Sears L, Raleigh E, Kobayashi I
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a methyl-specific endonuclease2011

    • Author(s)
      Ishikawa K, Handa N, Sears L, Raleigh E, Kobayashi I
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Journal Article] Birth and death of genes linked to chromosomal inversion2011

    • Author(s)
      Y Furuta*, M Kawai*, et al., I Kobayashi (*: Equal contribution)
    • Journal Title

      Proc. Nat. Acad. Sci. USA

      Volume: 108 no. 4 Issue: 4 Pages: 1501-1506

    • DOI

      10.1073/pnas.1012579108

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Contribution of RecFOR machinery of homologous recombination to cell survival after loss of a restriction-modification gene complex2009

    • Author(s)
      Handa N, Ichige A, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Microbiology (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Maintenance forced by a restriction-modification System can be modulated by a region in its modification enzyme not essential for the methyltransferase actjvity2009

    • Author(s)
      Satona ohno*, Naohumi Handa*, Miki Watanabe-Matsui Noriko Takahashi, Ichizo Kobayashi (*Equal contribution)
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 190

      Pages: 2039-2049

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Journal Article] ゲノムDNA二重鎖切断とその修復の高感度検出法の開発2009

    • Author(s)
      小林一三、半田直史、河合幹彦、高橋規子、福田江里
    • Journal Title

      Proceedings of the twenty-fifth Space Utilization Symposium, Space Utilization Research

      Volume: 25 Pages: 39-41

    • NAID

      120006830503

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a Type I restriction endonuclease2009

    • Author(s)
      Ishikawa K, Handa N, Kobayashi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Contribution of RecFOR machinery of homologous recombination to cell survival after loss of a restriction-modification gene complex2009

    • Author(s)
      Handa N, Ichige A, Kobayashi I
    • Journal Title

      Microbiology 印刷中

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a Type I restriction endonuclease2009

    • Author(s)
      Ishikawa K, Handa N, Kobayashi I
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 印刷中

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Reconstitution of Initial Steps of Double-strand DNA Break Repair by the RecF pathway of E. coll2009

    • Author(s)
      Handa N, Morimatsu K, Lovett ST, Kowalczvkowski SC
    • Journal Title

      Genes Dev (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Contribution of RecFOR machinery of homologous recombinatio to cell survival after loss of a restriction-modification gene complex.2009

    • Author(s)
      Handa N, Ichige A, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Microbiology (印刷中 掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Journal Article] Reconstitution of Initial Steps of Double-strand DNA Break Repair by the RecF pathway of E. coli2009

    • Author(s)
      Handa N, Morimatsu K, Lovett ST, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      Genes Dev 23

      Pages: 1234-1245

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Contribution of RecFOR machinery of homologous recombination to cell survival after loss of a restriction-modification gene complex2009

    • Author(s)
      N Handa, A Ichige, and I Kobayashi
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 155 Issue: 7 Pages: 2320-2332

    • DOI

      10.1099/mic.0.026401-0

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a Type I restriction endonuclease.2009

    • Author(s)
      Ishikawa K, Handa N, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research (印刷中 掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a Type I restriction endonuclease2009

    • Author(s)
      Ken Ishikawa, Naofumi Handa, Ichizo Kobayashi.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 37(11) Pages: 3531-3544

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] DNA Double- strand Breaks and their Consequences in Bacteria2009

    • Author(s)
      I Kobayashi and N Handa
    • Journal Title

      Encyclopedia of Life Sciences

      Volume: DOI:10.1002/9780470015902.a0000576.pub2

    • DOI

      10.1002/9780470015902.a0000576.pub2

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Reconstitution of Initial Steps of Double-strand DNA Break Repair by the RecF pathway of E. coli2009

    • Author(s)
      N Handa, K Morimatsu, S T Lovett, and S C Kowalczykowski
    • Journal Title

      Genes and Development

      Volume: 23 Issue: 10 Pages: 1234-1245

    • DOI

      10.1101/gad.1780709

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Sentsitive detection of DNA double-strand breakage and its repair. Proceedings of the twenty-fifth Space Utilization Symposium2009

    • Author(s)
      Ichizo Kobayashi, Naofumi Handa, Mikihiko Kawai, Noriko Takahashi, Eri Fukuda.
    • Journal Title

      Space Utilization Research 25

      Pages: 39-41

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Journal Article] Contribution of RecFOR machinery of homologous recombination to cell survival after loss of a restriction-modification gene complex2009

    • Author(s)
      Handa N, Ichige A, Kobayashi I
    • Journal Title

      Microbiology (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Journal Article] Single-molecule analysis of a red fluorescent RecA protein reveals a defect in nucleoprotein filament nucleation that relates to its reduced biological functions2009

    • Author(s)
      Handa N, Amitani I, Gumlaw N, Sandler SJ, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Journal Article] Single-molecule analysis of a red fluorescent RecA protein reveals a defect in nucleoprotein filament nucleation that relates to its reduced biological functions2009

    • Author(s)
      Handa N, Amitani I, Gumlaw N, Sandler SJ, Kowalczykowski SC.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem 印刷中

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Cleavage of a model DNA replication fork by a Type I restrition endonuclease2009

    • Author(s)
      Ishikawa K, Handa N, Kobayashi I
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Journal Article] Single-molecule analysis of a red fluorescent RecA protein reveals adefect in nucleoprotein filament nucleation that relates to its reduc ed biological functions2009

    • Author(s)
      Handa N, Amitani I, Gumlaw N, Sandler SJ, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Reconstitution of Initial Steps of Double-strand DNA Break Repair by the RecF pathway of E. coli2009

    • Author(s)
      Handa N, Morimatsu K, Lovett ST, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      Genes Dev (印刷中)(掲載確定)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Journal Article] Single-molecule analysis of a red fluorescent RecA protein reveals a defect in nucleoprotein filament nucleation that relates to its reduced biological functions2009

    • Author(s)
      N Handa, et al., S C Kowalczykowski
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 284 Issue: 28 Pages: 18664-18673

    • DOI

      10.1074/jbc.m109.004895

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Journal Article] Maintenance forced by a restriction-modification system can be modulated by a region in its modification enzyme not essential for the methyltransferase activity2008

    • Author(s)
      Satona Ohno*, Naohumi Handa*, Miki Watanabe, Noriko Takahashi, Ichizo Kobavashi
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 190

      Pages: 2039-2049

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Maintenance forced by a restriction-modification system can be modulated by a region in its modification enzyme not essential for the methyltransferase activity.2008

    • Author(s)
      Ohno S^*, Handa N^*, Watanabe M, Takahashi N, Kobayashi I (*: Equal contribution)
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 190

      Pages: 2039-2049

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Maintenance forced by a restriction-modification system can be modulated by a region in its modification enzyme not essential for the methyltransferase activity2008

    • Author(s)
      Ohno S*, Handa N*, Watanabe M, Takahashi N, Kobayashi I (*: Equal contribution)
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 190

      Pages: 2039-2049

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Maintenance forced by a restriction-modification system can be modulated by a region in its modification enzyme not essential for the methyltransferase activity.2008

    • Author(s)
      Ohno S*, Handa N*, Watanabe M, Takahashi N, Kobayashi I (*: Equal contribution)
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 190

      Pages: 2039-2049

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Journal Article] Maintenance forced by a restriction-modification system can be modulated by a region in its modification enzyme. not essential for themethyltransferase activity2008

    • Author(s)
      Satona Ohno*, Naohumi Handa*, Miki Watanabe, Noriko Takahashi, Ichizo Kobavashi.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 190

      Pages: 2039-2049

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] A RecA mutant, RecA73O, suppresses the recombination deficiency of the RecBC 1OO4D-χ^* interaction in vitro and in vivo.2007

    • Author(s)
      Handa N, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      J Mol Biol. 365

      Pages: 1314-1325

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Journal Article] A RecA mutant, RecA730, suppresses the recombination deficiency of the RecBC1OO4DChi* interaction in vitro and in vivo2007

    • Author(s)
      Handa N, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      J Mol Biol 365

      Pages: 1314-25

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] A RecA mutant, RecA73O, suppresses the recombination deficiency of the RecBC1004D-□^* interaction in vitro and in vivo.2007

    • Author(s)
      Handa N, Kowalczykowski SC.
    • Journal Title

      J Mol Biol. 365

      Pages: 1314-1325

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Journal Article] A RecA mutant, RecA730, suppresses the recombination deficiency of the RecBC1004D-Chi interaction in vitro and in vivo.2007

    • Author(s)
      Handa N, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      J Mol Biol, 365

      Pages: 1314-25

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA methyltransferase, M.PabI, from Pyrococcus abyss2007

    • Author(s)
      Watanabe M, Handa N, Yuzawa H, Kobayashi I
    • Journal Title

      Proceedings of International Symposium on Extremophiles and Their Applications 205

      Pages: 161-166

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA methyltransferase, M. PabI, from Pyrococcus abyssi2007

    • Author(s)
      Watanabe M, Handa N, Yuzawa H, Kobayashi I
    • Journal Title

      Proceedings of International Symposium on Extremophiles and Their Applications 205

      Pages: 161-166

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA methyltransferase, M. PabI, from Pyrococcus abyssi2007

    • Author(s)
      Watanabe M, Handa N, Yuzawa H, Kobayashi I
    • Journal Title

      Proceedings of International Symposium on Extremophiles and Their Applications 205

      Pages: 161-166

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Journal Article] A RecA mutant,RecA730,suppresses the recombination deficiency of the RecBC1004D-Chi*interaction in vitro and anvavo2007

    • Author(s)
      Handa N, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      J Mol Biol 365

      Pages: 1314-25

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] The AddAB helicase/nuclease forms a stable complex with its cognate chi sequence during translocation.2006

    • Author(s)
      Chedin F, Handa N, Dillingham MS, Kowalczykowski SC.
    • Journal Title

      J Biol Chem. 281

      Pages: 18610-18617

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Journal Article] The AddAB helicase/nuclease forms a stable complex with its cognate□sequence during translocation2006

    • Author(s)
      Frederic Chedin, Naofumi Handa, Mark S.Dillingham, and Stephen C.Kowalczykowski
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 281

      Pages: 18610-18617

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA Methyltransferase M.PabI(5'GTm6AC) from an Archaeon Pyrococcus abyssi.2006

    • Author(s)
      Miki Watanabe, Harumi Yuzawa, Naofumi Handa, Lciiizo Kobayasbi
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 72

      Pages: 5367-5375

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA Methyltransferase M.PabI(5'GTm6AC) from an Archaeon Pyrococeus abyssi.2006

    • Author(s)
      Miki Watanabe, Harumi Yuzawa, Naofiimi Handa, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 72

      Pages: 5367-5375

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Kowalczykowski, TheAddAB helicase/nuclease forms a stable complex with its cognate sequence during translocation2006

    • Author(s)
      Frederic Chedin, Naofumi Handa, Mark S. Dillingham, Stephen C.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 281

      Pages: 18610-18617

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA Methyltransferase M.PabI(5'GTm6AC)from an Archaeon Pyrococcus abyssi2006

    • Author(s)
      Miki Watanabe, Harumi Yuzawa, Naofumi Handa, and Ichizo Kobavashi
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 72

      Pages: 5367-5375

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA Methyltransferase M.PabI (5'GTm6AC) from an Archaeon Pyrococcus abyssi.2006

    • Author(s)
      Watanabe M, Yuzawa H, Handa N, Kobayashi I
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol. 72

      Pages: 5367-5375

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA Methyltransferase M.PabI (5'GTm6AC) from an Archaeon Pyrococcus abyssi.2006

    • Author(s)
      Watanabe M, Yuzawa H, Handa N, Kobayashi I
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol. 72

      Pages: 5367-5375

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Journal Article] The AddAB helicase/nuclease forms a stable complex with its cognate sequence during translocation,2006

    • Author(s)
      Frederic Chedin, Naofumi Handa, Mark S. DIllingham, Stephen C. Kowalczykowski
    • Journal Title

      Jounal of Biological Chemistry 281

      Pages: 18610-18617

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] The AddAB helicase/nuclease forms a stable complex with its cognate chi sequence during translocation.2006

    • Author(s)
      Chedin F, Handa N, Dillingham MS, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      J Biol Chem. 281

      Pages: 18610-18617

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA Methyltransferase M.Pabl(5'GTm6AC)from an Archaeon Pyrococcus abyssi2006

    • Author(s)
      Miki Watanabe, Naofumi Handa, Harumi Yuzawa and Ichizo Kobavashi
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 72

      Pages: 5367-5375

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Hyperthermophilic DNA Methyltransferase M.PabI(5' GTm6AC)from an Archaeon Pyrococcus abyssi.2006

    • Author(s)
      Miki Watanabe, Harumi Yuzawa, Naofumi Handa, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbilogy 72

      Pages: 5367-5375

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Single Molecule Study of a Recombinase2005

    • Author(s)
      Naofumi Handa
    • Journal Title

      Protein, Nucleic Acid and Enzyme 50 : 11

      Pages: 1429-1435

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] A trial of somatic gene targeting in vivo with an adenovirus vector2005

    • Author(s)
      AsamiIno, Yasuhiro Naito, Hiroyuki Mizuguchi, Naofumi Handa, Takao Hayakawa, and Ichizo Kobavashi
    • Journal Title

      Genetic Vaccines and Therapy 3

      Pages: 8-8

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] A trial of somatic gene targeting in vivo with an adenovirus vector.2005

    • Author(s)
      Ino A, Naito Y, Mizuguchi H, Handa N, Hayakawa T, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Genetic Vaccines and Therapy 3

      Pages: 8-8

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by bacteriophage (RecE) homologous recombination function but enhanced by bacterial (RecBCD) function.2005

    • Author(s)
      Naofumi Handa, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] A trial of somatic gene targeting in vivo with an adenovirus vector2005

    • Author(s)
      Asami Ino, Yasuhiro Naito, Hiroyuki Mizuguchi, Naofumi Handa, Takao Hayakawa, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Genetic Vaccines and Therapy 3

      Pages: 8-8

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Direct Visualization of RecBCD Movement Reveals Cotranslocation of the RecD Motor after chi Recognition2005

    • Author(s)
      Handa N, Bianco PR, Baskin RJ, Kowalczykowski SC
    • Journal Title

      Mol Cell 17

      Pages: 745-750

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by vacteriophage(Rec E) homologous recombination functin but enhanced by bacterial (Rec BCD) function.2005

    • Author(s)
      Naofumi Handa, et al.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by bacteriophage (RecE) homologous recombination function but enhanced by bacterial (RecBCD) function.2005

    • Author(s)
      Naofumi Handa., et al.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by bacteriophage(RecE) homologous recombination function but enhanced by bacterial(RecBCD) function2005

    • Author(s)
      Naofumi Handa, Ichizo Kobayashi.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] ゲノムを維持する組換え酵素の一分子生化学2005

    • Author(s)
      半田直史
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 50・11

      Pages: 1429-1435

    • NAID

      40006927839

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Journal Article] Direct Visualization of RecBCD Movement Reveals Cotranslocation of the RecD Motor after chi Recognition.2005

    • Author(s)
      Handa N, Bianco PR, Baskin RJ, Kowalczykowski Sc
    • Journal Title

      Mol Cell. 17

      Pages: 45-750

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] ゲノムを維持する組換え酵素の一分子生化学2005

    • Author(s)
      半田直史
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 50・11

      Pages: 1429-1435

    • NAID

      40006927839

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Journal Article] A trial of somatic gene targeting in vivo with an adenovirus vector.2005

    • Author(s)
      Ino A, Naito Y, Mizuguchi H, Handa N, Hayakawa T, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Genetic Vaccines and Therapy 3

      Pages: 8-8

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by bacteriophage (RecE) homologous recombination function but enhanced by bacterial (RecBCD) function.2005

    • Author(s)
      Handa N, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by bacteriophage (RecE) homologous recombination function but enhanced by bacterial (RecBCD) function.2005

    • Author(s)
      Naofumi Handa, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Direct Visualization of RecBCD Movement Reveals Cotranslocation of the RecD Motor after chi Recognition.2005

    • Author(s)
      Handa N, Bianco PR, Baskin RJ, Kowalczykowski SC.
    • Journal Title

      Molecular Cell 17

      Pages: 745-750

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770001
  • [Journal Article] A trial of somatic gene targeting in vivo with an adenovirus vector2005

    • Author(s)
      Asami Ino, Yasuhiro Naito, Hiroyuki Mizuguchi, Naofumi Handa, Takao Hayakawa, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Genetic Vaccines and Therapy 3

      Pages: 8-8

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] ゲノムを維持する組換え酵素の一分子生化学2005

    • Author(s)
      半田 直史
    • Journal Title

      蛋白核酸酵素 50:11

      Pages: 1429-1435

    • NAID

      40006927839

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by bacteriophage (RecE)homologous recombination function but enhanced by bacterial(RecBCD)function2005

    • Author(s)
      Naofumi Handa, Ichizo Kobayashi
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17310113
  • [Journal Article] Type III restriction is alleviated by bacteriophage (RecE) homologous recombination function but enhanced by bacterial (RecBCD) function.2005

    • Author(s)
      Handa N, Kobayashi I.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 187

      Pages: 7362-7373

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Journal Article] Direct Visualization of RecBCD Movement Reveals Cotranslocation of the RecD Motor after chi Recognition2005

    • Author(s)
      Handa N, et al.
    • Journal Title

      Mol Cell 17

      Pages: 745-750

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Direct Visualization of RecBCD Movement Reveals Cotranslocation of the RecD Motor after chi Recognition.2005

    • Author(s)
      Handa N, Bianco PR, Baskin RJ, Kowalczykowski SC.
    • Journal Title

      Molecular Cell 17

      Pages: 745-750

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17049008
  • [Journal Article] Direct Visualization of RecBCD Movement Reveals Cotranslocation of the RecD Motor after chi Recognition2005

    • Author(s)
      Handa N., et al.
    • Journal Title

      Mol Cell 17

      Pages: 745-750

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Accumulation of large non-circular forms of the chromosome in recombination-defective mutants of Escherichia coli2003

    • Author(s)
      N.Handa, et al.
    • Journal Title

      BMC Molecular Biology 4

      Pages: 5-5

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Accumulation of large non-circular forms of the chromosome in recombination-defective mutants of Escherichia coll.2003

    • Author(s)
      N.Handa., et al.
    • Journal Title

      BMC Molecular Biology 4

      Pages: 5-5

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Experimental genome evolution : large-scale genome rearrangements associated with resistance to replacement of a chromosomal restriction-modification gene complex.2001

    • Author(s)
      N.Handa, et al.
    • Journal Title

      Mol. Microbiol 40

      Pages: 932-940

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Journal Article] Experimental genome evolution : large-scale genome rearrangements associated with resistance to replacement of a chromosomal restriction-modification gene complex.2001

    • Author(s)
      N.Handa., et al.
    • Journal Title

      Mol. Microbiol 40

      Pages: 932-940

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-13141201
  • [Presentation] Genome-wide survey of homologous recombination and diversifying selection in an extremely sexual bacterial species2012

    • Author(s)
      K Yahara, M Kawai, Y Furuta, N Takahashi, N Handa. T Tsuru, K Oshima, M Yoshida. T Azuma, M Hattori. I Uchiyama, I Kobayashi
    • Organizer
      Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution 2012
    • Place of Presentation
      Dublin, Ireland(Poster Presentation)
    • Year and Date
      2012-06-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] 相同組換え率の分布と多様化選択:細菌でのゲノムワイド解析2012

    • Author(s)
      矢原耕史、河合幹彦、古田芳一、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、D Matelska, S D-Horkawicz, J Bujnicki, 内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      日本遺伝学会第84回大会
    • Place of Presentation
      九州大学、福岡
    • Year and Date
      2012-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2011

    • Author(s)
      古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2011-03-26
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2011

    • Author(s)
      古田芳一*, 河合幹彦*, 矢原耕史, 高橋規子, 半田直史, 鶴剛史, 大島健志朗, 吉田優, 東健, 服部正平, 内山郁夫, 小林一三(*:equalcontribution)
    • Organizer
      ゲノム微生物学会ワークショップ-ゲノムで繋がる微生物研究の新展開-
    • Place of Presentation
      仙台市東北大学(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ピロリ菌日本株ゲノム:超悪玉(?)発癌細菌の素顔2011

    • Author(s)
      河合幹彦、古田芳一、矢原耕史、鶴剛史、大島健志朗、半田直史、高橋規子、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜(ポスター発表)
    • Year and Date
      2011-12-14
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムから見る東アジア型ピロリ菌の進化2011

    • Author(s)
      内山郁夫、河合幹彦、古田芳一、矢原耕史、鶴剛史、大島健志朗.半田直史、高橋規子、吉田優、東健、服部正平、小林一三
    • Organizer
      第17回日本ヘリコバクター学会学術集会
    • Place of Presentation
      富山国際会議場、富山
    • Year and Date
      2011-06-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2011

    • Author(s)
      古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都 京都女子大学
    • Year and Date
      2011-03-26
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2011

    • Author(s)
      古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      宮城,東北学院大学
    • Year and Date
      2011-03-16
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2011

    • Author(s)
      古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      宮城 東北学院大学 土樋キャンパス
    • Year and Date
      2011-03-16
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] Novel genome rearrangement mechanisms detected by Helicobacter pylorigenome comparison2011

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress, BR30-3
    • Place of Presentation
      Sapporo Convention Center, Sapporo
    • Year and Date
      2011-09-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] DNA duplication associated with inversion (DDAI)and domain movement (DoMo) : two novel genome rearrangement mechanisms discovered through genome comparison2011

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      Annual Meeting of the Society for Molecular Biology and Evolution 2011 (SMBE2011)
    • Place of Presentation
      Kyoto Univ., Kyoto(poster presentation)
    • Year and Date
      2011-07-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Novel genome rearrangement mechanisms detected by Helicobacter pylori genome comparison2011

    • Author(s)
      Y Furuta, M Kawai, K Yahara, T Tsuru, N Takahashi, N Handa, K Oshiaa, M Hat tori, M Yoshida, T Azuma, I Uchiyama, I Kobayashi
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress (IUMS2011)
    • Place of Presentation
      Sapporo Convention Center, Sapporo, Japan
    • Year and Date
      2011-09-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2011

    • Author(s)
      古田芳一*、河合幹彦*、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、小林一三(*:equal contribution)
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      仙台市東北学院大学(口頭およびポスター発表)
    • Year and Date
      2011-03-16
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Genome rearrangements revealed through comparison of four complete genomes of Japanese Helicobacter pylori2010

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      XXIIIrd International Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation and gastric cancer, W7.2
    • Place of Presentation
      Rotterdam, The Netherlands
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Comparison of four complete genomes of Japanese Helicobacter pylori Genome rearrangements and genomic islands2010

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      Infectious Disease Genomics & Global Health 2010
    • Place of Presentation
      Hinxton, UK
    • Year and Date
      2010-09-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] クオラムセンシング遺伝子による、制限修飾系遺伝子EcoRIの発現調節とその生物学的意義2010

    • Author(s)
      半田直史、坂井亜紀子、橋口令、市毛朝雄、小林一三
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫 神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2010

    • Author(s)
      小林一三、古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫,神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-07
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] Genome rearrangements revealed through comparison of four complete genomes of Japanese Helicobacter pylori2010

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      XXIIIrd International Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation and gastric cancer
    • Place of Presentation
      Rotterdam, The Netherlands
    • Year and Date
      2010-09-18
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2010

    • Author(s)
      小林一三、古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会、1A-02
    • Place of Presentation
      札幌
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] クオラムセンシング遺伝子による、制限修飾系遺伝子EcoRIの発現調節とその生物学的意義2010

    • Author(s)
      半田直史、坂井亜紀子、橋口令、市毛朝雄、小林一三
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫,神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-09
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] ピロリ菌10株のゲノム比較によるゲノム再編の検出2010

    • Author(s)
      河合幹彦、古田芳一、鶴剛史、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第83回日本細菌学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市パシフィコ横浜(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2010

    • Author(s)
      小林一三、古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2010-09-20
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] ピロリ菌10株のゲノム比較によるゲノム再編の検出2010

    • Author(s)
      河合幹彦、古田芳一、矢原耕史、鶴剛史、高橋規子、半田直史、大島健志朗、服部正平、吉田優、東健、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第12回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      2010-08-04
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] クオラムセンシング遺伝子による、制限修飾系遺伝子EcoRIの発現調節とその生物学的意義2010

    • Author(s)
      半田直史, 坂井亜紀子, 橋口令, 市毛朝雄, 小林一三
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
    • Place of Presentation
      神戸市神戸国際会議場
    • Year and Date
      2010-12-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2010

    • Author(s)
      小林一三、古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫 神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2010-12-07
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] Complete genome sequences of multiple East Asian Helicobacter pylori strains reveals their co-evolution with human populations.2010

    • Author(s)
      Ichizo Kobayashi, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Yoshikazu Furuta, Takeshi Tsuru, Naofumi Handa, Noriko Takahashi, Kenshiro Oshima, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Masahira Hattori, Ikuo Uchiyama.
    • Organizer
      The 10th Japan-Korea International Symposium on Microbiology
    • Place of Presentation
      Yokohama, JAPAN(ポスター発表)
    • Year and Date
      2010-03-26
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ピロリ菌10株のゲノム比較によるゲノム再編の検出2010

    • Author(s)
      河合幹彦、古田芳一、矢原耕史、鶴剛史、高橋規子、半田直史、大島健志朗、服部正平、吉田優、東健、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第12回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      東京 東京工業大学 大岡山キャンパス
    • Year and Date
      2010-08-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] Comparison of four complete genomes of Japanese Helicobacter pylori : Genome rearrangements and genomic islands2010

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      Infectious Disease Genomics & Global Health 2010
    • Place of Presentation
      Hinxton, UK
    • Year and Date
      2010-09-13
    • Data Source
      KAKENHI-PUBLICLY-22113503
  • [Presentation] Comparison of four complete genomes of Japanese Helicobacter pylori : Genome rearrangements and genomic islands2010

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      Infectious Disease Genomics & Global Health 2010, 32
    • Place of Presentation
      Hinxton, UK(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Genome rearrangements revealed through comparison of four complete genomes of Japanese Helicobacter pylori2010

    • Author(s)
      Yoshikazu Furuta, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Takeshi Tsuru, Noriko Takahashi, Naofumi Handa, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      XXIIIrd International Workshop on Helicobacter and related bacteria in chronic digestive inflammation and gastric cancer
    • Place of Presentation
      Rotterdam, The Netherlands
    • Year and Date
      2010-09-18
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] 多数株の種内比較によるゲノム進化ダイナミクス解析2010

    • Author(s)
      河合幹彦、矢原耕史、古田芳一、鶴剛史、半田直史、高橋規子、大島健志朗、服部正平、吉田優、東健、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第4回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      九州大学、福岡(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] H.pylori evolution : clues from Japanese isolates' genomesSelfish restriction systems switching on bacterial death program2010

    • Author(s)
      Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Yoshikazu Furuta, Takeshi Tsuru, Naofumi Handa, Noriko Takahashi, Kenshiro Oshima, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Masahira Hattori, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      Hannover Medical School
    • Place of Presentation
      Hannover, Germany
    • Year and Date
      2010-08-06
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ピロリ菌10株のゲノム比較によるゲノム再編の検出2010

    • Author(s)
      河合幹彦、矢原耕史、古田芳一、鶴剛史、半田直史、高橋規子、大島健志朗、服部正平、吉田優、東健、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第4回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      九州大学、福岡(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ピロリ菌10株のゲノム比較によるゲノム再編の検出2010

    • Author(s)
      河合幹彦、古田芳一、矢原耕史、鶴剛史、高橋規子、半田直史、大島健志朗、服部正平、吉田優、東健、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第12回日本進化学会大会、OP4-8
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2010

    • Author(s)
      小林一三、古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会(BMB2010)
    • Place of Presentation
      神戸市神戸国際会議場(口頭およびポスター発表)
    • Year and Date
      2010-12-07
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ゲノムDNAの逆位に伴った遺伝子の重複と崩壊2010

    • Author(s)
      小林一三、古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、高橋規子、半田直史、鶴剛史、大島健志朗、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫
    • Organizer
      日本遺伝学会第82回大会
    • Place of Presentation
      北海道 北海道大学 高等教育機能開発総合センター
    • Year and Date
      2010-09-20
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22770167
  • [Presentation] Why DNA tracking by restriction endonucleases? Cleavage of a model replication fork by a type I restriction endonuclease2010

    • Author(s)
      Ken Ishikawa, Naofumi Handa, Ichizo Kobayashi.
    • Organizer
      6th New England Biolabs Meeting on Restriction/Modification, P20
    • Place of Presentation
      Bremen, Germany(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] 種内多数全ゲノム配列比較の戦略2009

    • Author(s)
      小林一三、東健、吉田優、河合幹彦、古田芳一、鶴剛史、半田直史、高橋規子、服部正平、大嶋健志朗、矢原耕史
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会シンポジウム「遺伝学のゲノム革命と次世代シーケンサー」
    • Place of Presentation
      信州大学、松本
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Helicobacter pylori isolated from Japan : genome sequences of 4 strains characterized by comparison with others2009

    • Author(s)
      河合幹彦、内山郁夫、矢原耕史、古田芳一、鶴剛史、半田直史、高橋規子、大島健志朗、服部正平、吉田優、東健、小林一三
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] 細菌のDNA複製フォークの制限酵素による切断2009

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会, 1A-04
    • Place of Presentation
      信州大学、松本
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] 大腸菌のRecF相同組換え経路の再構成2009

    • Author(s)
      半田直史、森松克実、Susan T.Lovett、Stephen C.Kowalczykowski.
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学、松本
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] 大腸菌の相同組換え酵素のサブユニット構成を変えた時の振る舞い2009

    • Author(s)
      半田直史
    • Organizer
      第82回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] DNA複製フォークのI型制限酵素による切断2009

    • Author(s)
      石田健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] Resection ; an important step for homologous recombination2009

    • Author(s)
      半田直史、森松克実、Susan T.Lovett, Stephen C.Kowalczykowski.
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] DNA複製フォークのI型制限酵素による切断:ゲノム維持機構としてのプログラム死?,3P-585(3T18p-6)2009

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-10-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Complete genome sequences of four Japanese H.pylori strains and their comparative analyses.2009

    • Author(s)
      Ichizo Kobayashi, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Yoshikazu Furuta, Takeshi Tsuru, Naofumi Handa, Noriko Takahashi, Kenshiro Oshima, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Masahira Hattori, Ikuo Uchiyama.
    • Organizer
      Sapporo Cancer Seminar 2009 (SCS2009)
    • Place of Presentation
      Sapporo(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Complete genome sequences of multiple Japanese Helicobacter pylori strains : a progress report.2009

    • Author(s)
      Ichizo Kobayashi, Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Yoshikazu Furuta, Takeshi Tsuru, Naofumi Handa, Noriko Takahashi, Kenshiro Oshima, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Masahira Hattori, Ikuo Uchiyama
    • Organizer
      CHRO 2009 : 15th International Workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms
    • Place of Presentation
      Toki Messe, Niigata, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] ピロリ菌10株のゲノム比較によるゲノム再編の検出2009

    • Author(s)
      古田芳一、河合幹彦、矢原耕史、大島健志朗、高橋規子、半田直史、吉田優、東健、服部正平、内山郁夫、小林一三
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、横浜(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] 利己的な遺伝子によるプログラム死:DNA複製フォークの切断2009

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第11回日本進化学会,P08-08
    • Place of Presentation
      札幌(ポスター発表)
    • Year and Date
      2009-09-03
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] 相同組換え初期反応の試験管内再構成2009

    • Author(s)
      半田直史、森松克実、Susan T.Lovett、Stephen C.Kowalczykowski.
    • Organizer
      第6回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      熱海
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] East Asian Helicobacter pylori Genomes : Co-evolution with their Human Host.2009

    • Author(s)
      Mikihiko Kawai, Koji Yahara, Yoshikazu Furuta, Takeshi Tsuru, Naofumi Handa, Noriko Takahashi, Kenshiro Oshima, Masaru Yoshida, Takeshi Azuma, Masahira Hattori, Ikuo Uchiyama, Ichizo Kobayashi
    • Organizer
      Global COE Workshop on Bioinforxnatics in the Era of "Genome Information Big Bang"
    • Place of Presentation
      Shenzhen, China
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] DNA複製フォークのI型制限酵素による切断2009

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 日本分離ピロリ菌4株のゲノム配列決定と他株との比較によるその特徴づけ2009

    • Author(s)
      河合幹彦、内山郁夫、矢原耕史、古田芳一、鶴剛史、半田直史、高橋規子、大島健志朗、服部正平、吉田優、東健、小林一三
    • Organizer
      第11回日本進化学会大会(札幌大会)
    • Place of Presentation
      北海道大学高等教育機能開発総合センター、札幌(ポスター発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] DNA複製フォークのI型制限酵素による切断2009

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] ゲノムDNA二重鎖切断とその修復の高感度検出法の開発2009

    • Author(s)
      小林一三、半田直史、河合幹彦、高橋規子、福田江里
    • Organizer
      第25回宇宙利用シンポジウム
    • Place of Presentation
      JAXA相模原キャンパス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] 複数のタンパク質が働く相同組換え反応の再構成2009

    • Author(s)
      半田直史、森松克実、Susan T.Lovett、Stephen C.Kowalczykowski.
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21370001
  • [Presentation] Behavior of a RecBCD enzyme with a RecB-RecD subunit fusion2008

    • Author(s)
      半田直史、Kowalczykowski, SC
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 複製フォーク型DNAに対するI型制限酵素の切断活性2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      東京大学生命科学研究ネットワークシンポジウム2008
    • Place of Presentation
      東大本郷キャンパス
    • Year and Date
      2008-09-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] DNA複製と制限のカップリング : in vitroでの複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      日本遺伝学会第80回大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一、鶴剛史、半田直史、小林一三
    • Organizer
      2007年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] Behavior of a RecBCD enzvme with/a RecB-RecD subunit fusion2008

    • Author(s)
      半田直史、Kowalczykowski, SC
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] Genomic ID sequence recognition by a genome maintenance enzyme2008

    • Author(s)
      半田直史
    • Organizer
      2^<nd> International Symposium on Bio-nanosystems
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] I型制限酵素EcoR124Iによる複製フォーク型DNAの切断2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      「染色体サイクルの制御ネットワーク」第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 利己的制限修飾遺伝子間に起きる、ゲノム上のメチル化サイトの取り合いが、ホスト殺しをもたらす2008

    • Author(s)
      Marat Sadykov, 半田直史、鶴剛史、小林一三
    • Organizer
      日本進化学会2008年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-08-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一, 半田直史, Marat Sadykov, 小林一三
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] I型制限酵素EcoR124Iは複製フォーク型DNAを切断する、2007年度組換え・染色体再編2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      第19回DNA複製・分配合同ワークショップ
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一、半田直史、Marat Sadykov、小林一三
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] Genomic ID sequence recognition by a genome maintenance enzyme2008

    • Author(s)
      半田直史
    • Organizer
      2nd International Symposium on Bio-nanosystems
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 制限修飾系遺伝子を失ったときのRecFOR組換え経路による二本鎖切断の修復2008

    • Author(s)
      半田直史、市毛朝雄、小林一三
    • Organizer
      2007年度組換え・染色体再編、第19回DNA複製・分配合同ワークショップ
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 制限修飾系遺伝子を失ったときのRecFOR組換え経路による二本鎖切断の修復、2007年度組換え・染色体再編2008

    • Author(s)
      半田直史, 市毛朝雄, 小林一三
    • Organizer
      第19回DNA複製・分配合同ワークショップ
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] Use of DNA modification gene as an alternative to antibiotic-resistance genes for selection of transfer and maintenance of foreign genes2008

    • Author(s)
      GEL, Handa N, Hirose A, Kobayashi I
    • Organizer
      第79回日本遺伝学会大会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] Genomic ID sequence recognition by a genome maintenance enzyme2008

    • Author(s)
      半田直史
    • Organizer
      2^<nd> International Symposium on Bio-nanosystems
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 二本鎖切断から開始されるホットスポットでの相同組換えに重要なRecAと一本鎖DNAの安定な結合2008

    • Author(s)
      半田 直史、Stephen C. Kowalczykowski
    • Organizer
      「染色体サイクルの制御ネットワーク」第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一、半田直史、Marat Sadykov、小林一三
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 二本鎖切断から開始されるホットスポットでの相同組換えに重要なRecAと一本鎖DNAの安定な結合2008

    • Author(s)
      半田 直史, Stephen C. Kowalczykowski
    • Organizer
      「染色体サイクルの制御ネットワーク」第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] Clevage of a DNA replication fork by a type I restriction enzyme2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一、半田直史、Marat Sadykov、小林一三
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      兵庫県神戸
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] Cleavage of a DNA replication fork by a type I restriction enzyme2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      第5回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      静岡県藤枝市
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 一般的なトキシンーアンチトキシン系同様のメカニズムによって、細胞死をより強く起こすように変化したEcoRII制限修飾系の解析2008

    • Author(s)
      大野里奈、半田直史、渡部美紀、高橋規子、小林一三
    • Organizer
      染色体サイクルの制御ネットワーク第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 利己的制限修飾遺伝子間に起きる、ゲノム上のメチル化サイトの取り合いが、ホスト殺しをもたらす2008

    • Author(s)
      Marat Sadykov, 半田直史、鶴剛史、小林一三
    • Organizer
      日本進化学会第10回大会
    • Place of Presentation
      東大駒場キャンパス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] Cleavage of a DNA replication fork by a type I restriction enzyme2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 利己的制限修飾遺伝子間に起きる、ゲノム上のメチル化サイトの取り合いが、ホスト殺しをもたらす2008

    • Author(s)
      Marat Sadykov, 半田直史, 鶴剛史, 小林一三
    • Organizer
      日本進化学会2008年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-08-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] I型制限酵素EcoR124Iは複製フォーク型DNAを切断する2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      2007年度組換え・染色体再編、第19回DNA複製・分配合同ワークショップ
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] I型制限酵素EcoR124Iによる複製フォーク型DNAの切断2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      染色体サイクルの制御ネットワーク第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一, 鶴剛史, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      2007年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第5回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      静岡県藤枝市
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 制限修飾系遺伝子を失ったときのRecFOR組換え経路による二本鎖切断の修復2008

    • Author(s)
      半田直史、市毛朝雄、小林一三
    • Organizer
      2007年度組換え・染色体再編、第19回DNA複製・分配合同ワークショップ
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第5回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      静岡県藤枝市
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] I型制限酵素EcoR124Iは複製フォーク型DNAを切断する2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      2007年度組換え・染色体再編、第19回DNA複製・分配合同ワークショップ
    • Place of Presentation
      伊豆
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 大腸菌の相同組換え酵素のサブユニット構成を変えた時の振る舞い2008

    • Author(s)
      半田直史
    • Organizer
      第82回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 一般的なトキシン-アンチトキシン系同様のメカニズムによって、細胞死をより強く起こすように変化したEcoRII制限修飾系の解析2008

    • Author(s)
      大野里奈, 半田直史, 渡部美紀, 高橋規子, 小林一三
    • Organizer
      「染色体サイクルの制御ネットワーク」第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] Use of DNA modification gene as an alternative to antibiotic-resistance genes for selection of transfer and maintenance of foreign genes2008

    • Author(s)
      GEL, Handa N, Hirose A, Kobayashi I
    • Organizer
      第79回日本遺伝学会大会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] DNA複製と制限のカップリング:in vitroでの複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      日本遺伝学会第80回大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] 一般的なトキシンーアンチトキシン系同様のメカニズムによって、細胞死をより強く起こすように変化したEcoRII制限修飾系の解析2008

    • Author(s)
      大野里奈、半田直史、渡部美紀、高橋規子、小林一三
    • Organizer
      「染色体サイクルの制御ネットワーク」第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      東大医科学研究所創立記念研究発表会
    • Place of Presentation
      東大医科研
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] I型制限酵素EcoR124Iによる複製フォーク型DNAの切断2008

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      「染色体サイクルの制御ネットワーク」第1回公開領域会議
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] Behavior of a RecBCD enzyme with a RecB-RecD subunit fusion2008

    • Author(s)
      半田直史、Kowalczykowski, SC
    • Organizer
      第6回3Rシンポジウム
    • Place of Presentation
      静岡県嬬恋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] ゲノム中で自己増幅した制限修飾遺伝子とそれに連鎖した遺伝子の発現量の増加2008

    • Author(s)
      古田芳一、鶴剛史、半田直史、小林一三
    • Organizer
      2007年度日本農芸化学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] DNA複製と制限のカップリング : in vitroでの複製フォーク型DNAのI型制限酵素による切断2008

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      日本遺伝学会第80回大会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 遺伝子の導入と維持の選択に、薬剤耐性遺伝子の代わりにDNA修飾遺伝子を利用する2007

    • Author(s)
      葛黎頴、半田直史、広瀬彩、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 遺伝子の導入と維持の選択マーカーとして、薬剤の代わりに、DNA修飾遺伝子を使用する2007

    • Author(s)
      葛黎頴、半田直史、広瀬彩、小林一三
    • Organizer
      第4回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      静岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 複製フォークに対するI型制限酵素ecoR124Iの構造特異的活性2007

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 変異型アンチキラー(メチル化酵素)によって増強された制限修飾系遺伝子による細胞死2007

    • Author(s)
      大野里奈、半田直史、渡部美紀、高橋規子、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 複数の制限修飾系の間でのDNAメチル化サイトの取り合いによって引き起こされる細胞死2007

    • Author(s)
      Marat R Sadykov、半田直史、鶴剛史、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 複数の制限修飾系の間でのDNAメチル化サイトの取り合いによって引き起こされる細胞死2007

    • Author(s)
      Marat Sadykov, 半田直史、鶴剛史、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19657002
  • [Presentation] 複製フォークに対するI型制限酵素ecoR124Iの構造特異的活性2007

    • Author(s)
      石川健、半田直史、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会, 第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] Use of DNA modification gene as an alternative to antibiotic-resistance genes for selection of transfer and maintenance of foreign genes2007

    • Author(s)
      GE L, Handa N, Hirose A, Kobayashi I
    • Organizer
      第79回日本遺伝学会大会
    • Place of Presentation
      岡山
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 遺伝子の導入と維持の選択に、薬剤耐性遺伝子の代わりにDNA 修飾遺伝子を利用する2007

    • Author(s)
      葛黎頴, 半田直史, 広瀬彩, 小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 複数の制限修飾系の間でのDNAメチル化サイトの取り合いによって引き起こされる細胞死2007

    • Author(s)
      Marat R Sadykov, 半田直史, 鶴剛史, 小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 複数の制限修飾系の間でのDNAメチル化サイトの取り合いによって引き起こされる細胞死2007

    • Author(s)
      Marat R Sadykov、半田直史、鶴剛史、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 複製フォークに対するI 型制限酵素ecoR124Iの構造特異的活性2007

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 変異型アンチキラー(メチル化酵素)によって増強された制限修飾系遺伝子による細胞死2007

    • Author(s)
      大野里奈、半田直史、渡部美紀、高橋規子、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 遺伝子の導入と維持の選択マーカーとして、薬剤の代わりに、DNA修飾遺伝子を使用する2007

    • Author(s)
      葛黎頴, 半田直史, 広瀬彩, 小林一三
    • Organizer
      第4回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      静岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] 遺伝子の導入と維持の選択に、薬剤耐性遺伝子の代わりにDNA修飾遺伝子を利用する2007

    • Author(s)
      葛黎頴、半田直史、広瀬彩、小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19037006
  • [Presentation] 変異型アンチキラー(メチル化酵素)によって増強された制限修飾系遺伝子による細胞死2007

    • Author(s)
      大野里奈, 半田直史, 渡部美紀, 高橋規子, 小林一三
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • [Presentation] DNA複製フォークのI型制限酵素による切断

    • Author(s)
      石川健, 半田直史, 小林一三
    • Organizer
      日本農芸化学会2009年度大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19790316
  • 1.  KOBAYASHI Ichizo (30126057)
    # of Collaborated Projects: 6 results
    # of Collaborated Products: 90 results
  • 2.  TAKAHASHI Noriko (70466829)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 44 results
  • 3.  MIKIHIKO Kawai (80451904)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 31 results
  • 4.  FURUTA Yoshikazu (40613667)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 27 results
  • 5.  UCHIYAMA Ikuo (90243089)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 24 results
  • 6.  ITAYA Mitsuyasu (60374013)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 7.  KOJI Yahara
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 23 results
  • 8.  MASAKI Fukuyo
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 9.  JANUSZ Bujnicki
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results

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