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YURA Kei  由良 敬

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Researcher Number 50252226
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Affiliation (Current) 2025: お茶の水女子大学, 基幹研究院, 教授
2025: 早稲田大学, 理工学術院, 教授(任期付)
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2019 – 2023: 早稲田大学, 理工学術院, 教授(任期付)
2017 – 2023: お茶の水女子大学, 基幹研究院, 教授
2017: お茶の水女子大学, 大学院人間文化創成科学研究科, 教授
2016: お茶の水女子大学, 人間文化創成科学研究科, 教授
2010: 独立行政法人日本原子力研究開発機構, 量子ビーム応用研究部門, 研究副主幹 … More
2009: お茶の水女子大学, 大学院・人間文化創成科学研究科研究院, 教授
2008 – 2009: Ochanomizu University, 大学院・人間文化創成科学研究科, 教授
2008: Ochanomizu University, 大学院人間文化創成科学研究科, 教授
2007: 独立行政法人日本原子力研究開発機構, 研究副主幹
2007: Japan Atomic Energy Agency, 量子ビーム応用研究部門, 研究副主幹
2006 – 2007: 日本原子力研究開発機構, システム計算科学センター, 研究副主幹
2005 – 2006: 独立行政法人日本原子力研究開発機構, システム計算科学センター, 研究副主幹
2004: Japan Atomic Energy Research Institute, Center for Fromotion of Computational Science and Engineering, Quantum Bioinformatics Group, Researcher, 計算科学技術推進センター, 副主任研究員
2004: 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 副主任研究員
2001 – 2003: 日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員
2002: 特殊法人日本原子力研究所, 計算科学技術推進センター, 研究員
1996 – 2001: 名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手
1997: Nagoya University, Division of Biological Science, Research Associate, 大学院理学研究科, 助手
1994 – 1995: 名古屋大学, 理学部, 助手 Less
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Biophysics / Biological Sciences / Biophysics / Basic Section 43040:Biophysics-related
Except Principal Investigator
Biophysics / 広領域 / Biophysics / Basic Section 39050:Insect science-related / Basic Section 54020:Connective tissue disease and allergy-related / Molecular biology … More / Civil and environmental engineering / Life / Health / Medical informatics / Biological Sciences / Neurochemistry/Neuropharmacology / Applied microbiology Less
Keywords
Principal Investigator
データベース / モジュール / 分子進化 / ゲノム配列 / DNA修復酵素 / RuvA / MutT / ゲノム / 機能 / ホモロジー検索 … More / 立体構造 / タンパク質 / タンパク質立体構造 / モチーフ / シアノバクテリア / 434Cro / 水素結合 / DNA / モジュールの共有による進化 / 転写制御因子 / コンピュータシミュレーション / ウミホタル / 発光メカニズム / ゲノム塩基配列 / 発光タンパク質 / molecular dynamics / molecular evolution / DNA photolyase / database / genome / DNA repair protein / アノテーション / 分子動力学 / DNAホトリアーゼ / DNA修復タンパク質 / 共進化情報 / タンパク質DNA相互作用 / タンパク質間相互作用 / 計算生物学 / 相互作用推定 / ダブレット / タンパク質-RNA相互作用 / シングレット / タンパク質問相互作用 / 発現制御 / 転写 / 蛋白質 / DNA修復 / 基質 / 補酵素 / ORF機能予測 / 予測実証実験 / 機能予測 / 3Dキーノート / 配位子 / カルシウム / マグネシウム / 亜鉛 / 金属イオン / 立体構造比較 / リン酸基 / HTH / 転写因子 / 形質転換 / Arcリプレッサー / DNAポリメラーゼβ / リン酸基結合 / ヘリックス・ターン・ヘリックス / ホメオドメイン / DNA polymerase β / Arc repressor / 塩基認識モジュール / HTHモジュール / リン酸基結合モジュール / リン酸結合モジュール / arc repressor / 434cro / コンピュータ・モデリング / カンファー / Camリプレッサー / シトクロムP-450cam … More
Except Principal Investigator
モジュール / イントロン / リン酸基結合 / 3Dキーノート / キシラナーゼ / module / タンパク質立体構造 / 選択的スプライシング / ゲノム情報 / DNA結合 / ヘリックス・ターン・ヘリックス / 転写因子 / 分子進化 / RNA・タンパク質相互作用 / らん藻ゲノム / 形質転換 / ゲノム機能予測 / 金属イオン結合 / モジュールシャッフリング / タンパク質機能 / Module / 膜タンパク質 / intron / 立体構造 / 分子動力学 / エクソンかき混ぜ / タンパク質 / 微生物 / データベース / RNA編集 / 逆転写酵素 / エキソンシャッフリング / CCG1 / タイワンエンマコオロギ / エンマコオロギ / エンマコオロギ属 / 卵休眠 / トランスクリプトーム解析 / 季節的適応進化 / コオロギ / 休眠 / 構造計算 / タンパク質間結合 / 細胞膜貫通部位 / 免疫創薬標的 / 創薬標的 / 自己免疫疾患 / 膜貫通ドメイン / シグナル伝達 / 免疫抑制シグナル / 遺伝子多型 / 免疫グロブリンFc受容体 / membrane-spanning 4 / Fc gamma RIIa / Fc gamma RIIb / IgG Fc受容体 / 2量体 / 膜貫通部位 / 全身性エリテマトーデス / Fc(gamma)RIIB / TMD4ファミリー / Fc受容体 / 複製開始点 / グアニン四重鎖 / ORC / DNA複製 / UV耐性 / ペリプラズム / 不活化機構 / 土木環境システム / 人工DNA / フローサイトメータ / 蛍光タンパク質 / 紫外線消毒 / オゾン消毒 / 塩素消毒 / 塩基配列 / 核酸種 / 紫外線耐性 / 蛍光タンパク発現 / 損傷部位 / 消毒処理 / RNA2次構造 / RNA立体構造 / RNAタンパク質相互作用 / ドッキング計算 / RNA-タンパク質相互作用 / RNA2次構造 / Alternative splicing / Hydrophobic cluster / Sugar-protein interaction / Human genome annotation / Cyanobacterium genome / 3D-keynote / Prediction of genome function / 疎水殻の自動同定 / 確率的アラインメント法 / タンパク質-リガンド相互作用予測法 / タンパク質フォールディング / タンパク質立体構造予測 / タンパク質-糖鎖予測 / サブユニット相互作用 / 疎水核 / タンパク質-糖鎖相互作用 / すき間 / ヒトゲノムアノテーション / Het PDB-Navi / タンパク質-リガンド相互作用 / 水和 / タンパク質-RNA相互作用 / FAMSBASE / HetPDB-Navi / タンパク質間ネットワーク / 疎水クラスタ / 糖鎖-タンパク質相互作用 / ヒトゲノム・アノテーション / deta base / protein conformation / molecular interaction / Gonome information / 3D keynote / Protein function / タンパク質高次構造 / 低分子結合 / ヒトゲノム / 機能予測 / Function finetuning / Nucleic acid interaction / Metal ion / peroxiclase / Membrane protein / Intron / shuffling / Module classification / 糖結合 / キメラ酵素 / フィコシアニン / ミニバルナ-ゼ / タンパク質相互作用 / サブユニット接触 / ヘモグロビン / ペルオキシダーゼ / 機能微調整 / 核酸との相互作用 / 金属イオン / ペルオキシターゼ / シャッフリング / モジュール分類 / protein evolution / domain fusion / amino acid replacement / reverse transcriptase / mini-protein / barnase / making protein soluble / タンパク質進化 / ドメイン融合 / アミノ酸置換 / ミニ蛋白質 / バルナーゼ / 蛋白質可溶化 / 力学的安定性 / エクソンのかき混ぜ / 赤池情報理論 / エクソン / ゲノム構造 / イントロンの起源 / Threading / principal variety of protein folds / Structural prediction / Structural comparison / Principle of architecture / Three-dimensional structure / Protein / 膜蛋白質 / 相同蛋白質 / タンパク質デザイン / モデリング / 構造分類 / 蛋白質 / リゾチウム / キメラタンパク / ファージディスプレイ / 立体構造予測 / 立体構造比較 / スレッティング / スレッディング / 立体構造基本型 / 構造予測 / 構造比較 / 構築原理 / helix-turn-helix / molecular evolution / molecular dynamics / functional unit / protein tertiary structure / exon shuffling / タンパク質工学 / 分化進化 / 機能部品 / 自律神経 / 電気生理学 / ドーパ / 自律神経系 / 受容体 / 神経伝達物質 / DNA修復 / 遺伝子 / 放射線 / リガンド結合部位 / RNA / バイオインフォマティクス / 理論生物学 / 蛋白質間相互作用 / 機能部位 / ホモロジーモデリング / 抗体の多様性獲得 / プロテインスプライシング / 選択的プロテオリシス / 翻訳後修飾 / タンパク質の多様化 / エキソン / 塩基特異的認識 / RNaseH / プラスチド / 塩基認識 / ホメオドメイン / シスチンノットファミリー / 変態ホルモン / TAF_<II>250 / コンピュータ・モデリング / DNA結合タンパク質 / Camリプレッサー / 転写制御因子 Less
  • Research Projects

    (32 results)
  • Research Products

    (82 results)
  • Co-Researchers

    (49 People)
  •  Elucidation of the egg diapause mechanism of the Teleogryllus emma based on comparative transcriptome analysis

    • Principal Investigator
      Takeda Makio
    • Project Period (FY)
      2021 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Review Section
      Basic Section 39050:Insect science-related
    • Research Institution
      Kobe University
  •  Building Inventory of Evolution and Luminescent Mechanisms of Bioluminescent ProteinsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      YURA Kei
    • Project Period (FY)
      2019 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 43040:Biophysics-related
    • Research Institution
      Waseda University
  •  A novel functional antigen receptor TMD module identified as an SLE-associating SNP-related structure

    • Principal Investigator
      Honda Zen-ichiro
    • Project Period (FY)
      2018 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Review Section
      Basic Section 54020:Connective tissue disease and allergy-related
    • Research Institution
      Ochanomizu University
  •  Quantitative evaluation of disinfection mechanism using techniques of cell biology and computational biology

    • Principal Investigator
      Otaki Masahiro
    • Project Period (FY)
      2017 – 2019
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Civil and environmental engineering
    • Research Institution
      Ochanomizu University
  •  The roles of the G-quadruplex-binding activity of human ORC in replication origin establishment

    • Principal Investigator
      Waga Shou
    • Project Period (FY)
      2015 – 2017
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Molecular biology
    • Research Institution
      Japan Women's University
  •  Comprehensive prediction of RNA-protein interactinos

    • Principal Investigator
      Asai Kiyoshi
    • Project Period (FY)
      2013 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • Research Field
      Life / Health / Medical informatics
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Identification of novel DOPA ligands and electrophysiological analysis of DOPA-induced response

    • Principal Investigator
      GOSHIMA Yoshio
    • Project Period (FY)
      2008 – 2010
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Neurochemistry/Neuropharmacology
    • Research Institution
      Yokohama City University
  •  Elucidation of the binding mode of DNA repair promoting protein to strand breaks

    • Principal Investigator
      NARUMI Issay
    • Project Period (FY)
      2007 – 2009
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Japan Atomic Energy Agency
  •  Development of a method to obtain information for prediction of interacting structres of biomoleculesPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      YURA Kei
    • Project Period (FY)
      2007 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Ochanomizu University
      Japan Atomic Energy Agency
  •  Studying Function of Alternative Splicing Products Based on Protein Structure Modeling

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      2006 – 2009
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Ochanomizu University
  •  遺伝子同時転写単位同定にもとづく新規DNA修復関連タンパク質の予測Principal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Japan Atomic Energy Agency
  •  タンパク質の多様性獲得戦略の解明に基づいたゲノム情報の解読

    • Principal Investigator
      郷 通子
    • Project Period (FY)
      2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagahama Institute of Bio-Science and Technology
  •  Function annotation of DNA repair related proteins using molecular evolution information and computer simulation of protein dynamicsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      YURA Kei
    • Project Period (FY)
      2004 – 2006
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Japan Atomic Energy Agency
  •  進化情報を用いたDNA修復酵素複合体の相互作用部位予測Principal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      2003
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Japan Atomic Energy Agency
  •  全ゲノム配列比較にもとづくDNA修復酵素の比較と分類Principal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Japan Atomic Energy Agency
  •  モジュール3Dキーノートを用いたゲノム機能予測法の開発Principal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      2001 – 2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Japan Atomic Energy Agency
      Nagoya University
  •  Decoding of genome function and evolution based on the 3D structures of proteins

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      2000 – 2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Nagahama Institute of Bio-Science and Technology
      Nagoya University
  •  金属イオン結合モジュールの金属配位様式の共通性・多様性Principal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      1999 – 2000
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  Development of a method to predict protein function based on module classification

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      1999 – 2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  Protein function and module shuffling

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      1999 – 2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      広領域
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

    • Principal Investigator
      郷 通子
    • Project Period (FY)
      1997
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  リン酸基結合モジュールにもとづくDNA結合部位の推定Principal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      1997 – 1998
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

    • Principal Investigator
      郷 通子
    • Project Period (FY)
      1996
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  DNAリン酸基に結合するモジュールは共通かPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      1996
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  タンパク質モジュールとエクソンとの対応の普遍性

    • Principal Investigator
      郷 通子
    • Project Period (FY)
      1996 – 1998
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  Development of design method to get soluble protein

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      1996 – 1997
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • Research Field
      広領域
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

    • Principal Investigator
      郷 通子
    • Project Period (FY)
      1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  リン酸を結合する複数のタンパク質に存在する共通のモジュールPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  Protein structure, comparison, prediction, and design

    • Principal Investigator
      GO Nobuhiro, 野口 俊之
    • Project Period (FY)
      1995 – 1999
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      KYOTO UNIVERSITY
      Nagoya University
  •  転写因子のモジュール・ドメイン構成とシグナル認識

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      1994
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  シトクロムP-450camとCamリプレッサーとの共通構造Principal Investigator

    • Principal Investigator
      由良 敬
    • Project Period (FY)
      1994
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University
  •  Classification of Protein Modules

    • Principal Investigator
      GO Mitiko
    • Project Period (FY)
      1994 – 1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for General Scientific Research (B)
    • Research Field
      Biophysics
    • Research Institution
      Nagoya University

All 2023 2022 2021 2020 2019 2017 2016 2015 2014 2010 2009 2008 2007 2006 2005 2004 2003 2002 2001 2000 Other

All Journal Article Presentation Book

  • [Book] 最先端コオロギ学 ~世界初! 新しい生物学がここにある~2022

    • Author(s)
      野地澄晴(共編著者:片岡孝介、由良敬 他)
    • Total Pages
      250
    • Publisher
      北隆館
    • ISBN
      4832610120
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K05614
  • [Book] Prediction of molecular interactions from 3D-structures : from small ligands to large protein complexes2009

    • Author(s)
      Kinoshita, K., Kono, H., Yura, K.
    • Publisher
      in Prediction of Protein Structures, Functions, and Interactions(ed. Bujnicki, J.M.), Wiley and Sons)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Book] 基礎と演習バイオインフォマティクス(第6章 データベースの構築と活用)(郷 道子、 高橋建一編)2004

    • Author(s)
      由良 敬(分担執筆)
    • Total Pages
      220
    • Publisher
      共立出版
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16014227
  • [Book] モジュールに基づく機能予測-3Dキーノート2002

    • Author(s)
      由良 敬, 郷 通子
    • Publisher
      蛋白質核酸酵素 47(8)
    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Dissecting Cricket Genomes for Advancement of Entomology and Entomophagy2022

    • Author(s)
      Kosuke Kataoka, Yuki Togawa, Ryuto Sanno, Toru Asahi, Kei Yura
    • Journal Title

      Biophysical Reviews

      Volume: 14 Issue: 1 Pages: 75-97

    • DOI

      10.1007/s12551-021-00924-4

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K05614
  • [Journal Article] Comparative Analysis of Mitochondrial Genomes in Gryllidea (Insecta: Orthoptera): Implications for Adaptive Evolution in Ant-Loving Crickets2021

    • Author(s)
      Ryuto Sanno, Kosuke Kataoka, Shota Hayakawa, Keigo Ide, Chuong N Nguyen, Thao P Nguyen, Binh T N Le, Oanh T P Kim, Katsuhiko Mineta, Haruko Takeyama, Makio Takeda, Toshiyuki Sato, Takeshi Suzuki, Kei Yura, Toru Asahi
    • Journal Title

      Genome Biology and Evolution

      Volume: 13 Issue: 10

    • DOI

      10.1093/gbe/evab222

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K05614
  • [Journal Article] Genomic and Transcriptomic Analyses of Bioluminescence Genes in the Enope Squid Watasenia scintillans2020

    • Author(s)
      Yoshida Masa-aki、Imoto Junichi、Kawai Yuri、Funahashi Satomi、Minei Ryuhei、Akizuki Yuki、Ogura Atsushi、Nakabayashi Kazuhiko、Yura Kei、Ikeo Kazuho
    • Journal Title

      Marine Biotechnology

      Volume: 22 Issue: 6 Pages: 760-771

    • DOI

      10.1007/s10126-020-10001-8

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20K21452, KAKENHI-PROJECT-19H03200, KAKENHI-PROJECT-19J15617
  • [Journal Article] 陸上植物オルガネラのRNA編集の役割2009

    • Author(s)
      由良敬, 郷通子
    • Journal Title

      生物物理 49

      Pages: 244-245

    • NAID

      10025975899

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] RESOPS : A database for analyzing the correspondence of RNA editing sites to protein three-dimensional structures.2009

    • Author(s)
      Yura, K., Sulaiman, S., Hatta, Y., Shionyu, M., Go, M.
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology 50

      Pages: 1865-1873

    • NAID

      10027344058

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Characteristics and prediction of RNA editing sites in transcripts of the moss Takakia lepidozioides chloroplast2009

    • Author(s)
      Kei Yura, et al.
    • Journal Title

      DNA Research 15

      Pages: 309-321

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Journal Article] 陸上植物オルガネラのRNA編集の役割2009

    • Author(s)
      由良敬、郷通子
    • Journal Title

      生物物理 49

      Pages: 244-245

    • NAID

      10025975899

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] RESOPS : A Database for Analyzing the Correspondence of RNA Editing Sites to Protein Three-Dimensional Structures.2009

    • Author(s)
      Kei Yura, Sintawee Sulaiman, Yosuke Hatta, Masafumi Shionyu, Mitiko Go
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology 50

      Pages: 1865-1873

    • NAID

      10027344058

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Correlation between amino acid residues converted by RNA editing and functional residues in protein three- dimensional structures in plant organelles.2008

    • Author(s)
      Yura, K., Go, M.
    • Journal Title

      BMC Plant Biology 8

      Pages: 79-79

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Correlation between amino acid residues converted by RNA editing and functional residues in protein three- dimensional structures in plant organelles2008

    • Author(s)
      Yura, K., Go, M
    • Journal Title

      BMC Plant Biology 8

      Pages: 79-79

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts.2008

    • Author(s)
      Yamasaki, C., Murakami, K., Fujii, Y., Sato, Y., Harada, E.,..., Yura, K.(66th),..., Shionyu, M.(101th),..., Go, M.(107th),..., Gojobori, T.(138th)
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 36

    • NAID

      120004689028

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] The H-Invitational Database (H-InvDB), a comprehensive annotation resource for human genes and transcripts2008

    • Author(s)
      Yamasaki, C., Murakami, K., Fujii, Y., Sato, Y., Harada, E., Yura, K. (66th), Shionyu, M. (101th), Go, M. (107th), Gojobori, T. (138th)
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 36

      Pages: 793-799

    • NAID

      120004689028

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] タンパク質の立体構造に基づく相互作用構造の推定2008

    • Author(s)
      由良敬
    • Journal Title

      薬学雑誌 128(11)

      Pages: 1547-1555

    • NAID

      110006991367

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Journal Article] Correlation between amino acid residues converted by RNA editing and functional residues in protein three-dimensional structures in plant organelles2008

    • Author(s)
      Kei Yura, et al.
    • Journal Title

      BMC Plant Biology 8

      Pages: 79-79

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Characteristics and prediction of RNA editing sites in transcripts of the moss Takakia lepidozioides chloroplast2008

    • Author(s)
      Yura K., Miyata, Y., Arikawa, T., Higuchi, M., Sugita, M.
    • Journal Title

      DNA Research 15(5)

      Pages: 309-321

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Journal Article] Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein and Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures2008

    • Author(s)
      Yura K.
    • Journal Title

      Proceedings of International Symposium on Frontiers of Computational Science

      Pages: 77-86

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Journal Article] Contribution of computational biology and structural genomics to understand genome and transcriptome.2007

    • Author(s)
      Go, M., Yura, K., Shionyu, M.
    • Journal Title

      Proceedings of the International Symposium on Frontiers of Computational Science 2005 (ISFCS2005), (eds.Kaneda, Y., Kawamura, H., Sasai, M.)(Springer)

      Pages: 75-80

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Contribution of computational biology and structural genomics to understand genome and transcriptome2007

    • Author(s)
      Go M., Yura K., Shionyu M.
    • Journal Title

      Proceedings of the International Symposium on Frontiers of Computational Science 2005 (ISFCS2005), (eds. Kaneda, Y., Kawamura, H., Sasai, M.), Springer

      Pages: 75-80

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Alternative splicing in human transcriptome : functional and structural influence on proteins.2006

    • Author(s)
      Yura, K., Shionyu, M., Hagino, K., Hijikata, A., Hirashima, Y., Nakahara, T., Eguchi, T., Shinoda, K., Yamaguchi, A., Takahashi, K., Itoh, T., Imanishi, T., Gojobori, T., Go, M.
    • Journal Title

      Gene 380

      Pages: 63-71

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Alternative splicing in human transcriptome : functional and structural influence on proteins.2006

    • Author(s)
      Kei Yura et al.
    • Journal Title

      Gene 380・2

      Pages: 3917-3928

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] Alternative splicing in human transcriptome : functional and structural influence on proteins2006

    • Author(s)
      Yura, K., Shionyu, M., Hagino, K., Hijikata, A., Hirashima, Y., Nakahara, T., Eguchi, T., Shinoda, K., Yamaguchi, A., Takahashi, K., Itoh, T., Imanishi, T., Gojobori, T., Go, M.
    • Journal Title

      Gene 380

      Pages: 63-71

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Journal Article] タンパク質のフォールディングー自己組織化と遺伝子のスプライシング2005

    • Author(s)
      郷 通子, 由良 敬
    • Journal Title

      Bionics 2・1

      Pages: 38-43

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16637005
  • [Journal Article] Structure and function of a family 10 beta-xylanase chimera of Streptomyces olivaceoviridis E-86 FXYN and Cellulomonas fimi Cex.2004

    • Author(s)
      Kaneko, S., Ichinose, H., Fujimoto, Z., Kuno, A., Yura, K., Go, M., Mizuno, H., Kusakabe, I., Kobayashi, H.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 279

      Pages: 26619-26626

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Het-PDB Navi. : A database for protein-small molecule interactions.2004

    • Author(s)
      Yamaguchi, A., Iida, K., Matsui, N., Tomoda, S., Yura, K., Go, M.
    • Journal Title

      J. Biochem. (Tokyo) 135

      Pages: 79-84

    • NAID

      10016197573

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Het-PDB Navi. : A database for protein-small molecule interactions2004

    • Author(s)
      Yamaguchi, A., Iida, K., Matsui, N., Tomoda, S., Yura, K., and, Go, M.
    • Journal Title

      J.Biochem. (Tokyo) 135

      Pages: 79-84

    • NAID

      10016197573

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Enlarged FAMSBASE : protein 3D structure models of genome sequences for 41 species.2003

    • Author(s)
      Yamaguchi, A., Iwadate, M., Suzuki, E., Yura, K., Kawakita, S., Umeyama, H., Go, M.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 31

      Pages: 463-468

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Enlarged FAMSBASE : protein 3D structure models of genome sequences for 41 species2003

    • Author(s)
      Yamaguchi, A., Iwadate, M., Suzuki, E., Yura, K., Kawakita, S., Umeyama, H., Go, M.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 31

      Pages: 463-468

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] 3D-keynote : genome function prediction based on protein module2002

    • Author(s)
      Yura, K., Go, M.
    • Journal Title

      Tanpakushitsu Kakusan Kouso 47 (8)

      Pages: 1090-1096

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Capacity of Thermoonospora alba XylA to impart thermostability in familyF/10 chimeric xylanases2001

    • Author(s)
      Ahsan M.M., Kaneko, S., Wang, Q., Yura, K., Go, M., Hayashi K.
    • Journal Title

      Enzyme Microb. Technol. 28

      Pages: 8-15

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Mutational analysis of genes involved in pilus structure, motility and transformation competency in the unicellular motile cyanobacterium Synechoc ystis sp. PCC 6803.2001

    • Author(s)
      Yoshihara, S., Geng, X.X., Okamoto, S., Yura, K., Murata, T., Go M., Ohmori, M., Ikeuchi, M.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 42

      Pages: 63-73

    • NAID

      10007423308

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Capacity of Thermoonospora alba XylA to impart thermostability in family F/10 chimeric xylanases.2001

    • Author(s)
      Ahsan M.M., Kaneko, S., Wang, Q., Yura, K., Go, M., Hayashi K.
    • Journal Title

      Enzyme Microb. Technol. 28

      Pages: 8-15

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Mutational analysis of genes involved in pilus structure, motility and transformation competency in the unicellular motile cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 68032001

    • Author(s)
      Yoshihara, S., Geng, X.X., Okamoto, S., Yura, K., Murata, T., Go M., Ohmori, M., Ikeuchi, M.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol. 42

      Pages: 63-73

    • NAID

      10007423308

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Significance of a two-domain structure in subunits of phycobiliproteins revealed by the normal mode analysis2000

    • Author(s)
      Kikuchi, H., Wako, H., Yura, K., Go, M., Mimuro, M.
    • Journal Title

      Biophysical Journal 79

      Pages: 1587-1600

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Significance of a two-domain structure in subunits of phycobiliproteins revealed by the normal mode analysis.2000

    • Author(s)
      Kikuchi, H., Wako, H., Yura, K., Go, M., Mimuro, M.
    • Journal Title

      Biophysical Journal 79

      Pages: 1587-1600

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Journal Article] Module shuffling of a family F/10 xylanase : replacement of modules M4and M5 of the FXYN of Streptomyces olivaceoviridis E-86 with those of the Cex of Cellulomonas fimi.2000

    • Author(s)
      Kaneko, S., Iwamatsu, S., Kuno, A., Fujimoto, Z., Sato, Y., Yura, K., Go, M., Mizuno, H., Taira, K., Hasegawa, T., Kusakabe, I., Hayashi, K.
    • Journal Title

      Protein Engng. 13

      Pages: 873-879

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12208006
  • [Presentation] マダラスズおよびシバスズのミトコンドリアDNA全長配列の解読とコオロギ上科における分子系統解析2023

    • Author(s)
      村田光陽 片岡孝介 三野流斗 里村和浩 小倉淳 朝日透 由良敬, 鈴木丈詞
    • Organizer
      第67回日本応用動物昆虫学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K05614
  • [Presentation] コオロギ科食用種Teleogryllus occipitalisおよびTarbinskiellus portentosusの染色体レベル全ゲノム塩基配列解読2023

    • Author(s)
      三野流斗, 片岡孝介, 内藤健, 由良敬, 朝日透
    • Organizer
      第67回日本応用動物昆虫学会大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-21K05614
  • [Presentation] Evolutionary Analysis of Luciferase, Photoprotein and Luciferin2019

    • Author(s)
      舟橋 実里、鈴木 博文、由良 敬
    • Organizer
      第57回日本生物物理学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H03200
  • [Presentation] ヒトおよびアフリカツメガエルORCAとORCとの結合に関する解析2017

    • Author(s)
      石川友紀、由良敬、小布施力史、和賀祥
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K06956
  • [Presentation] ヒトORC1のN末端側領域の機能解析2017

    • Author(s)
      中塚萌、堀之内遥香、溝部彩子、由良敬、和賀祥
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K06956
  • [Presentation] ヒトORC1サブユニットのN末端側領域の機能解析2016

    • Author(s)
      女部田寛子、保科祥子、寺西帆奈美、山﨑翠、橋本麻美子、太田黒恵美、由良敬、和賀祥
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2016-11-30
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K06956
  • [Presentation] ヒトORC2におけるORCA結合領域の同定2016

    • Author(s)
      石川友紀、及川郁子、坂井実華、由良敬、小布施力史、和賀祥
    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2016-11-30
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K06956
  • [Presentation] 動物細胞のDNA複製開始点の確立機構の解明に向けて2015

    • Author(s)
      和賀 祥、山﨑 翠、塚澤真衣、鈴木香菜、女部田寛子、寺西帆奈美、太田黒恵美、弓井絵利夏、由良 敬、保科祥子
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K06956
  • [Presentation] 分子動力学計算を用いた蛋白質・RNA 複合体立体構&#13312;予測2015

    • Author(s)
      由良敬,岩切淳一,浜田道昭,浅井潔,亀田倫史
    • Organizer
      第17回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      札幌パークホテル
    • Year and Date
      2015-07-15
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25240044
  • [Presentation] 分子動力学計算を用いたRNA・タンパク質複合体立体構造予測2015

    • Author(s)
      由良敬、岩切淳一、浜田道昭、浅井潔、亀田倫史
    • Organizer
      第17回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      北海道札幌市 ホテルライフォート札幌
    • Year and Date
      2015-07-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25240044
  • [Presentation] 分子動力学計算を用いたRNA・タンパク質複合体立体構造予測2014

    • Author(s)
      由良敬、岩切淳一、浜田道昭、浅井潔、亀田倫史
    • Organizer
      第16回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      愛知県名古屋市 ウインクあいち
    • Year and Date
      2014-07-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25240044
  • [Presentation] RNA編集とその生物的意味2010

    • Author(s)
      由良敬
    • Organizer
      大沢文夫研究会
    • Place of Presentation
      名古屋大学(名古屋市)
    • Year and Date
      2010-02-20
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Prediction of interface residues on proteins for RNA and protein molecules2009

    • Author(s)
      T Yura, K
    • Organizer
      Korea-Japan Seminars on Biomolecular Sciences - Experiments and Simulations,
    • Place of Presentation
      韓国ソウルKIAS
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] 放射線抵抗性細菌由来DNA修復促進蛋白質PprAの構造機構解析2009

    • Author(s)
      山田貢、安達基泰、佐藤勝也、玉田太郎、由良敬、黒木良太、鳴海一成
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-10-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19380054
  • [Presentation] Diversification of protein repertoire by alternative splicing2009

    • Author(s)
      Yura, K.
    • Organizer
      The 66th Korean Society for Biochemistry and Molecular Biology Annual Meeting
    • Place of Presentation
      COEX (Korea)
    • Year and Date
      2009-05-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Diversification of protein repertoire by alternative splicing2009

    • Author(s)
      Kei Yura
    • Organizer
      The 66th Korean Society for Biochemistry and Molecular Biology Annual Meeting
    • Place of Presentation
      COEX(Korea)
    • Year and Date
      2009-05-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] ナンジャモンジャゴケ葉緑体ゲノムデータに基づくRNAエディティング部位の予測2009

    • Author(s)
      由良敬
    • Organizer
      プロテイン・インフォマティクス蛋白質科学のためのバイオインフォマティクス,第9回日本蛋白質科学会年会ワークショップ
    • Place of Presentation
      熊本
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein And Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures2009

    • Author(s)
      Yura, K
    • Organizer
      ATI International Forum 2009 "Protein Structure Determination and Applications
    • Place of Presentation
      日本原子力研究開発機構
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] たくさんのデータ観察からわかるタンパク質が低分子を認識するようす2009

    • Author(s)
      由良敬
    • Organizer
      第3回お茶のオビ女子メ「学舞鎖揮学研究教'古センター公鰐シンポジクムr舞鎖が房る塗紛と病気」
    • Place of Presentation
      お茶の水女子大学
    • Year and Date
      2009-03-05
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] RESOPS : A database of RNA editing sites in plant organelle mapped onto protein three-dimensional structures2009

    • Author(s)
      Yura, K., Sulaiman, S., Hatta, Y., Shionyu, M., Go, M.
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2009-12-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Correlation between RNA editing sites on amino acid residues and protein three-dimensional structures in plant organelles2008

    • Author(s)
      Mitiko Go, Kei Yura
    • Organizer
      日本生物物理学会第46回年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-05
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Information Flow from DNA Sequence to Protein Function2008

    • Author(s)
      Yura, K., Go, M.
    • Organizer
      Science in Japan Forum 2008 "Interaction of Physics and Biology"
    • Place of Presentation
      JSPS, 米国ワシントンDC
    • Year and Date
      2008-06-20
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] DNA修復促進タンパク質PprAの構造と機能の推定2008

    • Author(s)
      由良 敬
    • Organizer
      日本原子力研究開発機構生命科学シンポジウム2008
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2008-03-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19380054
  • [Presentation] 植物オルガネラにおけるRNAエディティングの部位とタンパク質立体構造の関係2008

    • Author(s)
      郷通子, 由良敬
    • Organizer
      第10回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス(東京)
    • Year and Date
      2008-08-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Prediction of RNA editing sites solely from the newly characterized DNA sequences of the moss Takakialepidozioides chloroplast2008

    • Author(s)
      Yura, K.,Miyata, Y., Arikawa, T., Higuchi, M., Sugita, M.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会(福岡大会)
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] Effect of residue substitution by RNA editing on protein three-dimensional structures in plant organelles2008

    • Author(s)
      Yura, K., Go, M.
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会年会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)
    • Year and Date
      2008-12-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Effect of residue substitution by RNA editing on protein three-dimensional structures in plant organelles2008

    • Author(s)
      Kei Yura, Mitiko Go
    • Organizer
      BMB2008(第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会年会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      2008-12-10
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Information flow from DNA sequence to protein function2008

    • Author(s)
      Yura, K., Go, M.
    • Organizer
      Science in Japan Forum 2008 : Interaction of Physics and Biology
    • Place of Presentation
      JSPS米国ワシントンDC
    • Year and Date
      2008-06-20
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein and Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures2008

    • Author(s)
      Yura, K
    • Organizer
      Frontiers of ComputationalBiology on Protein Structures
    • Place of Presentation
      お茶の水女子大学
    • Year and Date
      2008-12-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] 植物オルガネラにおけるRNAエディティングの部位とタンパク質立体構造の関係2008

    • Author(s)
      郷通子, 由良敬
    • Organizer
      第10回日本進化学会大会
    • Place of Presentation
      東京大学駒場キャンパス
    • Year and Date
      2008-08-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Three-dimensional architecture of the Deinococcus radiodurans PprA protein2008

    • Author(s)
      鳴海一成、佐藤勝也、大庭寛史、由良敬、岩崎憲治
    • Organizer
      The 7th International conference on Extremophiles (Extremophiles 2008)
    • Place of Presentation
      ケープタウン、南アフリカ
    • Year and Date
      2008-09-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19380054
  • [Presentation] Correlation between RNA editing sites on amino acid residues and protein three-dimensional structures in plant organelles2008

    • Author(s)
      Go, M., Yura, K.
    • Organizer
      日本生物物理学会第46回年会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡市)
    • Year and Date
      2008-12-05
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Prediction of RNA editing sites solely from the newly characterized DNA sequences of the moss Takakia lepidozioides chloroplast2008

    • Author(s)
      Kei Yura, et al.
    • Organizer
      第46回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] Prediction of Protein-RNA, Protein-Protein and Protein-Ligand Interfaces Based on Protein Sequences and 3D-Structures2008

    • Author(s)
      Yura, K.
    • Organizer
      International Symposium on Frontiers of Computational Science
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19570157
  • [Presentation] 選択的スプライシングがもたらすタンパク質構造への影響2007

    • Author(s)
      郷通子、由良敬、高橋健一、塩生真史
    • Organizer
      シンポジウム「構造プロテオミクスを支援するバイオインフォマティクス」、生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      横浜パシフィコ(横浜)
    • Year and Date
      2007-12-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] 真核生物の遺伝子構造とタンパク質立体構造・機能の関係2007

    • Author(s)
      由良敬、塩生真史、郷通子
    • Organizer
      日本進化学会第9回京都大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2007-09-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] 真核生物の遺伝子構造とタンパク質立体構造・機能の関係2007

    • Author(s)
      由良敬, 塩生真史, 郷通子
    • Organizer
      日本進化学会第9回京都大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Year and Date
      2007-09-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] 放射線抵抗性細菌デイノコッカス由来の新規なDNA修復促進蛋白質PprAのDNAとの相互作用解析2007

    • Author(s)
      安達基泰、玉田太郎、佐藤勝也、由良敬、鳴海一成、黒木良太
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19380054
  • [Presentation] A possible effect of alternative splicing on multiple regions of a single protein2006

    • Author(s)
      Shionyu, M., Yura, K., Go, M.
    • Organizer
      5th EABS & 44th Annual Meeting of Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      沖縄コンベンションセンター(宜野湾市)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] 真核生物遺伝子産物の多様性を生み出している選択的スプライシングのタンパク質立体構造への影響2006

    • Author(s)
      由良敬, 郷通子
    • Organizer
      日本進化学会第8回大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      国立オリンピック記念青少年総合センター(東京都渋谷区)
    • Year and Date
      2006-08-30
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] Systematic detection of protein regions affected by alternative splicing2006

    • Author(s)
      Shionyu, M., Yura, K., Hijikata, A., Nakahara, T., Shinoda, K., Yamaguchi, A., Takahashi, K., Go, M.
    • Organizer
      20th International Congress of Biochemistry and Molecular Biology
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館(京都市)
    • Year and Date
      2006-06-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18370061
  • [Presentation] 分子動力学計算を用いた蛋白質・RNA 複合体立体構造予測

    • Author(s)
      由良 敬、岩切 淳一、浜田 道昭、浅井 潔、亀田 倫史
    • Organizer
      第16回日本RNA学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2014-07-23 – 2014-07-25
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25240044
  • [Presentation] 分子動力学計算を用 いた蛋白質・RNA 複合体立体構造予測

    • Author(s)
      由良 敬、岩切 淳一、浜田 道昭、浅井 潔、亀田 倫史
    • Organizer
      第52回日本生物物理学会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2014-09-25 – 2014-09-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25240044
  • 1.  GO Mitiko (70037290)
    # of Collaborated Projects: 12 results
    # of Collaborated Products: 42 results
  • 2.  NOGUTI Tosiyuki (90172775)
    # of Collaborated Projects: 4 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 3.  TAKAHASHI Ken-ichi (20322737)
    # of Collaborated Projects: 3 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 4.  GO Nobuhiro (50011549)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 5.  木寺 詔紀 (00186280)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 6.  SHIONYU Masafumi (30345847)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 14 results
  • 7.  NARUMI Issay (90343920)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 3 results
  • 8.  KUROKI Ryota (30391246)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 2 results
  • 9.  GOSHIMA Yoshio (00153750)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 10.  TAKAHASHI Takuya (20423824)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 11.  YAGAMI Tatsuro (00363812)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 12.  KAJIWARA Yasuhiro (50275020)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 13.  NISHIKAWA Ken (10093288)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 14.  WAKO Hiroshi (60158607)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 15.  YOMO Tetsuya (00222399)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 16.  ISHIMORI Koichiro (20192487)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 17.  HOJO Hironobu (00209214)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 18.  TOH Hiroyuki (70192656)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 19.  SHIRAI Tsuyoshi (00262890)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 20.  SODA Kunitsugu (10011686)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 21.  ISHIDA Hisashi (60360418)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 22.  HIGUCHI Mariko (90370460)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 23.  Asai Kiyoshi (30356357)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 5 results
  • 24.  Otaki Masahiro (70272367)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 25.  Waga Shou (60222402)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 5 results
  • 26.  KATAHIRA Masato (70211844)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 27.  Honda Zen-ichiro (70238814)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 28.  Takeda Makio (20171647)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 29.  加藤 晃一 (20211849)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 30.  鈴木 利治 (80179233)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 31.  古川 清 (10190133)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 32.  美宅 茂樹 (10107542)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 33.  森島 績 (50026093)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 34.  熊谷 泉 (10161689)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 35.  梅山 秀明 (20050619)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 36.  諏訪 牧子 (30242241)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 37.  浜田 道昭 (00596538)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 5 results
  • 38.  亀田 倫史 (40415774)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 5 results
  • 39.  石黒 亮 (70373264)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 40.  相川 京子 (80262351)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 41.  本田 浩章 (40245064)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 42.  市 育代 (50403316)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 43.  河野 肇 (60585074)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 44.  鈴木 博文 (60418572)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 1 results
  • 45.  片岡 孝介 (60822260)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 5 results
  • 46.  鈴木 丈詞 (60708311)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 2 results
  • 47.  澁谷 仁寿 (10828346)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 48.  籐 博幸
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 49.  OGURA Atsushi
    # of Collaborated Projects: 0 results
    # of Collaborated Products: 1 results

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