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Nishii Wataru  西井 亘

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西井 亘  ニシイ ワタル

NISHII Wataru  西井 亘

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Researcher Number 30287461
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Affiliation (based on the past Project Information) *help 2018: 国立研究開発法人理化学研究所, 生命機能科学研究センター, 客員主管研究員
2015 – 2017: 国立研究開発法人理化学研究所, 横山構造生物学研究室, 研究員
2007: The Institute of Physical and Chemical Research, タンパク質基盤研究グループ, 研究員
2006: 独立行政法人理化学研究所, タンパク質構造研究チーム, 研究員
2002 – 2005: 東京薬科大学, 生命科学部, 助手
1997 – 2000: 東京薬科大学, 生命科学部, 助手
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Functional biochemistry / Functional biochemistry / Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Except Principal Investigator
Structural biochemistry / Cell biology
Keywords
Principal Investigator
プロテオリシス / 細胞内タンパク質分解 / レドックス / X線結晶構造 / 基質特異性 / ATP依存性プロテアーゼ / 活性制御 / 4次構造 / アロステリックジスルフィド結合 / レドックス制御 … More / 結晶構造 / 腸内細菌 / X線小角散乱解析 / X線結晶解析 / 腸内細菌科 / AAA+プロテアーゼ / 細胞内プロテオリシス / タンパク質分解 / リボソームタンパク質 / 部位特異的変異 / 大量発現 / リボソーム / プロセッシブ分解 / 大腸菌 / ポリリン酸 / アミノ酸飢餓 / 細胞内イメージング / ラット海馬 / 細胞死 / 可視化解析 / 蛍光基質 … More
Except Principal Investigator
CAAXモチーフ特異的プロテアーゼ / Proteinase / Membrane-bound proteinase / Cathepsin E / Colopsin / Hepsin / CAAX-motif-specific proteinase / Progastrin-cleaving proteinase / Brain-gut proteinase / 金属プロテアーゼ / 基質特異性 / α-キモトリプシン / トリプシン / CAAX-モチーフ特異的プロテアーゼ / セリンプロテアーゼ / 膜結合性プロテアーゼ / カテプシンE遺伝子 / エンテロペプチダーゼ / プロテアーゼ / 膜結合プロテアーゼ / カテプシンE / コロプシン / ヘプシン / プロガストリン分解プロテアーゼ / 脳・腸管系プロテアーゼ / FRET(蛍光共鳴エネルギー転移) / 細胞内プロテアーゼ / 二重蛍光標識基質 / カスパーゼ / コラゲナーゼ / 細胞内注入 / アクリロダン標識基質 / 蛍光基質 / グルタミン酸刺激 / 細胞死 / カスパーゼ1 / 海馬スライス培養 / FRET / 二重蛍光基質 / 可視化解析 / 細胞内プロテオリシス Less
  • Research Projects

    (7 results)
  • Research Products

    (17 results)
  • Co-Researchers

    (5 People)
  •  Regulatory mechanisms of the AAA+ Lon proteasePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      西井 亘
    • Project Period (FY)
      2018 – 2020
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Review Section
      Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
    • Research Institution
      Institute of Physical and Chemical Research
  •  Redox regulation of proteolysis in the Enterobacteriacea cellsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Nishii Wataru
    • Project Period (FY)
      2015 – 2017
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Functional biochemistry
    • Research Institution
      Institute of Physical and Chemical Research
  •  大腸菌ATP依存性プロテアーゼLonおよびHslVUの基質切断機構Principal Investigator

    • Principal Investigator
      西井 亘
    • Project Period (FY)
      2005 – 2007
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Functional biochemistry
    • Research Institution
      The Institute of Physical and Chemical Research
      Tokyo University of Pharmacy and Life Science
  •  ATP依存性プロテアーゼによる生理基質機能部位の優先切断機構Principal Investigator

    • Principal Investigator
      西井 亘
    • Project Period (FY)
      2002 – 2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Functional biochemistry
    • Research Institution
      Tokyo University of Pharmacy and Life Science
  •  蛍光基質を用いた細胞内プロテオリシスの可視化解析Principal Investigator

    • Principal Investigator
      西井 亘
    • Project Period (FY)
      1999 – 2000
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      Functional biochemistry
    • Research Institution
      Tokyo University of Pharmacy and Life Science
  •  生細胞における蛋白質分解過程の可視化解析

    • Principal Investigator
      TAKAHASHI Kenji
    • Project Period (FY)
      1998 – 2000
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • Research Field
      Cell biology
    • Research Institution
      Tokyo University of Pharmacy and Life Science
  •  Structural, Functional and Physiological Characterization of Novel Brain-Gut Proteinases

    • Principal Investigator
      TAKAHASHI Kenji
    • Project Period (FY)
      1997 – 1998
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Structural biochemistry
    • Research Institution
      Tokyo University of Pharmacy and Life Science

All 2017 2016 2015 2008 2007 2005 2004

All Journal Article Presentation Patent

  • [Journal Article] SARS-CoV 3CL protease cleaves its C-terminal autoprocessing site by novel subsite cooperativity2016

    • Author(s)
      Muramatsu, T., Takemoto, C., Kim, Y.-T., Wang, H., Nishii, W., Terada, T. , Shirouzu, M., Yokoyama, S.
    • Journal Title

      Proc. Natl Acad. Sci. USA

      Volume: 113 Pages: 12997-13002

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07019
  • [Journal Article] Substrate Specificities of Porcine and Bovine Enterpeptidases toward the Peptide Val-(Asp)4-Lys-Ile-Val-Gly and Its Analogs2008

    • Author(s)
      Kim, Y.-T., Nishii, W., Matsushima, S., Inoue, H. Ito, H. Park S.-J. and Takahashi, K.
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 印刷中

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • [Journal Article] The effects of mutations in the carboxyl-teminal region on the catalytic activity of Escherichi a coli signal peptidase I.2008

    • Author(s)
      Kim YT, Yoshida H, Kojima M, Kurita R, Nishii W, Muramatsu T, Ito H, Park SJ, Takahashi K.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry 143

      Pages: 237-242

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • [Journal Article] Inhibition and stabilization of Aspergilloglutamic peptidase by the propeptide : Identication of critical sequences and residues in the propeptide.2005

    • Author(s)
      Kubota, K., Nishii, W., Kojima, M., Takahashi, K.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry 280

      Pages: 999-1006

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-14780495
  • [Journal Article] Cleavage mechanism of ATP-dependent Lon protease toward ribosomal S2 protein2005

    • Author(s)
      Nishii, W., Suzuki, T., Nakada, M., Kim, Y.-T., Muramatsu, T., Takahashi, K.
    • Journal Title

      FEBS Letters 579

      Pages: 6846-6850

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • [Journal Article] Identification of arginine residues important for the activity of Eschericha coli signal peptidase I2004

    • Author(s)
      Kim, Y.-T., Kurita, R., Kojima, M., Nishii, W., Tnokura, M., Muramatsu, T., Ito, H., Takahashi K.
    • Journal Title

      Biological Chemistry 386

      Pages: 381-388

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-14780495
  • [Patent] ウィルスプロテアーゼ生産方法2007

    • Inventor(s)
      横山茂之, 村松知成, 金龍泰, 西井亘
    • Industrial Property Rights Holder
      独立行政法人理化学研究所
    • Industrial Property Number
      2007-003242
    • Filing Date
      2007-11-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • [Presentation] ダイナミックな構造変化を介したAAA+プロテアーゼLonの制御メカニズム2017

    • Author(s)
      西井亘、藤井佳史、松村義隆、仙石徹、小島正樹、横山茂之
    • Organizer
      生物学会年会・第90回日本生化学会大会 合同大会(ConBio2017)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07019
  • [Presentation] Redox regulation of Lon protease activity by a disulfide bond in facultative anaerobes2016

    • Author(s)
      Nishii, W., Seki, E., Yanagisawa, T., Sehngoku, T., Terada, T., Murmatsu, T., Niino-Kukimoto, M, Shirouzu, M., Kojima, M., Kihara, H. & Yokoyama, S.
    • Organizer
      FASEB Science Research Conference
    • Place of Presentation
      コロラド(USA)
    • Year and Date
      2016-08-17
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07019
  • [Presentation] AAA+プロテアーゼLonの分子メカニズム2016

    • Author(s)
      西井亘,新野陸子,寺田貴帆,白水美香子,村松知成,横山茂之

    • Organizer
      第39回日本分子生物学会年会・公募シンポジウム
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2016-12-01
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07019
  • [Presentation] A redox switch shapes the exit pore of Enterobacteriaceal Lon protease to facultatively regulate proteolysis2015

    • Author(s)
      Nishii, W., Niino-Kukimoto, M, Terada, T., Shirouzu, M. Muramatsu, T., & Yokoyama, S.

    • Organizer
      9th General Meeting of the International Proteolysis Society
    • Place of Presentation
      ペナン(マレーシア)
    • Year and Date
      2015-10-06
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07019
  • [Presentation] Production of hepatitis C virus NS2-3 protease by the Escherichia coli cell-free protein synthesis method and control of its activity2015

    • Author(s)
      西井亘,松本武久,村松知成,横山茂之
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07019
  • [Presentation] アロステリックジスルフィド結合による細胞内プロテオリシスのレドックス制御2015

    • Author(s)
      西井亘,横山茂之
    • Organizer
      第15回日本蛋白質科学会年会公募型シンポジウム
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島)
    • Year and Date
      2015-06-26
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07019
  • [Presentation] SARSコロナウィルス3CLプロテアーゼの基質認識メカニズム2007

    • Author(s)
      金龍泰, 王宏飛, 竹本千重, 西井亘, 村松知成, 横山茂之
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • [Presentation] Cleavage mehcanisms of ATP-dependent Lon and HslVU proteases2007

    • Author(s)
      Nishii, W., Muramatsu, T., Kim, Y.-T., Yokoyama, S. and Takahashi, K.
    • Organizer
      5th General meeting of the International Proteolysis Society
    • Place of Presentation
      Patras, Greece
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • [Presentation] SARSコロナウィルス3CLプロテアーゼプロ体の活性化メカニズム2007

    • Author(s)
      金龍泰, 王宏飛, 竹本千重, 西井亘, 村松知成, 横山茂之
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • [Presentation] ATP依存性プロテアーゼLonおよびHslVUの基質分解機構2007

    • Author(s)
      西井亘, 村松知成, 金龍泰, 横山茂之, 高橋健治
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17770116
  • 1.  TAKAHASHI Kenji (70011533)
    # of Collaborated Projects: 2 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 2.  工藤 佳久 (20080179)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 3.  中村 健 (50227906)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 4.  KOJIMA Masaki (90277252)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results
  • 5.  INOUE Hideshi (20184765)
    # of Collaborated Projects: 1 results
    # of Collaborated Products: 0 results

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