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OHTSUBO Yoshiyuki  大坪 嘉行

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Researcher Number 40342761
Other IDs
Affiliation (Current) 2022: 東北大学, 生命科学研究科, 准教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2015 – 2022: 東北大学, 生命科学研究科, 准教授
2015: 東北大学, 大学院生命科学研究科, 助教
2011 – 2015: 東北大学, 生命科学研究科, 助教
2013: 東北大学, 大学院生命科学研究科, 助教
2007 – 2012: Tohoku University, 大学院・生命科学研究科, 助教 … More
2006: 東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助手
2005 – 2006: 東北大学, 大学院生命科学研究科, 助手
2004: 東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助手 Less
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Applied microbiology / Genome biology
Except Principal Investigator
Applied microbiology / Boundary agriculture / Basic Section 38020:Applied microbiology-related / Environmental agriculture(including landscape science) / Plant nutrition/Soil science / Transformative Research Areas, Section (IV) / Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
Keywords
Principal Investigator
カタボライト調節 / 二成分調節系 / 土壌細菌 / beta-proteobacteria / 環境細菌 / カタボライト調節メカニズム / PCB分解細菌 / beta-pretobacteria / 有機酸 / PCB分解菌 … More / recombination / ShortReadManager / illumina / リコンビネーション / k-mer / ソフトウエア / イルミナリード / ビフェニル資化能 / 協奏進化 / 次世代シーケンサー / ゲノム進化 / MMLV-RT / tailing activity / tailing enhancers / adaptor ligation / catabolite control / protein acetylation / TCRS / CIS法 / アダプター連結 / qTnSeq / タンパク質アセチル化 / 制御因子 / 水平伝達 / TSS解析 / Tnライブラリー / 接合伝達 / tailing活性 / PCBs / イルミナシーケンサー / qTSS … More
Except Principal Investigator
環境細菌 / 細菌 / 炭酸固定 / 可動性遺伝因子 / メタゲノム / 遺伝子 / 人為起源物質 / 細菌進化 / 微生物機能開発 / 環境汚染 / 分解酵素遺伝子 / スフィンゴモナス / 環境汚染物質 / oligotroph / 低栄養環境 / 細菌コミュニティ / バイオレメディエーション / 環境浄化 / 遺伝子水平伝播 / プラスミド / ゲノミックアイランド / 可動遺伝因子 / 遺伝子資源 / グノミックアイランド / 遺伝子治療 / 環境 / 微生物 / 遺伝子伝播 / 自然生態系 / 微生物学 / 独立栄養細菌 / 極貧有機炭素源環境 / ゲノム / 進化 / 環境汚染物質分解 / 細菌集団 / スフィンゴモナッド / グリオキシル酸回路 / 次世代型シーケンサー / 次世代シーケンサー / 複合生物系 / 複合微生物系 / 汚染土壌浄化 / 有害化合物 / 微生物間相互作用 / 土壌汚染防止・浄化 / 有害化学物質 / 微生物相互作用 / 極貧栄養環境 / 土壌微生物 / ネットワーク / 非線形時系列解析 / 培養実験 / environmental pollutants / evolution / mobile genetic elements / membrane vesicle / insertion sequence Less
  • Research Projects

    (20 results)
  • Research Products

    (653 results)
  • Co-Researchers

    (39 People)
  •  Advanced utilization strategies of beneficial bacteria based on the survival and growth mechanisms of bacteria under poor conditions

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2022 – 2024
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 38020:Applied microbiology-related
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Approach to the substance of bacterial extracellular genetic information storage device

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2022 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • Review Section
      Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  土壌微生物機能発揮の鍵となる群集・メタゲノム構造の特定

    • Principal Investigator
      近藤 倫生
    • Project Period (FY)
      2021 – 2025
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
    • Review Section
      Transformative Research Areas, Section (IV)
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Development of practical use of useful bacteria by understanding their behavior in the environment

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2019 – 2021
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 38020:Applied microbiology-related
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Soil-derived bacterial consortium capable of degrading chemical pollutant: interaction between pollutant-degrader and co-residing non-degraders

    • Principal Investigator
      Tsuda Masataka
    • Project Period (FY)
      2017 – 2019
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Plant nutrition/Soil science
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Behavior of environmental bacteria in microbial community and oligotrophic growth state

    • Principal Investigator
      Nagata Yuji
    • Project Period (FY)
      2016 – 2017
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Understanding of PCB-degrading soil bacterium and development of experimental methods for applied microbiologyPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Ohtsubo Yoshiyuki
    • Project Period (FY)
      2015 – 2017
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Studies on metabolic pathway involved in oligotrophic growth of heterotrophic bacteria

    • Principal Investigator
      Nagata Yuji
    • Project Period (FY)
      2014 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Mechanisms for acquiring ability to degrade novel compounds in sphingomonads and their applications

    • Principal Investigator
      Nagata Yuji
    • Project Period (FY)
      2013 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Behavior of microbial community in the environment polluted by aromatic compound

    • Principal Investigator
      Tsuda Masataka
    • Project Period (FY)
      2013 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Environmental agriculture(including landscape science)
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Studies on oligotrophic mutants of an aerobic heterotrophic bacterium

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2012 – 2013
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Studies on features and frequencies of recombination in bacterial evolutionPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      OHTSUBO Yoshiyuki
    • Project Period (FY)
      2011 – 2013
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Genome biology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Studies on molecular mechanisms for functional evolution of bacteria in the environment

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2010 – 2012
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Response of soil microbial community to exposure of environmental pollutants

    • Principal Investigator
      TSUDA Masataka
    • Project Period (FY)
      2010 – 2012
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Boundary agriculture
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Genomic organization and genomic dynamism of versatile sphingomonads

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2010 – 2011
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Revealing catabolite-control mechanisms of soil bacteriaPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      YOSHIYUKI Ohtsubo
    • Project Period (FY)
      2008 – 2010
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  挿入配列の土壌環境での動態の解明と新規遺伝子獲得への応用

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2007 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Horizontal transfer of bacterial genes for degradation of environmental pollutants

    • Principal Investigator
      TSUDA Masataka
    • Project Period (FY)
      2006 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Boundary agriculture
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  環境細菌のカタボライト調節分子メカニズムの解明Principal Investigator

    • Principal Investigator
      大坪 嘉行
    • Project Period (FY)
      2006 – 2007
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  PCB分解土壌細菌のカタボライト調節メカニズムの解明Principal Investigator

    • Principal Investigator
      大坪 嘉行
    • Project Period (FY)
      2004 – 2005
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University

All 2021 2020 2019 2018 2017 2016 2015 2014 2013 2012 2011 2010 2009 2008 2007 2006 2005 Other

All Journal Article Presentation Book Patent

  • [Book] DNA Traffic in the Environment2019

    • Author(s)
      Nagata Yuji、Kato Hiromi、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • Total Pages
      278
    • Publisher
      Springer
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2016

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Publisher
      ASM Press, Washington, DC
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Book] Biodegradation of Organochlorine Pesticides2015

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo Y, Tsuda M
    • Total Pages
      30
    • Publisher
      ASM Press, Washington, DC
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2015

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Publisher
      ASM Press, Washington, DC
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2015

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Publisher
      ASM Press, Washington, DC
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Book] Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., E. Nishiyama, Y. Ishibashi, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Total Pages
      13
    • Publisher
      Springer
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. (In : Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds) )Biodegradative Bacteria.2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y, Tsuda M
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo(doi:10.1007/978-4-431-54520-0_14)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In: Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds) Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y, Tsuda M
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
    • Total Pages
      358
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
    • Total Pages
      358
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Book] Mobile catabolic genetic elements in pseudomonads. In: Nojiri, H., M. Tsuda, M. Fukuda, and Y. Kamagata (eds), Biodegradative Bacteria: How Bacteria Degrade, Survive, Adapt, and Evolve2014

    • Author(s)
      Tsuda, M., Y. Ohtsubo, and H. Yano
    • Publisher
      Springer, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Book] Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Tsuda, M., Y. Ohtsubo, and H. Yano
    • Total Pages
      20
    • Publisher
      Springer
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Book] Biodegradative Bacteria: How Bacteria Degrade, Survive, Adapt, and Evolve2013

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo
    • Publisher
      Springer Verlag
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Book] 土壌環境細菌の比較ゲノム「比較ゲノム学から読み解く生命システム-基本概念から最新ゲノム情報まで-」(藤山秋佐夫監修)2007

    • Author(s)
      津田雅孝, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Publisher
      秀潤社
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems In:Nojiri, H., M. Tsuda, M. Fukuda, and Y. Kamagata (eds)

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, E. Nishiyama, Y. Ishibashi, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Publisher
      Biodegradative Bacteria. Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces carbon dioxide-dependent high-yield growth under oligotrophic conditions2020

    • Author(s)
      Shinnosuke Inaba, Hironori Sakai, Hiromi Kato, Takayuki Horiuchi, Hirokazu Yano, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, and Yuji Nagata
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 166

    • DOI

      10.1099/mic.0.000908

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Transcriptome analysis of zygotic induction during conjugative transfer of plasmid RP42020

    • Author(s)
      Miyakoshi Masatoshi、Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 11 Pages: 1125-1125

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.01125

    • NAID

      120007165442

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H03464, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] A transcriptional regulator, IscR, of Burkholderia multivorans acts as both repressor and activator for transcription of iron-sulfur cluster-biosynthetic isc operon2020

    • Author(s)
      Nonoyama S, Kishida K, Sakai K, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M
    • Journal Title

      Research in Microbiology

      Volume: 171 Pages: 319-330

    • DOI

      10.1016/j.resmic.2020.06.005

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Complete genome sequence of an anaerobic benzene-degrading bacterium, Azoarcus sp. strain DN112019

    • Author(s)
      Devanadera Allan、Vejarano Felipe、Zhai Yu、Suzuki-Minakuchi Chiho、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka、Kasai Yuki、Takahata Yoh、Okada Kazunori、Nojiri Hideaki
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 8

    • DOI

      10.1128/mra.01699-18

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Bacillus licheniformis TAB7, a compost-deodorizing strain with potential for plant growth promotion2019

    • Author(s)
      Mpofu Enock、Vejarano Felipe、Suzuki-Minakuchi Chiho、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka、Chakraborty Joydeep、Nakajima Masatoshi、Okada Kazunori、Tada Nobuki、Kimura Toshiaki、Nojiri Hideaki
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 8

    • DOI

      10.1128/mra.01659-18

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Thalassococcus sp. Strain S3, a Marine Roseobacter Clade Member Capable of Degrading Carbazole2019

    • Author(s)
      Vejarano Felipe、Suzuki-Minakuchi Chiho、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka、Okada Kazunori、Nojiri Hideaki
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 8

    • DOI

      10.1128/mra.00231-19

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PLANNED-19H05686, KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Lessons from the genomes of lindane-degrading sphingomonads2019

    • Author(s)
      Nagata Yuji、Kato Hiromi、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Environ Microbiol Rep

      Volume: 11 Pages: 630-644

    • DOI

      10.1111/1758-2229.12762

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Conjugative transfer of IncP-9 catabolic plasmids requires a previously uncharacterized gene, mpfK, whose homologs are conserved in various MPFT-type plasmids2019

    • Author(s)
      Kishida Kouhei、Nonoyama Shouta、Lukas Tim、Kawahara Shotaro、Kudo Koji、Nagata Yuji、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol

      Volume: 85

    • DOI

      10.1128/aem.01850-19

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Properties and efficient scrap-and-build repairing of mechanically sheared 3' DNA ends2019

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Sakai Keiichiro、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 2 Pages: 409-409

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0660-7

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Suppression of substrate inhibition in phenanthrene-degrading Mycobacterium by co-cultivation with a non-degrading Burkholderia strain2019

    • Author(s)
      Natsumi Ogawa, Hiromi Kato, Kouhei Kishida, Eikichi Ichihashi, Taichiro Ishige, Hirofumi Yoshikawa, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 印刷中 Pages: 625-637

    • DOI

      10.1099/mic.0.000801

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K18665, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Establishment of plasmid vector and allelic exchange mutagenesis systems in a mycobacterial strain that is able to degrade polycyclic aromatic hydrocarbon2018

    • Author(s)
      Kishida K, Ogawa N, Ichihashi E, Kato H, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 82 Pages: 1169-1171

    • DOI

      10.1080/09168451.2018.1445522

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K18665, KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Optimization of single strand DNA incorporation reaction by Moloney murine leukaemia virus reverse transcriptase2018

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Sasaki Haruna、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 25 Pages: 477-487

    • DOI

      10.1093/dnares/dsy018

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the marine carbazole-degrading bacterium Erythrobacter sp. strain KY52018

    • Author(s)
      Vejarano Felipe、Suzuki-Minakuchi Chiho、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka、Okada Kazunori、Nojiri Hideaki
    • Journal Title

      Microbiology Resource Announcements

      Volume: 7

    • DOI

      10.1128/mra.00935-18

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Conjugative transfer system of IncP-9 naphthalene-catabolic plasmid NAH7: characterization of its oriT region and relaxase and host range of conjugative system2017

    • Author(s)
      Kishida K, Inoue K, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol.

      Volume: 83

    • DOI

      10.1128/aem.02359-16

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Efficient N-tailing of blunt DNA ends by Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase2017

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 41769-41769

    • DOI

      10.1038/srep41769

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Compounds that enhance the tailing activity of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase2017

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 6520-6520

    • DOI

      10.1038/s41598-017-04765-8

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] The small protein HemP is a transcriptional activator for the hemin uptake operon in Burkholderia multivorans ATCC 176162017

    • Author(s)
      Sato T, Nonoyama S, Kimura A, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol.

      Volume: 83

    • DOI

      10.1128/aem.00479-17

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122, a Nitrogen-Fixing Soybean Symbiont.2017

    • Author(s)
      Masayuki Sugawara, Takahiro Tsukui, Takakazu Kaneko, Yoshiyuki Ohtsubo, Shusei Sato, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa.
    • Journal Title

      Genome A.

      Volume: 5(9)

    • DOI

      10.1128/genomea.01743-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Bacterium, Sphingobium sp. Strain MI1205.2016

    • Author(s)
      Tabata M, Ohhata S, Nikawadori Y, Sato T, Kishida K, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00246-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete genome sequence of cyanobacterium Fischerella sp. NIES-3754, providing thermoresistant optogenetic tools2016

    • Author(s)
      Hirose Y., Fujisawa T., Ohtsubo Y., Katayama M., Misawa N., Wakazuki S., Shimura Y., Nakamura Y., Kawachi M., Yoshikawa H., Eki T., and Kanesaki Y.
    • Journal Title

      J Biotechnol

      Volume: 220 Pages: 51-2

    • DOI

      10.1016/j.jbiotec.2016.01.011

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07368, KAKENHI-PROJECT-15K07557, KAKENHI-PROJECT-15H05712, KAKENHI-PROJECT-15H05578, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Algoriphagus sp. Strain M8-2, Isolated from a Brackish Lake2016

    • Author(s)
      Muraguchi Y, Kushimoto K, Ohtsubo Y, Suzuki T, Dohra H, Kimbara K, Shintani M.
    • Journal Title

      Genome Announc.

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00347-16

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Sphingopyxis terrae Strain 203-1 (NBRC 111660), a Polyethylene Glycol Degrader2016

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nonoyama S, Nagata Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F.
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00530-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Methylobacterium sp. Strain AMS5, an Isolate from a Soybean Stem2016

    • Author(s)
      Tomoyuki Minami, Yoshiyuki Ohtsubo, Mizue Anda, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 4(2)

    • DOI

      10.1128/genomea.00144-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Burkholderia caribensis Bcrs1W (NBRC110739), a strain co-residing with phenanthrene degrader Mycobacterium sp. EPa45.2016

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nonoyama S, Ogawa N, Kato H, Nagata Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      J Biotechnol

      Volume: 228 Pages: 67-68

    • DOI

      10.1016/j.jbiotec.2016.04.042

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Sphingopyxis macrogoltabida Strain 203N (NBRC 111659), a Polyethylene Glycol Degrader.2016

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nonoyama S, Nagata Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F.
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00529-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a γ-Hexachlorocyclohexane Degrader, Sphingobium sp. Strain TKS, Isolated from a γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Microbial Community2016

    • Author(s)
      Tabata M, Ohhata S, Kawasumi T, Nikawadori Y, Kishida K, Sato T, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00247-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Cyanobacterium Leptolyngbya sp. NIES-3755. Genome Announc.2016

    • Author(s)
      Hirose Y., Fujisawa T., Ohtsubo Y., Katayama M., Misawa N., Wakazuki S., Shimura Y., Nakamura Y., Kawachi M., Yoshikawa H., Eki T., and Kanesaki Y.
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00090-16

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07368, KAKENHI-PROJECT-15K07557, KAKENHI-PROJECT-15H05712, KAKENHI-PROJECT-15H05578, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Comparison of the complete genome sequences of four gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains: insights into the evolution of bacteria able to degrade a recalcitrant man-made pesticide2016

    • Author(s)
      Tabata M, Ohhata S, Nikawadori Y, Kishida K, Sato T, Kawasumi T, Kato H, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y.
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 6 Pages: 581-599

    • DOI

      10.1093/dnares/dsw041

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877, KAKENHI-PROJECT-16K18665
  • [Journal Article] Complete genome sequence of cyanobacterium Nostoc sp. NIES-3756, a potentially useful strain for phytochrome-based bioengineering2016

    • Author(s)
      Hirose Y., Fujisawa T., Ohtsubo Y., Katayama M., Misawa N., Wakazuki S., Shimura Y., Nakamura Y., Kawachi M., Yoshikawa H., Eki T., and Kanesaki Y.
    • Journal Title

      J. Biotechnol.

      Volume: 220 Pages: 51-52

    • DOI

      10.1016/j.jbiotec.2015.12.002

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15K07368, KAKENHI-PROJECT-15K07557, KAKENHI-PROJECT-15H05712, KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-15H05578, KAKENHI-PROJECT-15K14486
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Polyvinyl Alcohol-Degrading Strain Sphingopyxis sp. 113P3 (NBRC 111507).2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y. Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01169-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Properties and biotechnological applications of natural and engineered haloalkane dehalogenases2015

    • Author(s)
      Nagata Y, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 99 Pages: 9865-9581

    • DOI

      10.1007/s00253-015-6954-x

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a Phenanthrene Degrader, Mycobacterium sp. Strain EPa45 (NBRC 110737), Isolated from a Phenanthrene-Degrading Consortium2015

    • Author(s)
      Kato H, Ogawa N, Ohtsubo Y, Oshima K, Toyoda A, Mori H, Nagata Y, Kurokawa K, Hattori M, Fujiyama A, Tsuda M
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.00782-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Cyanobacterium Geminocystis sp. Strain NIES-3709, Which Harbors a Phycoerythrin-Rich Phycobilisome2015

    • Author(s)
      Yuu Hirose, Mitsunori Katayama, Yoshiyuki Ohtsubo, Naomi Misawa, Erica Iioka, Wataru Suda, Kenshiro Oshima, Mitsumasa Hanaoka, Kan Tanaka, Toshihiko Eki, Masahiko Ikeuchi, Yo Kikuchi, Makoto Ishida, and Masahira Hattori
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3 Pages: 1-2

    • DOI

      10.1128/genomea.00385-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24248061, KAKENHI-PROJECT-25830130, KAKENHI-PUBLICLY-26117707, KAKENHI-PROJECT-25252017, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete genome sequence of cyanobacterium Geminocystis sp. NIES-3708, which performs type II complementary chromatic acclimation.2015

    • Author(s)
      Yuu Hirose, Mitsunori Katayama, Yoshiyuki Ohtsubo, Naomi Misawa, Erica Iioka, Wataru Suda, Kenshiro Oshima, Mitsumasa Hanaoka, Kan Tanaka, Toshihiko Eki, Masahiko Ikeuchi, Yo Kikuchi, Makoto Ishida, and Masahira Hattori
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3 Pages: 1-2

    • DOI

      10.1128/genomea.00357-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24248061, KAKENHI-PROJECT-25830130, KAKENHI-PUBLICLY-26117707, KAKENHI-PROJECT-25252017, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Ohtsubo Y, Nagata Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01399-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Sphingopyxis macrogoltabida Type Strain NBRC 15033, Originally Isolated as a Polyethylene Glycol Degrader2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01401-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader, Burkholderia sp. HB-1 (NBRC 110738)2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Moriya A, Kato H, Ogawa N, Nagata Y, Tsuda M
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01283-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a Polypropylene Glycol-Degrading Strain, Microbacterium sp. No. 72015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01400-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome.2015

    • Author(s)
      Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, and Hisayuki Mitsui
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U S A

      Volume: 112(46) Pages: 14343-14347

    • DOI

      10.1073/pnas.1514326112

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Isolation of oxygenase genes for indigo-forming activity from an artificially polluted soil metagenome by functional screening using Pseudomonas putida strains as hosts2015

    • Author(s)
      Hifofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Akira Ono, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, and Masataka Tsuda
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: in press

    • DOI

      10.1007/s00253-014-6322-2

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Time series metagenomic analysis reveals robustness of soil microbiome against chemical disturbance2015

    • Author(s)
      Kato H, Mori H, Maruyama F, Toyoda A, Oshima K, Endo R, Fuchu G, Miyakoshi M, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Hattori M, Fujiyama A, Kurokawa K, Tsuda M
    • Journal Title

      DNA Res

      Volume: 22 Pages: 413-424

    • DOI

      10.1093/dnares/dsv023

    • NAID

      120005850199

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Rhodovulum sulfidophilum DSM 2351, an extracellular nucleic acids producing bacterium2015

    • Author(s)
      Nagao N, Hirose Y, Misawa N, Ohtsubo Y, Umekage S, Kikuchi Y.
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3(2) e00388-15 Pages: 1-2

    • DOI

      10.1128/genomea.00388-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25830130, KAKENHI-PROJECT-25252017, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genetic determinants for fitness in soil by using signature-tagged mutagenesis2014

    • Author(s)
      Nagata, Y., J. Senbongi, Y. Ishibashi, R. Sudo, M. Miyakoshi, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: in press Pages: 883-891

    • DOI

      10.1099/mic.0.077057-0

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genetic determinants for fitness in soil by using signature-tagged mutagenesis2014

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Junko Senbongi, Yoko Ishibashi, Rie Sudo, Masatoshi Miyakoshi, Yoshiyuki, Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 160 Pages: 883-891

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of the Thermophilic Polychlorinated Biphenyl Degrader Geobacillus sp. Strain JF8 (NBRC 109937)2014

    • Author(s)
      Shintani, M., Y. Ohtsubo, K. Fukuda, A. Hosoyama, S. Ohji, A. Yamazoe, N. Fujita, Y. Nagata, M. Tsuda, T. Hatta, and K. Kimbara
    • Journal Title

      Genome announcements

      Volume: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.01213-13

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Pseudomonas sp.strain TKP isolated from a γ-hexachlorocyclohexane-degrading mixed culture2014

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., K. Kishida, T. Sato, M. Tabata, T. Kawasumi, Y. Ogura, T. Hayashi, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 2

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa MTB-1, Isolated from a Microbial Community Enriched by the Technical Formulation of Hexachlorocyclohexane2014

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., T. Sato, K. Kishida, M. Tabata, Y. Ogura, T. Hayashi, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Genome Announc.

      Volume: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.01130-13

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [Journal Article] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes.2014

    • Author(s)
      Mori H, Maruyama F, Kato H, Toyoda A, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Fujiyama A, Tsuda M Kurokawa K
    • Journal Title

      DNA Res.

      Volume: 21 Pages: 217-227

    • DOI

      10.1093/dnares/dst052

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-24770015, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [Journal Article] Structural and Functional Analysis of Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites2014

    • Author(s)
      Chaloupkova R, Prudnikova T, Rezacova P, Prokop Z, Koudelakova T, Daniel L, Brezovsky J, Ikeda-Ohtsubo W, Sato Y, Kuty M, Nagata Y, Smatanova IK, Damborsky J
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section D

      Volume: D70 Pages: 1884-1897

    • DOI

      10.1107/s1399004714009018

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Stepwise enhancement of catalytic performance of haloalkane dehalogenase LinB towards gamma-hexachlorocyclohexane2014

    • Author(s)
      Ryota Moriuchi, Hiroki Tanaka, Yuki Nikawadori, Mayuko Ishitsuka, Michihiro Ito, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Jiri Damborsky, Zbynek Prokop, and Yuji Nagata
    • Journal Title

      AMB Express

      Volume: 4 Pages: 72-72

    • DOI

      10.1186/s13568-014-0072-5

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain TKP isolated from a γ-hexachlorocyclohexane-degrading mixed culture2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Kishida K, Sato T, Tabata M, Kawasumi T, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y
    • Journal Title

      Genome Announc.

      Volume: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.01241-13

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [Journal Article] Cointegrate-resolution of toluene-catabolic transposon Tn4651: determination of crossover site and the segment required for full resolution activity2013

    • Author(s)
      Yano, H., H. Genka, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, E.M. Top, M. Tsuda
    • Journal Title

      Plasmid.

      Volume: 69 Pages: 24-35

    • DOI

      10.1016/j.plasmid.2012.07.004

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2,4,6-Trichlorophenol Degrader2013

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T
    • Journal Title

      Genome announcements

      Volume: 1

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology

      Volume: 13 (1) Pages: 51-56

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the・ -hexachlorocyclohexane-degrading bactrium Sphingomonas sp. stain MM-12013

    • Author(s)
      Tabata M, Ohtsubo Y, Ohhata S, Tsuda M, Nagata Y.
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.00247-13

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Propionibacterium acnes Isolate from sarcoidosis patient.2013

    • Author(s)
      Minegishi K, Aikawa C, Furukawa A, Watanabe T, Nakano T, Ogura Y, Ohtsubo Y, Kurokawa K, Hayashi T, Maruyama F, Nakagawa I, Eishi Y
    • Journal Title

      Genome Announcment

      Volume: 1 Pages: 1-1

    • DOI

      10.1128/genomea.00016-12

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-12J05796, KAKENHI-PROJECT-12J06919, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23790478, KAKENHI-PROJECT-24659402, KAKENHI-PUBLICLY-25125708, KAKENHI-PROJECT-25293370, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-25670775, KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PUBLICLY-23125511
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2, 4, 6-Trichlorophenol Degrader2013

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T.
    • Journal Title

      Genome announcements

      Volume: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.00903-13

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013

    • Author(s)
      永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology

      Volume: 13 Pages: 51-56

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] Inhibitory effect of Pseudomonas putida nitrogen-related phosphotransferase system on conjugative transfer of IncP-9 plasmid from Escherichia col2013

    • Author(s)
      Inoue K, Miyazaki R, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M
    • Journal Title

      FEMS Microbiology Letters

      Volume: 345 Pages: 102-109

    • DOI

      10.1111/1574-6968.12188

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25892034
  • [Journal Article] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems2013

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo
    • Journal Title

      Biodegradative Bacteria: How Bacteria Degrade, Survive, Adapt, and Evolve

      Volume: Chapter 14 Pages: 279-291

    • DOI

      10.1007/978-4-431-54520-0_14

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013

    • Author(s)
      永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology

      Volume: 13(1) Pages: 51-56

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS102 located on integrative and conjugative element2012

    • Author(s)
      Ohtsubo Y., Y. Ishibashi, H. Naganawa, S. Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, M. Tsuda
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 194 Pages: 4237-4248

    • DOI

      10.1128/jb.00352-12

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS102 located on integrative and conjugative element2012

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, 4人, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriol

      Volume: 184 Pages: 4237-4248

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Povotal role of anthranilate dioxygenase genes in the adaptation of Burkholderia multivorans ATCC 17616 in soil2012

    • Author(s)
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Yamamoto, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      FEMS Microbiol Lett.

      Volume: 330 Pages: 46-55

    • DOI

      10.1111/j.1574-6968.2012.02532.x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase gene with its flanking regions from soil by activity-based screening techniques2012

    • Author(s)
      Ito, M., A. Ono, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      European Journal of Soil Biology

      Volume: 52 Pages: 16-19

    • DOI

      10.1016/j.ejsobi.2012.05.001

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012

    • Author(s)
      Kimura, S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 158 Pages: 1284-1293

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Acidovorax sp. strain KKS102, a polychlorinated-biphenyl degrader.2012

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., F. Maruyama, H. Mitsui, Y. Nagata, M. Tsuda
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 194 Pages: 6970-6971

    • DOI

      10.1128/jb.01848-12

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012

    • Author(s)
      Kimura, A., S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 158 Pages: 1284-1293

    • DOI

      10.1099/mic.0.057372-0

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] The lin genes for gamma-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp. MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids.2011

    • Author(s)
      Tabata, M., R.Endo, M.Ito, Y.Ohtsubo, A.Kumar, M. Tsuda, Y.Nagata
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem 75

      Pages: 466-472

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] The <I>lin</I> Genes for &gamma;-Hexachlorocyclohexane Degradation in <I>Sphingomonas</I> sp. MM-1 Proved to Be Dispersed across Multiple Plasmids2011

    • Author(s)
      Tabata, M., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 75 (3) Issue: 3 Pages: 466-472

    • DOI

      10.1271/bbb.100652

    • NAID

      10028201533

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • Language
      English
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • DOI

      10.1016/j.enzmictec.2011.10.005

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of SphingobiumjaponicumUT26, an archetypal gamma- hexachlorocyclohexane- degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypalgamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Y. Nagata, 3人, Y. Ohtsubo, 5人, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme Microb. Technol

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] The lin genes for γ-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp. MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids2011

    • Author(s)
      Tabata, M., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem

      Volume: 75(3) Pages: 466-472

    • NAID

      10028201533

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • Author(s)
      加藤広海,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Journal Title

      J.Environ. Biotechnol

      Volume: 10 Pages: 63-70

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcherの紹介2010

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48 Pages: 313-318

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行、大坪和香子、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48(5) Pages: 313-319

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48 Pages: 313-319

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48 Pages: 313-319

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウエアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行,大坪和香子,永田裕二,津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48 Pages: 313-319

    • NAID

      10026438311

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010

    • Author(s)
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda.
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: 12 Pages: 2539-2558

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representative gamma-hexachlorocyclohexane-degr ading bacterium Sphingobium japonicum UT26.2010

    • Author(s)
      Nagata, Y., 大坪嘉行, R.Endo, N.Ichikawa, A.Ankai, A.Oguchi, S.Fukui, N.Fujita, 津田雅孝
    • Journal Title

      J Bacteriol 192

      Pages: 5852-5853

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010

    • Author(s)
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: 12(9) Pages: 2539-2558

    • DOI

      10.1111/j.1462-2920.2010.02227.x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行、大坪和香子、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48(5) Pages: 313-319

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced insoil environment by in vivo expression technology2010

    • Author(s)
      E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Environ. Microbiol

      Volume: 12 Pages: 2539-2558

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 10(2) Pages: 63-70

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR062010

    • Author(s)
      Matsushima, R., H. Danno, M. Uchida, K. Ishihara, T. Suzuki, M. Kaneniwa, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 86 Pages: 567-576

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, R. Endo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriology

      Volume: 192 Pages: 5852-5853

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representativeγ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteriumSphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, R. Endo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriology

      Volume: 192 Pages: 5852-5853

    • DOI

      10.1128/jb.00961-10

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 10(2) Pages: 63-70

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR062010

    • Author(s)
      Matsushima, R., H. Danno, M. Uchida, K. Ishihara, T. Suzuki, M. Kaneniwa, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 86 Pages: 567-576

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウエアGenomeMatcher.2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, 大坪和香子, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物 48

      Pages: 313-319

    • NAID

      10026438311

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR06.2010

    • Author(s)
      Matsushima, R., H.Danno, M.Uchida, K.Ishihara, T.Suzuki, M.Kaneniwa, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol 86

      Pages: 567-576

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48 Pages: 313-319

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • Author(s)
      加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌 10

      Pages: 63-70

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology.2010

    • Author(s)
      Nishiyama, E., 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      Environ Microbiol 12

      Pages: 2539-2558

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性-難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2009

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性・難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性 -難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] 分子遺伝学的手法による細菌の土壌環境適応戦略の解明2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      生物工学会誌 87

      Pages: 434-436

    • NAID

      110007387598

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性 -難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-.2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 分子遺伝学的手法による細菌の土壌環境適応戦略の解明2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, 西山依里, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      生物工学会誌 87

      Pages: 434-436

    • NAID

      110007387598

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] Construction of signature-tagged mutant library in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics2008

    • Author(s)
      Shimoda, Y., H. Mitsui, H. Kamimatsuse, K. Minamisawa, E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, M. Tsuda, S. Shinpo, A. Watanabe, M. Kohara, M. Yamada, Y. Nakamura, S. Tabata,and S. Sato
    • Journal Title

      DNA Res 15

      Pages: 297-308

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] GenomeMatcher : a graphical user interface for DNA sequence comparison.2008

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., W.Ikeda-Ohtsubo, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics 9

      Pages: 376-376

    • NAID

      120003728119

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] GenomeMatcher : a graphical user interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., W. Ikeda-Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics 9

      Pages: 376-376

    • NAID

      120003728119

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Construction of signature-tagged mutant library in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics.2008

    • Author(s)
      Shimoda, Y., H.Mitsui, H.Kamimatsuse, K.Minamisawa, 西山依里, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝, S.Shinpo, A.Watanabe, M.Kohara, M.Yamada, Y.Nakamura, S.Tabata, S.Sato.
    • Journal Title

      DNA Res 15

      Pages: 297-308

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] Characterization of the traD operon of naphthalene-catabolic plasmid NAH72008

    • Author(s)
      Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      a host-range modifier in conjugative transfer. J. Bacteriol 190

      Pages: 6281-6289

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR : cultivation-independent isolation of gamma-hexachlorocyclohexane-degr ading genes from soil DNA.2008

    • Author(s)
      Fuchu, G., 大坪嘉行, M.Ito, R.Miyazaki, A.Ono, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol 79

      Pages: 627-32

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] GenomeMatcher : A graphical user interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo
    • Journal Title

      BMC Miyazaki 9

      Pages: 376-376

    • NAID

      120003728119

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] GenomeMatcher : A graphical user interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, et.al.
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics 9

      Pages: 376-376

    • NAID

      120003728119

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Journal Article] GenomeMatcher : A graphical user interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, et.al.
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics 9

      Pages: 376-376

    • NAID

      120003728119

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性-難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2008

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Journal Article] 多重染色体性のBurkholderia multivoransのゲノム構造と土壌でのゲノム情報発現2008

    • Author(s)
      津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 湯原悟志, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Journal Title

      土と微生物 62

      Pages: 93-97

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR : cultivation-independent isolation of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes from soil DNA2008

    • Author(s)
      Fuchu, G., Y. Ohtsubo, M. Ito, R. Miyazaki, A. Ono, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol 79

      Pages: 627-632

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsive transcriptional regulator Fur in Burkholderia multivorans.2008

    • Author(s)
      Yuhara, S., H.Komatsu, H.Goto, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 1763-74

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsive transcriptional regulator Fur in Burkholderia multivorans2008

    • Author(s)
      Yuhara, S., H. Komatsu, H. Goto, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 1763-1774

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] G. J. Zylstra, P. A. Williams, and M. Tsuda : Complete sequence determination combined with analysis of transposition/site-specific recombination events to explain genetic organization of IncP-7 TOL plasmid pWW53 and related mobile genetic elements2007

    • Author(s)
      Yano, H., C. E. Garruto, M. Sota, Y. Ohtsubo, Y. Nagata
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 369

      Pages: 11-26

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 自然環境で実際に機能する微生物遺伝子の遺伝学的手法による検索と解析2007

    • Author(s)
      津田雅孝, 西山依里, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Journal Title

      化学と生物 45

      Pages: 557-563

    • NAID

      10019578182

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 土壌生態系での環境細菌ゲノム情報発現2007

    • Author(s)
      津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Journal Title

      極限環境微生物学会誌 6

      Pages: 59-62

    • NAID

      130004486982

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Isolation and characterization of naphthalene-catabolic genes and plasmids from oil-contaminated soil by using two cultivation-independent approaches.2007

    • Author(s)
      Ono A, Miyazaki R, Sota M, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol. 74(2)

      Pages: 501-510

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18780051
  • [Journal Article] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007

    • Author(s)
      Nagata, Y., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol 74

      Pages: 741-752

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from γ-hexachlorocyclohexane-utilizing bacterium Sphingobium sp2007

    • Author(s)
      Ito, M., Z. Prokop, M. Klvana, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, J. Damborsky, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Arch. Microbiol 188

      Pages: 313-325

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Isolation and characterization of naphthalene-catabolic genes and plasmids from oil-contaminated soil by using two cultivation-independent approaches. Appl2007

    • Author(s)
      Ono, A., R. Miyazaki, M. Sota, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiol. Biotechnol 74

      Pages: 501-510

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Identification and characterization of genes encoding a putative ABC-type transporter essential for the utilization of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT262007

    • Author(s)
      Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 189

      Pages: 3712-3720

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Identification and Characterization of Genes Encoding a putative ABC-type Transporter Essential for the Utilization of {gamma}-Hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT26.2007

    • Author(s)
      Endo R, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y.
    • Journal Title

      J Bacteriol. (in press)

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18780051
  • [Journal Article] Growth inhibition by metabolites of gamma-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT26.2006

    • Author(s)
      Endo R, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem 70(4)

      Pages: 1029-1032

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18780051
  • [Journal Article] Identification of a response regulator gene for catabolite control from a PCB-degrading beta-proteobacteria, Acidovorax sp. KKS102.2006

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Goto H, Nagata Y, Kudo T, Tsuda M
    • Journal Title

      Mol Microbiol. 60(6)

      Pages: 1563-1575

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18780051
  • [Journal Article] Complete nucleotide sequence of an exogenously isolated plasmid pLB1 involved in the degradation of γ-hexachlorocyclohexane2006

    • Author(s)
      Miyazaki, R. Y. Sato, M. Ito, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol 72

      Pages: 6923-6933

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT26.2006

    • Author(s)
      Nagata Y, Kamakura M, Endo R, Miyazaki R, Ohtsubo Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      FEMS Microbiol. Lett. 256(1)

      Pages: 112-118

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16780050
  • [Journal Article] Free in PMC Complete nucleotide sequence of an exogenously isolated plasmid, pLB1, involved in gamma-hexachlorocyclohexane degradation.2006

    • Author(s)
      Miyazaki R, Sato Y, Ito M, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol 72(11)

      Pages: 6923-6933

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18780051
  • [Journal Article] Growth inhibition by metabolites of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT262006

    • Author(s)
      Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem 70

      Pages: 1029-1032

    • NAID

      10018532907

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Functional analysis of unique class II insertion sequence IS1071.2006

    • Author(s)
      Sota M, Yano H, Nagata Y, Ohtsubo Y, Genka H, Anbutsu H, Kawasaki H, Tsuda M.
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol 2006

      Pages: 291-297

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16780050
  • [Journal Article] Identification of a response regulator gene for catabolite control from a PCB-degrading β-proteobacteria, Acidovorax sp. KKS1022006

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo
    • Journal Title

      Molecular Microbiology 60

      Pages: 1563-1575

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Identification of a response regulator gene for catabolite control from a PCB-degrading β-proteobacteria, Acidovorax sp2006

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., H. Goto, Y. Nagata, T. Kudo, and M. Tsuda
    • Journal Title

      KKS102. Mol. Microbiol 60

      Pages: 1563-1575

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] High-Temperature-Induced Transposition of is Elements in Burkholderia multivorans ATCC 176162005

    • Author(s)
      大坪嘉行, 源河浩之, 小松春信, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      Applied and Environmental Microbiology 4(in press)

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16780050
  • [Journal Article] Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 17616.2005

    • Author(s)
      Nagata Y, Matsuda M, Komatsu H, Imura Y, Sawada H, Ohtsubo Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      J Biosci Bioeng 99(6)

      Pages: 603-610

    • NAID

      110002695708

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16780050
  • [Journal Article] Two rhizobial strains, Mesorhizobium loti MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110, encode haloalkane dehalogenases with novel structures and substrate specificities.2005

    • Author(s)
      Sato Y, Monincova M, Chaloupkova R, Prokop Z, Ohtsubo Y, Minamisawa K, Tsuda M, Damborsky J, Nagata Y.
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol 71(8)

      Pages: 4372-4379

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16780050
  • [Journal Article] Degradation of β-Hexachlorocyclohexane by Haloalkane Dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT262005

    • Author(s)
      Nagata Y, Prokop Z, Sato Y, Jerabek P, Kumar A, Ohtsubo Y, Tsuda M, Damborsky J.
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol 71(4)

      Pages: 2183-2185

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16780050
  • [Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の探索

    • Author(s)
      永山浩史,菅原智詞,遠藤諒,加藤広海,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Journal Title

      J.Environ. Biotechnol

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Patent] 二本鎖DNA末端の加工方法2017

    • Inventor(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Industrial Property Rights Holder
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2017
    • Overseas
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Patent] 二本鎖DNA末端の加工方法2016

    • Inventor(s)
      大坪嘉行
    • Industrial Property Rights Holder
      大坪嘉行
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
      2016-06-14
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Taq DNA polymeraseによる新規タイプのCIS反応2021

    • Author(s)
      川原 昌太郎,永田 裕二,大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 新規qTnSeq法の開発:PCB/ビフェニル分解菌への適用と2つの指標値の導入2021

    • Author(s)
      逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
    • Organizer
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] ICEKKS1024677の接合伝達を制御する遺伝子発現制御機構2021

    • Author(s)
      松本 哲,永田 裕二,大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] qTnSeq法を用いたBurkholderia属細菌における潜在的抗生物質耐性遺伝子の網羅的同定2021

    • Author(s)
      野々山翔太、逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
    • Organizer
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 新型コロナウィルスを認識するDNAアプタマーの作製と迅速検出法の構築2021

    • Author(s)
      大坪 嘉行,永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける転写制御因子IscRの解析2021

    • Author(s)
      野々山 翔太,岸田 康平,酒井 啓一郎,永田 裕二, 津田 雅孝,大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 実験進化系で得られた人工殺虫剤分解に関与する進化型ハロアルカンデハロゲナーゼ2021

    • Author(s)
      陳 楠楠,大坪 嘉行,永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB分解菌Acidovorax sp. KKS102株が示す多段階増殖とレスポンスレギュレーターBphQの翻訳後修飾2020

    • Author(s)
      酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] キャピラリーシーケンサーとTraceViewerを用いたDNA解析のススメ2020

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 培養条件検討からadhX遺伝子依存的貧栄養環境生育機構に迫る2020

    • Author(s)
      酒井 洋範、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達に関与するtraR遺伝子の機能解析2020

    • Author(s)
      松本 哲、酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Construction of experimental evolution system of haloalkane dehalogenases and characterization of the evolved enzymes2020

    • Author(s)
      Nannan CHEN, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 人工遺伝子クラスターを利用した有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子キャプチャリング株の作製2020

    • Author(s)
      蘇 立俊、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Burkholderia属ヘム獲得系転写活性化因子HemPの普遍的機能の解析2020

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] qTnSeq法を利用したPCB/ビフェニル分解菌の分解制限要因の同定と排除2020

    • Author(s)
      逸見裕太郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 有機リン系殺虫剤分解細菌Sphingopyxis wildii株由来の2種のハロアルカンデハロゲナーゼの解析2020

    • Author(s)
      鄧 文昊、Annapoorni Lakshman Sagar、陳 楠楠、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、Dayanannda Siddavattam、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB分解菌Acidovorax sp. KKS102株が示す多段階増殖とレスポンスレギュレーターBphQの翻訳後修飾2020

    • Author(s)
      酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達に関与するtraR遺伝子の機能解析2020

    • Author(s)
      松本哲、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] qTnSeq法を利用したPCB/ビフェニル分解菌の分解制限要因の同定と排除2020

    • Author(s)
      逸見 裕太郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Burkholderia 属ヘム獲得系転写活性化因子 HemP の普遍的機能の解析2020

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、永田 裕二、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 超音波で断片化したDNAの3'端と効率的修復2020

    • Author(s)
      大坪 嘉行、酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得のための人工キャプチャリング株の構築2020

    • Author(s)
      蘇 立俊、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 超音波で断片化したDNAの3'端と効率的修復2020

    • Author(s)
      大坪嘉行、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写活性化機構の解析2020

    • Author(s)
      野々山翔太、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 培養条件検討からadhX遺伝子依存的貧栄養環境生育機構に迫る2020

    • Author(s)
      酒井洋範、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia multivorans の鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写活性化機構の解析2020

    • Author(s)
      野々山 翔太、岸田 康平、永田 裕二、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得のための人工キャプチャリング株の構築2020

    • Author(s)
      蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] キャピラリーシーケンサーと TraceViewer を用いた DNA 解析のススメ2020

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] qTnSeq法の開発とPCB分解細菌への適用2019

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 人工の代謝酵素遺伝子クラスターを利用した高機能有機塩素殺虫剤資化細菌の育種2019

    • Author(s)
      蘇 立俊 , 加藤 広海 , 大坪 嘉行 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45の生育阻害因子の解析2019

    • Author(s)
      堀川慧太、池内倫子、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Mycobacterium sp. EPa45株におけるフェナントレン分解遺伝子群の転写解析2019

    • Author(s)
      市橋永吉、小川なつみ、加藤広海、岸田康平、野々山翔太、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia属細菌におけるFurで制御されるヘム獲得系活性化因子HemPの普遍的機能の解析2019

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤 拓哉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Identification of the electron transport components of the carbazole 1,9a-dioxygenase from the marine carbazole-degrading bacterium Erythrobacter sp. KY52019

    • Author(s)
      Felipe Vejarano、水口千穂、大坪嘉行、津田雅孝、岡田憲典、野尻秀昭
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 難培養性細菌の培養における細胞外多糖の重要性2019

    • Author(s)
      高橋紳八、加藤広海、永田裕二、大塚重人、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] プラスミドベクターpBBR1MCSの宿主域に関する研究2019

    • Author(s)
      岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 環境細菌におけるadhX遺伝子が関与する貧栄養環境適応機構の普遍性2019

    • Author(s)
      酒井洋範、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] IscR of Burkholderia multivorans plays both repressing and activating roles in transcription of isc operon for biosynthesis of Fe-S cluster2019

    • Author(s)
      Shouta Nonoyama, Kouhei Kishida, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • Organizer
      8th Congress of European Microbiologists
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の分配系が関与する接合伝達頻度上昇2019

    • Author(s)
      久土晃二、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia属細菌における鉄硫黄クラスター生合成系の転写制御機構の解析2019

    • Author(s)
      野々山翔太、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関与する二成分調節因子BphPQの機能調節の解析2019

    • Author(s)
      酒井啓一郎、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 環境細菌におけるadhX遺伝子が関与する貧栄養環境適応機構の普遍性2019

    • Author(s)
      酒井 洋範 , 加藤 広海 , 大坪 嘉行 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解資化遺伝子群を有すICEKKS1024677の水平伝播宿主域の解析2019

    • Author(s)
      川原昌太郎、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系因子BphPQの解析2018

    • Author(s)
      佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Identification and characterization of a novel gene essential for conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH72018

    • Author(s)
      Kouhei Kishida、Nonoyama Shouta、Nagata Yuji、Ohtsubo Yoshiyuki、Masataka Tsuda
    • Organizer
      Plasmid Biology 2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Furで制御されるBurkholderia属細菌ヘム獲得系活性化因子HemPの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] トランスクリプトーム解析を用いた環境細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応戦略の解明2018

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] フェナントレン分解Mycobacterium株の遺伝子破壊系構築とビフェニル分解への転写応答2018

    • Author(s)
      市橋永吉、小川なつみ、岸田康平、加藤広海、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系因子BphPQの解析2018

    • Author(s)
      佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 難分解性芳香族化合物分解コンソーシアム由来の分解細菌Mycobacteirum sp. EPa45株における生育阻害機構2018

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、岸田康平、市橋永吉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規な接合伝達必須遺伝子の機能解明2018

    • Author(s)
      岸田康平、Tim Lucas、野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達域規定因子の同定2018

    • Author(s)
      川原 昌太郎、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に必須な遺伝子セットの同定2018

    • Author(s)
      岸田康平、Tim Lucas、野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] トランスクリプトーム解析を用いた環境細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応戦略の解明2018

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解Mycobacterium株の遺伝子破壊系構築とビフェニル分解への転写応答2018

    • Author(s)
      市橋永吉、小川なつみ、岸田康平、加藤広海、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 代謝酵素遺伝子群の人工クラスターを利用した有機塩素系殺虫剤資化細菌の育種2018

    • Author(s)
      蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達域規定因子の同定2018

    • Author(s)
      川原 昌太郎, 岸田 康平, 永田 裕二, 大坪 嘉行, 津田 雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 好気性従属栄養細菌における極貧栄養環境適応変異株の解析2018

    • Author(s)
      稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 環境汚染物質の分解細菌コミュニティにおける非分解菌コロニーの分解菌コロニーへの接近現象2018

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 環境汚染物質の分解細菌コミュニティにおける非分解菌コロニーの分解菌コロニーへの接近現象2018

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Carriage modalities of the carbazole-degrading gene clusters among nine bacterial strains2018

    • Author(s)
      Vejarano Felipe、水口千穂、新谷政己、大坪嘉行、津田雅孝、岡田憲典、野尻秀昭
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 好気性従属栄養細菌における極貧栄養環境適応変異株の解析2018

    • Author(s)
      稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 逆転写酵素を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析法の確立2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 好気性従属栄養細菌株由来の極貧栄養環境での生育能を獲得した突然変異株の解析2018

    • Author(s)
      稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] デアミナーゼと融合した新規デハロゲナーゼの特徴2018

    • Author(s)
      中鉢千尋、佐藤優花里、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 難分解性芳香族化合物分解コンソーシアム由来の分解細菌Mycobacteirum sp. EPa45株における生育阻害機構2018

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、岸田康平、市橋永吉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 逆転写酵素のtailing活性と新規TSLR反応を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に必須な遺伝子セットの同定2018

    • Author(s)
      岸田 康平, Tim Lucas, 野々山 翔太 ,永田 裕二, 大坪 嘉行, 津田 雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] In vivo evolution system for haloalkane dehalogenases toward degradation of a man-made pesticide2018

    • Author(s)
      陳 楠楠, 大坪嘉行, 津田雅孝, 永田裕二
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] デアミナーゼと融合した新規デハロゲナーゼの特徴2018

    • Author(s)
      中鉢千尋、佐藤優花里、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 好気性従属栄養細菌株由来の極貧栄養環境での生育能を獲得した突然変異株の解析2018

    • Author(s)
      稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Furで制御されるBurkholderia属細菌ヘム獲得系活性化因子HemPの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 逆転写酵素を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析手法の確立2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 難分解性芳香族化合物分解コンソーシアム由来の分解細菌Mycobacteirum sp. EPa45株における生育阻害機構2018

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、岸田康平、市橋永吉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤資化に必須なABCトランスポーターホモログの機能解析2018

    • Author(s)
      佐藤緋奈子、中鉢千尋、佐藤優花里、矢野大和、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] トランスクリプトーム解析を用いた環境細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応戦略の解明2018

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Furで制御されるBurkholderia属細菌ヘム獲得系活性化因子HemPの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌難培養性細菌の単離及び易培養性細菌との共存関係2018

    • Author(s)
      高橋紳八、加藤広海、永田裕二、大塚重人、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規な接合伝達必須遺伝子の機能解明2018

    • Author(s)
      岸田康平、Tim Lucas、野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 代謝酵素遺伝子群の人工クラスターを利用した有機塩素系殺虫剤資化細菌の育種2018

    • Author(s)
      蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 逆転写酵素のtailing活性と新規TSLR反応を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 逆転写酵素を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析手法の確立2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤資化に必須なABCトランスポーターホモログの機能解析2018

    • Author(s)
      佐藤緋奈子、中鉢千尋、佐藤優花里、矢野大和、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解Mycobacterium株の遺伝子破壊系構築とビフェニル分解への転写応答2018

    • Author(s)
      市橋永吉、小川なつみ、岸田康平、加藤広海、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 逆転写酵素のtailing活性と新規TSLR反応を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌難培養性細菌の単離及び易培養性細菌との共存関係2018

    • Author(s)
      高橋紳八、加藤広海、永田裕二、大塚重人、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 環境汚染物質の分解細菌コミュニティにおける非分解菌コロニーの分解菌コロニーへの接近現象2018

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] In vivo evolution system for haloalkane dehalogenases toward degradation of a man-made pesticide2018

    • Author(s)
      陳 楠楠、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドの接合伝達に関わる全遺伝子の同定2017

    • Author(s)
      岸田 康平、ルーカス ティム、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害の緩和に対する非分解細菌の生細胞の重要性2017

    • Author(s)
      小川 なつみ、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] マウス白血病ウィルス由来逆転写酵素のN-tailing活性と解析ツールTraceViewer2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群の転写因子IscRの解析2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 細菌由来のデアミナーゼ―デハロゲナーゼ融合タンパク質の機能解析2017

    • Author(s)
      佐藤 あや華、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 極貧栄養環境での生育能を獲得した好気性従属栄養細菌突然変異株の解析2017

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 加藤 広海, 大坪 嘉行, 津田 雅孝, 永田 裕二
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Strong N-tailing activity and specific enhancers of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase toward blunt DNA ends2017

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda
    • Organizer
      15th International Union of Microbiological Societies (IUMS2017)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces the oligotrophic growth with carbon dioxide fixation2017

    • Author(s)
      Shinnosuke Inaba, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • Organizer
      The 7th Congress of European Microbiologists (FEMS 2017)
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群の転写因子IscRの解析2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌における適応機構の解明2017

    • Author(s)
      田上諒、西山 依里、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害の緩和に対する非分解細菌の生細胞の重要性2017

    • Author(s)
      小川 なつみ、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応メカニズムの経時的解析2017

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45株のフェナントレンに対する転写応答2017

    • Author(s)
      小川 なつみ、石毛 太一郎、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、吉川 博文、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      慶応大学湘南キャンパス(神奈川県・藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 定量的TnSeq解析法の構築とPCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株の全必須遺伝子の同定2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤γ-hexachlorocyclohexane分解コミュニティのメタゲノム解析2017

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      慶応大学湘南キャンパス(神奈川県・藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 金属イオンコファクターの違いによる接合伝達の鍵酵素relaxaseのnick導入塩基配列特異性の変化2017

    • Author(s)
      岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      慶応大学湘南キャンパス(神奈川県・藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群に対する転写因子Fur及びIscRの作用機序2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      慶応大学湘南キャンパス(神奈川県・藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌における適応機構の解明2017

    • Author(s)
      田上諒、西山 依里、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] マウス白血病ウィルス由来逆転写酵素のN-tailing活性と解析ツールTraceViewer2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Complete genome analysis of diverse carbazole-degrading bacteria2017

    • Author(s)
      Vejarano Felipe, Suzuki-Minakuchi Chiho, Ohtsubo Yoshiyuki, Tsuda Masataka, Okada Kazunori & Nojiri Hideaki
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規接合伝達必須遺伝子の機能解析2017

    • Author(s)
      岸田 康平、Tim Lukas, 大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 金属イオンコファクターの違いによる接合伝達の鍵酵素relaxaseのnick導入塩基配列特異性の変化2017

    • Author(s)
      岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応メカニズムの経時的解析2017

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 定量的TnSeq解析法の構築とPCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株の全必須遺伝子の同定2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 利用する:汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割2017

    • Author(s)
      加藤広海,小川なつみ,大坪嘉行,永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 逆転写酵素の強いtailing活性と解析ソフトTraceViewer2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      慶応大学湘南キャンパス(神奈川県・藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 細菌由来のデアミナーゼ―デハロゲナーゼ融合タンパク質の機能解析2017

    • Author(s)
      佐藤 あや華、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティに関する研究2017

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構に関する研究2017

    • Author(s)
      稲葉 慎之介、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の基質耐性突然変異株の取得と解析2017

    • Author(s)
      池内 倫子、小川 なつみ、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤の分解細菌コミュニティにおける非分解菌の役割2017

    • Author(s)
      加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45株のフェナントレンに対する転写応答2017

    • Author(s)
      小川 なつみ、石毛 太一郎、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、吉川 博文、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Strong N-tailing activity and specific enhancers of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase toward blunt DNA ends2017

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Organizer
      15th International Union of Microbiological Societies
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系制御因子についての解析2017

    • Author(s)
      佐々木 春菜, 永田 裕二, 津田 雅孝, 大坪 嘉行
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 極貧栄養環境での生育能を獲得した好気性従属栄養細菌突然変異株の解析2017

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 加藤 広海, 大坪 嘉行, 津田 雅孝, 永田 裕二
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の基質耐性突然変異株の取得と解析2017

    • Author(s)
      池内 倫子、小川 なつみ、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      慶応大学湘南キャンパス(神奈川県・藤沢市)
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドの接合伝達に関わる全遺伝子の同定2017

    • Author(s)
      岸田 康平、ルーカス ティム、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティに関する研究2017

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 逆転写酵素の強いtailing活性と解析ソフトTraceViewer2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤γ-hexachlorocyclohexane分解コミュニティのメタゲノム解析2017

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応メカニズムの経時的解析2017

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター生合成系の転写制御機構の解析2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割2017

    • Author(s)
      加藤広海,小川なつみ,大坪嘉行,永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害に対する非分解細菌の役割:RNA-seq解析による検討2017

    • Author(s)
      小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系制御因子についての解析2017

    • Author(s)
      佐々木 春菜, 永田 裕二, 津田 雅孝, 大坪 嘉行
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Strong N-tailing activity and specific enhancers of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase toward blunt DNA ends2017

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda
    • Organizer
      15th International Union of Microbiological Societies (IUMS2017)
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] シンポ・微生物のサバイバルゲーム「利用する:汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割」2017

    • Author(s)
      加藤広海,小川なつみ,大坪嘉行,永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規接合伝達必須遺伝子の機能解析2017

    • Author(s)
      岸田 康平、Tim Lukas, 大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces the oligotrophic growth with carbon dioxide fixation2017

    • Author(s)
      Shinnosuke Inaba, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • Organizer
      The 7th Congress of European Microbiologists (FEMS 2017)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構に関する研究2017

    • Author(s)
      稲葉 慎之介、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群の転写因子IscRの解析2017

    • Author(s)
      野々山翔太、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター生合成系の転写制御機構の解析2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤の分解細菌コミュニティにおける非分解菌の役割2017

    • Author(s)
      加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群に対する転写因子Fur及びIscRの作用機序2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害に対する非分解細菌の役割:RNA-seq解析による検討2017

    • Author(s)
      小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害に対する非分解細菌の役割:RNA-seq解析による検討2017

    • Author(s)
      小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 微生物のサバイバルゲーム「利用する:汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割」2017

    • Author(s)
      加藤広海,小川なつみ,大坪嘉行,永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌微生物のノトバイオロジー2016

    • Author(s)
      加藤 広海、森 宙史、永山 浩史、大坪 嘉行、永田 裕二、黒川 顕、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会シンポジウム「微生物エコシステムを制御せよ!最先端テクノロジーがもたらす複合微生物系研究のパラダイムシフト」
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      広島県広島市広島県民文化センター
    • Year and Date
      2016-06-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第89回日本細菌学会ワークショップ「共創:微生物エコシステム構成原理」
    • Place of Presentation
      大阪交流センター(大阪府、大阪市)
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田 康平, 井上 慧, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • Author(s)
      野々山 翔太, 佐藤 拓哉, 岸田 康平, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • Author(s)
      阿部史歩 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] プラスミドpCAR1を保持した3宿主における転写開始点の網羅的決定と宿主間比較2016

    • Author(s)
      舘はる香, 水口千穂, 高橋裕里香, 大坪嘉行, 津田雅孝, 岡田憲典, 野尻秀昭
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 湯原 悟志, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 土壌環境におけるBurkholderia属細菌の生育段階と土壌高発現遺伝子の転写変動パターンの関係性2016

    • Author(s)
      田上 諒、西山 依里、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本微生物生態学会第31回大会
    • Place of Presentation
      横須賀市文化会館(神奈川県・横須賀市)
    • Year and Date
      2016-10-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌環境におけるBurkholderia属細菌の生育段階と土壌高発現遺伝子の転写変動パターンの関係性2016

    • Author(s)
      田上 諒、西山 依里、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本微生物生態学会第31回大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横須賀市横須賀市文化会館
    • Year and Date
      2016-10-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      広島県民文化センター(広島県・広島市)
    • Year and Date
      2016-06-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • Author(s)
      野々山 翔太, 佐藤 拓哉, 岸田 康平, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • Author(s)
      阿部史歩 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌微生物のノトバイオロジー2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • Author(s)
      小川なつみ 加藤広海 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第89回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田康平 井上慧 大坪嘉行 永田裕二 津田 雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田 康平, 井上 慧, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第89回日本細菌学会総会シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪交流センター(大阪府・大阪市)
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016

    • Author(s)
      小山 旺, 森内 良太, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉 湯原悟志 野々山翔太 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田康平 井上慧 大坪嘉行 永田裕二 津田 雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016

    • Author(s)
      野々山翔太 佐藤拓哉 岸田康平 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      広島県民文化センター(広島県・広島市)
    • Year and Date
      2016-06-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      佐藤 あや華, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田康平 井上慧 大坪嘉行 永田裕二 津田 雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介 平野丈 宇井博紀 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • Author(s)
      野々山 翔太, 佐藤 拓哉, 岸田 康平, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉 湯原悟志 野々山翔太 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      佐藤 あや華, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 湯原 悟志, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Construction of in vivo evolution system for haloalkane dehalgenases2016

    • Author(s)
      Y. Nagata, R. Moriuchi, A. Koyama, Y. Ohtsubo, L. Chrast, J. Damborsky, and M. Tsuda
    • Organizer
      2nd ASM Conference on Experimental Microbial Evolution
    • Place of Presentation
      Washington DC, USA
    • Year and Date
      2016-08-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介 平野丈 宇井博紀 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • Author(s)
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] リボソームRNAオペロンが染色体に存在しない細菌の発見2016

    • Author(s)
      按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究、三井久幸
    • Organizer
      日本RNA学会-第4回 RIBOSOME MEETING
    • Place of Presentation
      大阪医科大学、(大阪府・高槻市)
    • Year and Date
      2016-09-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • Author(s)
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Plant-associated Aureimonas with the sole rRNA operon on a tiny plasmid2016

    • Author(s)
      M Anda, Y Ohtsubo, Ti Okubo, M Sugawara, Y Nagata, M Tsuda,S Ikeda, S Eda, H Mitsui, K Minamisawa
    • Organizer
      16th International Symposium on Microbial Ecology
    • Place of Presentation
      Palais des Congres de Montreal, Montreal, Canada
    • Year and Date
      2016-08-21
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 湯原 悟志, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田 康平, 井上 慧, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • Author(s)
      阿部史歩、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介 平野丈 宇井博紀 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田康平、井上慧、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016

    • Author(s)
      小山 旺, 森内 良太, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Construction of in vivo evolution system for haloalkane dehalgenases2016

    • Author(s)
      Y. Nagata, R. Moriuchi, A. Koyama, Y. Ohtsubo, L. Chrast, J. Damborsky, and M. Tsuda
    • Organizer
      2nd ASM Conference on Experimental Microbial Evolution
    • Place of Presentation
      The Mayflower Hotel, Washington DC, USA
    • Year and Date
      2016-08-04
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第89回日本細菌学会ワークショップ「共創:微生物エコシステム構成原理」
    • Place of Presentation
      大阪交流センター(大阪府、大阪市)
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      広島県広島市広島県民文化センター
    • Year and Date
      2016-06-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016

    • Author(s)
      野々山翔太 佐藤拓哉 岸田康平 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • Author(s)
      阿部史歩 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • Author(s)
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 再構築された土壌微生物群集の超長期培養2016

    • Author(s)
      加藤広海、渡来直生、森宙史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      日本微生物生態学会第31回大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横須賀市横須賀市文化会館
    • Year and Date
      2016-10-22
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉 湯原悟志 野々山翔太 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Plant-associated Aureimonas with the sole rRNA operon on a tiny plasmid2016

    • Author(s)
      Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Seishi Ikeda, Shima Eda, Hisayuki Mitsui and Kiwamu Minamisawa
    • Organizer
      16th International Symposium on Microbial Ecology
    • Place of Presentation
      Montreal, Canada
    • Year and Date
      2016-08-21
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016

    • Author(s)
      野々山翔太 佐藤拓哉 岸田康平 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • Author(s)
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • Author(s)
      小川なつみ 加藤広海 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      佐藤 あや華, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] リボソームRNAオペロンが染色体に存在しない細菌の発見2016

    • Author(s)
      按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究、三井久幸
    • Organizer
      日本RNA学会-第4回 RIBOSOME MEETING
    • Place of Presentation
      大阪府高槻市大阪医科大学
    • Year and Date
      2016-09-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016

    • Author(s)
      小山 旺, 森内 良太, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] プラスミドpCAR1上の転写開始点の網羅的決定と宿主間比較2016

    • Author(s)
      舘 はる香, 水口 千穂, 高橋 裕里香, 大坪 嘉行, 津田 雅孝, 岡田 憲典, 野尻 秀昭
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都・目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 土壌微生物のノトバイオロジー2016

    • Author(s)
      加藤 広海、森 宙史、永山 浩史、大坪 嘉行、永田 裕二、黒川 顕、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • Author(s)
      小川なつみ 加藤広海 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 再構築された土壌微生物群集の超長期培養2016

    • Author(s)
      加藤広海、渡来直生、森宙史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      日本微生物生態学会第31回大会
    • Place of Presentation
      横須賀市文化会館(神奈川県・横須賀市)
    • Year and Date
      2016-10-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道・札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県・土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会シンポジウム「環境での遺伝子リスクの醸成:薬剤耐性と病原性の遺伝子伝播」
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • Author(s)
      按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会ワークショップ12「ゲノムとOMICSの比較から現れた遺伝と進化をめぐる驚き」
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県、仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学弥生キャンパス(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2015-06-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学弥生キャンパス(東京都、文京区)
    • Year and Date
      2015-06-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • Author(s)
      按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学弥生キャンパス(東京都、文京区)
    • Year and Date
      2015-06-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会シンポジウム「環境での遺伝子リスクの醸成:薬剤耐性と病原性の遺伝子伝播」
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県・土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • Author(s)
      按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究、三井久幸
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • Author(s)
      按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会ワークショップ12「ゲノムとOMICSの比較から現れた遺伝と進化をめぐる驚き」
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県、仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 環境細菌の PCB 分解能を司る遺伝因子の解析と各種ゲノム解析ソフトウエアの開発2014

    • Author(s)
      大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会 2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • Author(s)
      永田裕二,平野丈,宇井博紀,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014

    • Author(s)
      大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] FinishChecker : 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会 2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014

    • Author(s)
      佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014

    • Author(s)
      大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Finish したゲノム配列のチェックツール : FinishChecker2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014

    • Author(s)
      荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014

    • Author(s)
      佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • Author(s)
      永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 根粒超着生ダイズから分離されたMethylobacterium sp. AMS5のゲノム解析2014

    • Author(s)
      南智之, 按田瑞恵, 大久保卓, 三井久幸, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • Author(s)
      永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014

    • Author(s)
      大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014

    • Author(s)
      荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014

    • Author(s)
      佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • Author(s)
      永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014

    • Author(s)
      荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] GenomeMatcher 等ウェット研究者向けツール2013

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(長浜)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第29回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Finishing関連の3つのツール : GenoFinisher, AceFileViewer, ShortReadManager2013

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(長浜)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013

    • Author(s)
      Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, German
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第29回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013

    • Author(s)
      Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      2nd Th&#252;nen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, Germany
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フィニッシング支援ツールGenoFinisherとAceFileViewer2013

    • Author(s)
      大坪嘉行ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • Author(s)
      永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] FinishChecker: Finishing用ツールGenoFinisherのprefinish配列チェック機能2013

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • Author(s)
      永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Finishing関連の3つのツール: GenoFinisher、AceFileViewer、ShortReadManager2013

    • Author(s)
      大坪嘉行ら
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第29回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二,森内良太,田中裕興,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • Author(s)
      Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
    • Organizer
      2nd Th&#252;nen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, Germany
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013

    • Author(s)
      Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, Germany
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Finishing関連の3つのツール: GenoFinisher、AceFileViewer、 ShortReadManager2013

    • Author(s)
      大坪嘉行ら
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フィニッシング支援ツールGenoFinisherとAceFileViewer2013

    • Author(s)
      大坪嘉行ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Finishing関連の3つのツール: GenoFinisher、AceFileViewer、ShortReadManager2013

    • Author(s)
      大坪嘉行ら
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フィニッシング支援ツールGenoFinisherとAceFileViewer2013

    • Author(s)
      大坪嘉行ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • Author(s)
      Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, Germany
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • Author(s)
      Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, German
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フィニッシング支援ツール GenoFinisher とAceFileViewer2013

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      農芸化学会 2013年度大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] フィニッシング用のツール GenoFinisherの開発2012

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 奥野 周, 永田 裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      農芸化学会 2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 微生物ドラフトゲノム配列のフィニッシング用ツール:GenoFinisher2012

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      第85回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      長崎(招待講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • Author(s)
      永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Metagenomic Analysis of Microbial Community in Soil Contaminated with Aromatic Pollutants2012

    • Author(s)
      M. Tsuda, 5 人, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, A. Fujiyama, and K. Kurokawa
    • Organizer
      Japan-Finland Biotechnology Symposium2012
    • Place of Presentation
      Sendai
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] フィニッシング用のツールGenoFinisher の開発2012

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      第85回日本細菌学会
    • Place of Presentation
      長崎
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] 微生物ドラフトゲノム配列のフィニッシング用ツール2012

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      第85回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      長崎
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • Author(s)
      永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • Author(s)
      Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012) Daegu
    • Place of Presentation
      Korea(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 微生物ドラフトゲノムのフィニッシングツール GenoFinisher2012

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 奥野 周, 永田 裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第6回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] フィニッシング用のツールGenoFinisherの開発2012

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 微生物ドラフトゲノム配列のフィニッシング用ツール2012

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      第85回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      長崎
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を 支える ABC トランスポーター2012

    • Author(s)
      永田裕二 、遠藤諒、 大坪嘉行 、 津田雅孝
    • Organizer
      第7回トランスポーター研究会年会
    • Place of Presentation
      京都(招待講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支えるABCトランスポーター2012

    • Author(s)
      永田裕二、遠藤諒、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第7回トランスポーター研究会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フィニッシング用のツールGenoFinisherの開発2012

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • Author(s)
      Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • Place of Presentation
      Daegu, Korea(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フィニッシング用のツールGenoFinisherの開発2012

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium. "Indo-Swiss-Collaboration inBiotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011

    • Author(s)
      Y. Nagata ,S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguch, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Organizer
      University of Delhi
    • Place of Presentation
      Delhi, India(招待講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] ドラフトゲノム配列のFinishiing支援ツール:454Finisher2011

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] ドラフトゲノム配列のFinishing支援ツール:454Finisher2011

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] ドラフトゲノム配列のFinishing支援ツール:454Finisher2011

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] 微生物ゲノム完全長決定支援ソフトウエア454Finisher2011

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] Development of a computational tool for finishing of draft genomic sequence2011

    • Author(s)
      Y.Ohtsubo
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] Development of a computational tool for finishing of draft genomic sequence2011

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsbuo, et al
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183
  • [Presentation] Development of a computational tool for finishing of draft genomic sequence2011

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo, et al
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Development of a computational tool for finishing of draft genomic sequence2011

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo, et al
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • Place of Presentation
      Sapporo, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 微生物ゲノム完全長決定支援ソフトウエア454Finisher(仮)2011

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      仙台・東北学院大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane) in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis"Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011

    • Author(s)
      Y. Nagata, Y. Ohtsubo, and M.Tsuda
    • Organizer
      University of Delhi
    • Place of Presentation
      Delhi, India(基調講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 微生物ゲノム完全長決定支援ソフトウエア454Finisher(仮)2011

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      仙台・東北学院大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] 微生物ゲノムFinishing支援ソフトウエア:GenoFinisher2011

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      ゲノム微生物学会ワークショップ
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] ドラフトゲノム配列のFinishing支援ツール:454Finisher2011

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] 微生物遺伝子資源の活用技術2011

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      東北大学-産総研連携公開講演会
    • Place of Presentation
      東京・アキバホール
    • Year and Date
      2011-07-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 微生物ゲノム完全長決定支援ソフトウエア454Finisher(仮)2011

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      仙台・東北学院大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] 解析ソフトウエアGenomeMatcherのドラフトゲノムシーケンスのコンプリート支援機能2010

    • Author(s)
      大坪嘉行
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] 土壌汚染に対する微生物遺伝子プールの変動解析2010

    • Author(s)
      津田雅孝,加藤広海,大坪嘉行,永田裕二
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] 解析ソフトウエアGenome Matcherのドラフトゲノムシーケンスのコンプリート支援機能2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      仙台・東北大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] PCB/biphenyl degradation operon repressed by different compounds in Acidovorax sp.KKS102 and Burkholderia multivorans ATCC 176162010

    • Author(s)
      大坪嘉行, et al.
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] ゲノム解析に有用なGUIツール: GenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪, ら
    • Organizer
      第22回バイオエンジニアリング講演会
    • Place of Presentation
      岡山理科大学
    • Year and Date
      2010-01-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] PCB/biphenyl degradation operon repressed by different compounds in Acidovorax sp.KKS 102 and Burkholderia multivorans ATCC 176162010

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., et al.
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] Meta-plasmid: In silico reconstruction of a plasmid-like circular DNA molecule and its possible role in the retrieved environment2010

    • Author(s)
      H. Suenaga, 5 人, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and K. Miyazaki
    • Organizer
      13th International Society for Microbial Ecology Conference
    • Place of Presentation
      Seattle, USA
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] PCB/biphenyl degradation operon repressed by different compounds in Acidovorax sp.KKS102 and Burkholderia multivorans ATCC 176162010

    • Author(s)
      Y.Ohtsubo
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] GenomeMatcherの新機能ContigAligner :第二世代シーケンサーによって得られたコンティグを参照ゲノムに沿って表示する機能2010

    • Author(s)
      大坪, ら
    • Organizer
      第四回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] 解析ソフトウエアGenomeMatcherのドラフトゲノムシーケンスのコンプリート支援機能2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      仙台・東北大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Fluctuation of gene pools of soil microbiota induced by contamination with aromatic hydrocarbons2010

    • Author(s)
      H. Kato, 2 人, Y. Ohtsubo, 5 人, Y. Nagata, A. Fujiyama, K. Kurokawa and M. Tsuda
    • Organizer
      13th International Society for Microbial Ecology Conference
    • Place of Presentation
      Seattle, USA
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] GenomeMatcher:メタゲノム由来の大量リードの処理解析機能2010

    • Author(s)
      大坪, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(駒場)
    • Year and Date
      2010-03-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] GenomeMatcher :メタゲノム由来の大量リードの処理解析機能2010

    • Author(s)
      大坪, ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学(駒場)
    • Year and Date
      2010-03-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] GenomeMatcherの新機能ContigAhgner:第二世代シーケンサーによって得られたコンティグを参照ゲノムに沿って表示する機能2010

    • Author(s)
      大坪, ら
    • Organizer
      第四回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      九州大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010

    • Author(s)
      Y. Nagata, S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability ofHuman Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy. (口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] PCB/biphenyl degradation operon repressed by different compounds in Acidovorax sp.KKS102 and Burkholderia multivorans ATCC 176162010

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., et al
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] ゲノム解析に有用なGUIツール:GenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪, ら
    • Organizer
      第22回バイオエンジニアリング講演会
    • Place of Presentation
      岡山理科大学
    • Year and Date
      2010-01-09
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20580070
  • [Presentation] 解析ソフトウエアGenomeMatcherのドラフトゲノムシーケンスのコンプリート支援機能2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      仙台・東北大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 解析ソフトウエアGenomeMatcherのドラフトゲノムシーケンスのコンプリート支援機能2010

    • Author(s)
      大坪嘉行, ら