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Nagata Yuji  永田 裕二

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NAGATA Yuji  永田 裕二

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Researcher Number 30237531
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Affiliation (Current) 2022: 東北大学, 生命科学研究科, 教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help 2016 – 2022: 東北大学, 生命科学研究科, 教授
2015: 東北大学, 大学院生命科学研究科, 准教授
2011 – 2015: 東北大学, 生命科学研究科, 准教授
2007 – 2012: Tohoku University, 大学院・生命科学研究科, 准教授
2006: 東北大学, 大学院生命科学研究科, 助教授 … More
2001 – 2005: 東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助教授
2001: 東北大学, 大学院・生命科学研究所, 助教授
2001: 東北大学, 生命科学研究科, 助教授
2000: Tohoku University, Institute of Genetic Ecology, Associate Professor, 遺伝生態研究センター, 助教授
1997 – 1999: 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助手
1996: 東京大学, 大学院・農学生命化学研究科, 助手
1994 – 1995: 東京大学, 農学部, 助手 Less
Review Section/Research Field
Principal Investigator
Applied microbiology / 応用微生物学・応用生物化学 / Basic Section 38020:Applied microbiology-related / Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
Except Principal Investigator
Biological Sciences / 応用微生物学・応用生物化学 / Boundary agriculture / Applied microbiology / 基礎ゲノム科学 / Environmental agriculture(including landscape science) / Plant nutrition/Soil science / Transformative Research Areas, Section (IV)
Keywords
Principal Investigator
BHC / 環境汚染物質 / Sphingomonas / 環境細菌 / 炭酸固定 / dehalogenase / periplasm / 細菌 / 微生物 / 人為起源物質 … More / 細菌進化 / 微生物機能開発 / スフィンゴモナス / 可動性遺伝因子 / ゲノム / oligotroph / 細胞内局在性 / ペリプラズム / 脱塩化水素酵素 / デハロゲナーゼ / Environmental pollutant / Dehydrochlorinase / Dehalogenase / hexachlorocyclohexane / sphingomonads / 低栄養環境 / 細菌コミュニティ / バイオレメディエーション / Pseudomonas / biodegradation / γ-BHC / Biodegradation / 環境微生物学 / 酵素 / バイオテクノロジー / 環境 / 遺伝子 / 遺伝子伝播 / 自然生態系 / 微生物学 / 独立栄養細菌 / 極貧有機炭素源環境 / 進化 / スフィンゴモナッド / グリオキシル酸回路 / 次世代型シーケンサー / 次世代シーケンサー / Xenobiotics / Subcellular localization / Periplasm / Cellular localization / 環境遺伝子資源 / 難培養性細菌 / ナフタレン / ハロアルカン / 芳香族化合物酸化酵素 / ハロアルカンデハロゲナーゼ / 機能相補 / 土壌ライブラリー / 環境汚染物質川 / Environmantal DNA / Uncultured bacteria / Naphthalene / Haloalkane / 水平伝播 / 接合伝達性プラスミド / 有機塩素系農薬 / 環境適応 / 水平伝達 / environmental pollutant / genome / horizontal gene transfer / transconjugative plasmid / chlorinated pesticide / adaptation / 複合生物系 / 複合微生物系 / 極貧栄養環境 / environmental pollutants / evolution / mobile genetic elements / membrane vesicle / insertion sequence … More
Except Principal Investigator
ゲノム構造 / セパシア菌 / 複数本染色体 / メタゲノム / 遺伝子クローニング / 可動遺伝因子 / プラスミド / 細菌 / 染色体理知図 / トランスポゾン挿入変異 / 鉄レギュロン / 環境細菌 / 遺伝子水平伝播 / 環境汚染 / 分解酵素遺伝子 / Candida maltosa / PCB / Pseudomonas / Sphingomonas / 染色体物理地図 / トランスポゾン挿入突然変異 / 挿入配列 / 可動移動式因子 / スフィンゴモナス属細菌 / スフィンゴ糖脂質 / ダイオキシン / 体腔 / 環境浄化・再生 / 環境ホルモン / ゲノムshotgunシーケンス / 染色体分配 / 環境ストレス / 根粒菌 / 共生 / ゲノム / マメ科植物 / ライブラリー / 環境保全 / データベース / ゲノムショットガンシーケンス / 染色体複製・分配 / カタボライト抑制 / 炭素源資化能 / 環境浄化 / 可動性遺伝因子 / ゲノミックアイランド / 遺伝子資源 / グノミックアイランド / 遺伝子治療 / 水平伝播 / ゲノム進化 / 環境 / 環境修復 / 接合伝達 / 環境汚染物質分解 / 細菌集団 / チトクロームP-450 / n-アルカン / ジカルボン酸 / 遺伝子破壊 / アシル-CoAオキシダーゼ / 小胞体 / パーオキシソーム / チトクローム P-450 / 遺伝子工学 / 酵母 / チトクロームP450 / アシルCoA オキシダーゼ / Candida tropicalis / Cytochrome P-450 / n-Alkane / Dicarboxylic Acid / Gene Disruption / Acyl-CoA Oxidase / Endoplasmic Reticulum / Peroxisome / 組換え微生物 / 制御因子 / バイオリアクター / GEMs / Regulatory factor / Bioreactor / 環境汚染物質 / 有機塩素系化合物 / 微生物分解 / ハロアルカンデトロゲナーゼ / コンピューターモデリング / 加水分解酵素 / ハロアルカンデハロゲナーゼ / dehalogenase / hydrolase / haloalkane / 基質特異性 / ホモロジーモデリング / 部位指定変異導入 / catalytic triad / Environmental pollutant / Chlroinated compound / Biodegradation / Haloalkane dehalogenase / Computer modelling / Hydrolase / 汚染土壌浄化 / 有害化合物 / 遺伝子 / 微生物間相互作用 / 土壌汚染防止・浄化 / 有害化学物質 / 微生物相互作用 / 土壌微生物 / ネットワーク / 非線形時系列解析 / 培養実験 Less
  • Research Projects

    (34 results)
  • Research Products

    (624 results)
  • Co-Researchers

    (48 People)
  •  Advanced utilization strategies of beneficial bacteria based on the survival and growth mechanisms of bacteria under poor conditionsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2022 – 2024
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 38020:Applied microbiology-related
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Approach to the substance of bacterial extracellular genetic information storage devicePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2022 – 2023
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
    • Review Section
      Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  土壌微生物機能発揮の鍵となる群集・メタゲノム構造の特定

    • Principal Investigator
      近藤 倫生
    • Project Period (FY)
      2021 – 2025
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
    • Review Section
      Transformative Research Areas, Section (IV)
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Development of practical use of useful bacteria by understanding their behavior in the environmentPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2019 – 2021
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Review Section
      Basic Section 38020:Applied microbiology-related
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Soil-derived bacterial consortium capable of degrading chemical pollutant: interaction between pollutant-degrader and co-residing non-degraders

    • Principal Investigator
      Tsuda Masataka
    • Project Period (FY)
      2017 – 2019
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Plant nutrition/Soil science
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Behavior of environmental bacteria in microbial community and oligotrophic growth statePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Nagata Yuji
    • Project Period (FY)
      2016 – 2017
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Studies on metabolic pathway involved in oligotrophic growth of heterotrophic bacteriaPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Nagata Yuji
    • Project Period (FY)
      2014 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Mechanisms for acquiring ability to degrade novel compounds in sphingomonads and their applicationsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      Nagata Yuji
    • Project Period (FY)
      2013 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Behavior of microbial community in the environment polluted by aromatic compound

    • Principal Investigator
      Tsuda Masataka
    • Project Period (FY)
      2013 – 2015
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Environmental agriculture(including landscape science)
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Studies on oligotrophic mutants of an aerobic heterotrophic bacteriumPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2012 – 2013
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Bacterial genetic determinants that control horizontal transfer of genes for degradation of environmental pollutants

    • Principal Investigator
      TSUDA Masataka
    • Project Period (FY)
      2011 – 2012
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Boundary agriculture
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Studies on molecular mechanisms for functional evolution of bacteria in the environmentPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2010 – 2012
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Response of soil microbial community to exposure of environmental pollutants

    • Principal Investigator
      TSUDA Masataka
    • Project Period (FY)
      2010 – 2012
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Boundary agriculture
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Genomic organization and genomic dynamism of versatile sphingomonadsPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2010 – 2011
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  培養非依存的手法を用いた自然生態系からの新規プラスミドの取得とその多様性の解明

    • Principal Investigator
      津田 雅孝
    • Project Period (FY)
      2008 – 2009
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
    • Research Field
      基礎ゲノム科学
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  挿入配列の土壌環境での動態の解明と新規遺伝子獲得への応用Principal Investigator

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      2007 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Comprehensive development of bacterial ability for the degradation ofchlorinated environmental pollutants using unexplored genetic sourcesPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2006 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Horizontal transfer of bacterial genes for degradation of environmental pollutants

    • Principal Investigator
      TSUDA Masataka
    • Project Period (FY)
      2006 – 2008
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      Boundary agriculture
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  セパシア菌ゲノムの構造と多様化・進化に関する研究

    • Principal Investigator
      津田 雅孝
    • Project Period (FY)
      2004
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Study of genome of pesticide-degrading bacteria as a representative of environmental bacteriumPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2004 – 2005
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  セパシア菌のゲノム構造とその再編成・多様化・進化に関する研究

    • Principal Investigator
      津田 雅孝
    • Project Period (FY)
      2003
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  全ゲノム塩基配列情報に基づく根粒菌の共生機構の解明

    • Principal Investigator
      南澤 究
    • Project Period (FY)
      2003
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      Applied microbiology
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  セパシア菌ゲノムを構成する3種染色体の構造とその可塑性に関する研究

    • Principal Investigator
      津田 雅孝
    • Project Period (FY)
      2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  セパシア菌のゲノム構造とその可塑性に関する研究

    • Principal Investigator
      津田 雅孝
    • Project Period (FY)
      2001
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  スフィンゴモナス属細菌を用いる環境浄化システム構築基盤

    • Principal Investigator
      村田 幸作
    • Project Period (FY)
      2001
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      Kyoto University
  •  Isolation and characterization of a novel gene for degradation of environmental pollutants from environmental genetic sourcePrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      2001 – 2002
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  セパシア菌ゲノムの分子遺伝学的研究

    • Principal Investigator
      TSUDA Masataka
    • Project Period (FY)
      2000
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
    • Review Section
      Biological Sciences
    • Research Institution
      Tohoku University
  •  Study on a novel dehydrochlorinase from BHC-degrading bacteriumPrincipal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      1999 – 2000
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      Tohoku University
      The University of Tokyo
  •  Mechanism-Based Biodegradability Prediction of Dehalogenase

    • Principal Investigator
      OHTA Akinori, 高木 正道
    • Project Period (FY)
      1998 – 1999
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B).
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Construction of effective PCB-degradation bioreactor by modification of regulatory system of PCB-degrading bacterium using genetic engineering.

    • Principal Investigator
      TAKAGI Masamichi
    • Project Period (FY)
      1997 – 1998
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Studies on location of xenobiotics degradation in the cell of BHC-degrading bacterium.Principal Investigator

    • Principal Investigator
      NAGATA Yuji
    • Project Period (FY)
      1997 – 1998
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  殺虫剤BHC分解に関与する脱塩素酵素群のグラム陰性細菌細胞内局在性に関する研究Principal Investigator

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      1996
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  殺虫剤BHC分解に関与するPseudomonas属細菌の新規脱塩素酵素系の解析Principal Investigator

    • Principal Investigator
      永田 裕二
    • Project Period (FY)
      1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      The University of Tokyo
  •  Genetic Engineering of Long Chain Dicarboxylic Acid Production in Yeast

    • Principal Investigator
      OHTA Akinori
    • Project Period (FY)
      1994 – 1995
    • Research Category
      Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B)
    • Research Field
      応用微生物学・応用生物化学
    • Research Institution
      The University of Tokyo

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All Journal Article Presentation Book

  • [Book] DNA Traffic in the Environment2019

    • Author(s)
      Nagata Yuji、Kato Hiromi、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • Total Pages
      278
    • Publisher
      Springer
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2016

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Publisher
      ASM Press, Washington, DC
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2015

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Publisher
      ASM Press, Washington, DC
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2015

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Publisher
      ASM Press, Washington, DC
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Book] Appearance and evolution ofγ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. (In : Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds)) Biodegradative Bacteria.2014

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo( doi:10.1007/978-4-431-54520-0_2)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. (In : Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds) )Biodegradative Bacteria.2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y, Tsuda M
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo(doi:10.1007/978-4-431-54520-0_14)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Book] Appearance and evolution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. In Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
    • Total Pages
      358
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
    • Total Pages
      358
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
    • Total Pages
      358
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Book] Appearance and evolution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. In Biodegradative Bacteria2014

    • Author(s)
      Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
    • Total Pages
      358
    • Publisher
      Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Book] 酵素利用技術大系2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Publisher
      株)エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Book] 酵素利用技術体系(脱ハロゲン酵素)2010

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Book] 脱ハロゲン酵素, 酵素利用技術体系2010

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Book] 環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス「難培養性微生物研究の最新技術II」2010

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Book] 難培養微生物研究の最新技術II2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Book] 「酵素利用技術体系」(部分執筆pp939-948:「脱ハロゲン酵素」)2010

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Book] 「難培養性微生物研究の最新技術II」(部分執筆pp211-219:「環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス」)2010

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Book] 難培養性微生物研究の最新技術II(環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス)2010

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Book] 環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス「難培養性微生物研究の最新技術II」(大熊盛也,工藤俊章編集)2010

    • Author(s)
      永田裕二,津田雅孝
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Book] 難培養性細菌も研究対象とするメタゲノム解「バイオフィルムの基礎と制御 : 特性・解析事例から形成防止・有効利用まで」2008

    • Author(s)
      永田裕二, 津田雅孝
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス社
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Book] バイオフィルムの基礎と制御(部分執筆)2008

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Total Pages
      399
    • Publisher
      株式会仕エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Book] 難培養性細菌も研究対象とするメタゲノム解析「バイオフィルムの基礎と制御」2008

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Publisher
      103-111株式会社エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Book] バイオフィルムの基礎と制御:特性・解析事例から形成防止・有効利用まで2008

    • Author(s)
      永田裕二
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Book] バイオフィルムの基礎と制御(部分執筆)2008

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Total Pages
      399
    • Publisher
      株式会社エヌ・ティー・エス
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Book] 土壌環境細菌の比較ゲノム「比較ゲノム学から読み解く生命システム-基本概念から最新ゲノム情報まで-」(藤山秋佐夫監修)2007

    • Author(s)
      津田雅孝, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Publisher
      秀潤社
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Book] 「比較ゲノム学から読み解く生命システム-基本概念から最新ゲノム情報まで(細胞工学別冊)」2007

    • Author(s)
      津田雅孝、永田裕二、大坪嘉行
    • Publisher
      土壌環境細菌の比較ゲノム
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems In:Nojiri, H., M. Tsuda, M. Fukuda, and Y. Kamagata (eds)

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, E. Nishiyama, Y. Ishibashi, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Publisher
      Biodegradative Bacteria. Springer Verlag, Tokyo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Microbial communities developing within bulk sediments under fish carcasses on a tidal flat2021

    • Author(s)
      Kawamoto Y, Kato H, Nagata Y, and Urabe J
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 16

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0247220

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces carbon dioxide-dependent high-yield growth under oligotrophic conditions2020

    • Author(s)
      Shinnosuke Inaba, Hironori Sakai, Hiromi Kato, Takayuki Horiuchi, Hirokazu Yano, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, and Yuji Nagata
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 166

    • DOI

      10.1099/mic.0.000908

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Structural and catalytic effects of surface loop-helix transplantation within haloalkane dehalogenase family2020

    • Author(s)
      Marek M, Chaloupkova R, Prudnikova T, Sato Y, Rezacova P, Nagata Y, Smatanova IK, Damborsky J
    • Journal Title

      Computational and Structural Biotechnology Journal

      Volume: 18 Pages: 1352-1362

    • DOI

      10.1016/j.csbj.2020.05.019

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Transcriptome analysis of zygotic induction during conjugative transfer of plasmid RP42020

    • Author(s)
      Miyakoshi Masatoshi、Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 11 Pages: 1125-1125

    • DOI

      10.3389/fmicb.2020.01125

    • NAID

      120007165442

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H03464, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] A transcriptional regulator, IscR, of Burkholderia multivorans acts as both repressor and activator for transcription of iron-sulfur cluster-biosynthetic isc operon2020

    • Author(s)
      Nonoyama S, Kishida K, Sakai K, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M
    • Journal Title

      Research in Microbiology

      Volume: 171 Pages: 319-330

    • DOI

      10.1016/j.resmic.2020.06.005

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Special Issue: Microbial degradation of xenobiotics2020

    • Author(s)
      Nagata Y
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 8 Pages: 487-487

    • DOI

      10.3390/microorganisms8040487

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] 従属栄養細菌のCO2依存的な極貧栄養環境適応2020

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      イオサイエンスとインダストリー

      Volume: 78 Pages: 498-500

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Lessons from the genomes of lindane-degrading sphingomonads2019

    • Author(s)
      Nagata Yuji、Kato Hiromi、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Environ Microbiol Rep

      Volume: 11 Pages: 630-644

    • DOI

      10.1111/1758-2229.12762

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Conjugative transfer of IncP-9 catabolic plasmids requires a previously uncharacterized gene, mpfK, whose homologs are conserved in various MPFT-type plasmids2019

    • Author(s)
      Kishida Kouhei、Nonoyama Shouta、Lukas Tim、Kawahara Shotaro、Kudo Koji、Nagata Yuji、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Appl Environ Microbiol

      Volume: 85

    • DOI

      10.1128/aem.01850-19

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Properties and efficient scrap-and-build repairing of mechanically sheared 3' DNA ends2019

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Sakai Keiichiro、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 2 Pages: 409-409

    • DOI

      10.1038/s42003-019-0660-7

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] Suppression of substrate inhibition in phenanthrene-degrading Mycobacterium by co-cultivation with a non-degrading Burkholderia strain2019

    • Author(s)
      Natsumi Ogawa, Hiromi Kato, Kouhei Kishida, Eikichi Ichihashi, Taichiro Ishige, Hirofumi Yoshikawa, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 印刷中 Pages: 625-637

    • DOI

      10.1099/mic.0.000801

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K18665, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Journal Article] 汚染物質分解コンソーシアムにおけるキープレイヤーとオーディエンス2018

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、津田雅孝、永田祐二
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology

      Volume: 18 Pages: 15-20

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Establishment of plasmid vector and allelic exchange mutagenesis systems in a mycobacterial strain that is able to degrade polycyclic aromatic hydrocarbon2018

    • Author(s)
      Kishida K, Ogawa N, Ichihashi E, Kato H, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 82 Pages: 1169-1171

    • DOI

      10.1080/09168451.2018.1445522

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K18665, KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Optimization of single strand DNA incorporation reaction by Moloney murine leukaemia virus reverse transcriptase2018

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Sasaki Haruna、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 25 Pages: 477-487

    • DOI

      10.1093/dnares/dsy018

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Journal Article] Conjugative transfer system of IncP-9 naphthalene-catabolic plasmid NAH7: characterization of its oriT region and relaxase and host range of conjugative system2017

    • Author(s)
      Kishida K, Inoue K, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol.

      Volume: 83

    • DOI

      10.1128/aem.02359-16

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Efficient N-tailing of blunt DNA ends by Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase2017

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 41769-41769

    • DOI

      10.1038/srep41769

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Compounds that enhance the tailing activity of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase2017

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 6520-6520

    • DOI

      10.1038/s41598-017-04765-8

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] The small protein HemP is a transcriptional activator for the hemin uptake operon in Burkholderia multivorans ATCC 176162017

    • Author(s)
      Sato T, Nonoyama S, Kimura A, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M.
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol.

      Volume: 83

    • DOI

      10.1128/aem.00479-17

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122, a Nitrogen-Fixing Soybean Symbiont.2017

    • Author(s)
      Masayuki Sugawara, Takahiro Tsukui, Takakazu Kaneko, Yoshiyuki Ohtsubo, Shusei Sato, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa.
    • Journal Title

      Genome A.

      Volume: 5(9)

    • DOI

      10.1128/genomea.01743-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Bacterium, Sphingobium sp. Strain MI1205.2016

    • Author(s)
      Tabata M, Ohhata S, Nikawadori Y, Sato T, Kishida K, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00246-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Methylobacterium sp. Strain AMS5, an Isolate from a Soybean Stem2016

    • Author(s)
      Tomoyuki Minami, Yoshiyuki Ohtsubo, Mizue Anda, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 4(2)

    • DOI

      10.1128/genomea.00144-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a γ-Hexachlorocyclohexane Degrader, Sphingobium sp. Strain TKS, Isolated from a γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Microbial Community2016

    • Author(s)
      Tabata M, Ohhata S, Kawasumi T, Nikawadori Y, Kishida K, Sato T, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 4

    • DOI

      10.1128/genomea.00247-16

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Comparison of the complete genome sequences of four gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains: insights into the evolution of bacteria able to degrade a recalcitrant man-made pesticide2016

    • Author(s)
      Tabata M, Ohhata S, Nikawadori Y, Kishida K, Sato T, Kawasumi T, Kato H, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y.
    • Journal Title

      DNA Research

      Volume: 6 Pages: 581-599

    • DOI

      10.1093/dnares/dsw041

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877, KAKENHI-PROJECT-16K18665
  • [Journal Article] Biodegradation of gamma-hexachlorocyclohexane by transgenic hairy root cultures of Cucurbita moschata that accumulate recombinant bacterial LinA2016

    • Author(s)
      Nanasato, Y., Namiki, S., Ohsima, M., Moriuchi R., Konagaya, K., Seike, N., Otani, T., Nagata, Y., Tsuda, M., Tabei, Y.
    • Journal Title

      Plant Cell Reports

      Volume: 35 Pages: 1963-1974

    • DOI

      10.1007/s00299-016-2011-1

    • Peer Reviewed / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Polyvinyl Alcohol-Degrading Strain Sphingopyxis sp. 113P3 (NBRC 111507).2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y. Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01169-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Properties and biotechnological applications of natural and engineered haloalkane dehalogenases2015

    • Author(s)
      Nagata Y, Ohtsubo, Y, Tsuda M
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 99 Pages: 9865-9581

    • DOI

      10.1007/s00253-015-6954-x

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a Phenanthrene Degrader, Mycobacterium sp. Strain EPa45 (NBRC 110737), Isolated from a Phenanthrene-Degrading Consortium2015

    • Author(s)
      Kato H, Ogawa N, Ohtsubo Y, Oshima K, Toyoda A, Mori H, Nagata Y, Kurokawa K, Hattori M, Fujiyama A, Tsuda M
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.00782-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Ohtsubo Y, Nagata Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01399-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Sphingopyxis macrogoltabida Type Strain NBRC 15033, Originally Isolated as a Polyethylene Glycol Degrader2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01401-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader, Burkholderia sp. HB-1 (NBRC 110738)2015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Moriya A, Kato H, Ogawa N, Nagata Y, Tsuda M
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01283-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of a Polypropylene Glycol-Degrading Strain, Microbacterium sp. No. 72015

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
    • Journal Title

      Genome Announc

      Volume: 3

    • DOI

      10.1128/genomea.01400-15

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome.2015

    • Author(s)
      Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, and Hisayuki Mitsui
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci U S A

      Volume: 112(46) Pages: 14343-14347

    • DOI

      10.1073/pnas.1514326112

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Isolation of oxygenase genes for indigo-forming activity from an artificially polluted soil metagenome by functional screening using Pseudomonas putida strains as hosts2015

    • Author(s)
      Hifofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Akira Ono, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, and Masataka Tsuda
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: in press

    • DOI

      10.1007/s00253-014-6322-2

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Time series metagenomic analysis reveals robustness of soil microbiome against chemical disturbance2015

    • Author(s)
      Kato H, Mori H, Maruyama F, Toyoda A, Oshima K, Endo R, Fuchu G, Miyakoshi M, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Hattori M, Fujiyama A, Kurokawa K, Tsuda M
    • Journal Title

      DNA Res

      Volume: 22 Pages: 413-424

    • DOI

      10.1093/dnares/dsv023

    • NAID

      120005850199

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genetic determinants for fitness in soil by using signature-tagged mutagenesis2014

    • Author(s)
      Nagata, Y., J. Senbongi, Y. Ishibashi, R. Sudo, M. Miyakoshi, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: in press Pages: 883-891

    • DOI

      10.1099/mic.0.077057-0

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genetic determinants for fitness in soil by using signature-tagged mutagenesis2014

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Junko Senbongi, Yoko Ishibashi, Rie Sudo, Masatoshi Miyakoshi, Yoshiyuki, Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 160 Pages: 883-891

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of the Thermophilic Polychlorinated Biphenyl Degrader Geobacillus sp. Strain JF8 (NBRC 109937)2014

    • Author(s)
      Shintani, M., Y. Ohtsubo, K. Fukuda, A. Hosoyama, S. Ohji, A. Yamazoe, N. Fujita, Y. Nagata, M. Tsuda, T. Hatta, and K. Kimbara
    • Journal Title

      Genome announcements

      Volume: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.01213-13

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Pseudomonas aeruginosa MTB-1, Isolated from a Microbial Community Enriched by the Technical Formulation of Hexachlorocyclohexane2014

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., T. Sato, K. Kishida, M. Tabata, Y. Ogura, T. Hayashi, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Genome Announc.

      Volume: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.01130-13

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [Journal Article] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes.2014

    • Author(s)
      Mori H, Maruyama F, Kato H, Toyoda A, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Fujiyama A, Tsuda M Kurokawa K
    • Journal Title

      DNA Res.

      Volume: 21 Pages: 217-227

    • DOI

      10.1093/dnares/dst052

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-24770015, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [Journal Article] Structural and Functional Analysis of Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites2014

    • Author(s)
      Chaloupkova R, Prudnikova T, Rezacova P, Prokop Z, Koudelakova T, Daniel L, Brezovsky J, Ikeda-Ohtsubo W, Sato Y, Kuty M, Nagata Y, Smatanova IK, Damborsky J
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section D

      Volume: D70 Pages: 1884-1897

    • DOI

      10.1107/s1399004714009018

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Stepwise enhancement of catalytic performance of haloalkane dehalogenase LinB towards gamma-hexachlorocyclohexane2014

    • Author(s)
      Ryota Moriuchi, Hiroki Tanaka, Yuki Nikawadori, Mayuko Ishitsuka, Michihiro Ito, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Jiri Damborsky, Zbynek Prokop, and Yuji Nagata
    • Journal Title

      AMB Express

      Volume: 4 Pages: 72-72

    • DOI

      10.1186/s13568-014-0072-5

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Pseudomonas sp. strain TKP isolated from a γ-hexachlorocyclohexane-degrading mixed culture2014

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Kishida K, Sato T, Tabata M, Kawasumi T, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y
    • Journal Title

      Genome Announc.

      Volume: 2

    • DOI

      10.1128/genomea.01241-13

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-221S0002
  • [Journal Article] γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria2014

    • Author(s)
      Yuji Nagata
    • Journal Title

      Biodegradative Bacteria: How Bacteria Degrade, Survive, Adapt, and Evolve

      Volume: Chapter 2 Pages: 19-41

    • DOI

      10.1007/978-4-431-54520-0_2

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] Cointegrate-resolution of toluene-catabolic transposon Tn4651: determination of crossover site and the segment required for full resolution activity2013

    • Author(s)
      Yano, H., H. Genka, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, E.M. Top, M. Tsuda
    • Journal Title

      Plasmid.

      Volume: 69 Pages: 24-35

    • DOI

      10.1016/j.plasmid.2012.07.004

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] The effect of a unique halide-stabilizing residue on the catalytic properties of haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefacience C582013

    • Author(s)
      Hassan, K. A. Gora, J. Brezvsky, R. Chaloupkova, H. Moskalikova, A. Fortova, Y. Nagata, J. Damborsky, Z. Prokop
    • Journal Title

      FEBS J.

      Volume: 280 Pages: 3149-3159

    • DOI

      10.1111/febs.12238

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2,4,6-Trichlorophenol Degrader2013

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T
    • Journal Title

      Genome announcements

      Volume: 1

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the・ -hexachlorocyclohexane-degrading bactrium Sphingomonas sp. stain MM-12013

    • Author(s)
      Tabata M, Ohtsubo Y, Ohhata S, Tsuda M, Nagata Y.
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.00247-13

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] Cointegrate-resolutionof toluene-catabolic transposon Tn46512013

    • Author(s)
      H. Yano, H. Genka, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, E. M. Top, and M. Tsuda
    • Journal Title

      determination of crossover site and the segment required for full resolution activity

      Volume: 69 Pages: 24-35

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Journal Article] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2, 4, 6-Trichlorophenol Degrader2013

    • Author(s)
      Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T.
    • Journal Title

      Genome announcements

      Volume: 1

    • DOI

      10.1128/genomea.00903-13

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013

    • Author(s)
      永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology

      Volume: 13 Pages: 51-56

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] Inhibitory effect of Pseudomonas putida nitrogen-related phosphotransferase system on conjugative transfer of IncP-9 plasmid from Escherichia col2013

    • Author(s)
      Inoue K, Miyazaki R, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M
    • Journal Title

      FEMS Microbiology Letters

      Volume: 345 Pages: 102-109

    • DOI

      10.1111/1574-6968.12188

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25892034
  • [Journal Article] Crystal structure and site-directed mutagenesis analysis of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingobium sp. MI12052013

    • Author(s)
      Masahiko Okai, Jun Ohtsuka, Fabiana L. Imai, Tomoko Mase, Ryota Moriuchi, Masataka Tsuda, Koji Nagata, Yuji Nagata, Masaru Tanokura
    • Journal Title

      J. Bacteriol.

      Volume: 195 Pages: 2642-2651

    • DOI

      10.1128/jb.02020-12

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23228003, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013

    • Author(s)
      永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      Journal of Environmental Biotechnology

      Volume: 13(1) Pages: 51-56

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS102 located on integrative and conjugative element2012

    • Author(s)
      Ohtsubo Y., Y. Ishibashi, H. Naganawa, S. Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, M. Tsuda
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 194 Pages: 4237-4248

    • DOI

      10.1128/jb.00352-12

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS102 located on integrative and conjugative element2012

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, 4人, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriol

      Volume: 184 Pages: 4237-4248

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Povotal role of anthranilate dioxygenase genes in the adaptation of Burkholderia multivorans ATCC 17616 in soil2012

    • Author(s)
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Yamamoto, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      FEMS Microbiol Lett.

      Volume: 330 Pages: 46-55

    • DOI

      10.1111/j.1574-6968.2012.02532.x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] ParI, an orphan ParA family protein from Pseudomonas putida KT2440-specific genomic island, interferes with the partition system of IncP-7 plasmids2012

    • Author(s)
      Miyakoshi, M., M. Shintani, K. Inoue, T. Terabayashi, F. Sai, M. Ohkuma, H. Nojiri, Y. Nagata, M. Tsuda
    • Journal Title

      Environ Microbiol.

      Volume: 14 Pages: 2946-295

    • DOI

      10.1111/j.1462-2920.2012.02861.x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] ParI, an orphan ParA family protein from Pseudomonas putida KT2440-specific genomic island,interferes with the partition system of IncP-7 plasmids2012

    • Author(s)
      M. Miyakoshi, M. Shintani, K. Inoue, T. Terabayashi, F. Sai, M. Ohkuma, H. Nojiri, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Environ. Microbiol

      Volume: 14 Pages: 2946-2959

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Acidovorax sp. KKS102, a polychlorinated biphenyl-degrading strain2012

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, F. Maruyama, H. Mitsui, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriol

      Volume: 194 Pages: 6970-6971

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Journal Article] γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase gene with its flanking regions from soil by activity-based screening techniques2012

    • Author(s)
      Ito, M., A. Ono, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      European Journal of Soil Biology

      Volume: 52 Pages: 16-19

    • DOI

      10.1016/j.ejsobi.2012.05.001

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012

    • Author(s)
      Kimura, S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 158 Pages: 1284-1293

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS102 located on integrative and conjugative element2012

    • Author(s)
      Y. Ohtsubo, Y. Ishibashi, H. Naganawa, S.Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J, Bacteriol

      Volume: 184 Pages: 4237-4248

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C582012

    • Author(s)
      Mase, T., H. Yabuki, M. Okai, J. Ohtsuka, F. L. Imai, Y. Nagata, and M. Tanokura
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section F

      Volume: F68 Pages: 652-654

    • DOI

      10.1107/s1744309112013942

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Complete genome sequence of Acidovorax sp. strain KKS102, a polychlorinated-biphenyl degrader.2012

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., F. Maruyama, H. Mitsui, Y. Nagata, M. Tsuda
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 194 Pages: 6970-6971

    • DOI

      10.1128/jb.01848-12

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012

    • Author(s)
      Kimura, A., S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology

      Volume: 158 Pages: 1284-1293

    • DOI

      10.1099/mic.0.057372-0

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Journal Article] Development of a crystallization protocol for the DbeA1 variant of novel haloalkane dehalogenase from Bradyrhizobium elkkani USDA942011

    • Author(s)
      Prudnikova, T., R. Chalouplova, Y. Sato, Y. Nagata, O. Degtjarik, M. Kuty, P. Rezacova, J. Damborsky, and I. Kuta Smatanova
    • Journal Title

      Crysta Growth & Design

      Volume: 11 Pages: 516-519

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Molecular Bases of Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenase DbjA2011

    • Author(s)
      佐藤優花里、夏目亮、Zbynek Prokop, Jan Brezovsky, Radka Chaloupkova, Jiri Damborsky、 永田裕二、千田俊哉
    • Journal Title

      Journal of the Crystallographic Society of Japan

      Volume: 53 Issue: 2 Pages: 124-129

    • DOI

      10.5940/jcrsj.53.124

    • NAID

      10028253974

    • ISSN
      0369-4585, 1884-5576
    • Language
      Japanese
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Stereoselectivity and conformational stability of haloalkane dehalogenase DbjA from Bardyrhizobium japonicum USDA110 : the effect of pH and temperature2011

    • Author(s)
      Chaloupkova, R., Z. Prokop, Y. Sato, Y. Nagata, and J. Damborsky
    • Journal Title

      FEBS J.

      Volume: 278 Pages: 2728-2738

    • DOI

      10.1111/j.1742-4658.2011.08203.x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] The <I>lin</I> Genes for &gamma;-Hexachlorocyclohexane Degradation in <I>Sphingomonas</I> sp. MM-1 Proved to Be Dispersed across Multiple Plasmids2011

    • Author(s)
      Tabata, M., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 75 (3) Issue: 3 Pages: 466-472

    • DOI

      10.1271/bbb.100652

    • NAID

      10028201533

    • ISSN
      0916-8451, 1347-6947
    • Language
      English
    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Biochemical characteristics of the novel haloalkane dehalogenase DatA isolated from the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens C582011

    • Author(s)
      Hasan, K., A. Fortova, T. Koudelakova, R. Chalooupkova, M. Ishitsuka, Y. Nagata, J. Damborsky, and Z. Prokop
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbial

      Volume: 77 (5) Pages: 1881-1884

    • DOI

      10.1128/aem.02109-10

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] ハロアルカン脱ハロゲン酵素DbjAの鏡像異性体選択性機構の解明2011

    • Author(s)
      佐藤優花里、夏目亮、Zbynek Prokop, Jan Brezovsky, Radka Chaloupkova, Jiri Damborsky、永田裕二、千田俊哉
    • Journal Title

      日本結晶学会誌

      Volume: 53 Pages: 124-129

    • NAID

      10028253974

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • DOI

      10.1016/j.enzmictec.2011.10.005

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Y. Nagata
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 49 Pages: 499-509

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Journal Article] Genomic organizationand genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Y. Nagata, S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme Microb. Technol

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Y.Nagata
    • Journal Title

      Enzyme and Microbial Technology

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypalgamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Y. Nagata, 3人, Y. Ohtsubo, 5人, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Enzyme Microb. Technol

      Volume: 49 Pages: 499-508

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] The lin genes for gamma-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp. MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids2011

    • Author(s)
      M. Tabata, R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem

      Volume: 75 Pages: 466-472

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Journal Article] Stereoselectivity and conformational stability of haloalkane dehalogenase DbjA from Bardyrhizobium japonicum USDA110 : the effect of pH and temperature2011

    • Author(s)
      Chaloupkova, R., Z. Prokop, Y. Sato, Y. Nagata, and J. Damborsky
    • Journal Title

      FEBS J

      Volume: 278 Pages: 2728-2738

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Biochemical characteristics of the novel haloalkane dehalogenase DatA isolated from the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens C58. Appl2011

    • Author(s)
      Hasan, K., A. Fortova, T. Koudelakova, R. Chalooupkova, M. Ishitsuka, Y. Nagata, J. Damborsky, and Z. Prokop
    • Journal Title

      Environ. Microbial

      Volume: 77(5) Pages: 1881-1884

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Development of a crystallization protocol for the DbeA1 variant of novel haloalkane dehalogenase from Bradyrhizobium elkkani USDA942011

    • Author(s)
      Prudnikova, T., R. Chalouplova, Y. Sato, Y. Nagata, O. Degtjarik, M. Kuty, P. Rezacova, J. Damborsky, and I. Kuta Smatanova
    • Journal Title

      Crystal Growth & Design

      Volume: 11 Pages: 516-519

    • DOI

      10.1021/cg1013363

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] The lin genes for γ-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp. MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids2011

    • Author(s)
      Tabata, M., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem

      Volume: 75(3) Pages: 466-472

    • NAID

      10028201533

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • Author(s)
      加藤広海,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Journal Title

      J.Environ. Biotechnol

      Volume: 10 Pages: 63-70

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行、大坪和香子、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48(5) Pages: 313-319

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article]2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      難培養微生物研究の最新技術II(シーエムシー出版)

      Pages: 211-219

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20651050
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウエアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行,大坪和香子,永田裕二,津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48 Pages: 313-319

    • NAID

      10026438311

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010

    • Author(s)
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda.
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: 12 Pages: 2539-2558

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Crystal structure of γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Okai, M., K. Kubota, M. Fukuda, Y. Nagata, K. Nagata, and M. Tanokura
    • Journal Title

      J. Mol. Biol

      Volume: 403 Pages: 260-269

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Crystal structure of γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Okai, M., K. Kubota, M. Fukuda, Y. Nagata, K. Nagata, and M. Tanokura
    • Journal Title

      J. Mol. Biol

      Volume: 403 Pages: 260-269

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2010.08.043

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム「生態機能と環境保全」2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      微生物生態学会誌

      Volume: 25(2) Pages: 77-78

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010

    • Author(s)
      Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Environmental Microbiology

      Volume: 12(9) Pages: 2539-2558

    • DOI

      10.1111/j.1462-2920.2010.02227.x

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010

    • Author(s)
      大坪嘉行、大坪和香子、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物

      Volume: 48(5) Pages: 313-319

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced insoil environment by in vivo expression technology2010

    • Author(s)
      E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Environ. Microbiol

      Volume: 12 Pages: 2539-2558

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al
    • Journal Title

      J.Bacteriol.

      Volume: 192 Pages: 5852-5853

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] 特集「生態機能と環境保全」に寄せて2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 10(2) Pages: 52-52

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering2010

    • Author(s)
      Prokop, Z., Y. Sato, J. Brezovsky, T. Mozga, R. Chalooupkova, T. Koudelakova, P. Jerabek, V. Stepankova, R. Natsume, J. G.E. van Leeuwen, D. B. Janssen, J. Florian, Y. Nagata, T. Senda, and J. Damborsky
    • Journal Title

      Angewandte Chemie

      Volume: 49 Pages: 6111-6115

    • DOI

      10.1002/ange.201001753

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 10(2) Pages: 63-70

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR062010

    • Author(s)
      Matsushima, R., H. Danno, M. Uchida, K. Ishihara, T. Suzuki, M. Kaneniwa, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 86 Pages: 567-576

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, R. Endo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriology

      Volume: 192 Pages: 5852-5853

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010

    • Author(s)
      H. Yano, 3人, Y. Nagata, M. Hattori, M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriol

      Volume: 192 Pages: 4337-4347

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article]2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      酵素利用技術大系(株)エヌ・ティー・エス)

      Pages: 939-948

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20651050
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representativeγ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteriumSphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, R. Endo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriology

      Volume: 192 Pages: 5852-5853

    • DOI

      10.1128/jb.00961-10

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 10(2) Pages: 63-70

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR062010

    • Author(s)
      Matsushima, R., H. Danno, M. Uchida, K. Ishihara, T. Suzuki, M. Kaneniwa, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl Microbiol Biotechnol

      Volume: 86 Pages: 567-576

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Y.Nagata
    • Journal Title

      J.Bacteriol.

      Volume: 192 Pages: 5852-5853

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Journal Article] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010

    • Author(s)
      Yano, H., M. Miyakoshi, K. Ohshima, M. Tabata, Y. Nagata, M. Hattori, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J.Bacteriol

      Volume: 192 Pages: 4337-4347

    • DOI

      10.1128/jb.00359-10

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      「生態機能と環境保全」微生物生態学会誌

      Volume: 25(2) Pages: 77-78

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010

    • Author(s)
      Yano, H., M. Miyakoshi, K. Ohshima, M. Tabata, Y. Nagata, M. Hattori, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriol

      Volume: 192 Pages: 4337-4347

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム「生態機能と環境保全」2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      微生物生態学会誌

      Volume: 25 Pages: 77-78

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] 特集「生態機能と環境保全」に寄せて2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      環境バイオテクノロジー学会誌

      Volume: 10(2) Pages: 52-52

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobingobium japonicum UT262010

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al.
    • Journal Title

      J.Bacteriol.

      Volume: 192 Pages: 5852-5853

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering2010

    • Author(s)
      Prokop, Z., Y. Sato, J. Brezovsky, T. Mozga, R. Chalooupkova, T. Koudelakova, P. Jerabek, V. Stepankova, R. Natsume, J. G. E. van Leeuwen, D. B. Janssen, J. Florian, Y. Nagata, T. Senda, and J. Damborsky
    • Journal Title

      Angewandte Chemie

      Volume: 49 Pages: 6111-6115

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性-難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物 47(1)

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis ofa novel haloalkane dehalogenase DbeA fromBradyrhizobium elkani USDA94.2009

    • Author(s)
      Prudnikova, T. T. Mozga, P. Rezacova, R.Chaloupkova, Y. Sato, Y. Nagata, J. Brynda,M. Kuty, J. Damborsky, and I. K. Smatanova.
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section F 65

      Pages: 353-356

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      マリンメタゲノムの有効利用(シーエムシー出版)

      Pages: 166-178

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20651050
  • [Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性 -難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-.2009

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物 47

      Pages: 35-42

    • NAID

      10026434544

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Construction of signature-tagged mutant library in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics2008

    • Author(s)
      Shimoda, Y., H. Mitsui, H. Kamimatsuse, K. Minamisawa, E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, M. Tsuda, S. Shinpo, A. Watanabe, M. Kohara, M. Yamada, Y. Nakamura, S. Tabata,and S. Sato
    • Journal Title

      DNA Res 15

      Pages: 297-308

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Construction of signature-taggedmutant library in Mesorhizobium loti as apowerful tool for functional genomics2008

    • Author(s)
      Shimoda, Y., H. Mitsui, H. Kamimatsuse,K. Minamisawa, E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y.Nagata, M. Tsuda, S. Shinpo, A. Watanabe, M.Kohara, M. Yamada, Y. Nakamura, S. Tabata and S. Sato
    • Journal Title

      DNAResearch 15

      Pages: 297-308

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] GenomeMatcher : a graphical user interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., W. Ikeda-Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics 9

      Pages: 376-376

    • NAID

      120003728119

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 土壌環境での細菌の生き様を探る(2008年度日本生物工学会大会報告)2008

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      日本生物工学会誌 86

      Pages: 549-549

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Journal Article] Characterization of the traD operonof naphthalene-catabolic plasmid NAH7 ahost-range modifier in conjugative transfer2008

    • Author(s)
      Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Bacteriol 190

      Pages: 6281-6289

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Characterization of the traD operon of naphthalene-catabolic plasmid NAH72008

    • Author(s)
      Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      a host-range modifier in conjugative transfer. J. Bacteriol 190

      Pages: 6281-6289

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR cultivation-independent isolation of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes fromsoil DNA2008

    • Author(s)
      Fuchu, G., Y. Ohtsubo, M. Ito, R.Miyazaki, A. Ono, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Microbiol.Biotechnol 79

      Pages: 627-632

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] 土壌環境での細菌の生き様を探る(2008年度日本生物工学会大会報告)2008

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      日本生物工学会誌 86

      Pages: 549-549

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] 多重染色体性のBurkholderia multivoransのゲノム構造と土壌でのゲノム情報発現2008

    • Author(s)
      津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 湯原悟志, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Journal Title

      土と微生物 62

      Pages: 93-97

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR : cultivation-independent isolation of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes from soil DNA2008

    • Author(s)
      Fuchu, G., Y. Ohtsubo, M. Ito, R. Miyazaki, A. Ono, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol 79

      Pages: 627-632

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 多重染色体性のBurkholderia multivoransのゲノム構造と土壌でのゲノム情報発現2008

    • Author(s)
      津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 湯原悟志, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Journal Title

      土と微生物 62 (2)

      Pages: 93-97

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] GenomeMatcher : A graphicaluser interface for DNA sequence comparison2008

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., W. Ikeda-Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      BMC Bioinformatics 9

      Pages: 376-376

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsive transcriptional regulator Fur in Burkholderia multivorans2008

    • Author(s)
      Yuhara, S., H. Komatsu, H. Goto, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 1763-1774

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsivetranscriptional regulator Fur in Burkholderiamultivorans2008

    • Author(s)
      Yuhara, S., H. Komatsu, H. Goto, Y.Otsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiology 154

      Pages: 1763-1774

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane byhaloalkane dehalogenase LinB from γ-hexachlorocyclohexane-utilizing bacteriumSphingobium sp2007

    • Author(s)
      Ito, M., Z. Prokop, M. Klvana, Y. Otsubo, M. Tsuda, J. Damborsky, and Y. Nagata
    • Journal Title

      MI1205. Arch Microbiol 188

      Pages: 313-325

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] G. J. Zylstra, P. A. Williams, and M. Tsuda : Complete sequence determination combined with analysis of transposition/site-specific recombination events to explain genetic organization of IncP-7 TOL plasmid pWW53 and related mobile genetic elements2007

    • Author(s)
      Yano, H., C. E. Garruto, M. Sota, Y. Ohtsubo, Y. Nagata
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 369

      Pages: 11-26

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 自然環境で実際に機能する微生物遺伝子の遺伝学的手法による検索と解析2007

    • Author(s)
      津田雅孝, 西山依里, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Journal Title

      化学と生物 45

      Pages: 557-563

    • NAID

      10019578182

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane) in bacteria and its biochemical and molecular basis2007

    • Author(s)
      Nagata, Y., et. al.
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. and Biotechnol. 76

      Pages: 741-752

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Journal Article] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007

    • Author(s)
      津田雅孝, 小野玲, 宮崎亮, 府中玄樹, 永田裕二
    • Journal Title

      J. Environ. Biotechnol. 7

      Pages: 75-78

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Weak activity ofhaloalkane dehalogenase LinB with1, 2, 3-trichloropropane revealed by X-raycrystallography and microcalorimetry2007

    • Author(s)
      Monincova, M., Z. Prokop, J. Vevodova, Y.Nagata and J. Damborsky
    • Journal Title

      Appl.Envirom. Microbiol 73

      Pages: 2005-2008

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and itsbiochemical and molecular basis. Appl2007

    • Author(s)
      Nagata, Y., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiol. and Biotechnol 76

      Pages: 741-752

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Complete sequencedetermination combined with analysis oftransposition/site-specific recombination eventsto explain genetic organization of IncP-7 TOLplasmid pWW53 and related mobile geneticelements2007

    • Author(s)
      Yano, H., C.E. Garruto, M. Sota, Y.Ohtsubo, Y. Nagata, G.J. Zylstra, P.A.Williams, and M. Tsuda
    • Journal Title

      J. Mol. Biol 369

      Pages: 11-26

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] The identification of catalytic pentad in the haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85 : reaction mechanism and molecular evolution2007

    • Author(s)
      Pavlova, M., M. Klvana, A. Jesenska, Z. Prokop, H. Konecna, T. Sato, M. Tsuda, Y. Nagata, and J. Damborsky
    • Journal Title

      J. Struct. Biol 157

      Pages: 384-392

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007

    • Author(s)
      Nagata, Y., et. al.
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. and Biotechnol. 76

      Pages: 741-752

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Identification and characterization ofgenes encoding a putative ABC-type transporteressential for the utilization of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobiumjaponicum UT262007

    • Author(s)
      Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y.Nagata
    • Journal Title

      J. Bacteriol 189

      Pages: 3712-3720

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a haloalkane dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA1102007

    • Author(s)
      Sato, Y., R. Natsume, M. Tsuda, J. Damborsky, Y. Nagata, and T. Senda
    • Journal Title

      Acta Cryst. F63

      Pages: 294-296

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 土壌生態系での環境細菌ゲノム情報発現2007

    • Author(s)
      津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 永田裕二, 大坪嘉行
    • Journal Title

      極限環境微生物学会誌 6

      Pages: 59-62

    • NAID

      130004486982

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] 自然環境で実際に機能する微生物遺伝子の遺伝学的手法による検索と解析2007

    • Author(s)
      津田雅孝、西山依里、永田裕二、大坪嘉行
    • Journal Title

      化学と生物 45

      Pages: 557-563

    • NAID

      10019578182

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007

    • Author(s)
      津田雅孝、小野玲、宮崎亮、府中玄樹、永田裕二
    • Journal Title

      J. Environ. Biotechnol 7(2)

      Pages: 75-78

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007

    • Author(s)
      Nagata, Y., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Microbiol. Biotechnol 74

      Pages: 741-752

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from γ-hexachlorocyclohexane-utilizing bacterium Sphingobium sp2007

    • Author(s)
      Ito, M., Z. Prokop, M. Klvana, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, J. Damborsky, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Arch. Microbiol 188

      Pages: 313-325

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007

    • Author(s)
      Yuji Nagata
    • Journal Title

      Applied Microbiology and Biotechnology 76

      Pages: 741-752

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] The identificationof catalytic pentad in the haloalkanedehalogenase DhmA from Mycobacterium aviumN85 : reaction mechanism and molecularevolution2007

    • Author(s)
      Pavlova, M., Klavana, A. Jesenska, Z.Prokop, H. Konecna, T. Sato, M. Tsuda, Y.Nagata, and J. Damborsky
    • Journal Title

      J. Struct. Biol 157

      Pages: 384-392

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Isolation andcharacterization of naphthalene-catabolic genesand plasmids from oil-contaminated soil by usingtwo cultivation-independent approaches2007

    • Author(s)
      Ono, A., R. Miyazaki, M. Sota, Y. Ohtsubo,Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl.Microbiol. Biotechnol 74

      Pages: 501-510

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Isolation and characterization of naphthalene-catabolic genes and plasmids from oil-contaminated soil by using two cultivation-independent approaches. Appl2007

    • Author(s)
      Ono, A., R. Miyazaki, M. Sota, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Microbiol. Biotechnol 74

      Pages: 501-510

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Identification and characterization of genes encoding a putative ABC-type transporter essential for the utilization of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT262007

    • Author(s)
      Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 189

      Pages: 3712-3720

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Senda.Crystallization and preliminary crystallographicanalysis of a haloalkane dehalogenase DbjA fromBradyrhizobium japonicum USDA1102007

    • Author(s)
      Sato, Y., R. Natsume, M. Tsuda, J. Damborsky, Y. Nagata and T
    • Journal Title

      ActaCryst Section F 63

      Pages: 294-296

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Growth inhibition by metabolites of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT26.2006

    • Author(s)
      Endo, R., Y.Ohtsubo, M.Tsuda, Y.Nagata
    • Journal Title

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 70

      Pages: 1029-1032

    • NAID

      10018532907

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Is metagenome treasure island?2006

    • Author(s)
      Y.Nagata
    • Journal Title

      Seibutsu-Kogaku Kaishi(in Japanese) 84(2)

      Pages: 73-73

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Identification of a responseregulator gene for catabolite control from aPCB-degrading β-proteobacteria, Acidovorax sp. KKS1022006

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., H. Goto, Y. Nagata, T. Kudo,and M. Tsuda
    • Journal Title

      Mol. Microbiol 60

      Pages: 1563-1575

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] ハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能2006

    • Author(s)
      永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      J. Environ. Biotechnol. 6

      Pages: 87-92

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT262006

    • Author(s)
      Nagata, Y. et al.
    • Journal Title

      FEMS Microbiol.Lett. in press

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] 境汚染物質を分解する酵素遺伝子の土壌からの直接的取得と解析2006

    • Author(s)
      小野玲、宮崎亮、永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      バイオインダストリー11月号 23(11)

      Pages: 44-49

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Functional analysis of unique class II insertion sequence IS1071.2006

    • Author(s)
      Sota, T., H.Yano, Y.Nagata, Y.Ohtsubo, H.Genka, H.Anbutsu, H.Kawasaki, M.Tsuda
    • Journal Title

      Appl.Environ.Microbiol. 72

      Pages: 291-297

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Completenucleotide sequence of an exogenously isolatedplasmid pLB1 involved in the degradation ofγ-hexachlorocyclohexane2006

    • Author(s)
      Miyazaki, R., Y. Sato, M. Ito, Y. Ohtsubo,Y. Nagata and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Envirom.Microbiol 72

      Pages: 6923-6933

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Complete nucleotide sequence of an exogenously isolated plasmid pLB1 involved in the degradation of γ-hexachlorocyclohexane2006

    • Author(s)
      Miyazaki, R. Y. Sato, M. Ito, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Journal Title

      Appl. Environ. Microbiol 72

      Pages: 6923-6933

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] ハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能2006

    • Author(s)
      永田裕二、津田雅孝
    • Journal Title

      J. Environ. Biotechnol 6

      Pages: 87-92

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] Expression of glycosylated haloalkane dehalogenase LinB in Pichia pastoris.2006

    • Author(s)
      Nakamura, T., M.Zamocky, Z.Zdrahal, R.Chaloupkova, M.Monincova, Z.Prokop, Y.Nagata, J.Damborsky
    • Journal Title

      Protein Expression and Purification 46

      Pages: 85-91

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT262006

    • Author(s)
      Nagata, Y. et al.
    • Journal Title

      FEMS Microbiol. Lett. 256

      Pages: 112-118

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] ハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能2006

    • Author(s)
      永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      J. Environ. Biotechnol. 6

      Pages: 87-92

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Journal Article] 環境汚染物質を分解する酵素遺伝子の土壌からの直接的取得と解析2006

    • Author(s)
      小野玲, 宮崎亮, 永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      バイオインダストリ- 23

      Pages: 44-49

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT26.2006

    • Author(s)
      Nagata, Y., M.Kamakura, R.Endo, R.Miyazaki, Y.Ohtsubo, M.Tsuda
    • Journal Title

      FEMS Microbiol.Lett. 256

      Pages: 112-118

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] メタゲノムは宝の山か?(バイオミディア)2006

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      日本生物工学会誌 84・2

      Pages: 73-73

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Growth inhibition by metabolites of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT262006

    • Author(s)
      Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem 70

      Pages: 1029-1032

    • NAID

      10018532907

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Identification of a response regulator gene for catabolite control from a PCB-degrading β-proteobacteria, Acidovorax sp2006

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., H. Goto, Y. Nagata, T. Kudo, and M. Tsuda
    • Journal Title

      KKS102. Mol. Microbiol 60

      Pages: 1563-1575

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Journal Article] Quantitative analysis of substrate specificity of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26.2005

    • Author(s)
      Kmunicek, J., K.Hynkova, T.Jedlicka, Y.Nagata, A.Negri, F.Gago, R.C.Wade, J.Damborsky
    • Journal Title

      Biochemistry 44

      Pages: 3390-3401

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Mycobacterial haloalkane dehalogenases : cloning, biochemical properties and distribution.2005

    • Author(s)
      Jesenska, A., M.Pavlova, M.Strouhal, R.Chaloupkova, I.Tesinska, M.Monincova, Z.Prokop, M.Bartos, I.Pavlik, I.Rychlik, P.Mobius, Y.Nagata, J.Damborsky
    • Journal Title

      Appl.Environ.Microbiol. 71

      Pages: 6736-6745

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 176162005

    • Author(s)
      Nagata, Y. et al.
    • Journal Title

      J.Biosci.Bioeng 99

      Pages: 603-610

    • NAID

      110002695708

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Mycobacterial haloalkane dehalogenases : cloning, biochemical properties and distribution2005

    • Author(s)
      永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物 43

      Pages: 33-42

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Identification of insertion sequence from a γ-hexachlorocyclohexane degrading bacterium, Sphingomonas paucimobilis UT26.2005

    • Author(s)
      Miyauchi, K., M.Fukuda, M.Tsuda, M.Takagi, Y.Nagata
    • Journal Title

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 69

      Pages: 216-219

    • NAID

      130000030576

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] メタゲノム的発想に基づいた新規環境汚染物質分解酵素遺伝子へのアプローチ2005

    • Author(s)
      永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      化学と生物 43

      Pages: 33-42

    • NAID

      10016570075

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT262005

    • Author(s)
      Nagata, Y. et al.
    • Journal Title

      Appl. Envirn. Microbiol. 71

      Pages: 2183-2185

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT262005

    • Author(s)
      Nagata, Y. et al.
    • Journal Title

      Appl.Envirn.Microbiol 71

      Pages: 2183-2185

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Metabolic pathway, genes, and enzymes for the degradation of chlorinated pesticide, γ-hexachlorocyclohexane.2005

    • Author(s)
      Nagata, Y., M.Tsuda
    • Journal Title

      Protein, Nucleic Acid, and Enzyme(in Japanese) 50(12)

      Pages: 1511-1518

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Two Rhizobial strains, Mesorhizobium loci MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110, encode haloalkane dehalogenases with novel structures and substrate specificities.2005

    • Author(s)
      Sato, Y., M.Monincova, R.Chaloupkova, Z.Prokop, Y.Ohtsubo, K.Minamisawa, M.Tsuda, J.Damborsky, Y.Nagata
    • Journal Title

      Appl.Environ.Microbiol. 71

      Pages: 4372-4379

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] 有機塩素系殺虫剤分解細菌の出現-代謝系の構築と酵素の機能2005

    • Author(s)
      永田裕二, 津田雅孝
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 50・12

      Pages: 1511-1518

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Identification and characterization of genes involved in the downstream degradation pathway of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingomonas paucimobilis UT26.2005

    • Author(s)
      Endo, R., M.Kamakura, K.Miyauchi, M.Fukuda, Y.Ohtsubo, M.Tsuda, Y.Nagata
    • Journal Title

      J.Bacteriol. 187

      Pages: 847-853

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Access to novel genes for the degradation of environmental pollutants by metagenomic approaches.2005

    • Author(s)
      Nagata, Y., M.Tsuda
    • Journal Title

      Kagaku-to-Seibutsu(in Japanese) 43

      Pages: 33-42

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] メタゲノム的発想に基づいた新規環境汚染物質分解酵素遺伝子へのアプローチ2005

    • Author(s)
      永田裕二
    • Journal Title

      化学と生物 43

      Pages: 33-42

    • NAID

      10016570075

    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16013203
  • [Journal Article] Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 17616.2005

    • Author(s)
      Nagata, Y., M.Matsuda, H.Komatsu, Y.Imura, H.Sawada, Y.Ohtsubo, M.Tsuda
    • Journal Title

      J.Biosci.Bioeng. 99

      Pages: 603-610

    • NAID

      110002695708

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 176162005

    • Author(s)
      Nagata, Y. et al.
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng. 99

      Pages: 603-610

    • NAID

      110002695708

    • Description
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] High-temperature-induced transposition of IS elements in Burkholderia multivorans ATCC 17616.2005

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., H.Genka, H.Komatsu, Y.Nagata, M.Tsuda
    • Journal Title

      Appl.Environ.Microbiol. 71

      Pages: 1822-1828

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26.2005

    • Author(s)
      Nagata, Y., Z.Prokop, Y.Sato, P.Jerabek, A.Kumar, Y.Ohtsubo, M.Tsuda, J.Damborsky
    • Journal Title

      Appl.Environ.Microbiol. 71

      Pages: 2183-2185

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Strategies for bioremediation of polychlorinated biphenyls.2004

    • Author(s)
      Ohtsubo, Y., T.Kudo, M.Tsuda, Y.Nagata
    • Journal Title

      Appl.Microbiol.Biotechnol. 65

      Pages: 250-258

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Genome biology of environmental bacteria and environmental DNA.2004

    • Author(s)
      Tsuda, M., H.Komatsu, Y.Ohtsubo, Y.Nagata
    • Journal Title

      J.Environ.Biotechnol.(in Japanese) 3

      Pages: 69-78

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] Crystral structure of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26 at 0.95Å resolution : dynamics of catalytic residues.2004

    • Author(s)
      Oakley, A.J., M.Klvana, M.Otyepka, Y.Nagata, M.C.Wilce, J.Damborsky
    • Journal Title

      Biochemsitry 43

      Pages: 870-878

    • Description
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16580050
  • [Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の探索

    • Author(s)
      永山浩史,菅原智詞,遠藤諒,加藤広海,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Journal Title

      J.Environ. Biotechnol

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] Taq DNA polymeraseによる新規タイプのCIS反応2021

    • Author(s)
      川原 昌太郎,永田 裕二,大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 新規qTnSeq法の開発:PCB/ビフェニル分解菌への適用と2つの指標値の導入2021

    • Author(s)
      逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
    • Organizer
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] ICEKKS1024677の接合伝達を制御する遺伝子発現制御機構2021

    • Author(s)
      松本 哲,永田 裕二,大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] γ-Hexachlorocyclohexane(HCH)汚染土壌のメタゲノム解析2021

    • Author(s)
      加藤 広海,田中 彩美,永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] qTnSeq法を用いたBurkholderia属細菌における潜在的抗生物質耐性遺伝子の網羅的同定2021

    • Author(s)
      野々山翔太、逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
    • Organizer
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を持つスフィンゴモナッド細菌株のmembrane vesicle形成とvesicleが有するDNA2021

    • Author(s)
      鈴木 達也,相馬 隆光,加藤 広海,豊福 雅典, 野村 暢彦,永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 新型コロナウィルスを認識するDNAアプタマーの作製と迅速検出法の構築2021

    • Author(s)
      大坪 嘉行,永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 従属栄養細菌の極貧栄養環境でのCO2依存的な増殖現象2021

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会シンポジウム「細菌の低栄養環境に対する増殖を伴う適応機構」
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける転写制御因子IscRの解析2021

    • Author(s)
      野々山 翔太,岸田 康平,酒井 啓一郎,永田 裕二, 津田 雅孝,大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 平板培地を用いた実験進化により構築したモデル細菌集団内の多様性維持機構2021

    • Author(s)
      平野彰大、山本達也、仁平賢、野村暢彦、永田裕二、矢野大和
    • Organizer
      第15回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼ及びデアミナーゼからなる融合酵素DahXのtRNA編集活性2021

    • Author(s)
      高橋 由紀子,佐藤 優花里,中鉢 千尋,野々山 翔太, 永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 実験進化系で得られた人工殺虫剤分解に関与する進化型ハロアルカンデハロゲナーゼ2021

    • Author(s)
      陳 楠楠,大坪 嘉行,永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB分解菌Acidovorax sp. KKS102株が示す多段階増殖とレスポンスレギュレーターBphQの翻訳後修飾2020

    • Author(s)
      酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] キャピラリーシーケンサーとTraceViewerを用いたDNA解析のススメ2020

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 農薬分解細菌を用いた平板培地実験進化系の構築2020

    • Author(s)
      仁平 賢、山本 達也、平野 彰大、野村 暢彦、永田 裕二、矢野 大和
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 培養条件検討からadhX遺伝子依存的貧栄養環境生育機構に迫る2020

    • Author(s)
      酒井 洋範、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達に関与するtraR遺伝子の機能解析2020

    • Author(s)
      松本 哲、酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Construction of experimental evolution system of haloalkane dehalogenases and characterization of the evolved enzymes2020

    • Author(s)
      Nannan CHEN, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 人工遺伝子クラスターを利用した有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子キャプチャリング株の作製2020

    • Author(s)
      蘇 立俊、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Burkholderia属ヘム獲得系転写活性化因子HemPの普遍的機能の解析2020

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] qTnSeq法を利用したPCB/ビフェニル分解菌の分解制限要因の同定と排除2020

    • Author(s)
      逸見裕太郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 有機リン系殺虫剤分解細菌Sphingopyxis wildii株由来の2種のハロアルカンデハロゲナーゼの解析2020

    • Author(s)
      鄧 文昊、Annapoorni Lakshman Sagar、陳 楠楠、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、Dayanannda Siddavattam、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB分解菌Acidovorax sp. KKS102株が示す多段階増殖とレスポンスレギュレーターBphQの翻訳後修飾2020

    • Author(s)
      酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達に関与するtraR遺伝子の機能解析2020

    • Author(s)
      松本哲、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Acidovorax sp. KKS102株が有する融合酵素DahXのtRNA編集活性2020

    • Author(s)
      高橋 由紀子、中鉢 千尋、野々山 翔太、佐藤 優花里、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] qTnSeq法を利用したPCB/ビフェニル分解菌の分解制限要因の同定と排除2020

    • Author(s)
      逸見 裕太郎、永田 裕二、津田 雅孝、大坪 嘉行
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Burkholderia 属ヘム獲得系転写活性化因子 HemP の普遍的機能の解析2020

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、永田 裕二、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 超音波で断片化したDNAの3'端と効率的修復2020

    • Author(s)
      大坪 嘉行、酒井 啓一郎、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得のための人工キャプチャリング株の構築2020

    • Author(s)
      蘇 立俊、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 超音波で断片化したDNAの3'端と効率的修復2020

    • Author(s)
      大坪嘉行、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写活性化機構の解析2020

    • Author(s)
      野々山翔太、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 培養条件検討からadhX遺伝子依存的貧栄養環境生育機構に迫る2020

    • Author(s)
      酒井洋範、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Survivability of a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading sphingomonad strain in soil.2020

    • Author(s)
      Kafayat YUSUF, Hiromi Kato, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Burkholderia multivorans の鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写活性化機構の解析2020

    • Author(s)
      野々山 翔太、岸田 康平、永田 裕二、大坪 嘉行、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得のための人工キャプチャリング株の構築2020

    • Author(s)
      蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を持つスフィンゴモナッド細菌株のmembrane vesicle形成2020

    • Author(s)
      鈴木 達也、相馬 隆光、加藤 広海、豊福 雅典、野村 暢彦、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] キャピラリーシーケンサーと TraceViewer を用いた DNA 解析のススメ2020

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第14回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] qTnSeq法の開発とPCB分解細菌への適用2019

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 生態学は生物群集デザインに活用できるか?2019

    • Author(s)
      近藤 倫生、東 豊浩、加藤 広海、川津 一隆、長田 穣、永田 裕二
    • Organizer
      日本生物工学会第71回大会シンポジウム
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 土壌細菌叢の初期形成過程における移動性細菌の役割2019

    • Author(s)
      加藤広海、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 人工の代謝酵素遺伝子クラスターを利用した高機能有機塩素殺虫剤資化細菌の育種2019

    • Author(s)
      蘇 立俊 , 加藤 広海 , 大坪 嘉行 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45の生育阻害因子の解析2019

    • Author(s)
      堀川慧太、池内倫子、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Mycobacterium sp. EPa45株におけるフェナントレン分解遺伝子群の転写解析2019

    • Author(s)
      市橋永吉、小川なつみ、加藤広海、岸田康平、野々山翔太、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia属細菌におけるFurで制御されるヘム獲得系活性化因子HemPの普遍的機能の解析2019

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤 拓哉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 難培養性細菌の培養における細胞外多糖の重要性2019

    • Author(s)
      高橋紳八、加藤広海、永田裕二、大塚重人、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Sphingobium japonicum UT26株の有機塩素系殺虫剤分解に関わるABCトランスポーターの解析2019

    • Author(s)
      尾形拓哉、佐藤優花里、永田裕二
    • Organizer
      日本生化学会東北支部会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] プラスミドベクターpBBR1MCSの宿主域に関する研究2019

    • Author(s)
      岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 異なる土壌間における微生物集団の移植実験2019

    • Author(s)
      加藤広海、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 環境細菌におけるadhX遺伝子が関与する貧栄養環境適応機構の普遍性2019

    • Author(s)
      酒井洋範、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] IscR of Burkholderia multivorans plays both repressing and activating roles in transcription of isc operon for biosynthesis of Fe-S cluster2019

    • Author(s)
      Shouta Nonoyama, Kouhei Kishida, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
    • Organizer
      8th Congress of European Microbiologists
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌細菌叢の初期形成過程における移動性細菌の役割2019

    • Author(s)
      加藤 広海 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] 微生物はなぜ群れを作るのか?:平板培地実験進化系を用いたBHQの検証2019

    • Author(s)
      仁平 賢, 山本 達也, 平野 彰大, 野村 暢彦, 永田 裕二 , 矢野 大和
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の分配系が関与する接合伝達頻度上昇2019

    • Author(s)
      久土晃二、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第13回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌細菌叢の液体培養系における遷移の動態解析2019

    • Author(s)
      東 豊浩 , 加藤 広海 , 長田 穣 , 永田 裕二 , 近藤倫生
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] Burkholderia属細菌における鉄硫黄クラスター生合成系の転写制御機構の解析2019

    • Author(s)
      野々山翔太、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関与する二成分調節因子BphPQの機能調節の解析2019

    • Author(s)
      酒井啓一郎、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 環境細菌におけるadhX遺伝子が関与する貧栄養環境適応機構の普遍性2019

    • Author(s)
      酒井 洋範 , 加藤 広海 , 大坪 嘉行 , 津田 雅孝 , 永田 裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第33回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19H02865
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解資化遺伝子群を有すICEKKS1024677の水平伝播宿主域の解析2019

    • Author(s)
      川原昌太郎、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2019年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌細菌叢の形成プロセスにおける再現性2018

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、黒川顕、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第32回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系因子BphPQの解析2018

    • Author(s)
      佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Identification and characterization of a novel gene essential for conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH72018

    • Author(s)
      Kouhei Kishida、Nonoyama Shouta、Nagata Yuji、Ohtsubo Yoshiyuki、Masataka Tsuda
    • Organizer
      Plasmid Biology 2018
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Furで制御されるBurkholderia属細菌ヘム獲得系活性化因子HemPの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] トランスクリプトーム解析を用いた環境細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応戦略の解明2018

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 難分解性芳香族化合物分解コンソーシアム由来の分解細菌Mycobacteirum sp. EPa45株における生育阻害機構2018

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、岸田康平、市橋永吉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達域規定因子の同定2018

    • Author(s)
      川原 昌太郎、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に必須な遺伝子セットの同定2018

    • Author(s)
      岸田康平、Tim Lucas、野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] トランスクリプトーム解析を用いた環境細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応戦略の解明2018

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解Mycobacterium株の遺伝子破壊系構築とビフェニル分解への転写応答2018

    • Author(s)
      市橋永吉、小川なつみ、岸田康平、加藤広海、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 代謝酵素遺伝子群の人工クラスターを利用した有機塩素系殺虫剤資化細菌の育種2018

    • Author(s)
      蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 好気性従属栄養細菌における極貧栄養環境適応変異株の解析2018

    • Author(s)
      稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 高度難分解性環境汚染物質分解細菌から微生物進化を探る2018

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 環境汚染物質の分解細菌コミュニティにおける非分解菌コロニーの分解菌コロニーへの接近現象2018

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 難分解性芳香族化合物分解コンソーシアム由来の分解細菌Mycobacteirum sp. EPa45株における生育阻害機構2018

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、岸田康平、市橋永吉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 逆転写酵素のtailing活性と新規TSLR反応を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] デアミナーゼと融合した新規デハロゲナーゼの特徴2018

    • Author(s)
      中鉢千尋、佐藤優花里、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 好気性従属栄養細菌株由来の極貧栄養環境での生育能を獲得した突然変異株の解析2018

    • Author(s)
      稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Furで制御されるBurkholderia属細菌ヘム獲得系活性化因子HemPの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 逆転写酵素を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析手法の確立2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤資化に必須なABCトランスポーターホモログの機能解析2018

    • Author(s)
      佐藤緋奈子、中鉢千尋、佐藤優花里、矢野大和、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規な接合伝達必須遺伝子の機能解明2018

    • Author(s)
      岸田康平、Tim Lucas、野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 従属栄養性土壌細菌の超貧栄養環境に対する適応機構2018

    • Author(s)
      稲葉慎之介、加藤広海、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本微生物生態学会第32回大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 逆転写酵素を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析手法の確立2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018

    • Author(s)
      野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] フェナントレン分解Mycobacterium株の遺伝子破壊系構築とビフェニル分解への転写応答2018

    • Author(s)
      市橋永吉、小川なつみ、岸田康平、加藤広海、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 逆転写酵素のtailing活性と新規TSLR反応を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析2018

    • Author(s)
      大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌難培養性細菌の単離及び易培養性細菌との共存関係2018

    • Author(s)
      高橋紳八、加藤広海、永田裕二、大塚重人、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 環境汚染物質の分解細菌コミュニティにおける非分解菌コロニーの分解菌コロニーへの接近現象2018

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2018年度大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] In vivo evolution system for haloalkane dehalogenases toward degradation of a man-made pesticide2018

    • Author(s)
      陳 楠楠、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第12回日本ゲノム微生物学会年会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドの接合伝達に関わる全遺伝子の同定2017

    • Author(s)
      岸田 康平、ルーカス ティム、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害の緩和に対する非分解細菌の生細胞の重要性2017

    • Author(s)
      小川 なつみ、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 極貧栄養環境での生育能を獲得した好気性従属栄養細菌突然変異株の解析2017

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 加藤 広海, 大坪 嘉行, 津田 雅孝, 永田 裕二
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces the oligotrophic growth with carbon dioxide fixation2017

    • Author(s)
      Shinnosuke Inaba, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
    • Organizer
      The 7th Congress of European Microbiologists (FEMS 2017)
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群の転写因子IscRの解析2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌叢メタゲノムの時間的変動と細菌間相互作用2017

    • Author(s)
      加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第61回日本放線菌学会学術講演会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応メカニズムの経時的解析2017

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌における適応機構の解明2017

    • Author(s)
      田上諒、西山 依里、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] マウス白血病ウィルス由来逆転写酵素のN-tailing活性と解析ツールTraceViewer2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規接合伝達必須遺伝子の機能解析2017

    • Author(s)
      岸田 康平、Tim Lukas, 大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 金属イオンコファクターの違いによる接合伝達の鍵酵素relaxaseのnick導入塩基配列特異性の変化2017

    • Author(s)
      岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応メカニズムの経時的解析2017

    • Author(s)
      田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 定量的TnSeq解析法の構築とPCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株の全必須遺伝子の同定2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 利用する:汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割2017

    • Author(s)
      加藤広海,小川なつみ,大坪嘉行,永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 細菌由来のデアミナーゼ―デハロゲナーゼ融合タンパク質の機能解析2017

    • Author(s)
      佐藤 あや華、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構に関する研究2017

    • Author(s)
      稲葉 慎之介、加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の基質耐性突然変異株の取得と解析2017

    • Author(s)
      池内 倫子、小川 なつみ、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45株のフェナントレンに対する転写応答2017

    • Author(s)
      小川 なつみ、石毛 太一郎、加藤 広海、大坪 嘉行、永田 裕二、吉川 博文、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Strong N-tailing activity and specific enhancers of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase toward blunt DNA ends2017

    • Author(s)
      Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
    • Organizer
      15th International Union of Microbiological Societies
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系制御因子についての解析2017

    • Author(s)
      佐々木 春菜, 永田 裕二, 津田 雅孝, 大坪 嘉行
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌叢メタゲノムの時間的変動と細菌間相互作用2017

    • Author(s)
      加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第61回日本放線菌学会学術講演会
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 二種類の酵素ドメインから構成される融合タンパク質の示差走査蛍光定量解析2017

    • Author(s)
      佐藤優花里、中鉢千尋、永田裕二
    • Organizer
      2017年度生命科学系学会合同年次大会
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティに関する研究2017

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 逆転写酵素の強いtailing活性と解析ソフトTraceViewer2017

    • Author(s)
      大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤γ-hexachlorocyclohexane分解コミュニティのメタゲノム解析2017

    • Author(s)
      加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割2017

    • Author(s)
      加藤広海,小川なつみ,大坪嘉行,永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] Strong N-tailing activity and specific enhancers of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase toward blunt DNA ends2017

    • Author(s)
      Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda
    • Organizer
      15th International Union of Microbiological Societies (IUMS2017)
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群の転写因子IscRの解析2017

    • Author(s)
      野々山翔太、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター生合成系の転写制御機構の解析2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤の分解細菌コミュニティにおける非分解菌の役割2017

    • Author(s)
      加藤 広海、大坪 嘉行、津田 雅孝、永田 裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都府京都市京都女子大学
    • Year and Date
      2017-03-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群に対する転写因子Fur及びIscRの作用機序2017

    • Author(s)
      野々山 翔太、佐藤 拓哉、岸田 康平、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      第11回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
    • Year and Date
      2017-03-02
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害に対する非分解細菌の役割:RNA-seq解析による検討2017

    • Author(s)
      小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-17H03781
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害に対する非分解細菌の役割:RNA-seq解析による検討2017

    • Author(s)
      小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
    • Organizer
      第2回環境微生物系学会合同大会2017
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌微生物のノトバイオロジー2016

    • Author(s)
      加藤 広海、森 宙史、永山 浩史、大坪 嘉行、永田 裕二、黒川 顕、津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会シンポジウム「微生物エコシステムを制御せよ!最先端テクノロジーがもたらす複合微生物系研究のパラダイムシフト」
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      広島県広島市広島県民文化センター
    • Year and Date
      2016-06-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第89回日本細菌学会ワークショップ「共創:微生物エコシステム構成原理」
    • Place of Presentation
      大阪交流センター(大阪府、大阪市)
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田 康平, 井上 慧, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • Author(s)
      野々山 翔太, 佐藤 拓哉, 岸田 康平, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • Author(s)
      阿部史歩 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 湯原 悟志, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 土壌環境におけるBurkholderia属細菌の生育段階と土壌高発現遺伝子の転写変動パターンの関係性2016

    • Author(s)
      田上 諒、西山 依里、大坪 嘉行、永田 裕二、津田 雅孝
    • Organizer
      日本微生物生態学会第31回大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横須賀市横須賀市文化会館
    • Year and Date
      2016-10-22
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • Author(s)
      野々山 翔太, 佐藤 拓哉, 岸田 康平, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 土壌微生物のノトバイオロジー2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第89回日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田 康平, 井上 慧, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016

    • Author(s)
      小山 旺, 森内 良太, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉 湯原悟志 野々山翔太 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田康平 井上慧 大坪嘉行 永田裕二 津田 雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016

    • Author(s)
      野々山翔太 佐藤拓哉 岸田康平 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      佐藤 あや華, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田康平 井上慧 大坪嘉行 永田裕二 津田 雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介 平野丈 宇井博紀 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉 湯原悟志 野々山翔太 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016

    • Author(s)
      佐藤 あや華, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介 平野丈 宇井博紀 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • Author(s)
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • Author(s)
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Plant-associated Aureimonas with the sole rRNA operon on a tiny plasmid2016

    • Author(s)
      M Anda, Y Ohtsubo, Ti Okubo, M Sugawara, Y Nagata, M Tsuda,S Ikeda, S Eda, H Mitsui, K Minamisawa
    • Organizer
      16th International Symposium on Microbial Ecology
    • Place of Presentation
      Palais des Congres de Montreal, Montreal, Canada
    • Year and Date
      2016-08-21
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 湯原 悟志, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • Author(s)
      阿部史歩、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016

    • Author(s)
      稲葉 慎之介, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016

    • Author(s)
      岸田康平、井上慧、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] Construction of in vivo evolution system for haloalkane dehalgenases2016

    • Author(s)
      Y. Nagata, R. Moriuchi, A. Koyama, Y. Ohtsubo, L. Chrast, J. Damborsky, and M. Tsuda
    • Organizer
      2nd ASM Conference on Experimental Microbial Evolution
    • Place of Presentation
      The Mayflower Hotel, Washington DC, USA
    • Year and Date
      2016-08-04
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第89回日本細菌学会ワークショップ「共創:微生物エコシステム構成原理」
    • Place of Presentation
      大阪交流センター(大阪府、大阪市)
    • Year and Date
      2016-03-23
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 土壌における細菌叢の形成・定着過程の長期モニタリング2016

    • Author(s)
      加藤広海、渡来直生、森宙史、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      広島県広島市広島県民文化センター
    • Year and Date
      2016-06-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構2016

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      広島県広島市広島県民文化センター
    • Year and Date
      2016-06-13
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016

    • Author(s)
      阿部史歩 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016

    • Author(s)
      渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 再構築された土壌微生物群集の超長期培養2016

    • Author(s)
      加藤広海、渡来直生、森宙史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      日本微生物生態学会第31回大会
    • Place of Presentation
      神奈川県横須賀市横須賀市文化会館
    • Year and Date
      2016-10-22
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016

    • Author(s)
      野々山翔太 佐藤拓哉 岸田康平 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016

    • Author(s)
      加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • Author(s)
      小川なつみ 加藤広海 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016

    • Author(s)
      守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] リボソームRNAオペロンが染色体に存在しない細菌の発見2016

    • Author(s)
      按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究、三井久幸
    • Organizer
      日本RNA学会-第4回 RIBOSOME MEETING
    • Place of Presentation
      大阪府高槻市大阪医科大学
    • Year and Date
      2016-09-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-16K14877
  • [Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016

    • Author(s)
      小山 旺, 森内 良太, 大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • Author(s)
      小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016

    • Author(s)
      小川なつみ 加藤広海 大坪嘉行 永田裕二 津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016

    • Author(s)
      大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第10回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学大岡山キャンパス(東京都、目黒区)
    • Year and Date
      2016-03-04
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016

    • Author(s)
      大坪 嘉行, 永田 裕二, 津田 雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道、札幌市)
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016

    • Author(s)
      佐藤拓哉、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016

    • Author(s)
      野々山翔太、佐藤拓哉、岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会シンポジウム「環境での遺伝子リスクの醸成:薬剤耐性と病原性の遺伝子伝播」
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • Author(s)
      按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会ワークショップ12「ゲノムとOMICSの比較から現れた遺伝と進化をめぐる驚き」
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県、仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Invited / Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学弥生キャンパス(東京都、文京区)
    • Year and Date
      2015-06-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-26660054
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015

    • Author(s)
      Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15
    • Int'l Joint Research
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015

    • Author(s)
      稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      東京大学弥生キャンパス(東京都、文京区)
    • Year and Date
      2015-06-29
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会シンポジウム「環境での遺伝子リスクの醸成:薬剤耐性と病原性の遺伝子伝播」
    • Place of Presentation
      土浦亀城プラザ(茨城県、土浦市)
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • Author(s)
      按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究、三井久幸
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015

    • Author(s)
      按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
    • Organizer
      日本遺伝学会第87回大会ワークショップ12「ゲノムとOMICSの比較から現れた遺伝と進化をめぐる驚き」
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス(宮城県、仙台市)
    • Year and Date
      2015-09-24
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015

    • Author(s)
      加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
    • Organizer
      第30回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      土浦
    • Year and Date
      2015-10-17
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292206
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • Author(s)
      永田裕二,平野丈,宇井博紀,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014

    • Author(s)
      大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014

    • Author(s)
      荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014

    • Author(s)
      佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • Author(s)
      永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 土壌微生物の移植メタゲノム2014

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014

    • Author(s)
      永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014

    • Author(s)
      大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014

    • Author(s)
      大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014

    • Author(s)
      佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014

    • Author(s)
      小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014

    • Author(s)
      荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第29回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013

    • Author(s)
      Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, German
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の接合伝達開始配列の解析2013

    • Author(s)
      岸田康平,井上慧,宮崎亮,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013

    • Author(s)
      加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
    • Organizer
      第29回日本微生物生態学会年次大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会 第20回記念フロンティアシンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二ら
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • Author(s)
      永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会 第20回記念フロンティアシンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会第20回記念フロンティアシンポジウム
    • Place of Presentation
      日仙台(招待講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • Author(s)
      永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013

    • Author(s)
      永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二,森内良太,田中裕興,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • Author(s)
      永田裕二ら
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013

    • Author(s)
      Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, Germany
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013

    • Author(s)
      岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      北九州
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013

    • Author(s)
      永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年大会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台)(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013

    • Author(s)
      佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      第7回 日本ゲノム微生物学会 若手の会 研究会
    • Place of Presentation
      静岡県駿東郡
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013

    • Author(s)
      永田裕二ら
    • Organizer
      第7回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      長浜
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • Author(s)
      Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, Germany
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-25292043
  • [Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会第20回記念フロンティアシンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013

    • Author(s)
      Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
    • Organizer
      2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
    • Place of Presentation
      Braunschweig, German
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • Author(s)
      Y. Nagata et al.
    • Organizer
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • Place of Presentation
      Daegu, Korea
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • Author(s)
      永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Metagenomic Analysis of Microbial Community in Soil Contaminated with Aromatic Pollutants2012

    • Author(s)
      M. Tsuda, 5 人, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, A. Fujiyama, and K. Kurokawa
    • Organizer
      Japan-Finland Biotechnology Symposium2012
    • Place of Presentation
      Sendai
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] IncP-7群プラスミドの接合伝達宿主域を規定する因子の探索2012

    • Author(s)
      瀬谷学人,井上慧,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • Author(s)
      永田裕二ら
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • Author(s)
      永田裕二ら
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012

    • Author(s)
      永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
    • Organizer
      第64回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      神戸(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Relationship between intergeneric conjugative transfer of plasmid NAH7 and nitrogen-related phosphotransferase system2012

    • Author(s)
      K. Inoue, R. Miyazaki, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2012
    • Place of Presentation
      Santander, Spain
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • Author(s)
      Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012) Daegu
    • Place of Presentation
      Korea(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • Author(s)
      Yuji Nagata
    • Organizer
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition
    • Place of Presentation
      Daegu, Korea
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を 支える ABC トランスポーター2012

    • Author(s)
      永田裕二 、遠藤諒、 大坪嘉行 、 津田雅孝
    • Organizer
      第7回トランスポーター研究会年会
    • Place of Presentation
      京都(招待講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支えるABCトランスポーター2012

    • Author(s)
      永田裕二、遠藤諒、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      第7回トランスポーター研究会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Multiple plasmids ofγ-hexachlorocylohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp2012

    • Author(s)
      M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      MM-1. International Plasmid Biology Conference 2012
    • Place of Presentation
      Santander, Spain
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • Author(s)
      Y. Nagata et al.
    • Organizer
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • Place of Presentation
      Daegu, Korea
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支えるABCトランスポーター2012

    • Author(s)
      永田裕二ら
    • Organizer
      第7回トランスポーター研究会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Invited
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子群のsinglecellレベルでの発現解析2012

    • Author(s)
      井上慧,宮崎亮,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年大会
    • Place of Presentation
      京都
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012

    • Author(s)
      Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
    • Place of Presentation
      Daegu, Korea(口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-24658068
  • [Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium. "Indo-Swiss-Collaboration inBiotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011

    • Author(s)
      Y. Nagata ,S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguch, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Organizer
      University of Delhi
    • Place of Presentation
      Delhi, India(招待講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis2011

    • Author(s)
      Nagata, Y, et aL
    • Organizer
      Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology"International Conference"Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane(HCH) & Other Chlorinated Contaminants
    • Place of Presentation
      Delhi, India
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達制御に関与する受容菌のリン酸基転移系2011

    • Author(s)
      井上慧,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
    • Organizer
      ゲノム微生物学会ワークショップ
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane)in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al.
    • Organizer
      Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology International ConferenceRecent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants
    • Place of Presentation
      Delhi, India
    • Year and Date
      2011-09-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al
    • Organizer
      "Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexaehlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"
    • Place of Presentation
      Delhi, India
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 「人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム」理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」2011

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      理研和光キャンパス
    • Place of Presentation
      鈴木梅太郎ホール(招待講演)
    • Year and Date
      2011-03-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al.
    • Organizer
      Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology International ConferenceRecent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants
    • Place of Presentation
      Delhi, India
    • Year and Date
      2011-09-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Structural analysis of plasmids for gamma-hexachlorocyclohexanedegradation in Sphingomonas sp2011

    • Author(s)
      M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      MM-1. International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • Place of Presentation
      Sapporo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] Nitrogen-related phosphotransferase system of Pseudomonas putida KT2440 exerts negative effect onconjugative acquisition ofnaphthalene-catabolic plasmid NAH72011

    • Author(s)
      K. Inoue, R. Miyazaki, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
    • Place of Presentation
      Sapporo
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-23658268
  • [Presentation] 人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム2011

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」
    • Place of Presentation
      和光・理研
    • Year and Date
      2011-03-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] 人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム2011

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」
    • Place of Presentation
      和光・理研
    • Year and Date
      2011-03-11
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane) in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis"Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011

    • Author(s)
      Y. Nagata, Y. Ohtsubo, and M.Tsuda
    • Organizer
      University of Delhi
    • Place of Presentation
      Delhi, India(基調講演)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 微生物遺伝子資源の活用技術2011

    • Author(s)
      永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
    • Organizer
      東北大学-産総研連携公開講演会
    • Place of Presentation
      東京・アキバホール
    • Year and Date
      2011-07-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011

    • Author(s)
      Nagata, Y, et al.
    • Organizer
      Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology"International Conference"Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane(HCH) & Other Chlorinated Contaminants
    • Place of Presentation
      Delhi, India
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane) in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis2011

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al
    • Organizer
      "Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"
    • Place of Presentation
      Delhi, India
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 土壌汚染に対する微生物遺伝子プールの変動解析2010

    • Author(s)
      津田雅孝,加藤広海,大坪嘉行,永田裕二
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] 微生物遺伝子資源の活用技術2010

    • Author(s)
      永田裕二, ら
    • Organizer
      東北大学-産総研 連携公開講演会
    • Place of Presentation
      東京・アキバホール
    • Year and Date
      2010-07-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] 細菌機能を利用した難分解性環境汚染物質分解へのアプローチ2010

    • Author(s)
      永田裕二
    • Organizer
      日本農芸化学会2010年大会
    • Place of Presentation
      東京
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20651050
  • [Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Fluctuation of gene pools of soil microbiota induced by contamination with aromatic hydrocarbons2010

    • Author(s)
      H. Kato, 2 人, Y. Ohtsubo, 5 人, Y. Nagata, A. Fujiyama, K. Kurokawa and M. Tsuda
    • Organizer
      13th International Society for Microbial Ecology Conference
    • Place of Presentation
      Seattle, USA
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380176
  • [Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010

    • Author(s)
      Y. Nagata, S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, N. Fujita, and M. Tsuda
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability ofHuman Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy. (口頭発表)
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] 微生物遺伝子資源の活用技術2010

    • Author(s)
      永田裕二, ら
    • Organizer
      東北大学-産総研連携公開講演会
    • Place of Presentation
      東京・アキバホール
    • Year and Date
      2010-07-28
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22380047
  • [Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010

    • Author(s)
      Nagata, Y., et al.
    • Organizer
      14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010

    • Author(s)
      Nagata, Y, et al.
    • Organizer
      14^<th> International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
    • Place of Presentation
      Rimini, Italy
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-22658024
  • [Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in natural environments2008

    • Author(s)
      Y. Nagata, et.al.
    • Organizer
      Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology -Ecology for the Changing World
    • Place of Presentation
      Sendai, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Presentation] Characterization of the traD operon in IncP-9 plasmid NAH7 : a host-range modifier in conjugative transfer2008

    • Author(s)
      Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      Y. Nagata et.al.
    • Organizer
      ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2008-11-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
    • Place of Presentation
      Tokyo
    • Year and Date
      2008-11-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] Characterization of plasmids from gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp2008

    • Author(s)
      Tabata, M, R. Endo, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      MM-1. International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      ISSM satellite symposium Environmental genomics
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2008-11-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Presentation] Reconstruction of transcription networks by the conjugative transfer of IncP plasmids.2008

    • Author(s)
      Miyakoshi, M., H. Nojiri, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      International Plasmid Biology Conference 2008
    • Place of Presentation
      Gdansk, Poland
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      Y. Nagata, et.al.
    • Organizer
      ISSM satellite symposium "Environmental aenomics"
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2008-11-05
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      Y. Nagata
    • Organizer
      ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
    • Place of Presentation
      東京・中央大学
    • Year and Date
      2008-11-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-20651050
  • [Presentation] スフィンゴモナス属類縁細菌群の多彩な難分解性物質分解能を支えるゲノム的基盤2008

    • Author(s)
      永田 裕二, ら
    • Organizer
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-19658030
  • [Presentation] スフィンゴモナス属類縁細菌群の多彩な難分解性物質分解能を支えるゲノム的基盤2008

    • Author(s)
      永田 裕二, ら
    • Organizer
      第2回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in natural environments2008

    • Author(s)
      Nagata,Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology -Ecology for the Changing World
    • Place of Presentation
      Sendai
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in natural environments2008

    • Author(s)
      Y. Nagata, et.al.
    • Organizer
      Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology-Ecology for the Changing World
    • Place of Presentation
      Sendai, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008

    • Author(s)
      Y. Nagata
    • Organizer
      ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
    • Place of Presentation
      東京・中央大学
    • Year and Date
      2008-11-15
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] 分子遺伝学的手法による細菌の土壌環境適応戦略の解明2008

    • Author(s)
      大坪嘉行, 西山衣里, 宮腰昌利, 永田裕二, 津田雅孝
    • Organizer
      2008年度日本生物工学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      仙台
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in naturalenvironments2008

    • Author(s)
      Nagata, Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
    • Organizer
      Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology -Ecology for the Changing World
    • Place of Presentation
      Sendai, Japan
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380054
  • [Presentation] Characterization of the traD gene cluster involved in the conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH72007

    • Author(s)
      Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
    • Organizer
      ASM Conference on Pseudomonas 2007
    • Place of Presentation
      Seattle, Washington, USA.
    • Data Source
      KAKENHI-PROJECT-18380189
  • [Presentation] Haloalkane dehalogenases possess two different structural bases for their enantioselectivity2007

    • Author(s)
      Prokop, Z., Y. Sato, T. Mozga, P. Jerabek, R. Natsume, J. Florian, M. Tsuda, Y. Nagata, T. Senda, and J. Damborsky
    • Organizer
      BIOTRANS 2007 - 8th International Symposium on Biocatalysis and Biotransformations