Nagata Yuji 永田裕二

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NAGATA Yuji 永田裕二

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Researcher Number	30237531
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Affiliation (Current)	2025: 東北大学, 生命科学研究科, 教授
Affiliation (based on the past Project Information) *help	2016 – 2025: 東北大学, 生命科学研究科, 教授 2015: 東北大学, 大学院生命科学研究科, 准教授 2011 – 2015: 東北大学, 生命科学研究科, 准教授 2007 – 2012: Tohoku University, 大学院・生命科学研究科, 准教授 2006: 東北大学, 大学院生命科学研究科, 助教授 … More 2001 – 2005: 東北大学, 大学院・生命科学研究科, 助教授 2001: 東北大学, 大学院・生命科学研究所, 助教授 2001: 東北大学, 生命科学研究科, 助教授 2000: Tohoku University, Institute of Genetic Ecology, Associate Professor, 遺伝生態研究センター, 助教授 1997 – 1999: 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助手 1996: 東京大学, 大学院・農学生命化学研究科, 助手 1994 – 1995: 東京大学, 農学部, 助手 Less
Review Section/Research Field	Principal Investigator Applied microbiology / 応用微生物学・応用生物化学 / Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields / Basic Section 38020:Applied microbiology-related Except Principal Investigator Biological Sciences / 応用微生物学・応用生物化学 / Boundary agriculture / Transformative Research Areas, Section (IV) / Plant nutrition/Soil science / Environmental agriculture(including landscape science) / 基礎ゲノム科学 / Applied microbiology
Keywords	Principal Investigator 環境汚染物質 / BHC / Sphingomonas / 環境細菌 / 炭酸固定 / 可動性遺伝因子 / ゲノム / 細菌進化 / 細菌 / 膜小胞 … More / バイオレメディエーション / 細菌コミュニティ / 低栄養環境 / sphingomonads / hexachlorocyclohexane / Dehalogenase / Dehydrochlorinase / Environmental pollutant / デハロゲナーゼ / 脱塩化水素酵素 / ペリプラズム / 細胞内局在性 / oligotroph / スフィンゴモナス / 微生物機能開発 / 人為起源物質 / 微生物 / periplasm / dehalogenase / 遺伝子水平伝播 / insertion sequence / membrane vesicle / mobile genetic elements / evolution / environmental pollutants / 挿入配列 / 未開拓遺伝子資源 / 極貧栄養環境 / 複合微生物系 / 複合生物系 / adaptation / chlorinated pesticide / transconjugative plasmid / horizontal gene transfer / genome / environmental pollutant / 水平伝達 / 環境適応 / 有機塩素系農薬 / 接合伝達性プラスミド / 水平伝播 / Haloalkane / Naphthalene / Uncultured bacteria / Environmantal DNA / 環境汚染物質川 / 土壌ライブラリー / 機能相補 / ハロアルカンデハロゲナーゼ / 芳香族化合物酸化酵素 / ハロアルカン / ナフタレン / 難培養性細菌 / 環境遺伝子資源 / Cellular localization / Periplasm / Subcellular localization / Xenobiotics / 次世代シーケンサー / 次世代型シーケンサー / グリオキシル酸回路 / スフィンゴモナッド / 進化 / 極貧有機炭素源環境 / 独立栄養細菌 / 微生物学 / 自然生態系 / 遺伝子伝播 / 遺伝子 / 環境 / バイオテクノロジー / 酵素 / 環境微生物学 / Biodegradation / γ-BHC / biodegradation / Pseudomonas … More Except Principal Investigator ゲノム構造 / 複数本染色体 / セパシア菌 / メタゲノム / 細菌 / プラスミド / 可動遺伝因子 / 遺伝子クローニング / Sphingomonas / Pseudomonas / PCB / Candida maltosa / 分解酵素遺伝子 / 環境汚染 / 遺伝子水平伝播 / 環境細菌 / 鉄レギュロン / トランスポゾン挿入変異 / 染色体理知図 / ネットワーク / 培養実験 / 非線形時系列解析 / 群集ネットワーク / 土壌微生物 / 微生物相互作用 / 有害化学物質 / 土壌汚染防止・浄化 / 微生物間相互作用 / 遺伝子 / 有害化合物 / 汚染土壌浄化 / Hydrolase / Computer modelling / Haloalkane dehalogenase / Biodegradation / Chlroinated compound / Environmental pollutant / catalytic triad / 部位指定変異導入 / ホモロジーモデリング / 基質特異性 / haloalkane / hydrolase / dehalogenase / ハロアルカンデハロゲナーゼ / 加水分解酵素 / コンピューターモデリング / ハロアルカンデトロゲナーゼ / 微生物分解 / 有機塩素系化合物 / 環境汚染物質 / Bioreactor / Regulatory factor / GEMs / バイオリアクター / 制御因子 / 組換え微生物 / Peroxisome / Endoplasmic Reticulum / Acyl-CoA Oxidase / Gene Disruption / Dicarboxylic Acid / n-Alkane / Cytochrome P-450 / Candida tropicalis / アシルCoA オキシダーゼ / チトクロームP450 / 酵母 / 遺伝子工学 / チトクローム P-450 / パーオキシソーム / 小胞体 / アシル-CoAオキシダーゼ / 遺伝子破壊 / ジカルボン酸 / n-アルカン / チトクロームP-450 / 細菌集団 / 環境汚染物質分解 / 接合伝達 / 環境修復 / 環境 / ゲノム進化 / 水平伝播 / 遺伝子治療 / グノミックアイランド / 遺伝子資源 / ゲノミックアイランド / 可動性遺伝因子 / 環境浄化 / 炭素源資化能 / カタボライト抑制 / 染色体複製・分配 / ゲノムショットガンシーケンス / データベース / 環境保全 / ライブラリー / マメ科植物 / ゲノム / 共生 / 根粒菌 / 環境ストレス / 染色体分配 / ゲノムshotgunシーケンス / 環境ホルモン / 環境浄化・再生 / 体腔 / ダイオキシン / スフィンゴ糖脂質 / スフィンゴモナス属細菌 / 可動移動式因子 / 挿入配列 / トランスポゾン挿入突然変異 / 染色体物理地図 Less

Development of efficient utilization system of unexplored genetic resources using gene acquisition ability of bacteriaPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  永田裕二
- Project Period (FY)
  2024 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
- Review Section
  
  Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
- Research Institution
  Tohoku University
Approach to the substance of bacterial extracellular genetic information storage devicePrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Nagata Yuji
- Project Period (FY)
  2022 – 2023
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
- Review Section
  
  Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
- Research Institution
  Tohoku University
Advanced utilization strategies of beneficial bacteria based on the survival and growth mechanisms of bacteria under poor conditionsPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  永田裕二
- Project Period (FY)
  2022 – 2024
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Review Section
  
  Basic Section 38020:Applied microbiology-related
- Research Institution
  Tohoku University
土壌微生物機能発揮の鍵となる群集・メタゲノム構造の特定
- Principal Investigator
  
  近藤倫生
- Project Period (FY)
  2021 – 2025
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Transformative Research Areas (A)
- Review Section
  
  Transformative Research Areas, Section (IV)
- Research Institution
  Tohoku University
Development of practical use of useful bacteria by understanding their behavior in the environmentPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Nagata Yuji
- Project Period (FY)
  2019 – 2021
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Review Section
  
  Basic Section 38020:Applied microbiology-related
- Research Institution
  Tohoku University
Soil-derived bacterial consortium capable of degrading chemical pollutant: interaction between pollutant-degrader and co-residing non-degraders
- Principal Investigator
  
  Tsuda Masataka
- Project Period (FY)
  2017 – 2019
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Plant nutrition/Soil science
- Research Institution
  Tohoku University
Behavior of environmental bacteria in microbial community and oligotrophic growth statePrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Nagata Yuji
- Project Period (FY)
  2016 – 2017
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
Studies on metabolic pathway involved in oligotrophic growth of heterotrophic bacteriaPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Nagata Yuji
- Project Period (FY)
  2014 – 2015
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
Mechanisms for acquiring ability to degrade novel compounds in sphingomonads and their applicationsPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  Nagata Yuji
- Project Period (FY)
  2013 – 2015
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
Behavior of microbial community in the environment polluted by aromatic compound
- Principal Investigator
  
  Tsuda Masataka
- Project Period (FY)
  2013 – 2015
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Environmental agriculture(including landscape science)
- Research Institution
  Tohoku University
Studies on oligotrophic mutants of an aerobic heterotrophic bacteriumPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  2012 – 2013
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
Bacterial genetic determinants that control horizontal transfer of genes for degradation of environmental pollutants
- Principal Investigator
  
  TSUDA Masataka
- Project Period (FY)
  2011 – 2012
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- Research Field
  
  Boundary agriculture
- Research Institution
  Tohoku University
Studies on molecular mechanisms for functional evolution of bacteria in the environmentPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  2010 – 2012
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
Response of soil microbial community to exposure of environmental pollutants
- Principal Investigator
  
  TSUDA Masataka
- Project Period (FY)
  2010 – 2012
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Boundary agriculture
- Research Institution
  Tohoku University
Genomic organization and genomic dynamism of versatile sphingomonadsPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  2010 – 2011
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
培養非依存的手法を用いた自然生態系からの新規プラスミドの取得とその多様性の解明
- Principal Investigator
  
  津田雅孝
- Project Period (FY)
  2008 – 2009
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
- Research Field
  
  基礎ゲノム科学
- Research Institution
  Tohoku University
挿入配列の土壌環境での動態の解明と新規遺伝子獲得への応用Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  永田裕二
- Project Period (FY)
  2007 – 2008
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Exploratory Research
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
Comprehensive development of bacterial ability for the degradation ofchlorinated environmental pollutants using unexplored genetic sourcesPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  2006 – 2008
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
Horizontal transfer of bacterial genes for degradation of environmental pollutants
- Principal Investigator
  
  TSUDA Masataka
- Project Period (FY)
  2006 – 2008
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  Boundary agriculture
- Research Institution
  Tohoku University
セパシア菌ゲノムの構造と多様化・進化に関する研究
- Principal Investigator
  
  津田雅孝
- Project Period (FY)
  2004
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Tohoku University
Study of genome of pesticide-degrading bacteria as a representative of environmental bacteriumPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  2004 – 2005
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
セパシア菌のゲノム構造とその再編成・多様化・進化に関する研究
- Principal Investigator
  
  津田雅孝
- Project Period (FY)
  2003
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Tohoku University
全ゲノム塩基配列情報に基づく根粒菌の共生機構の解明
- Principal Investigator
  
  南澤究
- Project Period (FY)
  2003
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  Applied microbiology
- Research Institution
  Tohoku University
セパシア菌ゲノムを構成する3種染色体の構造とその可塑性に関する研究
- Principal Investigator
  
  津田雅孝
- Project Period (FY)
  2002
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Tohoku University
セパシア菌のゲノム構造とその可塑性に関する研究
- Principal Investigator
  
  津田雅孝
- Project Period (FY)
  2001
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Tohoku University
スフィンゴモナス属細菌を用いる環境浄化システム構築基盤
- Principal Investigator
  
  村田幸作
- Project Period (FY)
  2001
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  Kyoto University
Isolation and characterization of a novel gene for degradation of environmental pollutants from environmental genetic sourcePrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  2001 – 2002
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  Tohoku University
セパシア菌ゲノムの分子遺伝学的研究
- Principal Investigator
  
  TSUDA Masataka
- Project Period (FY)
  2000
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
- Review Section
  
  Biological Sciences
- Research Institution
  Tohoku University
Study on a novel dehydrochlorinase from BHC-degrading bacteriumPrincipal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  1999 – 2000
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  Tohoku University
  The University of Tokyo
Mechanism-Based Biodegradability Prediction of Dehalogenase
- Principal Investigator
  
  OHTA Akinori, 高木正道
- Project Period (FY)
  1998 – 1999
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B).
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  The University of Tokyo
Construction of effective PCB-degradation bioreactor by modification of regulatory system of PCB-degrading bacterium using genetic engineering.
- Principal Investigator
  
  TAKAGI Masamichi
- Project Period (FY)
  1997 – 1998
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  The University of Tokyo
Studies on location of xenobiotics degradation in the cell of BHC-degrading bacterium.Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  NAGATA Yuji
- Project Period (FY)
  1997 – 1998
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  The University of Tokyo
殺虫剤BHC分解に関与する脱塩素酵素群のグラム陰性細菌細胞内局在性に関する研究Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  永田裕二
- Project Period (FY)
  1996
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  The University of Tokyo
殺虫剤BHC分解に関与するPseudomonas属細菌の新規脱塩素酵素系の解析Principal Investigator
- Principal Investigator
  
  永田裕二
- Project Period (FY)
  1995
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  The University of Tokyo
Genetic Engineering of Long Chain Dicarboxylic Acid Production in Yeast
- Principal Investigator
  
  OHTA Akinori
- Project Period (FY)
  1994 – 1995
- Research Category
  
  Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research (B)
- Research Field
  
  応用微生物学・応用生物化学
- Research Institution
  The University of Tokyo

[Book] DNA Traffic in the Environment2019
- Author(s)
  Nagata Yuji、Kato Hiromi、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
- Total Pages
  278
- Publisher
  Springer
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2016
- Author(s)
  Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
- Publisher
  ASM Press, Washington, DC
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2015
- Author(s)
  Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
- Publisher
  ASM Press, Washington, DC
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Book] Manual of Environmental Microbiology, 4th Edition2015
- Author(s)
  Nagata Y, Tabata M, Ohtsubo, Y, Tsuda M
- Publisher
  ASM Press, Washington, DC
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Book] Appearance and evolution ofγ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. (In : Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds)) Biodegradative Bacteria.2014
- Author(s)
  Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
- Publisher
  Springer Verlag, Tokyo( doi:10.1007/978-4-431-54520-0_2)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. (In : Nojiri H, Tsuda M, Fukuda M, Kamagata Y (eds) )Biodegradative Bacteria.2014
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y, Tsuda M
- Publisher
  Springer Verlag, Tokyo(doi:10.1007/978-4-431-54520-0_14)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Book] Appearance and evolution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. In Biodegradative Bacteria2014
- Author(s)
  Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
- Total Pages
  358
- Publisher
  Springer Verlag, Tokyo
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
- Total Pages
  358
- Publisher
  Springer Verlag, Tokyo
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems. In Biodegradative Bacteria2014
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nishiyama E, Ishibashi Y, Nagata Y Tsuda M
- Total Pages
  358
- Publisher
  Springer Verlag, Tokyo
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Book] Appearance and evolution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria. In Biodegradative Bacteria2014
- Author(s)
  Nagata Y, Tabata M, Ohhata S, Tsuda M
- Total Pages
  358
- Publisher
  Springer Verlag, Tokyo
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Book] 酵素利用技術大系2010
- Author(s)
  永田裕二
- Publisher
  株)エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Book] 酵素利用技術体系(脱ハロゲン酵素)2010
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Publisher
  エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Book] 脱ハロゲン酵素, 酵素利用技術体系2010
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Publisher
  エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Book] 環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス「難培養性微生物研究の最新技術II」2010
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Publisher
  シーエムシー出版
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Book] 難培養微生物研究の最新技術II2010
- Author(s)
  永田裕二
- Publisher
  シーエムシー出版
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Book] 「酵素利用技術体系」(部分執筆pp939-948:「脱ハロゲン酵素」)2010
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Publisher
  エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Book] 「難培養性微生物研究の最新技術II」(部分執筆pp211-219:「環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス」)2010
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Publisher
  シーエムシー出版
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Book] 難培養性微生物研究の最新技術II(環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス)2010
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Publisher
  シーエムシー出版
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Book] 環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス「難培養性微生物研究の最新技術II」(大熊盛也,工藤俊章編集)2010
- Author(s)
  永田裕二,津田雅孝
- Publisher
  シーエムシー出版
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Book] 難培養性細菌も研究対象とするメタゲノム解「バイオフィルムの基礎と制御 : 特性・解析事例から形成防止・有効利用まで」2008
- Author(s)
  永田裕二, 津田雅孝
- Publisher
  エヌ・ティー・エス社
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Book] バイオフィルムの基礎と制御(部分執筆)2008
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Total Pages
  399
- Publisher
  株式会仕エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19658030
[Book] 難培養性細菌も研究対象とするメタゲノム解析「バイオフィルムの基礎と制御」2008
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Publisher
  103-111株式会社エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Book] バイオフィルムの基礎と制御:特性・解析事例から形成防止・有効利用まで2008
- Author(s)
  永田裕二
- Publisher
  エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Book] バイオフィルムの基礎と制御(部分執筆)2008
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Total Pages
  399
- Publisher
  株式会社エヌ・ティー・エス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Book] 土壌環境細菌の比較ゲノム「比較ゲノム学から読み解く生命システム-基本概念から最新ゲノム情報まで-」(藤山秋佐夫監修)2007
- Author(s)
  津田雅孝, 永田裕二, 大坪嘉行
- Publisher
  秀潤社
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Book] 「比較ゲノム学から読み解く生命システム-基本概念から最新ゲノム情報まで(細胞工学別冊)」2007
- Author(s)
  津田雅孝、永田裕二、大坪嘉行
- Publisher
  土壌環境細菌の比較ゲノム
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Book] Strategies to reveal genomic function in natural soil systems In:Nojiri, H., M. Tsuda, M. Fukuda, and Y. Kamagata (eds)
- Author(s)
  Y. Ohtsubo, E. Nishiyama, Y. Ishibashi, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Publisher
  Biodegradative Bacteria. Springer Verlag, Tokyo
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] Three distinct metabolic phases of PCB/biphenyl degrader Acidovorax sp. KKS102 in nutrient broth2024
- Author(s)
  Sakai K, Kishida, K, Matsumoto, S Nagata Y, Tsuda M, Ohtsubo Y
- Journal Title
  
  Biosci. Biotechnol. Biochem.
  
  Volume: 88 Issue: 3 Pages: 305-315
- DOI
  10.1093/bbb/zbad178
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] Clamping-mediated incorporation of single-stranded DNA with concomitant DNA synthesis by Taq polymerase involves nick-translation2024
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Kawahara S, Nagata Y
- Journal Title
  
  Scientific Reports
  
  Volume: 14 Issue: 1 Pages: 2030-2030
- DOI
  10.1038/s41598-024-52095-3
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] Degradation of DDT by γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA2024
- Author(s)
  usuf Habibullah KO, Ito R, Stari L, Kishida K, Ohtsubo Y, Masai E, Fukuda M, Miyauchi K, Nagata Y
- Journal Title
  
  Biosci. Biotechnol. Biochem.
  
  Volume: 88 Issue: 1 Pages: 123-130
- DOI
  10.1093/bbb/zbad141
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] Frontier of chemically synthesized pesticide degradation by soil bacteria2023
- Author(s)
  永田裕二、加藤広海、大坪嘉行
- Journal Title
  
  Japanese Journal of Pesticide Science
  
  Volume: 48 Issue: 2 Pages: 125-131
- DOI
  10.1584/jpestics.W23-22
- ISSN
  2187-0365, 2187-8692
- Year and Date
  2023-08-20
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] Draft genome sequence of Cupriavidus sp. strain TKC, isolated from a γ-hexachlorocyclohexane-degrading community2023
- Author(s)
  Kato H,　Ohtsubo Y, Hirano S, Masuda S, Shibata A, Shirasu K, Nagata Y
- Journal Title
  
  Microbiology Resource Announcements
  
  Volume: 12 Issue: 12 Pages: 00567-23
- DOI
  10.1128/mra.00567-23
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] Host range of strand-biased circularizing integrative elements: a new class of mobile DNA elements nesting in Gammaproteobacteria2023
- Author(s)
  Idola Desmila、Mori Hiroshi、Nagata Yuji、Nonaka Lisa、Yano Hirokazu
- Journal Title
  
  Mobile DNA
  
  Volume: 14 Issue: 1 Pages: 1-23
- DOI
  10.1186/s13100-023-00295-5
- Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K05790, KAKENHI-PROJECT-18K05790, KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] たったひとつの遺伝子の発現でかすみを食べる細菌に2023
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  Seibutsu-kogaku Kaishi
  
  Volume: 101 Issue: 10 Pages: 554-554
- DOI
  10.34565/seibutsukogaku.101.10_554
- ISSN
  0919-3758, 2435-8630
- Year and Date
  2023-10-25
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] Reconstruction of a Soil Microbial Network Induced by Stress Temperature2022
- Author(s)
  Yang Dailin、Kato Hiromi、Kawatsu Kazutaka、Osada Yutaka、Azuma Toyohiro、Nagata Yuji、Kondoh Michio
- Journal Title
  
  Microbiology Spectrum
  
  Volume: 10 Issue: 5
- DOI
  10.1128/spectrum.02748-22
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PROJECT-18K14797, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-19H05641, KAKENHI-PROJECT-19H03299, KAKENHI-PROJECT-19H02865, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] CO2-dependent High-yield Growth of a Heterotrophic Bacterium under Oligotrophic Conditions2022
- Author(s)
 永田裕二、加藤広海、大坪嘉行
- Journal Title
 
 Journal of Environmental Biotechnology
 
 Volume: 22 Issue: 1 Pages: 9-13
- DOI
 10.50963/jenvbio.22.1_9
- ISSN
 1347-1856, 2436-5041
- Language
 Japanese
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
 KAKENHI-PROJECT-22K19124, KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-19H02865, KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Journal Article] Algorisms used for in silico finishing of bacterial genomes based on short-read assemblage implemented in GenoFinisher, AceFileViewer, and ShortReadManager2022
- Author(s)
  Ohtsubo Yoshiyuki、Hirose Yuu、Nagata Yuji
- Journal Title
  
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
  
  Volume: 86 Issue: 6 Pages: 693-703
- DOI
  10.1093/bbb/zbac032
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Genome evolution related to γ-hexachlorocyclohexane metabolic function in the soil microbial population2022
- Author(s)
  Kato Hiromi、Su Lijun、Tanaka Ayami、Katsu Honami、Ohtsubo Yoshiyuki、Otsuka Shigeto、Senoo Keishi、Nagata Yuji
- Journal Title
  
  Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
  
  Volume: 86 Issue: 6 Pages: 800-809
- DOI
  10.1093/bbb/zbac042
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Microbial communities developing within bulk sediments under fish carcasses on a tidal flat2021
- Author(s)
  Kawamoto Y, Kato H, Nagata Y, and Urabe J
- Journal Title
  
  PLOS ONE
  
  Volume: 16 Issue: 2 Pages: e0247220-e0247220
- DOI
  10.1371/journal.pone.0247220
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces carbon dioxide-dependent high-yield growth under oligotrophic conditions2020
- Author(s)
  Shinnosuke Inaba, Hironori Sakai, Hiromi Kato, Takayuki Horiuchi, Hirokazu Yano, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, and Yuji Nagata
- Journal Title
  
  Microbiology
  
  Volume: 166 Issue: 6 Pages: 531-545
- DOI
  10.1099/mic.0.000908
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Structural and catalytic effects of surface loop-helix transplantation within haloalkane dehalogenase family2020
- Author(s)
  Marek M, Chaloupkova R, Prudnikova T, Sato Y, Rezacova P, Nagata Y, Smatanova IK, Damborsky J
- Journal Title
  
  Computational and Structural Biotechnology Journal
  
  Volume: 18 Pages: 1352-1362
- DOI
  10.1016/j.csbj.2020.05.019
- Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Transcriptome Analysis of Zygotic Induction During Conjugative Transfer of Plasmid RP42020
- Author(s)
  Miyakoshi Masatoshi、Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
- Journal Title
  
  Frontiers in Microbiology
  
  Volume: 11 Pages: 1125-1125
- DOI
  10.3389/fmicb.2020.01125
- NAID
  120007165442
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H03464, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] A transcriptional regulator, IscR, of Burkholderia multivorans acts as both repressor and activator for transcription of iron-sulfur cluster-biosynthetic isc operon2020
- Author(s)
  Nonoyama S, Kishida K, Sakai K, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M
- Journal Title
  
  Research in Microbiology
  
  Volume: 171 Issue: 8 Pages: 319-330
- DOI
  10.1016/j.resmic.2020.06.005
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Special Issue: Microbial degradation of xenobiotics2020
- Author(s)
  Nagata Y
- Journal Title
  
  Microorganisms
  
  Volume: 8 Issue: 4 Pages: 487-487
- DOI
  10.3390/microorganisms8040487
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] 従属栄養細菌のCO2依存的な極貧栄養環境適応2020
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  イオサイエンスとインダストリー
  
  Volume: 78 Pages: 498-500
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Lessons from the genomes of lindane‐degrading sphingomonads2019
- Author(s)
  Nagata Yuji、Kato Hiromi、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
- Journal Title
  
  Environmental Microbiology Reports
  
  Volume: 11 Issue: 5 Pages: 630-644
- DOI
  10.1111/1758-2229.12762
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Conjugative Transfer of IncP-9 Catabolic Plasmids Requires a Previously Uncharacterized Gene, mpfK, Whose Homologs Are Conserved in Various MPFT-Type Plasmids2019
- Author(s)
  Kishida Kouhei、Nonoyama Shouta、Lukas Tim、Kawahara Shotaro、Kudo Koji、Nagata Yuji、Ohtsubo Yoshiyuki、Tsuda Masataka
- Journal Title
  
  Applied and Environmental Microbiology
  
  Volume: 85 Issue: 24
- DOI
  10.1128/aem.01850-19
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Properties and efficient scrap-and-build repairing of mechanically sheared 3’ DNA ends2019
- Author(s)
  Ohtsubo Yoshiyuki、Sakai Keiichiro、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
- Journal Title
  
  Communications Biology
  
  Volume: 2 Issue: 1 Pages: 409-409
- DOI
  10.1038/s42003-019-0660-7
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] Suppression of substrate inhibition in phenanthrene-degrading Mycobacterium by co-cultivation with a non-degrading Burkholderia strain.2019
- Author(s)
  Natsumi Ogawa, Hiromi Kato, Kouhei Kishida, Eikichi Ichihashi, Taichiro Ishige, Hirofumi Yoshikawa, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiology
  
  Volume: 印刷中 Issue: 6 Pages: 625-637
- DOI
  10.1099/mic.0.000801
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K18665, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Journal Article] 汚染物質分解コンソーシアムにおけるキープレイヤーとオーディエンス2018
- Author(s)
  加藤広海、小川なつみ、津田雅孝、永田祐二
- Journal Title
  
  Journal of Environmental Biotechnology
  
  Volume: 18 Pages: 15-20
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Journal Article] Establishment of plasmid vector and allelic exchange mutagenesis systems in a mycobacterial strain that is able to degrade polycyclic aromatic hydrocarbon.2018
- Author(s)
  Kishida K, Ogawa N, Ichihashi E, Kato H, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M.
- Journal Title
  
  Bioscience, biotechnology, and biochemistry
  
  Volume: 82 Issue: 7 Pages: 1-3
- DOI
  10.1080/09168451.2018.1445522
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K18665, KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Journal Article] Optimization of single strand DNA incorporation reaction by Moloney murine leukaemia virus reverse transcriptase2018
- Author(s)
  Ohtsubo Yoshiyuki、Sasaki Haruna、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
- Journal Title
  
  DNA Research
  
  Volume: 25 Issue: 5 Pages: 477-487
- DOI
  10.1093/dnares/dsy018
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Journal Article] Efficient N-tailing of blunt DNA ends by Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase.2017
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
- Journal Title
  
  Sci Rep
  
  Volume: 7 Issue: 1 Pages: 41769-41769
- DOI
  10.1038/srep41769
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Journal Article] Compounds that enhance the tailing activity of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase2017
- Author(s)
  Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
- Journal Title
  
  Sci Rep
  
  Volume: 7 Issue: 1 Pages: 6520-6520
- DOI
  10.1038/s41598-017-04765-8
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Journal Article] The Small Protein HemP Is a Transcriptional Activator for the Hemin Uptake Operon in Burkholderia multivorans ATCC 176162017
- Author(s)
  Sato T, Nonoyama S, Kimura A, Nagata Y, Ohtsubo Y, Tsuda M.
- Journal Title
  
  Appl Environ Microbiol.
  
  Volume: 83 Issue: 16
- DOI
  10.1128/aem.00479-17
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-17H03781, KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Journal Article] Complete genome sequence of Bradyrhizobium diazoefficiens USDA 122,a nitrogen-fixing soybean symbiont2017
- Author(s)
  Masayuki Sugawara, Takahiro Tsukui, Takakazu Kaneko, Yoshiyuki Ohtsubo, Shusei Sato, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Kiwamu Minamisawa.
- Journal Title
  
  Genome Announc.
  
  Volume: 5(9) Issue: 9
- DOI
  10.1128/genomea.01743-16
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Journal Article] Host Range of the Conjugative Transfer System of IncP-9 Naphthalene-Catabolic Plasmid NAH7 and Characterization of Its oriT Region and Relaxase.2016
- Author(s)
  Kishida K, Inoue K, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M.
- Journal Title
  
  Appl Environ Microbiol
  
  Volume: 83 Issue: 1
- DOI
  10.1128/aem.02359-16
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Journal Article] Complete genome sequence of a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium sp. strain MI12052016
- Author(s)
  Tabata M, Ohhata S, Nikawadori Y, Sato T, Kishida K, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 4 Issue: 2
- DOI
  10.1128/genomea.00246-16
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Complete genome sequence of Methylobacterium sp. strain AMS5, an isolate from a soybean stem2016
- Author(s)
  Tomoyuki Minami, Yoshiyuki Ohtsubo, Mizue Anda, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Hisayuki Mitsui, Masayuki Sugawara, Kiwamu Minamisawa
- Journal Title
  
  Genome Announc.
  
  Volume: 4(2) Issue: 2
- DOI
  10.1128/genomea.00144-16
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Complete Genome sequence of a gamma-hexachlorocyclohexane degrader, Sphingobium sp. Strain TKS, which was isolated from a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading microbial community2016
- Author(s)
  Tabata M, Ohhata S, Kawasumi T, Nikawadori Y, Kishida K, Sato T, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 4 Issue: 2
- DOI
  10.1128/genomea.00247-16
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Comparison of the complete genome sequences of four γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains: insights into the evolution of bacteria able to degrade a recalcitrant man-made pesticide.2016
- Author(s)
  Tabata M, Ohhata S, Nikawadori Y, Kishida K, Sato T, Kawasumi T, Kato H, Ohtsubo Y, Tsuda M, Nagata Y.
- Journal Title
  
  DNA Res.
  
  Volume: 6 Issue: 6 Pages: 581-599
- DOI
  10.1093/dnares/dsw041
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-15H04471, KAKENHI-PROJECT-16K14877, KAKENHI-PROJECT-16K18665
[Journal Article] Biodegradation of gamma-hexachlorocyclohexane by transgenic hairy root cultures of Cucurbita moschata that accumulate recombinant bacterial LinA2016
- Author(s)
  Nanasato, Y., Namiki, S., Ohsima, M., Moriuchi R., Konagaya, K., Seike, N., Otani, T., Nagata, Y., Tsuda, M., Tabei, Y.
- Journal Title
  
  Plant Cell Reports
  
  Volume: 35 Issue: 9 Pages: 1963-1974
- DOI
  10.1007/s00299-016-2011-1
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Journal Article] Complete genome sequence of a polyvinyl alcohol-degrading strain Sphingopyxis sp. 113P3 (NBRC 111507)2015
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nagata, Y. Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 3 Issue: 5
- DOI
  10.1128/genomea.01169-15
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Properties and biotechnological applications of natural and engineered haloalkane dehagoneases2015
- Author(s)
  Nagata Y, Ohtsubo, Y, Tsuda M
- Journal Title
  
  Applied Microbiology and Biotechnology
  
  Volume: 99 Issue: 23 Pages: 9865-9881
- DOI
  10.1007/s00253-015-6954-x
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader, Mycobacterium sp. strain EPa45 (NBRC 110737), isolated from a phenanthrene-degrading consortium.2015
- Author(s)
  Kato H, Ogawa N, Ohtsubo Y, Oshima K, Toyoda A, Mori H, Nagata Y, Kurokawa K, Hattori M, Fujiyama A, Tsuda M
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 3 Issue: 4
- DOI
  10.1128/genomea.00782-15
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Complete genome sequence of a polypropylene glycol and polyethylene glycol-degrading strain Sphingopyxis macrogoltabida EY-12015
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 3 Issue: 6
- DOI
  10.1128/genomea.01399-15
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Complete genome sequence of Sphingompyxis macrogoltabidus type strain NBRC 15033, originally isolated as a polyethylene glycol-degrader2015
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 3 Issue: 6
- DOI
  10.1128/genomea.01401-15
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Complete genome sequence of a phenanthrene degrader Burkholderia sp. HB-1 (NBRC:110738)2015
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Moriya A, Kato H, Ogawa N, Nagata Y, Tsuda M
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 3 Issue: 6
- DOI
  10.1128/genomea.01283-15
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Complete genome sequence of a polypropylene glycol-degrading strain Microbacterium sp. No.72015
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Nagata, Y, Numata M, Tsuchikane K, Hosoyama A, Yamazoe A, Tsuda M, Fujita N, Kawai F
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 3 Issue: 6
- DOI
  10.1128/genomea.01400-15
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Bacterial clade with the ribosomal RNA operon on a small plasmid rather than the chromosome2015
- Author(s)
  Mizue Anda, Yoshiyuki Ohtsubo, Takashi Okubo, Masayuki Sugawara, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, Kiwamu Minamisawa, and Hisayuki Mitsui
- Journal Title
  
  Proc Natl Acad Sci U S A.
  
  Volume: 112(46) Issue: 46 Pages: 14343-14347
- DOI
  10.1073/pnas.1514326112
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26252065, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Isolation of oxygenase genes for indigo-forming activity from an artificially polluted soil metagenome by functional screening using Pseudomonas putida strains as hosts2015
- Author(s)
  Hifofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Akira Ono, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, and Masataka Tsuda
- Journal Title
  
  Applied Microbiology and Biotechnology
  
  Volume: in press Issue: 10 Pages: 4453-4470
- DOI
  10.1007/s00253-014-6322-2
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
[Journal Article] Time-series metagenomic analysis reveals robustness of soil microbiome against chemical disturbance.2015
- Author(s)
  Kato H, Mori H, Maruyama F, Toyoda A, Oshima K, Endo R, Fuchu G, Miyakoshi M, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Hattori M, Fujiyama A, Kurokawa K, Tsuda M
- Journal Title
  
  DNA Research
  
  Volume: 22 Issue: 6 Pages: 413-424
- DOI
  10.1093/dnares/dsv023
- NAID
  120005850199
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-221S0002, KAKENHI-PROJECT-26660054, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-15H04471
[Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genetic determinants for fitness in soil by using signature-tagged mutagenesis. Microbiology2014
- Author(s)
  Nagata, Y., J. Senbongi, Y. Ishibashi, R. Sudo, M. Miyakoshi, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiology
  
  Volume: in press Issue: 5 Pages: 883-891
- DOI
  10.1099/mic.0.077057-0
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
[Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genetic determinants for fitness in soil by using signature-tagged mutagenesis2014
- Author(s)
  Yuji Nagata, Junko Senbongi, Yoko Ishibashi, Rie Sudo, Masatoshi Miyakoshi, Yoshiyuki, Ohtsubo, Masataka Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiology
  
  Volume: 160 Pages: 883-891
- Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Journal Article] Complete genome sequence of the thermophilic PCB degrader Geobacillus sp. JF8 (NBRC 109937)2014
- Author(s)
  Shintani, M., Y. Ohtsubo, K. Fukuda, A. Hosoyama, S. Ohji, A. Yamazoe, N. Fujita, Y. Nagata, M. Tsuda, T. Hatta, and K. Kimbara
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 2 Issue: 1
- DOI
  10.1128/genomea.01213-13
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206
[Journal Article] Complete genome sequence of Pseudomonas aeruginosa MTB-1 isolated from a microbial community enriched by the technical formulation of hexachlorocyclohexane.2014
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., T. Sato, K. Kishida, M. Tabata, Y. Ogura, T. Hayashi, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 2 Issue: 1
- DOI
  10.1128/genomea.01130-13
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-221S0002
[Journal Article] Structural and Functional Analysis of Novel Haloalkane Dehalogenase with Two Halide-Binding Sites2014
- Author(s)
  Chaloupkova R, Prudnikova T, Rezacova P, Prokop Z, Koudelakova T, Daniel L, Brezovsky J, Ikeda-Ohtsubo W, Sato Y, Kuty M, Nagata Y, Smatanova IK, Damborsky J
- Journal Title
  
  Acta Crystallographica Section D
  
  Volume: D70 Issue: 7 Pages: 1884-1897
- DOI
  10.1107/s1399004714009018
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-26660054
[Journal Article] Stepwise enhancement of catalytic performance of haloalkane dehalogenase LinB towards β-hexachlorocyclohexane2014
- Author(s)
  Ryota Moriuchi, Hiroki Tanaka, Yuki Nikawadori, Mayuko Ishitsuka, Michihiro Ito, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Jiri Damborsky, Zbynek Prokop, and Yuji Nagata
- Journal Title
  
  AMB Express
  
  Volume: 4 Issue: 1 Pages: 72-72
- DOI
  10.1186/s13568-014-0072-5
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-26660054
[Journal Article] Complete Genome Sequence of Pseudomonas sp. Strain TKP, Isolated from a gamma-Hexachlorocyclohexane-Degrading Mixed Culture2014
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Kishida K, Sato T, Tabata M, Kawasumi T, Ogura Y, Hayashi T, Tsuda M, Nagata Y
- Journal Title
  
  Genome announcements
  
  Volume: 2 Issue: 1
- DOI
  10.1128/genomea.01241-13
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-221S0002
[Journal Article] γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteria2014
- Author(s)
  Yuji Nagata
- Journal Title
  
  Biodegradative Bacteria: How Bacteria Degrade, Survive, Adapt, and Evolve
  
  Volume: Chapter 2 Pages: 19-41
- DOI
  10.1007/978-4-431-54520-0_2
- ISBN
  9784431545194, 9784431545200
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Journal Article] Coinetgrate-resolution of toluene-catabolic transposon Tn46512013
- Author(s)
  Yano, H., H. Genka, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, E.M. Top, M. Tsuda
- Journal Title
  
  Plasmid
  
  Volume: 69 Issue: 1 Pages: 24-35
- DOI
  10.1016/j.plasmid.2012.07.004
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] The effect of a unique halide-stabilizing residue on the catalytic properties of haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefacience C582013
- Author(s)
  Hassan, K. A. Gora, J. Brezvsky, R. Chaloupkova, H. Moskalikova, A. Fortova, Y. Nagata, J. Damborsky, Z. Prokop
- Journal Title
  
  FEBS J.
  
  Volume: 280 Issue: 13 Pages: 3149-3159
- DOI
  10.1111/febs.12238
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043
[Journal Article] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2,4,6-Trichlorophenol Degrader2013
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T
- Journal Title
  
  Genome announcements
  
  Volume: 1
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Journal Article] Complete Genome Sequence of the γ-Hexachlorocyclohexane-Degrading Bacterium Sphingomonas sp. Strain MM-1.2013
- Author(s)
  Tabata M, Ohtsubo Y, Ohhata S, Tsuda M, Nagata Y.
- Journal Title
  
  Genome Announc
  
  Volume: 1 Issue: 3
- DOI
  10.1128/genomea.00247-13
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043
[Journal Article] Design and experimental application of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013
- Author(s)
  Mori H, Maruyama F, Kato H, Toyoda A, Dozono A, Ohtsubo Y, Nagata Y, Fujiyama A, Tsuda M Kurokawa K
- Journal Title
  
  DNA Res
  
  Volume: 21 Issue: 2 Pages: 217-227
- DOI
  10.1093/dnares/dst052
- Peer Reviewed / Open Access
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23310131, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-24770015, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25305013, KAKENHI-PROJECT-221S0002
[Journal Article] Cointegrate-resolutionof toluene-catabolic transposon Tn46512013
- Author(s)
  H. Yano, H. Genka, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, E. M. Top, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  determination of crossover site and the segment required for full resolution activity
  
  Volume: 69 Pages: 24-35
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Journal Article] Complete Genome Sequence of Ralstonia pickettii DTP0602, a 2,4,6-Trichlorophenol Degrader2013
- Author(s)
  Ohtsubo Y, Fujita N, Nagata Y, Tsuda M, Iwasaki T, Hatta T.
- Journal Title
  
  Genome Announcements
  
  Volume: 1 Issue: 6
- DOI
  10.1128/genomea.00903-13
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292206
[Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013
- Author(s)
  永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  Journal of Environmental Biotechnology
  
  Volume: 13 Pages: 51-56
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Journal Article] Inhibitory effect of Pseudomonas putida nitrogen-related phosphotransferase system on conjugative transfer of IncP-9 plasmid from Escherichia coli2013
- Author(s)
  Inoue K, Miyazaki R, Ohtsubo Y, Nagata Y, Tsuda M
- Journal Title
  
  FEMS microbiology letters
  
  Volume: 345 Issue: 2 Pages: 102-109
- DOI
  10.1111/1574-6968.12188
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043, KAKENHI-PROJECT-25292206, KAKENHI-PROJECT-25892034
[Journal Article] Crystal structure and site-directed mutagenesis analyses of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingobium sp. MI1205.2013
- Author(s)
  Masahiko Okai, Jun Ohtsuka, Fabiana L. Imai, Tomoko Mase, Ryota Moriuchi, Masataka Tsuda, Koji Nagata, Yuji Nagata, Masaru Tanokura
- Journal Title
  
  J. Bacteriol.
  
  Volume: 195 Issue: 11 Pages: 2642-2651
- DOI
  10.1128/jb.02020-12
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23228003, KAKENHI-PROJECT-24658068, KAKENHI-PROJECT-25292043
[Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の検索2013
- Author(s)
  永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  Journal of Environmental Biotechnology
  
  Volume: 13(1) Pages: 51-56
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. strain KKS102, which are located on an integrative and conjugative element2012
- Author(s)
  Ohtsubo Y., Y. Ishibashi, H. Naganawa, S. Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, M. Tsuda
- Journal Title
  
  J Bacteriol
  
  Volume: 194 Issue: 16 Pages: 4237-4248
- DOI
  10.1128/jb.00352-12
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS102 located on integrative and conjugative element2012
- Author(s)
  Y. Ohtsubo, 4人, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Bacteriol
  
  Volume: 184 Pages: 4237-4248
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] Povotal role of anthranilate dioxygenase genes in the adaptation of Burkholderia multivorans ATCC17616 in soil2012
- Author(s)
  Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Yamamoto, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  FEMS Microbiology Letters
  
  Volume: 330 Issue: 1 Pages: 46-55
- DOI
  10.1111/j.1574-6968.2012.02532.x
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] ParI, an orphan ParA family protein from Pseudomonas putida KT2440-specific genomic island, interferes with the partition system of IncP-7 plasmids2012
- Author(s)
  Miyakoshi, M., M. Shintani, K. Inoue, T. Terabayashi, F. Sai, M. Ohkuma, H. Nojiri, Y. Nagata, M. Tsuda
- Journal Title
  
  Environ Microbiol
  
  Volume: 14 Issue: 11 Pages: 2946-2959
- DOI
  10.1111/j.1462-2920.2012.02861.x
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] ParI, an orphan ParA family protein from Pseudomonas putida KT2440-specific genomic island,interferes with the partition system of IncP-7 plasmids2012
- Author(s)
  M. Miyakoshi, M. Shintani, K. Inoue, T. Terabayashi, F. Sai, M. Ohkuma, H. Nojiri, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Environ. Microbiol
  
  Volume: 14 Pages: 2946-2959
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Journal Article] Complete genome sequence of Acidovorax sp. KKS102, a polychlorinated biphenyl-degrading strain2012
- Author(s)
  Y. Ohtsubo, F. Maruyama, H. Mitsui, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Bacteriol
  
  Volume: 194 Pages: 6970-6971
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Journal Article] Cloning ofγ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase gene with its flanking regions from soil byactivity-based screening techniques2012
- Author(s)
  Ito, M., A. Ono, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  European J. Soil Biology
  
  Volume: 52 Pages: 16-19
- DOI
  10.1016/j.ejsobi.2012.05.001
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012
- Author(s)
  Kimura, S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiology
  
  Volume: 158 Pages: 1284-1293
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] Conjugal transfer of polychlorinated biphenyl/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS102 located on integrative and conjugative element2012
- Author(s)
  Y. Ohtsubo, Y. Ishibashi, H. Naganawa, S.Hirokawa, S. Atobe, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J, Bacteriol
  
  Volume: 184 Pages: 4237-4248
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of the haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C582012
- Author(s)
  Mase, T., H. Yabuki, M. Okai, J. Ohtsuka, F. L. Imai, Y. Nagata, and M. Tanokura
- Journal Title
  
  Acta Crystallographica Section F
  
  Volume: F68 Issue: 6 Pages: 652-654
- DOI
  10.1107/s1744309112013942
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] Complete genome sequence of Acidovorax sp. KKS102, a polychlorinated biphenyl-degrading strain2012
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., F. Maruyama, H. Mitsui, Y. Nagata, M. Tsuda
- Journal Title
  
  J Bacteriol
  
  Volume: 194 Issue: 24 Pages: 6970-6971
- DOI
  10.1128/jb.01848-12
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-23658268, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] Suppression of pleiotrophic phenotypes of Burkholderia multivorans fur mutant by oxyR mutation2012
- Author(s)
  Kimura, A., S. Yuhara, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiology
  
  Volume: 158 Issue: 5 Pages: 1284-1293
- DOI
  10.1099/mic.0.057372-0
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22380176, KAKENHI-PROJECT-23651183, KAKENHI-PROJECT-24658068
[Journal Article] Development of a crystallization protocol for the DbeA1 variant of novel haloalkane dehalogenase from Bradyrhizobium elkkani USDA942011
- Author(s)
  Prudnikova, T., R. Chalouplova, Y. Sato, Y. Nagata, O. Degtjarik, M. Kuty, P. Rezacova, J. Damborsky, and I. Kuta Smatanova
- Journal Title
  
  Crysta Growth & Design
  
  Volume: 11 Pages: 516-519
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Stereoselectivity and conformational stability of haloalkane dehalogenase DbjA from Bardyrhizobium japonicum USDA110: the effect of pH and temperature2011
- Author(s)
  Chaloupkova, R., Z. Prokop, Y. Sato, Y. Nagata, and J. Damborsky
- Journal Title
  
  FEBS J
  
  Volume: 278 Issue: 15 Pages: 2728-2738
- DOI
  10.1111/j.1742-4658.2011.08203.x
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Biochemical characteristics of the novel haloalkane dehalogenase DatA isolated from the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens C582011
- Author(s)
  Hasan, K., A. Fortova, T. Koudelakova, R. Chalooupkova, M. Ishitsuka, Y. Nagata, J. Damborsky, and Z. Prokop
- Journal Title
  
  Appl. Environ. Microbial
  
  Volume: 77 (5) Issue: 5 Pages: 1881-1884
- DOI
  10.1128/aem.02109-10
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] ハロアルカン脱ハロゲン酵素DbjAの鏡像異性体選択性機構の解明2011
- Author(s)
  佐藤優花里、夏目亮、Zbynek Prokop, Jan Brezovsky, Radka Chaloupkova, Jiri Damborsky、永田裕二、千田俊哉
- Journal Title
  
  日本結晶学会誌
  
  Volume: 53 Pages: 124-129
- NAID
  10028253974
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Molecular Bases of Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenase DbjA2011
- Author(s)
  佐藤優花里、夏目亮、Zbynek Prokop, Jan Brezovsky, Radka Chaloupkova, Jiri Damborsky、永田裕二、千田俊哉
- Journal Title
  
  Nihon Kessho Gakkaishi
  
  Volume: 53 Issue: 2 Pages: 124-129
- DOI
  10.5940/jcrsj.53.124
- NAID
  10028253974
- ISSN
  0369-4585, 1884-5576
- Language
  Japanese
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Enzyme and Microbial Technology
  
  Volume: 49 Issue: 6-7 Pages: 499-508
- DOI
  10.1016/j.enzmictec.2011.10.005
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Nagata, Y., S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Enzyme and Microbial Technology
  
  Volume: 49 Pages: 499-508
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Y. Nagata
- Journal Title
  
  Enzyme and Microbial Technology
  
  Volume: 49 Pages: 499-509
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Journal Article] Genomic organizationand genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Y. Nagata, S. Natsui, R. Endo, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Enzyme Microb. Technol
  
  Volume: 49 Pages: 499-508
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Journal Article] The lin Genes for γ-Hexachlorocyclohexane Degradation in Sphingomonas sp. MM-1 Proved to Be Dispersed across Multiple Plasmids2011
- Author(s)
 Tabata, M., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Journal Title
 
 Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry
 
 Volume: 75 Issue: 3 Pages: 466-472
- DOI
 10.1271/bbb.100652
- NAID
 10028201533
- ISSN
 0916-8451, 1347-6947
- Language
 English
- Peer Reviewed
- Data Source
 KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Y.Nagata
- Journal Title
  
  Enzyme and Microbial Technology
  
  Volume: 49 Pages: 499-508
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypalgamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Y. Nagata, 3人, Y. Ohtsubo, 5人, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Enzyme Microb. Technol
  
  Volume: 49 Pages: 499-508
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] The lin genes for gamma-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp. MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids2011
- Author(s)
  M. Tabata, R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  Biosci. Biotechnol. Biochem
  
  Volume: 75 Pages: 466-472
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Journal Article] Stereoselectivity and conformational stability of haloalkane dehalogenase DbjA from Bardyrhizobium japonicum USDA110 : the effect of pH and temperature2011
- Author(s)
  Chaloupkova, R., Z. Prokop, Y. Sato, Y. Nagata, and J. Damborsky
- Journal Title
  
  FEBS J
  
  Volume: 278 Pages: 2728-2738
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Biochemical characteristics of the novel haloalkane dehalogenase DatA isolated from the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens C58. Appl2011
- Author(s)
  Hasan, K., A. Fortova, T. Koudelakova, R. Chalooupkova, M. Ishitsuka, Y. Nagata, J. Damborsky, and Z. Prokop
- Journal Title
  
  Environ. Microbial
  
  Volume: 77(5) Pages: 1881-1884
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Development of a crystallization protocol for the DbeA1 variant of novel haloalkane dehalogenase from Bradyrhizobium elkanii USDA942011
- Author(s)
  Prudnikova, T., R. Chalouplova, Y. Sato, Y. Nagata, O. Degtjarik, M. Kuty, P. Rezacova, J. Damborsky, and I. Kuta Smatanova
- Journal Title
  
  Crysta Growth & Design
  
  Volume: 11 Issue: 2 Pages: 516-519
- DOI
  10.1021/cg1013363
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047, KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] The lin genes for γ-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp. MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids2011
- Author(s)
  Tabata, M., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  Biosci. Biotechnol. Biochem
  
  Volume: 75(3) Pages: 466-472
- NAID
  10028201533
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010
- Author(s)
  加藤広海,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
- Journal Title
  
  J.Environ. Biotechnol
  
  Volume: 10 Pages: 63-70
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010
- Author(s)
  大坪嘉行、大坪和香子、永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  化学と生物
  
  Volume: 48(5) Pages: 313-319
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article]2010
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  難培養微生物研究の最新技術II(シーエムシー出版)
  
  Pages: 211-219
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20651050
[Journal Article] ゲノム解析ソフトウエアGenomeMatcher2010
- Author(s)
  大坪嘉行,大坪和香子,永田裕二,津田雅孝
- Journal Title
  
  化学と生物
  
  Volume: 48 Pages: 313-319
- NAID
  10026438311
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010
- Author(s)
  Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda.
- Journal Title
  
  Environmental Microbiology
  
  Volume: 12 Pages: 2539-2558
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Crystal structure of γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT262010
- Author(s)
  Okai, M., K. Kubota, M. Fukuda, Y. Nagata, K. Nagata, and M. Tanokura
- Journal Title
  
  J. Mol. Biol
  
  Volume: 403 Pages: 260-269
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Crystal structure of γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT262010
- Author(s)
  Okai, M., K. Kubota, M. Fukuda, Y. Nagata, K. Nagata, and M. Tanokura
- Journal Title
  
  J. Mol. Biol
  
  Volume: 403 Issue: 2 Pages: 260-269
- DOI
  10.1016/j.jmb.2010.08.043
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム「生態機能と環境保全」2010
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  微生物生態学会誌
  
  Volume: 25(2) Pages: 77-78
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced in soil environment by in vivo expression technology2010
- Author(s)
  Nishiyama, E., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Environmental Microbiology
  
  Volume: 12(9) Issue: 9 Pages: 2539-2558
- DOI
  10.1111/j.1462-2920.2010.02227.x
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] ゲノム解析ソフトウェアGenomeMatcher2010
- Author(s)
  大坪嘉行、大坪和香子、永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  化学と生物
  
  Volume: 48(5) Pages: 313-319
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Identification of Burkholderia multivorans ATCC 17616 genes induced insoil environment by in vivo expression technology2010
- Author(s)
  E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Environ. Microbiol
  
  Volume: 12 Pages: 2539-2558
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010
- Author(s)
  Nagata, Y., et al
- Journal Title
  
  J.Bacteriol.
  
  Volume: 192 Pages: 5852-5853
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] 特集「生態機能と環境保全」に寄せて2010
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  環境バイオテクノロジー学会誌
  
  Volume: 10(2) Pages: 52-52
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering2010
- Author(s)
  Prokop, Z., Y. Sato, J. Brezovsky, T. Mozga, R. Chalooupkova, T. Koudelakova, P. Jerabek, V. Stepankova, R. Natsume, J. G.E. van Leeuwen, D. B. Janssen, J. Florian, Y. Nagata, T. Senda, and J. Damborsky
- Journal Title
  
  Angewandte Chemie
  
  Volume: 49 Issue: 35 Pages: 6111-6115
- DOI
  10.1002/ange.201001753
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010
- Author(s)
  加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  環境バイオテクノロジー学会誌
  
  Volume: 10(2) Pages: 63-70
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR062010
- Author(s)
  Matsushima, R., H. Danno, M. Uchida, K. Ishihara, T. Suzuki, M. Kaneniwa, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl Microbiol Biotechnol
  
  Volume: 86 Pages: 567-576
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010
- Author(s)
  Nagata, Y., Y. Ohtsubo, R. Endo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Bacteriology
  
  Volume: 192 Pages: 5852-5853
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010
- Author(s)
  H. Yano, 3人, Y. Nagata, M. Hattori, M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Bacteriol
  
  Volume: 192 Pages: 4337-4347
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article]2010
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  酵素利用技術大系(株)エヌ・ティー・エス)
  
  Pages: 939-948
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20651050
[Journal Article] Complete genome sequence of the representativeγ-hexachlorocyclohexane-degrading bacteriumSphingobium japonicum UT262010
- Author(s)
  Nagata, Y., Y. Ohtsubo, R. Endo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Bacteriology
  
  Volume: 192 Issue: 21 Pages: 5852-5853
- DOI
  10.1128/jb.00961-10
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] 芳香族化合物による土壌撹乱における微生物遺伝子プールの変動2010
- Author(s)
  加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  環境バイオテクノロジー学会誌
  
  Volume: 10(2) Pages: 63-70
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Analysis of extracellular alginate lyase and its gene from a marine bacterial strain, Pseudoalteromonas atlantica AR062010
- Author(s)
  Matsushima, R., H. Danno, M. Uchida, K. Ishihara, T. Suzuki, M. Kaneniwa, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl Microbiol Biotechnol
  
  Volume: 86 Pages: 567-576
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT262010
- Author(s)
  Y.Nagata
- Journal Title
  
  J.Bacteriol.
  
  Volume: 192 Pages: 5852-5853
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Journal Article] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010
- Author(s)
  Yano, H., M. Miyakoshi, K. Ohshima, M. Tabata, Y. Nagata, M. Hattori, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J.Bacteriol
  
  Volume: 192 Issue: 17 Pages: 4337-4347
- DOI
  10.1128/jb.00359-10
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム2010
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  「生態機能と環境保全」微生物生態学会誌
  
  Volume: 25(2) Pages: 77-78
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Complete nucleotide sequence of TOL plasmid pDK1 provides evidence for evolutionary history of IncP-7 catabolic plasmids2010
- Author(s)
  Yano, H., M. Miyakoshi, K. Ohshima, M. Tabata, Y. Nagata, M. Hattori, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Bacteriol
  
  Volume: 192 Pages: 4337-4347
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] 環境バイオテクノロジー学会シンポジウム「生態機能と環境保全」2010
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  微生物生態学会誌
  
  Volume: 25 Pages: 77-78
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] 特集「生態機能と環境保全」に寄せて2010
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  環境バイオテクノロジー学会誌
  
  Volume: 10(2) Pages: 52-52
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Journal Article] Complete genome sequence of the representative γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobingobium japonicum UT262010
- Author(s)
  Nagata, Y., et al.
- Journal Title
  
  J.Bacteriol.
  
  Volume: 192 Pages: 5852-5853
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] Enantioselectivity of Haloalkane Dehalogenases and its Modulation by Surface Loop Engineering2010
- Author(s)
  Prokop, Z., Y. Sato, J. Brezovsky, T. Mozga, R. Chalooupkova, T. Koudelakova, P. Jerabek, V. Stepankova, R. Natsume, J. G. E. van Leeuwen, D. B. Janssen, J. Florian, Y. Nagata, T. Senda, and J. Damborsky
- Journal Title
  
  Angewandte Chemie
  
  Volume: 49 Pages: 6111-6115
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性-難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-2009
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  化学と生物 47(1)
  
  Pages: 35-42
- NAID
  10026434544
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis ofa novel haloalkane dehalogenase DbeA fromBradyrhizobium elkani USDA94.2009
- Author(s)
  Prudnikova, T. T. Mozga, P. Rezacova, R.Chaloupkova, Y. Sato, Y. Nagata, J. Brynda,M. Kuty, J. Damborsky, and I. K. Smatanova.
- Journal Title
  
  Acta Crystallographica Section F 65
  
  Pages: 353-356
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article]2009
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  マリンメタゲノムの有効利用(シーエムシー出版)
  
  Pages: 166-178
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20651050
[Journal Article] 環境細菌ゲノムの構造と可塑性 -難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-.2009
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  化学と生物 47
  
  Pages: 35-42
- NAID
  10026434544
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Construction of signature-tagged mutant library in Mesorhizobium loti as a powerful tool for functional genomics2008
- Author(s)
  Shimoda, Y., H. Mitsui, H. Kamimatsuse, K. Minamisawa, E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, M. Tsuda, S. Shinpo, A. Watanabe, M. Kohara, M. Yamada, Y. Nakamura, S. Tabata,and S. Sato
- Journal Title
  
  DNA Res 15
  
  Pages: 297-308
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Construction of signature-taggedmutant library in Mesorhizobium loti as apowerful tool for functional genomics2008
- Author(s)
  Shimoda, Y., H. Mitsui, H. Kamimatsuse,K. Minamisawa, E. Nishiyama, Y. Ohtsubo, Y.Nagata, M. Tsuda, S. Shinpo, A. Watanabe, M.Kohara, M. Yamada, Y. Nakamura, S. Tabata and S. Sato
- Journal Title
  
  DNAResearch 15
  
  Pages: 297-308
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] GenomeMatcher : a graphical user interface for DNA sequence comparison2008
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., W. Ikeda-Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  BMC Bioinformatics 9
  
  Pages: 376-376
- NAID
  120003728119
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] 土壌環境での細菌の生き様を探る(2008年度日本生物工学会大会報告)2008
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  日本生物工学会誌 86
  
  Pages: 549-549
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19658030
[Journal Article] Characterization of the traD operonof naphthalene-catabolic plasmid NAH7 ahost-range modifier in conjugative transfer2008
- Author(s)
  Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Bacteriol 190
  
  Pages: 6281-6289
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Characterization of the traD operon of naphthalene-catabolic plasmid NAH72008
- Author(s)
  Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  a host-range modifier in conjugative transfer. J. Bacteriol 190
  
  Pages: 6281-6289
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR cultivation-independent isolation of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes fromsoil DNA2008
- Author(s)
  Fuchu, G., Y. Ohtsubo, M. Ito, R.Miyazaki, A. Ono, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl. Microbiol.Biotechnol 79
  
  Pages: 627-632
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] 土壌環境での細菌の生き様を探る(2008年度日本生物工学会大会報告)2008
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  日本生物工学会誌 86
  
  Pages: 549-549
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] 多重染色体性のBurkholderia multivoransのゲノム構造と土壌でのゲノム情報発現2008
- Author(s)
  津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 湯原悟志, 永田裕二, 大坪嘉行
- Journal Title
  
  土と微生物 62
  
  Pages: 93-97
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Insertion sequence-based cassette PCR : cultivation-independent isolation of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes from soil DNA2008
- Author(s)
  Fuchu, G., Y. Ohtsubo, M. Ito, R. Miyazaki, A. Ono, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl. Microbiol. Biotechnol 79
  
  Pages: 627-632
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] 多重染色体性のBurkholderia multivoransのゲノム構造と土壌でのゲノム情報発現2008
- Author(s)
  津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 湯原悟志, 永田裕二, 大坪嘉行
- Journal Title
  
  土と微生物 62 (2)
  
  Pages: 93-97
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] GenomeMatcher : A graphicaluser interface for DNA sequence comparison2008
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., W. Ikeda-Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  BMC Bioinformatics 9
  
  Pages: 376-376
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsive transcriptional regulator Fur in Burkholderia multivorans2008
- Author(s)
  Yuhara, S., H. Komatsu, H. Goto, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiology 154
  
  Pages: 1763-1774
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Pleiotropic roles of iron-responsivetranscriptional regulator Fur in Burkholderiamultivorans2008
- Author(s)
  Yuhara, S., H. Komatsu, H. Goto, Y.Otsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiology 154
  
  Pages: 1763-1774
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane byhaloalkane dehalogenase LinB from γ-hexachlorocyclohexane-utilizing bacteriumSphingobium sp2007
- Author(s)
  Ito, M., Z. Prokop, M. Klvana, Y. Otsubo, M. Tsuda, J. Damborsky, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  MI1205. Arch Microbiol 188
  
  Pages: 313-325
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] G. J. Zylstra, P. A. Williams, and M. Tsuda : Complete sequence determination combined with analysis of transposition/site-specific recombination events to explain genetic organization of IncP-7 TOL plasmid pWW53 and related mobile genetic elements2007
- Author(s)
  Yano, H., C. E. Garruto, M. Sota, Y. Ohtsubo, Y. Nagata
- Journal Title
  
  J. Mol. Biol. 369
  
  Pages: 11-26
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] 自然環境で実際に機能する微生物遺伝子の遺伝学的手法による検索と解析2007
- Author(s)
  津田雅孝, 西山依里, 永田裕二, 大坪嘉行
- Journal Title
  
  化学と生物 45
  
  Pages: 557-563
- NAID
  10019578182
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane) in bacteria and its biochemical and molecular basis2007
- Author(s)
  Nagata, Y., et. al.
- Journal Title
  
  Appl. Microbiol. and Biotechnol. 76
  
  Pages: 741-752
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19658030
[Journal Article] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007
- Author(s)
  津田雅孝, 小野玲, 宮崎亮, 府中玄樹, 永田裕二
- Journal Title
  
  J. Environ. Biotechnol. 7
  
  Pages: 75-78
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Weak activity ofhaloalkane dehalogenase LinB with1, 2, 3-trichloropropane revealed by X-raycrystallography and microcalorimetry2007
- Author(s)
  Monincova, M., Z. Prokop, J. Vevodova, Y.Nagata and J. Damborsky
- Journal Title
  
  Appl.Envirom. Microbiol 73
  
  Pages: 2005-2008
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and itsbiochemical and molecular basis. Appl2007
- Author(s)
  Nagata, Y., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiol. and Biotechnol 76
  
  Pages: 741-752
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Complete sequencedetermination combined with analysis oftransposition/site-specific recombination eventsto explain genetic organization of IncP-7 TOLplasmid pWW53 and related mobile geneticelements2007
- Author(s)
  Yano, H., C.E. Garruto, M. Sota, Y.Ohtsubo, Y. Nagata, G.J. Zylstra, P.A.Williams, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  J. Mol. Biol 369
  
  Pages: 11-26
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] The identification of catalytic pentad in the haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85 : reaction mechanism and molecular evolution2007
- Author(s)
  Pavlova, M., M. Klvana, A. Jesenska, Z. Prokop, H. Konecna, T. Sato, M. Tsuda, Y. Nagata, and J. Damborsky
- Journal Title
  
  J. Struct. Biol 157
  
  Pages: 384-392
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007
- Author(s)
  Nagata, Y., et. al.
- Journal Title
  
  Appl. Microbiol. and Biotechnol. 76
  
  Pages: 741-752
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Identification and characterization ofgenes encoding a putative ABC-type transporteressential for the utilization of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobiumjaponicum UT262007
- Author(s)
  Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y.Nagata
- Journal Title
  
  J. Bacteriol 189
  
  Pages: 3712-3720
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Crystallization and preliminary crystallographic analysis of a haloalkane dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA1102007
- Author(s)
  Sato, Y., R. Natsume, M. Tsuda, J. Damborsky, Y. Nagata, and T. Senda
- Journal Title
  
  Acta Cryst. F63
  
  Pages: 294-296
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] 土壌生態系での環境細菌ゲノム情報発現2007
- Author(s)
  津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 永田裕二, 大坪嘉行
- Journal Title
  
  極限環境微生物学会誌 6
  
  Pages: 59-62
- NAID
  130004486982
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] 自然環境で実際に機能する微生物遺伝子の遺伝学的手法による検索と解析2007
- Author(s)
  津田雅孝、西山依里、永田裕二、大坪嘉行
- Journal Title
  
  化学と生物 45
  
  Pages: 557-563
- NAID
  10019578182
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007
- Author(s)
  津田雅孝、小野玲、宮崎亮、府中玄樹、永田裕二
- Journal Title
  
  J. Environ. Biotechnol 7(2)
  
  Pages: 75-78
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007
- Author(s)
  Nagata, Y., R. Endo, M. Ito, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl. Microbiol. Biotechnol 74
  
  Pages: 741-752
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from γ-hexachlorocyclohexane-utilizing bacterium Sphingobium sp2007
- Author(s)
  Ito, M., Z. Prokop, M. Klvana, Y. Ohtsubo, M. Tsuda, J. Damborsky, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  Arch. Microbiol 188
  
  Pages: 313-325
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in bacteria and its biochemical and molecular basis2007
- Author(s)
  Yuji Nagata
- Journal Title
  
  Applied Microbiology and Biotechnology 76
  
  Pages: 741-752
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] The identificationof catalytic pentad in the haloalkanedehalogenase DhmA from Mycobacterium aviumN85 : reaction mechanism and molecularevolution2007
- Author(s)
  Pavlova, M., Klavana, A. Jesenska, Z.Prokop, H. Konecna, T. Sato, M. Tsuda, Y.Nagata, and J. Damborsky
- Journal Title
  
  J. Struct. Biol 157
  
  Pages: 384-392
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Isolation andcharacterization of naphthalene-catabolic genesand plasmids from oil-contaminated soil by usingtwo cultivation-independent approaches2007
- Author(s)
  Ono, A., R. Miyazaki, M. Sota, Y. Ohtsubo,Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl.Microbiol. Biotechnol 74
  
  Pages: 501-510
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Isolation and characterization of naphthalene-catabolic genes and plasmids from oil-contaminated soil by using two cultivation-independent approaches. Appl2007
- Author(s)
  Ono, A., R. Miyazaki, M. Sota, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Microbiol. Biotechnol 74
  
  Pages: 501-510
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Identification and characterization of genes encoding a putative ABC-type transporter essential for the utilization of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT262007
- Author(s)
  Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  J. Bacteriol. 189
  
  Pages: 3712-3720
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Senda.Crystallization and preliminary crystallographicanalysis of a haloalkane dehalogenase DbjA fromBradyrhizobium japonicum USDA1102007
- Author(s)
  Sato, Y., R. Natsume, M. Tsuda, J. Damborsky, Y. Nagata and T
- Journal Title
  
  ActaCryst Section F 63
  
  Pages: 294-296
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Growth inhibition by metabolites of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT26.2006
- Author(s)
  Endo, R., Y.Ohtsubo, M.Tsuda, Y.Nagata
- Journal Title
  
  Biosci.Biotechnol.Biochem. 70
  
  Pages: 1029-1032
- NAID
  10018532907
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Is metagenome treasure island?2006
- Author(s)
  Y.Nagata
- Journal Title
  
  Seibutsu-Kogaku Kaishi(in Japanese) 84(2)
  
  Pages: 73-73
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Identification of a responseregulator gene for catabolite control from aPCB-degrading β-proteobacteria, Acidovorax sp. KKS1022006
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., H. Goto, Y. Nagata, T. Kudo,and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Mol. Microbiol 60
  
  Pages: 1563-1575
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] ハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能2006
- Author(s)
  永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  J. Environ. Biotechnol. 6
  
  Pages: 87-92
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT262006
- Author(s)
  Nagata, Y. et al.
- Journal Title
  
  FEMS Microbiol.Lett. in press
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] 境汚染物質を分解する酵素遺伝子の土壌からの直接的取得と解析2006
- Author(s)
  小野玲、宮崎亮、永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  バイオインダストリー11月号 23(11)
  
  Pages: 44-49
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Functional analysis of unique class II insertion sequence IS1071.2006
- Author(s)
  Sota, T., H.Yano, Y.Nagata, Y.Ohtsubo, H.Genka, H.Anbutsu, H.Kawasaki, M.Tsuda
- Journal Title
  
  Appl.Environ.Microbiol. 72
  
  Pages: 291-297
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Completenucleotide sequence of an exogenously isolatedplasmid pLB1 involved in the degradation ofγ-hexachlorocyclohexane2006
- Author(s)
  Miyazaki, R., Y. Sato, M. Ito, Y. Ohtsubo,Y. Nagata and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl. Envirom.Microbiol 72
  
  Pages: 6923-6933
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Complete nucleotide sequence of an exogenously isolated plasmid pLB1 involved in the degradation of γ-hexachlorocyclohexane2006
- Author(s)
  Miyazaki, R. Y. Sato, M. Ito, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  Appl. Environ. Microbiol 72
  
  Pages: 6923-6933
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] ハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能2006
- Author(s)
  永田裕二、津田雅孝
- Journal Title
  
  J. Environ. Biotechnol 6
  
  Pages: 87-92
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] Expression of glycosylated haloalkane dehalogenase LinB in Pichia pastoris.2006
- Author(s)
  Nakamura, T., M.Zamocky, Z.Zdrahal, R.Chaloupkova, M.Monincova, Z.Prokop, Y.Nagata, J.Damborsky
- Journal Title
  
  Protein Expression and Purification 46
  
  Pages: 85-91
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT262006
- Author(s)
  Nagata, Y. et al.
- Journal Title
  
  FEMS Microbiol. Lett. 256
  
  Pages: 112-118
- Description
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] ハロアルカンデハロゲナーゼの構造と機能2006
- Author(s)
  永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  J. Environ. Biotechnol. 6
  
  Pages: 87-92
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Journal Article] 環境汚染物質を分解する酵素遺伝子の土壌からの直接的取得と解析2006
- Author(s)
  小野玲, 宮崎亮, 永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  バイオインダストリ- 23
  
  Pages: 44-49
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Distribution of γ-hexachlorocyclohexane-degrading genes on three replicons in Sphingobium japonicum UT26.2006
- Author(s)
  Nagata, Y., M.Kamakura, R.Endo, R.Miyazaki, Y.Ohtsubo, M.Tsuda
- Journal Title
  
  FEMS Microbiol.Lett. 256
  
  Pages: 112-118
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] メタゲノムは宝の山か?(バイオミディア)2006
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  日本生物工学会誌 84・2
  
  Pages: 73-73
- Description
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Growth inhibition by metabolites of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingobium japonicum UT262006
- Author(s)
  Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Journal Title
  
  Biosci. Biotechnol. Biochem 70
  
  Pages: 1029-1032
- NAID
  10018532907
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Identification of a response regulator gene for catabolite control from a PCB-degrading β-proteobacteria, Acidovorax sp2006
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., H. Goto, Y. Nagata, T. Kudo, and M. Tsuda
- Journal Title
  
  KKS102. Mol. Microbiol 60
  
  Pages: 1563-1575
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Journal Article] Quantitative analysis of substrate specificity of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26.2005
- Author(s)
  Kmunicek, J., K.Hynkova, T.Jedlicka, Y.Nagata, A.Negri, F.Gago, R.C.Wade, J.Damborsky
- Journal Title
  
  Biochemistry 44
  
  Pages: 3390-3401
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Mycobacterial haloalkane dehalogenases : cloning, biochemical properties and distribution.2005
- Author(s)
  Jesenska, A., M.Pavlova, M.Strouhal, R.Chaloupkova, I.Tesinska, M.Monincova, Z.Prokop, M.Bartos, I.Pavlik, I.Rychlik, P.Mobius, Y.Nagata, J.Damborsky
- Journal Title
  
  Appl.Environ.Microbiol. 71
  
  Pages: 6736-6745
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 176162005
- Author(s)
  Nagata, Y. et al.
- Journal Title
  
  J.Biosci.Bioeng 99
  
  Pages: 603-610
- NAID
  110002695708
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Mycobacterial haloalkane dehalogenases : cloning, biochemical properties and distribution2005
- Author(s)
  永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  化学と生物 43
  
  Pages: 33-42
- Description
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Identification of insertion sequence from a γ-hexachlorocyclohexane degrading bacterium, Sphingomonas paucimobilis UT26.2005
- Author(s)
  Miyauchi, K., M.Fukuda, M.Tsuda, M.Takagi, Y.Nagata
- Journal Title
  
  Biosci.Biotechnol.Biochem. 69
  
  Pages: 216-219
- NAID
  130000030576
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] メタゲノム的発想に基づいた新規環境汚染物質分解酵素遺伝子へのアプローチ2005
- Author(s)
  永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  化学と生物 43
  
  Pages: 33-42
- NAID
  10016570075
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT262005
- Author(s)
  Nagata, Y. et al.
- Journal Title
  
  Appl. Envirn. Microbiol. 71
  
  Pages: 2183-2185
- Description
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT262005
- Author(s)
  Nagata, Y. et al.
- Journal Title
  
  Appl.Envirn.Microbiol 71
  
  Pages: 2183-2185
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Metabolic pathway, genes, and enzymes for the degradation of chlorinated pesticide, γ-hexachlorocyclohexane.2005
- Author(s)
  Nagata, Y., M.Tsuda
- Journal Title
  
  Protein, Nucleic Acid, and Enzyme(in Japanese) 50(12)
  
  Pages: 1511-1518
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Two Rhizobial strains, Mesorhizobium loci MAFF303099 and Bradyrhizobium japonicum USDA110, encode haloalkane dehalogenases with novel structures and substrate specificities.2005
- Author(s)
  Sato, Y., M.Monincova, R.Chaloupkova, Z.Prokop, Y.Ohtsubo, K.Minamisawa, M.Tsuda, J.Damborsky, Y.Nagata
- Journal Title
  
  Appl.Environ.Microbiol. 71
  
  Pages: 4372-4379
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] 有機塩素系殺虫剤分解細菌の出現-代謝系の構築と酵素の機能2005
- Author(s)
  永田裕二, 津田雅孝
- Journal Title
  
  蛋白質核酸酵素 50・12
  
  Pages: 1511-1518
- Description
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Identification and characterization of genes involved in the downstream degradation pathway of γ-hexachlorocyclohexane in Sphingomonas paucimobilis UT26.2005
- Author(s)
  Endo, R., M.Kamakura, K.Miyauchi, M.Fukuda, Y.Ohtsubo, M.Tsuda, Y.Nagata
- Journal Title
  
  J.Bacteriol. 187
  
  Pages: 847-853
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Access to novel genes for the degradation of environmental pollutants by metagenomic approaches.2005
- Author(s)
  Nagata, Y., M.Tsuda
- Journal Title
  
  Kagaku-to-Seibutsu(in Japanese) 43
  
  Pages: 33-42
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] メタゲノム的発想に基づいた新規環境汚染物質分解酵素遺伝子へのアプローチ2005
- Author(s)
  永田裕二
- Journal Title
  
  化学と生物 43
  
  Pages: 33-42
- NAID
  10016570075
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16013203
[Journal Article] Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 17616.2005
- Author(s)
  Nagata, Y., M.Matsuda, H.Komatsu, Y.Imura, H.Sawada, Y.Ohtsubo, M.Tsuda
- Journal Title
  
  J.Biosci.Bioeng. 99
  
  Pages: 603-610
- NAID
  110002695708
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Organization and localization of the dnaA and dnaK gene regions on the multichromosomal genome of Burkholderia multivorans ATCC 176162005
- Author(s)
  Nagata, Y. et al.
- Journal Title
  
  J. Biosci. Bioeng. 99
  
  Pages: 603-610
- NAID
  110002695708
- Description
  「研究成果報告書概要(和文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] High-temperature-induced transposition of IS elements in Burkholderia multivorans ATCC 17616.2005
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., H.Genka, H.Komatsu, Y.Nagata, M.Tsuda
- Journal Title
  
  Appl.Environ.Microbiol. 71
  
  Pages: 1822-1828
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Degradation of β-hexachlorocyclohexane by haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26.2005
- Author(s)
  Nagata, Y., Z.Prokop, Y.Sato, P.Jerabek, A.Kumar, Y.Ohtsubo, M.Tsuda, J.Damborsky
- Journal Title
  
  Appl.Environ.Microbiol. 71
  
  Pages: 2183-2185
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Strategies for bioremediation of polychlorinated biphenyls.2004
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., T.Kudo, M.Tsuda, Y.Nagata
- Journal Title
  
  Appl.Microbiol.Biotechnol. 65
  
  Pages: 250-258
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Genome biology of environmental bacteria and environmental DNA.2004
- Author(s)
  Tsuda, M., H.Komatsu, Y.Ohtsubo, Y.Nagata
- Journal Title
  
  J.Environ.Biotechnol.(in Japanese) 3
  
  Pages: 69-78
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] Crystral structure of haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26 at 0.95Å resolution : dynamics of catalytic residues.2004
- Author(s)
  Oakley, A.J., M.Klvana, M.Otyepka, Y.Nagata, M.C.Wilce, J.Damborsky
- Journal Title
  
  Biochemsitry 43
  
  Pages: 870-878
- Description
  「研究成果報告書概要(欧文)」より
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16580050
[Journal Article] 機能相補による芳香族化合物複合汚染土壌からの新規分解酵素遺伝子の探索
- Author(s)
  永山浩史,菅原智詞,遠藤諒,加藤広海,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
- Journal Title
  
  J.Environ. Biotechnol
  
  Volume: (in press)
- Peer Reviewed
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Presentation] Deterministic Shaping of Soil Bacterial Communities: Interplay of Rare Species and Environmental Selection2024
- Author(s)
  Leonardo Stari，Hiromi Kato，Yoshiyuki Ohtsubo， Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 様々な細菌集団および単離細菌株に対する有機塩素系殺虫剤分解酵素遺伝子のキャプチャリング実験2024
- Author(s)
  岡俊璃，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Deterministic Shaping of Soil Bacterial Communities: Interplay of Rare Species and Environmental Selection2024
- Author(s)
  Leonardo Stari，Hiromi Kato，Yoshiyuki Ohtsubo， Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Deterministic Shaping of Soil Bacterial Communities: Interplay of Rare Species and Environmental Selection2024
- Author(s)
  Leonardo Stari，Hiromi Kato，Yoshiyuki Ohtsubo， Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 移動性細菌 Paenibacillus sp. NK-L2 株が有機塩素系殺虫剤分解細菌株を運ぶヒッチハイク現象2024
- Author(s)
  松添華子，岸田なつみ，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Elucidating Soil Carbon Sequestration: A Shotgun Metagenome Study of Kyushu Forest Soils in Relation to Soil Characteristics and Tree Species Diversity2024
- Author(s)
  Leonardo Stari, Shoko Hirano, Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  第18回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] IV 型分泌装置の構成因子 TrbB は TraR による ICEKKS102 Tn4677 の切り出し活性化に関与する2024
- Author(s)
  松本哲，岸田康平，永田裕二，大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティの再構築2024
- Author(s)
  手塚隆博，岸田なつみ，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Elucidating Soil Carbon Sequestration: A Shotgun Metagenome Study of Kyushu Forest Soils in Relation to Soil Characteristics and Tree Species Diversity2024
- Author(s)
  Leonardo Stari, Shoko Hirano, Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  第18回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Cupriavidus 属細菌株のコロニー周辺部が大きく広がる突然変異株の取得と解析2024
- Author(s)
  平野翔子，Xiong Zhiyu，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 様々な細菌集団および単離細菌株に対する有機塩素系殺虫剤分解酵素遺伝子のキャプチャリング実験2024
- Author(s)
  岡俊璃，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 接合伝達における細胞膜リン脂質の役割2024
- Author(s)
  熊谷連，大坪嘉行，永田裕二，岸田康平
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] IV 型分泌装置 (T4SS) の内膜コンポーネント ICEKKS102Tn4677 環状化への関与2024
- Author(s)
  松本哲、岸田　康平、永田　裕二、大坪　嘉行
- Organizer
  第18回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 従属栄養細菌の超低栄養環境での増殖を引き起こす AdhX の基質の検討2024
- Author(s)
  伊藤蓮，Stari Leonardo，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 接合伝達における細胞膜リン脂質の役割2024
- Author(s)
  熊谷連，大坪嘉行，永田裕二，岸田康平
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Cupriavidus sp. TKC 株の DCG 現象に関わる遺伝子の探索2024
- Author(s)
  平野翔子、Stari Leonardo、Xiong Zhiyu、加藤広海、岸田康平、大坪　嘉行、永田　裕二
- Organizer
  第18回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] IV 型分泌装置の構成因子 TrbB は TraR による ICEKKS102 Tn4677 の切り出し活性化に関与する2024
- Author(s)
  松本哲，岸田康平，永田裕二，大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティの再構築2024
- Author(s)
  手塚隆博，岸田なつみ，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 細菌由来の有機塩素系殺虫剤γ-HCH 分解酵素を発現する形質転換シロイヌナズナの作製と評価2024
- Author(s)
  鄧文昊，高田美信，岸田康平，大坪嘉行，渡辺正夫，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Cupriavidus 属細菌株のコロニー周辺部が大きく広がる突然変異株の取得と解析2024
- Author(s)
  平野翔子，Xiong Zhiyu，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Sphingobium-Cupriavidus 属細菌株による有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティ形成2024
- Author(s)
  XIONG ZHIYU，平野翔子，岸田なつみ，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 細菌由来の有機塩素系殺虫剤γ-HCH 分解酵素を発現する形質転換シロイヌナズナの作製と評価2024
- Author(s)
  鄧文昊，高田美信，岸田康平，大坪嘉行，渡辺正夫，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Cupriavidus sp. TKC 株の DCG 現象に関わる遺伝子の探索2024
- Author(s)
  平野翔子、Stari Leonardo、Xiong Zhiyu、加藤広海、岸田康平、大坪　嘉行、永田　裕二
- Organizer
  第18回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 移動性細菌 Paenibacillus sp. NK-L2 株が有機塩素系殺虫剤分解細菌株を運ぶヒッチハイク現象2024
- Author(s)
  松添華子，岸田なつみ，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Sphingobium-Cupriavidus 属細菌株による有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティ形成2024
- Author(s)
  XIONG ZHIYU，平野翔子，岸田なつみ，加藤広海，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 従属栄養細菌の超低栄養環境での増殖を引き起こす AdhX の基質の検討2024
- Author(s)
  伊藤蓮，Stari Leonardo，岸田康平，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2024年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] IV 型分泌装置 (T4SS) の内膜コンポーネント ICEKKS102Tn4677 環状化への関与2024
- Author(s)
  松本哲、岸田　康平、永田　裕二、大坪　嘉行
- Organizer
  第18回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌微生物群集の動的スペクトル分解2024
- Author(s)
  長田穣, STARI Leonardo, 加藤広海, 永田裕二, 大坪嘉行, 近藤倫生
- Organizer
  第71回日本生態学会大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 土壌圏微生物による人工農薬分解のフロンティア2023
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農薬学会第48回大会　未来開拓シンポジウム「将来の植物保護に向けた応用微生物学」
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] The succession of taxonomic structure and metagenome composition of bacterial community cultured with different carbon sources2023
- Author(s)
  Leonardo Stari、Hiromi Kato、Yoshiyuki Ohtsubo、 Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] The succession of taxonomic structure and metagenome composition of bacterial community cultured with different carbon sources2023
- Author(s)
  Leonardo Stari、Hiromi Kato、Yoshiyuki Ohtsubo、 Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Cupriavidus-Sphingobium 属細菌株間の相互作用2023
- Author(s)
  平野翔子、Xiong Zhiyu 、佐子川さやか、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会36回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 土壌環境の細菌叢は移植できるのか？2023
- Author(s)
  加藤広海・南澤究・永田裕二
- Organizer
  土壌微生物学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Elucidating Soil Carbon Sequestration: A Shotgun Metagenome Study of Kyushu Forest Soils in Relation to Soil Characteristics and Tree2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Shoko Hirano, Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  第18回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 混合無菌土壌における細菌叢形成2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤広海、Leonardo Stari、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 従属栄養細菌の超低栄養環境での増殖を引き起こすAdhXは promiscuousなアルコール脱水酵素である2023
- Author(s)
  伊藤蓮、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 混合無菌土壌における細菌叢形成2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤広海、Leonardo Stari、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Evolution of Bacteria Degrading Artificially Synthesized Environmental Pollutants2023
- Author(s)
  Yuji Nagata
- Organizer
  International Symposium on Advanced and Sustainable Science and Technology (National Chung Hsing University, Taiwan)
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 従属栄養細菌の超低栄養環境での増殖を引き起こすAdhXはpromiscuousなアルコール脱水酵素である2023
- Author(s)
  伊藤蓮、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Temporal Evolution and Forces Shaping Bacterial Populations in Cultured Soil Consortia2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  日本微生物生態学会36回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 細菌由来のデハロゲナーゼを発現するシロイヌナズナ植物の人工農薬分解活性2023
- Author(s)
  鄧文昊、高田美信、大坪嘉行、渡辺正夫、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 混合無菌土壌に移植した土壌細菌集団の菌叢形成2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌圏微生物による人工農薬分解のフロンティア2023
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農薬学会第48回大会　未来開拓シンポジウム「将来の植物保護に向けた応用微生物学」
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] The succession of taxonomic structure and metagenome composition of bacterial community cultured with different carbon sources2023
- Author(s)
  Leonardo Stari、Hiromi Kato、Yoshiyuki Ohtsubo、 Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Uncovering the Dynamics of Microbial Genomic Structure and Function in Relation to Carbon Source Variation: An Investigation of Taxonomic Succession and Metagenome Composition2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 細菌由来のデハロゲナーゼを発現するシロイヌナズナ植物の人工農薬分解活性2023
- Author(s)
  鄧文昊、高田美信、大坪嘉行、渡辺正夫、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Uncovering the Dynamics of Microbial Genomic Structure and Function in Relation to Carbon Source Variation: An Investigation of Taxonomic Succession and Metagenome Composition2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] PCB分解細菌の可動性遺伝因子ICEKKS102Tn4677 の oriT における TraR標的の探索2023
- Author(s)
  松本哲、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Temporal Evolution and Forces Shaping Bacterial Populations in Cultured Soil Consortia2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  日本微生物生態学会36回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 原核生物における新しい可動遺伝因子グループ SE (Strand-biased Circularizing Integrative Element) の発見2023
- Author(s)
  矢野大和1, Idola Desmila, 森宙史, 永田裕二, 野中里佐
- Organizer
  日本遺伝学会95回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Evolution of Bacteria Degrading Artificially Synthesized Environmental Pollutants2023
- Author(s)
  Yuji Nagata
- Organizer
  International Symposium on Advanced and Sustainable Science and Technology (National Chung Hsing University, Taiwan)
- Invited / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 土壌環境の細菌叢は移植できるのか？2023
- Author(s)
  加藤広海・南澤究・永田裕二
- Organizer
  土壌微生物学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Temporal Evolution and Forces Shaping Bacterial Populations in Cultured Soil Consortia2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  日本微生物生態学会36回大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 土壌細菌の機能と進化2023
- Author(s)
  永田裕二、Stari Leonardo、加藤広海、大坪嘉行
- Organizer
  第70回日本生態学会大会シンポジウム「土壌圏の複雑性と適応性を明らかにする総合科学」
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Tracking Community Succession in Soil Bacterial Populations Cultured with Different Carbon Sources2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 土壌の違いが細菌叢形成に与える影響2023
- Author(s)
  平野　翔子、加藤　広海、Leonardo Stari、大坪　嘉行、永田　裕二
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Tracking Community Succession in Soil Bacterial Populations Cultured with Different Carbon Sources2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Tracking Community Succession in Soil Bacterial Populations Cultured with Different Carbon Sources2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Cupriavidus-Sphingobium 属細菌株間の相互作用2023
- Author(s)
  平野翔子、Xiong Zhiyu 、佐子川さやか、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会36回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌細菌の機能と進化2023
- Author(s)
  永田裕二、Stari Leonardo、加藤広海、大坪嘉行
- Organizer
  第70回日本生態学会大会シンポジウム「土壌圏の複雑性と適応性を明らかにする総合科学」
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 細菌由来のデハロゲナーゼを発現するシロイヌナズナ植物の人工農薬分解活性2023
- Author(s)
  鄧文昊、高田美信、大坪嘉行、渡辺正夫、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 新しい可動遺伝因子グループSEの転移経路と宿主域2023
- Author(s)
  矢野大和, イドラデスミラ , 森宙史, 永田裕二, 野中里佐
- Organizer
  日本微生物生態学会36回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌環境の細菌叢は移植できるのか？2023
- Author(s)
  加藤広海・南澤究・永田裕二
- Organizer
  土壌微生物学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌細菌の機能と進化2023
- Author(s)
  永田裕二、Stari Leonardo、加藤広海、大坪嘉行
- Organizer
  第70回日本生態学会大会シンポジウム「土壌圏の複雑性と適応性を明らかにする総合科学」
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 土壌細菌の進化と種間相互作用2023
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  第34回加藤記念研究助成贈呈式特別講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Uncovering the Dynamics of Microbial Genomic Structure and Function in Relation to Carbon Source Variation: An Investigation of Taxonomic Succession and Metagenome Composition2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 原核生物における新しい可動遺伝因子グループ SE (Strand-biased Circularizing Integrative Element) の発見2023
- Author(s)
  矢野大和1, Idola Desmila, 森宙史, 永田裕二, 野中里佐
- Organizer
  日本遺伝学会95回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] PCB分解細菌の可動性遺伝因子ICEKKS102Tn4677 の oriT における TraR標的の探索2023
- Author(s)
  松本哲、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌細菌の進化と種間相互作用2023
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  第34回加藤記念研究助成贈呈式特別講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 細菌由来のデハロゲナーゼを発現するシロイヌナズナ植物の人工農薬分解活性2023
- Author(s)
  鄧文昊、高田美信、大坪嘉行、渡辺正夫、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 土壌の違いが細菌叢形成に与える影響2023
- Author(s)
  平野　翔子、加藤　広海、Leonardo Stari、大坪　嘉行、永田　裕二
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌の違いが細菌叢形成に与える影響2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤　広海、Leonardo Stari、大坪　嘉行、永田　裕二
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Uncovering the Dynamics of Microbial Genomic Structure and Function in Relation to Carbon Source Variation: An Investigation of Taxonomic Succession and Metagenome Composition2023
- Author(s)
  Leonardo Stari, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 新しい可動遺伝因子グループSEの転移経路と宿主域2023
- Author(s)
  矢野大和, イドラデスミラ , 森宙史, 永田裕二, 野中里佐
- Organizer
  日本微生物生態学会36回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] PCB分解細菌の可動性遺伝因子ICEKKS102Tn4677 の oriT における TraR標的の探索2023
- Author(s)
  松本哲、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌細菌の機能と進化2023
- Author(s)
  永田裕二、Stari Leonardo、加藤広海、大坪嘉行
- Organizer
  第70回日本生態学会大会シンポジウム「土壌圏の複雑性と適応性を明らかにする総合科学」
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 従属栄養細菌の超低栄養環境での増殖を引き起こすAdhXは promiscuousなアルコール脱水酵素である2023
- Author(s)
  伊藤蓮、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 混合無菌土壌に移植した土壌細菌集団の菌叢形成2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 接合伝達を阻害するペプチド創薬のデザインとスクリーニング2023
- Author(s)
  岸田康平、熊谷連、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌圏微生物による人工農薬分解のフロンティア2023
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農薬学会第48回大会　未来開拓シンポジウム「将来の植物保護に向けた応用微生物学」
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 従属栄養細菌の超低栄養環境での増殖を引き起こすAdhXは promiscuousなアルコール脱水酵素である2023
- Author(s)
  伊藤蓮、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] PCB分解細菌の可動性遺伝因子ICEKKS102Tn4677のoriTにおけるTraR標的の探索2023
- Author(s)
  松本哲、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 接合伝達を阻害するペプチド創薬のデザインとスクリーニング2023
- Author(s)
  岸田康平、熊谷連、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 土壌圏微生物による人工農薬分解のフロンティア2023
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農薬学会第48回大会　未来開拓シンポジウム「将来の植物保護に向けた応用微生物学」
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 混合無菌土壌に移植した土壌細菌集団の菌叢形成2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 混合無菌土壌に移植した土壌細菌集団の菌叢形成2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 土壌の違いが細菌叢形成に与える影響2023
- Author(s)
  平野　翔子、加藤　広海、Leonardo Stari、大坪　嘉行、永田　裕二
- Organizer
  第17回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] The succession of taxonomic structure and metagenome composition of bacterial community cultured with different carbon sources2023
- Author(s)
  Leonardo Stari、Hiromi Kato、Yoshiyuki Ohtsubo、 Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 混合無菌土壌における細菌叢形成2023
- Author(s)
  平野翔子、加藤広海、Leonardo Stari、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2023年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Evolution of Bacteria Degrading Artificially Synthesized Environmental Pollutants2023
- Author(s)
  Yuji Nagata
- Organizer
  International Symposium on Advanced and Sustainable Science and Technology (National Chung Hsing University, Taiwan)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌細菌の進化と種間相互作用2023
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  第34回加藤記念研究助成贈呈式特別講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Cupriavidus株が長期持続的g-HCH分解細菌集団形成の鍵である2022
- Author(s)
  佐子川さやか、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Community succession of a soil bacterial population cultured with different carbon sources2022
- Author(s)
  Stari Lazo Leonardo Alfredo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] γ-HCH 分解細菌コミュニティ形成におけるCupriavidus 株の重要性2022
- Author(s)
  佐子川さやか，羽賀千晃，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] ICE 接合伝達に関与する推定転写因子 TraR の標的遺伝子の探索2022
- Author(s)
  松本哲，永田裕二，大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] γ-HCH 分解細菌の多様性と進化2022
- Author(s)
  勝保奈実、蘇立俊、田中彩美、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  第16回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Cupriavidus株が長期持続的g-HCH分解細菌集団形成の鍵である2022
- Author(s)
  佐子川さやか、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 土壌細菌機能発現を支える種間相互作用2022
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  大隅基礎科学創成財団微生物コンソーシアム定例会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] qTn-Seq 法を用いたSphingobium japonicum UT26 株の超低栄養環境での増殖に関わる遺伝子の同定2022
- Author(s)
  野々山翔太，柳熙盟，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] gamma-HCH 脱塩化水素酵素 LinA による DDT の分解2022
- Author(s)
  伊藤蓮，カファヤユスフ，宮内啓介，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] γ-HCH 分解細菌の多様性と進化2022
- Author(s)
  勝保奈実、蘇立俊、田中彩美、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  第16回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Cupriavidus株が長期持続的gamma-HCH分解細菌集団形成の鍵である2022
- Author(s)
  佐子川さやか、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 異なる無菌土壌への細菌集団移植時の菌叢形成2022
- Author(s)
  平野翔子, 加藤広海, 大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会35回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] ヒッチハイク現象の環境汚染物質分解細菌への応用2022
- Author(s)
  岩本和音，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] ヒッチハイク現象の環境汚染物質分解細菌への応用2022
- Author(s)
  岩本和音，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] qTn-Seq 法を用いたSphingobium japonicum UT26 株の超低栄養環境での増殖に関わる遺伝子の同定2022
- Author(s)
  野々山翔太，柳熙盟，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Community succession of a soil bacterial population cultured with different carbon sources2022
- Author(s)
  Stari Lazo Leonardo Alfredo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 細菌の環境適応・機能進化機構の包括的理解と環境細菌の高度利用および未開拓潜在機能開発への応用2022
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  公益財団法人発酵研究所 (IFO) 第16回助成研究報告会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌細菌機能発現を支える種間相互作用2022
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  大隅基礎科学創成財団微生物コンソーシアム定例会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Cupriavidus株が長期持続的g-HCH分解細菌集団形成の鍵である2022
- Author(s)
  佐子川さやか、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 異なる無菌土壌への細菌集団移植時の菌叢形成2022
- Author(s)
  平野翔子, 加藤広海, 大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会35回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] 土壌細菌機能発現を支える種間相互作用2022
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  大隅基礎科学創成財団微生物コンソーシアム定例会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解細菌が産生する membrane vesicle に含まれる DNA2022
- Author(s)
  石原知行，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 二価サブライブラリ構築による新型コロナウィルスに結合する DNA アプタマーの取得と展開2022
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会シンポジウム「機能性核酸の創製と生命科学応用に向けた新展開」
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 異なる無菌土壌への細菌集団移植時の菌叢形成2022
- Author(s)
  平野翔子, 加藤広海, 大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会35回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] Community succession of a soil bacterial population cultured with different carbon sources2022
- Author(s)
  Stari Lazo Leonardo Alfredo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22K19124
[Presentation] 細菌由来の有機塩素系殺虫剤分解に関わるデハロゲナーゼを発現するシロイヌナズナ植物の作製2022
- Author(s)
  鄧文昊，高田美信，大坪嘉行，渡辺正夫，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌細菌の進化と種間相互作用2022
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  第34回加藤記念研究助成贈呈式特別講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] 土壌細菌機能発現を支える種間相互作用2022
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  大隅基礎科学創成財団微生物コンソーシアム定例会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Burkholderia株由来の細胞外多糖類画分による難培養性 Verrucomicrobia門細菌の集積培養2022
- Author(s)
  笹川航，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Community succession of a soil bacterial population cultured with different carbon sources2022
- Author(s)
  Stari Lazo Leonardo Alfredo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23K23500
[Presentation] Burkholderia株由来の細胞外多糖類画分による難培養性 Verrucomicrobia門細菌の集積培養2022
- Author(s)
  笹川航，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 異なる無菌土壌への細菌集団移植時の菌叢形成2022
- Author(s)
  平野翔子, 加藤広海, 大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会35回大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] γ-HCH 分解細菌コミュニティ形成におけるCupriavidus 株の重要性2022
- Author(s)
  佐子川さやか，羽賀千晃，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解細菌が産生する membrane vesicle に含まれる DNA2022
- Author(s)
  石原知行，加藤広海，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2022年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Membrane vesicle production and vesicle-related DNA of sphingomonad strain capable of degrading organochlorine pesticide2021
- Author(s)
  Hiromi Kato, Tatsuya Suzuki, Tomoyuki Ishihara, Takamitsu Soma, Masanori Toyofuku, Nobuhiko Nomura, and Yuji Nagata
- Organizer
  EMBO Workshop Bacterial membrane vesicles: Biogenesis, functions and medical applications
- Data Source
  KAKENHI-PLANNED-21H05315
[Presentation] Taq DNA polymeraseによる新規タイプのCIS反応2021
- Author(s)
  川原昌太郎，永田裕二，大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] メタゲノムから見た土壌環境のγ -HCH 分解細菌の多様性2021
- Author(s)
  加藤広海,勝保奈実 , 永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会34回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 新規qTnSeq法の開発:PCB/ビフェニル分解菌への適用と2つの指標値の導入2021
- Author(s)
  逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  第15回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] γ-HCH分解細菌コミュニティの固体培地上での異種複合コロニー形成2021
- Author(s)
  佐子川さやか羽賀千晃加藤広海永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会34回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] ICEKKS1024677の接合伝達を制御する遺伝子発現制御機構2021
- Author(s)
  松本哲，永田裕二，大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] γ-Hexachlorocyclohexane(HCH)汚染土壌のメタゲノム解析2021
- Author(s)
  加藤広海，田中彩美，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] qTnSeq法を用いたBurkholderia属細菌における潜在的抗生物質耐性遺伝子の網羅的同定2021
- Author(s)
  野々山翔太、逸見裕太郎、永田裕二、大坪嘉行
- Organizer
  第15回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を持つスフィンゴモナッド細菌株のmembrane vesicle形成とvesicleが有するDNA2021
- Author(s)
  鈴木達也，相馬隆光，加藤広海，豊福雅典，野村暢彦，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 新型コロナウィルスを認識するDNAアプタマーの作製と迅速検出法の構築2021
- Author(s)
  大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 従属栄養細菌の極貧栄養環境でのCO2依存的な増殖現象2021
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会シンポジウム「細菌の低栄養環境に対する増殖を伴う適応機構」
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Burkholderia 株由来の細胞外多糖類による土壌細菌の選択的培養2021
- Author(s)
  笹川航 , 加藤広海 , 大塚重人 , 永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会34回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌環境中でのγ -HCH 分解細菌の多様性と進化2021
- Author(s)
  勝保奈実 , 田中彩美 , 加藤広海 , 永田裕二
- Organizer
  微生物生態学会34回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける転写制御因子IscRの解析2021
- Author(s)
  野々山翔太，岸田康平，酒井啓一郎，永田裕二，津田雅孝，大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 平板培地を用いた実験進化により構築したモデル細菌集団内の多様性維持機構2021
- Author(s)
  平野彰大、山本達也、仁平賢、野村暢彦、永田裕二、矢野大和
- Organizer
  第15回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Membrane vesicle production and vesicle-related DNA of sphingomonad strain capable of degrading organochlorine pesticide2021
- Author(s)
  Hiromi Kato, Tatsuya Suzuki, Tomoyuki Ishihara, Takamitsu Soma, Masanori Toyofuku, Nobuhiko Nomura, and Yuji Nagata
- Organizer
  EMBO Workshop Bacterial membrane vesicles: Biogenesis, functions and medical applications
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼ及びデアミナーゼからなる融合酵素DahXのtRNA編集活性2021
- Author(s)
  高橋由紀子，佐藤優花里，中鉢千尋，野々山翔太，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] バクテリアにおけるヒッチハイク現象の環境浄化技術への応用2021
- Author(s)
  岩本和音、Kafayat Olaide Yusuf Habibullah、加藤広海、永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 実験進化系で得られた人工殺虫剤分解に関与する進化型ハロアルカンデハロゲナーゼ2021
- Author(s)
  陳楠楠，大坪嘉行，永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2021年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] PCB分解菌Acidovorax sp. KKS102株が示す多段階増殖とレスポンスレギュレーターBphQの翻訳後修飾2020
- Author(s)
  酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] キャピラリーシーケンサーとTraceViewerを用いたDNA解析のススメ2020
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 農薬分解細菌を用いた平板培地実験進化系の構築2020
- Author(s)
  仁平賢、山本達也、平野彰大、野村暢彦、永田裕二、矢野大和
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 培養条件検討からadhX遺伝子依存的貧栄養環境生育機構に迫る2020
- Author(s)
  酒井洋範、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達に関与するtraR遺伝子の機能解析2020
- Author(s)
  松本哲、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Construction of experimental evolution system of haloalkane dehalogenases and characterization of the evolved enzymes2020
- Author(s)
  Nannan CHEN, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 人工遺伝子クラスターを利用した有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子キャプチャリング株の作製2020
- Author(s)
  蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Burkholderia属ヘム獲得系転写活性化因子HemPの普遍的機能の解析2020
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤拓哉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] qTnSeq法を利用したPCB/ビフェニル分解菌の分解制限要因の同定と排除2020
- Author(s)
  逸見裕太郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 有機リン系殺虫剤分解細菌Sphingopyxis wildii株由来の2種のハロアルカンデハロゲナーゼの解析2020
- Author(s)
  鄧文昊、Annapoorni Lakshman Sagar、陳楠楠、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、Dayanannda Siddavattam、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] PCB分解菌Acidovorax sp. KKS102株が示す多段階増殖とレスポンスレギュレーターBphQの翻訳後修飾2020
- Author(s)
  酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達に関与するtraR遺伝子の機能解析2020
- Author(s)
  松本哲、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Acidovorax sp. KKS102株が有する融合酵素DahXのtRNA編集活性2020
- Author(s)
  高橋由紀子、中鉢千尋、野々山翔太、佐藤優花里、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] qTnSeq法を利用したPCB/ビフェニル分解菌の分解制限要因の同定と排除2020
- Author(s)
  逸見裕太郎、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Burkholderia 属ヘム獲得系転写活性化因子 HemP の普遍的機能の解析2020
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤拓哉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 超音波で断片化したDNAの3'端と効率的修復2020
- Author(s)
  大坪嘉行、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得のための人工キャプチャリング株の構築2020
- Author(s)
  蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 超音波で断片化したDNAの3'端と効率的修復2020
- Author(s)
  大坪嘉行、酒井啓一郎、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写活性化機構の解析2020
- Author(s)
  野々山翔太、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 培養条件検討からadhX遺伝子依存的貧栄養環境生育機構に迫る2020
- Author(s)
  酒井洋範、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Survivability of a gamma-hexachlorocyclohexane-degrading sphingomonad strain in soil.2020
- Author(s)
  Kafayat YUSUF, Hiromi Kato, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Burkholderia multivorans の鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写活性化機構の解析2020
- Author(s)
  野々山翔太、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 有機塩素殺虫剤分解酵素遺伝子取得のための人工キャプチャリング株の構築2020
- Author(s)
  蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を持つスフィンゴモナッド細菌株のmembrane vesicle形成2020
- Author(s)
  鈴木達也、相馬隆光、加藤広海、豊福雅典、野村暢彦、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2020年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] キャピラリーシーケンサーと TraceViewer を用いた DNA 解析のススメ2020
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第14回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] qTnSeq法の開発とPCB分解細菌への適用2019
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2019年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 生態学は生物群集デザインに活用できるか？2019
- Author(s)
  近藤倫生、東豊浩、加藤広海、川津一隆、長田穣、永田裕二
- Organizer
  日本生物工学会第71回大会シンポジウム
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 土壌細菌叢の初期形成過程における移動性細菌の役割2019
- Author(s)
  加藤広海、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第33回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 人工の代謝酵素遺伝子クラスターを利用した高機能有機塩素殺虫剤資化細菌の育種2019
- Author(s)
  蘇立俊 , 加藤広海 , 大坪嘉行 , 津田雅孝 , 永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第33回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45の生育阻害因子の解析2019
- Author(s)
  堀川慧太、池内倫子、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第13回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Mycobacterium sp. EPa45株におけるフェナントレン分解遺伝子群の転写解析2019
- Author(s)
  市橋永吉、小川なつみ、加藤広海、岸田康平、野々山翔太、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第13回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Burkholderia属細菌におけるFurで制御されるヘム獲得系活性化因子HemPの普遍的機能の解析2019
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤　拓哉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第13回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 難培養性細菌の培養における細胞外多糖の重要性2019
- Author(s)
  高橋紳八、加藤広海、永田裕二、大塚重人、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2019年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Sphingobium japonicum UT26株の有機塩素系殺虫剤分解に関わるABCトランスポーターの解析2019
- Author(s)
  尾形拓哉、佐藤優花里、永田裕二
- Organizer
  日本生化学会東北支部会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] プラスミドベクターpBBR1MCSの宿主域に関する研究2019
- Author(s)
  岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第13回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 異なる土壌間における微生物集団の移植実験2019
- Author(s)
  加藤広海、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2019年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 環境細菌におけるadhX遺伝子が関与する貧栄養環境適応機構の普遍性2019
- Author(s)
  酒井洋範、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第33回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] IscR of Burkholderia multivorans plays both repressing and activating roles in transcription of isc operon for biosynthesis of Fe-S cluster2019
- Author(s)
  Shouta Nonoyama, Kouhei Kishida, Yuji Nagata, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
- Organizer
  8th Congress of European Microbiologists
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 土壌細菌叢の初期形成過程における移動性細菌の役割2019
- Author(s)
  加藤広海 , 津田雅孝 , 永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第33回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] 微生物はなぜ群れを作るのか？：平板培地実験進化系を用いたBHQの検証2019
- Author(s)
  仁平賢, 山本達也, 平野彰大, 野村暢彦, 永田裕二 , 矢野大和
- Organizer
  日本微生物生態学会第33回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の分配系が関与する接合伝達頻度上昇2019
- Author(s)
  久土晃二、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第13回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 土壌細菌叢の液体培養系における遷移の動態解析2019
- Author(s)
  東豊浩 , 加藤広海 , 長田穣 , 永田裕二 , 近藤倫生
- Organizer
  日本微生物生態学会第33回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] Burkholderia属細菌における鉄硫黄クラスター生合成系の転写制御機構の解析2019
- Author(s)
  野々山翔太、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2019年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関与する二成分調節因子BphPQの機能調節の解析2019
- Author(s)
  酒井啓一郎、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2019年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 環境細菌におけるadhX遺伝子が関与する貧栄養環境適応機構の普遍性2019
- Author(s)
  酒井洋範 , 加藤広海 , 大坪嘉行 , 津田雅孝 , 永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第33回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19H02865
[Presentation] PCB/ビフェニル分解資化遺伝子群を有すICEKKS1024677の水平伝播宿主域の解析2019
- Author(s)
  川原昌太郎、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2019年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 土壌細菌叢の形成プロセスにおける再現性2018
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、黒川顕、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第32回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系因子BphPQの解析2018
- Author(s)
  佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝、大坪嘉行
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Identification and characterization of a novel gene essential for conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH72018
- Author(s)
  Kouhei Kishida、Nonoyama Shouta、Nagata Yuji、Ohtsubo Yoshiyuki、Masataka Tsuda
- Organizer
  Plasmid Biology 2018
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Furで制御されるBurkholderia属細菌ヘム獲得系活性化因子HemPの解析2018
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤拓哉、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] トランスクリプトーム解析を用いた環境細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応戦略の解明2018
- Author(s)
  田上諒、西山依里、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 難分解性芳香族化合物分解コンソーシアム由来の分解細菌Mycobacteirum sp. EPa45株における生育阻害機構2018
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、岸田康平、市橋永吉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] PCB/ビフェニル分解菌Acidovorax sp. KKS102株が有するICEの接合伝達域規定因子の同定2018
- Author(s)
  川原昌太郎、岸田康平、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018
- Author(s)
  野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達に必須な遺伝子セットの同定2018
- Author(s)
  岸田康平、Tim Lucas、野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] トランスクリプトーム解析を用いた環境細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応戦略の解明2018
- Author(s)
  田上諒、西山依里、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] フェナントレン分解Mycobacterium株の遺伝子破壊系構築とビフェニル分解への転写応答2018
- Author(s)
  市橋永吉、小川なつみ、岸田康平、加藤広海、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 代謝酵素遺伝子群の人工クラスターを利用した有機塩素系殺虫剤資化細菌の育種2018
- Author(s)
  蘇立俊、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 好気性従属栄養細菌における極貧栄養環境適応変異株の解析2018
- Author(s)
  稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 高度難分解性環境汚染物質分解細菌から微生物進化を探る2018
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 環境汚染物質の分解細菌コミュニティにおける非分解菌コロニーの分解菌コロニーへの接近現象2018
- Author(s)
  加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 難分解性芳香族化合物分解コンソーシアム由来の分解細菌Mycobacteirum sp. EPa45株における生育阻害機構2018
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、岸田康平、市橋永吉、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 逆転写酵素のtailing活性と新規TSLR反応を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析2018
- Author(s)
  大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] デアミナーゼと融合した新規デハロゲナーゼの特徴2018
- Author(s)
  中鉢千尋、佐藤優花里、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 好気性従属栄養細菌株由来の極貧栄養環境での生育能を獲得した突然変異株の解析2018
- Author(s)
  稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Furで制御されるBurkholderia属細菌ヘム獲得系活性化因子HemPの解析2018
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤拓哉、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 逆転写酵素を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析手法の確立2018
- Author(s)
  大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤資化に必須なABCトランスポーターホモログの機能解析2018
- Author(s)
  佐藤緋奈子、中鉢千尋、佐藤優花里、矢野大和、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規な接合伝達必須遺伝子の機能解明2018
- Author(s)
  岸田康平、Tim Lucas、野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018
- Author(s)
  野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 従属栄養性土壌細菌の超貧栄養環境に対する適応機構2018
- Author(s)
  稲葉慎之介、加藤広海、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第32回大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 逆転写酵素を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析手法の確立2018
- Author(s)
  大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群における転写制御因子IscRの解析2018
- Author(s)
  野々山翔太、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] フェナントレン分解Mycobacterium株の遺伝子破壊系構築とビフェニル分解への転写応答2018
- Author(s)
  市橋永吉、小川なつみ、岸田康平、加藤広海、永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 逆転写酵素のtailing活性と新規TSLR反応を用いたトランスポゾン変異株ライブラリーの定量的解析2018
- Author(s)
  大坪嘉行、佐々木春菜、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 土壌難培養性細菌の単離及び易培養性細菌との共存関係2018
- Author(s)
  高橋紳八、加藤広海、永田裕二、大塚重人、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 環境汚染物質の分解細菌コミュニティにおける非分解菌コロニーの分解菌コロニーへの接近現象2018
- Author(s)
  加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2018年度大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] In vivo evolution system for haloalkane dehalogenases toward degradation of a man-made pesticide2018
- Author(s)
  陳楠楠、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  第12回日本ゲノム微生物学会年会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] IncP-9群プラスミドの接合伝達に関わる全遺伝子の同定2017
- Author(s)
  岸田康平、ルーカスティム、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害の緩和に対する非分解細菌の生細胞の重要性2017
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 極貧栄養環境での生育能を獲得した好気性従属栄養細菌突然変異株の解析2017
- Author(s)
  稲葉慎之介, 加藤広海, 大坪嘉行, 津田雅孝, 永田裕二
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Expression of an alcohol dehydrogenase gene in a heterotrophic bacterium induces the oligotrophic growth with carbon dioxide fixation2017
- Author(s)
  Shinnosuke Inaba, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda, Yuji Nagata
- Organizer
  The 7th Congress of European Microbiologists (FEMS 2017)
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群の転写因子IscRの解析2017
- Author(s)
  野々山翔太、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 土壌細菌叢メタゲノムの時間的変動と細菌間相互作用2017
- Author(s)
  加藤広海、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第61回日本放線菌学会学術講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応メカニズムの経時的解析2017
- Author(s)
  田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌における適応機構の解明2017
- Author(s)
  田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市京都女子大学
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] マウス白血病ウィルス由来逆転写酵素のN-tailing活性と解析ツールTraceViewer2017
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市京都女子大学
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の新規接合伝達必須遺伝子の機能解析2017
- Author(s)
  岸田康平、Tim Lukas, 大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 金属イオンコファクターの違いによる接合伝達の鍵酵素relaxaseのnick導入塩基配列特異性の変化2017
- Author(s)
  岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
- Year and Date
  2017-03-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransの土壌環境適応メカニズムの経時的解析2017
- Author(s)
  田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 定量的TnSeq解析法の構築とPCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株の全必須遺伝子の同定2017
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 利用する：汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割2017
- Author(s)
  加藤広海，小川なつみ，大坪嘉行，永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 細菌由来のデアミナーゼ―デハロゲナーゼ融合タンパク質の機能解析2017
- Author(s)
  佐藤あや華、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市京都女子大学
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構に関する研究2017
- Author(s)
  稲葉慎之介、加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] フェナントレン分解細菌の基質耐性突然変異株の取得と解析2017
- Author(s)
  池内倫子、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
- Year and Date
  2017-03-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] フェナントレン分解細菌Mycobacterium sp. EPa45株のフェナントレンに対する転写応答2017
- Author(s)
  小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
- Organizer
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
- Year and Date
  2017-03-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Strong N-tailing activity and specific enhancers of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase toward blunt DNA ends2017
- Author(s)
  Ohtsubo Yoshiyuki、Nagata Yuji、Tsuda Masataka
- Organizer
  15th International Union of Microbiological Societies
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] PCB分解細菌Acidovorax sp. KKS102株のカタボライト調節に関わる二成分調節系制御因子についての解析2017
- Author(s)
  佐々木春菜, 永田裕二, 津田雅孝, 大坪嘉行
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 土壌細菌叢メタゲノムの時間的変動と細菌間相互作用2017
- Author(s)
  加藤広海、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第61回日本放線菌学会学術講演会
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 二種類の酵素ドメインから構成される融合タンパク質の示差走査蛍光定量解析2017
- Author(s)
  佐藤優花里、中鉢千尋、永田裕二
- Organizer
  2017年度生命科学系学会合同年次大会
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤分解細菌コミュニティに関する研究2017
- Author(s)
  加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 逆転写酵素の強いtailing活性と解析ソフトTraceViewer2017
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
- Year and Date
  2017-03-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤γ-hexachlorocyclohexane分解コミュニティのメタゲノム解析2017
- Author(s)
  加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
- Year and Date
  2017-03-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 汚染物質分解コンソーシアムにおける非分解菌の役割2017
- Author(s)
  加藤広海，小川なつみ，大坪嘉行，永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] Strong N-tailing activity and specific enhancers of Moloney murine leukemia virus reverse transcriptase toward blunt DNA ends2017
- Author(s)
  Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda
- Organizer
  15th International Union of Microbiological Societies (IUMS2017)
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群の転写因子IscRの解析2017
- Author(s)
  野々山翔太、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター生合成系の転写制御機構の解析2017
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤拓哉、岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市京都女子大学
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 難分解性有機塩素系殺虫剤の分解細菌コミュニティにおける非分解菌の役割2017
- Author(s)
  加藤広海、大坪嘉行、津田雅孝、永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2017年度大会
- Place of Presentation
  京都府京都市京都女子大学
- Year and Date
  2017-03-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Burkholderia multivoransの鉄硫黄クラスター生合成遺伝子群に対する転写因子Fur及びIscRの作用機序2017
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤拓哉、岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第11回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神奈川県藤沢市慶應義塾大学湘南藤沢キャンパス
- Year and Date
  2017-03-02
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害に対する非分解細菌の役割：RNA-seq解析による検討2017
- Author(s)
  小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-17H03781
[Presentation] フェナントレン分解細菌の生育阻害に対する非分解細菌の役割：RNA-seq解析による検討2017
- Author(s)
  小川なつみ、石毛太一郎、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、吉川博文、津田雅孝
- Organizer
  第２回環境微生物系学会合同大会2017
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 土壌微生物のノトバイオロジー2016
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会シンポジウム「微生物エコシステムを制御せよ！最先端テクノロジーがもたらす複合微生物系研究のパラダイムシフト」
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子の解析2016
- Author(s)
  岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
- Place of Presentation
  広島県広島市広島県民文化センター
- Year and Date
  2016-06-13
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016
- Author(s)
  稲葉慎之介, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016
- Author(s)
  守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016
- Author(s)
  守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016
- Author(s)
  大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第89回日本細菌学会ワークショップ「共創:微生物エコシステム構成原理」
- Place of Presentation
  大阪交流センター（大阪府、大阪市）
- Year and Date
  2016-03-23
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016
- Author(s)
  野々山翔太, 佐藤拓哉, 岸田康平, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016
- Author(s)
  阿部史歩　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016
- Author(s)
  佐藤拓哉, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016
- Author(s)
  守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 土壌環境におけるBurkholderia属細菌の生育段階と土壌高発現遺伝子の転写変動パターンの関係性2016
- Author(s)
  田上諒、西山依里、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本微生物生態学会第31回大会
- Place of Presentation
  神奈川県横須賀市横須賀市文化会館
- Year and Date
  2016-10-22
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016
- Author(s)
  守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016
- Author(s)
  野々山翔太, 佐藤拓哉, 岸田康平, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 土壌微生物のノトバイオロジー2016
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌
- Year and Date
  2016-03-27
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] フェナントレン分解細菌Burkholderia sp.HB-1株のゲノムと芳香属分解遺伝子の解析2016
- Author(s)
  守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016
- Author(s)
  大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第89回日本細菌学会総会
- Place of Presentation
  大阪
- Year and Date
  2016-03-23
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子traDEFの解析2016
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016
- Author(s)
  小山旺, 森内良太, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016
- Author(s)
  佐藤拓哉　湯原悟志　野々山翔太　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016
- Author(s)
  岸田康平　井上慧　大坪嘉行　永田裕二　津田　雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016
- Author(s)
  野々山翔太　佐藤拓哉　岸田康平　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016
- Author(s)
  佐藤あや華, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016
- Author(s)
  岸田康平　井上慧　大坪嘉行　永田裕二　津田　雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016
- Author(s)
  稲葉慎之介　平野丈　宇井博紀　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 鉄濃度依存的に発現変動する機能未知遺伝子hemPの解析2016
- Author(s)
  佐藤拓哉　湯原悟志　野々山翔太　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] PCB/biphenyl分解細菌株が有する新規haloalkane dehalogenase遺伝子の解析2016
- Author(s)
  佐藤あや華, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムに存在する非分解菌の分解菌に対する効果2016
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 環境常在細菌が有する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子関与の新規極貧栄養環境適応機構2016
- Author(s)
  稲葉慎之介　平野丈　宇井博紀　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016
- Author(s)
  渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016
- Author(s)
  渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Plant-associated Aureimonas with the sole rRNA operon on a tiny plasmid2016
- Author(s)
  M Anda, Y Ohtsubo, Ti Okubo, M Sugawara, Y Nagata, M Tsuda,S Ikeda, S Eda, H Mitsui, K Minamisawa
- Organizer
  16th International Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Palais des Congres de Montreal, Montreal, Canada
- Year and Date
  2016-08-21
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016
- Author(s)
  佐藤拓哉, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016
- Author(s)
  阿部史歩、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 環境常在細菌におけるアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhX関与の普遍的低栄養環境適応戦略2016
- Author(s)
  稲葉慎之介, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連機能未知遺伝子群traDEFの解析2016
- Author(s)
  岸田康平、井上慧、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] Construction of in vivo evolution system for haloalkane dehalgenases2016
- Author(s)
  Y. Nagata, R. Moriuchi, A. Koyama, Y. Ohtsubo, L. Chrast, J. Damborsky, and M. Tsuda
- Organizer
  2nd ASM Conference on Experimental Microbial Evolution
- Place of Presentation
  The Mayflower Hotel, Washington DC, USA
- Year and Date
  2016-08-04
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 土壌細菌叢変動とレジームシフト2016
- Author(s)
  大坪嘉行、加藤広海、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第89回日本細菌学会ワークショップ「共創:微生物エコシステム構成原理」
- Place of Presentation
  大阪交流センター（大阪府、大阪市）
- Year and Date
  2016-03-23
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 土壌における細菌叢の形成・定着過程の長期モニタリング2016
- Author(s)
  加藤広海、渡来直生、森宙史、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
- Place of Presentation
  広島県広島市広島県民文化センター
- Year and Date
  2016-06-13
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 環境常在細菌に見出された新規低栄養環境適応機構2016
- Author(s)
  稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2016年度大会
- Place of Presentation
  広島県広島市広島県民文化センター
- Year and Date
  2016-06-13
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] 次世代シーケンサーを用いたqTnSeq法の構築2016
- Author(s)
  阿部史歩　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 微生物群集動態の原理解明に向けた再現モデルの構築2016
- Author(s)
  渡来直生、森宙史、加藤広海、大坪嘉行、小椋義俊、永田裕二、豊田敦、藤山秋佐夫、林哲也、津田雅孝、黒川顕
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 再構築された土壌微生物群集の超長期培養2016
- Author(s)
  加藤広海、渡来直生、森宙史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  日本微生物生態学会第31回大会
- Place of Presentation
  神奈川県横須賀市横須賀市文化会館
- Year and Date
  2016-10-22
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] Burkholderia multivorans における鉄硫黄クラスター合成遺伝子群の転写制御に対するFur及びIscRの作用機作2016
- Author(s)
  野々山翔太　佐藤拓哉　岸田康平　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 汚染土壌細菌叢の新規環境への定着及び再汚染のメタゲノム解析2016
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、渡来直生、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、豊田敦、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016
- Author(s)
  小川なつみ　加藤広海　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムMixEPa4における構成細菌間の相互作用2016
- Author(s)
  守屋梓、小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] リボソームRNAオペロンが染色体に存在しない細菌の発見2016
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究、三井久幸
- Organizer
  日本RNA学会-第4回 RIBOSOME MEETING
- Place of Presentation
  大阪府高槻市大阪医科大学
- Year and Date
  2016-09-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-16K14877
[Presentation] ハロアルカンデハロゲナーゼの細胞内酵素機能進化系の構築2016
- Author(s)
  小山旺, 森内良太, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 遺伝学的解析を用いた芳香族化合物分解コンソーシアムにおける分解菌と非分解菌の共在機構の解明2016
- Author(s)
  小川なつみ　加藤広海　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] SeqView: DNA 配列/アミノ酸配列の表示ツール2016
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第10回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京工業大学大岡山キャンパス（東京都、目黒区）
- Year and Date
  2016-03-04
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] DNA配列表示ツールSeqView2016
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌コンベンションセンター（北海道、札幌市）
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur制御下の機能未知遺伝子hemPの解析2016
- Author(s)
  佐藤拓哉、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] Burkholderia multivoransにおける鉄硫黄クラスター合成系遺伝子群の転写制御機構の解析2016
- Author(s)
  野々山翔太、佐藤拓哉、岸田康平、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2016年度大会
- Place of Presentation
  札幌
- Year and Date
  2016-03-27
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015
- Author(s)
  永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第30回日本微生物生態学会年次大会シンポジウム「環境での遺伝子リスクの醸成：薬剤耐性と病原性の遺伝子伝播」
- Place of Presentation
  土浦亀城プラザ（茨城県、土浦市）
- Year and Date
  2015-10-17
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015
- Author(s)
  按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
- Organizer
  日本遺伝学会第87回大会ワークショップ12「ゲノムとOMICSの比較から現れた遺伝と進化をめぐる驚き」
- Place of Presentation
  東北大学川内北キャンパス（宮城県、仙台市）
- Year and Date
  2015-09-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015
- Author(s)
  Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
- Organizer
  The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
- Place of Presentation
  Honolulu, Hawaii, USA
- Year and Date
  2015-12-15
- Invited / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015
- Author(s)
  加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第30回日本微生物生態学会年次大会
- Place of Presentation
  土浦亀城プラザ（茨城県、土浦市）
- Year and Date
  2015-10-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015
- Author(s)
  Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
- Organizer
  The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (Pacifichem 2015)
- Place of Presentation
  Honolulu, Hawaii, USA
- Year and Date
  2015-12-15
- Invited / Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015
- Author(s)
  稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
- Place of Presentation
  東京大学弥生キャンパス（東京都、文京区）
- Year and Date
  2015-06-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015
- Author(s)
  加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第30回日本微生物生態学会年次大会
- Place of Presentation
  土浦亀城プラザ（茨城県、土浦市）
- Year and Date
  2015-10-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Haloalkane dehalogenases in bacteria2015
- Author(s)
  Yuji Nagata, Ryota Moriuchi, Yoshiyuki Ohtsubo, and Masataka Tsuda
- Organizer
  The International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
- Place of Presentation
  Honolulu, Hawaii, USA
- Year and Date
  2015-12-15
- Int'l Joint Research
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 有機塩素系農薬分解細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの機能解析2015
- Author(s)
  稲葉慎之介、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2015年度大会
- Place of Presentation
  東京大学弥生キャンパス（東京都、文京区）
- Year and Date
  2015-06-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015
- Author(s)
  永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第30回日本微生物生態学会年次大会シンポジウム「環境での遺伝子リスクの醸成：薬剤耐性と病原性の遺伝子伝播」
- Place of Presentation
  土浦亀城プラザ（茨城県、土浦市）
- Year and Date
  2015-10-17
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 環境を汚染する難分解性農薬分解遺伝子群の水平伝播2015
- Author(s)
  永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第30回日本微生物生態学会年次大会
- Place of Presentation
  土浦
- Year and Date
  2015-10-17
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究、三井久幸
- Organizer
  日本遺伝学会第87回大会
- Place of Presentation
  仙台
- Year and Date
  2015-09-24
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] リボソームRNA遺伝子の染色体外への移行2015
- Author(s)
  按田瑞恵, 大坪嘉行, 大久保卓, 菅原雅之, 永田裕二, 津田雅孝, 南澤究, 三井久幸
- Organizer
  日本遺伝学会第87回大会ワークショップ12「ゲノムとOMICSの比較から現れた遺伝と進化をめぐる驚き」
- Place of Presentation
  東北大学川内北キャンパス（宮城県、仙台市）
- Year and Date
  2015-09-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] メタゲノム情報を基盤とした汚染土壌の細菌コンソーシアムの研究2015
- Author(s)
  加藤広海、小川なつみ、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第30回日本微生物生態学会年次大会
- Place of Presentation
  土浦
- Year and Date
  2015-10-17
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014
- Author(s)
  小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014
- Author(s)
  永田裕二,平野丈,宇井博紀,大坪嘉行,津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] フェナントレン分解コンソーシアムにおける非分解優占種細菌の役割2014
- Author(s)
  小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014
- Author(s)
  佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014
- Author(s)
  永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014
- Author(s)
  佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014
- Author(s)
  小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014
- Author(s)
  大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014
- Author(s)
  荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014
- Author(s)
  佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014
- Author(s)
  永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌微生物の移植メタゲノム2014
- Author(s)
  加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Finishしたゲノム配列のチェックツール: FinishChecker2014
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivoransにおけるFur依存的な鉄恒常性維持に関与するhemP遺伝子の解析2014
- Author(s)
  佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 土壌微生物の移植メタゲノム2014
- Author(s)
  加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 永山浩史, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤分解能を有するスフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機寒天培地での生育を司る機構に関する研究2014
- Author(s)
  永田裕二, 平野丈, 宇井博紀, 大坪嘉行, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7のoriTの同定と宿主域の解析2014
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Burkholderia multivoransのFurを介した転写制御機構の解明2014
- Author(s)
  佐藤拓哉, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] gamma-HCH分解能を有するsphingomonad細菌株における可動性遺伝因子を介したゲノム動態の解析2014
- Author(s)
  大畑智史, 田端理朗, 荷川取佑記, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] FinishChecker: 完全決定したつもりのゲノム配列のチェック機能2014
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] IncP-9群NAH7のoriTの同定と接合伝達宿主域に関する研究2014
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Acidvorax sp KKS102のカタボライト調節機構に関わる二成分制御系遺伝子bphPQの解析2014
- Author(s)
  佐藤旦, 小沼かおり, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Mycobacterium属細菌のフェナントレン分解能に対する非分解菌の効果2014
- Author(s)
  小川なつみ, 加藤広海, 遠藤諒, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第8回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 芳香族化合物汚染化土壌メタゲノムから培養非依存的手法により取得したフェノール分解関与遺伝子群の機能解析2014
- Author(s)
  永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解能を有するスフィンゴモナッド細菌群の挿入配列に関する研究2014
- Author(s)
  荷川取佑記, 大畑智史, 田端理朗, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2014年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013
- Author(s)
  佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013
- Author(s)
  加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
- Organizer
  第29回日本微生物生態学会年次大会
- Place of Presentation
  鹿児島
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二ら
- Organizer
  日本農芸化学会2013年大会
- Place of Presentation
  仙台
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013
- Author(s)
  Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
- Organizer
  2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
- Place of Presentation
  Braunschweig, German
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013
- Author(s)
  永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7の接合伝達開始配列の解析2013
- Author(s)
  岸田康平,井上慧,宮崎亮,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  長浜
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] 土壌微生物の他土壌への移植メタゲノミクス2013
- Author(s)
  加藤広海, 森宙史, 丸山史人, 豊田敦, 大坪嘉行, 永田裕二, 藤山秋佐夫, 黒川顕, 津田雅孝
- Organizer
  第29回日本微生物生態学会年次大会
- Place of Presentation
  鹿児島
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC 17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013
- Author(s)
  佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会　第20回記念フロンティアシンポジウム
- Place of Presentation
  仙台
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二ら
- Organizer
  日本農芸化学会2013年大会
- Place of Presentation
  仙台
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013
- Author(s)
  永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会
- Place of Presentation
  長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会　第20回記念フロンティアシンポジウム
- Place of Presentation
  仙台
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会第20回記念フロンティアシンポジウム
- Place of Presentation
  日仙台(招待講演)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二, 森内良太, 田中裕興, 大坪嘉行, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会
- Place of Presentation
  静岡県駿東郡
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013
- Author(s)
  永田裕二、大畑智史、田端理朗、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会
- Place of Presentation
  長浜バイオ大学(長浜)(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 機能発現に基づくメタゲノムライブラリーからの新規芳香族化合物分解酵素遺伝子の取得と解析2013
- Author(s)
  永山浩史, 菅原智詞, 遠藤諒, 加藤広海, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013
- Author(s)
  佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会
- Place of Presentation
  静岡県駿東郡
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2013年大会
- Place of Presentation
  仙台
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2013年大会
- Place of Presentation
  東北大学(仙台)(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 累積置換変異導入によるハロアルカンデハロゲナーゼLinBのbeta-HCH分解活性の機能進化に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二,森内良太,田中裕興,大坪嘉行,津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定とtraF欠失による宿主域変化2013
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会
- Place of Presentation
  静岡県駿東郡
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013
- Author(s)
  永田裕二ら
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  長浜
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Isolation of phenol-catabolic genes by cultivation-independent functional screening from metagenome of soil artificially polluted by aromatic hydrocarbons2013
- Author(s)
  Hirofumi Nagayama, Tomonori Sugawara, Ryo Endo, Hiromi Kato, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Hiroshi Mori, Ken, Kurokawa, and Masataka Tsuda
- Organizer
  2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
- Place of Presentation
  Braunschweig, Germany
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] IncP-9群プラスミドNAH7のoriTの同定及び接合伝達関連遺伝子traFの解析2013
- Author(s)
  岸田康平, 井上慧, 宮崎亮, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2013年度大会
- Place of Presentation
  北九州
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 人為起源環境汚染物質分解能を有するスフィンゴモナス細菌群のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2013
- Author(s)
  永田裕二、田端理朗、大畑智史、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2013年大会
- Place of Presentation
  東北大学(仙台)(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Burkholderia multivorans ATCC17616株の鉄恒常性維持機構の解明2013
- Author(s)
  佐藤拓哉, 木村明音, 湯原悟志, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会若手の会研究会
- Place of Presentation
  静岡県駿東郡
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 人為起源物質分解能を有するsphingomonad細菌群のゲノムと可動性遺伝因子2013
- Author(s)
  永田裕二ら
- Organizer
  第7回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  長浜
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013
- Author(s)
  Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
- Organizer
  2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
- Place of Presentation
  Braunschweig, Germany
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 人為起源物質分解細菌の出現と進化2013
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会第20回記念フロンティアシンポジウム
- Place of Presentation
  仙台
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Design and experimental validation of a novel non-degenerate universal primer set that amplifies prokaryotic 16S rRNA genes with a low possibility to amplify eukaryotic rRNA genes2013
- Author(s)
  Hiroshi Mori, Fumito Maruyama, Hiromi Kato, Atsushi Toyoda, Ayumi Dozono, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Asao Fujiyama, Masataka Tsuda, and Ken Kurokawa
- Organizer
  2nd Thunen Symposium on Soil Metagenomics: mining and learning from metagenomes plus workshop on bioinformatic tools for soil microbiologists
- Place of Presentation
  Braunschweig, German
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012
- Author(s)
  Y. Nagata et al.
- Organizer
  15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
- Place of Presentation
  Daegu, Korea
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012
- Author(s)
  永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
- Organizer
  第64回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  神戸(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Metagenomic Analysis of Microbial Community in Soil Contaminated with Aromatic Pollutants2012
- Author(s)
  M. Tsuda, 5 人, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, A. Fujiyama, and K. Kurokawa
- Organizer
  Japan-Finland Biotechnology Symposium2012
- Place of Presentation
  Sendai
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Presentation] IncP-7群プラスミドの接合伝達宿主域を規定する因子の探索2012
- Author(s)
  瀬谷学人,井上慧,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2012年大会
- Place of Presentation
  京都
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012
- Author(s)
  永田裕二ら
- Organizer
  第64回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  神戸
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012
- Author(s)
  永田裕二ら
- Organizer
  第64回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  神戸
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌のゲノムと可動性遺伝因子に関する研究2012
- Author(s)
  永田裕二,田端理朗,大畑智史,大坪嘉行,津田雅孝
- Organizer
  第64回日本生物工学会大会
- Place of Presentation
  神戸(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Relationship between intergeneric conjugative transfer of plasmid NAH7 and nitrogen-related phosphotransferase system2012
- Author(s)
  K. Inoue, R. Miyazaki, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  International Plasmid Biology Conference 2012
- Place of Presentation
  Santander, Spain
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012
- Author(s)
  Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS2012) Daegu
- Place of Presentation
  Korea(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012
- Author(s)
  Yuji Nagata
- Organizer
  15th International Biotechnology Symposium and Exhibition
- Place of Presentation
  Daegu, Korea
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支える ABC トランスポーター2012
- Author(s)
  永田裕二、遠藤諒、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第7回トランスポーター研究会年会
- Place of Presentation
  京都(招待講演)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支えるABCトランスポーター2012
- Author(s)
  永田裕二、遠藤諒、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  第7回トランスポーター研究会年会
- Place of Presentation
  京都
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Multiple plasmids ofγ-hexachlorocylohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp2012
- Author(s)
  M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  MM-1. International Plasmid Biology Conference 2012
- Place of Presentation
  Santander, Spain
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012
- Author(s)
  Y. Nagata et al.
- Organizer
  15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
- Place of Presentation
  Daegu, Korea
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] 細菌の有機塩素系殺虫剤分解資化能力を支えるABCトランスポーター2012
- Author(s)
  永田裕二ら
- Organizer
  第7回トランスポーター研究会年会
- Place of Presentation
  京都
- Invited
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達関連遺伝子群のsinglecellレベルでの発現解析2012
- Author(s)
  井上慧,宮崎亮,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2012年大会
- Place of Presentation
  京都
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] Genomes and mobile genetic elements of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterial strains2012
- Author(s)
  Y. Nagata, M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  15th International Biotechnology Symposium and Exhibition (IBS 2012)
- Place of Presentation
  Daegu, Korea(口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-24658068
[Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium. "Indo-Swiss-Collaboration inBiotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011
- Author(s)
  Y. Nagata ,S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguch, N. Fujita, and M. Tsuda
- Organizer
  University of Delhi
- Place of Presentation
  Delhi, India(招待講演)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane)in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis2011
- Author(s)
  Nagata, Y, et aL
- Organizer
  Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology"International Conference"Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane(HCH) & Other Chlorinated Contaminants
- Place of Presentation
  Delhi, India
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達制御に関与する受容菌のリン酸基転移系2011
- Author(s)
  井上慧,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝
- Organizer
  ゲノム微生物学会ワークショップ
- Place of Presentation
  仙台
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane)in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis2011
- Author(s)
  Nagata, Y., et al.
- Organizer
  Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology International ConferenceRecent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants
- Place of Presentation
  Delhi, India
- Year and Date
  2011-09-11
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Nagata, Y., et al
- Organizer
  "Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexaehlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"
- Place of Presentation
  Delhi, India
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 「人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム」理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」2011
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  理研和光キャンパス
- Place of Presentation
  鈴木梅太郎ホール(招待講演)
- Year and Date
  2011-03-11
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Nagata, Y., et al.
- Organizer
  Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology International ConferenceRecent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants
- Place of Presentation
  Delhi, India
- Year and Date
  2011-09-11
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] Structural analysis of plasmids for gamma-hexachlorocyclohexanedegradation in Sphingomonas sp2011
- Author(s)
  M. Tabata, S. Ohhata, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  MM-1. International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
- Place of Presentation
  Sapporo
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] Nitrogen-related phosphotransferase system of Pseudomonas putida KT2440 exerts negative effect onconjugative acquisition ofnaphthalene-catabolic plasmid NAH72011
- Author(s)
  K. Inoue, R. Miyazaki, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  International Union of Microbiological Societies 2011 Congress
- Place of Presentation
  Sapporo
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-23658268
[Presentation] 人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム2011
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」
- Place of Presentation
  和光・理研
- Year and Date
  2011-03-11
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] 人為起源の環境汚染物質分解能を有する細菌ゲノムのダイナミズム2011
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  理研シンポジウム「微生物研究の潮流とそれを支えるリソース基盤」
- Place of Presentation
  和光・理研
- Year and Date
  2011-03-11
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Aerobic degradation of lindane(γ-hexachlorocyclohexane) in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis"Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"2011
- Author(s)
  Y. Nagata, Y. Ohtsubo, and M.Tsuda
- Organizer
  University of Delhi
- Place of Presentation
  Delhi, India(基調講演)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 微生物遺伝子資源の活用技術2011
- Author(s)
  永田裕二、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  東北大学-産総研連携公開講演会
- Place of Presentation
  東京・アキバホール
- Year and Date
  2011-07-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Genomic organization and its structural dynamism of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal γ-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium2011
- Author(s)
  Nagata, Y, et al.
- Organizer
  Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology"International Conference"Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane(HCH) & Other Chlorinated Contaminants
- Place of Presentation
  Delhi, India
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] Aerobic degradation of lindane (γ-hexachlorocyclohexane) in Sphingobium japonicum UT26 and its biochemical and molecular basis2011
- Author(s)
  Nagata, Y., et al
- Organizer
  "Indo-Swiss-Collaboration in Biotechnology" International Conference "Recent Trends in Developing Bioremediation Strategies for Hexachlorocyclohexane (HCH) & Other Chlorinated Contaminants"
- Place of Presentation
  Delhi, India
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 土壌汚染に対する微生物遺伝子プールの変動解析2010
- Author(s)
  津田雅孝,加藤広海,大坪嘉行,永田裕二
- Organizer
  環境バイオテクノロジー学会2010年度大会
- Place of Presentation
  仙台
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Presentation] 微生物遺伝子資源の活用技術2010
- Author(s)
  永田裕二, ら
- Organizer
  東北大学-産総研連携公開講演会
- Place of Presentation
  東京・アキバホール
- Year and Date
  2010-07-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] 細菌機能を利用した難分解性環境汚染物質分解へのアプローチ2010
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本農芸化学会2010年大会
- Place of Presentation
  東京
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20651050
[Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010
- Author(s)
  Nagata, Y., et al
- Organizer
  14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
- Place of Presentation
  Rimini, Italy
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Fluctuation of gene pools of soil microbiota induced by contamination with aromatic hydrocarbons2010
- Author(s)
  H. Kato, 2 人, Y. Ohtsubo, 5 人, Y. Nagata, A. Fujiyama, K. Kurokawa and M. Tsuda
- Organizer
  13th International Society for Microbial Ecology Conference
- Place of Presentation
  Seattle, USA
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380176
[Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010
- Author(s)
  Y. Nagata, S. Natsui, Y. Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, N. Fujita, and M. Tsuda
- Organizer
  14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability ofHuman Society
- Place of Presentation
  Rimini, Italy. (口頭発表)
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] 微生物遺伝子資源の活用技術2010
- Author(s)
  永田裕二, ら
- Organizer
  東北大学-産総研連携公開講演会
- Place of Presentation
  東京・アキバホール
- Year and Date
  2010-07-28
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22380047
[Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010
- Author(s)
  Nagata, Y., et al.
- Organizer
  14th International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
- Place of Presentation
  Rimini, Italy
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] Organization and dynamism of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 genome2010
- Author(s)
 Nagata, Y, et al.
- Organizer
 14^<th> International Biotechnology Symposium and Exhibition Biotechnology for the Sustainability of Human Society
- Place of Presentation
 Rimini, Italy
- Data Source
 KAKENHI-PROJECT-22658024
[Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in natural environments2008
- Author(s)
  Y. Nagata, et.al.
- Organizer
  Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology -Ecology for the Changing World
- Place of Presentation
  Sendai, Japan
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19658030
[Presentation] Characterization of the traD operon in IncP-9 plasmid NAH7 : a host-range modifier in conjugative transfer2008
- Author(s)
  Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  International Plasmid Biology Conference 2008
- Place of Presentation
  Gdansk, Poland
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008
- Author(s)
  Y. Nagata et.al.
- Organizer
  ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
- Place of Presentation
  Tokyo, Japan
- Year and Date
  2008-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19658030
[Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008
- Author(s)
  Nagata, Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
- Place of Presentation
  Tokyo
- Year and Date
  2008-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Characterization of plasmids from gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingomonas sp2008
- Author(s)
  Tabata, M, R. Endo, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  MM-1. International Plasmid Biology Conference 2008
- Place of Presentation
  Gdansk, Poland
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008
- Author(s)
  Nagata, Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  ISSM satellite symposium Environmental genomics
- Place of Presentation
  Tokyo, Japan
- Year and Date
  2008-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Reconstruction of transcription networks by the conjugative transfer of IncP plasmids.2008
- Author(s)
  Miyakoshi, M., H. Nojiri, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  International Plasmid Biology Conference 2008
- Place of Presentation
  Gdansk, Poland
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008
- Author(s)
  Y. Nagata, et.al.
- Organizer
  ISSM satellite symposium "Environmental aenomics"
- Place of Presentation
  Tokyo, Japan
- Year and Date
  2008-11-05
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008
- Author(s)
  Y. Nagata
- Organizer
  ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
- Place of Presentation
  東京・中央大学
- Year and Date
  2008-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-20651050
[Presentation] スフィンゴモナス属類縁細菌群の多彩な難分解性物質分解能を支えるゲノム的基盤2008
- Author(s)
  永田裕二, ら
- Organizer
  第2回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  大阪大学
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19658030
[Presentation] スフィンゴモナス属類縁細菌群の多彩な難分解性物質分解能を支えるゲノム的基盤2008
- Author(s)
  永田裕二, ら
- Organizer
  第2回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  大阪大学
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in natural environments2008
- Author(s)
  Nagata,Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology -Ecology for the Changing World
- Place of Presentation
  Sendai
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in natural environments2008
- Author(s)
  Y. Nagata, et.al.
- Organizer
  Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology-Ecology for the Changing World
- Place of Presentation
  Sendai, Japan
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Molecular genetic approaches for elucidating adaptive strategies of bacteria in soil2008
- Author(s)
  Y. Nagata
- Organizer
  ISSM satellite symposium "Environmental genomics"
- Place of Presentation
  東京・中央大学
- Year and Date
  2008-11-15
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] 分子遺伝学的手法による細菌の土壌環境適応戦略の解明2008
- Author(s)
  大坪嘉行, 西山衣里, 宮腰昌利, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  2008年度日本生物工学会大会シンポジウム
- Place of Presentation
  仙台
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Adaptation and evolution of bacteria in naturalenvironments2008
- Author(s)
  Nagata, Y., Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  Memorial Symposium of the 24th International Prize for Biology -Ecology for the Changing World
- Place of Presentation
  Sendai, Japan
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Characterization of the traD gene cluster involved in the conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH72007
- Author(s)
  Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  ASM Conference on Pseudomonas 2007
- Place of Presentation
  Seattle, Washington, USA.
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Haloalkane dehalogenases possess two different structural bases for their enantioselectivity2007
- Author(s)
  Prokop, Z., Y. Sato, T. Mozga, P. Jerabek, R. Natsume, J. Florian, M. Tsuda, Y. Nagata, T. Senda, and J. Damborsky
- Organizer
  BIOTRANS 2007 - 8th International Symposium on Biocatalysis and Biotransformations
- Place of Presentation
  Oviedo, Spain
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Characterization of the traD gene cluster involved in the conjugative transfer of naphthalene-catabolic plasmid NAH72007
- Author(s)
  Miyazaki, R., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, M.Tsuda
- Organizer
  ASM Conference on Pseudomonas 2007 Seattle
- Place of Presentation
  Washington, USA
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] 生態系での細菌ゲノム情報発現 -遺伝学的手法を用いた発現遺伝子群の探索-2007
- Author(s)
  津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 永田裕二, 大坪嘉行
- Organizer
  極限環境微生物学会第8回シンポジウム
- Place of Presentation
  横浜
- Year and Date
  2007-07-03
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] 培養非依存的手法による土壌環境からの環境汚染物質分解酵素遺伝子の取得2007
- Author(s)
  永田裕二, 小野玲, 宮崎亮, 府中玄樹, 大坪嘉行, 津田雅孝
- Organizer
  日本微生物生態学会第23回大会シンポジウム.
- Place of Presentation
  松山
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Functional screening of genes for aromatic ring-hydroxylating oxygenases from soil metagenomic libraries Metagenomics 2007 San Diego2007
- Author(s)
  Ono, A., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, M. Tsuda
- Organizer
  California
- Place of Presentation
  USA
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007
- Author(s)
  津田雅孝, 小野玲, 宮崎亮, 府中玄樹, 永田裕二
- Organizer
  第59回日本生物工学会大会シンポジウム「メタゲノム研究と環境バイオテクノロジー」
- Place of Presentation
  広島大学東広島キャンパス総合科学部
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] 培養非依存的手法による土壌環境からの環境汚染物質分解酵素遺伝子の取得2007
- Author(s)
  永田裕二, ら
- Organizer
  日本微生物生態学会第23回大会シンポジウム
- Place of Presentation
  愛媛大学城北キャンパス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] 培養非依存的手法による土壌環境からの環境汚染物質分解酵素遺伝子の取得2007
- Author(s)
  永田裕二, ら
- Organizer
  日本微生物生態学会第23回大会シンポジウム
- Place of Presentation
  愛媛大学城北キャンパス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-19658030
[Presentation] 生態系での細菌ゲノム情報発現遺伝学的手法を用いた発現遺伝子群の探索極限環境微生物学会2007
- Author(s)
  津田雅孝, 西山依里, 宮腰昌利, 永田裕二, 大坪嘉行
- Organizer
  第8回シンポジウム
- Place of Presentation
  東京
- Year and Date
  2007-07-03
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] 培養非依存的手法による土壌環境からの環境汚染物質分解酵素遺伝子の取得2007
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  日本微生物生態学会第23回大会
- Place of Presentation
  松山・愛媛大学
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] 機能発現に基づく環境汚染物質分解酵素遺伝子の生態系からの直接的取得と解析2007
- Author(s)
  津田雅孝, 小野玲, 宮崎亮, 府中玄樹, 永田裕二
- Organizer
  第59回日本生物工学会大会シンポジウム
- Place of Presentation
  東広島
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] 培養非依存的手法による土壌環境からの環境汚染物質分解酵素遺伝子の取得2007
- Author(s)
  永田裕二、小野玲、宮崎亮、府中玄樹、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  日本微生物生態学会第23回大会シンポジウムI : 微生物生態学における環境ゲノミクス
- Place of Presentation
  愛媛大学城北キャンパス
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Haloalkane Dehalogenases Possess Two Different Structural Bases for Their Enantioselectivity2007
- Author(s)
  Prokop, Z., Y. Sato, T. Mozga, P. Jerabek,R. Natsume, J. Florian, M. Tsuda, Y. Nagata,T. Senda, and J. Damborsky
- Organizer
  BIOTRANS 2007 - 8th International Symposium on Biocatalysis and Biotransformations Oviedo
- Place of Presentation
  Spain
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Functional screening of genes for aromatic ring-hydroxylating oxygenases from soil metagenomic libraries2007
- Author(s)
  Ono, A., Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  Metagenomics2007
- Place of Presentation
  San Diego, California, USA
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Conjugal transfer of PCB/biphenyl degradation genes in Acidovorax sp. KKS1022006
- Author(s)
  Ohtsubo, Y., S. Atobe, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  International Symposium on Environmental Biotechnology
- Place of Presentation
  Leipzig, Germany
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] 細菌由来の脱ハロゲン酵素の構造一機能相関と応用への展望2006
- Author(s)
  永田裕二
- Organizer
  平成18年度日本生物工学会北日本支部七タシンポジウム「新しいバイオ技術の創製を目指して」
- Place of Presentation
  仙台
- Year and Date
  2006-08-05
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Novel ABC-type transporter genes essential for the γ-hexachlorocyclohexane utilization in Sphingobium japonicum UT262006
- Author(s)
  Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y.Nagata
- Organizer
  International Symposium on Environmental Biotechnology
- Place of Presentation
  Leipzig, Germany
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] Genetic organization of IncP-7 TOL plasmid pWW53 and the movement of its residing transposons2006
- Author(s)
  Yano, H., C. Garruto, M. Sota, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, P. A. Williams, G. J. Zylsra, and M. Tsuda
- Organizer
  Plasmid Biology
- Place of Presentation
  South Lake Tahoe, California, USA
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Exogenous isolation of a plasmid involved in the degradation of γ-hexachlorocyclohexane from its contaminated soil2006
- Author(s)
  Miyazaki, R., Y. Sato, M. Ito, Y. Ohtsubo, Y. Nagata, and M. Tsuda
- Organizer
  Plasmid Biology 2006
- Place of Presentation
  South Lake Tahoe, California, USA
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Direct isolation of genes and a plasmid for the degradation of γ-hexachlorocyclohexane from contaminated soil2006
- Author(s)
  Nagata, Y., M. Ito, R. Miyazaki, G. Fuchu, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  International Symposium on Environmental Biotechnology
- Place of Presentation
  Leipzig, Germany
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Novel ABC-type transporter genes essential for the γ-hexachlorocyclohexane utilization in Sphingobium japonicum UT262006
- Author(s)
  Endo, R., Y. Ohtsubo, M. Tsuda, and Y. Nagata
- Organizer
  International Symposium on Environmental Biotechnology
- Place of Presentation
  Leipzig, Germany
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380189
[Presentation] Direct isolation of genes and a plasmid for the degradation of γ-hexachlorocyclohexane from contaminated soil2006
- Author(s)
  Nagata, Y., M. Ito, R. Miyazaki, G. Fuchu, Y. Ohtsubo, and M. Tsuda
- Organizer
  International Symposium on Environmental Biotechnology
- Place of Presentation
  Leipzig, Germany
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-18380054
[Presentation] 移植された土壌微生物の定着過程とその安定性について
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 移植された土壌微生物の定着過程とその安定性について
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 次世代シーケンサー由来のリード処理ツール: ShortReadManager
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌細菌での鉄応答制御因子Furを介した転写調節機構の解明
- Author(s)
  佐藤拓哉、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 芳香族化合物分解コンソーシアムに存在する分解菌と非分解菌の関係
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 新規植物共生細菌Aurantimonas sp. AU20のゲノム解析
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、三井久幸、永田裕二、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  植物微生物研究会第23回研究交流会
- Place of Presentation
  岡崎
- Year and Date
  2014-09-07 – 2014-09-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] クラスター化した代謝酵素遺伝子群の導入による有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌の分子育種
- Author(s)
  荷川取佑記、宮崎亮、古屋佑磨、大畑智史、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 芳香族化合物複合汚染土壌から培養非依存的手法で取得したインディゴ生成活性に関与するコスミドクローンの解析
- Author(s)
  永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Comparison of complete genome sequences of four gamma-hexachlorocyclohexane-degrading sphingomonad strains
- Author(s)
  Yuji Nagata, Michiro Tabata, Satoshi Ohhata, Yuki Nikawadori, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
- Organizer
  15th International Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Seoul, South Korea
- Year and Date
  2014-08-24 – 2014-08-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 根粒超着生ダイズから分離された Methylobacterium sp.AMS5 のゲノム解析とミヤコグサにおける着生パターン
- Author(s)
  南智之,按田瑞恵,大久保卓,三井久幸,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝, 南澤究
- Organizer
  植物微生物研究会第23回研究交流会
- Place of Presentation
  岡崎
- Year and Date
  2014-09-07 – 2014-09-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株におけるFurの機能及び発現制御機構の解析
- Author(s)
  佐藤拓哉、木村明音、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] rRNA遺伝子オペロンが9-10 kbレプリコンのみに存在するゲノム構造をもつ細菌の系統分布
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、三井久幸、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 完全ゲノム配列比較に基づいた人為起源有機塩素系殺虫剤γ-HCH分解細菌の出現と進化の考察
- Author(s)
  永田裕二、田端理朗、大畑智史、荷川取佑記、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 芳香族化合物分解コンソーシアムに存在する分解菌と非分解菌の関係
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 次世代シーケンサー由来のリード処理ツール: ShortReadManager
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] フェナントレン分解細菌と共存する非分解優占種細菌の機能解明
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達宿主域に関する研究
- Author(s)
  岸田康平, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株におけるFurの機能及び発現制御機構の解析
- Author(s)
  佐藤拓哉　木村明音　湯原悟志　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 土壌細菌Burkholderia multivorans ATCC17616株におけるFurの機能及び発現制御機構の解析
- Author(s)
  佐藤拓哉　木村明音　湯原悟志　大坪嘉行　永田裕二　津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] クラスター化した代謝酵素遺伝子群の導入による有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane資化能を有する新規細菌株の分子育種
- Author(s)
  荷川取佑記、宮崎亮、古屋佑磨、大畑智史、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Comparison of complete genome sequences of four gamma-hexachlorocyclohexane-degrading sphingomonad strains
- Author(s)
  Yuji Nagata, Michiro Tabata, Satoshi Ohhata, Yuki Nikawadori, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
- Organizer
  15th Internantional Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Seoul, South Korea
- Year and Date
  2014-08-24 – 2014-08-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 根粒超着生ダイズから分離された Methylobacterium sp.AMS5 のゲノム解析とミヤコグサにおける着生パターン
- Author(s)
  南智之,按田瑞恵,大久保卓,三井久幸,大坪嘉行,永田裕二,津田雅孝, 南澤究
- Organizer
  植物微生物研究会第23回研究交流会
- Place of Presentation
  岡崎
- Year and Date
  2014-09-07 – 2014-09-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] rRNA遺伝子オペロンが9.4 kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、三井久幸、永田裕二、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Host range of conjugation system encoded by naphthalene-catabolic plasmid NAH7 from Pseudomonas putida
- Author(s)
  Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, and Masataka Tsuda
- Organizer
  International Symposium of the International Society for Plasmid Biology Scientific Meeting 2014
- Place of Presentation
  Queensland, Australia
- Year and Date
  2014-10-27 – 2014-11-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] クラスター化した代謝酵素遺伝子群の導入による有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane資化能を有する新規細菌株の分子育種
- Author(s)
  荷川取佑記、宮崎亮、古屋佑磨、大畑智史、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Host range of conjugation system encoded by naphthalene-catabolic plasmid NAH7 from Pseudomonas putida
- Author(s)
  Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, and Masataka Tsuda
- Organizer
  International Symposium of the International Society for Plasmid Biology Scientific Meeting 2014
- Place of Presentation
  Queensland, Australia
- Year and Date
  2014-10-27 – 2014-11-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 芳香族化合物複合汚染土壌から培養非依存的手法で取得したインディゴ生成活性に関与するコスミドクローンの解析
- Author(s)
  永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達宿主域に関する研究
- Author(s)
  岸田康平, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] rRNA遺伝子オペロンが9-10 kbレプリコンのみに存在するゲノム構造をもつ細菌の系統分布
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、三井久幸、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 複数の芳香族化合物による人工的汚染化土壌メタゲノムから取得したインディゴ生成活性を担うコスミドクローンの解析
- Author(s)
  永山浩史、加藤広海、菅原智詞、遠藤諒、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 次世代シーケンサー由来のリード処理ツール: ShortReadManager
- Author(s)
  大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 新規植物共生細菌Aurantimonas sp. AU20のゲノム解析
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、三井久幸、永田裕二、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  植物微生物研究会第23回研究交流会
- Place of Presentation
  岡崎
- Year and Date
  2014-09-07 – 2014-09-09
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] クラスター化した代謝酵素遺伝子群の導入による有機塩素系殺虫剤gamma-HCH分解細菌の分子育種
- Author(s)
  荷川取佑記、宮崎亮、古屋佑磨、大畑智史、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 複数の芳香族化合物による人工的汚染化土壌メタゲノムから取得したインディゴ生成活性を担うコスミドクローンの解析
- Author(s)
  永山浩史、加藤広海、菅原智詞、遠藤諒、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] Genetic ecology of Methylobacterium species in legume plants
- Author(s)
  Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, and Kiwamu Minamisawa
- Organizer
  The 6th Korea-Japan-Taiwan International Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Seoul, South Korea
- Year and Date
  2014-08-23 – 2014-08-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌細菌での鉄応答制御因子Furを介した転写調節機構の解明
- Author(s)
  佐藤拓哉、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] Comparison of complete genome sequences of four gamma-hexachlorocyclohexane-degrading sphingomonad strains
- Author(s)
  Yuji Nagata, Michiro Tabata, Satoshi Ohhata, Yuki Nikawadori, Yoshiyuki Ohtsubo, Masataka Tsuda
- Organizer
  15th Internantional Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Seoul, South Korea
- Year and Date
  2014-08-24 – 2014-08-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] rRNA遺伝子オペロンが9.4 kbレプリコンにのみ存在する細菌ゲノムの発見
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、大久保卓、菅原雅之、三井久幸、永田裕二、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] スフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの解析
- Author(s)
  稲葉慎之介、平野丈、宇井博紀、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Effect of anutoregulation of nodulation on pland colonization of Methylobacterium sp. AMS5 isolated from hypernodulated soybean
- Author(s)
  Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, and Kiwamu Minamisawa
- Organizer
  15th Internantional Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Seoul, South Korea
- Year and Date
  2014-08-24 – 2014-08-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌における微生物コミュニティの形成過程について
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] GenomeMatcherのアノテーション支援機能
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] スフィンゴモナッド細菌株の有機炭素源非添加無機固体培地での生育に関与する推定アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子adhXの解析
- Author(s)
  稲葉慎之介、平野丈、宇井博紀、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 移植された土壌微生物の定着過程とその安定性について
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 複数の芳香族化合物による人工的汚染化土壌メタゲノムから取得したインディゴ生成活性を担うコスミドクローンの解析
- Author(s)
  永山浩史、加藤広海、菅原智詞、遠藤諒、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] rRNA遺伝子オペロンが9-10 kbレプリコンのみに存在するゲノム構造をもつ細菌の系統分布
- Author(s)
  按田瑞恵、大坪嘉行、三井久幸、大久保卓、菅原雅之、永田裕二、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解細菌の分子育種
- Author(s)
  荷川取佑記, 宮崎亮, 古屋佑磨, 大畑智史, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] GenomeMatcherのアノテーション支援機能
- Author(s)
  大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 芳香族化合物分解コンソーシアムに存在する分解菌と非分解菌の関係
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] ナフタレン分解プラスミドNAH7の接合伝達宿主域に関する研究
- Author(s)
  岸田康平, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 植物マイクロビオームメタゲノム配列のマッピングによるMethylobacterium 属細菌集団の植物種依存性の解析
- Author(s)
  南智之、按田瑞恵、大久保卓、三井久幸、大坪嘉行、永田裕二、金子貴一、田畑哲之、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 土壌細菌での鉄応答制御因子Furを介した転写調節機構の解明
- Author(s)
  佐藤拓哉、湯原悟志、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] フェナントレン分解細菌と共存する非分解優占種細菌の機能解明
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 土壌における微生物コミュニティの形成過程について
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 土壌における微生物コミュニティの形成過程について
- Author(s)
  加藤広海、森宙史、丸山史人、永山浩史、大坪嘉行、永田裕二、黒川顕、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Genetic ecology of Methylobacterium species in legume plants
- Author(s)
  Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, and Kiwamu Minamisawa
- Organizer
  15th Internantional Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Seoul, South Korea
- Year and Date
  2014-08-23 – 2014-08-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 芳香族化合物複合汚染土壌から培養非依存的手法で取得したインディゴ生成活性に関与するコスミドクローンの解析
- Author(s)
  永山浩史、菅原智詞、遠藤諒、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] Host range of conjugation system encoded by naphthalene-catabolic plasmid NAH7 from Pseudomonas putida
- Author(s)
  Kouhei Kishida, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda
- Organizer
  International Symposium of the International Society for Plasmid Biology Scientific Meeting 2014
- Place of Presentation
  Palm Cove, Australia
- Year and Date
  2014-10-27 – 2014-11-01
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292206
[Presentation] 植物マイクロビオームメタゲノム配列のマッピングによるMethylobacterium 属細菌集団の植物種依存性の解析
- Author(s)
  南智之、按田瑞恵、大久保卓、三井久幸、大坪嘉行、永田裕二、金子貴一、田畑哲之、津田雅孝、南澤究
- Organizer
  第9回日本ゲノム微生物学会年会
- Place of Presentation
  神戸
- Year and Date
  2015-03-06 – 2015-03-08
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] 完全ゲノム配列比較に基づいた人為起源有機塩素系殺虫剤γ-HCH分解細菌の出現と進化の考察
- Author(s)
  永田裕二、田端理朗、大畑智史、荷川取佑記、大坪嘉行、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-25292043
[Presentation] 有機塩素系殺虫剤gamma-hexachlorocyclohexane分解細菌の分子育種
- Author(s)
  荷川取佑記, 宮崎亮, 古屋佑磨, 大畑智史, 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝
- Organizer
  日本農芸化学会2015年大会
- Place of Presentation
  岡山
- Year and Date
  2015-03-26 – 2015-03-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] フェナントレン分解細菌と共存する非分解優占種細菌の機能解明
- Author(s)
  小川なつみ、加藤広海、大坪嘉行、永田裕二、津田雅孝
- Organizer
  環境微生物系学会合同大会2014
- Place of Presentation
  浜松
- Year and Date
  2014-10-21 – 2014-10-24
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054
[Presentation] Effect of anutoregulation of nodulation on pland colonization of Methylobacterium sp. AMS5 isolated from hypernodulated soybean
- Author(s)
  Tomoyuki Minami, Mizue Anda, Takashi Ohkubo, Hisayuki Mitsui, Yoshiyuki Ohtsubo, Yuji Nagata, Masataka Tsuda, and Kiwamu Minamisawa
- Organizer
  15th Internantional Symposium on Microbial Ecology
- Place of Presentation
  Seoul, South Korea
- Year and Date
  2014-08-24 – 2014-08-29
- Data Source
  KAKENHI-PROJECT-26660054

1. TSUDA Masataka (90172022)

# of Collaborated Projects: 22 results

# of Collaborated Products: 484 results
2. OHTSUBO Yoshiyuki (40342761)

# of Collaborated Projects: 17 results

# of Collaborated Products: 534 results
3. KATO HIROMI (90727265)

# of Collaborated Projects: 4 results

# of Collaborated Products: 100 results
4. 澤田宏之 (40354055)

# of Collaborated Projects: 4 results

# of Collaborated Products: 0 results
5. TANOKURA MASARU (60136786)

# of Collaborated Projects: 3 results

# of Collaborated Products: 3 results
6. OHTA Akinori (30125885)

# of Collaborated Projects: 3 results

# of Collaborated Products: 0 results
7. TAKAGI Masamichi (50018339)

# of Collaborated Projects: 3 results

# of Collaborated Products: 0 results
8. KUROKAWA Ken (20343246)

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 10 results
9. SENDA Toshiya

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 2 results
10. JIRI Damborsky

# of Collaborated Projects: 2 results

# of Collaborated Products: 1 results
11. OKAI MASAHIKO (00596562)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
12. 村田幸作 (90142299)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
13. 河合富佐子 (60118007)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
14. 福田雅夫 (20134512)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
15. 五十嵐泰夫 (90114363)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
16. 室岡義勝 (60029882)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
17. 南澤究 (70167667)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
18. 横山正 (70313286)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
19. 田島茂行 (50116894)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
20. 佐伯和彦 (40201511)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
21. 大和田琢二 (90211804)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
22. 近藤倫生 (30388160)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 1 results
23. 川津一隆 (20747547)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
24. 岸田康平 (80816843)

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
25. TAKEYAM Haaruko

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
26. MATSUI Tohru

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
27. FURUHASHI Keizo

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
28. SHIMURA Minoru

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
29. KIMBARA Kazuhide

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
30. DAMBORSKY Jiri

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 4 results
31. Zbynek Prokop

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 1 results
32. DAMBORSKY Ji

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
33. KOCA Jarosla

# of Collaborated Projects: 1 results

# of Collaborated Products: 0 results
34. MARUYAMA Fumito

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results
35. 豊田敦

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 2 results
36. 加藤和人

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 2 results
37. 服部正平

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 2 results
38. 藤山秋佐夫

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 2 results
39. 南沢究

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 3 results
40. 宮腰昌利

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results
41. 野中里佐

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results
42. 矢野大和

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results
43. 佐藤修正

# of Collaborated Projects: 0 results

# of Collaborated Products: 1 results

Nagata Yuji 永田 裕二

NAGATA Yuji 永田 裕二

Research Projects

Research Products

Co-Researchers

Development of efficient utilization system of unexplored genetic resources using gene acquisition ability of bacteriaPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Approach to the substance of bacterial extracellular genetic information storage devicePrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Advanced utilization strategies of beneficial bacteria based on the survival and growth mechanisms of bacteria under poor conditionsPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Development of practical use of useful bacteria by understanding their behavior in the environmentPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Review Section

Research Institution

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Behavior of environmental bacteria in microbial community and oligotrophic growth statePrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Studies on metabolic pathway involved in oligotrophic growth of heterotrophic bacteriaPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Mechanisms for acquiring ability to degrade novel compounds in sphingomonads and their applicationsPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Studies on oligotrophic mutants of an aerobic heterotrophic bacteriumPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Studies on molecular mechanisms for functional evolution of bacteria in the environmentPrincipal Investigator

Principal Investigator

Project Period (FY)

Research Category

Research Field

Research Institution

Principal Investigator

Nagata Yuji 永田裕二

NAGATA Yuji 永田裕二