瀬尾茂人 SENOO Shigeto

研究者番号	30432462
その他のID
所属 (現在)	2025年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 准教授
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記	2021年度 – 2024年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 准教授 2017年度 – 2021年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 准教授 2012年度 – 2016年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 助教 2014年度: 大阪大学, 大学院情報科学研究科, 助教 2009年度: 大阪大学, 大学院・情報科学研究科, 助教 … もっと見る 2007年度 – 2008年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 助教 2007年度: 阪大, 情報科学研究科, 助手 2006年度: 大阪大学, 情報科学研究科, 助手隠す
審査区分/研究分野	研究代表者生体生命情報学 / 小区分62010:生命、健康および医療情報学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 生命・健康・医療情報学研究代表者以外中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野 / 中区分62:応用情報学およびその関連分野 / 生命・健康・医療情報学 / 小区分50020:腫瘍診断および治療学関連 / 学術変革領域研究区分(Ⅲ) / 小区分55010:外科学一般および小児外科学関連 / 中区分38:農芸化学およびその関連分野 / システムゲノム科学
キーワード	研究代表者バイオインフォマティクス / バイオイメージインフォマティクス / 遺伝子発現解析 / 空間トランスクリプトーム / 機械学習 / 細胞画像処理 / 深層学習 / トランスクリプトーム解析 / 発現プロファイル / 類似構造探索 … もっと見る / オミクス解析 / 1細胞発現解析 / シングルセル解析 / データマイニング / 強化学習 / 褐色脂肪細胞 / 類似構造検索 / ゲノム / 生物情報学 / トランスクリプトーム / CAGE … もっと見る研究代表者以外バイオインフォマティクス / 遺伝子発現解析 / 生体イメージング / 骨格筋 / 褐色脂肪組織 / 1細胞トランスクリプトーム解析 / 細胞系譜解析 / 細胞系譜推定 / ベイジアンネットワーク / 脂肪細胞 / 細胞遊走 / 細胞追跡 / CRISPR / CRISPR-gRNA library / 疲弊T細胞 / メモリーT細胞 / CRISPR gRNA library / TCF-1 / CRISPR gRNA / 癌免疫療法 / CRISPR-Cas9 / 癌免疫 / CRISPRライブラリ / がん免疫療法 / T細胞 / 腫瘍免疫 / CRISPR Library / 進化ゲーム理論 / 社会的選択理論 / 細胞コミュニティ / 肥満 / Artificial Intelligence / 乳房温存手術 / 乳腺切除断端 / 生細胞 / アクロレイン / 術中迅速診断 / 乳癌 / 運動 / 1細胞RNAシーケンス / 1細胞RNAシーケンス解析 / 1細胞RNAシーケンシング解析 / 細胞アトラス / クラスタリング / 選択的スプライシング / フラボノイド / 食品化合物 / スプライシング / 次世代シーケンス解析 / ルテオリン / アピゲニン / 選択的mRNAスプライシング / 時系列データ解析 / トランスクリプトーム解析 / ネットワーク解析 / １細胞RNAシーケンシング / 1細胞RNAシーケンシング / 動的ベイジアンネットワークモデル / 遺伝子制御ネットワーク推定 / 炎症反応 / 免疫細胞 / 細胞動態 / 細胞イメージング解析 / セグメンテーション / イメージング解析 / 細胞イメージング / 大規模データ解析 / 褐色脂肪細胞 / 熱産生 / 細胞分化 / microRNA / 遺伝子ネットワーク / モデル化とシミュレーション / 細胞トラッキング / 蛍光イメージング / バイオイメージインフォマティクス / 数理モデル / 画像処理 / 細胞画像解析隠す

生細胞染色法を用いた乳癌の乳房温存手術の切除断端に対する術中迅速診断の確立
- 研究代表者
  
  多根井智紀
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分55010:外科学一般および小児外科学関連
- 研究機関
  大阪大学
時空間情報を統合した1細胞発現解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  大阪大学
褐色脂肪組織由来の新規筋再生制御因子の同定・解析　環境温度と筋再生の関連性の検討
- 研究代表者
  
  後藤剛
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2023
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野
- 研究機関
  京都大学
細胞動画像とオミクスデータの統合による細胞コミュニティの解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(B)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  大阪大学
骨イメージングではじめる動的多細胞コミュニティ学
- 研究代表者
  
  菊田順一
- 研究期間 (年度)
  2022 – 2024
- 研究種目
  
  学術変革領域研究(B)
- 審査区分
  
  学術変革領域研究区分(Ⅲ)
- 研究機関
  神戸大学
   大阪大学
網羅的遺伝子ノックアウト技術を活用した新規がんー免疫チェックポイント標的薬の創製
- 研究代表者
  
  藤木文博
- 研究期間 (年度)
  2021 – 2024
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分50020:腫瘍診断および治療学関連
- 研究機関
  大阪大学
褐色脂肪組織による骨格筋機能制御機構の解明　新規褐色脂肪欠失マウスを用いた検討
- 研究代表者
  
  後藤剛
- 研究期間 (年度)
  2020 – 2021
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分59:スポーツ科学、体育、健康科学およびその関連分野
- 研究機関
  京都大学
活性フラボノイドによる選択的mRNAスプライシング制御の分子機構解明と応用展開
- 研究代表者
  
  増田誠司
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2020
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分38:農芸化学およびその関連分野
- 研究機関
  京都大学
情報量基準に基づく細胞集団の多重分類・比較方式の開発と細胞アトラスへの応用
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
細胞動画像とオミクスデータの統合的情報解析技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2019 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 審査区分
  
  小区分62010:生命、健康および医療情報学関連
- 研究機関
  大阪大学
シミュレーションとGANを介した強化学習による細胞動画像処理の自動化技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2020
- 研究種目
  
  挑戦的研究(萌芽)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
ベイジアンネットワークによる遺伝子制御予測に基づく細胞多様性の解析手法の開発
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2018 – 2021
- 研究種目
  
  基盤研究(A)
- 審査区分
  
  中区分62:応用情報学およびその関連分野
- 研究機関
  大阪大学
リアルタイム生体イメージングによる網羅的な細胞動態の解析
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2016 – 2018
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大阪大学
バイオイメージングデータの時空間解析のための情報処理技術の関発研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2015 – 2018
- 研究種目
  
  基盤研究(C)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大阪大学
脂肪細胞の分化転換における遺伝子ネットワークの網羅的解析技術の開発
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2014 – 2017
- 研究種目
  
  基盤研究(B)
- 研究分野
  
  生命・健康・医療情報学
- 研究機関
  大阪大学
４Ｄイメージングによる生体環境の動的解析
- 研究代表者
  
  松田秀雄
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2014
- 研究種目
  
  挑戦的萌芽研究
- 研究分野
  
  システムゲノム科学
- 研究機関
  大阪大学
高速シーケンサーを用いた遺伝子制御ネットワーク解析技術の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2012 – 2015
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  大阪大学
発現構造比較による網羅的なトランスクリプトーム解析手法の開発研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2007 – 2009
- 研究種目
  
  若手研究(B)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  大阪大学
発現構造を用いた比較トランスクリプトーム解析研究代表者
- 研究代表者
  
  瀬尾茂人
- 研究期間 (年度)
  2006 – 2007
- 研究種目
  
  若手研究(スタートアップ)
- 研究分野
  
  生体生命情報学
- 研究機関
  大阪大学

[雑誌論文] 動画像シミュレータを介した強化学習による細胞追跡手法2023
- 著者名/発表者名
  長村徹, 瀬尾茂人, 藤本健二, 繁田浩功, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌数理モデル化と応用
  
  巻: 16 ページ: 11-22
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[雑誌論文] Cell Tracking via Reinforcement Learning with Microscopic Image Simulator2023
- 著者名/発表者名
  Nagamura Toru、Seno Shigeto、Shigeta Hironori、Mashita Tomohiro、Matsuda Hideo
- 雑誌名
  
  Proceedings of the 2023 13th International Conference on Biomedical Engineering and Technology
  
  巻: 23 ページ: 16-22
- DOI
  10.1145/3620679.3620682
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[雑誌論文] A Novel Method for Gene Regulatory Network Inference with Pseudotime Data Using Information Criterion2022
- 著者名/発表者名
  Shuhei Yao, Kaito Uemura, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  International Journal of Bioscience, Biochemistry and Bioinformatics
  
  巻: 12
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[雑誌論文] SC-JNMF: single-cell clustering integrating multiple quantification methods based on joint non-negative matrix factorization2021
- 著者名/発表者名
  Shiga Mikio、Seno Shigeto、Onizuka Makoto、Matsuda Hideo
- 雑誌名
  
  PeerJ
  
  巻: 9 ページ: e12087-e12087
- DOI
  10.7717/peerj.12087
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[雑誌論文] Tracking and Analysis of FUCCI-Labeled Cells Based on Particle Filters and Time-to-Event Analysis.2020
- 著者名/発表者名
  Fujimoto, K., Seno, S., Shigeta, H., Mashita, T., Ishii, M., Matsuda, H.
- 雑誌名
  
  Int J Biosci Biochem Bioinforma.
  
  巻: 10 号: 2 ページ: 94-109
- DOI
  10.17706/ijbbb.2020.10.2.94-109
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-17H06391, KAKENHI-PROJECT-18K19842
[雑誌論文] Long non-coding RNA 2310069B03Rik functions as a suppressor of Ucp1 expression under prolonged cold exposure in murine beige adipocytes2020
- 著者名/発表者名
  Mari Iwase, Shoko Sakai, Shigeto Seno, Yu-Sheng Yeh, Tony Kuo, Haruya Takahashi, Wataru Nomura, Huei-Fen Jheng, Paul Horton, Naoki Osato, Hideo Matsuda, Kazuo Inoue, Teruo Kawada, Tsuyoshi Goto
- 雑誌名
  
  Bioscience, biotechnology, and biochemistry
  
  巻: 84 号: 2 ページ: 305-313
- DOI
  10.1080/09168451.2019.1677451
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K00387, KAKENHI-PROJECT-18H04124, KAKENHI-PROJECT-19H02910
[雑誌論文] SC-JNMF: Single-cell clustering integrating multiple quantification methods based on joint non-negative matrix factorization2020
- 著者名/発表者名
  Shiga Mikio、Seno Shigeto、Onizuka Makoto、Matsuda Hideo
- 雑誌名
  
  bioRxiv
  
  巻: -
- DOI
  10.1101/2020.09.30.319921
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[雑誌論文] Food-Derived Compounds Apigenin and Luteolin Modulate mRNA Splicing of Introns with Weak Splice Sites2019
- 著者名/発表者名
  Kurata Masashi、Fujiwara Naoko、Fujita Ken-ichi、Yamanaka Yasutaka、Seno Shigeto、Kobayashi Hisato、Miyamae Yusaku、Takahashi Nobuyuki、Shibuya Yasuyuki、Masuda Seiji
- 雑誌名
  
  iScience
  
  巻: 22 ページ: 336-352
- DOI
  10.1016/j.isci.2019.11.033
- NAID
  120007132694
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22280, KAKENHI-PROJECT-19K15807, KAKENHI-PROJECT-19H02884, KAKENHI-PROJECT-17K13264
[雑誌論文] Improvement of detection performance of fusion genes from RNA-Seq data by clustering short reads2019
- 著者名/発表者名
  Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Naoki Osato, Masafumi Shimoda, Shinzaburo Noguchi, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 印刷中
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[雑誌論文] 生体蛍光観察動画像の深度を考慮した深層学習による細胞追跡精度の改善2019
- 著者名/発表者名
  嶋田彩人 , 瀬尾茂人 , 繁田浩功 , 間下以大 , 内田穣 , 石井優 , 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌数理モデル化と応用
  
  巻: 12 ページ: 82-91
- NAID
  170000150463
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19842
[雑誌論文] Direct cell-cell contact between mature osteoblasts and osteoclasts dynamically controls their functions in vivo2018
- 著者名/発表者名
  Masayuki Furuya、Junichi Kikuta、Sayumi Fujimori、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  Nature Communications
  
  巻: 9 号: 1 ページ: 300-300
- DOI
  10.1038/s41467-017-02541-w
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-17K11005, KAKENHI-PROJECT-16K12525, KAKENHI-PROJECT-15H05671, KAKENHI-PROJECT-16H02619
[雑誌論文] A Phytol-Enriched Diet Activates PPAR-α in the Liver and Brown Adipose Tissue to Ameliorate Obesity-Induced Metabolic Abnormalities2018
- 著者名/発表者名
  Ji-Yeong An 、Huei-Fen Jheng、Hiroyuki Nagai、Kohei Sanada、Haruya Takahashi、Mari Iwase、Natsumi Watanabe、Young-Il Kim、Aki Teraminami、Nobuyuki Takahashi、Rieko Nakata、Hiroyasu Inoue、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  Molecular Nutrition & Food Research
  
  巻: - 号: 6 ページ: 1700688-1700688
- DOI
  10.1002/mnfr.201700688
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-26280106, KAKENHI-PROJECT-16K07734
[雑誌論文] The dipeptidyl peptidase-4 (DPP-4) inhibitor teneligliptin enhances brown adipose tissue function, thereby preventing obesity in mice2018
- 著者名/発表者名
  Takeda Kenichiro、Sawazaki Honami、Takahashi Haruya、Yeh Yu-Sheng、Jheng Huei-Fen、Nomura Wataru、Ara Takeshi、Takahashi Nobuyuki、Seno Shigeto、Osato Naoki、Matsuda Hideo、Kawada Teruo、Goto Tsuyoshi
- 雑誌名
  
  FEBS Open Bio
  
  巻: 8 号: 11 ページ: 1782-1793
- DOI
  10.1002/2211-5463.12498
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16H02551, KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-16K12525
[雑誌論文] Chromatin 3D reconstruction from chromosomal contacts using a genetic algorithm2018
- 著者名/発表者名
  Viacheslav Kapilevich, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Yoichi Takenaka
- 雑誌名
  
  IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics
  
  巻: - 号: 5 ページ: 1-1
- DOI
  10.1109/tcbb.2018.2814995
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-15K00402
[雑誌論文] The hepatokine FGF21 is crucial for peroxisome proliferator-activated receptor-α agonist-induced amelioration of metabolic disorders in obese mice2017
- 著者名/発表者名
  Tsuyoshi Goto、Mariko Hirata、Yumeko Aoki、Mari Iwase、Haruya Takahashi、Minji Kim、Yongjia Li、Huei-Fen Jheng、Wataru Nomura、Nobuyuki Takahashi、Chu-Sook Kim、Rina Yu、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  The Journal of Biological Chemistry
  
  巻: 292 号: 22 ページ: 9175-9190
- DOI
  10.1074/jbc.m116.767590
- 査読あり / オープンアクセス / 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-16K07734, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] Bone marrow cavity segmentation using graph-cuts with wavelet-based texture feature2017
- 著者名/発表者名
  Shigeta Hironori、Mashita Tomohiro、Junichi Kikuta、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  Journal of Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 15 号: 05 ページ: 1740004-1740004
- DOI
  10.1142/s0219720017400042
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-16K12525
[雑誌論文] Over-expression of PPARα in obese mice adipose tissue improves insulin sensitivity2017
- 著者名/発表者名
  Haruya Takahashi、Kohei Sanada、Hiroyuki Nagai、Yongjia Li、Yumeko Aoki、Takeshi Ara、Shigeto Seno、et.al
- 雑誌名
  
  Biochemical and Biophysical Research Communications
  
  巻: 493 号: 1 ページ: 108-114
- DOI
  10.1016/j.bbrc.2017.09.067
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403, KAKENHI-PROJECT-16K14927
[雑誌論文] Diagnostic Assessment of Deep Learning Algorithms for Detection of Lymph Node Metastases in Women With Breast Cancer2017
- 著者名/発表者名
  Babak Ehteshami Bejnordi、the CAMELYON16 Consortium (Shigeto Seno(49番目, 総数61))
- 雑誌名
  
  The Journal of the American Medical Association
  
  巻: 318 号: 22 ページ: 2199-2199
- DOI
  10.1001/jama.2017.14585
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[雑誌論文] Detecting shifts in gene regulatory networks during time-course experiments at single-time-point temporal resolution2016
- 著者名/発表者名
  Yoichi Takenaka, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  J. Bioinformatics and Computational Biology
  
  巻: 13 号: 05 ページ: 1543002-1543020
- DOI
  10.1142/s0219720015430027
- 査読あり / 謝辞記載あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00402, KAKENHI-PROJECT-24700294, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] Proinflammatory cytokine interleukin-1β suppresses cold-induced thermogenesis in adipocytes2016
- 著者名/発表者名
  Tsuyoshi Goto, Supaporn Naknukool, Rieko Yoshitake, Yuki Hanafusa, Soshi Tokiwa, Yongjia Li, Tomoya Sakamoto, Takahiro Nitta, Minji Kim, Nobuyuki Takahashi, Rina Yu, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Hideo Matsuda, Teruo Kawada
- 雑誌名
  
  Cytokine
  
  巻: 77 ページ: 107-114
- DOI
  10.1016/j.cyto.2015.11.001
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] グラフカットを用いた骨髄腔画像の領域分割2015
- 著者名/発表者名
  宇佐見潤, 繁田浩功, 間下以大, 黒田嘉宏, 菊田順一, 瀬尾茂人, 石井優, 松田秀雄, 竹村治雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌数理モデル化と応用
  
  巻: ８ページ: 18-27
- NAID
  110009886640
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[雑誌論文] Metagenome fragment classification based on multiple motif-occurrence profiles2014
- 著者名/発表者名
  Naoki Matsushita, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  PeerJ
  
  巻: 2: e559 ページ: 1-13
- DOI
  10.7717/peerj.559
- 査読あり / オープンアクセス
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24650155, KAKENHI-PROJECT-24700294, KAKENHI-PROJECT-26280106
[雑誌論文] 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法2013
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌　数理モデル化と応用
  
  巻: 6(3) ページ: 140-150
- NAID
  110009550153
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[雑誌論文] 複数時系列遺伝子発現プロファイルを利用した遺伝子制御ネットワーク推定の精度向上手法2013
- 著者名/発表者名
  渡邉之人, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 雑誌名
  
  情報処理学会論文誌数理モデル化と応用
  
  巻: 6 ページ: 151-162
- NAID
  110009550160
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[雑誌論文] An estimation method for a cellular-state-specific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles2013
- 著者名/発表者名
  Ryo Araki, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  Gene
  
  巻: Vol.518 号: 1 ページ: 17-25
- DOI
  10.1016/j.gene.2012.11.090
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22310125, KAKENHI-PROJECT-22680023, KAKENHI-PROJECT-24650155, KAKENHI-PROJECT-24700294
[雑誌論文] A Method for Isoform Prediction from RNA-Seq Data by Iterative Mapping2012
- 著者名/発表者名
  Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics（TBIO）
  
  巻: 5 ページ: 27-33
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[雑誌論文] Improved prediction method for protein interactions using both structural and functional characteristics of proteins2010
- 著者名/発表者名
  Tatsuya Yoshikawa, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics vol.3
  
  ページ: 10-23
- 査読あり
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[雑誌論文] A Combination Method of the Tanimoto Coefficient and Proximity Measure of Random Forest for Compound Activity Prediction2008
- 著者名/発表者名
  Gen Kawamura, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics Vol.49No.SIG5
  
  ページ: 46-57
- NAID
  110006824830
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[雑誌論文] A Distributed-Processing System for Accelerating Biological Research using Data-Staging2008
- 著者名/発表者名
  Yoshiyuki Kido, Shigeto Seno, Susumu Date, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 雑誌名
  
  IPSJ Transactions on Bioinformatics Vol.49,No.SIG5
  
  ページ: 58-64
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[雑誌論文] A Method for Similarity Search of Genomic Positional Expression Using CAGE2006
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno
- 雑誌名
  
  PLoS Genetics Vol. 2 ISS. 4
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18800022
[産業財産権] 評価方法、評価装置およびプログラム2018
- 発明者名
  石井優、菊田順一、松田秀雄、瀬尾茂人
- 権利者名
  石井優、菊田順一、松田秀雄、瀬尾茂人
- 産業財産権種類
  特許
- 産業財産権番号
  2018-007571
- 出願年月日
  2018
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] シングルセル解析の前処理について2023
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  NGS EXPO 2023
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12246
[学会発表] 細胞動画像とオミクスデータの統合的情報解析方法の開発への取り組み2023
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  第46回日本基礎老化学会大会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12246
[学会発表] A Coarse-to-Fine Linear Programming Approarch for Spatial Transcriptome Deconvolution2023
- 著者名/発表者名
  Takeru Ishii, Shigeto Seno, Shunji Umetani, Hideo Matsuda
- 学会等名
  GIW / ISCB-Asia 2023
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[学会発表] 骨イメージングではじめる動的多細胞コミュニティ学2023
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人、加藤晋、梅谷俊治、五十嵐彰、図斎大、澤亮治、呂沢宇、菊田順一
- 学会等名
  日本科学振興協会年次大会2023
- データソース
  KAKENHI-ORGANIZER-22H05083
[学会発表] A Graph Based Method of Pattern Mining for Spatial Transcriptome Data2023
- 著者名/発表者名
  Ayaka Mae, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Yu-Chen Liu, Sangeun Kim, Daisuke Okuzaki, Ryoichi Mori, Hideo Matsuda
- 学会等名
  CBI学会2023年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12246
[学会発表] Click-to-sense法による乳腺切除断端の術中迅速診断の開発2023
- 著者名/発表者名
  多根井智紀,波多野高明,北原友梨,盛本浩二,PradiptaAmbara, 谷口梓,久保杏奈,阿部かおり,増永奈苗,塚部昌美,草田義昭, 三宅智博,下田雅史,瀬尾茂人,中山貴寛,吉留克英,増田慎三, 森井英一,田中克典,島津研三
- 学会等名
  第31回日本乳癌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K08709
[学会発表] 畳み込みニューラルネットワークを用いた繰り返しパターンの検出手法と顕微鏡画像への応用2022
- 著者名/発表者名
  新田恭晟, 瀬尾茂人, 細田一史, 松田秀雄
- 学会等名
  第137回数理モデル化と問題解決研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[学会発表] 医療画像診断のための弱教師あり学習を用いた確信度付き良悪性分類手法2022
- 著者名/発表者名
  永野由貴斗, 瀬尾茂人, 多根井智紀, 草田義昭, 松田秀雄
- 学会等名
  第25回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2022)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12246
[学会発表] 時系列ラベルを用いた物体検出による筋線維再生の定量評価の提案2022
- 著者名/発表者名
  山岡悠, 瀬尾茂人, 深田宗一朗, 松田秀雄
- 学会等名
  第25回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2022)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K12246
[学会発表] 動画像シミュレータを介した強化学習による細胞追跡手法2022
- 著者名/発表者名
  長村徹，瀬尾茂人，藤本健二，繁田浩功，松田秀雄
- 学会等名
  第141回情報処理学会数理モデル化と問題解決研究会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[学会発表] バイオインフォマティクスツールのエコシステム2022
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  NGS EXPO 2022
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[学会発表] Click-to-sense法による乳腺切除断端の術中迅速診断の開発：多施設共同臨床試験 (KBCSG-TR2119)2022
- 著者名/発表者名
  多根井智紀,北原友梨,波多野高明,久保杏奈,Pradipta Ambara,盛本浩二,増永奈苗,吉波哲大,阿部かおり,草田義昭,三宅智博,加々良尚文,下田雅史,田中克典,瀬尾茂人,森井英一,中山貴寛,吉留克英,増田慎三,島津研三
- 学会等名
  第30回日本乳癌学会総会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-22K08709
[学会発表] 空間トランスクリプトーム解析のための数理最適化を用いた細胞比率の推定手法2022
- 著者名/発表者名
  Takeru Ishii, Shigeto Seno, Shunji Umetani and Hideo Matsuda
- 学会等名
  第11回生命医薬情報学連合大会
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[学会発表] 医療画像診断のための弱教師あり学習を用いた確信度付き良悪性分類手法2022
- 著者名/発表者名
  永野由貴斗, 瀬尾茂人, 多根井智紀, 草田義昭, 松田秀雄
- 学会等名
  第25回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2022)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[学会発表] 時系列ラベルを用いた弱教師あり学習による筋組織再生過程の定量化手法の提案2022
- 著者名/発表者名
  椙村渉, 瀬尾茂人, 深田宗一朗, 松田秀雄
- 学会等名
  第137回数理モデル化と問題解決研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[学会発表] 細胞動画像シミュレータを介した強化学習による細胞追跡手法2022
- 著者名/発表者名
  長村徹, 瀬尾茂人, 藤本健二, 繁田浩功, 松田秀雄
- 学会等名
  第25回画像の認識・理解シンポジウム
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[学会発表] 時系列ラベルを用いた物体検出による筋線維再生の定量評価の提案2022
- 著者名/発表者名
  山岡悠, 瀬尾茂人, 深田宗一朗, 松田秀雄
- 学会等名
  第25回情報論的学習理論ワークショップ(IBIS2022)
- データソース
  KAKENHI-PLANNED-22H05085
[学会発表] 生命科学データの情報処理について2021
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  化学工学会第52回秋季大会バイオ部会
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[学会発表] Feature selection with VAE for scRNA-seq analysis2021
- 著者名/発表者名
  Toshiya Tanaka, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  29th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[学会発表] シングルセル発現解析ツールの動向について2021
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  Single-Cell 2021 Osaka セミナー
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[学会発表] 核内エキソソームの分解ターゲットとなるpolyA+RNAの解析2021
- 著者名/発表者名
  杉元啓悟、藤原奈央子、瀬尾茂人、増田誠司
- 学会等名
  日本農芸化学会2021年度仙台大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22280
[学会発表] Cell trajectory inference for mouse stem cell differentiation using cell type information from single-cell RNA-seq data2021
- 著者名/発表者名
  Yutaka Izeki, Mona Mizutome, Junko Yoshida, Shigeto Seno, Kyoji Horie, Hideo Matsuda
- 学会等名
  29th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 20th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894
[学会発表] 白色脂肪組織の glycerol kinase は細胞内脂肪酸代謝調節を介して褐色化を制御する2021
- 著者名/発表者名
  後藤剛、岩瀬麻里、常盤颯志、瀬尾茂人、向井貴子、高橋春弥、野村亘、Jheng Huei-Fen、松村成暢、楠堂達也、大里直樹、松田秀雄、井上和生、河田照雄
- 学会等名
  日本農芸化学会 2021年度大会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-20K21755
[学会発表] Cell trajectory inference for revealing differentiation process of mouse stem cells using single cell RNA-seq data2020
- 著者名/発表者名
  Takumi Adachi, Junko Yoshida, Shigeto Seno, Kyoji Horie, Hideo Matsuda
- 学会等名
  28th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894
[学会発表] A method for tracking cell migration in vivo based on deep learning with target detection2020
- 著者名/発表者名
  Tsubasa Mizugaki, Utkrisht Rajkumar, Kenji Fujimoto, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Vineet Bafna, Hideo Matsuda
- 学会等名
  28th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19842
[学会発表] Single-cell transcriptome analysis for elucidating cell dynamics2019
- 著者名/発表者名
  Naoki Osato, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Single cell biology meets diagnostics - 12th International workshop on approaches to single cell analysis
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[学会発表] Data Augmentation for Immune Cell Tracking using Random Walk Models and Generative Adversarial Networks2019
- 著者名/発表者名
  Kenji Fujimoto, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Yutaka Uchida, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Bioimage Informatics 2019
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19842
[学会発表] DNN models and postprocessing thresholds for endoscopy artifact detection in practice2019
- 著者名/発表者名
  Seiryo Watanabe, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  CEUR Workshop Proceedings
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19842
[学会発表] 生体蛍光観察動画像の深度を考慮した深層学習による細胞追跡精度の改善2019
- 著者名/発表者名
  嶋田彩人, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 間下以大, 内田穣, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  第122回数理モデル化と問題解決研究発表会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19842
[学会発表] 細胞画像の領域分割のための敵対的生成ネットワークを用いた訓練データ生成手法2019
- 著者名/発表者名
  藤本健二, 瀬尾茂人, 渡邊誓旅, 繁田浩功, 間下以大, 松田秀雄
- 学会等名
  第22回画像の認識・理解シンポジウム (MIRU2019)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19842
[学会発表] 一細胞遺伝子発現解析のためのJoint-NMFを用いたクラスタリング手法2019
- 著者名/発表者名
  志賀幹夫, 瀬尾茂人, 鬼塚真, 松田秀雄
- 学会等名
  第42回日本分子生物学会年会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19H04207
[学会発表] バイオインフォマティクスと機械学習2019
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  阪大AI Meet UP
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] A method for inferring gene regulatory networks based on pseudo time-series gene expression profiles from single-cell RNA-seq data2019
- 著者名/発表者名
  Kaito Uemura, Naoki Osato, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[学会発表] A study on novel estimation method of cell differentiation lineage by single cell trajectory inference2019
- 著者名/発表者名
  Shuhei Yao, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  27th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and 18th European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19K22894
[学会発表] バイオインフォマティクスのデータマイニング2018
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  奈良先端科学技術大学院大学DSCトーク
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] Detection of fusion genes from human breast cancer cell-line RNA-Seq data using shifted short read clustering2018
- 著者名/発表者名
  Yoshiaki Sota, Shigeto Seno, Hironori Shigeta, Naoki Osato, Masafumi Shimoda, Shinzaburo Noguchi, Hideo Matsuda
- 学会等名
  IEEE 18th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering (BIBE 2018)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18H04124
[学会発表] 細胞画像のセグメンテーション精度向上のための画像類推を用いた学習データ拡張2018
- 著者名/発表者名
  赤沢秀樹, 渡邊誓旅, 繁田浩功, 間下以大, 瀬尾茂人, 松田秀雄
- 学会等名
  画像の認識・理解シンポジウム(MIRU2018)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-18K19842
[学会発表] 細胞画像のセグメンテーション精度向上のための画像類推を用いた学習データ拡張2018
- 著者名/発表者名
  赤沢秀樹, 渡邊誓旅, 繁田浩功, 間下以大, 瀬尾茂人, 松田秀雄
- 学会等名
  第21回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2018
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] 細胞画像のセグメンテーション精度向上のための画像類推を用いた学習データ拡張2018
- 著者名/発表者名
  赤沢秀樹, 渡邊誓旅, 繁田浩功, 間下以大, 瀬尾茂人, 松田秀雄,
- 学会等名
  画像の認識・理解シンポジウム(MIRU2018)
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] 細胞個体の移動傾向の違いを考慮したグローバルデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法2017
- 著者名/発表者名
  伊藤澄美，瀬尾茂人，繁田浩功，菊田順一，竹中要一，石井優，松田秀雄
- 学会等名
  第112回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  岩手県盛岡市
- 年月日
  2017-02-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] Clustering of cells for single cell analysis using latent Dirichlet allocation2017
- 著者名/発表者名
  Mitsuhiro Eto, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2017)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 細胞個体の移動傾向の違いを考慮したグローバルデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法2017
- 著者名/発表者名
  伊藤澄美, 瀬尾茂人, 繁田浩功, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第112回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  清温荘（岩手県）
- 年月日
  2017-02-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] 蛍光顕微鏡画像のためのグラフカットによる毛細血管の抽出手法2017
- 著者名/発表者名
  嶋田彩人, 繁田浩功, 瀬尾茂人, 池田わたる, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  第16回画像の認識・理解シンポジウム MIRU2017
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] 畳み込みニューラルネットワークを用いた脂肪細胞セグメンテーションにおける分割精度改善手法の提案2017
- 著者名/発表者名
  薮崎隼人, 瀬尾茂人, 竹中要一, 後藤剛, 河田照雄, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第112回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  清温荘（岩手県）
- 年月日
  2017-02-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 一細胞解析のための潜在的ディリクレ配分法を用いた遺伝子群の機能予測手法2017
- 著者名/発表者名
  江藤充宏, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  NGS現場の会第五回研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] Clustering of cells for single cell analysis using Latent Dirichlet Allocation2017
- 著者名/発表者名
  Mitsuhiro Eto, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  ISMB/ECCB 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] A method of bioimage analysis for spatial pattern of cellular interaction and intercalation2017
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno, Masayuki Furuya, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  ISMB/ECCB 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] A method of bioimage analysis for spatial pattern of cellular interaction and intercalation2017
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno, Masayuki Furuya, Junichi Kikuta, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2017)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] Analyzing cell migration dynamics from intravital imaging by deformable image matching2017
- 著者名/発表者名
  Hideo Matsuda, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Junichi Kikuta, Masaru Ishii
- 学会等名
  ISMB/ECCB 2017
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] １細胞RNA-seqの特性を考慮した遺伝子発現差解析手法の検討2017
- 著者名/発表者名
  大里直樹, 繁田浩功, 瀬尾茂人, 松田秀雄
- 学会等名
  NGS現場の会第五回研究会
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] Analyzing cell migration dynamics from intravital imaging by deformable image matching2017
- 著者名/発表者名
  Hideo Matsuda, Hironori Shigeta, Shigeto Seno, Junichi Kikuta, Masaru Ishii
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology and European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB 2017)
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] 畳み込みニューラルネットワークを用いた脂肪細胞セグメンテーションにおける分割精度改善手法の提案2017
- 著者名/発表者名
  薮崎隼人，瀬尾茂人，竹中要一，後藤剛，河田照雄，松田秀雄
- 学会等名
  第112回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  岩手県盛岡市
- 年月日
  2017-02-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] A bone marrow cavity segmentation method using wavelet-based texture feature2016
- 著者名/発表者名
  Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Shigeto Seno, Haruo Takemura, Hideo Matsuda, Masaru Ishii
- 学会等名
  International Conference on Pattern Recognition (ICPR2016)
- 発表場所
  Cancun Center, Cancun, Mexico
- 年月日
  2016-12-04
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] ウェーブレット特徴量を用いた生体骨組織の骨髄腔の領域分割手法2016
- 著者名/発表者名
  繁田浩功, 間下以大, 菊田順一, 瀬尾茂人, 竹村治雄, 松田秀雄, 石井優
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016
- 発表場所
  大阪大学銀杏会館（大阪府）
- 年月日
  2016-06-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] An accurate estimation method for expression profiles of novel transcripts from RNA-Seq data2016
- 著者名/発表者名
  F. Iwasaki, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016)
- 発表場所
  Swan and Dolphin Hotel, Orlando, USA
- 年月日
  2016-07-08
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 画像処理とディープラーニングの手法を用いた病理診断支援2016
- 著者名/発表者名
  渡邊誓旅, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  バイオイメージインフォマティクスワークショップ2016
- 発表場所
  大阪府吹田市
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] オプティカルフローを用いた3次元生体イメージングデータからの細胞動態の解析2016
- 著者名/発表者名
  藤代昂希, 瀬尾茂人, 竹中要一, 古家雅之, 菊田順一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  第201回CVIM研究会
- 発表場所
  金沢工業大学（石川県・野々市市）
- 年月日
  2016-03-03
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] 模様特徴量とグラフカットを利用した生体骨組織の骨髄腔の領域分割2016
- 著者名/発表者名
  繁田浩功，間下以大，菊田順一，瀬尾茂人，石井優，松田秀雄
- 学会等名
  第5回生命医薬情報学連合大会
- 発表場所
  東京国際交流館プラザ平成（東京都）
- 年月日
  2016-09-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] A Bone Marrow Cavity Segmentation Method Using Wavelet-Based Texture Feature2016
- 著者名/発表者名
  Hironori Shigeta, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Shigeto Seno, Haruo Takemura, Hideo Matsuda, Masaru Ishii
- 学会等名
  the 23rd International Conference on Pattern Recognition
- 発表場所
  Cancun, Mexico
- 年月日
  2016-12-06
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] 抗がん剤の薬効評価のための経時観察蛍光画像からのデータマイニング2016
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  バイオイメージインフォマティクス・ワークショップ2015
- 発表場所
  九州大学病院キャンパスコラボ・ステーション（福岡県・福岡市）
- 年月日
  2016-06-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] Bayesian network inference from gene expression profiles with a small number of samples2016
- 著者名/発表者名
  K. Saito, S. Seno, Y. Takenaka, H. Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2016)
- 発表場所
  UCLA, Los Angeles, USA
- 年月日
  2016-04-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] バイオサイエンスのための生体医用画像2016
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  生体医用画像研究会第3回若手の会
- 発表場所
  大阪大学シグマホール（大阪府・豊中市）
- 年月日
  2016-03-12
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] A method for reducing false positives of target genes of microRNAs by combining two prediction tools2016
- 著者名/発表者名
  H. Matsuda, J. Tsuda, S. Seno, Y. Takenaka
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2016)
- 発表場所
  Swan and Dolphin Hotel, Orlando, USA
- 年月日
  2016-07-08
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] Dynamic analysis of gene regulations using leaving-one-out expression profile2016
- 著者名/発表者名
  Y. Takenaka, S. Seno, H. Matsuda
- 学会等名
  International Conference on Research in Computational Molecular Biology (RECOMB 2016)
- 発表場所
  UCLA, Los Angeles, USA
- 年月日
  2016-04-17
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] 小サンプル数データに対するベイジアンネットワークのスコアベース構造学習改善手法2016
- 著者名/発表者名
  齋藤和正, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第45回バイオ情報学研究発表会
- 発表場所
  北陸先端科学技術大学院大学（石川県）
- 年月日
  2016-03-18
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] オプティカルフローとウェーブレット解析を用いた白血球の動態の解析手法2016
- 著者名/発表者名
  松原周平, 瀬尾茂人, 西澤志乃, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  バイオイメージインフォマティクスワークショップ2016
- 発表場所
  大阪府吹田市
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] Deep learningを用いた脂肪組織画像における細胞の認識2016
- 著者名/発表者名
  水野雄太，瀬尾茂人，渡邊誓旅，竹中要一, 平松拓郎，後藤剛，河田照雄，松田秀雄
- 学会等名
  第107回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  山口県健康づくりセンター（山口県・山口市）
- 年月日
  2016-03-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] コンポーネントツリーとデータアソシエーションを用いた細胞追跡手法2016
- 著者名/発表者名
  藏重昂平，瀬尾茂人，竹中要一，松田秀雄
- 学会等名
  第107回数理モデル化と問題解決研究発表会
- 発表場所
  山口県健康づくりセンター（山口県・山口市）
- 年月日
  2016-03-07
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-15K00403
[学会発表] オプティカルフローとウェーブレット解析を用いた白血球の動態の解析手法2016
- 著者名/発表者名
  松原周平, 瀬尾茂人, 西澤志乃, 菊田順一, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ 2016
- 発表場所
  大阪大学銀杏会館（大阪府）
- 年月日
  2016-06-22
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-16K12525
[学会発表] ダイナミックベイジアンネットワークを用いた遺伝子制御ネットワーク推定の部分問題化による近似解法2015
- 著者名/発表者名
  上木怜, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  第42回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
- 年月日
  2015-06-23
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] Detecting the shifts of gene regulatory networks during time-course experiments with a single time point temporal resolution2015
- 著者名/発表者名
  Yoichi Takenaka, Shigeto Seno, Hideo Matsuda
- 学会等名
  GIW/InCOB2015
- 発表場所
  日本科学未来館（江東区）
- 年月日
  2015-09-09
- 国際共著/国際学会である
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] イメージングデータの定量化とトランスオミクス解析2015
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  生理学研究所研究会
- 発表場所
  自然科学研究機構岡崎コンファレンスセンター（岡崎市）
- 年月日
  2015-09-14
- 招待講演
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] 大域データ対応付けの反復実行による細胞追跡精度の改善手法2014
- 著者名/発表者名
  藏重昂平, 福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第39回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  大阪大学情報科学研究科（大阪府）
- 年月日
  2014-09-19
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法2014
- 著者名/発表者名
  津田絢子, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  情報処理学会第38回バイオ情報学研究会
- 発表場所
  沖縄科学技術大学院大学（沖縄県）
- 年月日
  2014-06-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-26280106
[学会発表] タイムラプスイメージングによる細胞周期観測画像の時空間解析2014
- 著者名/発表者名
  福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ
- 発表場所
  岡崎コンファレンスセンター（愛知県）
- 年月日
  2014-06-09
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] 経時観測蛍光画像からのモーションヒストリーイメージを用いた細胞分裂の検出方法2013
- 著者名/発表者名
  福田浩二郎, 瀬尾茂人, 間下以大, 前田栄, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013
- 発表場所
  国立情報学研究所, 東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] Global Data Associationによる経時観察画像における破骨前駆細胞の自動追跡手法2013
- 著者名/発表者名
  尾野貴広, 瀬尾茂人, 間下以大, 竹中要一, 石井優, 松田秀雄
- 学会等名
  画像の認識・理解シンポジウムMIRU2013
- 発表場所
  国立情報学研究所, 東京
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] n automatic cell-tracking method and spatiotemporal analysis for time-lapse multicolor fluorescent images of cell cycle2012
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno
- 学会等名
  第35回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  福岡国際会議場（福岡県）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] A cell-tracking method for time-lapse multicolor fluorescent images2012
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno
- 学会等名
  Bioimage Informatics 2012
- 発表場所
  Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Germany
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] An estimation method for a cellular-state-specific gene regulatory network along tree-structured gene expression profiles2012
- 著者名/発表者名
  Ryo Araki, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  GIW2012
- 発表場所
  Tainan, Taiwan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] Transcript-Type Dependent Normalization of Expression Levels in RNA-Seq Data for Non-Coding RNA Analysis2012
- 著者名/発表者名
  Tomoshige Ohno, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology 2012
- 発表場所
  Tokyo, Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] Bayes-based inference of gene regulatory network for multiple time series gene expression profile2012
- 著者名/発表者名
  Yukito Watanabe, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Joint Conference on Informatics is Biology, Medicine and Pharmacology 2012
- 発表場所
  Tokyo, Japan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] Estimate Dynamic Gene Regulatory Networks in Adipocyte Differentiation for Detecting Changes of Gene Regulations by Splitting Time Course Data2012
- 著者名/発表者名
  Tomoyoshi Nakayama, Yoshiyuki Kido, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  GIW2012
- 発表場所
  Tainan, Taiwan
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] A method for analyzing gene expression profiles based on the underlying structures2009
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno
- 学会等名
  International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2009)
- 発表場所
  Stockholm, Sweden
- 年月日
  2009-06-29
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[学会発表] An approach for efficient computational analysis of massive RNA-Seq data2009
- 著者名/発表者名
  石川元一, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  第32回日本分子生物学会年会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2009-12-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[学会発表] CAGE発現プロファイルを用いた転写開始点の発現パターンのクラスタリング手法2008
- 著者名/発表者名
  寺家谷満, 瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  日本分子生物学会第8回春季シンポジウム
- 発表場所
  京王プラザホテル札幌
- 年月日
  2008-05-26
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[学会発表] A method for analysis of tissue-specific alternative transcripts using CAGE tags2008
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2008)
- 発表場所
  Toronto, Canada
- 年月日
  2008-07-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[学会発表] A method for analysis of tissue-specific alternative transcripts using CAGE tags2008
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno
- 学会等名
  Intelligent Systems for Molecular Biology(ISMB2008)
- 発表場所
  Toronto, Canada
- 年月日
  2008-07-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[学会発表] A Clustering Method for Expression Patterns of Transcription Starting Sites2008
- 著者名/発表者名
  Mitsuru Jikeya, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB2008)
- 発表場所
  Toronto, Canada
- 年月日
  2008-07-21
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[学会発表] グラフ構造を用いた組織特異的な選択的スプライシングの解析手法2007
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人, 竹中要一, 松田秀雄
- 学会等名
  日本分子生物学会第30回大会
- 発表場所
  パシフィコ横浜
- 年月日
  2007-12-11
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-19700275
[学会発表] ベイジアンネットワークによる遺伝子制御ネットワーク推定結果の反復構築のための計算速度向上手法
- 著者名/発表者名
  津田絢子,瀬尾茂人,竹中要一,松田秀雄
- 学会等名
  第98回MPS・第38回BIO合同研究発表会
- 発表場所
  沖縄科学技術大学院大学
- 年月日
  2014-06-25 – 2014-06-27
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] A Method of Sequence Analysis for High-Throughput Sequencer Data Based on Shifted Short Read Clustering
- 著者名/発表者名
  Kensuke Suzuki, Daisuke Ueta, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  BIOCOMP2013
- 発表場所
  Las Vegas, Nevada, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] Reconstruction of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Separation of Time-course Data
- 著者名/発表者名
  Tomoyoshi Nakayama, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  BIOCOMP2013
- 発表場所
  Las Vegas, Nevada, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] 多色蛍光タイムラプスイメージングによる細胞周期観測データのための細胞自動追跡手法
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  バイオイメージ・インフォマティクスワークショップ2012
- 発表場所
  理化学研究所発生・再生科学総合研究センター、神戸（兵庫県）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] Integrative prediction of miRNA-mRNA interactions from high-throughput sequencing data
- 著者名/発表者名
  Tomoshige Ohno, Hiromi Daiyasu, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  RECOMB DREAM 2013
- 発表場所
  Las Vegas, Nevada, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] 混合正規分布モデルを用いた経時観測蛍光画像からの細胞核の検出と追跡手法
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  情報処理学会第92回数理モデル化と問題解決研究会
- 発表場所
  武雄市文化会館（佐賀県）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] 多色蛍光イメージングによる経時観測データのための細胞追跡手法
- 著者名/発表者名
  瀬尾茂人
- 学会等名
  ビジョン技術の実利用ワークショップ View2012
- 発表場所
  パシフィコ横浜アネックス・ホール、横浜（神奈川県）
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] Improvement approach of cell tracking accuracy by using inter-frame information
- 著者名/発表者名
  Kohei Kurashige, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Junichi Kikuta, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Bioimage Informatics Conference
- 発表場所
  フラームスブラバント州庁舎（ルーベン、ベルギー）
- 年月日
  2014-10-08 – 2014-10-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] Gene Set Enrichment Analysis for a Long Time Series Gene Expression Profile
- 著者名/発表者名
  Yuta Okuma, Shigeto Seno, Yoichi Takenaka, Hideo Matsuda
- 学会等名
  BIOCOMP2013
- 発表場所
  Las Vegas, Nevada, USA
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24700294
[学会発表] An automatic event detection method using semi-supervised learning for time-lapse imaging data
- 著者名/発表者名
  Kojiro Fukuda, Shigeto Seno, Tomohiro Mashita, Yoichi Takenaka, Masaru Ishii, Hideo Matsuda
- 学会等名
  Bioimage Informatics Conference
- 発表場所
  フラームスブラバント州庁舎（ルーベン、ベルギー）
- 年月日
  2014-10-08 – 2014-10-10
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229
[学会発表] Automatic cell tracking for time-lapse fluorescent images of cell cycle
- 著者名/発表者名
  Shigeto Seno
- 学会等名
  International Symposium "Towards Comprehensive Understanding of Immune Dynamism"
- 発表場所
  Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics, Dresden, Germany
- データソース
  KAKENHI-PROJECT-24651229

1. 松田秀雄 (50183950)

共同の研究課題数: 5件

共同の研究成果数: 36件
2. 石井優 (10324758)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 13件
3. 後藤剛 (10550311)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 2件
4. 高橋春弥 (30750369)

共同の研究課題数: 2件

共同の研究成果数: 1件
5. 河田照雄 (10177701)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
6. 増田誠司 (20260614)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
7. 間下以大 (00467606)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 5件
8. 山下英里華 (10880106)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
9. 水野紘樹 (90707655)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
10. 井上和生 (80213148)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
11. 多根井智紀 (80771518)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
12. 盛本浩二 (00599996)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
13. PRADIPTA AMBARA (90631648)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
14. 亀井康富 (70300829)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
15. 梅谷俊治 (80367820)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 2件
16. 菊田順一 (60710069)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
17. 加藤晋 (30553101)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 1件
18. 藤木文博 (40456926)

共同の研究課題数: 1件

共同の研究成果数: 0件
19. 大里直樹

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 1件
20. 竹中要一

共同の研究課題数: 0件

共同の研究成果数: 3件

瀬尾 茂人 SENOO Shigeto

研究課題

研究成果

共同研究者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

時空間情報を統合した1細胞発現解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

細胞動画像とオミクスデータの統合による細胞コミュニティの解析手法の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

細胞動画像とオミクスデータの統合的情報解析技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

シミュレーションとGANを介した強化学習による細胞動画像処理の自動化技術の開発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

審査区分

研究機関

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

バイオイメージングデータの時空間解析のための情報処理技術の関発研究代表者

研究代表者

研究期間 (年度)

研究種目

研究分野

研究機関

研究代表者

瀬尾茂人 SENOO Shigeto