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小野口 真広  ONOGUCHI MASAHIRO

ORCIDORCID連携する *注記
研究者番号 30645297
その他のID
所属 (現在) 2025年度: 早稲田大学, 理工学術院総合研究所(理工学研究所), 主任研究員
所属 (過去の研究課題情報に基づく) *注記 2020年度 – 2025年度: 早稲田大学, 理工学術院総合研究所(理工学研究所), 次席研究員(研究院講師)
2018年度 – 2019年度: 国立研究開発法人産業技術総合研究所, 生命工学領域, 産総研特別研究員
2017年度: 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 特任助教
2013年度: 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教
審査区分/研究分野
研究代表者
小区分43060:システムゲノム科学関連 / 小区分43050:ゲノム生物学関連 / システムゲノム科学 / 分子生物学
研究代表者以外
中区分62:応用情報学およびその関連分野
キーワード
研究代表者
RNA結合タンパク質 / トランスポゾン / RNA binding protein / transposon / エンハンサー / repeat element / RNA二次構造 / SAFB / ヘテロクロマチン / eCLIP … もっと見る / LINE1 / ゲノム進化 / 大脳進化 / 1細胞解析 / 神経前駆細胞 / 反復配列 / ChIRP / flamenco / ハエ / OSC / ChIRP-MS / PIWI / piRNA / ニューロン分化 / long noncoding RNA … もっと見る
研究代表者以外
RNA結合タンパク質 / 散在的リピート / BERT / 長鎖ノンコーディングRNA / 難溶性RNA / lncRNA / アルゴリズム / トランスポゾン / リピート要素 / 分子シミュレーション / バイオインフォマティクス / ノンコーディングRNA / 相分離 隠す
  • 研究課題

    (6件)
  • 研究成果

    (18件)
  • 共同研究者

    (5人)
  •  RNA機能ドメインの網羅的解析技術の開発研究代表者

    • 研究代表者
      小野口 真広
    • 研究期間 (年度)
      2025 – 2027
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43060:システムゲノム科学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  RNAを中心とした分子ネットワークに基づく生物学的相分離の俯瞰的・体系的理解

    • 研究代表者
      浜田 道昭
    • 研究期間 (年度)
      2023 – 2025
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分62:応用情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  eCLIPデータを用いた機能性RNA反復配列の探索研究代表者

    • 研究代表者
      小野口 真広
    • 研究期間 (年度)
      2021 – 2024
    • 研究種目
      基盤研究(C)
    • 審査区分
      小区分43050:ゲノム生物学関連
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  リピート要素のde novo発見に基づく長鎖ノンコーディングRNAの機能の解明

    • 研究代表者
      浜田 道昭
    • 研究期間 (年度)
      2020 – 2022
    • 研究種目
      基盤研究(A)
    • 審査区分
      中区分62:応用情報学およびその関連分野
    • 研究機関
      早稲田大学
  •  選択的なpiRNA生合成経路の包括的解析研究代表者

    • 研究代表者
      小野口 真広
    • 研究期間 (年度)
      2017 – 2019
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      システムゲノム科学
    • 研究機関
      国立研究開発法人産業技術総合研究所
      慶應義塾大学
  •  エンハンサーによるlncRNAを介した新しい遺伝子発現制御機構の解析研究代表者

    • 研究代表者
      小野口 真広
    • 研究期間 (年度)
      2013
    • 研究種目
      若手研究(B)
    • 研究分野
      分子生物学
    • 研究機関
      東京大学

すべて 2023 2022 2021 2018 2017 2014 2013

すべて 雑誌論文 学会発表 図書 産業財産権

  • [図書] エピジェネティクス実験スタンダード2017

    • 著者名/発表者名
      牛島俊和,眞貝洋一,塩見春彦/編, 小野口真広, 他/著
    • 総ページ数
      398
    • 出版者
      羊土社
    • ISBN
      475810199X
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15051
  • [雑誌論文] Transposons contribute to the acquisition of cell type-specific cis-elements in the brain2023

    • 著者名/発表者名
      Sekine Kotaro、Onoguchi Masahiro、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      Communications Biology

      巻: 6 号: 1 ページ: 631-631

    • DOI

      10.1038/s42003-023-04989-7

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133, KAKENHI-PROJECT-22H04925
  • [雑誌論文] Binding patterns of RNA-binding proteins to repeat-derived RNA sequences reveal putative functional RNA elements2021

    • 著者名/発表者名
      Onoguchi Masahiro、Zeng Chao、Matsumaru Ayako、Hamada Michiaki
    • 雑誌名

      NAR Genomics and Bioinformatics

      巻: 3 号: 3

    • DOI

      10.1093/nargab/lqab055

    • 査読あり / オープンアクセス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-16H05879, KAKENHI-PROJECT-21K06133, KAKENHI-PROJECT-17K20032, KAKENHI-PROJECT-20K15784, KAKENHI-PROJECT-16H06279
  • [産業財産権] 人工合成RNAを用いた包括的かつ定量的なRNA-タンパク質複合体相互作用解析方法2023

    • 発明者名
      小野口真広、足達俊吾、浜田道昭
    • 権利者名
      小野口真広、足達俊吾、浜田道昭
    • 産業財産権種類
      特許
    • 出願年月日
      2023
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] LINE1 RNAと相互作用するタンパク質の網羅的解析とクロマチン制御機構の解明2023

    • 著者名/発表者名
      小野口真広、足達俊吾、浜田道昭
    • 学会等名
      第46回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] 哺乳類の脳細胞において特異的に機能するトランスポゾン由来エンハンサーの同定2023

    • 著者名/発表者名
      伊藤恵理,小野口真広,浜田道昭
    • 学会等名
      生命情報科学若手の会 第15回研究会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] Elucidation for features of mRNAs driving stress granule formation2023

    • 著者名/発表者名
      村松栞,小野口真広,浜田道昭
    • 学会等名
      第7回Tokyo Bioinformatics Meeting研究会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] Comprehensive analysis of the LINE1-associated proteins and estimation of novel regulators of LINE12023

    • 著者名/発表者名
      小野口真広、足達俊吾、浜田道昭
    • 学会等名
      第24回日本RNA学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] Analysis of the relasionship between cancer-related lncRNAs and transposable elements2023

    • 著者名/発表者名
      高山直也,小野口真広,浜田道昭
    • 学会等名
      第7回Tokyo Bioinformatics Meeting研究会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] LINE1配列と相互作用するタンパク質の網羅的解析と新規制御因子の探索2022

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Onoguchi, Shungo Adachi, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第45回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] ニューロンにおける転移因子の転移異常と統合失調症発症の関係2022

    • 著者名/発表者名
      Miyako Ishihara, Kotaro Sekine, Masahiro Onoguchi and Michiaki Hamada
    • 学会等名
      第11回生命医薬情報学連合大会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] Comprehensive analysis of the LINE1-associated proteins and estimation of novel regulators of LINE12022

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Onoguchi, Shungo Adachi, Michiaki Hamada
    • 学会等名
      Cold Spring Harhor Asia RNA Biology
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] Binding Patterns of RNA Binding Proteins To Repeat-Derived RNA Sequences Reveal Putative Functional RNA Elements2021

    • 著者名/発表者名
      小野口真広、曽超、松丸綾子、浜田道昭
    • 学会等名
      日本RNA学会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] Binding patterns of RNA binding proteins to repeat-derived RNA sequences reveal putative functional RNA elements2021

    • 著者名/発表者名
      Onoguchi Masahiro、Zeng Chao、Matsumaru Ayako、Hamada Michiaki
    • 学会等名
      2021 Keystone Symposia Conference, Non-Coding RNAs: Biology and Applications
    • 国際共著/国際学会である
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-21K06133
  • [学会発表] 細胞がトランスクリプトームからpiRNA前駆体を識別する仕組みの理解2018

    • 著者名/発表者名
      小野口真広、足達俊吾、塩見春彦
    • 学会等名
      第41回日本分子生物学会年会
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-17K15051
  • [学会発表] Regulation of neuronal differentiation by Polycomb components Cbx2 and Cbx72014

    • 著者名/発表者名
      Taruho Endoh, Masafumi Tsuboi, Masahiro Onoguchi, Yusuke Hirabayashi and Yukiko Gotoh
    • 学会等名
      第7回神経発生討論会
    • 発表場所
      大阪大学吹田キャンパス
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840005
  • [学会発表] A long noncoding RNA derived from an enhancer region regulates Neurogenin1 gene expression2013

    • 著者名/発表者名
      Masahiro Onoguchi and Yukiko Gotoh
    • 学会等名
      Cold Spring Harbor Laboratory Meeting
    • 発表場所
      NY, USA
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840005
  • [学会発表] Regulation of neuronal differentiation by Polycomb components Cbx2 and Cbx72013

    • 著者名/発表者名
      Taruho Endoh, Masafumi Tsuboi, Masahiro Onoguchi, Yusuke Hirabayashi and Yukiko Gotoh
    • 学会等名
      第36回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • データソース
      KAKENHI-PROJECT-25840005
  • 1.  浜田 道昭 (00596538)
    共同の研究課題数: 2件
    共同の研究成果数: 1件
  • 2.  栗崎 以久男 (50583340)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 3.  曽 超 (80822460)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 4.  福永 津嵩 (80791433)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件
  • 5.  足達 俊吾 (90783803)
    共同の研究課題数: 1件
    共同の研究成果数: 0件

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